295 research outputs found
Use and Participation in Virtual Social Networks: a Theoretical Model
No full textManagers are increasingly interested in the social web as it provides numerous opportunities for strengthening and expanding relationships with customers. Firms want to leverage the willingness of consumers to join and contribute to virtual social networks in many ways. Firms rely on users to provide product support in online help forums, to create product reviews in e-tailing, and to post blogs, photos, videos, bookmarks and conversation in advertising-supported online models. Despite this, the network processes that lead to these user-based assets are poorly understood.
In this paper we explore factors influencing use and participation in virtual social networks. We begin by discussing some unusual drivers and inhibitors present with virtual social networks – highlighted by the presence of positive network externalities, as well as of fears that the content will be misused. We next discuss the relevant theoretical background to the phenomenon of online social networks. Finally, we will offer hypotheses stemming from a model of how all these factors work together, test the model with a dataset collected from two different virtual social networks, and discuss the implications of our work.
Findings offer managers insights on how to nurture web 2.0 processes
The Influence of Personality on Active and Passive Use of Social Networking Sites
No full textManagers are more and more interested in social networking sites because they provide opportunities for strengthening relationships with customers as well as site content and service. Using social networking sites effectively, however, depends on understanding both the psychological attributes and social interactions of participants. The paper addresses these topics by presenting the results of a two-study inquiry into the importance of two personality traits (consumer innovativeness and expressiveness) to active and passive use of social networks among Italian consumers. In Study 1 (n = 753) it was found that innovativeness is positively related to active and passive use. Study 2 (n = 277) revealed that self-identity expressiveness and social identity expressiveness positively influence only active use. These results suggest that managers need to distinguish between, and differentially encourage, joining and browsing such sites on the one hand and actively contributing to them on the other. Managers can also enhance the impact of their social networking sites by taking into account social and self-identity expressiveness to increase affiliation and market share and by encouraging consumers to use these sites actively
Fingerprint of the mitochondrial ABC transporter Mdl1p from Saccharomyces cerevisiae
No full textThe multidrug resistance like protein 1 (Mdl1p) belongs to the class of ATP binding cassette (ABC) transporters which comprise a large family of membrane proteins utilising ATP hydrolysis to drive up-hill transport of a wide variety of solutes across membranes. Mdl1p is a mitochondrial ABC transporter involved in the export of protein fragments derived from the proteolysis of non-assembled inner membrane proteins out of the mitochondrial matrix. Mdl1p forms a homodimeric complex consisting of two polytrophic transmembrane domains (TMDs) and two nucleotide binding domains (NBDs). The transport function and structural organisation of Mdl1p have not been elucidated yet. To characterise the ATP hydrolysis cycle of Mdl1p, the His-tagged NBD (amino acids D423-R695) was over-expressed in Escherichia coli and purified to homogeneity. The isolated NBD was active in ATP binding and hydrolysis. The ATPase activity was non-linear regarding to the protein concentration, indicating that the functional state is a dimer. Dimeric catalytic transition states could be trapped and three different intermediate states were isolated, containing two ATPs, one ATP and one ADP, or two DPs, which are trapped by orthovanadate or beryllium fluoride. These experiments showed that (i) ATP binding to the NBDs induces dimerisation, (ii) in all isolated dimeric states, two nucleotides are present, (iii) phosphate can dissociate from the dimer, (iv) both nucleotides are hydrolysed, and (v) hydrolysis occurs in a sequential mode. Studies in the workgroup systematically screened for