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Les communautés phytoplanctoniques dans un océan arctique en mutation : biogéographie, phénologie, productivité
No full textL’océan Arctique subit actuellement des modifications majeures et abruptes dans ces compartiments atmosphériques et océaniques reliées au changement climatique. Les premières conséquences écologiques à la perte de la glace de mer sont indéniables, telles qu’une augmentation globale de la production primaire (PP) annuelle à travers l’Arctique. Cependant, dans certaines régions, des études suggèrent plutôt une perte de productivité en réponse à une intensification locale de la stratification verticale. La réponse des communautés arctiques phytoplanctoniques au changement climatique reste toujours une question d’actualité complexe et incertaine, ayant de potentiels impacts sur l’ensemble des niveaux trophiques des écosystèmes marins. L’objectif premier de cette thèse se concentre sur cette problématique, avec une emphase particulière sur la biogéographie, la phénologie (c.-à-d., l’étude des cycles biologiques récurrents annuels) et la productivité des communautés phytoplanctoniques arctiques. Plus spécifiquement, cette étude s’appuie sur deux approches de recherche complémentaires : (1) la compilation et l’analyse de bases de données historiques traitant de la répartition verticale et spatiale, de la productivité et de l’écologie du phytoplancton arctique, et de (2) l’utilisation de la télédétection pour décrire la biogéographie, la phénologie et les changements en cours au niveau des communautés phytoplanctoniques arctiques. Basée sur une compilation inédite de profils verticaux de chlorophylle a (chl a; c.-à-d., 5206 stations), nous avons documenté la variabilité spatio-temporelle de la répartition verticale du phytoplancton et des différents régimes de productivité (de régions oligotrophes à eutrophes) pour l’ensemble de l’océan Arctique. Un modèle empirique a également pu être développé prédisant la répartition verticale de la chl a basée sur les valeurs de chl a de surface en fonction des saisons et des provinces biogéographiques de l’océan Arctique. Ce modèle nous a permis d’améliorer les estimations satellitales de la PP, mais aussi de mieux comprendre l’écologie et la phénologie des communautés phytoplanctoniques. Un intérêt particulier s’est porté sur les mécanismes de formation et de maintien des maxima de chlorophylle de subsurface (MCS) et de leur contribution à la PP annuelle. Par leur position verticale dictée par les profondeurs combinées de la nitracline et des masses d’eaux atlantiques (dans l’Arctique de l’Est) et pacifiques (dans l’Arctique de l’Ouest), ces MCSs contribuent significativement à la PP principalement dans les régions oligotrophes et lors des périodes de post-floraison. Dans un second temps, l’utilisation de la télédétection nous a révélé une conséquence inattendue du recul de la glace de mer en Arctique au niveau de la phénologie du phytoplancton arctique. Les régions qui avaient une seule floraison annuelle il y a seulement une dizaine d’années, développent maintenant une deuxième floraison à l’automne. Cette nouvelle floraison, qui coïncide avec le retard de la prise des glaces et à l’exposition accrue de la surface de l’océan aux vents automnaux, implique que l’océan Arctique pourrait passer d’un mode polaire à un mode boréal. Des scénarios biogéographiques du devenir de la PP annuelle, étroitement liés à la phénologie, peuvent ainsi être définis en réponse au retrait du couvert de glace de mer. Ces prédictions nous aideront à mieux appréhender de possibles changements au niveau des communautés phytoplanctoniques, pouvant engendrer par la suite des répercussions sur le cycle du carbone et les écosystèmes marins arctiques.The Arctic Ocean is currently experiencing major and abrupt changes in its atmospheric and oceanic compartments due to climate change. The first emerging ecological consequences to the loss of sea ice are undeniable, such as increasing annual primary production (PP) globally in the Arctic Ocean. However, in some areas, studies suggest a decrease in productivity in response to a local intensification of the vertical stratification of the upper water column. The response of phytoplankton communities to climate change remains complex and difficult to predict, with potential dramatic impacts extending through all trophic levels of marine ecosystems. The primary objective of this thesis explores this fundamental question, with a particular emphasis on biogeography, phenology (i.e., the study of annual recurring biological cycles) and productivity of Arctic phytoplankton communities. More specifically, this study is based on two complementary research approaches: (1) the compilation and analysis of historical databases covering the vertical and spatial distribution, productivity and ecology of Arctic phytoplankton, and (2) the use of remote sensing data describing the biogeography, phenology and ongoing changes in Arctic phytoplankton communities. Based on a unique compilation of vertical profiles of chlorophyll a (chl a; i.e., 5206 stations), we documented the spatio-temporal variability of the vertical distribution of phytoplankton and the range of productivity regimes (from oligotrophic to eutrophic regions) across the Arctic Ocean. An empirical model has also been developed to predict the vertical distribution of chl a based on surface chl a values depending on season and the province of the Arctic Ocean. The benefits of this model allow us to improve satellite-derived PP estimates and improve our understanding of the ecology and phenology of phytoplankton communities. Particular attention has been focused on the mechanisms of formation and maintenance of subsurface chlorophyll maximum (SCM) and their contribution to annual PP. On account of their vertical position, dictated by the depths of both the nitracline and Atlantic (in the Eastern Arctic) and Pacific (in the Western Arctic) waters, these SCMs appear important to PP, particularly in oligotrophic regions and during post-bloom periods. In a second step, the use of remote sensing could reveal an unexpected consequence of Arctic ice loss on Arctic phytoplankton. Regions that experienced a single annual bloom only a decade ago now develop a second bloom in the fall. This new bloom, which coincides with delayed freeze-up and increasing exposure of the sea surface to winds in the fall, implies that the Arctic Ocean may be shifting from a polar to a temperate mode. Biogeographic scenarios for the future of the annual PP, which is closely related to phenology, can thus be defined in response to the current receding sea-ice cover. These predictions will allow us to better anticipate the possible changes in phytoplankton productivity and community structure and the potential cascading repercussions on the carbon cycle and marine Arctic ecosystems
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Influence des facteurs du milieu sur la structure et le fonctionnement des communautés phytoplanctoniques du Haut-Arctique canadien : distinction des régions oligotrophes et eutrophes
Full text linkRÉSUMÉ: Une étude biogéographique a été menée dans le Haut-Arctique canadien, afm
d'examiner la dynamique phytoplanctonique en relation avec les facteurs du milieu.
