Chimica et Natura Acta
Not a member yet
191 research outputs found
Sort by
Identification of Secondary Metabolites in Ethyl Acetate Extract of Ki Encok Plant Roots (Plumbago zeylanica Linn) and In Silico Cytotoxicity Activity
The Ki Encok plant (Plumbago zeylanica Linn) has been extensively studied and is known to have cytotoxic activity. However, no research has yet investigated the compound content of the ethyl acetate extract from that plant. This study aims to identify the secondary metabolite content in the ethyl acetate extract of Plumbago zeylanica L. roots and to determine the potential of these secondary metabolites to bind with the Caspase-3 protein in silico. The ethyl acetate extract of Plumbago zeylanica roots was tested for its phytochemical properties and examined using GC-MS. The compounds found were then searched for their structures in Pubchem, tested in silico using the CB-Dock2 software, and evaluated for drug-likeness with SwissADME. Qualitative phytochemical tests indicate the presence of alkaloid and tannin compounds. The GC-MS test showed the presence of Plumbagin, Gamma sitosterol, and 4-ethoxybenzaldehyde. In the in silico test, docking between Gamma sitosterol, Plumbagin, and 4-ethoxybenzaldehyde with the target protein Caspase-3 has free binding energies of -8.5, -7.0, and -6.1. The Gamma sitosterol-Caspase-3 complex shows the best free-binding energy among the three ligands. Further in vitro or in vivo studies are needed to assess whether the interaction between Gamma sitosterol and Caspase-3 is inhibition or activation
Formulation of Nanoemulsion Based Sungkai Leaves Extract (Peronema canescens Jack) and Cinnamon Oil (Cinnamomum Burmannii (Nees & Th Nees) Blume) as an Antioxidant and Skin Protection Factors (SPF) Agent
Sungkai (Peronema canescens Jack) and Cinnamon (Cinnamomum burmannii) are herbal plants which are known to have a high content of secondary metabolite compounds as a source of natural antioxidants which are able to inhibit free radical compounds in the body and convert these free radical compounds into non-radical compounds. The greater the free radical scavenger activity in the product, the better the SPF value will be. However, the use of the extract as an active substance in cosmetic dosage forms has a low pharmaceutical elegance, so the extract is formulated using the SNEDDS (Self Nano-Emulsifying Drug Delivery System) technique. Nanoemulsion able to increase the solubility of natural ingredients by eliminating variability in absorption, permeability, and the bioavailability of drugs or bioactive compounds from natural ingredient extracts by maximizing drug penetration into the body and minimizing side effects. The aim of this research is to characterize a nanoemulsion preparation from a combination of sungkai leaves extract and cinnamon in order to obtain the optimal formula for a nanoemulsion preparation as an antioxidant product and skin protection factor agent. This research began with making extracts using the maceration method using 96% ethanol solvent, followed by making nanoemulsions using the spontaneous method. The extract concentration used was 200 mg. Observation of physical properties includes centrifugation test, organoleptic test, percent transmittance, solubility, pH, emulsion type, particle size, polydispersity index, antioxidant activity, SPF value of nanoemulsion preparation and irritation test. Analysis was carried out based on descriptive test parameters. Based on the research results, nanoemulsion preparations were made with Tween 80 surfactant, PEG 400 cosurfactant, VCO oil phase, and aqua deion water phase. So that the optimum formula nanoemulsion preparation (F1) was obtained with an active substance concentration of 100 mg sungkai extract and 100 mg cinnamon extract that met the requirements as a transparent, stable, visual nanoemulsion preparation product, with a transmittance value of 98%, a skin pH range of 6.14, having emulsion type (o/w) with a nanoemulsion particle size of 35.0 nm, PI of 0.479 and has a very strong IC50 antioxidant activity of 20.29 ppm with an SPF value of 7.4 in extra protection
24-Methylenecycloartanol Isolated from The Fruit Peel of Matoa (Pometia pinnata) and Its Activity as an Antibacterial against Staphylococcus aureus and Escherichia coli
