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Fish domestication in aquaculture: modulations of stress physiology and immune system in a percid fish, the Eurasian perch (Perca fluviatilis L.).
In cultured fish, stress is regarded as an important cause of impaired health, and particularly resistance to infectious disease, since it can directly or indirectly affect the immune system. Methods to reduce stress responses associated with such immunosuppressive effects are thus actively searched out. It is assumed that domestication may be associated with a reduction in stress responsiveness because stress-resistant animals may be positively selected along captive rearing as a result of an improved fitness. Fish domestication is very recent and the adaptive potential to farming conditions may still be high for numerous species including Eurasian perch for which adaptability to captivity conditions is not yet clarified.
The general objective of the present thesis was thus to evaluate the physiological and immune responses of Eurasian perch juveniles to some potentially stressful husbandry conditions and to examine whether these responses can be modulated along domestication. In this respect, we exposed Eurasian perch juveniles from distinct generational levels (F1 vs F4/F5) to chronic confinement, single or repeated hypoxia, and repeated water emersion. We measured usual stress indicators and several immune parameters. Proteomic analyses were also performed to resolve serum proteins. Finally, fish were genetically characterized using a microsatellite approach. Our results showed that Eurasian perch was affected by chronic confinement and environmental hypoxia. Under chronic confinement, only F1 juveniles displayed an increased sensitivity of the HPI axis (higher serum cortisol rise) to an acute handling stressor and a cellular stress response (higher HSP70 level in hepatocytes) in comparison to the respective control groups. Proteomic analyses further evidenced down-regulation of some immune serum proteins in F1 individuals while up-regulation was observed only in the F4 fish. During hypoxia, both generations displayed serum and hematological readjustments (spleen contraction leading to increased red blood cell count, hyperglycemia, up-regulation of C3 components). Under repeated exposure to this stressor, the results suggested the development of acclimation mechanisms (lower hyperglycemia, increased serum transferrin abundance) but also immune depression (lower lysozyme activity and abundance of C3 components). These responses appeared to be similar in both generations. Therefore, chronic confinement and repeated hypoxia negatively affected some immune parameters and domestication reduced the stress responsiveness of fish confronted to chronic confinement but not to hypoxia, probably owing to the different capacity of these stressors to severely affect internal homeostasis. Repeated water emersion did not result in an important chronic stress response since only alpha-2-macroglobulins (a2Ms) abundance was up-regulated in the serum of stressed fish. With the exception of the acute cortisol response (20 min post stressor) observed following netting and anesthesia, we did not detect any cortisol increase throughout the experimental periods when fish were confronted to chronic confinement, single or repeated hypoxia or repeated water emersion. This result suggested that cortisol is not an ideal stress indicator in perch because its increase might be absent or short-lasting under the tested conditions. Using cortisol, it might be difficult to detect such stressing situations since appropriate sampling events should be performed in a relatively short-time window. Domestication was also accompanied by complex changes in the abundance of some immune and acute phase protein isoforms/fragments (i.e. C3 complement components, Wap65, LAAO, fibrinogen, transferrin, Ig heavy and light chains and a2Ms). At present, it is not possible to conclude on the overall disease resistance of domesticated fish since we mainly investigated immune changes in serum and since bacterial challenges were not conducted in optimal conditions. More information should also be obtained on the differentially expressed protein isoforms and fragments as they can greatly differ in their activities. Finally, we observed that the fish from higher domestication level (F4, F5) were globally able to develop similar physiological and immune responses to stressors than the F1 generation despite a low genetic diversity. Actually, the microsatellite analysis highlighted a reduced allelic number, heterozygosity and higher genetic homogeneity along generations. Inbreeding was however not detected (low occurrence of linkage disequilibrium and negative Fis values). Taken together, these results confirm that inbreeding depression did not occur and suggest that loss of genetic diversity at neutral loci and possibly at coding regions may, to some extent, not be considered deleterious under stable and nearly optimal farming conditions. Further investigations such as QTL or associated genetic marker studies would be needed to further improve our knowledge on the connection between the observed phenotypic and genotypic data.
