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Les infections associées aux soins d'origine bactérienne en France : situation, évolution, prévention et perspectives
No full textL’hygiène hospitalière est un atout majeur des établissements de santé (ES) afin de lutter contre les infections associées aux soins (IAS). L’évolution des protocoles de soins depuis l’instauration de l’hygiène des mains a permis de voir diminuer l’incidence de ces infections.Cette thèse s’est intéressée aux infections associées aux soins d’origine bactérienne. Notamment à l’état des lieux et à l’évolution de ces IAS des années 1990 à nos jours ; grâce aux enquêtes nationales de prévalence et aux réseaux de surveillance dans les ES et établissements médico-sociaux (EMS). La prévention de ces IAS et aussi la prévention de la propagation des bactéries multi à hautement résistantes est également un aspect majeur de la lutte contre ces infections. En effet, l’antibiorésistance est qualifiée selon l’OMS de menace pour la santé globale. Afin de lutter contre celle-ci, de nombreuses stratégies ont été développées avec notamment un meilleur usage des antibiotiques mais aussi de nombreuses perspectives thérapeutiques. Un travail de fond multidisciplinaire et mondial reste pour les années à venir nécessaire afin d’endiguer la propagation de ces bactéries.Même si la prévalence des IAS a diminué de 50% en 30 ans, il reste des efforts à fournir afin de réduire toujours plus la part d’infections évitables. Avec la pandémie actuelle, il a été démontré que l’adhésion des professionnels de santé aux protocoles d’hygiènes, en particulier les précautions standard, est indispensable et représente le gold standard de la prévention. Cependant, cela n’est pas encore appliqué systématiquement au bon moment. La sensibilisation reste donc nécessaire auprès de tous les professionnels de santé afin de toujours améliorer la prise en charge des patients et de réduire la survenue de ces IAS
Chi-Square and F Approximations of Hetelling's Generalized T0^2
No full textTitle: Chi-Square and F Approximations of Hetelling's Generalized T0^2, Author: Davin Y.N. Yip. Location: ThodeChi-square approximation of Retelling's generalized T0^2 have
been investigated by Professor Tiku. In this project, further results
on the approximation are presented and examined. Also, an F approximation
for the distribution of Retelling's generalized T0^2 is proposed. The
results are compared with other approximations and discussed.ThesisMaster of Science (MSc
Canberra cancels Amann's contract
No full texttag=1 data=Canberra cancels Amann's contract
tag=2 data=Davies, Anne
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tag=32 data=EVANS, GARETH%BEALE, JULIAN%AMANN, ROBERT%DAVIN, HUGH%MORRIS, PETE
Porin flexibility in Providencia stuartii: Cell-surface-exposed loops L5 and L7 are markers of Providencia porin OmpPst1
No full textEpidemiologically unrelated Providencia stuartii strains isolated in hospitals in the south of France were investigated for their porin sequences and profiles. Noticeable resistance to Î2-lactams was found to be associated with production of extended spectrum Î2-lactamases or AmpC overproduction, but not metallo-Î2-lactamases. At the same time, the expression level of outer membrane porins was unmodified in these isolates. The identity of the amino acid sequences of the major porin OmpPst1 was less than 90% in the tested clinical strains, whereas sequences of the second major porin OmpPst2 were found to be identical in all isolates. Sequence diversity identified in the OmpPst1 porins was mainly located in two cell-surface-exposed loops (L5 and L7): these loops were found to be responsible for 80% of the main movements of the protein. Parallel tempering MD simulations indicated possible coordinated movement of these loops that might affect the electrostatic interaction of the porin with membrane components (e.g. LPS) or with external molecules/surfaces. This suggests that such flexibility of surface-exposed domains of OmpPst1 may participate in bacterial adaptation to the environment
Mendonça Dias, C., Azaoui, B. & Chnane-Davin, F. (Dir.)., 2020, Allophonie. Inclusion et langues des enfants migrants à l’école. Limoges : Lambert-Lucas.
No full textL’ouvrage Allophonie. Inclusion et langues des enfants migrants à l’école (2020), dirigé par Catherine Mendonça Dias, Brahim Azaoui et Fatima Chnane-Davin, est un livre dense et riche compte tenu de sa dimension interdisciplinaire et internationale. Il se présente comme un prolongement de l’enquête pluridisciplinaire Evascol (Armagnague et al., 2018) portant sur la scolarisation des élèves allophones nouvellement arrivés en France et des enfants issus de familles itinérantes et de voyageurs, ..
