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Characterization of gene regulation and contribution of c-di-GMP signaling to biofilm formation and virulence in Leptospira interrogans
No full textLa leptospirose, zoonose réémergente, touche plus d'un million de personnes chaque année, provoquant près de 60 000 décès. Cette maladie est causée par une bactérie pathogène du genre Leptospira transmise à l’Homme par des environnements contaminés par l'urine d'animaux porteurs. Un mécanisme clé de sa persistance pourrait être la formation de biofilm, qui protège les bactéries des conditions adverses. Ce travail explore les mécanismes régulant la formation de cette structure. L’analyse transcriptomique de bactéries d’un biofilm mature a révélé une adaptation à des conditions défavorables avec une augmentation des mécanismes de résistance au stress. Malgré les régulations majeures et la diminution de leur activité métabolique, les leptospires au sein du biofilm conservent leur virulence. Cette étude révèle également une régulation importante de l’opéron csoR/copZA, impliqué dans l’homéostasie du cuivre chez les leptospires pathogènes. La création d’une souche transformée avec des mutations ponctuelles sur le site de liaison au cuivre du régulateur de transcription CsoR a apporté des éléments-clés de compréhension du fonctionnement de cette protéine. Enfin, il a été montré que la concentration intracellulaire de c-di-GMP, un messager central dans la formation de biofilm, augmente significativement entre 5 et 12 jours de culture. La création de souches transformantes surexprimant des enzymes de synthèse ou de dégradation du c-di-GMP a permis de mieux caractériser le rôle de ce second messager. Ces résultats offrent de nouvelles perspectives sur la persistance de L. interrogans et ouvrent des pistes pour des stratégies préventives innovantes contre la leptospirose.Leptospirosis, a re-emerging zoonosis, affects more than a million people every year, causing almost 60,000 deaths. The disease is caused by a pathogenic bacterium of the genus Leptospira, transmitted to humans through environments contaminated by the urine of carrier animals. A key mechanism in its persistence could be biofilm formation, which protects the bacteria from adverse conditions. This study explores the mechanisms regulating the formation of this structure. Transcriptomic analysis of bacteria from a mature biofilm revealed adaptation to unfavorable conditions with an increase in stress resistance mechanisms. Despite major regulation and a reduction in their metabolic activity, leptospires within the biofilm retain their virulence. This study also revealed significant regulation of the csoR/copZA operon, involved in copper homeostasis in pathogenic leptospires. The creation of a strain transformed with point mutations at the copper-binding site of the transcription regulator CsoR provided key insights into the functioning of this protein. Finally, it was shown that the intracellular concentration of c-di-GMP, a central messenger in biofilm formation, increases significantly between 5 and 12 days of culture. The creation of transformant strains overexpressing c-di-GMP synthesis or degradation enzymes has enabled us to better characterize the role of this second messenger. These results offer new insights into the persistence of L. interrogans and point the way to innovative preventive strategies against leptospirosis
Ecological determiners and microbiliogiques of the environmental component of the leptosirose in New Caledonia
No full textL’importance des contaminations humaines, via les eaux et les sols, fait de la leptospirose une zoonose d’origine environnementale. Pourtant, la survie des leptospires pathogènes dans l’environnement reste peu étudiée.À ce jour, le genre Leptospira est composé des Pathogènes 1 (anciennement pathogènes) et 2 (anciens intermédiaires), Saprophytes 1 (anciennement saprophytes) et 2 (nouveau groupe de saprophytes). Le remaniement subi par la phylogénie des leptospires repose sur la découverte d’une grande biodiversité de leptospires. On dénombre aujourd’hui 64 espèces dont 46 ont été isolées depuis l’environnement. L’hypothèse du sol comme habitat environnemental des leptospires pathogènes, remobilisés par l’eau lors de pluies, a été confortée grâce à une revue systématique de la littérature. Afin de mieux comprendre le mode de vie environnemental des leptospires, leur survie a été étudiée en eaux, solutions de sols et sols. Ainsi, une survie de leptospires pathogènes de plus d’un an a été confirmée en eau dépourvue en nutriment. De plus, le maintien de leur virulence après cette longue