28 research outputs found
Marietta Robusti, La Tintoretta: a critical discussion of a Venetian pittrice
No full textMarietta Robusti, known also as Marietta Tintoretta, is recognized today primarily as a beloved pupil of her famous father, Jacopo Tintoretto. Before her premature death around 1590, Robusti earned international fame for her painted portraits and was praised by contemporary biographers. Though she was never granted the opportunity to practice autonomously outside of her father’s workshop, her role within it was multifaceted, working as an assistant, a portraitist, and most likely a model. Robusti was one of the earliest examples of a new but growing tradition of female painters being trained by their fathers in Cinquecento Italy. Robusti’s artistic legacy, however, is established by her biographers in terms of virtuous qualities pertaining to her gender and the adoration of her father rather than artistic achievement. As a result, no extant works by Robusti are securely known today. Chapter one discusses Marietta Robusti and the Tintoretto bottega, along with the rise of women artists in Cinquecento Venice and Renaissance constructs of feminine virtu in early modern biographies. The second chapter critically considers Robusti’s historiography, with specific attention to her earliest biographers and their gendered treatment of Robusti and her work. Chapter two also examines the trend of collecting works by women artists as curiosities. Chapter three includes a critical discussion of Robusti’s highly disputed oeuvre and range of paintings documented in collection history
A truncated and catalytically inactive isoform of KDM5B histone demethylase accumulates in breast cancer cells and regulates H3K4 tri-methylation and gene expression
No full textKDM5B histone demethylase is overexpressed in many cancers and plays an ambivalent role in oncogenesis, depending on the specific context. This ambivalence could be explained by the expression of KDM5B protein isoforms with diverse functional roles, which could be present at different levels in various cancer cell lines. We show here that one of these isoforms, namely KDM5B-NTT, accumulates in breast cancer cell lines due to remarkable protein stability relative to the canonical PLU-1 isoform, which shows a much faster turnover. This isoform is the truncated and catalytically inactive product of an mRNA with a transcription start site downstream of the PLU-1 isoform, and the consequent usage of an alternative ATG for translation initiation. It also differs from the PLU-1 transcript in the inclusion of an additional exon (exon-6), previously attributed to other putative isoforms. Overexpression of this isoform in MCF7 cells leads to an increase in bulk H3K4 methylation and induces derepression of a gene cluster, including the tumor suppressor Cav1 and several genes involved in the interferon-alpha and -gamma response. We discuss the relevance of this finding considering the hypothesis that KDM5B may possess regulatory roles independent of its catalytic activity.</p
Mass spectrometry‐based characterization of histones in clinical samples: applications, progress, and challenges
No full textIn the last 15 years, increasing evidence linking epigenetics to various aspects of cancer biology has prompted the investigation of histone post‐translational modifications (PTMs) and histone variants in the context of clinical samples. The studies performed so far demonstrated the potential of this type of investigations for the discovery of both potential epigenetic biomarkers for patient stratification and novel epigenetic mechanisms potentially targetable for cancer therapy. Although traditionally the analysis of histones in clinical samples was performed through antibody‐based methods, mass spectrometry (MS) has emerged as a more powerful tool for the unbiased, comprehensive, and quantitative investigation of histone PTMs and variants. MS has been extensively used for the analysis of epigenetic marks in cell lines and animal tissue and, thanks to recent technological advances, is now ready to be applied also to clinical samples. In this review, we will provide an overview on the quantitative MS‐based analysis of histones, their PTMs and their variants in cancer clinical samples, highlighting current achievements and future perspectives for this novel field of research. Among the different MS‐based approaches currently available for histone PTM profiling, we will focus on the ‘bottom‐up’ strategy, namely the analysis of short proteolytic peptides, as it has been already successfully employed for the analysis of clinical samples
1D augmented fluid-structure interaction systems with viscoelasticity: from water pipelines to blood vessels
No full textNowadays, mathematical models and numerical simulations are widely used in the whole fluid dynamics research field. They represent a powerful resource to better understand phenomena and processes and to significantly reduce the costs that would otherwise be necessary for carrying out laboratory experiments (sometimes even allowing to obtain useful data that could not be collected by measurements).