All in all, it can be hypothesized that a reduction in stress sensitivity may be part of domestication, depending on the stressor characteristics, and that this change is rather independent of the genetic diversity in farmed stocks.Chez les poissons d’élevage, le stress est une cause importante d’altération de la santé, en particulier de la résistance aux maladies infectieuses, car il peut affecter directement ou indirectement le système immunitaire. Dès lors, des méthodes visant à réduire les réponses au stress liées à de tels effets immunosuppresseurs sont activement recherchées. Dans ce contexte, la domestication pourrait être associée à une réduction de la sensibilité au stress, les animaux résistants étant positivement sélectionnés au cours de l’élevage en raison de leur meilleure forme physique. Chez le poisson, la domestication est très récente et le potential d’adaptation aux conditions d’élevage reste très élevé pour de nombreuses espèces dont la Perche commune. Chez cette dernière, l’adaptatiblité aux conditions de vie captive n’est actuellement pas encore clarifiée.
L’objectif général de cette thèse était d’évaluer les réponses physiologiques et immunitaires des juvéniles de la Perche commune exposés à des conditions d’élevage potentiellement stressantes et d’examiner si ces réponses pouvaient être modulées au cours de la domestication. Pour ce faire, nous avons exposé des juveniles de Perche commune appartenant à des niveaux générationnels distincts (F1 vs F4/F5) à du confinement chronique, à un stress d’hypoxie unique ou répété, et à un stress d’exondation répétée. Nous avons mesuré des marqueurs de stress classiques et divers paramètres immunitaires. Des analyses protéomiques ont également été menées pour étudier les variations d’abondance des protéines sériques. Finalement, les poissons ont été caractérisés génétiquement à l’aide une approche microsatellite. Nos résultats montrent que la Perche commune peut être affectée par le confinement chronique et par le stress d’hypoxie. Lors du confinement chronique, les juvéniles F1 ont montré une sensibilité accrue au niveau de l’axe HPI (élévation plus importante du cortisol dans le serum) après un stress aigu de capture et d’anesthésie et une réponse de stress cellulaire (abondance plus élevée d’HSP70 au niveau du foie) en comparaison avec leurs groupes contrôles respectifs. L’analyse protéomique a également mis en évidence une plus faible abundance de plusieures protéines immunitaires dans le sérum chez les individus F1 alors que, chez les poissons F4, ces protéines immunitaires étaient uniquement sur-exprimées. Durant l’hypoxie, les deux générations ont présenté des réajustements sériques et hématologiques (contraction de la rate menant à une augmentation du nombre de globules rouges, hyperglycémie, abundance plus élevée de composants C3). Lors d’une exposition répétée à ce stresseur, les résultats suggèrent le développement de mécanismes d’acclimatation (hyperglycémie moins élevée, abundance plus élevée de transferrine dans le serum) mais aussi une depression immunitaire (activité lysozyme et abundance de composants C3 plus faibles). Ces réponses étaient similaires pour chacune des générations. Ainsi, le confinement chronique et l’hypoxie répétée ont affecté négativement certains paramètres immunitaires. De plus, la domestication a été accompagnée d’une réduction de la sensibilité au stress chez les poissons confrontés au confinement chronique mais pas à l’hypoxie, ceci étant probablement en rapport avec la capacité de ces stresseurs à affecter plus ou moins sévèrement l’homéostasie du poisson. Le stress d’exondation répétée n’a pas induit d’ importante réponse chronique au stress étant donné que seule l’abondance des alpha-2-macroglobulines (a2Ms) était augmentée dans le serum des individus stressés. A l’exception de l’élévation rapide (endéans 20 minutes) du cortisol à la suite du stress de capture et d’anesthésie, nous n’avons pas détecté d’augmentation de la cortisolémie dans les différentes experimentations soit lorsque les poissons étaient confrontés au stress de confinement chronique, d’hypoxie unique ou répétée et d’exondation répétée. Ce résultat suggère que le cortisol n’est pas un indicateur de stress idéal chez la Perche parce que son augmentation semble absente ou de courte durée dans les conditions testées. Par la mesure de l’élévation du cortisol (si elle existe), il pourrait dond être difficile de détecter de telles situations stressantes