over-expression of the full-length Mdl1p and expression conditions were optimised. These studies showed that highest expression was obtained in S. cerevisiae, where the protein was over-expressed 100-fold. In this work over-expressed His-tagged protein was purified via immobilised metal-ion affinity chromatography that was active in ATP binding and hydrolysis with a turn-over of 2.5 ATP per second. N-terminal amino acid sequencing of purified Mdl1p by Edman degradation confirmed experimentally a N-terminal targeting sequence of a mitochondrial ABC transporter of S. cerevisiae for the first time. This sequence was determined to be 59 amino acids in length. Mdl1p was reconstituted into liposomes, which was confirmed by freeze fracture electron microscopy. The reconstituted protein showed ATP hydrolysis similar to the solubilised Mdl1p. However peptide translocation with radiolabelled X(8) or X(23) libraries as done for the transporter associated with antigen processing TAP could not be shown with this setup. Furthermore, structural insights of the mitochondrial transport complex and its oligomeric state were obtained via single particle electron microscopy. It was shown that Mdl1p forms a homodimer in detergent. These in vitro studies provide the basis for further detailed investigation of the mitochondrial ABC transporter Mdl1p.Die Ausbildung biologischer Membranen und die daraus resultierende Abgrenzung von speziellen Reaktionskompartimenten stellen einen entscheidenden Schritt in der Evolution des Lebens dar. Dabei sind Membranen allerdings keine unpassierbaren Mauern, sondern hochselektiv permeable Diffusionsbarrieren. Dies wird durch das Vorhandensein von spezifischen molekularen Kanälen und Pumpen bewerkstelligt. Der Transport von Molekülen über Membranen stellt einen vektoriellen Prozess dar, der den Stoffaustausch und die Kommunikation der einzelnen Kompartimente untereinander sowie mit der Umgebung ermöglicht. Eine Gruppe von Membranpumpen stellt die Familie der „ATP binding cassette“ (ABC) Transporter dar, eine der größten Familien paraloger Proteine, die die aktive Beförderung unterschiedlichster Substanzen über biologische Membranen ausführt. Vertreter dieser Superfamilie finden sich in allen bekannten Organismen von Bakterien bis hin zu Säugern und nehmen an einer Vielzahl von zellulären Prozessen teil. Sie sind an der Nährstoffaufnahme, dem Lipidtransport, an der Ionen- und Osmolyt-Homöostase sowie an der Antigenprozessierung beteiligt. Unter Verbrauch von ATP transportieren sie gegen einen Konzentrationsgradienten eine Fülle von chemischen Stoffen, wie z. B. Kohlenhydrate, Peptide, Proteine, Steroide, Antibiotika, Metallionen sowie ein breites Spektrum an hydrophoben Substanzen. Neben der Transportaktivität können diese Proteine eine Funktion als Ionenkanäle, Regulatoren von Kanälen oder Rezeptoren haben. Einige Vertreter weisen eine hohe klinische Relevanz auf. Beispielsweise ist die Mutation des ABC Transporters CFTR die molekulare Grundlage für die Entstehung der cystischen Fibrose. Andere Vertreter dieser Proteinfamilie sind an dem Phänomen der Resistenzentwicklung verschiedener Gewebe während chemotherapeutischer Behandlungen beteiligt. Ihre Überexpression stellt ein ernstzunehmendes Problem bei der Behandlung von Tumoren und AIDS dar. Demzufolge ist die Aufklärung der Struktur und Funktionsweise dieser Molekülklasse von zentraler Bedeutung. Die Architektur von ABC Transportern ist trotz der Diversität der zu transportierenden Substrate sehr ähnlich. Typischerweise besteht ein ABC Transporter aus vier Domänen: zwei Transmembrandomänen (TMD) und zwei Nukleotidbindungsdomänen (NBD). Definiert wird die Proteinfamilie durch die Homologie innerhalb der NBDs, welche die konservierten Sequenzabschnitte Walker A und B sowie die für ABC Proteine spezifische C-Schleife beinhalten. Die NBDs gelten als die Motordomänen von ABC Transportern, die ATP hydrolysieren und dadurch die für den Transport benötigte Energie zur Verfügung stellen. Die Anordnung der Domänen ist variabel. Bei Prokaryonten werden vornehmlich alle vier Domänen einzeln translatiert. Hier kommt häufig ein periplasmatisches Bindungsprotein mit hoher Substrataffinität vor, das mit dem jeweiligen Transporter assoziiert ist. Eukaryontische ABC Transporter existieren als „Volltransporter“ bestehend aus einer Polypeptidkette mit je zwei TMDs