8 research outputs found
The protein kinase Pstol1 from traditional rice confers tolerance of phosphorus deficiency
No full textPublished online: 22 August 2012As an essential macroelement for all living cells, phosphorus is indispensable in agricultural production systems. Natural phosphorus reserves are limited1, and it is therefore important to develop phosphorus-efficient crops. A major quantitative trait locus for phosphorus-deficiency tolerance, Pup1, was identified in the traditional aus-type rice variety Kasalath about a decade ago2, 3. However, its functional mechanism remained elusive4, 5 until the locus was sequenced, showing the presence of a Pup1-specific protein kinase gene6, which we have named phosphorus-starvation tolerance 1 (PSTOL1). This gene is absent from the rice reference genome and other phosphorus-starvation-intolerant modern varieties7, 8. Here we show that overexpression of PSTOL1 in such varieties significantly enhances grain yield in phosphorus-deficient soil. Further analyses show that PSTOL1 acts as an enhancer of early root growth, thereby enabling plants to acquire more phosphorus and other nutrients. The absence of PSTOL1 and other genes—for example, the submergence-tolerance gene SUB1A—from modern rice varieties underlines the importance of conserving and exploring traditional germplasm. Introgression of this quantitative trait locus into locally adapted rice varieties in Asia and Africa is expected to considerably enhance productivity under low phosphorus conditions.Rico Gamuyao, Joong Hyoun Chin, Juan Pariasca-Tanaka, Paolo Pesaresi, Sheryl Catausan, Cheryl Dalid, Inez Slamet-Loedin, Evelyn Mae Tecson-Mendoza, Matthias Wissuwa & Sigrid Heue
A novel allele of the P-starvation tolerance gene OsPSTOL1 from African rice (Oryza glaberrima Steud) and its distribution in the genus Oryza
Get PDFThe deficiency of phosphorus (P) in soil is a major problem in Sub-Saharan Africa due to general nutrient depletion and the presence of P-fixing soils. Developing rice cultivars with enhanced P efficiency would, therefore, represent a sustainable strategy to improve the livelihood of resource-poor farmers. Recently the Pup1 locus, a major QTL for tolerance to P deficiency in soil, was successfully narrowed-down to a major gene, the protein kinase OsPSTOL1 (P-starvation tolerance), which was found to be generally absent from modern irrigated rice varieties. Our target is to improve the tolerance of African mega-varieties to P deficiency through marker-assisted introgression of PSTOL1. As a first step, we have determined the Pup1 haplotype and surveyed the presence or absence of PSTOL1 and other genes of the Pup1 locus in African mega-varieties, NERICAs (New Rice for Africa) and their Oryza glaberrima parents. Here, we report the presence of a novel PSTOL1 allele in upland NERICAs that was inherited from the O. glaberrima parent CG14. This allele showed a 35 base-pair substitution when aligned to the Kasalath allele, but maintained a fully conserved kinase domain, and is present in most O. glaberrima accessions evaluated. In-silico and marker analysis indicated that many other genes of the Kasalath Pup1 locus were missing in the O. glaberrima genome, including the dirigent-like gene OsPupK20-2, which was shown to be downstream of PSTOL1. We have developed several allele-specific markers for the use for molecular breeding to transfer the PSTOL1 gene from Kasalath to African mega-varieties, including NERICAs.Juan Pariasca-Tanaka, Joong Hyoun Chin, Khady Nani Dramé, Cheryl Dalid, Sigrid Heuer, Matthias Wissuw
Enseñar, aprender y construir el nosotros: un estudio interaccionista en un aula de preescolar en entorno vulnerable
Get PDFSe estudia en profundidad la singularidad de las prácticas de una docente en un plantel de nivel educativo preescolar, en un contexto de pobreza y exclusión social en la comunidad de Angostura, San Luis Potosí. Mediante un estudio interpretativo de tipo interaccionista y socioconstructivista, se analizan e interpretan las interacciones observadas a partir de las lógicas movilizadas por la docente y los estudiantes.1 Estas lógicas pueden ser de orden relacional, pedagógico y epistemológico, las cuales, en momentos de la clase, corren en paralelo originando polos de tensión, que son “un sistema construido” (Vinatier, 2008) en el trabajo, ante los acuerdos, desacuerdos, los ajustes y desajustes entre las distintas lógicas de acción. Destacan el aprendizaje y el proceso mental y social que desarrolla habilidades de pensamiento y conocimientos para formular ideas y resolver problemas (Saint-Onge, 1997). La enseñanza es la acción de la profesora y la puesta en práctica de sus saberes de diferente orden, que finaliza en el aprendizaje de los alumnos (Vinatier y Altet 2002). La interacción es la “esencia” del acto educativo; en ésta se comparten significados, valores, y quienes participan toman y dan sentido al otro (Bazdresch, 2000). Los resultados dan cuenta de un conjunto de reglas de acción docente, tales como la mediación didáctica a través de la escucha atenta; la problematización de contenidos por medio de la conversación genuina, el uso de la consigna autoimplicándose; el manejo respetuoso de la norma y referido a la tarea, a la cercanía afectiva, al uso de la pregunta, y la distribución equitativa de recursos. Los principios pedagógicos en acción que dan sentido al trabajo observado son el aprendizaje como un acto de coconstrucción; enseñar a aceptar al otro y aprender a trabajar juntos; el afecto como vehículo fundamental en la relación con los niños y la contribución, desde la escuela, a la construcción de horizontes de vida. Se reafirma que en la naturaleza de los intercambios docente-alumnos están los elementos para comprender cómo se generan oportunidades para que niños que crecen y se desarrollan en ambientes de marginación puedan acceder a la construcción de saberes y quedar incluidos en la vida del aula.ITESO, A.C
