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Desarrollo de métodos (bio)electroquímicos que faciliten la determinación de analitos de interés en el campo de la salud y las fuentes de energía renovables
Get PDFEste trabajo de Tesis se orientó al desarrollo de métodos analíticos alternativos a los hoy vigentes, que faciliten la determinación de compuestos de interés tanto para diagnóstico clínico como para la industria de combustibles alternativos. Se realizaron aportes para tres situaciones de relevancia: diagnóstico de toxoplasmosis, tuberculosis y evaluación de calidad de biodiesel. La toxoplasmosis es una parasitosis causada por Toxoplasma gondii que afecta a humanos sin generar complicaciones, excepto cuando los infectados son inmunodeprimidos o mujeres embarazadas que no cursaron previamente la enfermedad. En este caso, el parásito puede atravesar placenta, generando infección congénita del feto, pudiendo producirle graves consecuencias que pueden llegar a la muerte. Una de las técnicas de diagnóstico utiliza el ensayo de inmunoadsorción ligado a enzima, permitiendo la detección de anticuerpos específicos contra el parásito, los cuales son indicadores de existencia de infección. No obstante, para detectar toxoplasmosis aguda, al día de hoy se carece de una estandarización confiable, principalmente en la preparación del antígeno. Por ello, en este trabajo se procuró identificar regiones donde se codificarán algunos marcadores de fase aguda que concentrarán una alta proporción de determinantes antigénicos para luego clonarlas, expresarlas como proteínas recombinantes, marcarlas con biotina y así utilizarlas como sistema de revelado de anticuerpos específicos contra proteínas de T. gondii. Los inmunoensayos aquí presentados proponen una metodología que permitirá en un futuro distinguir sueros provenientes de individuos con infección aguda de aquellos con infección crónica o no infectados.
La tuberculosis es una enfermedad infecto-contagiosa causada por la bacteria Mycobacterium tuberculosis. Su diagnóstico se basa en una serie de estudios que finaliza con la identificación del agente etiológico en cultivos obtenidos a partir de esputo. Esta identificación puede demorar aproximadamente dos meses, debido al prolongado tiempo de replicación de la micobacteria. Esto conlleva la potencialidad de contagio a individuos sanos y un compromiso importante de la salud del infectado. Últimamente, se han desarrollado técnicas indirectas de detección de M. tuberculosis utilizando el bacteriófago D29, capaz de infectar específicamente micobacterias. Es una metodología donde se facilita la replicación del fago en la muestra proveniente del paciente, para luego evaluar el título de fagos liberados, infectando un cultivo testigo de
Micobacterium smegmatis, micobacteria de replicación rápida. Siendo el glicerol fuente de carbono en cultivos de micobacterias, se planteó determinar su concentración remanente como método de evaluar integridad de M. smegmatis estableciéndose así una medida indirecta de la previa presencia de M. tuberculosis en la muestra problema. Además, el glicerol es el principal subproducto en la elaboración del biodiesel y su concentración es indicativa de la calidad del combustible, transformándose en analito relevante para la industria de energías alternativas a la derivada del petróleo. Se desarrollaron y validaron dos métodos amperométricos de cuantificación de glicerol: a) Con electrodo de oro en NaOH 0,1 M, aplicable a medios acuosos (LD 10 μM, intervalo lineal 0,024 a 2,00 mM), b) Con bioelectrodo de pasta de C modificada con glicerol deshidrogenasa, aplicable a medios complejos, como cultivos bacterianos (LD 20 M, intervalo lineal: 0,060 a 1,75 mM).Fil: Faccendini, Pablo Luis. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Cienicas Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Química Rosario (IQUIR-CONICET); Argentina
Selective application of two rapid, low-cost electrochemical methods to quantify glycerol according to the sample nature
No full textThe selection of the method to quantify glycerol largely depends on the amount present in the sample, the matrix nature where glycerol has to be determined, and the potential interferences accompanying the analyte. We compared different electrochemical methods to determine glycerol in terms of convenience, from the point of view of the sample nature, the time spent to accomplish the analysis, the preferably use of green consumables, the limit of detection (LD), and the operational cost. We studied two alternative methodologies based on amperometric measurements to determine glycerol. In aqueous media, we use the versatile gold electrode, being the linear range 2.5 × 10−5 to 2.0 × 10−3 M, and the LD 10 μM (3 × SDb, standard deviation of the blank). In extremely complex matrixes, where many electroactive species are expected to be present, we propose to use a new approach based on biosensor technology, which takes advantage of an inexpensive, soluble redox mediator, and uses only one enzyme with its cofactor in solution. The substrate was a glassy carbon paste electrode; the system used the enzyme glycerol dehydrogenase, soluble NAD+ as cofactor, and ferricyanide as charge mediator. The response showed to be linear between 7.0 × 10−5 and 1.8 × 10−3 M, and the LD was 20 μM. The biosensor displayed more than two month stability without the enzyme losing activity when kept dried at 4 °C. The time taken to complete the analysis was 10 min, counting from the moment the sample was taken until the signal was recorded. The operational cost of the whole analysis was less than that derived of using other biosensors or a spectrophotometric assay.Fil: Faccendini, Pablo Luis. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Rosario. Instituto de Química Rosario; ArgentinaFil: Ribone, María Élida. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Rosario. Instituto de Química Rosario; ArgentinaFil: Lagier, Claudia Marina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Rosario. Instituto de Química Rosario; Argentin
Evaluation and Comparison of the Ability of Online Available Prediction Programs to Predict True Linear B-cell Epitopes