puisque tout échantillonnage devrait être effectué dans un laps de temps relativement court après le stress. La domestication était aussi accompagnée de changements complexes de l’abondance de diverses protéines immunitaires et de phase aigue (composants C3, Wap65, LAAO, fibrinogène, transferrine, chaines lourdes et légères d’Ig et a2Ms). Actuellement, il n’est pas possible de déterminer la résistance globale aux maladies des poissons domestiqués car nous avons essentiellement étudié les modulations immunitaires au niveau du sérum et parce que les infections bactériennes expérimentales n’ont pu être menées dans des conditions optimales. Il est aussi nécessaire d’obtenir de plus amples informations sur les isoformes et/ou fragments de ces protéines différentiellement exprimées car elles peuvent fortement différer en terme d’activité. Finalement, nous avons observé que les poissons appartenant à un niveau de domestication plus élevé (F4, F5) étaient globalement capables de déveloper des réponses physiologiques et immunitaires aux stresseurs similaires à celles de la génération F1 malgré une plus faible diversité génétique. En effet, l’analyse microsatellite a démontré une réduction du nombre d’allèles, de l’hétérozygotie et une plus grande homogénéité génétique au cours des générations. Nous n’avons cependant pas mis en évidence un quelconque niveau de consanguinité (faible niveau de déséquilibre de liaison et valeurs de Fis négatives). Dans l’ensemble, les résultats confirment l’absence de dépression de consanguinité et suggèrent que la perte de diversité génétique aux loci neutres voire peut-être dans les régions codantes pourrait ne pas s’avérer dommageable dans des conditions d’élevage constantes et pratiquement optimales. D’autres analyses telles que les QTL ou les études de marqueurs génétiques associés sont maintenant nécéssaires pour améliorer nos connaissances de la relation entre les données phénotypiques et génotypiques.
En conclusion, la domestication peut s’accompagner d’une réduction de la sensibilité au stress, en fonction des caractéristiques de ce dernier, et que ce changement peut se reveler, dans une certainte mesure, relativement indépendent de la diversité génétique de la population d’élevage.(DOCSC03) -- FUNDP, 201
Organic and inorganic nanofilms on Nitinol and Phynox: from fundamental towards applications in biomaterials
x(DOCSC02) -- FUNDP, 201
Quantification and characterization of microvesicles: Applications in hereditary spherocytosis, type-II heparin-induced thrombocytopenia and cancer
Microvesicles (MVs) are sub-micron-size cellular fragments released by eukaryotic cells following activation or apoptosis. Their diameter ranges between 30 and 1000 nm. Microvesicles are defined by size, concentration, morphology, biochemical composition, cellular origin, physical properties and activity. Microvesicles are thought to play a major role in cellular cross-talk, inflammation, thrombosis and angiogenesis. A thorough investigation of the mechanisms governing their release and their interaction with target cells is required for a proper understanding of their contribution to disease progression or repair mechanism. The study of MVs offers potential insights into novel mechanisms by which cells communicate. As potential disease biomarkers, MVs measurement and characterization in biological fluids could also reveal new diagnostic and/or prognostic information in human disease. Numerous techniques have been described to detect and/or characterize the MVs. However, no single technique is able to provide all MV characteristics. In addition, many pre-analytical variables lead to potential artefacts in MV analysis. The validation and standardization of techniques that could be used to determine the MV characteristics are needed before studying the diagnostic and prognostic impacts of MVs in retrospective and prospective clinical trials. Therefore, in this work: - We developed and validated an easy-to-use and useful quality control parameter for MV analysis by flow cytometry, the most frequently used technique to study MVs. - We developed and validated a reproducible MV quantification method by FCM in whole blood in order to avoid preanalytical concerns of plasma assays (i.e. loss of MPs by centrifugation and lack of standardization in centrifugation methods). - We showed that this method could contribute to the diagnosis of hereditary spherocytosis, a haemolytic anemia characterized by a release of