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Calibration Bayésienne d'un modèle d'étude d'écosystème prairial (outils et applications à l'échelle de l'Europe)
No full textLes prairies représentent 45% de la surface agricole en France et 40% en Europe, ce qui montre qu il s agit d un secteur important particulièrement dans un contexte de changement climatique où les prairies contribuent d un côté aux émissions de gaz à effet de serre et en sont impactées de l autre côté. L enjeu de cette thèse a été de contribuer à l évaluation des incertitudes dans les sorties de modèles de simulation de prairies (et utilisés dans les études d impact aux changements climatiques) dépendant du paramétrage du modèle. Nous avons fait appel aux méthodes de la statistique Bayésienne, basées sur le théorème de Bayes, afin de calibrer les paramètres d un modèle référent et améliorer ainsi ses résultats en réduisant l incertitude liée à ses paramètres et, par conséquent, à ses sorties. Notre démarche s est basée essentiellement sur l utilisation du modèle d écosystème prairial PaSim, déjà utilisé dans plusieurs projets européens pour simuler l impact des changements climatiques sur les prairies. L originalité de notre travail de thèse a été d adapter la méthode Bayésienne à un modèle d écosystème complexe comme PaSim (appliqué dans un contexte de climat altéré et à l échelle du territoire européen) et de montrer ses avantages potentiels dans la réduction d incertitudes et l amélioration des résultats, en combinant notamment méthodes statistiques (technique Bayésienne et analyse de sensibilité avec la méthode de Morris) et outils informatiques (couplage code R-PaSim et utilisation d un cluster de calcul). Cela nous a conduit à produire d abord un nouveau paramétrage pour des sites prairiaux soumis à des conditions de sécheresse, et ensuite à un paramétrage commun pour les prairies européennes. Nous avons également fourni un outil informatique de calibration générique pouvant être réutilisé avec d autres modèles et sur d autres sites. Enfin, nous avons évalué la performance du modèle calibré par le biais de la technique Bayésienne sur des sites de validation, et dont les résultats ont confirmé l efficacité de cette technique pour la réduction d incertitude et l amélioration de la fiabilité des sorties.Grasslands cover 45% of the agricultural area in France and 40% in Europe. Grassland ecosystems have a central role in the climate change context, not only because they are impacted by climate changes but also because grasslands contribute to greenhouse gas emissions. The aim of this thesis was to contribute to the assessment of uncertainties in the outputs of grassland simulation models, which are used in impact studies, with focus on model parameterization. In particular, we used the Bayesian statistical method, based on Bayes theorem, to calibrate the parameters of a reference model, and thus improve performance by reducing the uncertainty in the parameters and, consequently, in the outputs provided by models. Our approach is essentially based on the use of the grassland ecosystem model PaSim (Pasture Simulation model) already applied in a variety of international projects to simulate the impact of climate changes on grassland systems. The originality of this thesis was to adapt the Bayesian method to a complex ecosystem model such as PaSim (applied in the context of altered climate and across the European territory) and show its potential benefits in reducing uncertainty and improving the quality of model outputs. This was obtained by combining statistical methods (Bayesian techniques and sensitivity analysis with the method of Morris) and computing tools (R code -PaSim coupling and use of cluster computing resources). We have first produced a new parameterization for grassland sites under drought conditions, and then a common parameterization for European grasslands. We have also provided a generic software tool for calibration for reuse with other models and sites. Finally, we have evaluated the performance of the calibrated model through the Bayesian technique against data from validation sites. The results have confirmed the efficiency of this technique for reducing uncertainty and improving the reliability of simulation outputs.CLERMONT FD-Bib.électronique (631139902) / SudocSudocFranceF
contribution à l'étude des splénopathies neutropéniques (le foie et les suites de la splénectomie)
No full textAIX-MARSEILLE2-BU Méd/Odontol. (130552103) / SudocSudocFranceF
Microparticules endothéliales et plaquettaires en cytométrie en flux dans les thrombocytoses
