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Diagnóstico molecular de la vaginitis: Desarrollo y validación de un test de PCR a tiempo real para la identificación de los principales agentes causantes de vaginitis infecciosa
No full textLa microbiota vaginal desempeña un papel fundamental en la salud ginecológica al actuar
como barrera protectora frente a infecciones. Las alteraciones en este ecosistema pueden
derivar en afecciones como la vaginosis bacteriana (VB), la vulvovaginitis candidiásica (VVC) y la
tricomoniasis, que representan las principales causas de vaginitis infecciosa. Estas condiciones
no solo impactan significativamente la calidad de vida de las pacientes, sino que también se
asocian con complicaciones obstétricas y un mayor riesgo de contraer infecciones de
transmisión sexual (ITS).
Este trabajo presenta el diseño, desarrollo y validación de un test molecular basado en la
técnica de PCR en tiempo real para el diagnóstico de las principales causas de vaginitis. El test
diseñado permite la detección simultánea, mediante un formato de PCR multiplex, de los
microorganismos que forman parte de la microbiota, Lactobacillus spp. (L. crispatus, L. jensenii,
L. iners y L. gasseri), y los patógenos clave involucrados en estas infecciones: Gardnerella
vaginalis, Fannyhessea vaginae, Candida albicans, C. glabrata, C. albicans, C. krusei, Candida
spp. (C. parapsilosis, C. tropicalis y C. dubliniensis) y Trichomonas vaginalis.
Para el diseño del test, en base a bibliografía y alineamientos de genomas, se identificaron
los microorganismos clínicamente relevantes y se seleccionaron dianas genéticas altamente
conservadas para el diagnóstico. Se diseñaron oligonucleótidos y sondas TaqMan específicas
para cada diana, optimizando las condiciones de reacción hasta alcanzar una sensibilidad y
especificidad óptimas inicialmente en formato singleplex para posterior aplicación en formato
multiplex. Durante el desarrollo del test, se evaluaron diversos reactivos de PCR y métodos de
extracción. Se seleccionó el master mix, kit de extracción y protocolo de amplificación que
generó el mejor rendimiento.
Se desarrolló un algoritmo propio para el diagnóstico de VB, que pretende establecer una
clasificación de la microbiota vaginal similar a la que proporciona el método de Nugent (gold
standard) en base a la cantidad de Lactobacillus frente a la cantidad de G. vaginalis y F. vaginae
presente en la muestra. Este algoritmo alcanzó un AUC de 0,950, con una sensibilidad del 93% y
una especificidad del 90,4%.
Para demostrar la validez científica y el desempeño analítico y clínico del método, se realizó
una validación interna conforme a los criterios establecidos en el Reglamento (UE) 2017/746
para la comercialización de productos sanitarios de diagnóstico in vitro (IVD) en la Unión
Europea (marcado CE). Esta validación incluyó el análisis del límite de detección, precisión, sensibilidad y especificidad diagnóstica, reactividad cruzada, inclusividad y estabilidad del
método para su uso con muestras de exudado vaginal de origen humano. Además, se evaluó la
integración del test con sistemas automatizados, como el MagXtract® 3200 System, y su
compatibilidad con equipos de amplificación, como el CFX96™ Real-Time PCR Detection System
y el Azure Cielo™ 6 Real-Time PCR System. Los resultados obtenidos del análisis de estos
parámetros confirmaron el adecuado funcionamiento analítico y clínico del test.
Una vez obtenida la certificación CE, se llevó a cabo una evaluación externa que incluyó la
comparación con métodos de diagnóstico tradicionales y otros basados en técnicas de
amplificación de ácidos nucleicos (NAAT). El análisis del desempeño del test Vaginal Panel
Realtime PCR kit frente a estos métodos demostró que ofrece un rendimiento clínico
equiparable para el diagnóstico de VB, VVC y tricomoniasis.
En conclusión, este trabajo describe el diseño, desarrollo y validación del test Vaginal Panel
Realtime PCR Kit que representa un avance significativo en el diagnóstico de vaginitis,
proporcionando una herramienta rápida, precisa y confiable para el manejo clínico. Su
implementación en la práctica clínica permite mejorar la atención a las pacientes, reducir
complicaciones y optimizar las estrategias terapéuticas.Tesis Univ. Granada.Vircell S.L
Exploring genomic diversity and reproductive strategies in three expansion phases of the superdominant Brachypodium rupestre in high mountain grasslands
No full textTall-grass expansion in natural plant communities is a concern under current global change
scenarios. Driven by factors such as community vulnerability and the competitive abilities of tall-grass
species, this phenomenon is exemplified by Brachypodium rupestre (Host) Roem. and Schult, a perennial tall-grass native to Europe. B. rupestre spreads
aggressively in the grasslands of the western Pyrenees
due to a disrupted regime of lack of herbivory and
recurrent burnings that has persisted over several decades. This study aims to investigate whether the contrasted managements of grazing, abandonment and
burnings have promoted specific reproductive traits
and impacted the population genomics of B. rupestre.