incubation a été démontré. D’autre part, les solutions de sol à pH neutre et de faible conductivité ainsi que les sols à faible capacité d’échange cationique et capacité au champ ainsi que pauvres en sodium et calcium semblent favoriser la survie des leptospires pathogènes.Ces études contribuent à comprendre la transmission environnementale de la leptospirose. L’identification de l’habitat de ces bactéries pathogènes permettra d’améliorer les stratégies de contrôle et de prévention de cette maladie potentiellement mortelle, applicables à d’autres infections environnementales.The extent of human contamination, via water and soil, makes leptospirosis an environmental zoonosis. However, the survival of pathogenic leptospires in the environment remains poorly studied. To date, the genus Leptospira is composed of Pathogens 1 (formerly pathogens) and 2 (former intermediates), Saprophytes 1 (formerly saprophytes) and 2 (new group of saprophytes). The reorganization undergone by the phylogeny of leptospires is based on the discovery of a great biodiversity of leptospires. There are now 64 species of which 46 have been isolated from the environment. The hypothesis of the soil as the environmental habitat of pathogenic leptospires, remobilized by water during rains, was confirmed thanks to a systematic review of the literature. In order to better understand the environmental way of life of leptospires, their survival was studied in water, soil solutions and soils. Thus, a survival of pathogenic leptospires of more than one year has been confirmed in nutrient-free water. In addition, the maintenance of their virulence after this long incubation has been demonstrated. On the other hand, soil solutions with neutral pH and low conductivity as well as soils with low cation exchange capacity and field capacity as well as low in sodium and calcium seem to promote the survival of pathogenic leptospires. Understand the environmental transmission of leptospirosis. Identifying the habitat of these pathogenic bacteria will improve control and prevention strategies for this potentially fatal disease, applicable to other environmental infections
Epidémiologie et facteurs de virulence des bactéries du genre Vibrio responsables de mortalité de crevettes d'élevage en Nouvelle-Calédonie. Perspectives de lutte.
No full textNew Caledonia has a number of assets for marine shrimp culture. However, its rapid growth encountered a slowdown in 1993, due to the emergence of a seasonal pathology that was named Syndrome 93. Involving bacteria from the Vibrio genus, this disease affects juvenile shrimp during grow out. Strains of significant importance belong to the species Vibrio penaeicida and V. nigripulchritudo and are highly pathogenic to juvenile shrimp. A molecular typing study was conducted in order to clarify their epidemiology and to draw zoosanitary advice. A wide epidemiological survey of V. penaeicida (currently in progress) demonstrates the important impact of ecological events in the outbreak of the disease. Virulence of V. penaeicida was studied as a function of host developmental stage. Toxic factors were shown in bacterial culture supernatants. An hypothesis was drawn regarding the route of entry of these bacterial pathogens into their host. Plasmids harboured by these pathogenic strains are currently being studied with regards to virulence. Means of minimising the impact of Syndrome 93 in grow out ponds have been studied, and zoosanitary practices are discussed. Genetic selection for a disease-resistant shrimp strain seem to be a promising issue. Research outlooks include the study of bacterial ecology in shrimp environment, pathogeny of Syndrome 93 disease with regards to Vibrio virulence factors and the study of the host – pathogen relationship. These future studies could eventually beneficiate from the background knowledge on other Vibrio species.La Nouvelle-Calédonie présente de nombreux atouts pour la pénéiculture. Le ralentissement brutal de son développement en 1993 s'explique par l'émergence d'une pathologie saisonnière qui affecte les crevettes juvéniles en grossissement, mettant en cause des bactéries du genre Vibrio et qui a reçu le nom de Syndrome 93. Vibrio penaeicida et V. nigripulchritudo sont deux espèces au pouvoir pathogène particulièrement élevé qui affectent les élevages. Une étude de typage moléculaire a permis de préciser leur épidémiologie et de proposer quelques conseils d'ordre zoosanitaire. Un suivi épidémiologique par amplification génique est en cours pour V. penaeicida, qui montre l'importance des facteurs écologiques dans l'apparition des épisodes pathologiques. La pathogénicité