und zwei NBDs oder auch als „Halbtransporter“ wie beispielsweise der ABC Transporter Mdl1p (multidrug resistance like protein 1) mit jeweils einer TMD und einer NBD pro Genprodukt. Der Transportmechanismus, die Energetisierung sowie das strukturelle Zusammenspiel der verschiedenen Domänen innerhalb dieser Membranproteinkomplexe sind bisher größtenteils unverstanden. Auch die (physiologisch relevanten) Substrate vieler ABC Proteine sind zumeist nicht identifiziert. In dieser Arbeit wird der ABC Transportkomplex dl1p der inneren Mitochondrienmembran von Saccharomyces cerevisiae als Modellsystem funktionell und strukturell charakterisiert. Dabei soll die Tatsache nicht unerwähnt bleiben, dass die Bäckerhefe aufgrund leichter genetischer Manipulierbarkeit und schneller Produktion von Biomasse einen idealen Modellorganismus darstellt. Mdl1p spielt eine wichtige Rolle bei der Mitochondrienbiogenese, da es für den Export von Degradationsprodukten, wie z.B. falsch assemblierter Untereinheiten der Atmungskette, verantwortlich ist. Die innere Mitochondrienmembran ist neben der inneren Chloroplastenmembran die einzige zelluläre Membran, die nicht direkt mit dem Cytosol in Kontakt tritt und folglich nicht der Qualitätskontrolle durch das Ubiquitin/Proteasomsystem unterliegt. Daher verfügen Mitochondrien über eine autonome, ATP abhängige Qualitätskontrolle, die durch einen proteolytischen Multienzymkomplex vermittelt wird. Die AAA Proteasen (ATPase associated with a variety of cellular activities) sind für den Abbau von falsch gefalteten Proteinen der inneren Mitochondrienmembran verantwortlich. Mdl1p exportiert vermutlich die dabei entstandenen Peptide aus der Matrix in den Intermembranraum des Mitochondriums. Aufgrund seines modulartigen Aufbaus kann der ABC Transporter Mdl1p in seine Nterminale TMD und C-terminale NBD unterteilt werden. Die lösliche NBD (Aminosäuren D423 bis R695) wurde in Escherichia coli überexprimiert und über eine Affinitätsschleife zur Homogenität gereinigt. Die Aktivität des Proteins bezüglich ATP Bindung und Hydrolyse bleibt dabei erhalten. Interessanterweise ist die ATP Hydrolyse nicht linear von der Proteinkonzentration abhängig wie bei Arbeiten in der Arbeitsgruppe gezeigt wurde. Diese Beobachtung lässt auf einen nicht monomeren Zwischenzustand im ATPase Zyklus schließen. Tatsächlich kann in dieser Arbeit mittels der ATPase Inhibitoren ortho-Vanadat (Vi) und Berylliumfluorid (BeFx) ein wild-typ-NBD-Dimer in Gelfiltrationsläufen beobachtet werden. Das Gleichgewicht zwischen Monomer und Dimer ist dabei strikt abhängig von der eingesetzten Inhibitorkonzentration. Ortho-Vanadat und BeFx stellen Analoga des anorganischen Phosphates dar. Sie arretieren einen Enzymzustand während der ATP Hydrolyse, in dem das ADP Molekül in der Bindungstasche verbleibt, während das Phosphat bereits dissoziert ist. Eine Stöchiometriebestimmung mit radioaktiv markiertem ATP ergab, dass das Dimer mit zwei Nukleotiden beladen ist und beide hydrolysiert sind. Die Mutation des Glutamats 599 (E599) stromabwärts des Walker B Motivs zu einem Glutamin (Q) führt zu einer NBD mit stark verringerter ATPase-Aktivität. Dieses Glutamat ist innerhalb der Familie der ABC Transporter hoch konserviert und seine Funktion während des Hydrolyseprozesses wird in der Literatur kontrovers diskutiert. In allen beschriebenen Fällen gilt diese Mutante jedoch als hydrolyse- bzw. transportdefizient. Die Mdl1p-NBD-Mutante bildet in Gegenwart von ATP ein stabiles Dimer. Stöchiometrieuntersuchungen an dem E599Q-NBD-Dimer zeigen, dass zwei Nukleotide inkorporiert sind. Nach einer Inkubation unter „Nicht-Hydrolysebedingungen“ (4 °C, ohne Mg2+) bleiben zwei ATP Moleküle im Dimer erhalten. Wird die NBD jedoch bei 30 °C in Gegenwart von Mg2+ inkubiert, kann ein Dimer isoliert werden, in dem ein ATP und ein ADP detektierbar ist. Auch nach einer Inkubation über mehrere Stunden, kann kein Dimer mit zwei ADP Molekülen erhalten werden. Dieses Ergebnis zeigt, dass zumindest ein ATP-Molekül zur Erhaltung des Dimers erforderlich ist. Hydrolyse beider Nukleotide führt zur Dissoziation des Komplexes. Basierend auf diesen Ergebnissen kann ein Modell für die ATP Hydrolyse erstellt werden, in dem die Bindung der Nukleotide an die monomeren Untereinheiten eine Assoziation der NBDs induziert. Zwei ATP-Moleküle werden sequentiell hydrolysiert, bevor das Dimer mit gebundenen