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Cryptococcus neoformans in populations of columbids in the municipality of Medellín – Colombia, and associated zoonotic risks
Get PDFilustraciones, fotografías a color, mapasEn la actualidad, existe una problemática generada por el aumento de la densidad poblacional de la paloma doméstica o de Castilla (Columba livia), especie introducida desde hace muchos años en América, la cual, por sus características físicas y comportamentales genera simpatía en las poblaciones humanas, que en muchas ocasiones suministran alimento y refugio para las palomas. Las principales ciudades de Colombia son un foco importante para la proliferación de la especie, debido a las características de su infraestructura, ya que se asemeja a las zonas habitadas por estas en el ambiente natural (acantilados rocosos), factor que ha influido en su establecimiento y su proliferación. La zona urbana del municipio de Medellín no es ajena a esta problemática, pues las personas han creado palomeras y se han gestionado suministros a través de la administración municipal para velar por su alimentación, desconociendo que esta especie ha sido referenciada como transmisora potencial de microorganismos como virus, bacterias y hongos, dentro de los que está el Cryptococcus neoformans, hongo levaduriforme encapsulado que se puede encontrar en sus heces y es el causante de la enfermedad zoonótica denominada criptococosis, que se manifiesta con inflamación de tejidos blandos, principalmente del sistema nervioso central en personas con sistema inmune comprometido. Este estudio se enfocó en el estudio de la presencia del hongo en las poblaciones de palomas mediante el muestreo de los acúmulos de sus heces, ya que ese es el medio propicio para el crecimiento del hongo; se pensó inicialmente en estudiar otras poblaciones de colúmbidos que habitan la ciudad, como Columbina talpacoti y Zenaida auriculata, pero se encontró que estas no generan acúmulos de excretas por sus números reducidos y su ecología, por lo que se excluyeron de la investigación. De acuerdo con lo anterior, se determinó la presencia del microorganismo en los hábitats urbanos usados por las poblaciones de C. livia, para lo cual se visitaron 75 estaciones distribuidas en 14 comunas de la ciudad de Medellín, en las que se tomaron 75 muestras de sus heces. Como resultado, 4 fueron positivas para la presencia de C. neoformans; estas se registraron en las comunas: 3 (Plaza Campo Valdés), 4 (Iglesia San Cayetano), 11 (Universidad Pontificia Bolivariana) y 16 (Unidad deportiva Belén), permitiendo determinar las zonas que representan un posible riesgo ambiental, por lo que es pertinente establecer medidas de manejo y control poblacional para las palomas de Castilla, y así minimizar los factores de riesgo ambiental que puedan afectar la salud humana y la estabilidad ecológica de este ecosistema urbano (Texto tomado de la fuente)At present, there is a problem generated by the increase in the population density of the domestic pigeon or Castilla pigeon (Columba livia), a species introduced for many years in America, which, due to its physical and behavioral characteristics, generates sympathy in the human populations, which often provide food and shelter for pigeons. The main cities of Colombia are an important focus for the proliferation of the species, due to the characteristics of its infrastructure, since it resembles the areas inhabited by them in the natural environment (rocky cliffs), a factor that has influenced its establishment and its proliferation. The urban area of the municipality of Medellín is no stranger to this problem, since people have created pigeon houses and supplies have been managed through the municipal administration to ensure their diet, unaware that this species has been referenced as a potential transmitter of microorganisms such as viruses, bacteria and fungi, including Cryptococcus neoformans, an encapsulated yeast-like fungus that can be found in their feces and is the cause of the zoonotic disease called cryptococcosis, which manifests with inflammation of soft tissues, mainly of the central nervous system in people with compromised immune systems. This study focused on the study of the presence of the fungus in the populations of pigeons by sampling the accumulations of their feces, since this is the favorable environment for the growth of the