Lors de radiales de 3500 km couvrant la mer de Beaufort, l'archipel canadien et la baie
de Baffm, un ensemble de variables environnementales (i.e. la structure
hydrographique, et les conditions atmosphériques et celles du couvert de glace de mer)
et biologiques ont été mesurées dans la zone euphotique pendant la fin de l'été en 2005,
le début de l'automne en 2006 et l' automne en 2007. La production et la biomasse
(chlorophylle (chI) a) phytoplanctonique ont été mesurées à sept profondeurs optiques
et à la profondeur du maximum de fluorescence chlorophyllienne (ZDCM). De plus, la
composition taxinomique, l'abondance et la structure de taille du phytoplancton ont été
caractérisées au Z DCM. À l'aide d'analyses multidimensionnelles (i.e. analyses de
redondance et analyses multidimensionnelles non métriques), les interactions entre la
composition phytoplanctonique et les variables environnementales et biologiques ont
été examinées. Deux régimes phytoplanctoniques distincts de par la production, la
biomasse, l'abondance et la structure de taille des communautés, ont ainsi pu être mis
en évidence: un système basé sur les flagellés situé au sud-ouest de la mer de Beaufort,
dans le golfe Amundsen et la partie centrale de l'archipel canadien et un système basé
sur les diatomées caractérisant la baie de Baffin, le détroit de Lancaster et le centre du
golfe Amundsen. Les régions oligotrophes sont, d'une part, caractérisées par une faible
production et une faible biomasse de cellules phytoplanctoniques de grande taille
(> 5 /lm) et, d' autre part, par une abondance relative élevée de picophytoplancton
eucaryote « 2 /lm) et de nanoflagellés non identifiés (2 - 20 /lm). En contraste, les
régions eutrophes sont caractérisées par une forte production et une forte biomasse de
cellules phytoplanctoniques de grande taille, en majeure partie des diatomées centrales
surtout représentées par le genre Chaetoceros. Les différences entre ces deux régimes
phytoplanctoniques sont expliquées, en grande partie par une faible stratification de la
colonne d' eau et de fortes concentrations de nitrates au niveau du ZDCM dans les régions
eutrophes versus oligotrophes. Cette étude démontre le rôle clé du mélange vertical et
des apports en nutriments sur le type de régime et de communautés phytoplanctoniques,
soulignant la diversité de régions biogéographiques pouvant être significativement
perturbées par les changements en cours dans l'Arctique. -- ABSTRACT: A large-scale biogeographic study was conducted to assess phytoplankton
dynamics and its environmental control across the Canadian High Arctic. Repeated
3500 km transects across the Beaufort Sea, the Canadian Arctic Archipelago and Baffm
Bay provided the opportunity to measure environmental (i.e. hydrographic structure,
atrnospheric and sea ice conditions) and biological variables measured in the upper
water column during late summer 2005, early faU 2006 and faH 2007. Phytoplankton
production and chlorophyH (chi) a biomass were measured at seven optical depths and
at the depth of maximum chi a fluorescence (ZDCM). In addition, phytoplankton
taxonomic composition, abundance and size structure were determined at the Z DCM.
Redundancy analyses and non-metric multidimensional scaling were used to assess
relationships between phytoplankton composition in relation to biological and
environmental variables. Two distinct phytoplankton regimes were documented based
on the production, biomass, abundance and size structure of phytoplankton
communities: (1) a flageHate-based system extending over the eastem Beaufort Sea, the
Amundsen Gulf and the central part of the Canadian Arctic Archipelago, and (2) a
diatom-based system centered in Baffm Bay, Lancaster Sound and in central Amundsen
Gulf. The oligotrophic regions were characterized by low production and biomass of
large phytoplankton cells (> 5 f!m) and hlgh relative abundance of eukaryotic
picophytoplankton « 2 f!m) and unidentified nanoflageHates (2 - 20 f!m). The
eutrophic regions were characterized by high production and biomass of large ceHs and
high relative abundance of centric diatoms, mainly Chaetoceros species. The
differences between the two phytoplankton regimes were explained, in part, by
differences' in stratification of the water column and nitrate concentrations at the Z DCM.
This study demonstrates the key role of water column mixing and nutrient input on
phytoplankton communities and regimes in the Canadian High Arctic, underpinning a
diversity of biogeographic regions that may be significantly altered by ongoing Arctic
changes
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Full text linkWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
koamabayili/VECTRON-author-checklist: VECTRON author checklist
No full textWe have done our best to complete the author checklist relating to the use of animals in the hut study. Note that the objective for the hut study was to evaluate the IRS treatment applications for residual efficacy against Anopheles mosquitoes, including the local An. coluzzii mosquito population. Cows were only used to attract mosquitoes into the huts and no tests were carried out directly on the cows. The author checklist is intended for use with studies where experiments are carried out on animals, which is why we have had such difficulty in completing this for the hut study, as many of the questions do not relate to how the cows were used
Author-wise bibliometric analysis based on entropy.
No full textAuthor-wise bibliometric analysis based on entropy.</p
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