MVs and unexplained occurrence of venous and arterial thrombosis after splenectomy. - We developed and validated a high sensitive sizing atomic force microscopy (AFM) method. - We characterized tumor cell-derived MVs released by cultured breast cancer cells MDA-MB 231 (Cells) by FCM, Transmission Electron Microscopy, AFM and Thrombin Generation Assay. - Finally, we developed a platelet microparticle generation assay (PMPGA), a test which reproduces the in vivo type II heparin-induced thrombocytopenia (HIT) reaction. We showed that this assay, presented at least similar performances in comparison to the current biological reference, i.e. 14C-Serotonin Release Assay. As flow cytometry is widespread available, PMPGA may become a new promising biological reference to diagnose type-II HIT.Les microvésicules (MVs) sont des fragments cellulaires libérés par les cellules eucaryotes suite à un processus d’activation ou d’apoptose. Leur diamètre se situe entre 30 et 1000nm. Les MVs sont définies par leur taille, leur concentration, leur morphologie, leur composition biochimique, leur origine cellulaire, leurs propriétés physiques et leur activité. Elles jouent un rôle majeur dans la communication cellulaire, l’inflammation, la thrombose et l’angiogenèse. Des études complémentaires des mécanismes dirigeant leur libération et leur interaction avec les cellules cibles sont nécessaires pour la compréhension de leur contribution à la progression des maladies et aux mécanismes de réparation. En tant que biomarqueurs potentiels, la mesure et la caractérisation des MVs dans les liquides biologiques pourrait aussi révéler des informations diagnostiques et/ou pronostiques nouvelles en pathologie humaine. De nombreuses techniques ont été décrites pour détecter et/ou caractériser les MVs. Cependant, une technique n’est pas capable à elle seule de fournir toutes les caractéristiques des MVs. De plus, de nombreuses variables préanalytiques sont responsables d’artéfacts potentiels dans l’analyse des MVs. La validation et la standardisation de techniques qui pourraient être utilisées pour déterminer les caractéristiques des MVs sont donc nécessaires avant d’étudier les impacts diagnostiques et pronostiques des MVs dans des essais cliniques prospectifs ou rétrospectifs. Au cours de ce travail, différents objectifs ont été atteints : - Nous avons développé et validé un paramètre de contrôle de qualité facile à utiliser et utile pour l’analyse des MVs par cytométrie en flux (CMF), la technique la plus utilisée pour étudier les MVs. - Nous avons développé et validé une méthode reproductible de quantification des MVs en sang par cytométrie en flux, afin d’éviter les problèmes préanalytiques liés aux essais sur plasma (ex : perte des MVs par centrifugation et manque de standardisation des méthodes de centrifugation). - Nous avons démontré que cette méthode pouvait contribuer au diagnostic de sphérocytose héréditaire, une anémie hémolytique caractérisée par une libération de MVs et une incidence inexpliquée de thrombose veineuse et artérielle, après splénectomie.- Nous avons développé et validé une méthode de détermination de la taille hautement sensible : la microscopie de force atomique (MFA). - Nous avons caractérisé les MVs libérées par des cellules cancer du sein cultivées in vitro (MDA-MB 231) par CMF, microscopie électronique à transmission, MFA et test de génération de trombine. - Finalement, nous avons développé un test de génération de microparticules plaquettaires (PMPGA), un test qui reproduit la réaction se déroulant in vivo lors de la thrombocytopénie induite par l’héparine de type-II. Nous avons montré que cet essai, présente une performance au moins similaire à la référence biologique actuelle à savoir le test de libération de sérotonine radiomarquée au 14C. Comme la cytométrie en flux est utilisée de façon généralisée, le PMPGA pourrait devenir une nouvelle référence biologique pour le diagnostic de TIH de type-II.(DOCMED02) -- FUNDP, 201
étude théorique et expérimentale de la fluorescence de structures photoniques naturelles
Elytra of beetles or scales of butterflies are materials that, from natural selection, evolved amazing properties (rigidity, hydrophobicity, etc.). In addition, they manipulate the light to target a specific color. The most common is the pigmentary coloration, relative to the electronic structure of the material, but the structural coloration, relative to the geometry of the material, cannot be neglected.