fungus; Initially, it was thought of studying other populations of columbids that inhabit the city, such as Columbina talpacoti and Zenaida auriculata, but it was found that these do not generate excreta accumulations due to their reduced numbers and their ecology, so they were excluded from the research. According to the above, the presence of the microorganism in the urban habitats used by the populations of C. livia was determined, for which 75 stations distributed in 14 communes of the city of Medellín were visited, in which 75 samples of stool were taken. As a result, 4 were positive for the presence of C. neoformans; these were registered in the communes: 3 (Plaza Campo Valdés), 4 (San Cayetano Church), 11 (Universidad Pontificia Bolivariana) and 16 (Belén Sports Unit), allowing to determine the areas that represent a possible environmental risk, so it is It is pertinent to establish population management and control measures for Castilian pigeons, and thus minimize environmental risk factors that may affect human health and the ecological stability of this urban ecosystemMaestríaMagíster en Ciencias - BiologíaLínea Manejo y Conservación de la Vida Silvestr
Evaluación de los patrones de comportamiento de Saguinus leucopus asociados a cuatro condiciones de encierro diferentes y su relación con niveles de estrés
Get PDFColombia es considerada como uno de los países más diversos en primates neotropicales, con aproximadamente 31 especies, 5 de las cuales son endémicas (Aotus jorgehernandezi, Saguinus leucopus, S. oedipus, Callicebus caquetensis, C. ornatus) en conjunto con al menos 7 subespecies (Ateles hybridus brunneus, Callicebus torquatus medemi, Cebus albifrons cesarae, Lagothrix lagothricha lugens, Pithecia monachus milleri, Saguinus nigricollis hernandezi, Saimiri sciureus albigena). De éstas, 13 se encuentran en peligro de extinción. Lo anterior se debe a factores como el tráfico ilegal, deforestación, construcción de obras y desarrollo de megaproyectos. Para mantener la supervivencia de estas especies, los principales esfuerzos de conservación se centran en los procesos de rehabilitación y reintroducción llevados a cabo en los centros de rehabilitación y rescate de fauna silvestre, dado que a través del manejo en cautiverio se puede mantener manadas o individuos bajo condiciones controladas que permitan aumentar las tasas de reproducción y el establecimiento de poblaciones viables que sirvan como reservorio genético para el futuro. Tratándose de especies endémicas y sensibles, las tasas de supervivencia en cautiverio son variables, por lo que garantizar que puedan regresar a su medio natural y permanezcan en él no es un objetivo fácil de alcanzar. El estrés es un indicador de la dificultad de adaptación de los animales silvestres al cautiverio y a la carencia de condiciones favorables de los encierros. Uno de los indicadores de estrés más estudiados en animales cautivos es la concentración de cortisol. La respuesta comportamental a situaciones estresantes en primates ha sido estudiada por diversos autores, los cuales han definido las siguientes categorías, con sus respectivos comportamientos, como indicadores de estrés: estereotipias, conductas autoimpartidas (autoacicalamiento y rascado), descanso y ocultamiento. Igualmente, se ha demostrado que existen condiciones del cautiverio que aumentan el estrés como lo son los patrones de alimentación, limpieza de los encierros, temperatura, cercanía a predadores, presencia de visitantes, estructura física de los encierros, nivel de ruido, condiciones sociales y entorno social. Por lo anterior, esta investigación pretendió probar las siguientes hipótesis: 1. Las categorías de estereotipias, conductas autoimpartidas, descanso y ocultamiento están asociadas a altos niveles de estrés en individuos de Saguinus leucopus en cautiverio; 2.Los comportamientos que integran las categorías de estereotipias, conductas autoimpartidas, descanso y ocultamiento se exhiben de forma diferente en los cuatro encierros analizados; 3. Características del cautiverio como las diferentes formas de interferencia de los humanos (patrones de alimentación, limpieza de los encierros, presencia de visitantes, estructura física del encierro, ruido, temperatura, confinamiento, cercanía a predadores y conformación de grupos) y el entorno social, afectan los niveles de estrés en individuos de Saguinus leucopus. Para ello se escogió