ADP-Molekülen dissoziert. Bei Arbeiten in der Arbeitsgruppe wird innerhalb eines systematischen Ansatzes die Überexpression von Mdl1p als Gesamtprotein etabliert. Dazu kommen als prokaryontische Expressionssysteme das gram-negative Bakterium Escherichia coli und das gram-positive Bakterium Lactococcus lactis zum Einsatz. Weiterhin wird der homologe eukaryontische Expressionswirt Sacharomyces cerevisiae verwendet. Das MDL1-Gen konnte durch das Einführen einer neuen und die Nutzung einer vorhandenen Restriktionschnittstelle in drei Kassetten unterteilt werden, die eine weitere genetische Manipulation und Klonierung deutlich vereinfachen. So werden Kassetten mit und ohne N-terminaler mitochondrialer Leitsequenz und verschiedenen Affinitätsschleifen konstruiert. Zu Zwecken detaillierter Untersuchung des Gesamttransporters wurde die schon von der NBD bekannte Mutante E599Q als auch die bei anderen ABC Transportern als ATP-hydrolyseinaktiv bekannte Mutation des konservierten Histidins (H631) der H-Schleife zu einem Alanin generiert (H631 -> A). Ergebnis dieser Arbeiten war, dass in E. coli im besten Fall 0,005 % Mdl1p (bezogen auf die Gesamtmembranproteinmenge) erzielt wurde, was deutlich unter der erwarteten und für weitere Experimente erforderlichen Expressionsausbeute lag. Dabei wurde das Protein in verschiedene „high-“ und „low-copy“ Vektoren mit unterschiedlichen Promotoren wie z. B. T7 (IPTG-induziert), ARA (Arabinose-induziert) oder TRC (IPTG-induziert) kloniert. Weiterhin wurde die Expression in verschiedenen E. coli-Stämmen bei verschiedenen Wachstumstemperaturen getestet. Auch die Konzentration der Induktoren wie IPTG oder Arabinose und der Zeitpunkt sowie die Dauer der Induktion wurden systematisch variiert. Schließlich wurde Mdl1p zusammen mit der “Membraninsertionsmaschinerie” SecY, SecE, SecG und YidC und in Stämmen, die seltene tRNAs codieren, exprimiert. Um das Translationsprodukt möglicherweise besser vor degenerativen Prozessen innerhalb der Zelle zu schützen, werden diese mit höheren Konzentrationen Ethanol oder Sorbitol im Medium kultiviert, mit dem Ziel, auf diese Weise Chaperone zu induzieren. Die Expression wurde jeweils durch quantitativen Westerntransfer mit anschließender Immundetektion unter der Verwendung der Mdl1p-NBD als Referenz evaluiert. Ähnlich niedrige Ausbeuten von 0,01 % Mdl1p werden in L. lactis erzielt, wobei analoge Variationen der Expressionsbedingungen, wie für E. coli beschrieben, durchgeführt wurden. In beiden Ansätzen stellen die erhaltenen Mengen keine Verbesserung der Ausbeute im Vergleich zum homologen Expressionssystem dar. Wie im Rahmen der Arbeiten zur Überexpression von Mdl1p bestimmt wurde, wird Mdl1p in S. cerevisiae bis zu 0,01 % des totalen mitochondrialen Membranproteingehalts exprimiert. Um die Mdl1p-Menge zu erhöhen, wurden in der Arbeitsgruppe verschiedene Ansätze getestet, wie beispielsweise die plasmidgetriebene, starke und konstitutive Expression über einen GPD-Promotor (Glycerolphosphatdehydrogenase). Interessanterweise wird in diesem Fall weniger Protein erhalten als bei einer wildtyp-Expression. Dies legte die Vermutung nahe, dass hohe Mengen Mdl1p von der Zelle nicht toleriert werden können. Grosse Mengen Mdl1p wurden letztlich nur über einen GAL1-Promotor (Galaktose induzierbar) auf einem 2µ-Plasmid erreicht. Über die His(8)-Schleife am C-Terminus des Proteins und der Verwendung der Metall-Affinitätschromatographie gelang im Rahmen dieser Arbeit die Isolierung von Mdl1p bis zu einer Homogenität von 95 %. Dabei wurde ein breites Spektrum an nicht-, einfach- und zwitterionischen Detergenzien zur Solubilisierung verwendet. Hier zeigen sich zwei wichtige Aspekte: Erstens solubilisieren unterschiedliche Detergenzien Mdl1p in sehr unterschiedlichem Ausmaß. Mit dem Detergenz Tetradecylphosphocholine (FC-14) kann beispielsweise bis zu 1 mg Protein pro Liter Hefekultur präpariert werden. Bei den Detergenzien Dodecylmaltosid (DDM) und Digitonin sind die Ausbeuten reduziert und belaufen sich auf 0,2 bzw. 0,1 mg pro Liter Zellkultur. Zweitens wird auch die Hydrolyseaktivität des gereinigten Proteins stark durch das Detergenz beeinflusst. So zeigt Mdl1p seine höchste Geschwindigkeit in Digitonin während in DDM nur noch ein Drittel der Geschwindigkeit detektiert werden kann. In FC-14 ist keine Hydrolysetätigkeit mehr vorhanden. Daher wurden alle Experimente