Currently there are many important industries of hydraulic systems which, for the correct analysis of the behavior of the designed systems, require the preventive use of an accurate mathematical model, able to describe the trend of the properties of the fluid in the pipelines. On the other hand, the availability of robust and efficient mathematical instruments, together with the engineering know-how in the fluid mechanics sector, represents an invaluable tool for a consistent support even in hemodynamics studies, providing practical approaches for the quantification of variables involved in the cardiovascular fluid dynamics.
The correct characterization of the interactions occurring between the fluid and the wall that circumscribes the motion of the fluid itself, is a fundamental aspect in all the contexts involving deformable ducts, which requires the utmost attention at every stage of both the development of the computational scheme and the interpretation of the results and at their application to cases of practical interest.
In this PhD Thesis, innovative mathematical models able to predict the behavior of the fluid-structure interaction mechanism that underlies the dynamics of flows in different compliant ducts is presented. Starting from the purely civil engineering sector, with the study of plastic water pipelines, the final application of the proposed tool is linked to the medical research field, to reproduce the mechanics of blood flow in both arteries and veins. With this aim, various linear viscoelastic models, from the simplest to the more sophisticated, have been applied and extended to obtain augmented fluid-structure interaction systems in which the constitutive equation of the material is directly inserted into the system as partial differential equation. These systems are solved recurring to second-order Finite Volume Methods that take into account the recent evolution in the computational literature of hyperbolic balance laws systems. The models have been extensively validated through different types of test cases, highlighting the advantages of using the augmented formulation of the system of equations. Numerical results have been compared with quasi-exact solutions of idealized time-dependent tests for situations close to reality or with reference values obtained with numerical schemes generally adopted in the specific research field investigated. Furthermore, comparisons with experimental data have been considered both for the water pipelines scenario and the blood flow modeling, recurring to ad hoc in-vivo measurements for the latter. Accuracy and efficiency analyses have been performed in different contexts, as well as a sensitivity analysis with regards to the final part of the project, related to a more applicative study on arterial hypertension.Oggigiorno, modelli matematici e simulazioni numeriche sono ampiamente utilizzati nell’intero campo della ricerca fluidodinamica. Essi rappresentano una potente risorsa per comprendere meglio i fenomeni e i processi e per ridurre significativamente i costi che sarebbero altrimenti necessari per la realizzazione di esperimenti di laboratorio (a volte anche per ottenere utili dati che non potrebbero essere raccolti mediante misurazioni).
Attualmente esistono molte importanti industrie di sistemi idraulici che, per la corretta analisi del comportamento dei sistemi progettati, richiedono l’uso preventivo di un accurato modello matematico, in grado di descrivere l’andamento delle proprietà del fluido nelle tubazioni. D’altra parte, la disponibilità di strumenti matematici robusti ed efficienti, insieme al know-how ingegneristico nel settore della fluidodinamica, rappresenta uno strumento inestimabile per un supporto costante anche negli studi emodinamici,
fornendo approcci pratici per la quantificazione delle variabili coinvolte nella fluidodinamica cardiovascolare.
La corretta caratterizzazione delle interazioni tra il fluido e la parete che ne circoscrive il moto, è un aspetto fondamentale in tutti i contesti di condotte deformabili, che richiede la massima attenzione in ogni fase dello sviluppo dello schema di calcolo e della interpretazione dei risultati e nella loro applicazione a casi di interesse pratico.