una muestra de 14 individuos de la especie S.leucopus mantenidos en cuatro tipos de encierro diferentes, dos en la Unidad de Rescate y Rehabilitación de Animales Silvestres de la Universidad Nacional de Colombia-URRAS y dos en el zoológico del Parque Jaime Duque. Se midió el número de exhibiciones por individuo de los comportamientos que integraron las categorías de estereotipias, conductas autoimpartidas (autoacicalamiento y rascado), descanso y ocultamiento mediante muestreo ad libitum con registro continuo y animal focal. La concentración de cortisol fecal fue medida mediante la prueba de Elisa y los datos de condiciones del cautiverio y entorno social se tomaron con base en los resultados de diversas fuentes de información primaria y observaciones en campo. Mediante el análisis de Spearman se estableció la correlación entre la concentración de cortisol y los comportamientos que integraron las categorías mencionadas; mediante análisis de varianza (ANOVA) se determinó las diferencias de exhibición de los comportamientos que integraron las categorías mencionadas en los cuatro encierros analizados; mediante la prueba de chi-cuadrado, se determinó la relación por independencia de las condiciones del cautiverio y el entorno social con el cortisol, y finalmente mediante odds ratio y regresión múltiple se determinó la fuerza de dependencia de estas variables. Los comportamientos que presentaron correlación directa significativa con el cortisol fueron desplazamiento colgando de 4 patas, rascado, desperezarse y meterse en la cama o casa, y el que presentó correlación inversa signficativa fue ocultarse. Los demás comportamientos no registraron correlación significativa con el cortisol. Los comportamientos que integraron la categoria “Estereotipias”, fueron significativos entre los encierros III y IV; la categoría “Conductas autoimpartidas”, tuvo un patrón de exhibición significativamente diferente entre los cuatro encierros analizados, este resultado está definido por las diferencias entre los encierros I-II y II-IV; la categoría “Descanso”, no tuvo un patrón de exhibición significativamente diferente entre los cuatro encierros analizados; la categoría “Ocultamiento” si bien registró un valor p superior a 0.05, éste fue muy cercano al limite, razón por la cual se tuvo en cuenta en esta investigación, los resultados indican que la diferencia está dada principalmente entre lo encieros I-II y I-IV. Las condiciones de cautiverio Repartir, extender y esconder la comida, y Animales provenientes de incautaciones por tráfico ilegal, son las que mayor asociación por independencia tuvieron con el cortisol; Presencia de macho dominante, Ruido, Hembra unida a un macho no conocido y Presencia de visitantes registraron valores que no fueron significativos. Sin embargo, de las dos primeras no se descarta su dependencia del cortisol. Las condiciones restantes registraron asociación por independencia con el cortisol, Mobiliario fue la condición con mayor dependencia del cortisol seguida en orden descendente por Presencia de arboles naturales, Variedad de sustratos, Uso de la dimensión vertical, Cercania a predadores, Limpieza de encierros, Presencia de vegetación no natural o natural seca para soporte, Animales encerrados individualmente yTemperatura.Abstract. Colombia is considered one of the most diverse countries in Neotropical primates, with about 31 species, 5 of which are endemic beside 7 subspecies. Of these, 13 are endangered. This is due to factors such as illegal trafficking, deforestation, construction projects and megaprojects. To maintain the survival of these species, major conservation efforts focus on rehabilitation and reintroduction processes carried out at wildlife rescue centers, since through controlled captive management can be kept herds or individuals under controlled conditions that increase reproduction rates to establish viable populations, which will be genetic reservoir to the future. In the case of endemic and sensitive species, survival rates in captivity are variables, so ensure they can return to their natural environment and remain in it, is not an easy goal to achieve. As an indicator of the difficulty of animal adaptation to captivity and the lack of favorable enclousure conditions, it is stress. One of the most studied indicators of stress in captive animals is cortisol. The behavioral response to stressful situations in