Biomédica
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Estudio de mutaciones en los genes IDH1 e IDH2 en una muestra de gliomas de población colombiana
No full textIntroduction: Gliomas are the most common primary tumors of the central nervous system and, according to their malignancy, they are graded from I to IV. Recent studies have found that there is an association between gliomas and mutations in exon 4 of genes that codify for isocitrate dehydrogenases 1 and 2 (IDH1: codon 132; IDH2: codon 172).Objective: To establish the frequency of mutations in IDH1 and IDH2 in a sample of gliomas from Colombian population.Materials and methods: DNA was extracted from tumor tissue. The exon 4 of IDH1 and IDH2 was amplified by PCR using specific primers and subsequently sequenced. Mutations were determined using the 4Peaks MAFFT programs.Results: We found mutations in the IDH1 gene in 34% of the glioma samples, with a predominance of the nonsynonymous mutation R132H. Mutations in the IDH2 gene were found in 7.5% of cases, with a predominance of the nonsynonymous R172K and R172W mutations.Conclusions: The frequency of mutations in the IDH1 and IDH2 genes in the sample was similar to that reported in other studies. The analysis of these mutations may be important to establish prognostic factors and for the development of future therapeutic targets in gliomas.Introducción. Los gliomas son los tumores primarios más comunes del sistema nervioso central y se clasifican de I a IV según su grado de malignidad. En recientes investigaciones se ha encontrado que su aparición está relacionada con mutaciones en el exón 4 de los genes que codifican las deshidrogenasas de isocitrato 1 y 2 (IDH1: codón 132; IDH2: codón 172).Objetivo. Determinar la frecuencia de mutaciones en los genes IDH1 e IDH2 en una muestra de gliomas de pacientes colombianos.Materiales y métodos. La extracción de ADN se hizo a partir de tejido tumoral. El exón 4 de los genes IDH1 e IDH2 se amplificó mediante PCR utilizando iniciadores específicos y, posteriormente, se secuenciaron. Para la determinación de las mutaciones, se emplearon los programas 4Peaks y MAFFT.Resultados. Se determinó la presencia de mutaciones en el gen IDH1 en el 34 % de las muestras, con predominio de la mutación no sinónima R132H. En el 7,5 % de los casos se detectaron mutaciones en el gen IDH2, principalmente las mutaciones no sinónimas R172K y R172W.Conclusiones. La frecuencia de mutaciones en los genes IDH1 e IDH2 en la muestra fue similar a la reportada en otros estudios. El análisis de estas mutaciones puede ser importante como factor pronóstico y para su uso como potenciales blancos terapéuticos en gliomas
Patrones de prescripción de fármacos antiparkinsonianos en un grupo de pacientes de Colombia, 2015
No full textIntroduction: Parkinson’s disease, whose prevalence in Colombia is 4.7 per 1,000 inhabitants, is a public health problem and a therapeutic challenge for health professionals.Objective: To determine the prescribing patterns of antiparkinson drugs and the variables associated with its use in a population from Colombia.Materials and methods: We conducted a descriptive cross-sectional study. We selected patients who had been given antiparkinson drugs uninterruptedly between January 1st and March 31st, 2015 from a systematized database of approximately 3.5 million people affiliated to the Colombian health system. We included sociodemographic, pharmacologic and comedication variables. For the multivariate analysis, we used the IBM SPSS™-22 software.Results: A total of 2,898 patients was included; the mean age was 65.1years, and 50.7% were men; 69.4% (n=2010) of people received monotherapy and 30.6% combination therapy with two to five antiparkinson drugs. The most frequently prescribed drugs were: levodopa 45.5% (n=1,318 patients), biperiden 23.1% (670), amantadine 18.3% (531) and pramipexole 16.3% (471). The most commonly used association was levodopa/carbidopa + entacapone (n=311; 10.7%). Multivariate analysis showed that being male (OR=1.56; 95%CI: 1.321-1.837), over 60 years (OR=1.41; 95%CI 1.112-1.782) and receiving treatment in the city