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High-resolution fMRI reveals a dorsal brain pathway selective for conspecific vocalizations in macaques
No full textThis dataset is associated with the article titled "High-resolution fMRI reveals a dorsal brain pathway selective for conspecific vocalizations in macaques" . The dataset includes the following: High-resolution fMRI data in NIfTI format, acquired from macaques during auditory stimulation experiments. Event files in TSV format, containing the onset and duration of each stimulus presented during scanning sessions. MATLAB scripts used to generate the main results presented in the paper
Cortical and subcortical neural bases of audio-visual social processing in macaques
No full textLa compréhension de notre environnement et de notre place dans celui-ci, repose sur de nombreux concepts que les neurosciences cherchent à éclairer. Savoir réagir correctement dans un groupe social est un processus très exigeant qui nécessite plusieurs fonctions cognitives et une perception adaptée via tous nos sens. Dans cette thèse, nous cherchons à mieux caractériser le mécanisme sous-jacent et la base neuronale de la perception audio-visuelle des stimuli sociaux et les effets de sa contextualisation. Nous avons utilisé principalement l'imagerie par résonance magnétique (IRM) fonctionnelle, mais aussi l'IRM anatomique et de diffusion ainsi que la pharmacologie sur des singes macaques. Dans la première partie de la thèse, nous nous concentrons sur le traitement audio-visuel des stimuli sociaux et démontrons une forte dépendance de la perception auditive à la signification des stimuli dans le contexte social. Nous montrons également une intégration multisensorielle dans le sillon temporal supérieur et dans la région médiane du pulvinar. Ce noyau thalamique postérieur a été particulièrement intriguant, montrant une activation dépendante de la tâche pour des stimuli identiques. En analysant la connectivité pulvino-corticale grâce à l'analyse de l'état de repos (resting state), nous validons notre hypothèse établie suite à une revue de la littérature de sa connectivité anatomique et de son implication fonctionnelle sur le cerveau. En effet, nous montrons que non seulement ce noyau présente un schéma de connectivité topographique global avec le cortex le long de trois axes d’orientation classiques (ventro-dorsal, latero-médial and antéro-postérieur) mais en plus nous rapportons de multiples champs de projection pulvinaires locaux dans plusieurs régions corticales. Une étude longitudinale nous permet, grâce aux données préliminaires, d'ajouter un point de vue développemental sur ce noyau. Nous montrons que des changements notables dans la connectivité pulvino-corticale liés à la perception socio-auditive se produisent au cours de la période pré-adolescente et adolescente chez le macaque. En annexe de cette thèse, nous présentons des études méthodologiques permettant d'acquérir une meilleure résolution avec moins d'artefacts en IRM de diffusion. Ce travail est notamment important pour fournir des données permettant de mieux analyser la connectivité anatomique et la microstructure. Dans une seconde annexe, nous montrons que l'influence de la norépinephrine sur l'attention visuo-spatiale dépend de l'environnement. Dans l'ensemble, ce travail de thèse a une contribution multi-échelle dans la compréhension du traitement social audio-visuel. Il montre de nouveaux résultats sur l'impact du contexte dans la perception socio-auditive, apporte de nouvelles preuves sur le rôle central du pulvinar comme régulateur cortical et de plus nous présentons des résultats préliminaires suggérant que les changements dans la connectivité pulvinar pourraient jouer un rôle dans le développement et le raffinement des compétences cognitives sociales. Tout ceci est montré grâce à une combinaison de plusieurs méthodes que nous avons cherché à développer ou améliorer pour atteindre nos objectifs et d’approches fondamentales pour répondre à notre principale question selon plusieurs angles et points de vue.Understanding our environment and our place in it, is based on many concepts that the neurosciences seek to shed light on. How to react properly in a social group is a highly demanding process that requires several cognitive functions and an adapted perception of all our senses. In this thesis, we search to better characterize the underlying mechanism and neural basis of audio-visual perception of social stimuli and the effects of its contextualisation. We used mainly functional magnetic resonance imaging (MRI), but also anatomical and diffusion MRI and pharmacology on macaque monkeys. In the first part of the thesis, we focus on the audio-visual processing of social stimuli and demonstrate the huge dependency of auditory perception on the meaning of the stimuli in the context. We show also a multisensory integration in the superior