Nine sites varying in cover of B. rupestre classified
into three expansion phases associated to different
management regimes were monitored: (i) scattered
populations in multispecific grazed sites, (ii) stand
populations expanding at sites of relaxed grazing or
abandonment, and (iii) superdominant populations
constituting dense degraded covers in recurrently
burned sites. ddRADseq data showed high genomic
diversity but relatively low genomic structure, likely
due to substantial gene flow and the absence of wind
barriers. The standardized index of association supported asexual reproduction in all populations,
which is coupled with sexual reproduction. Contrasting management practices did not promote distinct
genomic identities between expansion phases; rather,
the genetic differentiation and divergence of populations responded to life history and spatial isolation,
even within a small geographic area. The similar levels of genetic diversity and the significantly different
number of clones between expansion phases suggest
a complex pattern of genotypic and clonal variability,
which may be influenced by environmental factors
(historical disturbance regimes).Ministerio de Ciencia e Innovación de España (Proyectos PID2020-116786RB-C31, PID2022-140074NB-I00, TED2021-131073B-I00, PDC2022-133712-I00)Gobierno de Aragón (Proyecto Bioflora A01-23R)Fundaciones “La Caixa” y Caja Navarra(Beca LCF/PR/PR13/51080004)Universidad Pública de Navarra (Open Access funding
Estadística de trayectorias y fluctuaciones de la corriente en sistemas fuera del equilibrio
No full textEn esta tesis se estudian los sistemas fuera del equilibrio. Se construye
un marco teórico aplicable a sistemas de transporte unidimensionales
lejos del equilibrio termodinámico. Para ello, se
introducen dos herramientas: la primera es la Teoría de Grandes
Desviaciones, con la que es posible caracterizar estadísticamente
la ocurrencia de fluctuaciones propias de los llamados “eventos
raros”, aquellos que son muy improbables y parecen romper las
leyes de la termodinámica. La segunda es el Formalismo de Integrales
de Camino, que utilizamos para tratar las trayectorias en el
espacio de fases asociadas a estos eventos raros.
Combinando ambas herramientas surge la teoría principal de este
trabajo, la Teoría Macroscópica de Fluctuaciones, desarrollada para
sistemas hidrodinámicos y aplicada a un caso práctico: el modelo
Kipnis-Marchioro-Presutti (KMP). Se han replicado resultados
conocidos, generalizado el modelo bajo la presencia de un
campo externo y verificado el teorema de Gallavotti-Cohen.
Finalmente, se exploran aplicaciones de esta teoría en el estudio
de fenómenos emergentes, como los cristales de tiempo (estructuras
que rompen la simetría temporal discreta, usadas en computación
cuántica), así como en modelos de transporte como el
WASEP, donde se observa la aparición espontánea de simetrías
rotas y organización colectiva fuera del equilibrio.This thesis explores systems far from equilibrium by developing
a theoretical framework applicable to one-dimensional transport
systems beyond thermodynamic equilibrium. Two main tools are
introduced: the first is Large Deviation Theory, which statistically
characterizes the occurrence of fluctuations associated with socalled
“rare events”, those highly improbable deviations that appear
to violate the laws of thermodynamics. The second is the
Path Integral Formalism, which we use to analyze trajectories in
phase space corresponding to these rare events.
By combining these two tools, we arrive at the central theory of
this work: the Macroscopic Fluctuation Theory, developed for hydrodynamic
systems and applied to a practical case, the Kipnis-
Marchioro-Presutti (KMP) model. We reproduce known results,
extend the model to include an external field, and verify the
Gallavotti-Cohen fluctuation theorem.
Finally, we explore the applications of this theory to emergent
phenomena, such as time crystals (structures that spontaneously
break discrete time-translation symmetry, often used in quantum
computing), and in transport models like WASEP, where spontaneous
symmetry breaking and collective organization emerge out
of equilibrium.Universidad de Granada. Facultad de Ciencias. Grado en Física. Trabajo Fin de Grado. Curso académico 2024/202
Guía sobre el empleo ético de la inteligencia artificial generativa en la preparación del trabajo fin de grado en Derecho
No full textDepartamento de Derecho Internacional Público y Relaciones Internacionales de la Universidad de Granad
ABP_CAE: Aprendizaje Basado en Proyectos Coordinados en Arquitectura y Edificación
No full textEl proyecto ABP_CAE tiene como objetivo principal la implementación de una metodología
innovadora basada en el Aprendizaje Basado en Proyectos (ABP) como integración de competencias específicas
y transversales de diversas asignaturas en el Grado de Edificación y Arquitectura a través de un proyecto común
que involucra a diversas figuras del programa formativo: profesorado, alumnado y egresados.