of Barranquilla (OR=2.23; 95%CI 1.675-2.975) were statistically associated with a greater risk of using combination therapy; 68.2% (n=1,977) patients were given concomitant treatment with other drugs.Conclusions: Prescribing habits of drugs with high therapeutic value predominated, mainly in antiparkinson drugs monotherapy. Most were employed in the usual recommended doses. It is necessary to explore the clinical effectiveness of the medications studied and differentiate between disease and parkinsonian syndromes subtypes.Introducción. La enfermedad de Parkinson, cuya prevalencia en Colombia es de 4,7 por 1.000 habitantes, constituye un problema de salud pública y un reto terapéutico para los profesionales de la salud.Objetivo. Determinar los patrones de prescripción de fármacos antiparkinsonianos y las variables asociadas con su utilización en una población colombiana.Materiales y métodos. Se hizo un estudio descriptivo de corte transversal. A partir de una base de datos de 3,5 millones de afiliados al sistema de salud, se seleccionaron pacientes con prescripción de medicamentos antiparkinsonianos de manera ininterrumpida entre el 1º de enero y el 31 de marzo de 2015. Se incluyeron variables sociodemográficas, farmacológicas y de medicación concomitante. El análisis multivariado se hizo con el programa IBM SPSS™-22.Resultados. Se hallaron 2.898 pacientes, con una edad media de 65,1 años, de los cuales el 50,7 % correspondía a hombres. El 69,4 % (n=2.010) de las personas recibía monoterapia y el 30,6 %, tratamiento combinado con dos a cinco medicamentos antiparkinsonianos. Los más prescritos eran la levodopa (45,5 %; n=1.318 pacientes), el biperideno (23,1 %; n=670), la amantadina (18,3 %; n=531) y el pramipexol (16,3 %; n=471). La asociación más utilizada fue la de levodopa-carbidopa y entacapone (n=311; 10,7 %). En el análisis multivariado se encontró que ser hombre (odds ratio, OR=1,56; IC95% 1,321-1,837), ser mayor de 60 años (OR=1,41; IC95% 1,112-1,782) y recibir tratamiento en Barranquilla (OR=2,23; IC95% 1,675-2,975), se asociaban con una mayor probabilidad de emplear el tratamiento combinado. Al 68,2 % (n=1.977) de los pacientes se les había prescrito tratamiento concomitante con otros medicamentos.Conclusión. Predominaron los hábitos de prescripción de medicamentos con gran valor terapéutico, principalmente en la monoterapia, la mayoría en las dosis usuales recomendadas. Es necesario explorar la efectividad clínica de las prescripciones estudiadas, y diferenciar entre la enfermedad y los subtipos de síndromes parkinsonianos
Infección concomitante por tuberculosis y el virus de la inmunodeficiencia humana: situación epidemiológica en el departamento del Meta, 2010-2015
No full textIntroduction. One third of the increase in tuberculosis cases is attributed to the spread of HIV.Objective. To describe the Tb/HIV coinfection in the department of Meta from 2010 to 2015.Materials and methods. We conducted an observational, descriptive and retrospective study. After selecting 219 cases for analysis, two new databases were constructed and analyzed in three phases: Identification of sociodemographic and clinical characteristics, indicators by municipality (prevalence and therapeutic success) and stratification in epidemiological scenarios according to the prevalence (burden) of the illness.Results. Sixty percent of the municipalities corresponded to scenario 2. People with Tb/HIV coinfection who had not been treated previously, had 2.39 times more probability of having therapeutic success compared to those previously treated, this association being statistically significant (RP=2,39; 95% CI 1,3-9,6; p=0,01).Conclusion. Stratification by epidemiological scenarios is useful for planning prevention and control activities.Introducción. Una tercera parte del incremento de los casos de tuberculosis se atribuye a la propagación del HIV.Objetivo. Describir la infección concomitante de tuberculosis y HIV en el departamento del Meta durante el periodo de 2010 a 2015.Materiales y métodos. Se hizo un estudio observacional, descriptivo y retrospectivo. Se seleccionaron los 219 casos de análisis