Alienation in the novels of Sargeson and Davin. A study of four novels : I saw in my dream ; I for one...; Cliffs of Fall ; Roads from home
No full textThis thesis argues that, in four novels, Sargeson and Davin are writing variations on a
similar theme, which we may call simply "alienation".
At the risk of becoming tedious, these variations must be defined. We will make an
arbitrary distinction between two types of isolation. One is brought about through feelings, or emotion. The other is reached through thought, or intellect.
It is suggested that, while Sargeson writes about a solitude which is attained through the senses,
Davin concerns himself with a solitude which is
attained through the intellect. Sargeson's sympathies
are with the underdog: in this case someone who has
the worst of an encounter, and is therefore compelled
by his emotions to become an outcast. Davin's
sympathies, on the other hand, are with the overman:
in this case someone who thinks himself superior to
moral restrictions, and chooses to keep his distance
from conventional codes of behavior. For convenience,
we will usually refer to both types of solitary by a neutral word, "outsider"
: meaning a non-member of some group.
The novels, which have been chosen because they seem representative of their authors' early
work, are: I Saw in My Dream and I for One... by
Frank Sargeson; and Cliff's of Fall and Roads from
Home by Dan Davin.
Close attention will be paid to the narrative
techniques each author employs, for there appears
to be an important correspondence between that which
each is intent upon saying, and the manner in which
it is said
Dan Davin : a bibliographic study : a thesis presented in partial fulfilment of the requirements for the degree of Master of Arts in English at Massey University
No full textI have aimed to include as many published works, both primary and secondary, including sound recordings and film, as I have been able to discover within the library resources of New Zealand. The Hocken Library, the Dunedin Public Library and the Alexander Turnbull Memorial Library all have important resources not available elsewhere.
The Alexander Turnbull Memorial Library has a small collection of Davin's papers and I understand negotiations are continuing to increase this collection. The Library also holds a considerable collection of letters from Davin to other major New Zealand writers such as Maurice Duggan and Frank Sargeson. The Archives of the British Broadcasting Corporation, the Oxford University Press and the libraries of Oxford University are sure to hold a great deal of material to which I did not have access and which is therefore outside the scope of this bibliography. [From Introduction
Identification and evolution of drug efflux pump in clinical Enterobacter aerogenes strains isolated in 1995 and 2003.
No full textBackgroundThe high mortality impact of infectious diseases will increase due to accelerated evolution of antibiotic resistance in important human pathogens. Development of antibiotic resistance is a evolutionary process inducing the erosion of the effectiveness of our arsenal of antibiotics. Resistance is not necessarily limited to a single class of antibacterial agents but may affect many unrelated compounds; this is termed 'multidrug resistance' (MDR). The major mechanism of MDR is the active expulsion of drugs by bacterial pumps; the treatment of gram negative bacterial infections is compromised due to resistance mechanisms including the expression of efflux pumps that actively expel various usual antibiotics (beta-lactams, quinolones, ...).Methodology/principal findingsEnterobacter aerogenes has emerged among Enterobacteriaceae associated hospital infections during the last twenty years due to its faculty of adaptation to antibiotic stresses. Clinical isolates of E. aerogenes belonging to two strain collections isolated in 1995 and 2003 respectively, were screened to assess the involvement of efflux pumps in antibiotic resistance. Drug susceptibility assays were performed on all bacterial isolates and an efflux pump inhibitor (PAbetaN) previously characterized allowed to decipher the role of efflux in the resistance. Accumulation of labelled chloramphenicol was monitored in the presence of an energy poison to determine the involvement of active efflux on the antibiotic intracellular concentrations. The presence of the PAbetaN-susceptible efflux system was also identified in resistant E. aerogenes strains.Conclusions/significanceFor the first time a noticeable increase in clinical isolates containing an efflux mechanism susceptible to pump inhibitor is report within an 8 year period. After the emergence of extended spectrum beta-lactamases in E. aerogenes and the recent characterisation of porin mutations in clinical isolates, this study describing an increase in inhibitor-susceptible efflux throws light on a new step in the evolution of mechanism in E. aerogenes
Resistance to antibiotics by efflux in multiresistant Enterobacteriaceae : detection, prevalence and development of a technique allowing use for diagnostic purposes.
