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Identification and functional analysis of Receptor for Draxin, a repulsive guidance protein
No full text本研究では、cDNAライブラリーの発現スクリーニングにより新規ガイダンス分子Draxin受容体の同定を試みた。FACSを用いた発現スクリーニングを行ったが、受容体のクローニングには至らなかった。一方、既知の受容体タンパクからのスクリーニングを行った(candidate approach)結果、Draxinと強く結合する膜タンパクを見出した。現在、この分子が真にDraxin受容体であるかどうかを詳細に解析している。研究課題/領域番号:19770196, 研究期間(年度):2007-2008出典：「新規神経ガイダンス分子Draxin受容体の固定とその機能解析」研究成果報告書 課題番号19770196
（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所））
（https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-19770196/19770196seika/)を加工して作成research repor
Going Beyond Counting First Authors in Author Co-citation Analysis
No full textThe present study examines one of the fundamental aspects of author co-citation analysis (ACA) - the way co-citation
counts are defined. Co-citation counting provides the data on which all subsequent statistical analyses and mappings
are based, and we compare ACA results based on two different types of co-citation counting - the traditional type that
only counts the first one among a cited work's authors on the one hand and a non-traditional type that takes into
account the first 5 authors of a cited work on the other hand. Results indicate that the picture produced through this non-traditional author co-citation counting contains more coherent author groups and is therefore considerably clearer. However, this picture represents fewer specialties in the research field being studied than that produced through the traditional first-author co-citation counting when the same number of top-ranked authors is selected and analyzed. Reasons for these effects are discussed
Draxin roles in thalamocortical projections
No full textdraxinはサブプレート神経を含む大脳新皮質に強く、大脳腹側部と視床に弱く発現する。大脳新皮質に発現するdraxinが視床皮質軸索投射に重要であるかを検証するために、レスキュー実験を行った。pCAGGSプロモーター下にloxpを両端に持つβ-geoとさらに下流にdraxin-IRES-eGFPを持つトランスジェニックマウスを作成した。このマウスを用いてdraxinノックアウトマウスにおいて大脳新皮質特異的にdraxinの発現を誘導した結果、多くの視床皮質軸索が大脳新皮質に向かって投射する事が分かった。
この結果から、サブプレートを含む大脳新皮質に発現するdraxinの重要性が示唆された。In this study, we have focused on Draxin functions in thalamocortical projections. It has long been recognized that neocortical pioneer axons from subplate neurons are essential for the guidance of thalamocortical projections. Draxin is strongly expressed in early-born cortical neurons, including subplate and Cajal-Retzius cells, and weakly expressed in the ventral telencephalon and dorsal thalamus. Draxin deficient mice showed severe defects in thalamocortical projections. Thalamic axons showed a pathfinding error in the internal capsule region at embryonic day 14.5, when cortical axon pathfinding still appeared normal.