primates has been studied by various authors, which have defined the following categories, with their respective behaviors, such as stress indicators: stereotypies, self-applied behaviors (selfgrooming and scratching), rest and hiding. Similarly, it has been shown that there are conditions of captivity that increase stress such as nutritional patterns, cleaning patterns, temperature, predators proximity, visitors presence, enclosure structure, noise level, social conditions and social environment. Therefore, this study sought to test the following hypotheses: 1. Stereotypies, self-applied behaviors, rest and hiding categories, are associated with high stress levels in individuals of white-footed tamarin in captivity; 2.The behaviors that integrated the categories of stereotypies, self-applied, rest and hiding are displayed differently in the four enclousures analyzed; 3. Characteristics of captivity such as different forms of human interference (nutritional patterns, cleaning patterns, visitors presence, enclousure structure, noise level, temperature, predators proximity and group conformation) and social environment, affect stress levels in individuals of white-footed tamarin. Thus, a sample of 14 individuals of S.leucopus held in four different enclosures, two at Colombia National University´s Wild Life Rescue and Rehabilitation Unit and two at Jaime Duque Zoo, were chosen. It was measured the number of exhibits of each behaviors that integrated the stereotypies, self-applied behaviors, rest and hiding categories, by ad libitum sampling with continuous recording and focal animal. Fecal cortisol concentration was measured by ELISA test and captivity conditions and social environment data were taken based on the results of various primary information sources and field observations. By Spearman correlation analysis it was establish the correlation between cortisol and those behaviors which integrated the categories mentioned; by variance analysis (ANOVA) it was established the different display of behaviors that integrated the categories mentioned above and by multiple regression analysis, it was established the influence degree, in captivity, of human interferences and social environment in stress levels. Behaviors that had significant direct correlation with cortisol were hanging in four-foot, scratching, stretching and get into bed or home, and the one which had significant inverse correlation was hidden. Other behaviors reported no significant correlation with cortisol. Behaviors that formed the “Stereotypies” category were significant different between III and IV enclousures; “Self-applied” category´s behaviors had a pattern display significantly different between the four runnings analyzed, this result is defined by the differences between the I- II and II – IV enclosures ; "Rest" category did not have a pattern display significantly different between the four runnings analyzed ; “Hiding” category, although recorded a p value greater than 0.05, it was very close to the limit, so it was taken into account in this research, the results indicate that the difference is due mainly between I- II and I- IV enclousures.Related to captivity conditions “Extend, and hiding food” and “Animals from illegal traffic”, were the most associated with cortisol; “Dominant male presence”, “Noise”, “Female with unknown male” and “visitors presence” were not significant. However, the first two cortisol dependence was not discarded. The remaining conditions registered association with cortisol, “Furniture” was the most associated with cortisol, followed in descending order, by “Natural trees presence”, “Diffetrent substrates” , “Vertical dimension use”, “Predators”, “Cleaning cages patterns”, “Vegetation support”, “Individually locked animals” and “Temperature”Maestrí
Comportamiento de la ardillas sciurus granatensis y microsciurus pucheranii en cautiverio antes y después de la implementación de un plan de enriquecimiento ambiental
Get PDFBiólogo (a)Pregrad
Análisis de los factores asociados a la presencia de micobacterias tuberculosas y no tuberculosas en tres géneros de primates colombianos cautivos (Saguinus, Cebus y Saimiri)