y se elaboraron dos nuevas bases de datos que fueron analizadas en tres fases: determinación de las características sociodemográficas y clínicas, construcción de indicadores por municipio (prevalencia y éxito terapéutico) y estratificación en situaciones epidemiológicas según la prevalencia (carga) de la enfermedad.Resultados. El 60 % de los municipios se ajustó a la situación designada como 2. El tratamiento de las personas con infección concomitante de tuberculosis y HIV cuya condición de ingreso era nueva, tuvo 2,39 veces más probabilidades de ser exitoso que el de los previamente tratados, siendo esta asociación estadísticamente significativa (razón de posibilidades, RP=2,39; IC95% 1,3-9,6; p=0,01). Conclusión. La estratificación por situaciones epidemiológicas es útil para planificar actividades de prevención y control
Micobacteriosis identificadas en el Laboratorio Nacional de Referencia de Colombia entre 2012 y 2016
No full textIntroduction: In recent years, there has been an increase in the prevalence of mycobacterioses caused by non-tuberculous mycobacteria, which are considered as emerging pathogens. Their presence depends on several factors such as the clinical history, the health status of the affected person, and the presence of these microorganisms in the water, the soil, and the animals, among others.Objective: To describe the mycobacteria and the etiological agent identified in isolates received at the Laboratorio Nacional de Referencia de Micobacterias of the Instituto Nacional de Salud between 2012 and 2016.Materials and methods: We conducted a retrospective analysis of samples from 273 patients with mycobacterioses. We analyzed the following variables: mycobacteriosis type, etiological agent, and associated predisposing factors.Results: 57.1% of the cases presented pulmonary mycobacteriosis; 26%, cutaneous; 10.6%, disseminated, and 2.6%, lymphatic. We found the Mycobacterium avium complex more frequently in pulmonary mycobacteriosis, while M. abscessus was more frequent in the extrapulmonary types of the disease. Patients with pulmonary mycobacteriosis had a history of tuberculosis more frequently than those with extrapulmonary forms.Conclusion: These findings highlight the importance of the differential diagnosis between M. tuberculosis complex species and non-tuberculous mycobacteria since the latter are genetically resistant to conventional antituberculosis drugs.Introducción. En los últimos años se ha observado un aumento en la prevalencia de micobacteriosis ocasionadas por micobacterias no tuberculosas, las cuales hoy se consideran como agentes patógenos emergentes. Su presencia depende de varios factores, como los antecedentes clínicos, el estado de salud de la persona afectada y la presencia de estos microorganismos en el agua, el suelo y los animales, entre otros.Objetivo. Describir las micobacteriosis identificadas en el Laboratorio Nacional de Referencia de Micobacterias del Instituto Nacional de Salud, entre 2012 y 2016.Materiales y métodos. Se hizo un análisis retrospectivo que incluyó 273 pacientes con micobacteriosis. Las variables analizadas fueron el tipo de micobacteriosis, el agente etiológico y los factores de riesgo asociados.Resultados. El 57,1 % de los casos presentó micobacteriosis pulmonar, el 26 %, cutánea, el 10,6 %, diseminada, y el 2,6 %, linfática. La comparación entre la forma pulmonar y la extrapulmonar evidenció que el complejo Mycobacterium avium se presenta con mayor frecuencia en las micobacteriosis pulmonares, en tanto que M. abscessus fue más frecuente en las extrapulmonares. Los pacientes con micobacteriosis pulmonar presentaban antecedentes de tuberculosis con mayor frecuencia que aquellos con las formas extrapulmonares.Conclusión. Estos hallazgos resaltan la importancia del diagnóstico diferencial entre las especies del complejo M. tuberculosis y las micobacterias no tuberculosas, ya que estas últimas son resistentes genéticamente a los fármacos convencionales contra la tuberculosis
Tuberculosis asociada a antagonistas del factor de necrosis tumoral alfa, presentación de un caso y análisis de los casos reportados en Colombia
