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Development of microbial community simulation methods to characterize and analyze the effects of metal concentrations on pathogen silencing/promotion
No full textDissertação de mestrado em BioinformaticsGenome-scale metabolic modeling has become a widespread methodology for analyzing microbial metabolism.
The mathematical modeling of these networks has proven itself as an indispensable tool for understand ing microbes by predicting their behavior and systematically allowing the testing of different hypotheses.
On microbial communities, it further allows the prediction of interactions at the level of metabolites and
metabolic reactions, therefore providing valuable insights on the inner working of the vast networks they
constitute. Current extensions of this methodology have considered the addition of enzymatic data to
single models in order to further constraint reaction fluxes and produce far more accurate results.
The goal of the research presented in this dissertation is to combine different methodologies currently
in existence in order to create a methodology that allows the effective and accurate simulation of the
behaviour of gut microbial species inside a communal space. These simulations will ultimately aim to
predict growth under low levels of transition metals in situations that resemble those of infection, where the
host limits the availability of iron and other elements essential to all life forms in order to fight pathogenesis.
Through the combination of the enhancement of models with enzymatic data with the creation of
compartmentalized models under different simulation methods, the devised work aimed to extend both
existent methodologies and produce results that were improved throughout the entirety of the work by
basing and aiming to replicate provided results obtained from in vitro conditions. The obtained results
reveal not only that the enhancement of models with enzyme constraints provide community stability but
also the extension of the capabilities of community simulation methods previously established.
The results of this work constitute a novel approach to the simulation of gut microbial communities that
revealed the impact the enhancement process has on both the way models behave in singular settings and
also in providing community stability. Moreover, the devised approach and subsequent results provide the
oportunity of extension and improvement with ever more data in the application to similar or other study
cases.A simulação metabólica de modelos em escala genômica tornou-se uma metodologia proeminente na
análise do metabolismo microbiano. A modelação matemática destas redes tem-se provado continuamente como uma ferramenta indispensável na compreensão do comportamento de microorganismos ao
prever o seu comportamento, permitindo assim a sistematização da testagem de diferentes hipóteses.
Em comunidades microbianas, esta permite ainda a previsão das interações ao nível dos metabolitos e
reações, conferindo assim uma visão mais alargada do funcionamento interno destas vastas redes por
eles constituídas. As extensões para esta metodologia atualmente utilizadas como a adição de restrições
enzimáticas têm como objetivo o aumento das restrições aplicadas a cada modelo, de modo a que estes
produzam resultados cada vez mais precisos.
O objetivo deste projeto de investigação apresentado nesta dissertação passa pela combinação de
diferentes metodologias atualmente existentes de modo a proceder à criação de uma nova metodologia
que permita a simulação do comportamento de espécies microbianas do trato intestinal inseridas num
espaço comunitário. Estas simulações terão como objetivo final a capacidade de prever o seu crescimento
sobre baixos níveis de metais de transição em situações que se assemelham ás de infeção, onde o
hospedeiro limita a disponibilidade de ferro e outros elementos essenciais à vida de modo a combater a
patogénese.
Através da combinação do melhoramento de modelos pela adição de restrições enzimáticas com a criação de modelos compartimentalizados sobre diferentes métodos de simulação, o present trabalho visou
a extensão de ambas as metodologias e produzir resultados que foram sistematicamente aprimorados por
se basearam e emularem resultados obtidos em condições in vitro. Os resultados obtidos revelam que
não só o melhoramento dos modelos com restrições enzimáticas promovem a estabilidade comunitária,
mas também que extendem as capacidades de métodos previamente estabelecidos.
