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Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
The present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
The impact of early life adversity on cortical structure in adolescent twins followed since birth
Des études animales ont montré que l’exposition du foetus à l’adversité affecte le développement cérébral et la régulation d’émotions plus tard. Cette régulation serait reliée aux changements structurels cérébraux, particulièrement au circuit fronto-limbique. Cependant, ces résultats n’ont pas été entièrement répliqués chez l’humain. Le but de cette étude était de tester si l'adversité précoce conduit à des altérations structurelles des régions (orbitofrontal, préfrontal, cingulaire) fronto-limbiques, identifiées comme régions-clés dans la (de)régulation d’émotions. Les mesures principales de l’adversité étaient un poids léger à la naissance et l’hostilité maternelle puisqu’ils étaient parmi les plus prédictifs des résultats développementaux et comportementaux chez l’humain. Les mesures secondaires, incluant le tempérament difficile d’enfant et l’impulsivité en adolescence, étaient utilisées du à leur lien avec le développement cérébral et émotionnel. Les participants étaient des jumeaux identiques, membres de l’Étude des Jumeaux Nouveau-nés du Québec (ÉJNQ, N = 650 paires) suivis depuis 5 mois à 15 ans, leur âge actuel. Ceci a permis de mieux contrôler le facteur génétique et ainsi mieux isoler les effets d’environnement. Trente-sept paires ont été recrutées. La structure cérébrale de chacun, obtenue avec l’imagerie par résonance magnétique, a été analysée avec la régression linéaire. Le poids à la naissance n’a eu aucun effet. L’hostilité maternelle a prédit une réduction de l’aire du gyrus cingulaire postérieur. Tempérament difficile a prédit une réduction de l’aire du cortex orbitofrontal. L’impulsivité était associée avec l’aire et volume du cortex préfrontal réduits. Ces résultats soulignent l’importance des interventions précoces afin d’empêcher des altérations menant à la psychopathologie.Animal studies have shown that fetal exposure to adversity affects brain development and emotion regulation later on. Emotion regulation would be related to a structural change in the brain, particularly the fronto-limbic circuitry. However, results have not been entirely confirmed in humans. The purpose of the present study was to test whether early adversity
leads to structural changes in the fronto-limbic (prefrontal, orbitofrontal and cingulate)
regions, previously identified as key areas in emotion (dys)regulation. Main measures of
adversity were low birth weight and maternal hostility because these were among the best
predictors of developmental and behavioral outcomes in humans. Secondary measures,
including difficult child temperament and adolescent impulsivity, were used because of their
link with brain and emotion development. Participants were identical twins part of Quebec
Study of Newborn Twins (QSNT, N = 650 pairs), followed from 5 months to 15 years, their
current age. Using identical twins allowed to better control the genetic factors and, thus, to
better isolate the specific effects of early environment. Thirty-seven pairs have been recruited. Each twin’s brain structure was assessed with magnetic resonance imaging and analyzed using linear regression. Birth weight showed no effect on brain structure. Maternal hostility predicted a reduction in cortical area of posterior cingulate gyrus. Difficult child temperament predicted a reduction in cortical area of orbitofrontal cortex. Impulsivity was associated with smaller cortical area and volume in prefrontal cortex. These results highlight the importance of the early interventions in order to prevent the alterations leading to development of psychopathology
Variations on the Author
“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
We provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Méthylation de gènes liés au stress à travers différents tissus périphériques humains, et la pertinence pour le fonctionnement cérébral