de V. penaeicida a été étudiée en fonction du stade de développement de l'hôte, et des facteurs toxiques ont été mis en évidence dans les surnageants de culture. Une hypothèse a été émise sur la voie d'entrée du pathogène dans l'hôte. L'hypothèse d'un support plasmidique de la virulence a été émise et est actuellement étudiée. Des moyens de lutte ont été étudiés, des aspects de gestion zoosanitaires discutés. La sélection de lignées de crevettes à moindre sensibilité à l'infection apparaît comme une piste prometteuse. Des perspectives de recherches sont proposées, notamment l'étude de l'écologie de ces Vibrio pathogènes dans l'environnement d'élevage, de la pathogénie des vibrioses engendrées en terme de facteurs de virulence, des relations hôte – pathogène. Ces travaux pourront s'appuyer sur les nombreuses connaissances acquises depuis plusieurs années pour d'autres espèces du genre Vibrio
Suivi épidémiologique de Vibrio penaeicida : bassin 9 de la Station d'Aquaculture de Saint-Vincent
No full textLe suivi épidémiologique de Vibrio penaeicida a débuté en février 1998 sur quatre fermes et quatre écloseries du Territoire. Cette fiche biotechnique présente les résultats préliminaires issus de l' étude d'un élevage sur le bassin 9 de la Station d'Aquaculture de Saint Vincent. Ce suivi s'est accompagné d'un suivi des comptages hémocytaires des crevettes en intermue de ce bassin, dont les résultats seront présentés dans une fiche biotechnique séparée. Un important pic de mortalité a été observé dans ce bassin. Les crevettes moribondes étudiées en début du pic de mortalité étaient toutes atteintes d'une vibriose à Vibrio penaeicida. Par la suite, l'ADN de Vibrio penaeicida n'a pas systématiquement été détecté dans les crevettes examinées au moment de la plus forte mortalité. L'ensemble des résultats est présenté et discuté
Leptospirosis: Time to move to molecular epidemiology: Comments on "Reassessment of MLST schemes for Leptospira spp. typing worldwide" by Varni and colleagues.
No full textInternational audienceletter without abstrac
Suivi épidémiologique de Vibrio penaeicida : étude de la transmission pseudo-verticale : suivi des écloseries
No full textDans le cadre du suivi épidémiologique de Vibrio penaeicida dans les élevages de crevettes du Territoire, il importait de considérer l'éventualité d'une transmission pseudo-verticale du pathogène, c'est-à-dire des géniteurs aux larves et post-larves. Ce suivi a concerné des productions de quatre écloseries du Territoire (Ecloserie du Nord, Ecloserie de Mara, Ecloserie de Montagnès et Ecloserie de la SASV) à différentes saisons, et sur différents stades de
développement. Le portage de V. penaeicida est confirmé sur les géniteurs, mais la transmission pseudo-verticale semble exclue au vu des résultats de ce suivi
Epidémiologie et facteurs de virulence des bactéries du genre Vibrio responsables de mortalité de crevettes d'élevage en Nouvelle-Calédonie. Pespectives de lutte
No full textLa Nouvelle-Calédonie présente de nombreux atouts pour la pénéiculture. Le ralentissement brutal de son développement en 1993 s'explique par l'émergence d'une pathologie saisonnière qui affecte les crevettes juvéniles en grossissement, mettant en cause des bactéries du genre Vibrio et qui a reçu le nom de Syndrome 93. Vibrio penaeicida et V. nigripulchritudo sont deux espèces au pouvoir pathogène particulièrement élevé qui affectent les élevages. Une étude de typage moléculaire a permis de préciser leur épidémiologie et de proposer quelques conseils d'ordre zoosanitaire. Un suivi épidémiologique par amplification génique est en cours pour V. penaeicida, qui montre l'importance des facteurs écologiques dans l'apparition des épisodes pathologiques. La pathogénicité de V. penaeicida a été étudiée en fonction du stade de développement de l'hôte, et des facteurs toxiques ont été mis en évidence dans les surnageants de culture. Une hypothèse a été émise sur la voie d'entrée du pathogène dans l'hôte. L'hypothèse d'un support plasmidique de la virulence a été émise et est actuellement étudiée. Des moyens de lutte ont été étudiés, des aspects de gestion zoosanitaires discutés. La sélection de lignées de crevettes à moindre sensibilité à l'infection apparaît comme une piste prometteuse. Des perspectives de recherches sont proposées, notamment l'étude de l'écologie de ces Vibrio pathogènes dans l'environnement d'élevage, de la pathogénie des vibrioses engendrées en terme de facteurs de virulence, des relations hôte - pathogène. Ces travaux pourront s'appuyer sur les nombreuses connaissances acquises depuis plusieurs années pour d'autres espèces du genre Vibrio.