No full textLes microparticules (MP) circulantes sont de petites vésicules membranaires de 0,1 à 1 m de diamètre, relarguées par les cellules en réponse à l'activation ou l'apoptose. Bien que leur détection dans le plasma ne soit pas standardisée, la cytométrie en flux (CMF) est la technique la plus communément utilisée pour les mettre en évidence. Les objectifs de cette étude étaient de mettre au point la technique de dosage par CMF des MP d'origine plaquettaire (PMP) et endothéliale (EMP) en CMF au CHU de Nantes, et d'étudier l'intérêt de cette méthode dans le diagnostic différentiel entre thrombocytose réactionnelle (TR) et thrombocytémie essentielle (TE). MATERIEL ET METHODES: La technique a été mise au point, sur la base de données de la littérature, sur le cytomètre Navios (Beckman Coulter) en utilisant l'option W2 permettant l'accès à la CMF dite de haute sensibilité. Au total, 13 sujets sains, 22 patients présentant une TE (au diagnostic ou non traitée) et 13 patients souffrant de TR ont été inclus. Les acquisitions ont été réalisées sur des plasmas pauvres en plaquettes (PPP) obtenus à partir d'un protocole pré-analytique stringent. RESULTATS: L'évaluation de la méthode s'est avérée satisfaisante. La recherche d'EMP était négative dans l'ensemble des échantillons. Significativement moins de PMP ont été retrouvées chez les sujets sains par rapport aux séries TR et TE. Le nombre de PMP était plus élevé pour les TE que pour les TR, mais de façon non significative. Une corrélation négative entre le nombre de PMP et le nombre de plaquettes a été observée dans le groupe des sujets contrôles et dans la série TR. Au contraire, dans le groupe TE, cette corrélation était positive. Par ailleurs, dans la population TE, il n'existe pas de différence significative entre les patients présentant ou non une mutation de Jak2. CONCLUSION : La technique mise au point peut être appliquée à Nantes à d'autres situations physiopathologiques. L'absence d'EMP suggère qu'il existe peu d'altérations vasculaires dans les pathologiques étudiées. La recherche des PMP a permis d'obtenir des valeurs comparables à celles publiées chez les sujets sains et confirme que les altérations de la thrombopoïèse sont associées à leur augmentation. Les résultats obtenus laissent également supposer qu'il existe un mode de production de PMP différent chez les sujets pathologiques par rapport aux sujets sains. Le nombre de PMP ne semble cependant pas à lui seul contribuer au diagnostic de TE.NANTES-BU Médecine pharmacie (441092101) / SudocSudocFranceF
Étude rétrospective d'une file active de 43 patients atteints d'un syndrome de Sjögren dans un service de médecine interne et d'immunologie clinique au CHU de Bordeaux
No full textIntroduction : Le syndrome de Sjögren est la troisième affection auto-immune après le lupus érythémateux disséminé et la polyarthrite rhumatoïde caractérisée par une xérophtalmie et une xérostomie invalidantes associé à un terrain dysimmunitaire marqué par des anticorps spécifiques et une sialadénite lymphocytaire. Des atteintes systémiques sont possibles dont le plus redoutable est le lymphome. Nous avons vérifié la performance des critères américano-européens (AECG 2002) et de l'American College of Rheumatology (ACR) dans une population atteints d'un syndrome de Sjögren dans un service de médecine interne à Bordeaux et apprécié l'association à d'autres maladies auto-immunes. Matériel et Méthodes : 43 patients atteints d'un syndrome de Sjögren issus d'une requête PMSI ont été étudiés rétrospectivement et classés selon les deux critères cités. Résultats : Selon l'interrogatoire du PMSI, 29 patients (67%) ont un syndrome de Sjögren primaire et 8 (19%) un syndrome secondaire. 29 patients (67%) sont atteints d'un syndrome de Sjögren primaire et 4 (9%) d'un syndrome secondaire selon les critères AECG. 28 patients (65%) sont atteints d'un syndrome de Sjögren selon les critères ACR. Le test de kappa de concordance entre les critères AECG et ACR est 0.657. Il est de 0.798 entre les critères AECG et le PMSI pour le syndrome de Sjögren primaire et de 0.385 pour le syndrome de Sjögren secondaire. La discordance résulte du fait que les examens objectifs dont la recherche d'une kératoconjonctivite sèche ne sont pas recherchés systématiquement ni répéter dans le temps pour la biopsie salivaire. La xérophtalmie est traitée dans 84% des cas, la xérostomie chez 58% des cas. Les atteintes rénales, neurologiques, pulmonaires et thyroïdiennes sont de 20%, 22%, 9% et 7% respectivement. Deux cas de lymphomes sont retrouvés et 24 cas (56%) de maladies auto-immunes dont 3 lupus. Conclusion : Le diagnostic est difficile et la recherche des signes objectifs de la maladie doit être systématique.BORDEAUX1-Bib.electronique (335229901) / SudocSudocFranceF
Imagerie thoracique des infections invasives à champignons filamenteux chez les patients atteints de granulomatose septique chronique, Aspect initial et évolution
No full textLE KREMLIN-B.- PARIS 11-BU Méd (940432101) / SudocSudocFranceF
