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Etude des facteurs environnementaux régulant l'activité bactériocines des souches du complexe d'espèces Ralstonia solanacearum
No full textSource Agritrop Cirad (https://agritrop.cirad.fr/607860/)International audienceLes bactériocines sont des protéines à activité antimicrobienne, sécrétées par certaines bactéries. L'action de ces protéines est restreinte aux bactéries de la même espèce ou d'espèces proches de la bactérie sécrétrice [1]. Déjà utilisées dans de nombreux domaines comme l'agroalimentaire, la santé ou l'agriculture [2], ces protéines bactériennes sont considérées comme une alternative au phénomène d'antibiorésistance. Le complexe d'espèces Ralstonia solanacearum (ceRs) fait partie des nombreuses bactéries capables de sécréter des bactériocines [3]. Classé deuxième au rang mondial des phytobactérioses les plus nuisibles au monde [4], le flétrissement bactérien causé par le ceRs est répertorié sur tous les continents, mais est plus prévalent dans les régions tropicales et subtropicales [5] . En obstruant le xylème des plantes hôtes, ces bactéries telluriques peuvent induire le flétrissement irréversible chez plus de 450 espèces de plantes, comme la tomate, la pomme de terre ou encore le bananier [6]. Le ceRs se décline en trois espèces (Ralstonia solanacearum, Ralstonia pseudosolanacearum et Rastonia syzygii). Au sein de ces trois espèces, une classification suivant les origines géographiques des souches définit 4 phylotypes (I,II,III,IV) et une analyse du gène codant l'endoglucanase les distingue en sequevars [6]. Nous avons montré que l'activité antimicrobienne des bactériocines varie selon la souche productrice et la souche cible 3, ce qui confèrerait à chaque souche du ceRS une aptitude à la compétition qui lui est propre. Dans la zone du Sud-Ouest de l'océan Indien (SOOI), certains variants sont prévalents dans les petites îles (comme le sequevar I-31 à La Réunion, Mayotte, Comores, Seychelles), mais n'arrivent pas à s'implanter dans d'autres îles (Madagascar), où un autre variant (sequevar I-18) prédomine. Les bactériocines pourraient expliquer cette différence de répartition géographique en jouant un rôle majeur dans la compétition entre souches. Ce poster présente les premiers travaux de caractérisation des bactériocines du ceRs, notamment les méthodes d'analyse de l'activité antimicrobienne, ainsi que l'évolution de cette activité face aux variations de paramètres physico-chimiques (tels que la température, le pH, les effets de la congélation)
Etude des facteurs environnementaux régulant l'activité bactériocines des souches du complexe d'espèces Ralstonia solanacearum
Full text linkLes bactériocines sont des protéines à activité antimicrobienne, sécrétées par certaines bactéries. L'action de ces protéines est restreinte aux bactéries de la même espèce ou d'espèces proches de la bactérie sécrétrice [1]. Déjà utilisées dans de nombreux domaines comme l'agroalimentaire, la santé ou l'agriculture [2], ces protéines bactériennes sont considérées comme une alternative au phénomène d'antibiorésistance. Le complexe d'espèces Ralstonia solanacearum (ceRs) fait partie des nombreuses bactéries capables de sécréter des bactériocines [3]. Classé deuxième au rang mondial des phytobactérioses les plus nuisibles au monde [4], le flétrissement bactérien causé par le ceRs est répertorié sur tous les continents, mais est plus prévalent dans les régions tropicales et subtropicales [5] . En obstruant le xylème des plantes hôtes, ces bactéries telluriques peuvent induire le flétrissement irréversible chez plus de 450 espèces de plantes, comme la tomate, la pomme de terre ou encore le bananier [6]. Le ceRs se décline en trois espèces (Ralstonia solanacearum, Ralstonia pseudosolanacearum et Rastonia syzygii). Au sein de ces trois espèces, une classification suivant les origines géographiques des souches définit 4 phylotypes (I,II,III,IV) et une analyse du gène codant l'endoglucanase les distingue en sequevars [6]. Nous avons montré que l'activité antimicrobienne des bactériocines varie selon la souche productrice et la souche cible 3, ce qui confèrerait à chaque souche du ceRS