temporal sulcus and in the medial region of the pulvinar. This posterior thalamic nucleus has been particularly intriguing, showing a task depend activation to the same stimuli. Analysing the pulvino-cortical connectivity thank to resting state analysis, we validate our hypothesis established following a review of the literature of its anatomical connectivity and functional implication on the brain. Indeed, we show that not only this nucleus has a global topographical connectivity pattern with the cortex along three classical orienting axes (ventro_dorsal, matero-medial and antero-posterior), but in addition we report multiple local pulvinar projection fields in several cortical regions. A longitudinal study allows us, thanks to preliminary data, to add a developmental point of view on this nucleus. We show that notable changes in pulvinar-cortex connectivity linked with socio-auditory perception occur across the pre-adolescent and adolescent period in macaques. In appendix of this thesis, we show methodological studies permitting to acquire a better resolution with less artefacts for diffusion MRI. This work is notably important to provide data allowing to better anatomical connectivity and microstructure analysis. In a second appendix, we show that norepinephrine influence on visuo-spatial attention depends on the environment. Overall this thesis work has a multiscale contribution in the understanding of audio-visual social processing. It shows new results on the impact of context in socio-auditory perception, brings new evidences on the central role of the pulvinar as a cortical regulator and moreover we present preliminary result suggesting that changes in pulvinar connectivity could play a role in development and refinement of social cognitive skills. All this is shown through a combination of several methods that we have sought to develop or improve in order to achieve our objectives and fundamental approaches to answer our main question from several angles and points of view
Bases neurales corticales et sous-corticales du traitement social audio-visuel chez le macaque
No full textUnderstanding our environment and our place in it, is based on many concepts that the neurosciences seek to shed light on. How to react properly in a social group is a highly demanding process that requires several cognitive functions and an adapted perception of all our senses. In this thesis, we search to better characterize the underlying mechanism and neural basis of audio-visual perception of social stimuli and the effects of its contextualisation. We used mainly functional magnetic resonance imaging (MRI), but also anatomical and diffusion MRI and pharmacology on macaque monkeys. In the first part of the thesis, we focus on the audio-visual processing of social stimuli and demonstrate the huge dependency of auditory perception on the meaning of the stimuli in the context. We show also a multisensory integration in the superior temporal sulcus and in the medial region of the pulvinar. This posterior thalamic nucleus has been particularly intriguing, showing a task depend activation to the same stimuli. Analysing the pulvino-cortical connectivity thank to resting state analysis, we validate our hypothesis established following a review of the literature of its anatomical connectivity and functional implication on the brain. Indeed, we show that not only this nucleus has a global topographical connectivity pattern with the cortex along three classical orienting axes (ventro_dorsal, matero-medial and antero-posterior), but in addition we report multiple local pulvinar projection fields in several cortical regions. A longitudinal study allows us, thanks to preliminary data, to add a developmental point of view on this nucleus. We show that notable changes in pulvinar-cortex connectivity linked with socio-auditory perception occur across the pre-adolescent and adolescent period in macaques. In appendix of this thesis, we show methodological studies permitting to acquire a better resolution with less artefacts for diffusion MRI. This work is notably important to provide data allowing to better anatomical connectivity and microstructure analysis. In a second appendix, we show that norepinephrine influence on visuo-spatial attention depends on the environment. Overall this thesis work has a multiscale contribution in the understanding of audio-visual social processing. It shows new results on the impact of context in socio-auditory perception, brings new evidences on the central role of the pulvinar as a cortical regulator and moreover we present preliminary result suggesting that changes in pulvinar connectivity could play a role in development and refinement of social cognitive skills. All this is shown through a combination of several methods that we have sought to develop or improve in order to achieve our objectives and fundamental approaches to answer our