This suggests that draxin has direct functions in thalamocortical projections. Furthermore, the thalamocortical phenotype in draxin-/- mice is sufficiently rescued by transgenic expression of draxin in the neocortex. These results suggest that draxin from neocortical pioneer neurons is required for the guidance of thalamocortical projections.研究課題/領域番号:23680036, 研究期間(年度):2011-04-01 - 2014-03-31出典：研究課題「軸索ガイダンス分子draxinが担う視床皮質軸索投射機構の解明」課題番号23680036
（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所））
（https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-23680036/23680036seika/）を加工して作成research repor
Gene knockout in the cerebral cortex
No full text本研究では、子宮内エレクトロポレーションとCRISPR/Cas9システムとを組み合わせることにより、大脳皮質特異的な遺伝子ノックアウト法の確立を目指した。マウス大脳皮質にSatb2遺伝子に対するCRISPRコンストラクトを導入し、Satb2の発現を免疫染色により調べた。その結果、Satb2に対するCRISPRコンストラクトが導入された細胞のほとんどで、Satb2の発現が消失していた。これらの結果から、子宮内エレクトロポレーション法を用いたCRISPR/Cas9の導入により大脳皮質神経細胞において効果的に標的遺伝子をノックアウトできることが分かった。The CRISPR/Cas9 system has recently been adapted for generating knockout mice to investigate physiological functions and pathological mechanisms. Here, we report a highly efficient procedure for brain-specific disruption of genes of interest in vivo. We constructed pX330 plasmids expressing humanized Cas9 and single-guide RNAs (sgRNAs) against the Satb2 gene, which encodes an AT-rich DNA-binding transcription factor. We found that the introduction of pX330-Satb2 into the developing mouse brain using in utero electroporation led to a dramatic reduction of Satb2 expression in the transfected cerebral cortex, suggesting DSBs had occurred in the Satb2 gene with high efficiency. Thus, our procedure combining the CRISPR/Cas9 system and in utero electroporation is an effective and rapid approach to achieve brain-specific gene knockout in vivo.研究課題/領域番号:15K14332, 研究期間(年度):2015-04-01 - 2017-03-31出典：「大脳皮質特異的なノックアウト動物作成法の開発」研究成果報告書 課題番号15K14332
（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所））
（https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-15K14332/15K14332seika/）を加工して作成金沢大学医薬保健研究域医学系research repor
Variations on the Author
No full text“Variations on the Author” discusses two of Eduardo Coutinho’s recent films (Um Dia na Vida, from 2010, and Últimas Conversas, posthumously released in 2015) and their contribution to the general question of documentary authorship. The director’s filmography is characterized by a consistent yet self-effacing form of authorial self-inscription: Coutinho often features as an interviewer that rather than express opinions propels discourses; an interviewer that is good at listening. This mode of self-inscription characterizes him as an author who is not expressive but who is nonetheless markedly present on the screen. In Um Dia na Vida, however, Coutinho is completely absent form the image, while Últimas Conversas, on the contrary, includes a confessional prologue that moves the director from the margins to the center of his films. This article examines the ways in which these works stand out in the filmography of a director who offers new insights into the notion of cinematic authorship
Roles of Draxin signaling in formation of the corpus callosum and thalamocortical projections
No full text本研究の目的は、我々が発見した新規ガイダンス分子であるDraxinに着目し、非常に複雑な脳神経回路の形成メカニズムの一端を明らかにする事である。本研究では、Draxinがユニークな役割を果たすと考えられる脳梁形成と視床皮質軸索投射に着目した。視床皮質軸索と皮質視床軸索は内包で直接的に相互作用し、最終的な標的にお互いをガイドする。パイオニア軸索を発するサブプレート神経が視床皮質軸索投射に必須であることが明らかにされているが、その過程に関わるガイダンス分子は報告されていない。我々は、Draxinの機能に関して以下の事を明らかにした。1)Draxinノックアウトマウスの視床皮質軸索は内包までは到達するが、その後大脳新皮質に投射されず、一部は外包に異常に投射する。2)Draxinはサブプレート神経を含む大脳新皮質に強く発現する。3)Draxin-Alkaline Phosphatase (AP)タンパク質は視床皮質軸索に結合する事から、視床皮質神経細胞にDraxin受容体が発現すると考えられる。さらに、Draxinは視床組織片からの神経突起に結合し、その伸長を阻害する。4)Draxinノックアウトマウスにおけるサブプレート神経の形成は正常である。以上の結果から、サブプレート神経を含む大脳新皮質から分泌されるDraxinが視床皮質軸索の内包から大脳新皮質への投射に必須のガイダンス分子であると考えられた。脳梁形成に関しては、Draxinの反発活性を仲介する受容体がdccである事を明らかにした。