Triterpenoids are compounds with highly diverse chemical structures and exhibit interesting biological activities such as antiviral, antibacterial, anti-inflammatory, and anticancer properties. The matoa plant (Pometia pinnata), belonging to the genus Pometia from the family Sapindaceae, has been used in traditional medicine and shows potential as an antibacterial agent. The purpose of this research was to isolate and determine the chemical structure of triterpenoids from the peel of the matoa fruit (P. pinnata) and to evaluate their antibacterial activity against Staphylococcus aureus and Escherichia coli. The ethyl acetate extract from the peel of P. pinnata demonstrated significant antibacterial activity. In this study, a triterpenoid compound was identified, and its chemical structure was determined using spectroscopic methods, including UV, IR, MS, 1H-NMR, 13C-NMR, and 2D-NMR, as well as by comparing data from the literature. The compound was identified as a cycloartane-type triterpenoid known as 24-methylenecycloartanol. The compound was then tested for antibacterial activity against S. aureus and E. coli. The test results showed a minimum inhibitory concentration (MIC) of 500 μg/mL for both bacteria, which was categorized as very wea
Deteksi Mekanisme Efflux Pump Pada Resistensi Bakteri Staphylococcus haemolyticus, Sampel Pus Klinis Rumah Sakit Pekanbaru
Infeksi adalah masalah kesehatan yang disebabkan oleh mikroorganisme patogen seperti bakteri. Salah satu jenis infeksi yaitu infeksi kulit dan jaringan lunak yang umumnya disebabkan oleh Staphylococcus aureus dan menyebabkan pembentukan pus. Saat ini, telah dilaporkan bahwa kasus spesies CoNS (Coagulase Negative Staphylococcus) seperti Staphylococcus haemolyticus sebagai penyebab infeksi, mengalami peningkatan. Selain itu, spesies ini juga diketahui telah mengalami resistensi terhadap beberapa golongan antibiotik. Dalam penelitian ini dilakukan karakterisasi isolat bakteri klinis dari sampel pus agar yang dilakukan dengan identifikasi mikrobiologi (kultur isolat, pewarnaan Gram dan uji biokimia) pada bakteri patogen (Isolat 3887), dan dilanjutkan dengan identifikasi molekuler, antara lain ekstraksi DNA kromoson dan plasmid, amplifikasi gen 16S rRNA, sekuensing dan analisis bioinformatik menggunakan BioEdit, BLAST dan filogenetika. Uji suseptibilitas terhadap 25 jenis antibiotik dan deteksi gen resisten clindamycin (ermA, ermB, ermC dan msrA) dan cefazolin (blaTEM-1, blaSHV dan blaOXA-1) dilakukan untuk mengidentifikasi kemungkinan mekanisme resistensi bakteri patogen. Berdasarkan hasil identifikasi mikrobiologi dan molekuler, isolat 3887 merupakan CoNS dengan strain Staphylococcus haemolyticus. Isolat 3887 resisten terhadap 12 dari 25 antibiotik yang diuji dan memiliki fenotipe resisten tertinggi terhadap clindamycin dan cefazolin. Hasil uji deteksi gen resisten clindamycin dan cefazolin menunjukkan hanya gen msrA yang terdeteksi baik pada kromosom dan plasmid isolat 3887 yang menunjukkan bahwa mekanisme resistensi melalui efflux pump
The Role of Transforming Growth Factor-Beta, Fibroblast Growth Factor, Platelet-derived Growth Factor, Epidermal Growth Factor, Insulin-like Growth Factor, Vascular Endothelial Growth Factor, and Sonic Hedgehog in the Non-syndromic cleft lip with or without cleft palate development: A Scoping Review
Non-syndromic cleft lip with or without cleft palate (NSCLP) birth defect, it imposes an enormous stress on society and requires nutrition, dental, speech, behavioural, and surgical therapies. The NSCLP multifactorial aetiology, including the environment and genetic factors. The environment and genetic factors affect the cellular mechanism, cell proliferation, cell differentiation, and cell migration and signalling pathways. Genetic growth factors including Transforming Growth Factor-Beta (TGF-β), Fibroblast Growth factors (FGFs), Platelet-derived Growth factors (PDGFs), Epidermal Growth factor (EGF), Insulin-like growth factors (IGF), Vascular Endothelial Growth factor (VEGF), Sonic Hedgehog (SHH). The study aims to understand the role of the growth factors “TGF-β, FGFs, PDGFs, EGF, IGF, VEGF, and SHH” in NSCLP