In questa Tesi di Dottorato vengono presentati innovativi modelli matematici in grado di prevedere il comportamento del meccanismo di interazione fluido-struttura che sta alla base della dinamica dei flussi in diverse condotte deformabili. Partendo dal settore dell’ingegneria puramente civile, con lo studio di condotte idrauliche in plastica, l’applicazione finale dello strumento proposto è legata al campo della ricerca medica, per riprodurre la meccanica del flusso sanguigno sia nelle arterie che nelle vene. A tal fine, sono stati applicati ed estesi diversi modelli viscoelastici lineari, dai più semplici ai più sofisticati, per ottenere sistemi aumentati di interazione fluido-struttura in cui l’equazione costitutiva del materiale è direttamente inserita nel sistema come equazione alle derivate parziali. Questi sistemi sono risolti ricorrendo a Metodi ai Volumi Finiti al secondo ordine che tengono conto della recente evoluzione della letteratura computazionale dei sistemi iperbolici di leggi di bilancio. I modelli sono stati ampiamente validati attraverso diversi tipi di casi test, evidenziando i vantaggi dell’utilizzo del sistema di equazioni in forma aumentata. I risultati numerici sono stati confrontati con soluzioni quasi esatte di problemi ideali dipendenti dal tempo per situazioni vicine alla realtà o con valori di riferimento ottenuti con schemi numerici adottati solitamente nello specifico campo di ricerca indagato. Inoltre, sono stati presi in considerazione confronti con dati sperimentali sia per lo scenario delle condotte idriche che per la modellazione del flusso sanguigno, ricorrendo a misurazioni in-vivo ad hoc per quest’ultimo. Sono state effettuate analisi di accuratezza ed efficienza in diversi contesti, nonché un’analisi di sensitività per quanto riguarda la parte finale del progetto, relativa ad uno studio più applicativo sull’ipertensione arteriosa
Interpretative study of the piece water's trio for clarinet, viola and piano from Ricardo Tacuchian
No full textOrientador: Emerson Luiz de BiaggiDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de ArtesResumo: O objeto de estudo deste trabalho é a peça "Trio das Águas" composta por Ricardo Tacuchian no ano de 2012 e dedicada ao Terra Brasilis Trio, grupo no qual a autora desta dissertação atua como pianista. O primeiro capítulo aborda aspectos do ofício de compositor segundo Tacuchian, seus anseios e motivações para compor, fazendo ainda uma breve explanação a respeito dos fundamentos teóricos do Sistema ¿ T, ferramenta de controle de alturas desenvolvida pelo compositor no início dos anos 80 utilizada para a composição do "Trio das Águas". No segundo capítulo identificamos aspectos relevantes do emprego do Sistema ¿ T e que serviram de base para estruturar esta primeira interpretação. As sugestões interpretativas aqui encontradas baseiam-se no trabalho em conjunto dos primeiros intérpretes da obra com o compositor, buscando melhor compreensão de suas ideias quanto à concepção da obra, sonoridade e articulações desejadas. Os anexos consistem em textos de autoria do compositor sobre a abordagem estética em suas obras e seu Sistema ¿ T, disponibilizados pelo mesmo, e que deram suporte a essa dissertação. Ao levantar essas informações, o presente trabalho tem por objetivo dar subsídios aos futuros intérpretes desta peça no desenvolvimento de uma interpretação coerente com as idéias do compositorAbstract: The subject of this dissertation is the piece "Trio das Águas" (Water¿s Trio) composed by Ricardo Tacuchian in the year 2012 and dedicated to the Terra Brasilis Trio, ensemble where the author of this dissertation acts as pianist. The first chapter addresses aspects of the composer¿s craft, his wishes and motivations to compose it, and explains the T-System (Sistema ¿T), a pitch control tool developed by the in the 1980¿s used in the composition of the "Trio das Águas". In the second chapter, we identify relevant aspects of the use of this T-System that worked as basis for the first interpretation of the piece. The interpretative suggestions are based in the collaborative work of the first interpreters with the composer, seeking a better comprehension of his ideas about the concept of the work, sonority and desirable articulations. The attachments consist of texts by the composer about the aesthetical approach in his pieces and the "Sistema ¿ T". These texts, made available by the composer himself, served as basis for this dissertation. The present dissertation has as its goal to offer support to future interpreters of this piece, facilitating the development of an interpretation coherent with the composer¿s ideasMestradoPraticas InterpretativasMestra em Músic
Simulazione e ottimizzazione di sistemi Pull mediante programmazione matematica