Developing rice with high yield under phosphorus deficiency: Pup1 sequence to application
Get PDFThe major quantitative trait locus (QTL) Phosphorus uptake1 (Pup1) confers tolerance of phosphorus deficiency in soil and is currently one of the most promising QTLs for the development of tolerant rice (Oryza sativa) varieties. To facilitate targeted introgression of Pup1 into intolerant varieties, the gene models predicted in the Pup1 region in the donor variety Kasalath were used to develop gene-based molecular markers that are evenly distributed over the fine-mapped 278-kb QTL region. To validate the gene models and optimize the markers, gene expression analyses and partial allelic sequencing were conducted. The markers were tested in more than 80 diverse rice accessions revealing three main groups with different Pup1 allele constitution. Accessions with tolerant (group I) and intolerant (group III) Pup1 alleles were distinguished from genotypes with Kasalath alleles at some of the analyzed loci (partial Pup1; group II). A germplasm survey additionally confirmed earlier data showing that Pup1 is largely absent from irrigated rice varieties but conserved in varieties and breeding lines adapted to drought-prone environments. A core set of Pup1 markers has been defined, and sequence polymorphisms suitable for single-nucleotide polymorphism marker development for high-throughput genotyping were identified. Following a marker-assisted backcrossing approach, Pup1 was introgressed into two irrigated rice varieties and three Indonesian upland varieties. First phenotypic evaluations of the introgression lines suggest that Pup1 is effective in different genetic backgrounds and environments and that it has the potential to significantly enhance grain yield under field conditions.Joong Hyoun Chin, Rico Gamuyao, Cheryl Dalid, Masdiar Bustamam, Joko Prasetiyono, Sugiono Moeljopawiro, Matthias Wissuwa, and Sigrid Heue
Evaluación del comportamiento del pavimento rígido adicionando plástico reciclado ABS y fibra de bagazo de caña para concreto f ́c=210kg/cm2, Cajamarca-2024
Get PDFEn la actualidad estas preocupaciones de las infraestructuras viales y el uso de
materiales de construcción están propensas a experimentar deslizamientos de
tierra y el equilibrio natural del suelo; por ello se empleo la incorporación de ABS y
FBC para la elaboración del concreto. Este problema se debe al crecimiento
poblacional y a la deficiencia en la construcción vial. El objetivo de este estudio es
Evaluar el comportamiento del pavimento rígido adicionando plástico reciclado ABS
y fibra de bagazo de caña para concreto f ́c=210kg/cm2, Cajamarca-2024. Se lleva
a cabo una metodología de tipo aplicado, enfoque cuantitativo, diseño experimental
de tipo cuasi-experimental y nivel explicativo. En este estudio se realizaron ensayos
en el laboratorio para obtener las propiedades físicas y mecánicas, teniendo las
dosificaciones ABS (0.5% +1% + 1.5% + 2%) y FBC (1.5%), lo cual se obtuvo el
porcentaje más optimo (ABS 1% + 1.5% FBC). Esta evaluación se realizó
cumpliendo con las normas técnicas (NTP y ASTM). La zonificación se define bajo
los criterios de las necesidades sociales y ambientales. Los resultados muestran
que la incorporación tiene un impacto positivo en las resistencias del concreto. La
adición proporcionó al concreto una mejor resistencia a la deformación de las
fisuras
A novel allele of the P‑starvation tolerance gene OsPSTOL1 from African rice (Oryza glaberrima Steud) and its distribution in the genus Oryza
No full textWe have developed allele-specific markers for molecular breeding to transfer the PSTOL1 gene from Kasalath to African mega-varieties, including NERICAs, to improve their tolerance to P-deficient soil. The deficiency of phosphorus (P) in soil is a major problem in Sub-Saharan Africa due to general nutrient depletion and the presence of P-fixing soils. Developing rice cultivars with enhanced P efficiency would, therefore, represent a sustainable strategy to improve the livelihood of resource-poor farmers. Recently the Pup1 locus, a major QTL for tolerance to P deficiency in soil, was successfully narrowed-down to a major gene, the protein kinase OsPSTOL1 (P-starvation tolerance), which was found to be generally absent from modern irrigated rice varieties. Our target is to improve the tolerance of African mega-varieties to P deficiency through marker-assisted introgression of PSTOL1. As a first step, we have determined the Pup1 haplotype and surveyed the presence or absence of PSTOL1 and other genes of the Pup1 locus in African mega-varieties, NERICAs (New Rice for Africa) and their Oryza glaberrima parents. Here, we report the presence of a novel PSTOL1 allele in upland NERICAs that was inherited from the O. glaberrima parent CG14. This allele showed a 35 base-pair substitution when aligned to the Kasalath allele, but maintained a fully conserved kinase domain, and is present in most O. glaberrima accessions evaluated. In-silico and marker analysis indicated that many other genes of the Kasalath Pup1 locus were missing in the O. glaberrima genome, including the dirigent-like gene OsPupK20-2, which was shown to be downstream of PSTOL1. We have developed several allele-specific markers for the use for molecular breeding to transfer the PSTOL1 gene from Kasalath to African mega-varieties, including NERICAs
Alternate wetting and drying irrigation for rice in Bangladesh: Is it sustainable and has plant breeding something to offer?