mit Protein durchgeführt, das in Anwesenheit von Digitonin gereinigt wurde. Das solubilisierte Protein bindet ATP wie durch 8-azido-[alpha-32P]ATP-photocross-linking-Experimente gezeigt wurde und besitzt eine Hydrolyseaktivität mit einem KM(ATP) von 0,85 mM und einer Wechselzahl von 2,5 ATP pro Sekunde. Die beiden Mutanten (E599Q, H631A), die in gleicher Weise und Menge exprimiert und präpariert werden können wie das Wildtyp-Protein, sind zwar in der Lage ATP zu binden, nicht jedoch es zu hydrolysieren. Im Rahmen dieser Arbeit wird weiterhin die Existenz einer N-terminalen Leitsequenz von Mdl1p ermittelt und näher charakterisiert. In der Literatur werden spezifische Signalsequenzen diskutiert, die eine eindeutige Adressierung und einen Transport von Proteinen an ihren Einsatzort in den verschiedenen Zellorganellen gewährleisten. Für mitochondriale Proteine werden sowohl N-terminale Leitsequenzen unterschiedlicher Länge (bis zu 105 Aminosäuren) als auch interne, in der Proteinfaltung verschlüsselte, Leitstrukturen beschrieben. Auch für Mdl1p werden mittels computerbasierter Methoden („in silico“) verschiedene Sequenzen vorhergesagt. Daher soll die Frage nach Art und Länge der Zielsequenz für Mdl1p experimentell beantworten werden. Dazu wird das Protein über die His(8)-Schleife aus Mitochondrien präpariert und mittels N-terminalem Edman-Abbau analysiert. Da die ersten 7 Aminosäuren sequenziert werden, kann eine eindeutige Alignierung der erhaltenen Sequenz mit der Gesamt-Mdl1p-Sequenz erreicht werden. An Hand dieser Daten kann erstmals für einen mitochondrialen ABC Transporter aus Hefe experimentell eine N-terminale Leitsequenz gezeigt werden, die im Fall von Mdl1p 59 Aminosäuren beträgt. Mdl1p kann in Liposomen rekonstituiert werden, was in Zusammenarbeit mit dem Max-Planck-Institut für Biophysik in Frankfurt durch Gefrierbruch-Elektronenmikroskopie nachgewiesen werden konnte. Hierbei blieb die ATP Hydrolysefähigkeit von Mdl1p nahezu erhalten, was den Einsatz von Proteoliposomen für Importstudien ermöglicht. Ein Peptidtransport mit radioaktiv markierten Peptidbibliotheken einer Länge von 8 bzw. 23 Aminosäuren (dabei enthalten die Peptide alle proteinogenen Aminosäuren in gleichem Verhältnis mit Ausnahme von Cystein) konnte mit diesem System allerdings nicht gezeigt werden. Gründe für diese Ergebnisse werden in dieser Arbeit ausführlich diskutiert, was zu einer Neubewertung der Rolle von Mdl1p als Peptidetransporter führt. Das solubilisierte Protein wurde in einer Kooperation mit dem Max-Planck-Institut für Biophysik in Frankfurt mittels Einzelpartikel-Elektronenmikroskopie untersucht, was Einsichten in den oligomeren und strukturellen Aufbau des Proteins ermöglicht. Dabei werden die Einzelpartikel zu einer dreidimensionalen Ansicht rekonstruiert und mit den Kristallstrukturen des ABC Transporters MsbA verglichen. Diese zeigen MsbA in zwei sehr unterschiedlichen Konformationen, eine offene und eine geschlossene Form. Die Dimensionen der Partikel von Mdl1p kommen hierbei der offenen Form non MsbA am nächsten. Dabei wird auch deutlich, dass Mdl1p in Detergenz sehr wahrscheinlich als Homodimer vorliegt. Die vorliegende Arbeit mit ihren in vitro Studien zeigt zum ersten Mal eine Art „Fingerabdruck“ des mitochondrialen ABC Transporters Mdl1p aus S. cerevisiae und stellt damit eine Basis für detaillierte Untersuchungen dieses Proteins dar
Adding store to web: migration and synergy effects in multi‐channel retailing
No full textPurpose – The purpose of this paper is to investigate the topic of multi-channel retailing. Specifically, the research intends to determine if and to what extent the opening of physical stores by a former web-only retailer reduces or extends overall retail sales, and whether such effects tend to change over time. Empirical analysis focuses on data elaboration from a retailer who has passed from the initial mono-channel model (pure online), to a multi-channel one with the opening of stores. Design/methodology/approach – Through the analysis of an internal data set of a leading consumer electronics retailer applying Probit and Logit estimation techniques, the authors extract information about actual customers’ purchases (or rather retail sales) in three newly opened stores and about online purchases (through an e-commerce web site managed by the same retailer with the same store brand) by people