1,720,983 research outputs found
Inflammatory circuit that triggers malignant progression
Get PDF本研究は、RBの非細胞自律的な機能を徹底的に探索することによって、がん微小環境研究に新展開をもたらし、単なるRB研究を超えて、新規かつ汎用性のある制がん標的分子を発見することを目指した。RB不活性化によって誘導されるIL-6-STAT3 サーキットが乳がんの自己複製に寄与することを見出した。RB不活性化によるIL-6の発現誘導には、脂肪酸酸化の亢進によるミトコンドリア活性化とそれによるJNK活性化が寄与することも判明した。また、STAT3の活性化は、ミトコンドリアの呼吸鎖の発現を制御する事によってミトコンドリア由来の活性酸素を抑制し、細胞の自己複製能の維持に関わることも明らかになった。Retinoblastoma (RB) protein inactivation during tumor progression is often associated with a gain of immature phenotypes and chemo-resistance. Determination of an Rb inactivation signature in the context of gaining undifferentiated phenotype revealed that interleukin (IL)-6 is critically implicated in it. Breast cancers are often characterized by RB pathway inactivation. Low RB expression is linked to poorer prognosis and higher IL-6 expression in cases of breast cancer. IL-6 secreted from human breast cancers appeared to determine their tumor-initiating ability and chemo-resistance by promoting a positive feed forward loop between IL-6 and STAT3. The mechanism whereby RB inactivation increased IL-6 production involved fatty acid oxidation (FAO)-dependent mitochondrial metabolism. In addition, IL-6, via STAT3-mediated feedback to mitochondria, autonomously adjusts mitochondrial superoxide to levels suitable to maintain stem cell-like activity.研究課題/領域番号:26640070, 研究期間(年度):2014-04-01 - 2016-03-31出典：研究課題「炎症性サーキット―がん悪性進展を促す炎症性微小環境のトリガー」課題番号26640070
（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所））
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Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Get PDFThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Rbがん抑制遺伝子欠損によって誘導される蛋白質高イソプレニル化の研究
Get PDFRb不活性化によって誘導されるイソプレニル化の亢進は、Rb-E2F複合体によるSREBP転写因子群の転写制御によるものと考えられる。今年度は、RbとSREBP転写因子群の遺伝学的関係を更に探求した。様々な遺伝学低背景をもつ細胞においてRbをノックダウンすることによって、Rb蛋白質不活性化によるSREBP転写因子群の転写亢進は、がん抑制遺伝子p53のステータスによって大きく左右されることがわかった。SREBP転写因子群によって転写制御を受ける遺伝子のなかにfatty acid synthaseがある。これは、腫瘍の悪性進展過程において発現が誘導され、その産物に対する阻害剤には、種々のがんにおける治療効果が期待されている。がん細胞において特異的に観察される代謝異常は、Warburg効果として有名な解糖系の亢進と、もうひとつは、脂肪酸合成の亢進である。ヒトの大半のがんで異常の観察されるRbおよびp53が、脂肪代謝経路においてクロストークしているという発見である。また、p53は、すでに、解糖系の様々な酵素の転写制御に関わることが報告されている。更には、Rb不活性化によってSREBPが強く誘導される細胞は、スフィア形成や、胚性遺伝子の発現誘導など、幹細胞のような挙動を示すこともわかってきた。がんの代謝異常とがん幹細胞をつなぐ知見である可能性がある。以上の発見は、がん細胞における代謝異常出現の機構と意義を説明するのみならず、このような代謝異常の制御ががんの克服に繋がるであろうことを明確に指し示すものと考える。今後は、がん悪性進展におけるSREBP転写因子群とその下流遺伝子の働きに焦点をあてて研究を進める。研究課題/領域番号:21390093, 研究期間(年度):2009 – 2011出典：研究課題「Rbがん抑制遺伝子欠損によって誘導される蛋白質高イソプレニル化の研究」課題番号21390093
（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所））
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Drug discovery based on collateral lethality
Get PDF当初SUCLA2のアイソザイムであるSUCLG2の阻害が合成致死性を発揮すると考えたが、その効果は、限定的であった。そこで、我々は、SUCLA2を欠く前立腺がん細胞株とそこにSUCLA2を再構成した前立腺がん細胞株を作成、CRISPR-CAS9ライブラリーを用い、SUCLA2を欠く前立腺がん細胞株において特異的にドロップアウトする代謝遺伝子を検索し、8の候補遺伝子を得た。さらに我々は、SUCLA2欠失前立腺がん特異的に細胞死を誘導する化合物のスクリーニングを行い、現在までに、天然化合物ライブラリーのスクリーニングから、化合物2種がSUCLA2欠失株特異的に細胞傷害性を示すことを明らかにした。