No full textRésistance aux antibiotiques par efflux chez les Enterobacteriaceae multirésistantes : détection, prévalence et mise au point d'une technique permettant une utilisation à but diagnostic.Résumé :L'émergence des souches cliniques multirésistantes est un problème de santé publique dans la prise en charge et le traitement des infections associées. On assiste chez une souche à la co-existence de plusieurs mécanismes de résistance et l'efflux d'antibiotiques est souvent retrouvé en même temps que la résistance enzymatique et/ou les mutations des cibles. Les pompes d'efflux de type RND (Resistance Nodulation cell Division) avec AcrAB comme chef de file, sont les pompes majoritairement impliquées chez les entérobactéries. En routine au laboratoire, seules les résistances enzymatiques et les mutations de cible peuvent être identifiées. La mise au point d'un système de diagnostic permettant de confirmer la présence d'efflux pourrait être une aide dans l'amélioration de la prise en charge des patients infectés.L'état actuel de nos connaissances sur l'efflux chez les bactéries à Gram négatif et la régulation génétique de l'expression des pompes a été détaillé et discuté et a fait l'objet de 2 revues.Des souches cliniques d'Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, K. aerogenes, K. oxytoca, Enterobacter cloacae et Citrobacter koseri ont été utilisées dans notre étude.Des fluoroquinolones et le chloramphénicol ont été testés pour déterminer les concentrations minimales inhibitrices (CMI) en présence ou non d'un inhibiteur des pompes, la phénylalanine arginine β -naphthylamide (PAẞN) à 20µg/mL.Le test semi-quantitatif de détection d'efflux a été optimisé sur des souches représentatives. L'enrofloxacine à une concentration de 3 µg/mL a été adoptée après plusieurs essais puis utilisée pour réaliser les tests d'accumulation intracellulaire chez les Entérobactéries intactes avec ou sans carbonyl cyanide m-chlorophenylhydrazone (CCCP) à 20 µM. La lecture des résultats a été effectuée par spectrofluorimétrie après incubation à 25°C, une nuit.L'optimisation de la détermination par spectrofluorimétrie du niveau d'accumulation intracellulaire d'enrofloxacine nous a permis d'élaborer et proposer un mode opératoire reproductible pour la routine. La détermination d'un seuil de détection semi-quantitatif de l'efflux permet d'envisager l'application de ce test à visée diagnostique en laboratoire et de répondre à nos objectifs initiaux.Certaines souches ont été séquencées et les mutations retrouvées dans les régulateurs génétiques des effecteurs de la perméabilité membranaire montrent que : 1) certaines mutations sont devenues clonales et caractérisent l'empreinte génétique des souches d'aujourd'hui, 2) K. pneumoniae représente l'espèce qui présente le plus de mutations, ces dernières concernant avant tout les répresseurs des différents systèmes de régulation ou de pompes ainsi que le canal TolC.Mots clés : Entérobactéries, pompes d'efflux, multirésistance, souches cliniques, fluoroquinolonesResistance to antibiotics by efflux in multiresistant Enterobacteriaceae: detection, prevalence and development of a technique allowing use for diagnostic purposes.Summary :The emergence of multiresistant clinical strains is a public health problem in the management and treatment of associated infections. We observe in a strain the co-existence of several resistance mechanisms and the efflux of antibiotics is often found at the same time as the enzymatic resistance and/or the mutations of the targets. Efflux pumps of the RND (Resistance Nodulation cell Division) type, with AcrAB as the leader, are the pumps mainly involved in enterobacteriaceae. Routinely in the laboratory, only enzyme resistances and target mutations can be identified. The development of a diagnostic system to confirm the presence of efflux could help improve the management of infected patients.The current state of our knowledge on efflux in Gram-negative bacteria and the genetic regulation of pump expression has been detailed and discussed and has been the subject of 2 reviews.Clinical strains of Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, K. aerogenes, K. oxytoca, Enterobacter cloacae and Citrobacter koseri were used in our study.Fluoroquinolones and chloramphenicol were tested to determine the minimum inhibitory concentrations (MIC) in the presence or absence of a pump inhibitor, phenylalanine arginine β -naphthylamide (PAẞN) at 20µg/mL.The semi-quantitative efflux detection test has been optimized on