Among the pigments stand the fluorescent molecules, able to absorb an incident flux and to emit a lower energy flux. The fluorescent sources confinement in a photonic structure modifies the phenomenon properties (incident flux absorption, emission spatial distribution, etc.).
Industry, that tends to manufacture products with well-targeted features, uses a large variety of materials. The limitation comes from a lack of imagination for designing the structures in order to obtain a specific effect and from an inefficiency to generate them with the nowadays available technology. Conversely, nature offers a wide range of architectures, built from a narrow range of materials. Bio-inspiration combines both fields in order to synthesize new products.
This project focused on the precise context of fluorescence confined in a natural photonic structure. Before artificially transpose the observations of nature, it was crucial to understand the underlying physics. Experimentally, the integumentary structures of some insects have been described using microscopy techniques. Reflection and emission properties were studied using angular and spectrophotometric measurements. Numerical simulations based on the scattering matrix method were conducted in order to explain the observations.Les élytres de coléoptères ou les écailles de papillons sont des matériaux qui, suite à l’évolution, présentent des propriétés étonnantes (rigidité, hydrophobicité, etc.). De plus, ils manipulent la lumière pour fournir une coloration précise. Cette dernière peut être pigmentaire ou structurale, selon qu’elle est élaborée par la structure électronique ou la géométrie du matériau.
Parmi les pigments, on trouve des molécules fluorescentes, capables d’absorber un flux incident et d’émettre un flux de plus faible énergie. Le confinement de telles sources dans une structure photonique modifie les propriétés du phénomène (absorption du flux incident, distribution spatiale de l’émission, etc.).
L’industrie, tentant de fabriquer des produits avec certaines spécificités, utilise un large éventail de matériaux. La limitation provient d’un manque d’imagination sur les structures à adopter pour atteindre tel ou tel effet. A contrario, la nature offre une vaste gamme d’architectures, bâties à partir de matériaux analogues. La bio-inspiration tente de réunir ces deux domaines en vue de synthétiser des produits inédits.
Ce projet s’attache au contexte particulier de la fluorescence confinée dans une structure photonique naturelle. Avant de transposer artificiellement les observations de la nature, il est crucial d’en comprendre la physique sous-jacente. Les structures tégumentaires des insectes furent décrites au moyen de la microscopie. Leurs propriétés de réflexion et d’émission furent étudiées à l’aide de mesures spectrophotométriques angulaires. Des simulations numériques basées sur la méthode des matrices de diffusion furent menées afin d’expliquer les observations expérimentales.(DOCSC01) -- FUNDP, 201
Study of the physicochemical properties of SiC and TiC nanoparticles and their evolution in biocompatible dispersants
This thesis focuses on the evolution of the physicochemical properties of two carbide nanoparticles, SiC and TiC, in contact with biocompatible dispersants. The rationale is based on the fact that several of the toxicological evaluation required manipulations and / or interactions cause
changes in the nanoparticles physicochemical surface. These changes call into question the relevance of existing tests and, to some extent, may raise unfounded concerns about their potential toxicity to humans and the environment. The nanoparticles were dispersed in aqueous dispersants following various dispersion protocols; later, these dispersions were mixed with culture medium or biological medium in the particular conditions of in vitro assays. This thesis shows that toxicological evaluation results can be influenced by the various necessary manipulations and / or interactions. The evaluation first defined the nanoparticles fingerprints in their pristine state, before contact with the biological medium. Next, the objective was to elucidate the evolution of key physicochemical parameters at different stages of contact with biocompatible fluids. Their physicochemical parameters were monitored during cell line incubation for toxicity assessment and using human reconstituted gastric fluid. Finally, for a better overview of the specific nanoparticle– culture medium interaction, a SiC nanoparticles evaluation with three different cell line tests was performed. The evaluation was focused on two main parameters: particle size distribution and surface composition. It was found that