living in the new store service areas before and after the openings. Findings – The paper shows that, for the single customer, the probability of purchasing online is reduced by the store opening in the short term, but tends to increase in the long term. Besides, results indicate that long-term synergy between the two channels depends mainly on indirect influence due to the mere presence of the store brand in the area rather than on the direct experience of shopping in the store. Research limitations/implications – The study highlights that channel portfolio enlargement from mono- to multi-channel retailing tends to activate a sort of life cycle; while in the early phase of store addition web sales tend to be cannibalized because the two channels are perceived as “substitutes” for each other, in the long run migration turns into a synergy effect; different channels tend to interact with and reinforce each other as customer touch points of the same retailer, in an omni-channel perspective. Originality/value – The paper herein presents various original elements concerning types of available data (actual sales rather than consumers’ intentions/perceptions and individual level data rather than aggregate level ones), estimation technique used (binary choice model) and research hypotheses (distinguishing between “direct” and “indirect” synergy effects in multi-channel retailing)
Changes in nutritional biomarkers, sleep, perceived stress, and performance in Division I female soccer players throughout a competitive season
No full textBackground: A balance between training stress and recovery is essential for successful athletic performance, thus the development of an evidence-based approach to monitoring changes in stress and recovery is critical. The purpose of this study was to combine analysis of nutritional biomarkers with mood, sleep, and performance assessments to examine changes in recovery and training status throughout a competitive season. Methods: Division I female collegiate soccer players (N=25; Mage=19.4 + 1.4 yrs; Mht= 167.9 + 6.3 cm) participated in blood draws at the beginning of preseason (T1) and every four weeks after within ~18 hours following a game (T2-T4). Athletes arrived well hydrated following an overnight fast. Several performance tests were administered prior to the start of preseason (PT1) and end-of-season (PT2). These included body composition (body fat (%BF), fat free mass (FFM), and fat mass (FM), vertical jump (VJ), and VO2max. Glutamine (Glu), Taurine (Tau), Tryptophan (Trp), Phenylalanine (Phe), Iron (Fe), Vitamin B12 (VitB12), Vitamin D (VitD), and Omega-3 (n-3FA) were analyzed. Mood and sleep were assessed using the Multi-Component Training Distress Scale (MTDS), and the Pittsburgh Sleep Quality Index (PSQI), respectively. Workload was assessed using several measures including heart rate data, distance covered (Dis), caloric expenditure (kcal), caloric expenditure (kcal/kg), and training load (TL). Additionally, counter movement jump (CMJ) was assessed at the beginning of practice at each time point. RM MANOVAs with univariate follow-ups were conducted with significance at P.05). Trp decreased from T2-T3 (∆Trp = -10.9 ± 4.3 umol/L, P<.05) and remained depressed. Glu increased from T1-T2 (∆Glu = 82.1 ± 23.1 umol/L, P<.05) then returned to baseline. Conclusions: The highest training stress occurred during the initial training block (T1-T2) and resulted in negative changes in VitD and Fe. The greatest mood disturbance occurred at the end of the season when Trp levels also declined. Trp, a precursor of serotonin, may provide a mechanism for understanding changes in mood typically reported with overreaching. Decreases in VO2max and VT also occurred at the end of the season which corresponded to tournament play. SQ may be more important for full recovery than SD, as increased SD did not mitigate changes in mood. These results highlight the stress experienced by a collegiate athlete during a condensed season including increased physiological disruption around tournament play. Further, this holistic approach to athlete monitoring may provide greater insight to assessing accumulated stress both on and off the field by tracking physiological, nutritional, and psychological changes throughout a season.M.S.Includes bibliographical reference
