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Characterization of Ligand Binding in Human Serum Albumin from Atomistic Energy Transfer Simulations
Get PDFFörster resonance energy transfer (FRET) is a key biophysical method for probing nanometer‑scale distances in biomolecular systems, but its direct application to protein–ligand complexes suffers from substantial biases due to restricted chromophore orientations and the limited validity of the point‑dipole approximation. This study introduces a protocol for identifying binding sites and characterizing ligand coordination modes in situ by combining fluorescence spectroscopy with efficient atomistic simulations based on the TrESP‑MMPol model. The protocol integrates electrostatic potential‑fitted transition charges with a polarizable classical environment, thereby overcoming the orientation and dielectric-screening assumptions inherent to Förster theory. The protocol has been applied to human serum albumin (HSA) and a library of fluorescent small molecules, including known binders of the HSA, accurately reproducing the binding sites of naproxen, carprofen, and indomethacin, and revealing novel binding scenarios for other molecules. The results show that direct comparison of experimental FRET data with atomistically simulated observables enables discrimination of plausible binding models – including the site and binding mode – and avoids systematic errors in distance estimation. The protocol is particularly attractive to examine targets with a single tryptophan, and can also be extended to other targets of interest in drug discovery via site-labelling with unnatural amino acids
Principal component analysis as an efficient method for capturing multivariate brain signatures of complex disorders—ENIGMA study in people with bipolar disorders and obesity
Get PDFMultivariate techniques better fit the anatomy of complex neuropsychiatric disorders which are characterized not by alterations in a single region, but rather by variations across distributed brain networks. Here, we used principal component analysis (PCA) to identify patterns of covariance across brain regions and relate them to clinical and demographic variables in a large generalizable dataset of individuals with bipolar disorders and controls. We then compared performance of PCA and clustering on identical sample to identify which methodology was better in capturing links between brain and clinical measures. Using data from the ENIGMA-BD working group, we investigated T1-weighted structural MRI data from 2436 participants with BD and healthy controls, and applied PCA to cortical thickness and surface area measures. We then studied the association of principal components with clinical and demographic variables using mixed regression models. We compared the PCA model with our prior clustering analyses of the same data and also tested it in a replication sample of 327 participants with BD or schizophrenia and healthy controls. The first principal component, which indexed a greater cortical thickness across all 68 cortical regions, was negatively associated with BD, BMI, antipsychotic medications, and age and was positively associated with Li treatment. PCA demonstrated superior goodness of fit to clustering when predicting diagnosis and BMI. Moreover, applying the PCA model to the replication sample yielded significant differences in cortical thickness between healthy controls and individuals with BD or schizophrenia. Cortical thickness in the same widespread regional network as determined by PCA was negatively associated with different clinical and demographic variables, including diagnosis, age, BMI, and treatment with antipsychotic medications or lithium. PCA outperformed clustering and provided an easy-to-use and interpret method to study multivariate associations between brain structure and system-level variables. PRACTITIONER POINTS: In this study of 2770 Individuals, we confirmed that cortical thickness in widespread regional networks as determined by principal component analysis (PCA) was negatively associated with relevant clinical and demographic variables, including diagnosis, age, BMI, and treatment with antipsychotic medications or lithium. Significant associations of many different system-level variables with the same brain network suggest a lack of one-to-one mapping of individual clinical and demographic factors to specific patterns of brain changes. PCA outperformed clustering analysis in the same data set when predicting group or BMI, providing a superior method for studying multivariate associations between brain structure and system-level variable
Examining the Integration of SDGs in a First-Year Methodology Course: A Case Study in Social Education by Admission Pathway