the nanoparticles physicochemical properties evolve from initial conditions to an altered state,
highlighting the contact with the biocompatible medium. On the one hand, modifications were produced in the nanoparticles in a type-, time- and dispersion medium-dependent way and on the other hand, these modifications were found to alter the test results. To summarize, it is highlighted that a case by case scenario is mandatory for nanoparticle evaluation because they behave differently in each medium, due to interaction and modifications produced on their surface.Cette thèse porte sur l'étude de l’évolution des propriétés physico-chimiques de deux carbures (SiC, TiC), sous la forme de nanoparticules, lors de leur contact avec des dispersants biocompatibles. En effet, l’évaluation toxicologique in vitro de ces deux matériaux nécessite de nombreuses manipulations dans divers milieux pouvant entrainer de substantielles modifications de leurs propriétés physicochimiques et donc de leur toxicité. Nous avons tout d’abord analysé les matériaux sous la forme sèche. La taille, la composition chimique de surface et du volume, la surface spécifique ont d’abord été mesurés. Ensuite, les propriétés telles que la distribution de taille et la composition chimique de surface ont été suivies au cours de différentes étapes impliquant leur contact avec des fluides biocompatibles : durant une pré-dispersion dans de l’eau et dans pluronic F108 pendant l’incubation de lignées cellulaires de type pulmonaire (A549), des kératinocytes IHK (NhTERT)et des sébocytes (SZ95) ou encore en présence de fluide gastrique. Il est montré que la distribution de taille et la composition chimique sont modifiés en fonction de la nature de la monoparticule, du milieu dispersant, de la méthode de dispersion et du temps de traitement : des phénomènes d’agglomération et de desagglomération ont été observées en fonction du temps d’incubation ainsi que de profondes modifications de la composition chimique de surface qui indiquent par exemple une adsorption préférentielle de protéines du milieu de culture masquant l’effet nocif du matériaux testé, ou encore une dissolution possible des monoparticules en fonction du fluide biologique. D’une manière générale, nous avons montre que les changements de propriétés
physicochimiques par rapport aux matériaux de base dépendent du milieu pour le SiC alors qu’ils dépendent de la méthode de dispersion pour le TiC. Forts de ces observations nous constatons que pour l’évaluation in vitro de la toxicité potentielle de nanomatériaux, aucune généralisation n’est de mise, et qu’une évaluation au cas par cas en fonction des milieux biologiques est requise.(DOCSC01) -- FUNDP, 201
Cartographie génétique de Cichorium intybus L. : Marqueurs moléculaires et synténie
Belgium is the world's largest producer of industrial chicory. This species is cultivated to extract inulin, a storage polysaccharide with pre-biotic properties used in food processing. The selection of chicory varieties is mainly phenotypic and based essentially on sugar yield, bolting, disease resistance and root morphology. The objective of this work is to develop molecular tools that can improve and facilitate breeding.
EST (Expressed Sequence Tag) libraries were used to develop SSR (Simple Sequence Repeats) and SNP (Single Nucleotide Polymorphism) genic markers. A total of 130 markers were validated for industrial chicory. These markers were used to build a genetic map of 1208 cM composed of 237 markers (152 AFLP markers, 27 SNP markers and 40 SSR markers) in collaboration with UCL and the Chicoline Company. The transcribed sequences associated with mapped genic markers were then used to search for orthologs in lettuce to develop a comparative map between the two species. This analysis has allowed identifying regions of synteny in which there were positional candidate genes potentially involved in different mechanisms of interest for the selection of chicory.La Belgique est le premier producteur mondial de chicorée industrielle. Cette espèce est cultivée afin d’en extraire l’inuline, un polysaccharide de réserve utilisé dans l’agro-alimentaire et aux vertus pré-biotiques. La sélection des variétés cultivées de chicorée est majoritairement phénotypique et basée essentiellement sur le rendement en sucre, la montaison, la résistance aux maladies ainsi que sur la morphologie racinaire. L’objectif de ce travail consiste à développer des outils moléculaires pouvant améliorer et faciliter cette sélection.