FT-Raman spectroscopic investigations on the organic crosslinking in hybrid polymers. Pt.II: Reactions of epoxy silanes
No full textS.139-145FT-Raman spectroscopy was used together with supplementary C-13-NMR measurements to analyze the reaction of the epoxy moieties of 3-glycidoxypropyltrimethoxysilane and 5,6-epoxyhexyltrimethoxysilane during sol-gel processing. Based on the results for simple epoxides reported in Riegel, Kiefer, Hofacker and Schottner (Appl. Spec. 54, 1384 (2000)) the formation of beta-hydroxy methyl ethers can be derived. An additional condensation of the epoxy rings yielding a mixture of oligo ethers is considered very probable from the Raman measurements. Raman and NMR assignments are proposed for 5,6-epoxyhexyltrimethoxysilane.24Nr.
Member Participation in Commerce-Based Online Communities
No full textBenoit (née Moeller) S, Hogreve J, Bilstein N, Sichtmann C. Member Participation in Commerce-Based Online Communities. In: Henning-Thurau T, Hofacker CF, eds. What happens in marketing, stays digital. Rethinking marketing in the era of unlimited data. AMA educators proceedings. Vol 27. Chicago, IL: American Marketing Association; 2016
Computational analysis of next generation sequencing data : from transcription start sites in bacteria to human non-coding RNAS
Get PDFThe advent of next generation sequencing (NGS) technologies has revolutionized the field of molecular biology by providing a wealth of sequence data. “Transcriptomics”, which aims to identify and annotate the complete set of RNA molecules transcribed from a genome, is one of the main applications of these high-throughput methods. Special attention has been paid in determining the exact position of the 5’ ends of RNA transcripts, the transcription start sites (TSSs), and subsequently in identifying the regulatory motifs that are ultimately responsible for governing gene expression. Recently, a novel experimental approach termed dRNA-seq has emerged which enables TSS identification in prokaryotic genomes at a genome-wide scale. While the experimental procedure has reached a point of maturity, the computational downstream analysis of dRNA-seq data is still in its infancy. Analysis of dRNA-seq data was previously done manually, a tedious task that is prone to errors and biases. In order to automate this process we developed a computational tool for accurate and systematic analysis of dRNA-seq data to identify the TSSs genome-wide. In particular, we used a Bayesian framework for TSS calling and a Hidden Markov Model to infer the canonical motifs in the promoter regions of TSSs in order to further capture TSSs that show low evidence of expression. In a second contribution, we exploited the power of next generation sequencing to identify and characterize the expression and processing mechanisms of snoRNAs. SnoRNAs are a particular class of non-protein coding RNAs whose main function is post-transcriptional modification of other non-protein coding RNAs. SnoRNAs carry out their function as part of ribonucleoprotein complexes (RNPs). In order to gain insights into these protein-RNA interactions, we used a technique called PAR-CLIP (Photoactivatable-Ribonucleoside-Enhanced Crosslinking and Immunoprecipitation) that allows the identification of protein-RNA contacts at nucleotide resolution. Using PAR-CLIP data, we were able to demonstrate that snoRNAs undergo precise processing and that many loci in the human genome generate snoRNA-like transcripts whose evolutionary conservation and expression are considerably lower than currently catalogued snoRNAs. Finally, we set out to use small RNA-seq data from the ENCODE project to construct a comprehensive catalog of genomic loci that give rise to snoRNAs. In addition we expanded the current catalog of human snoRNAs and studied the plasticity of snoRNA expression across different cell types. Our analysis confirmed prior observations that several snoRNAs show cell type specific expression, mainly in neurons. A more striking observation was that snoRNA expression appears to be strongly dysregulated in cancers which could lead to the identification of novel biomarkers
Reverse dark current in organic photodetectors and the major role of traps as source of noise