Os resultados deste trabalho consitutem uma nova abordagem para a simulação de comunidades
microbianas intestinais que revelam o impacto que o processo de melhoramento teve na maneira como
os modelos se comportam, assim como na promoção da estabilidade das comunidades. Adicionalmente,a abordagem desenvolvidade e subsequentemente, os seus resultados, são passíveis de extensão e melhoramento para ainda mais dados de modo a serem aplicados a estudos similares ou extendidos a outros
casos de estudo
Assédio moral no direito do trabalho e a aplicação da teoria da indenização punitiva no quantum indenizatório
No full textDissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Jurídicas, Programa de Pós-Graduação em Direito, Florianópolis, 2015.O presente trabalho tem o objetivo de verificar, a partir da análise do modelo jurisprudencial brasileiro, se as indenizações por dano moral em decorrência de assédio moral no Direito do Trabalho são concedidas com caráter punitivo, bem como se o sistema normativo brasileiro permite a utilização da teoria da função punitiva para a quantificação do seu valor. Diante destas questões, a partir do estudo das causas e consequências do instituto do assédio moral no Direito do Trabalho, o trabalho estabelece a sua natureza jurídica, bem como apresenta uma proposta de um conceito operacional do assédio moral. A partir de uma pesquisa jurisprudencial realizada no âmbito do Tribunal Superior do Trabalho, busca-se estabelecer uma classificação quanto às condutas vedadas que geram o assédio moral, bem como, quanto aos principais critérios utilizados pelos julgadores no arbitramento do quantum indenizatório nas condenações por dano moral decorrentes de assédio moral no âmbito das relações de trabalho. Ainda, o presente trabalho analisa as principais teorias, requisitos essenciais e funções da Responsabilidade Civil na contemporaneidade, bem como a aplicabilidade da teoria dos punitive damages do Direito norte-americano e inglês ao Direito brasileiro. Por fim, analisa a aplicabilidade ou não da função punitiva da Responsabilidade Civil no Direito do Trabalho, suas limitações normativas e principiológicas, a partir dos principais critérios utilizados pelos julgadores no arbitramento do valor da indenização por danos morais decorrentes de assédio moral, para ao final apresentar uma crítica quanto à utilização da função punitiva pelos Tribunais Trabalhistas brasileiros.Abstract : This study aims to verify, based on the analysis of the Brazilian court decisions, if indemnities for moral damage resulting from moral harassment in Labor Law are awarded with punitive character, as well as if the Brazilian law permits the use of the punitive function theory to quantify their value. In view of these issues, studying the causes and consequences of the institute of moral harassment in Labor Law, this work establishes its legal nature and presents a proposal for an operational concept of moral harassment. Based on a case research conducted in the ambit of the Superior Labor Court, it seeks to establish a classification regarding prohibited conduct that generate moral harassment, as well as the main criteria used by judges in the arbitration of indemnity quantum in condemnations for moral damage due to moral harassment in the ambit of labor relations. Additionally, this work analyzes the main theories, essential requirements and roles of civil liability in contemporary times, as well as the applicability of the theory of punitive damages of the North American and English Law to the Brazilian Law. Lastly, it analyzes whether the punitive function of civil liability is applicable or not in Labor Law, its normative and principlebased limitations, given the main criteria used by judges in the arbitration of the value of the indemnity for moral damages arising from moral harassment and, at the end, it presents a critique regarding the use of the punitive function by Brazilian Labor Courts
Estudos sobre a gestão do programa esporte e lazer da cidade
No full textV657 Vieira, Larissa Haddad Souza. Estudos sobre a gestão do programa esporte e lazer da cidade / Larissa Haddad Souza Vieira. – Brasília : Gráfica e Editora Ide- al, 2011. 188 p. ; 30 cm. ISBN: 978-85-89196-49-9 1. Esporte. 2. Lazer. 3. Programa de governo. I. Título. CDU 796O PRÊMIO BRASIL busca incentivar, apoiar e valorizar produções científicas, tec- nológicas, jornalísticas e pedagógicas que possam contribuir para a qualificação e inovação de Políticas Públicas de Esporte e Lazer de Inclusão Social. Lançado em 2008 pelo Minis- tério do Esporte, este concurso público que teve sua segunda edição no ano de 2010, selecio- nou e premiou diversos trabalhos.REDE CEDE