Les banques EST (Expressed Sequence Tag) ont été utilisées afin de développer des marqueurs géniques de type SSR (Simple Sequence Repeats) et SNP (Single Nucleotide Polymorphism). Au total, 130 marqueurs ont été validés chez la chicorée industrielle. Ces marqueurs ont été utilisés pour la construction d’une carte génétique de 1208 cM composée de 237 marqueurs (152 marqueurs AFLP, 27 marqueurs SNP et 40 marqueurs SSR) en collaboration avec l’UCL et la société Chicoline. Les séquences transcrites associées aux marqueurs géniques cartographiés ont ensuite été utilisées pour la recherche d’orthologues chez la laitue afin d’élaborer une carte comparative entre les deux espèces. Cette analyse a permis de mettre en évidence des régions de synténie dans lesquelles se trouvaient des gènes candidats positionnels potentiellement impliqués dans divers mécanismes d’intérêt pour la sélection de la chicorée.(DOCSC03) -- FUNDP, 201
L'échange électronique de données de santé : régimes socio-techniques en confrontation.
x(DOCSESG02) -- FUNDP, 201
How can veterinarians base their decisions on the best scientific evidence?
In the veterinary profession, as in human medicine, a great deal of time is spent in making diagnostic, therapeutic and preventive decisions in a complex and uncertain environment, where there is often a lack of optimal evidence. The Evidence Based Medicine (EBM) is an approach developed to better inform medical decisions. EBM refers to the conscientious, explicit and judicious use of current best evidence from research for the care of an individual patient. The concept of EBM was first described in human medicine in the early 1990s and was introduced to veterinary medicine 10 years later. However, it is not clear that the EBM approach promulgated in human medicine could be applied to the same extent to veterinary medicine. In this thesis, we hypothesize that an evidence based veterinary medicine (EBVM) is essential but the way it is taught in human medicine is currently inadequate for veterinary medicine, and that appropriate tools of scientific information must be designed and developed. We suggest that systematic reviews can provide high level scientific evidence and we discuss their methodology and ways of reporting. We postulate that accurate summaries of those reviews could be published in educational literature to help veterinarians base their decisions on the best scientific evidence. The efficacy of such interventions should be proved scientifically by using strong research methodology such as randomized controlled trials and validated psychometric instruments that will be used to capture decisional profiles of veterinarians.(DOCMED01) -- FUNDP, 201
Etude de paléoaltération météorique (Crétacé Inférieur à Néogène) sur socle silicoclastique hétérogène : caractérisation et essai de cartographie d'altérites en Région Wallonne (Belgique).