Différents facteurs environnementaux peuvent influencer l'expression génétique via des modifications épigénétiques telles que la méthylation de l'ADN. Un nombre grandissant d’études épigénétiques psychiatriques font usage de mesures périphériques de méthylation de l'ADN pour la compréhension de la fonction cérébrale et du comportement humain. La méthylation périphérique au niveau de gènes liés au stress a été associée à l’adversité précoce et à la vulnérabilité au développement de troubles de santé mentale. Les échantillons périphériques couramment utilisés sont dérivés du sang, de la salive ou des cellules buccales. Toutefois, nous ne savons toujours pas à quel point les niveaux de méthylation à travers différents tissus périphériques intra-individuels, ainsi que leurs associations respectives avec le fonctionnement cérébral et le comportement, sont comparables. L'objectif de cette étude était d'examiner les associations entre la méthylation périphérique de deux gènes liés au stress, NR3C1 et FKBP5, la connectivité cérébrale au repos et la fonction cérébrale en réponse à des stimuli émotionnels chez 44 adultes en santé. De plus, la force de ces associations a été comparée entre les échantillons de salive et de cellules buccales. Finalement, la stabilité de la méthylation de ces deux gènes à travers différents tissus périphériques, et à travers le temps, a été vérifiée. Les résultats de cette étude démontrent une association positive entre la méthylation salivaire de NR3C1 et la connectivité fronto-limbique au repos, et entre la méthylation de FKBP5 dérivée des cellules buccales et la réponse fronto-médiane bilatérale et parahippocampique gauche à des stimuli de tristesse. Les niveaux de méthylation de FKBP5 dérivés des cellules buccales et de la salive étaient significativement corrélés, des résultats qui n’ont pas été répliqués pour le gène NR3C1. Finalement, les niveaux de méthylation des deux gènes sont demeurés stables pour une période de 2 ans. Nos résultats ouvrent à la possibilité que la stabilité de la méthylation à travers différents tissus périphériques, ainsi que les associations entre la méthylation périphérique et différents processus mentaux, pourraient être spécifiques aux gènes étudiés et aux types de cellules périphériques utilisés.Early environmental factors influence gene expression via epigenetic modifications such as DNA
methylation. Peripheral DNA methylation of stress-related genes has been associated with early
adversity and vulnerability to different mental health outcomes. Commonly used peripheral
samples are derived from blood, saliva or buccal cells. However, it is still not known whether
peripherally derived DNA methylation in a specific cell type is most strongly associated with
human brain processes and behavior. The aim of the present study was to investigate the
association between peripherally derived NR3C1 and FKBP5 methylation, frontal-limbic brain
function and resting-state functional connectivity in healthy adults, and to compare the strength
of these associations across different peripheral tissue samples. Additionally, cross-tissue
convergence and two-year stability of DNA methylation were assessed for both genes. Saliva
derived NR3C1 methylation was associated with greater fronto-limbic resting-state connectivity,
whereas buccal cell-derived FKBP5 methylation was positively associated with bilateral middle
frontal and left parahippocampal response to sad emotional stimuli. Saliva- and buccal cellderived
FKBP5 methylation levels were significantly correlated to one another, and methylation
in both genes remained stable for two years. Results regarding cross-tissue convergence and
were not replicated for NR3C1. These findings suggest that methylation in different genes and in
different peripheral tissues might differently capture brain processes, and that DNA methylation
tissue specificity and time stability might in turn be gene specific
Facteurs de risque précoces et mécanismes neurobiologiques impliqués dans le développement de symptômes de troubles des conduites alimentaires chez les jeunes
Les troubles des conduites alimentaires sont des conditions psychiatriques dont les premiers symptômes apparaissent généralement à l’adolescence. Leurs conséquences à long terme, leurs coûts en soins de santé et leurs impacts sur la qualité de vie en font de graves conditions psychiatriques. Le (neuro)développement durant l’enfance serait une étape clé dans l’émergence des troubles des conduites alimentaires, via par exemple, des facteurs liés à la croissance, à l’alimentation, à l’environnement psychosocial, mais aussi à des aspects neurobiologiques. Toutefois, l’interaction entre ces facteurs variés ainsi que les mécanismes biologiques spécifiques qui mènent à l’émergence des troubles des conduites alimentaires demeurent mal compris, tout comme l’évolution de ces conditions à travers le temps. Cela complique le développement d’interventions efficaces, tant d’un point de vue préventif que thérapeutique. Il y a donc un besoin flagrant d’efforts de