No full textTumor necrosis factor-α (TNF-α) is an important fundamental cytokine during the immune response against cancer and infections such as tuberculosis. This molecule also plays a key pathogenic role in complex and difficult-to-treat diseases such as rheumatoid arthritis, ankylosing spondylitis, Crohn’s disease, psoriasis and ulcerative colitis. The treatment of these diseases frequently needs TNF-α antagonists, which has been related to an increased risk of developing tuberculosis, mycoses, and other severe infections.We report the case of a 68-year-old man with Crohn’s disease, who developed disseminated tuberculosis due to anti-TNF-α immunosuppressive therapy. The diagnosis was based on the histopathological findings and molecular biology assays.We discuss the clinical presentation and workup of this case, and we present a comparative analysis of tuberculosis cases associated with anti-TNF-α reported in Colombia during the last 10 years emphasizing on the diagnosis and treatment of latent tuberculosis.El factor de necrosis tumoral alfa (FNTα) es una citocina fundamental en la reacción inmunitaria frente al cáncer y a infecciones tales como la tuberculosis. Esta molécula también desempeña un papel fundamental en la patogenia de enfermedades complejas y de difícil tratamiento, como la artritis reumatoidea, la espondilitis anquilosante, la enfermedad de Crohn, la psoriasis y la colitis ulcerativa, condiciones que suelen requerir el uso de medicamentos que antagonizan la función del factor de necrosis tumoral alfa, el cual se ha relacionado con un incremento del riesgo de desarrollar tuberculosis, micosis y otras infecciones graves.Se reporta el caso de un hombre de 68 años de edad con diagnóstico de enfermedad de Crohn, a quien se le administró tratamiento con antagonistas del FNTα, debido a lo cual desarrolló tuberculosis diseminada. El diagnóstico se hizo con base en los hallazgos histológicos y mediante pruebas de biología molecular.Se discuten la presentación clínica y el manejo del caso, y se hace un análisis comparativo de los casos de tuberculosis asociados al tratamiento con antagonistas del FNTα reportados en Colombia durante los últimos diez años, con especial énfasis en la detección y el tratamiento de la tuberculosis latente
Seroprevalencia de los virus linfotrópicos de células T humanas de tipos I y II en donantes del Banco de Sangre del Hospital Pablo Tobón Uribe, entre 2014 y 2015
No full textIntroduction: The human-T cell lymphotropic virus is a retrovirus with various types known so far. HTLV-I and HTLV-II are of clinically importance as they cause different diseases such as adult T-cell leukemia/lymphoma, tropical spastic paraparesis, and human T-lymphotropic virus type I-associated myelopathy (HAM).Objective: To estimate the prevalence of presumptive and confirmatory reactivity to HTLV-I/II in blood donors of Hospital Pablo Tobón Uribe Blood Bank between 2014 and 2015.Materials and methods: The information was obtained from the Hospital Pablo Tobón Uribe Blood Bank database. We analyzed age, sex, place of origin, and place of residence of donors, and the reactivity using the screening test (ELISA) as well as the confirmatory test (immunoblot).Results: The donor population studied included 6,275 men and 8,148 women, for a total of 14,423 donors recruited between March 1, 2014, and June 30, 2015. Of all tested donors, 25 were positive for HTLV-I/II by the screening test (ELISA). After performing the confirmatory test (immunoblot), only nine patients were positive for HTLV-I/II (36%), of whom eight were reactive to HTLV-I (32%) and one to HTLV-II (4%), for a global seroprevalence of 0.06% (CI 95%: 0.10-0.25).Conclusions: Our findings were consistent with those found in similar studies in non-endemic areas of the country and with those from studies at international level reported in the literature.Introducción. El virus linfotrópico humano de células T (HTLV) es un retrovirus del cual se conocen varios tipos, entre ellos el HTLV-I y el HTLV-II, los cuales son de importancia clínica por ser los causantes de diferentes enfermedades, como la leucemia y el