Get PDFThis work deals with the use of predictors to identify useful B-cell linear epitopes to develop immunoassays. Experimental techniques to meet this goal are quite expensive and time consuming. Therefore, we tested 5 free, online prediction methods (AAPPred, ABCpred, BcePred, BepiPred and Antigenic) widely used for predicting linear epitopes, using the primary structure of the protein as the only input. We chose a set of 65 experimentally well documented epitopes obtained by the most reliable experimental techniques as our true positive set. To compare the quality of the predictor methods we used their positive predictive value (PPV), i.e. the proportion of the predicted epitopes that are true, experimentally confirmed epitopes, in relation to all the epitopes predicted. We conclude that AAPPred and ABCpred yield the best results, as compared with the other programs and with a random prediction procedure. Our results also indicate that considering the consensual epitopes predicted by several programs does not improve the PPV.Fil: Costa, Juan Gabriel. Universidad Nacional del Litoral. Facultad de Bioquímica y Ciencias Biológicas. Laboratorio de Tecnología Inmunológica; ArgentinaFil: Faccendini, Pablo Luis. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Rosario. Instituto de Química Rosario; ArgentinaFil: Sferco, Silvano Juan. Universidad Nacional del Litoral. Facultad de Bioquímica y Ciencias Biológicas. Departamento de Física; ArgentinaFil: Lagier, Claudia Marina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Rosario. Instituto de Química Rosario; ArgentinaFil: Marcipar, Ivan Sergio. Universidad Nacional del Litoral. Facultad de Bioquímica y Ciencias Biológicas. Laboratorio de Tecnología Inmunológica; Argentin
Optimización de las condiciones del proceso de acondicionamiento y obtención de harina integral del grano de quinoa (Chenopodium quinoa Willd.) en relación a su capacidad antioxidante y antimicrobiana
No full textLa quinoa (Chenopodium quinoa Willd) es considerada un pseudocereal. Constituye un cultivo estratégico para contribuir a la seguridad y soberanía alimentaria debido a su calidad nutritiva, amplia variabilidad genética, adaptabilidad y bajo costo de producción. Contiene compuestos bioactivos, como los compuestos fenólicos que contribuyen a diversas actividades fisiológicas, antimicrobianas, antinflamatorias y anticancerígenas. El grano entero puede incorporarse a sopas, ensaladas y guisos, pero también puede ser molido para obtener una harina, que se emplea en la elaboración de diversos panificados o pueden maltearse y fermentar para obtener cerveza. Además, las semillas pueden ser germinadas (brotes para ensaladas), tostadas o infladas para elaborar alimentos para desayuno y snacks. En general, es necesario exponer los granos de cereales y pseudocereales al secado, con el propósito de adecuar el contenido de humedad para asegurar su conservación. Asimismo, las condiciones de secado de estos granos pueden originar variaciones en el rendimiento de la molienda, concomitantes con la cantidad y el valor de los productos y subproductos que se obtengan. Los alimentos deshidratados siempre han sido utilizados para consumo directo en épocas de escasez, sin embargo, actualmente están siendo muy utilizados para la formulación de otros tipos de alimentos, ya sea como ingredientes de alimentos funcionales, de ahí su importancia. En consecuencia, es necesario evaluar el efecto de la operación de secado y los parámetros que la regulan, sobre el rendimiento y sobre las propiedades antioxidantes y antimicrobianas de la harina de quinoa, obtenida por molienda de los granos secados. Con el
objetivo de preservar la retención de componentes funcionales, como los antioxidantes, una herramienta adecuada para definir las condiciones operativas de secado es el uso de modelos matemáticos de simulación y optimización validados. En este contexto, se propuso optimizar las condiciones del proceso de acondicionamiento y obtención de harina integral del grano de Quínoa (Chenopodium Quínoa Willd variedad Hualhuas) en relación a su capacidad antioxidante y antimicrobiana. Para ello se realizaron experiencias de secado a las temperaturas de 40º, 60º y 80ºC y dos velocidades de aire de secado, 0,2 y 0,7 m/s. Se aplicó un modelo de difusión de Fick de transferencia de humedad, para estimar la evolución temporal de la distribución radial del contenido de humedad local en los granos de quinoa durante el secado. Fue posible modelar esta operación unitaria, obteniendo una alta precisión entre los datos experimentales y los estimados mediante la aplicación del modelo. Se obtuvo el coeficiente de difusividad efectiva, que resultó influenciado por la temperatura del grano y el coeficiente de transferencia de masa que resultó afectado por la velocidad del aire de secado. Los coeficientes de difusión obtenidos para los granos de quinoa se encuentran dentro de los intervalos reportados por la bibliografía. Los resultados de los tratamientos térmicos a diferentes condiciones de temperatura y velocidad aplicados sobre las semillas, mostraron que los mayores incrementos en los niveles de actividad antioxidante y en el contenido de compuestos fenólicos totales, se alcanzaron utilizando temperaturas de secado de 80°C. En cambio, el aumento de la temperatura de secado produjo una disminución en el contenido de flavonoides. Ninguno de los extractos hidroalcohólicos obtenidos a partir de las harinas de quinoa presentó actividad antimicrobiana, para las concentraciones ensayadas. Para el modelo, se obtuvieron valores de Error Cuadrático Medio (ECM) bajos y altos de R2, siendo el modelo satisfactorio para describir el proceso de secado. Como se esperaba, el uso de temperaturas de secado más altas promueve una mayor movilidad del agua en los sistemas alimentarios desde el interior hasta la superficie y aumenta la difusividad efectiva de la transferencia de masa.Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Exactas, Ingeniería y Agrimensur
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Get PDFThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Get PDF“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Get PDFWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Get PDFWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
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