ESTUDOS SOBRE A GESTÃO DO PROGRAMA ESPORTE E LAZER DA CIDADE
No full textLIVRO PREMIADO PELA REGIÃO SUDESTE NO PRÊMIO BRASIL DE ESPORTE E LAZER DE INCLUSÃO SOCIALVIEIRA, Larissa Haddad Souza, M. Sc., Universidade Federal de Viçosa, maio de 2010. Estudos sobre a gestão do Programa Esporte e Lazer da Cidade. Orientadora: Suely de Fátima Ramos Silveira. Coorientadores: Marco Aurélio Marques Ferreira e Karla Maria Damiano Teixeira. Esta dissertação aborda o Programa Esporte e Lazer da Cidade (PELC), de iniciativa do Ministério do Esporte, avaliando resultados de sua aplicação e buscando, também, à luz dos conceitos teóricos associados à avaliação de projetos, programas e políticas públicas, discutir o esporte e o lazer enquanto questões de políticas públicas. O estudo organiza-se em quatro capítulos, sendo o primeiro teórico (bibliográfico) e os demais empíricos, um predominantemente quantitativo e dois qualitativos. Foram utilizados como instrumentos metodológicos os seguintes procedimentos: pesquisa bibliográfica; coleta de dados primários, por entrevistas, e secundários, pelo acesso ao banco de dados da Secretaria Nacional de Desenvolvimento de Esporte e Lazer (SNDEL); Análise Exploratória de Dados (AED); Análise Envoltória de Dados (DEA); Análise de Conteúdo. Através da consecução desta dissertação, foram ressaltadas algumas características do PELC: a heterogeneidade de seus convênios; a importância de seus processos de formação e de avaliação; a necessidade de melhor aplicação de recursos financeiros e humanos em direção a maiores e melhores resultados; a necessidade de maior enfoque do programa no estímulo à gestão local, minimizando efeitos negativos do baixo orçamento federal destinado ao mesmo; a necessidade de seu desenvolvimento, bem como de uma Política Nacional de Esporte/Lazer, como política de Estado, ultrapassando questões políticas governamentais. Sendo o PELC um programa relativamente jovem, com apenas sete anos de implementação, encontra-se em desenvolvimento, podendo e devendo ser aperfeiçoado visando a uma maior efetividade da atuação pública, tanto em nível federal quanto nas esferas estadual e municipalPRÊMIO BRASIL/REDE CEDES/MINISTÉRIO DO ESPORT
Contribuição ao conhecimento dos recursos hídricos subterrâneos da bacia hidrográfica do Rio Araranguá, SC
No full textTese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Filosofia e Ciências Humanas. Programa de Pós-graduação em GeografiaEsta tese de doutoramento tem como objeto de estudo a Bacia Hidrográfica do Rio Araranguá, situada ao sul do Estado de Santa Catarina. A escolha dos recursos hídricos subterrâneos como tema da proposta desta tese de Doutorado centra-se, em um primeiro momento, no objetivo de subsidiar o preenchimento de uma grande lacuna, relacionada ao estágio atual do conhecimento destes recursos, no que se refere a tipos de sistema aqüífero presentes nesta bacia hidrográfica bem como às suas potencialidades, aspectos qualitativos, vulnerabilidade natural e riscos de contaminação. O mapeamento geológico baseado em critérios litofaciológicos permitiu a individualização em mapa, no Membro Siderópolis (terço superior da Formação Rio Bonito), de três seqüências distintas: Seqüência Superior # Areias Transgressivas; Seqüência Média # Barro Branco; e Seqüência Inferior # Bonito. Permitiu verificar-se também que os Depósitos de Leques Aluviais afloram numa área de 1088 km2 nesta bacia. Foram cadastrados 582 pontos de água, sendo 148 referentes aos poços tubulares profundos, 316, aos poços escavados, 60, aos poços-ponteiras e 58, às fontes, tendo também sido classificados seus usos. São apresentados, em escala 1:100.000, os seguintes mapas: Geológico, Hidrogeológico, Vulnerabilidade Natural dos Aqüíferos Porosos Profundos, Vulnerabilidade Natural dos Leques Aluviais, Fontes de Poluição, Hidroquímico e Produtividade dos Poços. O mapeamento hidrogeológico permitiu a identificação de 8 sistemas aqüíferos, sendo 4 relacionados às rochas sedimentares gonduânicas, 3 aos sedimentos quaternários e um relacionado às rochas basálticas
A Pre-sença da capoeira na vida de alunos em duas escolas municipais de São José, SC