main question from several angles and points of view.La compréhension de notre environnement et de notre place dans celui-ci, repose sur de nombreux concepts que les neurosciences cherchent à éclairer. Savoir réagir correctement dans un groupe social est un processus très exigeant qui nécessite plusieurs fonctions cognitives et une perception adaptée via tous nos sens. Dans cette thèse, nous cherchons à mieux caractériser le mécanisme sous-jacent et la base neuronale de la perception audio-visuelle des stimuli sociaux et les effets de sa contextualisation. Nous avons utilisé principalement l'imagerie par résonance magnétique (IRM) fonctionnelle, mais aussi l'IRM anatomique et de diffusion ainsi que la pharmacologie sur des singes macaques. Dans la première partie de la thèse, nous nous concentrons sur le traitement audio-visuel des stimuli sociaux et démontrons une forte dépendance de la perception auditive à la signification des stimuli dans le contexte social. Nous montrons également une intégration multisensorielle dans le sillon temporal supérieur et dans la région médiane du pulvinar. Ce noyau thalamique postérieur a été particulièrement intriguant, montrant une activation dépendante de la tâche pour des stimuli identiques. En analysant la connectivité pulvino-corticale grâce à l'analyse de l'état de repos (resting state), nous validons notre hypothèse établie suite à une revue de la littérature de sa connectivité anatomique et de son implication fonctionnelle sur le cerveau. En effet, nous montrons que non seulement ce noyau présente un schéma de connectivité topographique global avec le cortex le long de trois axes d’orientation classiques (ventro-dorsal, latero-médial and antéro-postérieur) mais en plus nous rapportons de multiples champs de projection pulvinaires locaux dans plusieurs régions corticales. Une étude longitudinale nous permet, grâce aux données préliminaires, d'ajouter un point de vue développemental sur ce noyau. Nous montrons que des changements notables dans la connectivité pulvino-corticale liés à la perception socio-auditive se produisent au cours de la période pré-adolescente et adolescente chez le macaque. En annexe de cette thèse, nous présentons des études méthodologiques permettant d'acquérir une meilleure résolution avec moins d'artefacts en IRM de diffusion. Ce travail est notamment important pour fournir des données permettant de mieux analyser la connectivité anatomique et la microstructure. Dans une seconde annexe, nous montrons que l'influence de la norépinephrine sur l'attention visuo-spatiale dépend de l'environnement. Dans l'ensemble, ce travail de thèse a une contribution multi-échelle dans la compréhension du traitement social audio-visuel. Il montre de nouveaux résultats sur l'impact du contexte dans la perception socio-auditive, apporte de nouvelles preuves sur le rôle central du pulvinar comme régulateur cortical et de plus nous présentons des résultats préliminaires suggérant que les changements dans la connectivité pulvinar pourraient jouer un rôle dans le développement et le raffinement des compétences cognitives sociales. Tout ceci est montré grâce à une combinaison de plusieurs méthodes que nous avons cherché à développer ou améliorer pour atteindre nos objectifs et d’approches fondamentales pour répondre à notre principale question selon plusieurs angles et points de vue
Bases neurales corticales et sous-corticales du traitement social audio-visuel chez le macaque
No full textUnderstanding our environment and our place in it, is based on many concepts that the neurosciences seek to shed light on. How to react properly in a social group is a highly demanding process that requires several cognitive functions and an adapted perception of all our senses. In this thesis, we search to better characterize the underlying mechanism and neural basis of audio-visual perception of social stimuli and the effects of its contextualisation. We used mainly functional magnetic resonance imaging (MRI), but also anatomical and diffusion MRI and pharmacology on macaque monkeys. In the first part of the thesis, we focus on the audio-visual processing of social stimuli and demonstrate the huge dependency of auditory perception on the meaning of the stimuli in the context. We show also a multisensory integration in the superior temporal sulcus and in the medial region of the pulvinar. This posterior thalamic nucleus has been particularly intriguing, showing a task depend activation to the same stimuli. Analysing the pulvino-cortical connectivity thank to resting state analysis, we validate our hypothesis established following a review of the literature of its anatomical connectivity and functional implication on the brain. Indeed, we show that not only this nucleus has a global topographical connectivity pattern with the cortex along three classical orienting axes (ventro_dorsal, matero-medial and antero-posterior), but