No full textLAUREA SPECIALISTICAIn questo lavoro di Tesi, partendo dall’approccio di simulazione mediante Programmazione Lineare (MRP), è stato sviluppato un modello approssimato che permette l’ottimizzazione dei livelli di controllo dei sistemi KCS e BSCS.In sintesi, questa tesi fornisce un nuovo approccio nel campo dell’ottimizzazione dei livelli di controllo per sistemi KCS e BSCS, utilizzando la programmazione matematica. I modelli ottenuti possono essere sfruttati come primo passo in una procedura di ottimizzazione, in quanto forniscono un algoritmo in grado di offrire una buona soluzione approssimata e robusti limiti alla soluzione esatta.Starting from the simulation approach using Mathematical Programming Representation (MRP), in this dissertation work was developed a model that allows the optimized control levels for KCS and BSCS.In summary, this thesis provides a new approach in the field of control levels optimization for KCS and BSCS systems, using Mathematical Programming Representation. The models obtained can be exploited as a first step in an optimization process, as they provide an algorithm able to offer a good approximate solution and robust bounds for the exact solution
Il protocollo anatomico piede "Shriners Hospital for Children Greenville" (SHCG Foot Model) : estrazione delle curve di normalità e applicazioni in clinica
No full textQuesto progetto di tesi nasce per essere di supporto ad un’esigenza del Laboratorio di Analisi del Movimento e Biomeccanica (LAMB) dell’ospedale “Sol et Salus” (RN) di approfondire lo studio della cinematica del piede, con il proposito di fornire diagnosi funzionali più dettagliate a pazienti con deformità podaliche. L’obiettivo di questo progetto era di studiare il protocollo piede multi-segmento “Shriners Hospital for Children Greenville (SHCG) Foot Model” attraverso un sistema stereofotogrammetrico optoelettronico, soffermandosi sulla produzione delle curve di normalità e sull’applicazione in clinica del protocollo, in particolare simulando il posizionamento dei marker su piede equino-varo-supinato.
Per raggiungere questi obiettivi, sono stati utilizzati due raccolte dati. La prima, su 8 soggetti sani, ha permesso di ottenere le curve di normalità per i 12 angoli del piede calcolati dal protocollo. Le curve ottenute presentano una buona sovrapposizione con quanto è presente in letteratura e saranno utilizzate come riferimento normativo per i futuri esami clinici del laboratorio.
La seconda, condotta su 4 soggetti sani, aveva come obiettivo lo studio della robustezza del protocollo a uno spostamento predefinito di 4 marcatori: i pazienti a cui viene applicato il protocollo in clinica possono presentare delle deformità di piede tali da non consentire il posizionamento standard dei marcatori. Questa analisi ha permesso di capire quali angoli siano robusti allo spostamento dei marcatori e quali invece debbano essere commentati con cautela, o meglio con consapevolezza degli effetti di tale riposizionamento. Inoltre, un angolo -l’angolo fra retropiede e gamba nel piano frontale– ha presentato effetti differenti tra piede destro e sinistro, suggerendo l’opportunità di ulteriori approfondimenti.
Infine, si è acquisito un caso clinico, una paziente con piede cavo, in cui si sono evidenziate le differenze tra paziente e curve di normalità ricavate in questa tesi
Exploring the relationship between public spending composition, firm productivity, and financial structure: evidence from EU manufacturing firms
No full textLAUREA MAGISTRALEQuesta tesi esamina la relazione tra la composizione della spesa pubblica e la produttività delle imprese, colmando una lacuna nella letteratura riguardo l'effetto a livello microeconomico della politica fiscale. Si indaga se l'allocazione della spesa pubblica verso funzioni produttive aumenti la Produttività Totale dei Fattori (TFP) e come tale effetto sia mediato da condizioni finanziarie e caratteristiche strutturali specifiche delle imprese.
Utilizzando un vasto insieme di dati panel a livello di impresa provenienti da aziende manifatturiere dell'UE e dati macroeconomici sulla spesa pubblica, si rileva che un aumento del livello della spesa pubblica destinata a Istruzione, Sanità e Affari Economici (EHEA) è associato a un incremento della Produttività Totale dei Fattori delle imprese. Tale risultato è coerente con l'ipotesi di crowding-in; l'assenza di effetti di crowding-out suggerisce una relazione di complementarità tra investimenti pubblici e privati. L'effetto non è omogeneo, poiché le condizioni finanziarie modellano l'impatto positivo per le imprese con maggiore esposizione al rischio e una salute finanziaria più debole, indicando che i vincoli finanziari inibiscono l'assorbimento dei benefici derivanti dagli investimenti pubblici.