Weathered heterogeneous siliciclastic rocks are ubiquitous in the Walloon Region. This study first aims to characterize and secondly to map the weathered rocks, the characterization remaining an essential step of the mapping work. Firstly the characterization was performed on the Ardennian Allochthonous (Ardenne Anticlinorium and Dinant Synclinorium) and the Brabant Parautochthonous (Brabant Massif). Based on macroscopic observations, classification of weathering degrees of alterites is proposed. The mineralogy (XRD, thin section) and the geochemistry (major elements, trace elements, REE) of the studied sites are quite consistent with these categories. The evolutions of clay parageneses and Vogt's weathering index (1927) provide representative results of the weathering degree at the regional scale. The dated alterites do confirm the presence of five weathering periods in the Walloon Region: Permian-Triassic, Early Cretaceous, "middle" Cretaceous, Paleocene-Eocene and Miocene. Within these periods, the weathering is induced during favorable phases. A chronological model of saprolitisation is proposed for the Walloon Region: a relationship between weathering phases, climate and relative sea-level changes is suggested. Secondly the knowledge acquired by the characterization of the weathering profiles in the Walloon Region facilitates the mapping of the weathered rocks in the Haute-Lesse area. The tools and methods tested in this work show several advantages and disadvantages for the mapping of weathered siliciclastic rocks. Those selected allow a distinction between the different types of alterites. A methodology based on the airborne radiometry to map the weathered heterogeneous siliciclastic rocks at the regional scale is developed. Confirming the uplift of the Ardennes, the airborne radiometry is a suitable tool for geomorphology. The mapping of weathered rocks in the Walloon Region would be useful through a field survey on topographic maps at the 1/10.000 scale. The explanatory notes would supply the link between the weathering profiles characterization and their mapping. The weathering processes in the Walloon Region are fairly uniform from one site to another. On the other hand, the results of weathering processes on different lithologies are different in intensity and thickness. A preliminary characterization study of the weathered rocks in the Walloon Region is required for mapping, regardless of the scale and accuracy.Les roches silicoclastiques hétérogènes altérées par des fluides météoriques sont omniprésentes en Région Wallonne. Cette étude vise, dans un premier temps, à les caractériser et, dans un second temps, à les cartographier ; la caractérisation détaillée demeurant une étape indispensable à la cartographie. Dans un premier temps, les roches altérées (altérites) de l'Allochtone Ardennais (Anticlinorium de l'Ardenne et Synclinorium de Dinant) et du Parautochtone Brabançon (Massif du Brabant) sont caractérisées. Sur base d'observations macroscopiques, une classification du degré d'altération des altérites est proposée. La minéralogie (DRX, lames minces) et la géochimie (éléments majeurs, en traces, Terres rares) des sites étudiés sont assez cohérentes avec ces différentes catégories. Les évolutions des paragenèses argileuses et de l'indice d'altération V de Vogt (1927) traduisent le degré d'altération à l'échelle régionale. Les altérites datées confirment la présence de cinq périodes propices à l'altération météorique en Région Wallonne : Permo-Trias, Crétacé Inférieur, Crétacé "moyen", Paléocène-Eocène et Miocène. Au sein de ces périodes, l'altération météorique est activée durant des phases particulièrement favorables. Un modèle chronologique de saprolitisation est proposé à l'échelle de la Région Wallonne : une relation entre les phases d'altération, le climat et les variations relatives du niveau marin est suggérée. Dans un second temps, les connaissances acquises par la caractérisation de l'altération météorique en Région Wallonne facilitent la cartographie des roches altérées dans la région de la Haute-Lesse. Les outils et méthodes testés dans ce travail montrent plusieurs avantages et inconvénients pour la cartographie des roches altérées silicoclastiques hétérogènes. Ceux qui sont retenus autorisent une distinction entre les différentes catégories d'altérites. Une méthodologie basée sur la radiométrie aéroportée permettant de cartographier les roches silicoclastiques hétérogènes altérées à l'échelle régionale est développée. En confirmant l'uplift de l'Ardenne, la radiométrie aéroportée s'avère être également un outil géomorphologique intéressant. La cartographie des roches altérées en Région Wallonne passerait par un levé de terrain sur des cartes topographiques à 1/10 000. La notice explicative serait alors le lien entre la caractérisation des roches altérées et leur cartographie. Le processus d'altération en Région Wallonne est assez homogène d'un site à l'autre. En revanche, l'altération sur des lithologies différentes forme des profils différents dont l'intensité et l'épaisseur peuvent varier fortement. Une étude préalable de caractérisation des roches altérées en Région Wallonne est donc nécessaire à la cartographie, quelles que soient l'échelle et la précision souhaitées.(DOCSC04) -- FUNDP, 201
Molecular and evolutionary insights into sexual marine mammals and asexual bdelloid rotifers
n/an/a(DOCSC03) -- FUNDP, 201