development. Preferential Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-analyses (PRISMA) standards were followed when performing this scoping review. The 942 articles were extracted, and the following inclusion and exclusive criteria 43 articles were eligible for review. Twenty-seven studies identify 26 genes and 25 single-nucleotide polymorphisms (SNPs)/variants of the growth factors that are a significant risk for NSCLP development. In conclusion, the analysis of diverse populations and growth factors including TGF-β, FGFs, PDGFs, EGF, IGF, VEGF, and SHH were associated with NSCLP. The growth factors were involved in the cellular mechanism, cell proliferation, cell differentiation cell migration and signalling pathways that lead to the pathogenesis of NSCLP
Sintesis Karbon Aktif Magnetik dari Tempurung Kelapa menggunakan Aktivator Soda Kue dengan Variasi Perbandingan Massa Karbon Aktif dan Oksida Besi
Tempurung kelapa mengandung lignin, selulosa, dan hemiselulosa, yang dapat dimanfaatkan sebagai bahan pembuatan karbon. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui karakteristik karbon aktif (KA) dan karbon aktif magnetik (KAM) yang dibuat dengan variasi massa karbon aktif :oksida besi (KA:OB) 1:1, 2:1 dan 3:2 serta uji kinerjanya dalam mengadsorpsi ion Pb(II). Tahapan penelitian dimulai dari pirolisis tempurung kelapa (t=2 jam, T=230oC) hingga menjadi karbon selanjutnya diaktivasi dengan larutan natrium bikarbonat (soda kue) 4% dengan perendaman 24 jam menghasilkan KA. Karbon aktif disintesis menjadi KAM dengan metode kopresipitasi refluks pada suhu 70°C dengan mencampurkan larutan besi FeCl3 dan FeSO4 (rasio molar 2:1), dengan penambahan larutan NaOH 5M. Material KAM dikarakterisasi menggunakan FTIR, kemudian diuji kemampuan adsorpsinya terhadap ion Pb(II). Hasil uji kadar air, kadar abu, serapan iodin dan methylene blue KA berturut-turut sebesar 10,85%; 6,48%, dan 676,7916 mg/g, memenuhi SNI No. 06-3730-1995. Analisis FTIR KAM menunjukan puncak khas Fe-O pada bilangan gelombang 546,54 cm-1 (KAM 1:1), 406,38 cm-1 (KAM 2:1) dan 406,78 cm-1 (KAM 3:2). Adsorpsi ion Pb(II) oleh KAM 2:1 memberikan efektivitas adsorpsi 98,444 % mengikuti model isoterm Jovanovich
Kinerja Inhibisi Antioksidan Ekstrak Daun Miana (Coleus scutellarioides (L.) Benth.) pada Variasi Waktu Ekstraksi dan sebagai Bahan Tambahan Sabun Mandi Cair
Kulit menjadi salah satu organ penting dari tubuh manusia, sehingga perlu untuk dijaga dan dilindungi. Sabun mandi merupakan salah satu produk yang dapat membersihkan kulit, sehingga diharapkan selain dapat membersihkan kulit sabun mandi juga harus dapat melindungi kulit dari reaksi oksidasi. Daun miana (Coleus scutellarioides (L.) Benth.)dapat dimanfaatkan sebagai salah satu zat tambahan dalam sabun mandi, hal ini karena daun miana memiliki kandungan senyawa metabolit sekunder yang dapat bermanfaat sebagai antioksidan alami.Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui pengaruh waktu ekstraksi ultrasonikasi dan pengaruh penambahan ekstrak daun miana terhadap inhibisi antioksidan dalam pembuatan sabun mandi cair. Penelitian ini menggunakan dua variabel bebas yaitu waktu ekstraksi (60, 90, 120, 150 dan 180 menit) dan konsentrasi ekstrak (0%, 1%, 2%, 3% dan 4%) dalam formula sabun, dengan menggunakan metode ekstraksi ultrasonikasi. Adapun proses ekstrasi dengan menggunakan pelarut etanol 96%. Hasil perhitungan rendemen tertinggi yaitu pada ekstraksi 150 menit, dengan nilai 2,30. %Inhibisi antioksidan tertinggi juga didapat pada ekstrak dengan waktu ekstraksi 150 menit, yaitu 81,486. Persamaan regresi yang diperoleh yaitu y = -0,4427x4 + 4,9163x3 - 19,212x2 + 32,665x + 56,91 dan R² = 1. Kemudian untuk %inhibisi antioksidan sabun mandi cair yang paling tinggi yaitu pada sabun mandi dengan konsentrasi esktak daun miana 4% (v/v) yaitu sebesar 59,322. Dengan persamaan regresi yang diperoleh yaitu y = -1,1874x2 + 17,939x - 1,7731 dan R² = 0,9866. Hasil pengujian organoleptik dari 30 Panelis didapatkan bahwa konsentrasi ekstrak yang ditambahkan dalam sabun tidak mempengaruhi hasil pengujian organoleptik
Identifikasi Senyawa Aktif Rimpang Kunyit (Curcuma longa L.) sebagai Kandidat Antikanker Melalui Studi In Silico terhadap Reseptor Lymphocyte-Specific Protein Tyrosine Kinase