linfoma de células T del adulto, la paraparesia espástica tropical y la mielopatía asociada al HTLV.Objetivo. Obtener la prevalencia de las reacciones presuntiva y confirmatoria de los virus HTLV-I y HTLV-II en los donantes del Banco de Sangre del Hospital Pablo Tobón Uribe de Medellín, entre el 2014 y el 2015.Materiales y métodos. La información se obtuvo de la base de datos del Banco de Sangre del Hospital Pablo Tobón Uribe. Se analizaron la edad, el sexo y el lugar de procedencia y de residencia de los donantes, así como la reacción en la prueba de tamización (ELISA) y en la prueba confirmatoria (inmunoblot). Resultados. La población de donantes estudiados incluyó a 6.275 hombres y 8.148 mujeres, para un total de 14.423 donantes reclutados entre el 1° de marzo de 2014 y el 30 de junio de 2015. De ellos, 25 resultaron positivos para HTLV-I o HTLV-II en la prueba de tamización (ELISA). En la prueba confirmatoria (inmunoblot), nueve (36 %) pacientes fueron positivos para el HTLV-I o HTLV-II , y de ellos ocho (32 %) lo fueron para el HTLV-I y uno (4 %) para el HTLV-II; la seroprevalencia global fue de 0,06 % (IC95% 0,10-0,25). Conclusiones. Los hallazgos del estudio concordaron con los de estudios similares en áreas no endémicas del país y con los de los estudios consultados a nivel internacional
Costos de la prueba de tamización para la enfermedad de Chagas en donantes de dos bancos de sangre de Colombia, 2015
No full textIntroduction: Transfusion is a mechanism of transmission of Chagas’ disease. There are no studies on the costs of the screening test in Colombian blood banks.Objective: To estimate the costs of the screening test for Chagas’ disease among blood donors in two Colombian blood banks, 2015.Materials and methods: We conducted a micro-costing study from the perspective of the health care provider to estimate the cost of Chagas’ disease testing in two blood banks, Banco de Sangre de la Cruz Roja, Seccional Bolívar, and Banco de Sangre del Hospital de Yopal, Casanare, taking into account four cost categories: 1) Administrative costs: public services and insurance costs were calculated based on the blood bank area in square meters; 2) capital costs: building and equipment costs that were annualized using a 3% discount rate and a lifespan of 20 years for building and five for equipment; 3) costs of Chagas’ disease test materials and reagents adjusted by blood bank production level, and 4) costs of staff in charge of Chagas’ disease test processing. The costs of transfusion bagsand immunohematology tests are also reported.Results: The cost of Chagas’ disease test in the blood bank of Seccional Bolívar was COP 12), and the blood bag and immunohematology test costs were COP 8.2) and COP 2.2), respectively. In the blood bank of Yopal, Casanare, the costs were COP 24.6), COP 9.6) and COP 4), respectively. Personnel cost accounted for the highest percentage of the total cost for both blood banks (47.5% in Seccional Bolívar, and 55.7% in Yopal, Casanare).Conclusion: Our results are an important input for the planning of services and cost-effectiveness studies for screening tests for Chagas’ disease in Colombian blood banks.Introducción. La transfusión es un mecanismo de transmisión de la enfermedad de Chagas. No se han hecho estudios de costos de la prueba de tamización en bancos de sangre de Colombia.Objetivo. Estimar los costos de la prueba de tamización para la enfermedad de Chagas en donantes de bancos de sangre de Colombia, 2015.Materiales y métodos. Se hizo un estudio de costos desde la perspectiva del prestador de servicios en los bancos de sangre de la Cruz Roja, seccional Bolívar, y del Hospital de Yopal, Casanare, que incluyó: 1) gastos administrativos, es decir, costos de servicios públicos y seguros asignados según los metros cuadrados de las instalaciones del banco de sangre; 2) costos de capital, es decir, edificación y equipos, anualizados con una tasa de descuento de 3 % y considerando una vida útil de 20 y cinco años, respectivamente; 3) costos de insumos y materiales ajustados al nivel de producción, y 4) costos del recurso humano encargado del procesamiento de