recherche sur les troubles des conduites alimentaires, car leur meilleure compréhension permettrait de mieux guider les travaux visant à optimiser leur prévention et leur traitement. De ce fait, l’objectif général de la thèse est de mieux comprendre les facteurs développementaux et les processus neurobiologiques impliqués dans le développement des symptômes de troubles des conduites alimentaires de l’enfance au début de l’âge adulte, par une approche biopsychosociale. La présente thèse est composée de sept chapitres. Les deux premiers chapitres permettent d’introduire les différents concepts d’importance pour les différentes études de la thèse. Les troisième et quatrièmes chapitres présentent deux études développementales sur l’évolution et les facteurs de risque de troubles des conduites alimentaires dans la communauté, afin de mieux caractériser les individus les plus à risque. Le chapitre cinq porte quant à lui sur les corrélats cérébraux du comportement alimentaire chez les enfants, afin d’étudier si des altérations neurobiologiques pourraient être présentes dès l’enfance chez les personnes avec des comportements alimentaires inadaptés. Finalement, les chapitres six et sept abordent les résultats de la thèse d’une façon intégrative, en plus de proposer des perspectives de recherche future. En somme, les travaux de cette thèse pourraient fournir des bases scientifiques qui alimenteront les efforts de recherche visant à mieux dépister et prévenir les troubles des conduites alimentaires dans la communauté.Eating disorders are psychiatric conditions that typically emerge during adolescence. Their long- term consequences, health care costs and impact on quality of life make them serious psychiatric conditions. Childhood (neuro)development is thought to be a key period in the emergence of eating disorders, via, for example, factors related to growth, eating behaviors and the psychosocial environment, but also neurobiological aspects. However, the interaction between these different factors and the specific biological mechanisms leading to the emergence of eating disorders remain poorly understood, as does the evolution of these conditions over time. This complicates the development of effective interventions, both from a preventive and therapeutic perspective. Thus, research efforts are needed to better understand the development of eating disorders, as such efforts could provide insight to optimize prevention and treatment in eating disorders. As such, the overall goal of this thesis is to better understand the developmental factors and neurobiological processes involved in the development of eating disorder symptoms from childhood to early adulthood, using a biopsychosocial approach. The current thesis is composed of seven chapters. The first two chapters introduce the various concepts of importance to the different empirical studies presented in the following chapters of the thesis. The third and fourth chapters are two developmental studies on the development and risk factors of eating disorders in the community, in order to better characterize individuals who are most at risk. Chapter five focuses on the brain correlates of eating behavior in children, in order to identify whether neurobiological alterations could be present already in childhood in individuals with maladaptive eating behaviors. Finally, chapters six and seven discuss the findings of the thesis in an integrative manner, in addition to proposing perspectives for future research. In sum, the work presented in this thesis could provide scientific evidence to inform research efforts to improve the detection and prevention of eating disorders in community settings
The impact of early life adversity on cortical structure in adolescent twins followed since birth
Des études animales ont montré que l’exposition du foetus à l’adversité affecte le développement cérébral et la régulation d’émotions plus tard. Cette régulation serait reliée aux changements structurels cérébraux, particulièrement au circuit fronto-limbique. Cependant, ces résultats n’ont pas été entièrement répliqués chez l’humain. Le but de cette étude était de tester si l'adversité précoce conduit à des altérations structurelles des régions (orbitofrontal, préfrontal, cingulaire) fronto-limbiques, identifiées comme régions-clés dans la (de)régulation d’émotions. Les mesures principales de l’adversité étaient un poids léger à la naissance et l’hostilité maternelle puisqu’ils étaient parmi les plus prédictifs des résultats développementaux et comportementaux chez l’humain. Les mesures