Curcuma longa L. dapat meningkatkan efek agen kemoterapi dalam pengobatan kanker kolorektal. Kanker kolorektal diekspresikan oleh peningkatan Lck pada sel epitel kolon. Perancangan obat dengan aktivitas sebagai inhibitor Lck dapat menjadi strategi penting untuk mengobati kanker kolorektal. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi potensi aktivitas senyawa aktif yang terkandung dalam rimpang kunyit terhadap reseptor Lck melalui studi in silico metode penambatan molekuler sebagai kandidat obat antikanker, khususnya kanker kolorektal. Studi ini dilakukan dengan cara simulasi penambatan molekuler dengan AutoDock Tools-1.5.6., prediksi Lipinski dengan LigandScout, dan ADMET dengan PreADMET. Senyawa bidesmetoksikurkumin memiliki nilai ∆G sebesar -6,36 kkal/mol, konstanta inhibisi 13.71 µM dan interaksi dengan asam amino GLU317 dan MET319. Nilai HIA (Human Intestinal Absorption) dan Caco2 adalah 93,750% dan 21,402 nm/detik dengan nilai PPB (Plasma Protein Binding) dan BBB (Brain-blood Barrier) adalah 93,826% dan 0,785. Senyawa ini tidak bersifat mutagen namun karsinogen, serta memenuhi aturan Lipinski. Senyawa bidesmetoksikurkumin dapat dijadikan sebagai lead compound yang memiliki aktivitas terhadap reseptor Lck sebagai kandidat obat antikanker kolorektal
Prediksi Epitop Sel T Sitotoksik dari Protein Selubung Virus Dengue melalui Pendekatan Imunoinformatika sebagai Kandidat Vaksin Dengue Berbasis Peptida
Infeksi virus dengue (DENV) menjadi ancaman kesehatan global yang terus mengalami peningkatan kasus pada setiap tahun terutama pada musim penghujan, di daerah beriklim tropis maupun subtropis. Vaksin dengue yang tersedia saat ini berbahan dasar virus yang dilemahkan dinilai memiliki potensi antibody-dependent enhancement (ADE) yang memicu terbentuknya badai sitokin, berujung pada kondisi imunopatogenik. Melalui pendekatan imunoinformatika, penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi peptida sebagai epitop potensial dari protein selubung DENV serotipe 1-4 yang dapat berinteraksi dengan salah satu HLA dominan dan paling banyak dipelajari yaitu HLA-A*02:01, serta HLA-A*24:02 dan HLA-A*24:07, keduanya merupakan HLA kelas I yang paling dominan di populasi Indonesia. Sebanyak 43 protein selubung DENV disejajarkan dan diamati nilai entropi untuk memilih satu urutan residu dari setiap serotipe DENV yang lestari. Penyaringan imunoinformatika dilanjutkan sampai mendapatkan peptida yang memenuhi kriteria seleksi epitop sebagai kandidat epitop vaksin dengue yaitu bersifat antigenik, tidak homolog dengan protein manusia, bukan alergen, dan tidak toksik. Didapatkan 20 peptida memenuhi kriteria diantaranya 10/20 untuk HLA-A*02:01 serta 4/17 dan 6/17 yang mengikat HLA-A*24:02 dan HLA-A*24:07 secara berurutan. Penelitian ini merupakan awal dalam perancangan vaksin peptida dengue yang masih harus dilanjutkan dan dibuktikan secara in silico dengan melihat interaksi molekuler tiga dimensi antara kandidat epitop dengan masing – masing alel
Penentuan Jenis Senyawa Flavonoid pada Isolat Biji Kakao (Theobroma cacao L.) dalam Fraksi N-butanol dengan Aktivitas Antioksidan Tertinggi menggunakkan Metode Spektrofotometri UV-VIS
Kakao (Theobroma cacao L.) merupakan salah satu tanaman yang memiliki kandungan flavonoid yang sangat tinggi. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui jenis senyawa flavonoid pada isolat biji kakao dalam fraksi n-butanol yang memiliki aktivitas antioksidan tertinggi. Pengujian aktivitas antioksidan dilakukan dengan metode DPPH. Sementara itu, pengujian penentuan jenis golongan senyawa flavonoid dilakukan secara kualitatif melalui metode pereaksi geser (NaOH 2M, NaOAc, H3BO3, AlCl3, dan HCl). Penentuan aktivitas antioksidan dilihat dari nilai AAI. Isolat 1 memperlihatkan nilai AAI sebesar 4,30±0,43 (sangat kuat), isolat 2 sebesar 3,75±0,23 (sangat kuat), isolat 3 sebesar 3,04±0,36 (sangat kuat) dan isolat 4 sebesar 1,35±0,05 (kuat). Hasil penentuan jenis flavonoid menggunakan pereaksi geser diperoleh hasil bahwa isolat 1 merupakan senyawa golongan flavanon atau dihidroflavonol dengan jenis 6,7-dihidroksi flavanon/ dihididroksi dihidroflavonol atau 7,8-dihidroksi flavanon/dihididroksi dihidroflavonol yang terdapat orto dihidroksi pada cincin A dan B