Questi risultati, che si dimostrano robusti anche a fronte di una serie di specificazioni alternative, sottolineano che l'efficacia della politica fiscale dipende dalla qualità e dalla destinazione della spesa. La composizione della spesa conta più della sua dimensione aggregata, e il suo impatto a livello di impresa è influenzato in modo cruciale dalla salute finanziaria e dalla dimensione delle aziende.This thesis examines the relationship between the composition of public expenditure and firms’ productivity, addressing a gap in the literature concerning the micro-level effect of fiscal policy. It investigates whether allocating public spending toward productive functions enhances Total Factor Productivity (TFP) and how this effect is mediated by firm-specific financial conditions and structural characteristics.
Employing a large panel dataset of firm-level data from EU manufacturing firms and macroeconomic data on public expenditure, we find that an increase in the level of public spending allocated in Education, Health, and Economic Affairs (EHEA) is associated with an increase in firm Total Factor Productivity. This effect is consistent with the crowding-in hypothesis; the absence of crowding-out effects suggests a complementary relationship between public and private investment. This effect is not homogeneous, as financial conditions shape the positive impact for firms with high-risk exposure and weaker financial health, indicating that financial constraints inhibit the absorption of public investment benefits.
These findings, which are robust to a battery of alternative specifications, underscore that the effectiveness of fiscal policy relies on the quality and targeting of expenditure. The composition matters more than its aggregate size, and its impact at the firm level is crucially mediated by the financial health and size of firms
CPIExtract: a framework for collecting and harmonizing small molecule-protein interaction data from diverse databases
No full textLAUREA MAGISTRALELe interazioni tra piccole molecole (composti) e proteine sono fondamentali per le funzioni cellulari e per la comprensione dei meccanismi biologici. Tuttavia, i dati sulle interazioni composto-proteina (ICP) sono distribuiti in database diversi, ciascuno con formati e standard di mantenimento unici, creando un ostacolo significativo per i ricercatori che intendono utilizzare queste informazioni. Questo lavoro presenta CPIExtract, un framework progettato per estrarre, filtrare e armonizzare sistematicamente i dati ICP da nove principali database in un unico formato unificato. Superando l'eterogeneità dei dati, CPIExtract amplia notevolmente la raccolta accessibile di dati ICP, fornendo oltre dieci volte il numero di annotazioni disponibili rispetto ad un singolo database come DrugBank. I dataset standardizzati generati da CPIExtract permettono ai ricercatori di migliorare l'analisi e applicare facilmente le informazioni in diverse applicazioni di ricerca biomedica.
In particolare, i dati di CPIExtract contribuiscono a migliorare i modelli di machine learning, come AI-Bind, per la scoperta di farmaci. Integrare i dati ICP armonizzati nel loro training migliora la generalizzabilità e le prestazioni di questi modelli, soprattutto nella previsione delle interazioni per composti e proteine meno studiati. Questo lavoro evidenzia il potenziale di CPIExtract per accelerare la scoperta e la progettazione di agenti terapeutici, fornendo dataset robusti e completi che colmano le lacune nei database ICP esistenti.The binding interactions between small molecules (compounds) and proteins are fundamental to cellular functions and essential for understanding biological mechanisms. However, data on compound-protein interactions (CPI) are dispersed across multiple databases, each with unique formats and curation standards, creating significant challenges for researchers seeking to utilize this information. This work presents CPIExtract, a framework designed to systematically extract, filter, and harmonize CPI data from nine major databases into a single, unified format. By overcoming data heterogeneity, CPIExtract greatly expands the accessible collection of CPI data, providing over ten times the annotations available in a single database like DrugBank. The standardized datasets generated by CPIExtract enable researchers to streamline analysis and readily apply the information in disparate biomedical research applications.