Get PDFThe crop management practice of alternate wetting and drying (AWD) is being promoted by IRRI and the national research and extension program in Bangladesh and other parts of the world as a water-saving irrigation practice that reduces the environmental impact of dry season rice production through decreased water usage, and potentially increases yield. Evidence is growing that AWD will dramatically reduce the concentration of arsenic in harvested rice grains conferring a third major advantage over permanently flooded dry season rice production. AWD may also increase the concentration of essential dietary micronutrients in the grain. However, three crucial aspects of AWD irrigation require further investigation. First, why is yield generally altered in AWD? Second, is AWD sustainable economically (viability of farmers' livelihoods) and environmentally (aquifer water table heights) over long-term use? Third, are current cultivars optimized for this irrigation system? This paper describes a multidisciplinary research project that could be conceived which would answer these questions by combining advanced soil biogeochemistry with crop physiology, genomics, and systems biology. The description attempts to show how the breakthroughs in next generation sequencing could be exploited to better utilize local collections of germplasm and identify the molecular mechanisms underlying biological adaptation to the environment within the context of soil chemistry and plant physiology
Musik Kelambut Identitas Etnis Papua di Sentani
Get PDFKata Pengantar
Puji syukur dipanjatkan kehadapan Ida Sanghyang Widhi Wasa
(Tuhan Yang Maha Esa), karena atas Asung Kertha WaranugrahaNya, penyusunan buku berjudul “Musik Kelambut, Identitas Etnis
Papua di Sentani’ dapat diselesaikan.
Buku ini merupakan hasil penelitian tentang eksistensi musik
Kelambut sebagai bagian dari seni budaya masyarakat Papua yang
ada di Sentani, Jayapura. Ketertarikan penulis pada Kelambut dimulai
ketika acara Seminar pendirian Institut Seni Budaya Indonesia (ISBI)
Tanah Papua yang dilaksanakan di Gedung Sasana Krida, Kantor
Gubernur Papua, pada tanggal 23 November 2012. Upacara
pembukaan seminar itu ditandai dengan pemukulan dua buah
Kelambut. Setiap instrument dimainkan oleh dua orang yaitu
Kelambut pertama dimainkan oleh Plt. Gubernur Papua, Bpk. Ir.
Constant Karma bersama wakil dari Ditjen Dikti, Kemdikbud;
sedangkan Kelambut yang kedua dimainkan oleh Rektor ISI
Denpasar, Prof. Dr. I Wayan Rai S., MA. bersama Kadis Pendidikan
Papua, Dr. James Modouw.
Pengalaman memainkan Kelambut untuk pertama kalinya pada
saat pembukaan seminar itu mendorong penulis semakin kuat untuk
meneliti instrumen musik khas Sentani ini secara lebih mendalam.
Selanjutnya, di sela-sela kesibukan sebagai Rektor ISBI Tanah Papua
(2014-2020), apabila ada waktu luang selalu dimanfaatkan untuk
meneliti Kelambut di Sentani, Jayapura.
Sesuai dengan latar belakang keilmuan penulis sendiri maka
pengkajian tentang Kelambut di Sentani dilakukan dalam perspektif
Etnomusikologi. Dalam hubungan ini kajian tentang Kelambut
ditekankan pada studi tentang musik itu sendiri (interms of itself) dan
fungsinya dalam konteks sosial budaya masyarakat pendukungnya
(its socio-cultural context).