Initially, we thought that inhibition of SUCLG2, which is an isozyme of SUCLA2, exerts synthetic lethality, but the effect was limited. Therefore, we created a prostate cancer cell line lacking SUCLA2 and a prostate cancer cell line in which SUCLA2 was reconstituted. Using the CRISPR-CAS9 library, we searched genes those dropped specifically in prostate cancer cell lines lacking SUCLA2, and obtained 8 candidate genes. Furthermore, we screened for compounds that induce cell death specifically in SUCLA2-deficient prostate cancer, and to date, from the screening of natural compound libraries, we found two compounds are specifically cytotoxic for SUCLA2-deleted strains.研究課題/領域番号:17K19586, 研究期間(年度):2017-06-30 – 2019-03-31出典：研究課題「パッセンジャー変異合成致死性による新規がん代謝治療標的探索」課題番号17K19586
（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所））
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Variations on the Author
Get PDF“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Get PDFWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Regulation of metabolism by RB tumor suppressor gene
Get PDFPGAM1,2は、RBによる解糖系制御を介在する最重要の分子であることが判明し、この遺伝子群の転写制御機構も明らかになった。PGAMは、RBによる分化制御を介在することも明らかになった。RB不活性化によるメバロン酸経路の亢進は、コレステロールおよびその代謝物の合成を高め、細胞中の活性酸素のレベルを下げることが示唆された。同時に、RB不活性化は、アンドロゲン受容体の核移行を亢進すること、この現象が、コレステロール合成の阻害によって抑制されることを見出した。Lipidome解析によって、RB不活性化は、脂肪酸伸長・不飽和化酵素群の発現亢進によって脂質の組成におおきな影響を与えることが示唆された。We found that PGAM1 and 2 mediate function of RB tumor suppressor to regulate glycolysis. We also clarified how RB controls transcription of these genes. A further study demonstrated that PGAMs mediate RB function to control differentiation. On the other hand, we investigated the clinical significance of the RB function to control cholesterol synthesis. RB loss via increasing cholesterol synthesis recruits androgen receptor (AR) to nucleus and reduces ROS. These phenomenons were antagonized addition of statins, Lastly, we performed lipidomics analysis of RB-inactivated cells, which indicated that RB status gives significant impact on the quantitative and qualitative status of fatty acids,研究課題/領域番号:26290037, 研究期間(年度):2014-04-01 - 2017-03-31出典：「RBがん抑制遺伝子の代謝制御機能」研究成果報告書 課題番号26290037
（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所））
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Analysis of cellular signals toward carcinogenesis and metastasis using genetically modified mice
Get PDFRbがん抑制遺伝子ヘテロ型欠損マウスを中心に、様々な複合遺伝子変異マウスを作製し解析した。Rb不活性化時に、Ras依存的なDNA損傷応答と細胞老化シグナルが誘導され、がんの悪性化に拮抗することを証明した。また、Rbが、E2FとSREBP依存的に、Ras蛋白質等のイソプレニル化を制御することを見いだした。一方、Rasの拮抗的下流遺伝子RECKが、MMP-2依存的に、β1-integrinシグナルとEGFRシグナルを制御することを見いだした。We analyzed Rb-heterozygous mice simultaneously lacking various Rb-related genes. We proved that Rb-deficient carcinogenesis is antagonized by cellular senescence and DNA damage response in a Ras-dependent manner. We also discovered that Rb inactivation upregulates number of genes involved in protein isoprenylation via E2F or SREBP leading to accelerated membrane trafficking of Ras. In addition, we discovered that RECK, an antagonistic downstream target of Ras, regulates beta1-integrin and EGFR signaling.研究課題/領域番号:20012027, 研究期間(年度):2008–2009出典：研究課題「複合遺伝子変異マウスを用いたがん化・転移シグナルの解明」課題番号20012027
（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所））
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Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Get PDFWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
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