No full textOrganic photodetectors have promising applications in low-cost imaging, health monitoring and near-infrared sensing. Recent research on organic photodetectors based on donor-acceptor systems has resulted in narrow-band, flexible and biocompatible devices, of which the best reach external photovoltaic quantum efficiencies approaching 100%. However, the high noise spectral density of these devices limits their specific detectivity to around 10(13)Jones in the visible and several orders of magnitude lower in the near-infrared, severely reducing performance. Here, we show that the shot noise, proportional to the dark current, dominates the noise spectral density, demanding a comprehensive understanding of the dark current. We demonstrate that, in addition to the intrinsic saturation current generated via charge-transfer states, dark current contains a major contribution from trap-assisted generated charges and decreases systematically with decreasing concentration of traps. By modeling the dark current of several donor-acceptor systems, we reveal the interplay between traps and charge-transfer states as source of dark current and show that traps dominate the generation processes, thus being the main limiting factor of organic photodetectors detectivity. The suppression of dark current in organic photodetectors (OPDs) is important for maximizing the performance of the devices. Here, the authors report the relationship between the high dark saturation current and the presence of mid-gap trap states in OPDs with a donor-acceptor structure.Open Access funding enabled and organized by Projekt DEAL.
Acknowledgements
This work was supported by the German Federal Ministry for Education and Research (BMBF) and by the German Research Foundation (DFG) within the Cluster of excellence Center for Advancing Electronics Dresden (cfaed) and the DFG projects HEFOS (Grant No. FI 2449/1-1) and Photogen (Grant No. VA 1035/5-1). B.K.B. acknowledges funding from DFG Priority Programme FFlexCom under the project FlexARTwo (LE 747/52-2 and EL 506/22-2). J.K. acknowledges funding by the Deutsche Akademische Austausch Dienst (DAAD). J.B. thanks for the financing from Sächsische Aufbaubank through project InfraKart (Grant No. 100325708). Furthermore, we acknowledge N. Sergeeva, Prof. Dr. T. Kirchartz, and Prof. Dr. B. E. Pieters for fruitful discussions.Kublitski, J; Hofacker, A (corresponding author), Tech Univ Dresden, Dresden Integrated Ctr Appl Phys & Photon Mat IAP, Nothnitzer Str 61, D-01187 Dresden, Germany ; Tech Univ Dresden, Inst Appl Phys, Nothnitzer Str 61, D-01187 Dresden, Germany.
Vandewal, K (corresponding author), Hasselt Univ, Inst Mat Onderzoek IMO, Wetenschapspk 1, BE-3590 Diepenbeek, Belgium.
[email protected]; [email protected]; [email protected]
Fine-tuning structural RNA alignments in the twilight zone
Get PDFBremges A, Schirmer S, Giegerich R. Fine-tuning structural RNA alignments in the twilight zone. BMC Bioinformatics. 2010;11(1): 222.Background A widely used method to find conserved secondary structure in RNA is to first construct a multiple sequence alignment, and then fold the alignment, optimizing a score based on thermodynamics and covariance. This method works best around 75% sequence similarity. However, in a "twilight zone" below 55% similarity, the sequence alignment tends to obscure the covariance signal used in the second phase. Therefore, while the overall shape of the consensus structure may still be found, the degree of conservation cannot be estimated reliably. Results Based on a combination of available methods, we present a method named planACstar for improving structure conservation in structural alignments in the twilight zone. After constructing a consensus structure by alignment folding, planACstar abandons the original sequence alignment, refolds the sequences individually, but consistent with the consensus, aligns the structures, irrespective of sequence, by a pure structure alignment method, and derives an improved sequence alignment from the alignment of structures, to be re-submitted to alignment folding, etc.. This circle may be iterated as long as structural conservation improves, but normally, one step suffices. Conclusions Employing the tools ClustalW, RNAalifold, and RNAforester, we find that for sequences with 30-55% sequence identity, structural conservation can be improved by 10% on average, with a large variation, measured in terms of RNAalifold's own criterion, the structure conservation index
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