in addition we report multiple local pulvinar projection fields in several cortical regions. A longitudinal study allows us, thanks to preliminary data, to add a developmental point of view on this nucleus. We show that notable changes in pulvinar-cortex connectivity linked with socio-auditory perception occur across the pre-adolescent and adolescent period in macaques. In appendix of this thesis, we show methodological studies permitting to acquire a better resolution with less artefacts for diffusion MRI. This work is notably important to provide data allowing to better anatomical connectivity and microstructure analysis. In a second appendix, we show that norepinephrine influence on visuo-spatial attention depends on the environment. Overall this thesis work has a multiscale contribution in the understanding of audio-visual social processing. It shows new results on the impact of context in socio-auditory perception, brings new evidences on the central role of the pulvinar as a cortical regulator and moreover we present preliminary result suggesting that changes in pulvinar connectivity could play a role in development and refinement of social cognitive skills. All this is shown through a combination of several methods that we have sought to develop or improve in order to achieve our objectives and fundamental approaches to answer our main question from several angles and points of view.La compréhension de notre environnement et de notre place dans celui-ci, repose sur de nombreux concepts que les neurosciences cherchent à éclairer. Savoir réagir correctement dans un groupe social est un processus très exigeant qui nécessite plusieurs fonctions cognitives et une perception adaptée via tous nos sens. Dans cette thèse, nous cherchons à mieux caractériser le mécanisme sous-jacent et la base neuronale de la perception audio-visuelle des stimuli sociaux et les effets de sa contextualisation. Nous avons utilisé principalement l'imagerie par résonance magnétique (IRM) fonctionnelle, mais aussi l'IRM anatomique et de diffusion ainsi que la pharmacologie sur des singes macaques. Dans la première partie de la thèse, nous nous concentrons sur le traitement audio-visuel des stimuli sociaux et démontrons une forte dépendance de la perception auditive à la signification des stimuli dans le contexte social. Nous montrons également une intégration multisensorielle dans le sillon temporal supérieur et dans la région médiane du pulvinar. Ce noyau thalamique postérieur a été particulièrement intriguant, montrant une activation dépendante de la tâche pour des stimuli identiques. En analysant la connectivité pulvino-corticale grâce à l'analyse de l'état de repos (resting state), nous validons notre hypothèse établie suite à une revue de la littérature de sa connectivité anatomique et de son implication fonctionnelle sur le cerveau. En effet, nous montrons que non seulement ce noyau présente un schéma de connectivité topographique global avec le cortex le long de trois axes d’orientation classiques (ventro-dorsal, latero-médial and antéro-postérieur) mais en plus nous rapportons de multiples champs de projection pulvinaires locaux dans plusieurs régions corticales. Une étude longitudinale nous permet, grâce aux données préliminaires, d'ajouter un point de vue développemental sur ce noyau. Nous montrons que des changements notables dans la connectivité pulvino-corticale liés à la perception socio-auditive se produisent au cours de la période pré-adolescente et adolescente chez le macaque. En annexe de cette thèse, nous présentons des études méthodologiques permettant d'acquérir une meilleure résolution avec moins d'artefacts en IRM de diffusion. Ce travail est notamment important pour fournir des données permettant de mieux analyser la connectivité anatomique et la microstructure. Dans une seconde annexe, nous montrons que l'influence de la norépinephrine sur l'attention visuo-spatiale dépend de l'environnement. Dans l'ensemble, ce travail de thèse a une contribution multi-échelle dans la compréhension du traitement social audio-visuel. Il montre de nouveaux résultats sur l'impact du contexte dans la perception socio-auditive, apporte de nouvelles preuves sur le rôle central du pulvinar comme régulateur cortical et de plus nous présentons des résultats préliminaires suggérant que les changements dans la connectivité pulvinar pourraient jouer un rôle dans le développement et le raffinement des compétences cognitives sociales. Tout ceci est montré grâce à une combinaison de plusieurs méthodes que nous avons cherché à développer ou améliorer pour atteindre nos objectifs et d’approches fondamentales pour répondre à notre principale question selon plusieurs angles et points de vue
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Full text linkWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
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