Get PDFPurpose: This study analyses how Sustainable Development Goals (SDGs) are incorporated intoa first-year Social Education methodology course at a Spanish public university. It assesses theimpact on students' understanding of sustainability and its relevance to socio-educationalresearch and future careers, considering different admission pathways. Design/methodology/approach: A case study on integrating the SDGs into a methodologycourse, which involved 110 students. Students' knowledge and perceptions were measuredbefore and after the teaching experience using an online questionnaire. Differences based onadmission pathways (CFGS and PAU) were explored. Findings: Initially, students had a low understanding of sustainability and SDGs, with thoseentering through PAU having an even lower understanding. However, both groups showedsignificant improvement after the teaching experience. Interestingly, the pattern ofdifferentiation was inverse, with PAU students showing a higher level of SDG knowledgecompared to CFGS students by the end of the course. While students recognised the importanceof SDGs in their careers, their personal involvement with them in daily life appeared moderate. Research limitations/implications: The assessment tool, based on validated surveys, aims forbetter accuracy in measuring university students' knowledge and perceptions of sustainability.Future research may broaden its scope to assess effectiveness in different courses and amongdiverse student groups. Practical implications: The variations in student knowledge and perception about sustainabilityand the SDGs, before and after the teaching experience, and across different admissionpathways, highlight the important role of higher education institutions in achieving equity andshaping future change agents’ perspectives. Originality/value: These findings reveal how innovative educational experiences promotesustainability and social responsibility among university students, emphasising the crucial roleof ongoing assessment in ensuring effective sustainability and equity education
Faculty of education in internship at school: impact on university teaching
Get PDFLa investigació que es presenta s’emmarca en el projecte ARMIF00017, Disseny i validació d’un model formatiu de pràctiques observacionals i participatives per al professorat universitari a centres d’educació infantil i primària. Es vol desenvolupar un model pels formadors de mestres a les tres universitats catalanes implicades: la Universitat de Barcelona, la Universitat Autònoma de Barcelona i la Universitat de Vic.La comunicació presenta el progrés de la recerca, centrant-se en l’anàlisi de l’impacte de les estades en la pràctica docent dels formadors a través de la tècnica de la fotoveu
Rendimiento académico y estrés en estudiantes del grado en enfermería de la Universidad de Barcelona
Get PDFEl objetivo fue determinar el grado de rendimiento académico y su relación con el estrés y diversas variables sociodemográficas del alumnado de enfermería. Se realizó un estudio observacional transversal y prospectivo donde se registraron diversas variables sociodemográficas, grado de estrés y la escala de rendimiento académico (RA) desde la perspectiva del alumnado. Participaron 201 estudiantes, obteniendo una puntuación media de estrés de 3,71±0.9 puntos y de RA de 29,48±8,25 en la dimensión de actividades académicas, 21,12±5,10 en dedicación al estudio y 9,64±4,27 en recursos didácticos. La edad, sexo y las cargas familiares impactan en el grado de estrés y RA
MeerKAT view of Hickson Compact Groups. II. Deficiency in the core andsurrounding regions
Get PDFAbstract
Context. Hickson compact groups (HCGs) offer an ideal environment for investigating galaxy transformation as a result of interactions. It has been established that the evolutionary sequence of HCGs is marked by an intermediate stage characterised by a substantial amount of H I in their intragroup medium (IGrM) in the form of tidal tails and bridges (phase 2), rapidly followed by a final stage in which no IGrM gas is found and i which their member galaxies are highly H I deficient (phase 3).
Aims. Despite numerous single-dish and interferometric H I studies on the HCGs, a clear H I picture of the groups within their large-scale environment still remains to be uncovered. Taking advantage of MeerKAT’s high column density sensitivity and large field of view, we aim to investigate the rapid transformation of HCGs from the intermediate to late phases, and establish a picture of their gas content variations in the context of their large-scale environments.
Methods. We performed MeerKAT observations of six HCGs that were selected to represent the intermediate and late phases of the proposed evolutionary sequence. Combining the H I observations with data from recent wide-field optical surveys, we evaluated the H I deficiencies of galaxies in a ∼30′ radius of the HCGs.