secondaires, incluant le tempérament difficile d’enfant et l’impulsivité en adolescence, étaient utilisées du à leur lien avec le développement cérébral et émotionnel. Les participants étaient des jumeaux identiques, membres de l’Étude des Jumeaux Nouveau-nés du Québec (ÉJNQ, N = 650 paires) suivis depuis 5 mois à 15 ans, leur âge actuel. Ceci a permis de mieux contrôler le facteur génétique et ainsi mieux isoler les effets d’environnement. Trente-sept paires ont été recrutées. La structure cérébrale de chacun, obtenue avec l’imagerie par résonance magnétique, a été analysée avec la régression linéaire. Le poids à la naissance n’a eu aucun effet. L’hostilité maternelle a prédit une réduction de l’aire du gyrus cingulaire postérieur. Tempérament difficile a prédit une réduction de l’aire du cortex orbitofrontal. L’impulsivité était associée avec l’aire et volume du cortex préfrontal réduits. Ces résultats soulignent l’importance des interventions précoces afin d’empêcher des altérations menant à la psychopathologie.Animal studies have shown that fetal exposure to adversity affects brain development and emotion regulation later on. Emotion regulation would be related to a structural change in the brain, particularly the fronto-limbic circuitry. However, results have not been entirely confirmed in humans. The purpose of the present study was to test whether early adversity
leads to structural changes in the fronto-limbic (prefrontal, orbitofrontal and cingulate)
regions, previously identified as key areas in emotion (dys)regulation. Main measures of
adversity were low birth weight and maternal hostility because these were among the best
predictors of developmental and behavioral outcomes in humans. Secondary measures,
including difficult child temperament and adolescent impulsivity, were used because of their
link with brain and emotion development. Participants were identical twins part of Quebec
Study of Newborn Twins (QSNT, N = 650 pairs), followed from 5 months to 15 years, their
current age. Using identical twins allowed to better control the genetic factors and, thus, to
better isolate the specific effects of early environment. Thirty-seven pairs have been recruited. Each twin’s brain structure was assessed with magnetic resonance imaging and analyzed using linear regression. Birth weight showed no effect on brain structure. Maternal hostility predicted a reduction in cortical area of posterior cingulate gyrus. Difficult child temperament predicted a reduction in cortical area of orbitofrontal cortex. Impulsivity was associated with smaller cortical area and volume in prefrontal cortex. These results highlight the importance of the early interventions in order to prevent the alterations leading to development of psychopathology
Frontal-limbic brain processes in healthy individuals : environmental, epigenetic and behavioral correlates
Des altérations au niveau du cerveau ont été observées dans le circuit fronto-limbique (incluant le cortex préfrontal, le cortex cingulaire antérieur, hippocampe et amygdale), densément innervé avec la sérotonine, chez les individus souffrant de troubles affectifs. La relation entre les processus fronto-limbiques et le bien-être émotionnel peut être influencée par la génétique et l’environnement, ainsi que par leur interaction (GxE). Toutefois, les mécanismes spécifiques sous-tendant cette relation ne sont pas connus à ce jour. Un mécanisme physiologique sous-jacent l’effet GxE sur l’expression des gènes est la méthylation de l’ADN. Le but de cette thèse était, donc, d'étudier les effets environnementaux sur et la pertinence de la méthylation de l'ADN pour les processus fronto-limbiques chez des individus en bonne santé. Dans la première étude, l'association entre l'humeur au quotidien (évaluée à l’aide de la méthode de journal quotidien) et les processus cérébraux a été étudiée. Dans la deuxième étude, l'association entre la méthylation périphérique du gène du transporteur de la sérotonine [SLC6A4] (liée au fonctionnement émotionnel), provenant de différents tissus, et les processus cérébraux a été étudiée. Dans la troisième étude, nous avons examiné si l'association entre la méthylation périphérique du gène SLC6A4 et les processus cérébraux était indépendante de la variation génétique (en utilisant un échantillon de jumeaux homozygotes). Sommairement, l'humeur négative et positive était positivement associée à la connectivité fonctionnelle au repos entre le cortex cingulaire postérieur et antérieur. La méthylation du gène SLC6A4 était positivement associée au volume cortical préfrontal