representative strains. Enrofloxacin at a concentration of 3 µg/mL was adopted after several trials and then used to perform intracellular accumulation tests in intact Enterobacteriaceae with or without carbonyl cyanide m-chlorophenylhydrazone (CCCP) at 20 µM. The results were read by spectrofluorimetry after incubation at 25° C. overnight.The optimization of the determination by spectrofluorimetry of the level of intracellular accumulation of enrofloxacin has enabled us to develop and propose a reproducible procedure for routine use. The determination of a semi-quantitative detection threshold of the efflux makes it possible to consider the application of this test for diagnostic purposes in the laboratory and to meet our initial objectives.Some strains have been sequenced and the mutations found in the genetic regulators of membrane permeability effectors show that: 1) some mutations have become clonal and characterize the genetic fingerprint of today's strains, 2) K. pneumoniae represents the species which presents the most mutations, the latter concerning above all the repressors of the various regulatory systems or pumps as well as the TolC channel.Keywords: Enterobacteriaceae, efflux pumps, multidrug resistance, clinical strains, fluoroquinolone
Regulation of membrane permeability in Gram-negative bacteria and its relation to antibiotic susceptibility
No full textLa perméabilité membranaire joue un rôle important dans la résistance aux antibiotiques chez lesbactéries à Gram négatif.L’objectif de notre travail était de caractériser la fonction tenue par les deux régulateurs globaux dela perméabilité membranaire chez Enterobacer aerogenes: mar et ram. L’objectif initial futd’identifier le répresseur spécifique de RamA qui manquait en tant qu’élément de la cascade derégulation actuellement définie. La sélection de 60 souches nous a permis de confirmer le rôlecentral joué par RamA dans la régulation, ainsi qu’identifier des mutations pouvant être critiques, auniveau de RamR. Ainsi, l’absence variations observées dans le régulon marRAB et l’expressionmodérée des transcrits montrée par qRT-PCR laisse penser, que RamA a un rôle clef dans larégulation de l’expression des porines et des pompes d’efflux chez E. aerogenes.L’autre partie de notre travail reposait sur l’étude de la translocation des antibiotiques au traversdes porines. L’étude des interactions porine-carbapénèmes s’est faite sur la porine sauvage OmpFd'Escherichia coli et deux mutations. Les résultats indiquent également l'importance de l'aspartateen position 113 dans la sélectivité de translocation des carbapénèmes au sein de la porine OmpF.Ce travail montre ainsi que la translocation des pénicillines est aussi sous la dépendance desinteractions qui se créent entre le substrat et le résidu en position 113 de OmpF et limitent alorsleur passage au niveau du canal porine. Nous avons recherché la contribution attribuée à la porineOmp36 d'E. aerogenes dans la translocation de certaines béta-lactamines. Les mesures ont permisde conclure que les deux beta-lactaminGenetic permeability plays an important role in antibiotic resistance of Gram-negative bacteria.Our work was to characterize and better understand of the genetic regulation of membranepermeability in E. aerogenes. We focused on two global regulators, mar and ram, in about 60clinical isolates. Alterations in the upstream region of ramA and in ramR but no mutations in marAnor marR were observed. Overexpression of ramA or ramR led to an altered antibiotic susceptibilityassociated to decrease of porins expression and over-expression of efflux-pumps. qRT-PCR pointedout the estimated importance of the ram-regulon in the regulation cascade.Another part of this work was to characterize the translocation of compounds through porins andthe role of porins in drug uptake in general. Measurement of the rate of antibiotic action of threecarbapenems in an E. coli strain solely expressing OmpF as porin clearly indicated the importanceof the aspartate at position 113 in antibiotic translocation. A multi-disciplinary three way approachof computer modeling, black-lipid-bilayer assays and measurement of antibiotic action, suggestedthat interactions with residue D113 of E. coli porin OmpF are rate-limiting for transport throughthe porin channel. Combination of biological and biophysical measurements with E. aerogenesporin Omp36 denoted that interactions between the porin channel and the antibiotic facilitate andaccelerate transport
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