las pruebas. Se reportó, asimismo, el costo de las bolsas y de las pruebas de inmunohematología.Resultados. En el banco de sangre de la Cruz Roja, seccional Bolívar, el costo de la prueba fue de COP 12), mientras que la bolsa y la prueba de inmunohematología costaron COP 8,2) y COP 2,2), respectivamente. En el banco de sangre del Hospital de Yopal, los costos ascendieron a COP 24,6), COP 9,6) y COP 4), respectivamente. La mayor participación en el costo de la prueba correspondió al recurso humano (47,5 % en Cartagena y 55,7 % en Yopal).Conclusiones. Estos resultados son importantes para la planificación de los servicios y los análisis de costo-efectividad de la prueba de tamización para la enfermedad de Chagas en los bancos de sangre
Detección molecular de Salmonella spp., Listeria spp. y Brucella spp. en queso artesanal fresco comercializado en Barranquilla: un estudio piloto
No full textIntroduction: Each year approximately 3 million people die as the result of foodborne diseases. The fresh artisan (handmade) cheese produced and distributed in the Colombian Caribbean region is a native product from the departments of Córdoba, Sucre, Bolívar, Atlántico, Magdalena, Cesar, and La Guajira. Its mass consumption increases the risk of infection with Salmonella spp., Listeria spp., and Brucella spp., as it is made with a very rustic technology, with unpasteurized cow milk, without standardized and hygienic procedures and its storage is inadequate.Objective: To detect the presence of Salmonella spp., Listeria spp., and Brucella spp. in samples of fresh artisan cheese from the Colombian Caribbean region.Materials and methods: Twenty-seven samples of cheese from five departments of the Caribbean Region (Atlántico (n=6), Bolívar (n=2), Córdoba (n=1), Magdalena (n=16), and Sucre (n=2)) were analyzed by real-time polymerase chain reaction (qPCR). Seventeen of the samples corresponded to soft cheese, five to semi-hard cheese and five to hard cheese.Results: In 62.9% (17/27) of the samples we detected Salmonella spp., in 70.4% (19/27), Listeria spp., and in 22.2% (6/27), Brucella spp., mainly from the department of Magdalena. In 62.5% (10/16) of the samples we detected Salmonella spp. and Listeria spp. while in the department of Atlántico, 50% (3/6) of the samples corresponded to Brucella spp.Conclusion: The results confirmed the presence of these microorganisms in all the samples of soft cheese from the Colombian Caribbean region.Introducción. Cada año mueren, aproximadamente, tres millones de personas como consecuencia de las enfermedades transmitidas por alimentos. El queso artesanal fresco que se produce y distribuye en la región Caribe colombiana es un producto autóctono de los departamentos de Córdoba, Sucre, Bolívar, Atlántico, Magdalena, Cesar y La Guajira. Su consumo masivo aumenta el riesgo de infección con salmonelosis, listeriosis y brucelosis debido a que es elaborado con una tecnología muy rústica, con leche de vaca no pasteurizada, sin procedimientos estandarizados e higiénicos, y a que su almacenamiento no es adecuado.Objetivo. Detectar la presencia de Salmonella spp., Listeria spp. y Brucella spp. en muestras de queso artesanal costeño fresco procedente de los departamentos de la región Caribe colombiana.Materiales y métodos. Mediante reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real (qPCR), se analizaron 27 muestras de queso proveniente de cinco departamentos de la región Caribe: Atlántico (n=6), Bolívar (n=2), Córdoba (n=1), Magdalena (n=16) y Sucre (n=2). Del total de las muestras, 17 eran de queso blando, cinco de queso semiduro y cinco de queso duro.Resultados. En el 62,9 % de las muestras se detectó Salmonella spp. (17/27), en el 70,4 %, Listeria spp. (19/27), y en el 22,2 %, Brucella spp. (6/27). Las muestras provenían principalmente del departamento del Magdalena y, en 62,5 % (10/16) de ellas, se encontró Salmonella spp. y Listeria spp., en tanto que en el 50 % (3/6) de las muestras del departamento del Atlántico se detectó Brucella spp. Conclusión. Los resultados evidenciaron la presencia de estos microorganismos en todas las muestras de queso costeño blando