lorsqu'elle était dérivée du sang, de la salive et des cellules buccales. La méthylation du gène SLC6A4 dérivée des cellules buccales était également positivement associée au volume cortical antérieur cingulaire et à la connectivité fonctionnelle au repos entre les régions pariétales et le cortex cingulaire antérieur. Aussi, la méthylation périphérique du gène SLC6A4 était positivement associée à l'activité corticale orbitofrontale ainsi qu'à la connectivité fonctionnelle entre l’amygdale, le cortex orbitofrontal et le cortex cingulaire antérieur en réponse à des stimuli émotionnels négatifs, indépendamment de la séquence d'ADN des individus. Dans l'ensemble, les résultats actuels pourraient indiquer que la fonction et la structure cérébrale dans les régions fronto-limbiques, particulièrement dans le cortex cingulaire antérieur et préfrontal, sont positivement associées à l'humeur dans la vie quotidienne et à la méthylation périphérique du gène SLC6A4 chez des individus en bonne santé. En outre, la relation entre ces processus fronto-limbiques et la méthylation périphérique du gène SLC6A4 serait largement sous influence de l’environnement. Aussi, les résultats actuels suggèrent que les cellules buccales constitueraient un tissu préférable pour étudier la méthylation du gène SLC6A4 et les processus neuraux apparentés. Des études supplémentaires sont nécessaires pour valider ces résultats auprès de populations cliniques ou chez les individus exposés à des conditions environnementales différentes.Neural alterations have been observed in the frontal-limbic circuitry (including the prefrontal cortex, the anterior cingulate cortex, the hippocampus and the amygdala), densely innervated with serotonin, in the individuals with affective disorders. Relationship between the frontal-limbic processes and emotional well-being is affected by the genetics and the environment as well as by their interaction (GxE). Yet, the specific mechanisms are not known to this day. The aim of the present thesis was to study the environmental effects on and the relevance of DNA methylation (a physiological mechanism underpinning the GxE influences on gene expression) for the frontal-limbic brain processes in healthy individuals. In the first study, association between the daily-life mood (assessed using a daily diary method) and the brain processes was studied. In the second study, association between the peripheral DNA methylation in the serotonin transporter [SLC6A4] gene (linked to emotional functioning), derived from different tissues, and the brain processes was examined. In the third study, we examined whether the association between the peripheral SLC6A4 gene methylation and the brain processes was independent of the genetic variation (using a monozygotic twin sample). Briefly, daily-life negative and positive mood was positively associated with the resting-state functional connectivity between posterior and anterior cingulate cortices. The SLC6A4 gene methylation was positively associated with the prefrontal cortical volume when derived from blood, saliva and buccal cells; buccal-derived SLC6A4 gene methylation was also found to be positively associated with the anterior cingulate cortical volume and the resting-state functional connectivity between parietal areas and the anterior cingulate cortex. The peripheral SLC6A4 gene methylation was also positively associated with the orbitofrontal cortical activity as well as with the functional connectivity between the amygdala, the orbitofrontal and the anterior cingulate cortices in response to negative emotional stimuli, regardless of individuals’ DNA sequence. Overall, current findings might indicate that brain function and structure in the frontal-limbic regions, particularly in the anterior cingulate and the prefrontal cortices, are positively associated with the daily-life mood and the peripheral SLC6A4 gene methylation in healthy individuals. Additionally, the relationship between these frontal-limbic processes and peripheral SLC6A4 gene methylation appear to be largely driven by the environmental influences. Also, current results suggest that buccal cells may be a suitable peripheral tissue for studying the SLC6A4 gene methylation and its related neural processes. Future studies are necessary to validate these results in the clinical population as well as in the individuals exposed to differential environmental conditions
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
We conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
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