Incidence du chaussage sur les technopathies de la course à pied, débat autour du barefoot et du minimalisme (avis de médecins généralistes, médecins du sport, kinésithérapeutes et podologues)
No full textContexte et objectif. La "running", chaussure à talon surélevé et amortissant, est très populaire parmi les coureurs car elle limiterait les risques de technopathies de la course à pied (TCP). Mais cela n est pas prouvé. Faisant l hypothèse qu elle pourrait au contraire favoriser les blessures, les pratiques ancestrales du "barefoot" (pieds nus) et du minimalisme (course avec chaussures à semelle fine et plate) réapparaissent dans nos sociétés modernes. L objectif de cette thèse est de recueillir auprès de différents soignants leur avis sur ces questions. Matériel et méthode. Un questionnaire de 9 questions a été adressé à 127 médecins généralistes, 124 médecins du sport, 141 kinésithérapeutes et 131 podologues. Résultats. Le taux de réponses est de 61,1%. La chaussure usée ou inadaptée est l un des facteurs de risque de TCP le plus cité. 64,4% des soignants considère la chaussure de "running" comme la plus adaptée à la pratique du jogging comparativement à la chaussure minimaliste. Parmi les 41% qui ont un avis, 76% déconseillent le barefoot et le minimalisme. La profession tout comme l expérience en matière de TCP n ont pas d incidence sur ces résultats. Conclusions. La majorité des soignants considère la chaussure de running comme un élément protecteur du coureur malgré l absence d élément le prouvant. Cette idée s accompagne d une réserve ou d une défiance vis-à-vis du barefoot et du minimalisme, pourtant modes de déplacement les plus anciens de l être humain.Background The running shoe, with its shock absorbing and raised heel, is very popular among the runners as it is said to reduce the risks of running-related injuries (RRI). But this hasn t been demonstrated yet. According to the hypothesis that it could, on the contrary, lead to injuries, the traditionnal practises of barefoot and minimalism (which consists in running with thin and flat soled shoes) tend to come back in our modern societies.The objective of this thesis was to collect the thoughts and opinions of different health workers concerning these issues. Methods 127 general practitioners, 124 sports physicians, 141 physiotherapists and 131 podiatrists were asked to answer a 9 question questionnaire. Results 61,1% of them answered the questions. Running with a pair of worn out or unsuited shoes is enhanced as being the major risk to develop overuse injuries. 64.4% of health workers consider that the cushionned shoe is better suited to running use than the minimalist shoe. Among the 41% of persons who gave their opinions, 76% advise against practising barefoot and minimalism. The domain of the surveyed people as well as their experience concerning RRI don t interfere on the results. Conclusions Most of the health workers view the running shoe as a protecting element for the runner, in spite of the lack of proof. This idea is accompagnied by a doubt or even distrust towards barefoot and minimalism, even though this practises are the man s most ancient way of moving.BORDEAUX1-Bib.electronique (335229901) / SudocSudocFranceF
La périnéoplastie en tant que traitement des vaginites chez la chienne présentant une vulve barrée (étude expérimentale)
No full textLes vaginites liées à une vulve barrée sont une entité particulière dont le traitement chirurgical reste peu répandu. Les résultats de périnéoplastie sur 28 chiennes opérées au Centre Hospitalier Universitaire Vétérinaire ONIRIS entre février 2009 et juin 2014 ont étés évalués. L anomalie de conformation vulvaire semble être plus courante chez les chiennes de moyen à grand format. Le signe clinique le plus fréquent lié à une vulve barrée était la présence d écoulements vulvaires (72% des chiennes). Au moins 45.8% des chiennes avaient un examen cytologique compatible avec une vaginite. L efficacité de la chirurgie dans la résolution des signes cliniques et cytologiques liés à la vulve barrée est jugée de 100%. Les cultures bactériennes préopératoire et postopératoire montrent une grande proportion de cultures pures. La qualité des espèces bactériennes isolée dans le cadre de notre étude expérimentale est semblable à celle décrite dans la littérature.NANTES-Ecole Nat.Vétérinaire (441092302) / SudocSudocFranceF
Etude de l hémolyse dans le HELLP syndrome (à propos d une série de 11 cas)