Hasil dan temuan dari penelitian ini disajikan dalam lima bab
sebagai berikut. Pada Bab 2 diketengahkan tentang Etnografi
Kabupaten Jayapura. Di dalamnya berisi gambaran wilayah
Kabupaten Jayapura, deskripsi tentang sekilas sejarah Kabupaten
Jayapura dan gambaran penduduk Kabupaten Jayapura. Diuraikan
pula tinjauan historis masyarakat Sentani serta kehidupan religi
masyarakat Sentani.
Topik inti buku ini adalah tentang keberadaan musik Kelambut
di Sentani. Untuk itu pada Bab 3 dibahas musik Kelambut sebagai
identitas etnis Papua di Sentani. Di dalamnya diuraikan Kelambut
sebagai objek Etnomusikologi, serta penjelasan lebih rinci perihal
eksistensi musik Kelambut di Sentani.
Sebagai bagian dari seni budaya Papua, dewasa ini keberadaan
musik dihadapkan kepada ‘persaingan esksistensi seni-budaya global’
pada era revolusi Industri 4.0. Oleh karena itu, dalam Bab 4 disajikan
sub bahasan yang mengulas upaya merawat dan mengembangkan
Kelambut di Era Global. Di dalamnya dideskripsikan lebih lanjut
musik Kelambut dalam Festival Danau Sentani (FDS),
pengembangkan musik Kelambut pada era global, serta langkah
strategis dalam pengembangan musik Kelambut.
Buku ini tidak akan pernah tersusun tanpa dukungan berbagai
pihak. Untuk itu, ijinkan saya menyampaikan ucapan terima kasih dan
penghargaan yang setinggi-tingginya kepada Dr. Ni Made Ruastiti,
SST., MSi. yang telah bersedia meluangkan waktu dan pikiran
sebagai editor dari buku ini, teman sejawat di lingkungan ISBI Tanah
Papua, di antaranya Dr. Yunus Wafom, Dr. Don A.L. Flassy, Yanes
Koyari, S.Sn., Veronika Lisorante Samban, Aprylin C. Simatupang,
Raja Frans, Dalid Purba, Ida Bagus Surya Pradantha, SSn. MSn.,
Syafiuddin, M.Sn. Beribu terimakasih, saya sampaikan juga kepada
teman-teman seniman Papua seperti Pilo Modouw (informan kunci
dalam penelitian Kelambut ini), Olof Marwery, Daud Wally, Agus Ohee, Erick Rumbrawer, Hendrik Baransano, Alfred Mofu, dan
Darlene Litaay. Secara khusus penulis ingin menyampaikan ucapan
terimakasih kepada sdr. Hengky Yarangga yang sangat setia
menemani penulis “berpetualang” di bumi Cendrawasih selama enam
tahun lebih (14 Oktober 2014 – 8 Desember 2020). Dukungan yang
luar biasa juga datang dari Bp. Komang Alit Widana (Ketua PHDI
Papua), Ida Bagus Suta Kertya (Ketua PHDI Jayapura), para
Sulinggih dan seluruh semeton penyungsung Pura Agung Surya
Bhuvana, Jayapura. Penghargaan dan ucapan terimakasih juga saya
sampaikan kepada Bp. Drs. I Gusti Made Sudarmika (Kepala Balai
Arkeologi Papua), Mas Hari Suroto (peneliti Balai Arkeologi Papua),
Ibu Dessy Usmani (Kepala Balai Pelestarian Nilai Budaya, Papua), I
Made Suda (staf BPNB) Papua; Ricky Irawan, S.Sn., M.Sn., Arya
Pageh Wibawa, ST., M.Ds. (ISI Denpasar). Tak ketinggalan pula
motivasi yang luar biasa datang dari the Sadguna’s (Nini Ceyi, Degus,
Dikla, Omang, Makyu, Satya, Ajus, dan Ayu Dyah). Kepada temanteman yang lain yang tak dapat saya sebutkan satu persatu, saya
ucapkan terimakasih. Semuanya telah berkenan memberi motivasi,
informasi dan data lapangan sehingga proses penelitian dan
penyusunan buku ini bisa dilaksanakan.
Tiada gading yang tak retak, begitu pula format dan isi buku
ini yang belum sepenuhnya sempurna. Untuk itu, bilamana ada saran,
kritik dan masukan dari pembaca untuk penyempurnaan buku ini
lebih lanjut penulis akan terima dengan senang hati dan lapang dada.
Akhirnya, penulis berharap semoga buku ini ada manfaatnya
baik secara teoritis maupun praktis dalam upaya pengembangan
musik Kelambut pada khususnya serta pelestarian dan pengembangan
seni-budaya masyarakat Papua pada umumnya. Semoga dunia ini
dapat kita tundukkan dengan kebenaran, kesucian, dan keindahan
(Satyam, Siwam, Sundaram).
Denpasar, 6 Agustus 202