Namely, CPIExtract’s data aids the improvement of machine learning models, such as AI-Bind, for drug discovery. Integrating harmonized CPI data into their training improves these models' generalizability and performance, especially in predicting interactions for understudied compounds and proteins. This work highlights CPIExtract’s potential to accelerate the discovery and design of therapeutic agents by supplying robust, comprehensive datasets that bridge the gaps in current CPI databases
Unlocking the potential of a new inertial sensor: advancements in movement analysis and functional assessment
No full textLAUREA MAGISTRALELe Unità di Misura Inerziali (IMU) hanno rivoluzionato l’analisi del movimento umano in vari settori, dalla valutazione della performance sportiva alla riabilitazione clinica. L’introduzione del sensore inerziale Microgate GykoPro rappresenta un significativo progresso rispetto al suo predecessore Gyko, con dimensioni ridotte e funzionalità onboard.
Lo studio ha sviluppato e validato nuovi algoritmi di elaborazione per l’implementazione onboard, migliorando portabilità e facilità d’uso del sensore. L’integrazione onboard di un filtro di sensor fusion Madgwick ha ottimizzato le prestazioni degli algoritmi. La qualità e la coerenza delle ricostruzioni di angoli e posizioni sono state valutate rispetto a uno standard di riferimento rappresentato dal robot collaborativo (Cobot) Doosan M1013.
Gli algoritmi per l’analisi del Range di movimento (ROM), fluidità del movimento, oscillazioni posturali, forza e potenza sono stati sviluppati e usati in diverse acquisizioni su un campione di soggetti. Durante i movimenti di flesso-estensione del ginocchio, flessione, estensione e abduzione-adduzione della spalla, sono state osservate differenze significative nel ROM e nella fluidità tra lato sinistro e destro nei 14 soggetti analizzati. I valori di ROM ottenuti sono coerenti con quelli riportati in letteratura. L’analisi posturale ha evidenziato l’importanza del feedback visivo nel mantenere la stabilità e ha rivelato differenze tra i casi di supporto monopodalico.
Una ricerca innovativa condotta su 2 soggetti ha combinato i dati provenienti dalla IMU con quelli dell’elettromiografia di superficie (sEMG) per valutare la fatica muscolare durante gli esercizi di panca piana e squat. L’analisi si concentra sulla ricerca di possibili correlazioni tra la massima velocità concentrica e i parametri calcolati sulla sEMG. Tuttavia, per ottenere risultati più robusti, sono necessarie ulteriori indagini su un numero maggiore soggetti.
In conclusione, questo studio fornisce preziose informazioni sull’ottimizzazione del sensore GykoPro e sulle sue nuove applicazioni, rappresentando un punto di partenza per sviluppi futuri e ricerche nell’analisi del movimento e nella valutazione della fatica.Inertial Measurement Units (IMUs) have revolutionized human movement analysis across various fields, from sports performance evaluation to clinical rehabilitation. The introduction of the Microgate GykoPro inertial sensor represents a significant advancement compared to its predecessor, the Gyko sensor, addressing market demands with its reduced dimensions and onboard functionality.
This study aimed to develop and validate new processing algorithms for onboard implementation, enhancing the sensor’s usability and portability. The integration of an onboard Madgwick sensor fusion filter optimized algorithms performance. Furthermore, the quality and consistency of angle and position reconstructions were evaluated against a gold standard represented by the Doosan M1013 collaborative robot (Cobot).
Algorithms for Range of Motion (ROM), Movement fluidity, Sway and Muscle Force and Power analyses were successfully developed and used to acquire meaningful metrics on a population sample. On the 14 subjects analyzed, significant differences in ROM and fluidity were observed between left and right sides during knee flexion-extension, shoulder flexion, extension and abduction-adduction demonstrating the algorithm’s ability of detecting such differences. The obtained ROM values were consistent with those reported in literature. Postural sway analysis highlighted the importance of visual feedback in maintaining stability and revealed differences across right and left monopodal support.
An innovative exploration was also conducted on 2 subjects by combining IMU output data with surface electromyography (sEMG) data to assess muscle fatigue, during the bench press and barbell squat exercises. This analysis was based on searching for potential correlations between maximum concentric velocity and parameters computed on the sEMG. However further investigations on larger number of subjects are needed to obtain more solid and robust results.
In conclusion, this study provides valuable insights into the optimization of GykoPro inertial sensor processing and novel applications, offering a useful starting point for future developments and research in movement analysis and fatigue assessment