Get PDFLas micobacterias no tuberculosas (MNT) son patógenos oportunistas en huéspedes inmunocomprometidos. Las fuentes de infección son variables y es necesario determinarlas. El objetivo de este trabajo fue analizar los factores asociados a la presencia de micobacterias en primates cautivos. Se analizaron muestras de lavado gástrico y sangre de 94 primates en tres centros de recepción de fauna. La identificación de micobacterias se realizó utilizando pruebas bioquímicas y mediante el método molecular PCR análisis de restricción del gen hsp65 (PRA). Para determinar la asociación entre variables individuales y de alojamiento se realizó regresión logística binaria con base en Odds Ratios (OR), luego de la estimación de independencia con chi2. Un valor de p0,05 se consideró significativo, y un OR1 como una fuerte asociación entre variables. Se encontró una prevalencia de MNT de 20,2% principalmente en el género Saimiri (M. alvei, M. terrae, M. nonchromogenicum, M. peregrinum, M. boenickei M. abcessus, M. flavescens, M. intracellulare, M. phlei, M. moriokaense, M. vanbaalenii, M. gordonae y M. simiae). La presencia de micobacterias fue mayor en primates de bajo peso, en alojamientos con alta temperatura y elevada pluviosidad, y en substratos de tierra. El género de primate y la presencia de otro grupo taxónomico en el encierro también mostraron dependencia. La presencia de MNT se asoció al comportamiento de la especie, las condiciones ambientales y la diversidad micobacteriana en ciertos substratos. De acuerdo a estos resultados, se concluye que es importante evaluar las posibles fuentes de infección con MNT, y monitorear a los animales con bajo peso.Abstract. Nontuberculous mycobacteria (NTM) are opportunistic pathogens in immunocompromised hosts. The sources of infection could vary and it is necessary to determine them. The aim of this study was to determine and to analyze the factors associated to the occurrence of mycobacteria in captive primates. Gastric lavage and blood samples of 94 primates located in three centers of wildlife reception were analyzed. Identification was made by biochemical test and PCR-restriction analysis of hsp65 gene (PRA). The association between individuals and location variables was made by binary logistic regression based on Odds Ratios (OR), after chi2 independence estimation. It was considered significant at p-value 0.05 and a strong association at OR 1. A prevalence of 20% of NTM was found mainly in Saimiri (M. alvei, M. terrae, M. nonchromogenicum, M. peregrinum, M. boenickei M. abcessus, M. flavescens, M. intracellulare, M. phlei, M. moriokaense, M. vanbaalenii, M. gordonae and M. simiae). Mycobacteria occurrence was higher in low weight primates, in locations with high temperature and high pluviosity, and in soil substrates. The genus of the primate generates and the presence of another taxonomic group also showed dependency. The presence of NTM was associated with the behavior of the species, environmental conditions and mycobacterial diversity in some substrates. According to these results, it is important to evaluate NTM sources of infectious and to monitor animals with low body weight.Maestrí
Efecto del estrés sobre la calidad seminal del titi gris (Saguinus leucopus) bajo condiciones de cautiverio.
Get PDFSe realizó el intento de colecta de semen mediante la técnica de estimulación vibratoria del pene (EVP) a quince (15) especímenes de tití gris (Saguinus leucopus) bajo condiciones de cautiverio en cuatro sitios a nivel nacional, con el objetivo de llevar a cabo la estandarización de la técnica, la caracterización seminal y la comparación de los niveles de cortisol en heces para evaluar si el estrés afectaba la calidad seminal. Se empleó Ketamina a dosis entre 5 a 10 mg/Kg para la sedación previo al muestreo, se obtuvo en el uso de la técnica un 52,6% de éxito en la combinación de 90 Hz de vibración y 1 mm de amplitud; tiempo de eyaculación de 12:35±6:42 minutos; pH de 7,5±0,26; volumen de 24±18,82 µL; motilidad masal de 3,7/5,0±0,5; motilidad progresiva de 97,1±45,4%; concentración espermática de 87617±21327 x 104 spz/µL; normalidad de 69,3±11,06% y viabilidad de 93,7±4,9%. Se empleó satisfactoriamente el diluyente TALP-HEPES y este no afecto las características antes descritas. Los resultados arrojados para la concentración de cortisol en heces no tuvieron incidencia en las características seminales de los animales muestreados, solamente el tiempo de eyaculación tuvo una débil relación (r2=0,24; coef correl=-0,04), ya que fue ligeramente prolongado en animales probablemente estresados causado posiblemente por el estrés de cautiverio