No full textObjectif Le but de l étude était de mettre en évidence un mécanisme autre que mécanique à l origine de l hémolyse dans le HELLP syndrome tel qu un déficit d expression des protéines de régulation du complément à la surface des cellules sanguines. D autres mécanismes étaient également recherchés : une activation du complément, un déficit acquis ou constitutionnel de la protéine ADAMTS 13, une carence vitaminique, une cause allo ou auto immune, une hémoglobinopathie ou une cause infectieuse. Matériels et méthodes Une étude prospective, exploratoire et observationnelle a été menée à la maternité de Jeanne de Flandre au CHRU de Lille entre Novembre 2013 et Février 2014. Toutes les patientes présentant un HELLP syndrome pendant cette période ont accepté de participer à l étude. Résultats Onze patientes ont été incluses. Cinq patientes (45,5%) présentaient une anomalie d expression des protéines de régulation du complément à la surface des cellules sanguines. Six patientes (54,6%) présentaient une activation de la voie classique du complément. Sept patientes (63,7%) présentaient une baisse de l activité ADAMTS 13. Une patiente (9,1%) présentait une carence en folates et une maladie auto-immune (SAPL). Les facteurs associés à un défaut d expression de protéines régulant le complément étaient un âge gestationnel plus précoce lors de la survenue du HELLP syndrome (28 SA (24 28) vs 36,5 (35,3 37), p=0,008), un recours plus fréquent à une corticothérapie avant l accouchement (5 patientes (100%) vs 1 patiente (16,7%), p=0,015) et un terme d accouchement plus précoce (28 SA (26 28) vs 36,5 SA (35,25 37), p=0,008). Conclusion Un déficit d expression de protéines régulant le complément est retrouvé chez une partie des patientes présentant un HELLP syndrome. Une étude prospective cas/témoins est nécessaire pour confirmer nos résultats.LILLE2-BU Santé-Recherche (593502101) / SudocSudocFranceF
Hémophilie en pratique bucco-dentaire
No full textL'hémophilie est une des maladies génétiques de la coagulation les plus courantes. Les personnnes atteintes, principalement des garçons, ont des hémorragies provoquées ou spontanées, parfois dès les premiers mois de la vie. Les conséquences dans leur vie quotidienne sont importantes et tout va devoir être adapté à leur problème de coagulation. Le risque hémorragique est un point important dans la pratique dentaire. La conduite à tenir face à un patient hémophile doit être rigoureuse car leur vie peut être en jeu, pour certains gestes, si toutes les précautions ne sont pas prises. Le chirurgien-dentiste ne doit pas se considérer seul devant ces patients et se réfère à tout le corps médical présent autour de celui-ci. L'intervention du dentiste et des spécialistes des centres de référence doit avant toute chose permettre au patient de connaître parfaitement sa maladie et d'adopter les habitudes appropriées pour éviter d'avoir recours à la chirurgie.Hemophilia is one of the most common clotting genetic diseases. The sufferers, mostly boys, have caused or spontaneous hemorrhages, sometimes right from the first months of the life. The consequences in their daily life are important and everything is going to be adapted to their clotting problem. The hemorrhagic risk is an important point in dental practice. The guidance to a haemophiliac patient must be rigorous because their life may be at stake, for certain actions, if precautions are not taken. The dentist should not consider him alone in front of those patients and refers to the medical community around them. The intervention of the dentist and specialists of Hemophilia Centers must above all allow the patient to perfectly know his illness and to adopt appropriate habits to avoid need surgery.BORDEAUX2-BU Sci.Homme/Odontol. (330632102) / SudocSudocFranceF
La prévalence des sensibilités dentaires en Ille-et-Vilaine
No full textLes sensibilités dentaires sont des douleurs extrêmement répandues dans la population et l hypersensibilité dentinaire en est l une des étiologies. Cette thèse a pour but d évaluer la prévalence des sensibilités dentaires en Ille-et-Vilaine. Une enquête par questionnaire a été menée dans ce département sur 404 individus. Ce questionnaire a permis d évaluer également les caractéristiques des douleurs ressenties, l impact de ses douleurs sur la vie quotidienne, et la prise en charge de celles-ci. Les résultats ont montré que les douleurs ressenties étaient majoritairement courtes, provoquées, et stimulées par le froid. La prévalence de l expérience de dents sensibles mesurée a été de 31,20 %.Dental sensitivities are extremely widespread among the population and dentin hypersensitivity is one of the etiologies. This thesis aimed to assess the prevalence of dental sensitivity in Ille-et-Vilaine. A questionnaire survey was carried out in the department of 404 individuals. It allowed assessing the characteristics of the pain experience, the impact of pain on daily life, and the pain management. The results showed that the pain experiences were mostly short, provoked, and cold-induced. The measured prevalence of tooth sensitiveness was 31.20%.RENNES1-BU Santé (352382103) / SudocSudocFranceF