In this study, we focused on Draxin functions in corpus callosum formation and thalamocortical projections. We found that Draxin has a critical role for the projections of corticothalamic and thalamocortical axons. Draxin is strongly expressed in early-born cortical neurons, including subplate and Cajal-Retzius cells, and weakly expressed in the ventral telencephalon and dorsal thalamus. Draxin deficient mice showed severe defects in the guidance of these axons : thalamocortical and corticothalamic axons followed an ectopic route through the external capsule instead of projecting to the cortex and thalamus, respectively. We found that thalamic axons showed a pathfinding error in the internal capsule region at embryonic day 14.5, when cortical axon pathfinding still appeared normal. This suggests that primary defects in the thalamocortical axon pathfinding cause misprojection of cortical axons. In addition, we showed that Draxin binds to thalamocortical axons and has inhibitory effects for neurite outgrowth from thalamic explants. Thus, we propose that Draxin repulsion from the neocortex may be essential for proper guidance of thalamocortical axons. We also found that Draxin repulsion is mediated by a receptor, dcc in the callosal neurons.研究課題/領域番号:21700382, 研究期間(年度):2009-2010出典：研究課題「脳梁と視床-皮質神経回路形成におけるDraxinシグナルの役割」課題番号21700382
（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所））
（https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-21700382/21700382seika/）を加工して作成金沢大学医薬保健研究域医学系 / 熊本大学research repor
Appropriate Similarity Measures for Author Cocitation Analysis
No full textWe provide a number of new insights into the methodological discussion about author cocitation analysis. We first argue that the use of the Pearson correlation for measuring the similarity between authors’ cocitation profiles is not very satisfactory. We then discuss what kind of similarity measures may be used as an alternative to the Pearson correlation. We consider three similarity measures in particular. One is the well-known cosine. The other two similarity measures have not been used before in the bibliometric literature. Finally, we show by means of an example that our findings have a high practical relevance.information science;Pearson correlation;cosine;similarity measure;author cocitation analysis
糖鎖による軸索ガイダンス分子draxinの機能制御機構の解明
No full text精巧な神経回路網は高次神経機能の構造的基盤である。約２０年前に神経軸索ガイダンス分子が発見され、神経軸索が（中間）標的細胞からの軸索ガイダンス分子に導かれるという軸索誘導の基本メカニズムは明らかにされた。しかし、脳発生期に複雑で精巧な脳回路がどのようにして形成されるのかについては分かっていない。この１０年間に、軸索ガイダンス分子であるnetrin, Slit, Ephrinの働きが糖鎖により制御されることが報告され、糖鎖によるより高度な軸索ガイダンス機構の存在が示された。脳発生期にはヘパラン硫酸（HS）やコンドロイチン硫酸（CS）の糖鎖構造が時空間的にダイナミックに変化していく事は明らかになっているが、それらの軸索ガイダンスにおける役割については不明な点が多い。
本研究では、我々が独自に発見した軸索ガイダンス分子draxinとプロテオグリカンとの関連性を調べた。ノックアウトマウスの解析から、draxinが脳回路形成に重要であることは分かっていたが、その活性制御についてはほとんど分かっていなかった。本研究において、draxinが視床神経の軸索伸長に対して濃度依存的な活性を保持し、その活性制御にヘパラン硫酸プロテオグリカンが重要であることが分かった。研究課題/領域番号:26110715, 研究期間(年度):2014-04-01 – 2016-03-31出典：研究課題「糖鎖による軸索ガイダンス分子draxinの機能制御機構の解明」課題番号26110715
（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所））
（https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PUBLICLY-26110715/）を加工して作成金沢大学医薬保健研究域医学系research repor
Dispelling the Myths Behind First-author Citation Counts
No full textWe conducted a full-scale evaluative citation analysis study of scholars in the XML research field to explore just how different from each other author rankings resulting from different citation counting methods actually are, and to demonstrate the capability of emerging data and tools on the Web in supporting more realistic citation counting methods. Our results contest some common arguments for the continued
use of first-author citation counts in the evaluation of scholars, such as high correlations between author rankings by first-author citation counts and other citation
counting methods, and high costs of using more realistic citation counting methods that are not well-supported by the ISI databases. It is argued that increasingly available digital full text research papers make it possible for citation analysis studies to go beyond what the ISI databases have directly supported and to employ more
sophisticated methods
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