y de captura; se podría especular que entre mayor nivel de estrés, mayor dificultad en la eyaculación. La EVP es un método innovador, replicable, viable y seguro para la obtención de semen en Saguinus leucopus y quizás en otros callitríchidos. / Abstract. Semen collection attempts were performed by the technique of penile vibratory stimulation (PVS) in fifteen (15) specimens of silvery-brown tamarin (Saguinus leucopus) in captivity at four locations, with the aim to standardize the technique, to characterize the semen and to compare the cortisol levels to evaluate if stress affected the seminal quality. Ketamine was use in a dose between 5 to 10 mg/Kg of the sedation for the semen sampling. The success obtained in the use of the technique was 52,6% in the combination of 90 Hertz of vibration and 1 mm of amplitude; time of ejaculation of 12:35 ±6:42 minutes; pH of 7,5±0,26; volume of 24±18,82 μL; masal motility of 3,7/5,0±0,5; progressive motility of 97,1±45,4%; sperm concentration of 87617±21327 x 104 spz/μL; normal morphology 69,3±11,06% and viability of 93,7±4,9%. TALP-HEPES extender was satisfactorily use and did not affect the seminal characteristics. The results of the cortisol levels in feces did not have incidence on the seminal characteristics, but only the time of ejaculation was weakly related (r2=0,24, corre coef=-0,04), since it was slightly prolonged in apparently stressed animals probably caused by the captivity and capture stress. It could be possible to speculate that greater level of stress could increase the difficulty in the ejaculation. The PVS is an innovating, replicable, viable and safe method for obtaining semen in Saguinus leucopus and perhaps in other callitrichids.Maestrí
A review of ulcerative stomatitis in snakes
No full textInfectious stomatitis in ophidians is a frequent clinical condition in the management of wild animals in captivity. It is mainly associated with stress, environmental and nutritional deficiencies or with other diseases that increases the risk of growing pathogenic organisms, causing the death of the animal. Clinical signs could not be easy to detect and therefore it is recommended to carry out periodic monitoring of snakes in captivity. Due to the multi-factorial condition, one or several etiologic agents can cause or perpetuate the disease, being very important the continuous collection of mouth smear to perform specific analysis such as cultures and antibiograms, in order to guarantee a successful identification and treatment. In advanced cases, the prognosis is usually poor due to septicemia and secondary effects such as pneumonia and osteomielitis or gastroenteritis by single continuity through the digestive tract and; therefore the main resource against this disease is to minimize the exposition of the snake to predisposing factors or stress that could threaten their life.La estomatitis en ofidios es una condición de frecuente diagnóstico en la clínica de animales silvestres. Se relaciona principalmente con eventos estresantes como deficiencias medioambientales, nutricionales o una enfermedad subyacente, las cuales terminan favoreciendo el crecimiento de gérmenes patógenos y, de esta forma, llevan a la muerte del animal. Los signos clínicos pueden pasar inadvertidos por un tiempo variable, por lo que se recomienda hacer revisiones periódicas a los ofidios en cautiverio. Debido a que es una entidad multifactorial, uno o varios agentes etiológicos se implican como causales y perpetuantes de la condición, por lo que es de gran importancia someter las muestras colectadas a análisis específicos, para así poder identificarlos y garantizar un mayor éxito en el momento de instaurar un tratamiento. En casos avanzados el pronóstico casi siempre es malo debido a la posibilidad de una diseminación hematógena, con sus efectos secundarios como neumonía y osteomielitis, o por continuidad, causando gastroenteritis. Por ello, la principal herramienta de combate frente a la entidad es minimizar la exposición de los ofidios a factores predisponentes o estresantes, que sin lugar a dudas ponen en peligro la vida del animal
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Get PDFThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Get PDF“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Get PDFWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
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