Bactéries pathogènes, hôtes, et environnement : une approche multifactorielle pour l'étude de la leptospirose en Nouvelle-Calédonie
No full textLa leptospirose constitue un réel problème de santé publique en Nouvelle-Calédonie et dans les autres collectivités Françaises du Pacifique. Reconnue depuis de nombreuses années comme une pathologie majeure (avec une incidence dépassant parfois les 100 cas pour 100,000 habitants), elle est une pathologie infectieuse endémique de premier plan qui connait une recrudescence et un caractère épidémique lors des années à forte pluviométrie. Cette maladie a été étudiée de façon historique à l'Institut Pasteur de Nouvelle-Calédonie (IPNC), qui a ainsi développé les outils utiles à son diagnostic et à son étude et acquis au cours des années une expertise reconnue sur cette maladie. Du fait du caractère zoonotique et environnemental de cette maladie, une approche multifactorielle de son étude est mise en place à l'IPNC, et s'articule autour de 3 axes, répondant à 3 constats : L'épidémiologie et l'écologie de cette maladie humaine et animale comportant une large composante environnementale demeurent insuffisamment connues, notamment en Nouvelle-Calédonie. Leur description a longtemps été basée sur une taxonomie strictement sérologique, actuellement obsolète et dont l'avènement de la génétique moléculaire a mis en évidence de nombreuses limites. Dans le cadre d'un site pilote, mais aussi en collaboration avec les acteurs de l'élevage, l'éco-épidémiologie de la leptospirose en Nouvelle-Calédonie est revisitée avec une approche moléculaire. Les critères pronostiques manquent fréquemment aux cliniciens pour différencier, lors d'une leptospirose nécessitant une prise en charge hospitalière, les cas graves de ceux qui évolueront rapidement vers une guérison. Du fait du tableau de choc septique fréquemment observé dans les leptospiroses sévères, il est possible que des indicateurs pronostiques du choc septique aient également une application dans le cadre de la leptospirose. A la suite de travaux sur modèle animal sensible, des critères biologiques à valeur pronostiques seront évalués dans des cas de leptospirose hospitalisés en Nouvelle-Calédonie. Enfin, le diagnostic clinique de leptospirose est délicat, du fait de la diversité des formes cliniques et la confirmation par le diagnostic biologique, nécessaire, est complexe et demande des techniques spécialisées. En contraste, l'accès à ces techniques spécialisées n'est que rarement offert aux régions ou aux zones où l'incidence de la leptospirose est la plus élevée. Notre troisième volet d'étude concerne la mise au point puis la validation d'un test de diagnostic rapide, de type bandelette, qui permettrait la détection d'antigènes de leptospires pathogènes dans les liquides biologiques. Parallèlement, la mise en place du diagnostic biologique de leptospirose dans plusieurs instituts du Réseau International des Instituts Pasteur s'efforcera de documenter la présence de la leptospirose dans des régions où elle n'est pas décrite, ou de mieux évaluer son impact réel sur la santé publique de ces régions
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
No full textThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
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