une aptitude à la compétition qui lui est propre. Dans la zone du Sud-Ouest de l'océan Indien (SOOI), certains variants sont prévalents dans les petites îles (comme le sequevar I-31 à La Réunion, Mayotte, Comores, Seychelles), mais n'arrivent pas à s'implanter dans d'autres îles (Madagascar), où un autre variant (sequevar I-18) prédomine. Les bactériocines pourraient expliquer cette différence de répartition géographique en jouant un rôle majeur dans la compétition entre souches. Ce poster présente les premiers travaux de caractérisation des bactériocines du ceRs, notamment les méthodes d'analyse de l'activité antimicrobienne, ainsi que l'évolution de cette activité face aux variations de paramètres physico-chimiques (tels que la température, le pH, les effets de la congélation)
Etude des facteurs environnementaux régulant l'activité bactériocines des souches du complexe d'espèces Ralstonia solanacearum
No full textSource Agritrop Cirad (https://agritrop.cirad.fr/607860/)International audienceLes bactériocines sont des protéines à activité antimicrobienne, sécrétées par certaines bactéries. L'action de ces protéines est restreinte aux bactéries de la même espèce ou d'espèces proches de la bactérie sécrétrice [1]. Déjà utilisées dans de nombreux domaines comme l'agroalimentaire, la santé ou l'agriculture [2], ces protéines bactériennes sont considérées comme une alternative au phénomène d'antibiorésistance. Le complexe d'espèces Ralstonia solanacearum (ceRs) fait partie des nombreuses bactéries capables de sécréter des bactériocines [3]. Classé deuxième au rang mondial des phytobactérioses les plus nuisibles au monde [4], le flétrissement bactérien causé par le ceRs est répertorié sur tous les continents, mais est plus prévalent dans les régions tropicales et subtropicales [5] . En obstruant le xylème des plantes hôtes, ces bactéries telluriques peuvent induire le flétrissement irréversible chez plus de 450 espèces de plantes, comme la tomate, la pomme de terre ou encore le bananier [6]. Le ceRs se décline en trois espèces (Ralstonia solanacearum, Ralstonia pseudosolanacearum et Rastonia syzygii). Au sein de ces trois espèces, une classification suivant les origines géographiques des souches définit 4 phylotypes (I,II,III,IV) et une analyse du gène codant l'endoglucanase les distingue en sequevars [6]. Nous avons montré que l'activité antimicrobienne des bactériocines varie selon la souche productrice et la souche cible 3, ce qui confèrerait à chaque souche du ceRS une aptitude à la compétition qui lui est propre. Dans la zone du Sud-Ouest de l'océan Indien (SOOI), certains variants sont prévalents dans les petites îles (comme le sequevar I-31 à La Réunion, Mayotte, Comores, Seychelles), mais n'arrivent pas à s'implanter dans d'autres îles (Madagascar), où un autre variant (sequevar I-18) prédomine. Les bactériocines pourraient expliquer cette différence de répartition géographique en jouant un rôle majeur dans la compétition entre souches. Ce poster présente les premiers travaux de caractérisation des bactériocines du ceRs, notamment les méthodes d'analyse de l'activité antimicrobienne, ainsi que l'évolution de cette activité face aux variations de paramètres physico-chimiques (tels que la température, le pH, les effets de la congélation)
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Full text linkWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
koamabayili/VECTRON-author-checklist: VECTRON author checklist
No full textWe have done our best to complete the author checklist relating to the use of animals in the hut study. Note that the objective for the hut study was to evaluate the IRS treatment applications for residual efficacy against Anopheles mosquitoes, including the local An. coluzzii mosquito population. Cows were only used to attract mosquitoes into the huts and no tests were carried out directly on the cows. The author checklist is intended for use with studies where experiments are carried out on animals, which is why we have had such difficulty in completing this for the hut study, as many of the questions do not relate to how the cows were used
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