No full textDissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Desportos, Programa de Pós-Gradução em Educação Física, Florianópolis, 2011A capoeira encontra-se hoje inserida sob diversas formas nas escolas, com crescente destaque às aulas de Educação Física. Se a referência a seu rico contexto histórico e cultural originário, relacionado também à marginalidade, é frequentemente evocada na justificativa de sua valorização pelas escolas, pouco se questiona sobre a intensidad e do significado que esta experiência com a capoeira pode exercer na vida (existência) dos alunos que a praticam na escola. Tratando-se de uma pesquisa de bases fenomenológica e de caráter existencialista, buscamos compreender como alguns alunos de duas escolas municipais em São José, SC, significaram sua experiência com a capoeira na escola. Para entendermos a intensidade de construção de significados na vida dos sujeitos-alunos estudados, buscamos entendê-los em seu mundo mais cotidiano (mundo-vivido) e em seu Se-movimentar nas aulas de capoeira nas escolas. Utilizamos procedimentos de acesso aos significados subjetivos por eles construídos em seus mundos por meio de entrevistas, observações participantes nas aulas de capoeira e de algum procedimentos midiáticos com fotos e edição e confecção de um pequeno filme com cada aluno-sujeito. Os sujeitos-alunos pareceram significar a capoeira em suas vidas das mais variadas formas, seja como atividade prazerosa e complementar às experiências de movimento, como uma atividade que ganha perspectivas de aplicação no futuro (#ser professor de capoeira#), ou mesmo como uma forma de construção de uma identidade positiva de si frente aos outros, como uma #estratégia de sobrevivência# construída frente às situações de violência (física, social e moral) experimentadas existenciariamente. As reflexões resultantes do estudo são de caráter filosófico e apontam para a necessidade de conhecimento sobre o Ser (existência) nas atividades educativas desenvolvidas na escola, ou seja, de diálogo e problematização com o mundo-vivido dos educandos. Com relação às aulas de capoeira nas escolas, observou-se um potencial educativo latente em sua forma particular de trabahar com uma leitura de mundo que talvez possa dialogar e fazer sentidos no mundo daqueles educandos oriundos de contextos de carências materiais e existenciais, tidos como #bagunceiros#, trazendo-os positivamente às práticas escolares e estimulando suas perspectivas de futuro e de #querer viver# humano. Em certa medida, e para alguns sujeitos, a capoeira e existência parecem confundir-se, tal a significância da primeira para a #vida# do Ser.Capoeira is now included in various forms in schools, with growing emphasis on physical education classes. If the reference to its rich historical and cultural origin, also related to marginality, is often invoked in justification of his appreciation for the schools, there is little question about the intensity of the meaning that this experience with capoeira can have in life (existence) of the students who practice it at school. Being a research based in a phenomenological-existentialist character, we understand how some students from two public schools in San José, SC, meant their experience with capoeira in the school. To understand the intensity of meaning in life of the subjects studied, we seek to understand them in their everyday world (world-lived) and their Se-movimentar in capoeira classes at the schools. We used procedures for accessing the subjective meanings constructed by them in their world through interviews, participant observations in capoeira classes and some procedures with photos and media editing and also making a short film with each student-subject. The subjects-students seemed to signify the capoeira in their lives in many different forms, whether as a pleasurable activity and complement in the experience of movement as, an activity that gets prospects for application in the future ("to be a professor of capoeira), or even as a way of constructing a positive identity of themselves concerning others, as a "survival strategy" built by the subject facing situations of violence (physical, social and moral) existenciarily experienced. The reflections from the study are of philosophical nature and point to the need for knowledge about Being (existence) in educational activities at school, that is, dialogue and questioning with the students' lived-world. With respect to capoeira classes in schools, there was a latent educational potential in their particular way of annuities with a reading of the world that can maybe talk and make sense in the world of those students that come from contexts of material deprivation and existential deemed "mischief", bringing them positively to school practices and encouraging their future prospects and of #wanting to live" human desire. To some extent, and for some subjects, capoeira and existence seem to be confused, as we note the significance of the first on the "life" of the Being
Teatralidade e sociabilidade no planejamento urbano na Ilha de Santa Catarina: um caminho entre o passado e o presente, a técnica e a política, a política e a festa
