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Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
Full text linkThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Cell-to-cell communication via exosome transfer in endometrial cancer
Full text linkエキソソームは直径数10nm の細胞外分泌小胞であり、新たな細胞間情報伝達分子として注目されている。本研究課題では子宮内膜癌細胞と子宮内膜間質細胞とのエキソソームを介した情報伝達機構につき検討し、内膜癌細胞から内膜間質細胞へとエキソソームを介した機能性small RNA の受け渡しが証明された。子宮内膜癌細胞は、エキソソーム内RNA の授受を介して内膜間質細胞の遺伝子発現を制御している可能性が示唆された。Exosomes are small membrane vesicles containing various RNAs. Recent evidence suggests that human cells communicate with each other by exchanging exosomes. We found that endometrial cancer cells transmit gene regulatory small RNAs to endometrial fibroblasts using exosomes as vehicles. The results indicate a novel cell-to-cell communication between cancer cells and stromal cells via exosome transfer.研究課題/領域番号:23791819, 研究期間(年度):2011-2012出典：研究課題「エキソソームによる子宮内膜の細胞間情報伝達の分子機構と内膜癌化に関する基礎研究」課題番号23791819
（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所））
（https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-23791819/23791819seika/）を加工して作成金沢大学医薬保健研究域保健学系research repor
Tissue-FISHによる新しいテロメア長測定法の開発と婦人癌早期診断への応用
Full text linkパラフィン切片上の個々の細胞におけるテロメア長をin situにて評価する方法(telo-FISH)を開発し、子宮頚部および子宮内膜の癌化過程におけるテロメア長の変化について検討を行った。
1.Telo-FISH法の開発:ホルマリン固定パラフィン包埋切片とCy3ラベルテロメア相補的プローブを用いてin situ hybridizationを行った。Cy3シグナルおよびDAPIの蛍光強度をOpenlabで定量した。個々の細胞について、核内のCy3シグナル値をDAPI測定値で除してtelomere intensity(TI)を計算した。ヌードマウス皮下腫瘍を用いてTelomere Restriction Fragment (TRF) analysisおよびtelo-FISHを行った。TI値とTRFによるテロメア長には有意な正の相関を認めtelo-FISHによりテロメア長の定量的評価が可能であることが示された。
2.臨床検体を用いたtelo-FISHによるテロメア長の解析:子宮頸部および子宮内膜について、正常組織/前癌病変/癌病変のtelo-FISHを行った。子宮頸部前癌病変であるCIN1およびCIN2では正常上皮に比べ病変部のTI値が有意に低下していた。CIN3および頸癌のTI値は、正常上皮より短い傾向にあるものの、有意な低下には至らなかった。免疫組織化学染色法による検討では、CIN2およびCIN3の中でもTI値が高い症例にhTERTの発現が強く、子宮頚癌発癌過程においてCIN2-CIN3でのテロメレース活性化とテロメア長回復の様子が示唆された。一方、子宮内膜では前癌病変である内膜増殖症のTI値は正常内膜と有意差がなかった。内膜癌のTI値は正常内膜に比べ低い傾向にあったが、有意差は認めなかった。
3.染色体不安定性とテロメア長:染色体17p centromere/subtelomere領域のTissue-FISHを行った。CINでは正常子宮頚部上皮に比べ17pのarm loss/arm gainを示す細胞の比率が有意に高く、染色体の不安定化が示唆された。子宮内膜増殖症では17p arm loss/arm gainの増加は認めなかった。
以上より、子宮頚癌では前癌病変におけるテロメア短縮が染色体不安定化を介する癌化に関与していることが示唆された。一方、子宮内膜癌では前癌段階でのテロメア長の明らかな変動は認めず、子宮頚癌・内膜癌の癌化過程におけるテロメア動態の違いが明瞭となった。研究課題/領域番号:17791107, 研究期間(年度):2005 – 2006出典：「Tissue-FISHによる新しいテロメア長測定法の開発と婦人癌早期診断への応用」研究成果報告書 課題番号17791107
（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所））
（https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-17791107/)を加工して作成金沢大学医薬保健研究域医学系research repor
Variations on the Author
Full text link“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
Full text linkWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
Visualization of cancer cells with tumor-specific replication adenovirus and its application to cancer screening
Full text linkがん細胞の可視化は、がんの診断や治療への応用が可能な技術である。本研究では、がん特異的に発現する遺伝子と蛍光蛋白を産生するウイルスとを組み合わせてがん細胞でのみ増殖し蛍光を発するウイルス(TRAD-GFP)を作成し、TRAD-GFP を利用した婦人科がんのスクリーニングについて検討した。その結果、TRAD-GFP による蛍光の有無によって正常細胞とがん細胞とが区別でき、さらに蛍光を目印にがん細胞のみを効率よく回収してがんの遺伝子異常を高感度に検出することができた。これらの技術は、客観的かつ感度・特異度の高い新しいがん検診システムに応用できる可能性がある。研究課題/領域番号:19791141, 研究期間(年度):2007-2008出典：「腫瘍特異的増殖性アデノウイルスを用いた子宮癌細胞の可視化とスクリーニング法の開発」研究成果報告書 課題番号19791141
（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所））
（https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-19791141/19791141seika/)を加工して作成research repor
Novel function of hTERT and its application to cancer therapy
Full text linkテロメア伸長酵素として知られるテロメレースの触媒サブユニットであるhTERTは、悪性腫瘍に特異的に高発現する蛋白である。近年、TERTがテロメア伸長以外の機能を有することが示唆されている。我々は、hTERTがRNA分子であるRMRPと結合して、RNA依存性RNAポリメレース(RdRP)活性を示すことを見出した。RMRPは正常細胞株から癌細胞株まで幅広く発現している。hTERTとRMRPとを共に発現している子宮癌・乳癌細胞株を用いた検討では、hTERT-RMRP複合体のRdRP活性により、細胞内でRMRPを鋳型にした長い2本鎖RNAの合成、さらには2本鎖RNAの切断によってRMRPに由来するsmall RNAが生成されることがわかった。このRMRP由来small RNAは塩基配列特異的に遺伝子発現を抑制すること示唆された。hTERT elongates telomere through its telomere-specific RNA dependent DNA polymerase activity. Accumulating evidence indicates hTERT has other function(s) beyond telomere maintenance. We identified RMRP as a novel binding partner of hTERT. hTERT-RMRP complex exhibited RNA dependent RNA polymerase (RdRP) activity and synthesized complementary strand of RMRP in vivo. The short RNA derived from the product of the RdRP activity was supposed to be involved in RNA silencing.研究課題/領域番号:21791579, 研究期間(年度):2009-2010出典：研究課題「テロメレースの新機能を標的とした婦人科癌治療に向けての基礎的研究」課題番号21791579
（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所））
（https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-21791579/21791579seika/）を加工して作成金沢大学医薬保健研究域保健学系research repor
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
Full text linkWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
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