Results. We find that galaxies surrounding both phases exhibit similar distributions in their gas content. Similarly, galaxies making up the cores of phase 2 HCGs are comparable to their neighbours in terms of H I deficiencies. However, phase 3 groups are over an order of magnitude more deficient than their surroundings, supporting previous findings that late-phase HCG galaxies are more evolved than their large-scale environments
Anatomía de unos gobiernos independentistas
Get PDFDesde 2010 las fuerzas nacionalistas catalanas han protagonizado una marcada y acelerada apuesta política e institucional para la independencia de Cataluña. El fenómeno ha sido objeto de diferentes análisis generales y más epecíficas para lo que se refiere a los partidos más importantes de ese espacio político: Convergència i Unió y Esquerra Republicana de Catalunya. En este artículo, en cambio, se quiere focalizar la atención en la evolución de las características, la acción de impulso y la composición de los ejecutivos autonómicos catalanes en los años que van de 2010 a 2017. La razón de este planteamiento tiene que ver con dos razones de peso. La primera de ella tiene que ver con la enorme carga declarativa, de relato que han desarrollado los gobiernos de la Generalitat: analizar los rasgos principales de sus acciones institucionales ayuda a despejar el horizonte y a captar de forma más concreta los elementos de continuidad o de ruptura a lo largo del tiempo. La segunda tiene que ver con intentar reconstruir -por debajo de las condiciones de "excepcionalidad" siempre mencionadas- las relaciones de fuerza entre los diferentes partidos nacionalistas que han integrado en integran el gobierno, así como las dinámicas más significativas de la emersión de una clase dirigente nueva. Palabras clave Independentismo; nacionalismo; políticas de gobierno; élite política; cultura polític
La participación en la junta por medios telemáticos: asistencia y ejercicio del derecho de voto
Get PDFEn este artículo se analizan dos medidas relacionadas con las nuevas tecnologías, que afectan a la junta general de las sociedades anónimas y las sociedades de responsabilidad limitada: por un lado, la asistencia telemática y, por otro, el ejercicio del derecho de voto por correspondencia postal, electrónica u otro medio de comunicación a distancia. A pesar de que están reguladas en la Ley de Sociedades de Capital (LSC) cabe destacar que no lo están de una forma clara ni satisfactoria. Aunque solo están previstas en la Ley para las sociedades anónimas, se ha admitido su aplicación también a las sociedades de responsabilidad limitada. La asistencia telemática, prevista en el artículo 182 LSC, se permite cuando los estatutos hayan contemplado esta posibilidad y quede garantizada la identidad del sujeto. En este artículo estudiaremos en profundidad estos requisitos así como todo lo relativo al ejercicio de este derecho. La admisión de la asistencia telemática abre la posibilidad de la celebración de la junta de forma totalmente virtual, puesta en duda por parte de la doctrina y que el estado de alarma, decretado como consecuencia de la pandemia del Covid 19, ha admitido durante el mismo. En cuanto al derecho de voto, tal y como recoge el artículo 189 LSC, se puede ejercitar por correspondencia postal, electrónica u otro medio de comunicación a distancia, ya sea de forma previa o durante la celebración de la junta, cuando se garantice la identidad del sujeto. Tal y como se desarrollará en este artículo, será necesario que los estatutos o bien el reglamento de la junta determinen todo lo relativo, como podría ser el procedimiento admisible para emitir el voto, el plazo durante el cual la sociedad podrá recibir esos votos o quien debe custodiarlos. Finalmente, debemos apuntar que se dedicará un apartado a estudiar las diferencias de estas medidas cuando estén contempladas para las sociedades cotizadas, previstas en el artículo 521 LSC
El sodio como excipiente de medicamentos y su potencial relación con la elevación de la presión arterial
Get PDFObjetivos: Conocer la composición cuantitativa de sodio en las formas farmacéuticas efervescentes y en soluciones de analgésicos, suplementos de calcio y mucolíticos utilizadas crónicamente; evaluar en qué proporción se tiene en cuenta el potencial riesgo a la hora de prescribir estos medicamentos a pacientes hipertensos y analizar si la toma de estas formas farmacéuticas por la población hipertensa se acompañaba de una descompensación de los valores de presión arterial (PA). Métodos: Se calculó el porcentaje de hipertensos tratados con paracetamol, calcio y acetilcisteína efervescentes (bicarbonato y carbonato sódico) en 10 Centros de Atención Primaria. Se realizó un estudio de cohortes retrospectivo con grupo control (ajustado por edad y género) en uno de los centros; seguimiento de un año. Las variables estudiadas fueron: PA sistólica (PAS) y diastólica (PAD) pre-post inicio del tratamiento con las formas farmacéuticas efervescentes, considerando clínicamente relevantes incrementos >5 mmHg; intensificación del tratamiento antihipertensivo. Resultados: Un 7,7% (rango: 5,4%-9,9%) de pacientes hipertensos se trataron con los medicamentos efervescentes estudiados. El porcentaje de hipertensos que mostraron un aumento de PAS relevante fue significativamente superior en el grupo tratado con medicamentos efervescentes en comparación al del grupo control: 35,9% (IC 95% 27,2%44,6%) vs. 18,8% (IC 95% 12,7%-24,8%) y también respecto a la intensificación del tratamiento antihipertensivo, 46,6% (IC 95% 37,5%-55,6%) vs. 30% (IC 95% 22,9%37,1%). Conclusiones: La sensibilización al potencial efecto adverso es muy variable. Los medicamentos efervescentes que incluyen carbonato-bicarbonato de sodio pueden incrementar la PA. El uso de las formas farmacéuticas efervescentes, especialmente en pacientes de riesgo, debe evitarse.