No full textTese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Filosofia e Ciências Humanas. Programa de Pós-Graduação em Antropologia Social.A tese tem como objeto as formas de expressão coletivas e os espaços de sociabilidade desenvolvidos nos processos de conflitos e tentativas de negociação com o Estado durante a elaboração de planos diretores para a região do Campeche, bairro localizado no município de Florianópolis, entre os anos 1990 e meados dos anos 2000. A pesquisa procurou identificar os atores envolvidos, as formas associativas que surgiram e as redes de relações que se formaram entre os moradores da localidade e a partir deles. Foram analisadas: a percepção dos moradores sobre o processo de urbanização da região; as ações do Estado na produção da legalidade urbana; os dispositivos legais consolidados na legislação brasileira e municipal sobre o uso da terra, sobre a participação pública e sobre a gestão da cidade; e os eventos públicos bem como as estratégias de ação e mobilização dos moradores. Entre as fontes utilizadas estão documentos oficiais, periódicos, sítios e mensagens eletrônicas, entrevistas, observação e participação de eventos de diversos tipos (assembleias de moradores, reuniões de associações, festas, audiências públicas e reuniões entre funcionários públicos, vereadores e moradores), além de trabalhos acadêmicos sobre o tema. As principais formulações teóricas que contribuíram para a pesquisa foram: a noção de teatralidade, relacionada à dimensão simbólica do poder, e a política como estrutura de ação em Clifford Geertz; a noção de sociabilidade proposta por Georg Simmel e a relação com o desenvolvimento de culturas subjetivas e formas associativas; a noção de poder como modo de ação sobre a ação do outro e de resistência como constitutiva das relações de poder de Michel Foucault, assim como a noção de economia das ilegalidades deste mesmo autor; e, por fim, algumas das questões propostas pela abordagem metodológica de Bruno Latour em sua teoria ator-rede (actor-network-theory), trazendo conceitos como associação, porta-voz, mediador e controvérsia, além das questões relativas à relação entre ciência e política. O texto resultante da pesquisa apresenta uma descrição que procura dar visibilidade à produtividade de atores, aos eventos e às formas associativas decorrentes dos conflitos e tentativas de negociação em pauta, assim como às relações de poder, controvérsias e ações de atores diversos no processo de produção da legislação urbana.This dissertation takes as its object of study the forms of collective expression and the spaces of sociality developed during the conflicts and negotiations with the State during the elaboration of the urban plans for the Campeche region in the south of Florianópolis, from the 1990s until the middle of the first decade of the 21st Century. The study strove to identify the primary actors and manners in which people associated, as well as the networks of relationships that were developed in the process. The dissertation analyzes: 1) the perception of citizens about the urbanization process of the region, 2) the actions of the state and the production of urban legality, 3) the legal devices consolidated in Brazilian and municipal law on land use, public participation, and municipal administration, 4) public events and political strategies of citizens. Other resources include official documents, periodicals, electronic bulletin boards and email lists, interviews, observation and participation at many events (assemblies, association meetings, festivals, public meetings and meetings with officials, assemblymen, and citizens), as well as academic papers on the subject. The theories used as a basis for the study include, 1) The notion of theatrality and its relation to the symbolic dimension of power, and politics as a structure of action in Clifford Geertz, 2) the notion of sociability proposed by Georg Simmel and the relationship with the development of subjective cultures and forms of association, 3) the notion of power as action over the action of the other, and resistance as constitutive of power relations in Michel Foucault, as well as Foucault's notion of the economy of illegalities, 4) and finally, some of the issues brought up by the methodology of Bruno Latour in his actor-network theory, bringing to the fore concepts like association, spokesman, mediator, and controversy, in addition to questions related to science and politics. The text that results from this study attempts to give visibility to the actors in the process, to the events and the forms of association that emerged with the conflict, and to the relations of power, controversy, and action from the diverse actors in a process of urban legislation