La metodología se desarrollará en varias etapas, comenzando con la elección y elaboración de un proyecto de
edificación que sirva como eje central para la integración de las distintas asignaturas como, por ejemplo, el
proyecto de una vivienda unifamiliar. Asimismo, se definirán microproyectos asociados a cada asignatura y
alineados con las competencias específicas de cada una de ellas, pero siempre dentro del contexto del proyecto
de edificación general, promoviendo así una visión integral y multidisciplinaria del proceso de diseño y
construcción. Este proyecto no solo deberá ser desafiante y relevante para el alumnado, sino que también debe
estar diseñado para abarcar un amplio espectro de competencias.
Esta metodología permite que quienes cursan las asignaturas apliquen conocimientos teóricos en un contexto
práctico real, fomentando el trabajo en equipo, la resolución de problemas, la gestión de proyectos y la
comunicación efectiva. La innovación de este proyecto reside no solo en la metodología ABP per se, sino también
en su enfoque integrador y multidisciplinario, que prepara a los futuros egresados/as a afrontar los desafíos
reales del mundo profesional. Al trabajar en un proyecto común, el alumnado puede ver cómo las diferentes
disciplinas se interrelacionan y complementan, lo que proporciona una experiencia de aprendizaje más rica y
aplicable a la vida real.
Para asegurar la calidad y la mejora continua del proyecto, se establecerá un sistema de reflexión y análisis
basado en la retroalimentación constante tanto del alumnado como del profesorado. Los ajustes metodológicos
se realizarán según la eficacia observada, buscando siempre la excelencia educativa y la relevancia en el ámbito
profesional
Performance comparison of variable-stepsize IMEX SBDF methods on advection-diffusion-reaction models
No full textLos modelos de Advección-Difusión-Reacción (ADR) describen los mecanismos de transporte en medios fluidos o sólidos. A menudo se formulan como Ecuaciones en Derivadas Parciales que, para su resolución numérica en tiempo, se discretizan espacialmente dando lugar a sistemas de Ecuaciones Diferenciales Ordinarias (EDOs). Este artículo investiga el rendimiento de los métodos basados en fórmulas de diferenciación hacia atrás semiimplícitos con paso variable (VSSBDF) de hasta cuarto orden para resolver modelos ADR. Para ello, se han empleando dos enfoques diferentes de división implícita-explícita: una división basada en la física y una división basada en una linealización dinámica del sistema resultante de EDOs, denominada en este artículo división jacobiana. Desarrollamos un algoritmo adaptativo para control de error y paso de tiempo específico para métodos VSSBDF de hasta cuarto orden basado en una técnica de refinamiento de duplicación de pasos que utiliza estimaciones de los errores de truncamiento locales. A través de una comparación sistemática entre la división basada en la física y la división jacobiana en seis modelos ADR de prueba, evaluamos el rendimiento en función de los tiempos de CPU y la precisión correspondiente. Nuestros hallazgos muestran la superioridad general de la estrategia de división jacobiana en varios experimentos.Advection-diffusion-reaction (ADR) models describe transport mechanisms in fluid or solid media. They are often formulated as partial differential equations that are spatially discretized into systems of ordinary differential equations (ODEs) in time for numerical resolution. This paper investigates the performance of variable stepsize, semi-implicit, backward differentiation formula (VSSBDF) methods of up to fourth order for solving ADR models employing two different implicit-explicit splitting approaches: a physics-based splitting and a splitting based on a dynamic linearization of the resulting system of ODEs, called jacobian splitting in this paper. We develop an adaptive time-stepping and error control algorithm for VSSBDF methods up to fourth order based on a step-doubling refinement technique using estimates of the local truncation errors. Through a systematic comparison between physics-based and Jacobian splitting across six ADR test models, we evaluate the performance based on CPU times and corresponding accuracy. Our findings demonstrate the general superiority of Jacobian splitting in several experiments
Tideglusib enhances ALP activity and upregulates RANKL expression in Osteoblast-macrophage Co-cultures within a 3D collagen scaffold
No full textObjectives
Tideglusib (Tx) is known for its osteogenic potential, yet its effects on the interplay between osteoblasts and M1 macrophages remain underexplored. This in vitro study aimed to isolate and evaluate both the individual and combined roles of M1 macrophages and osteoblasts in macrophage differentiation and osteoblast function, specifically focusing on how these interactions influence protein expression of osteogenesis and osteoclastogenesis in the presence or absence of Tx.
Methods
Osteoblast and macrophage cells were co-cultured in direct contact for 24 and 48 h, with or without the presence of Tx. ALP activity, the expression of inflammatory-related genes using RT-qPCR, and histological analyses were performed.
Results
Co-culturing osteoblasts and M1 macrophages with Tx increased alkaline phosphatase production, indicative of enhanced osteoblast activity. Histological assessments revealed that Tx treatment contributed to the stability and maintenance of cell morphology within the scaffold, suggesting a supportive environment for cell viability and function. Tx significantly reduced the expression of pro-inflammatory markers, such as TNF-α and IL-1β, in the co-culture at both 24 and 48 h Tx also effectively inhibited osteoclastogenic differentiation in macrophages, thereby diminishing their pro-inflammatory phenotype.
Conclusions
Tx increased ALP activity and produced a significant up-regulation of RANKL expression, indicating enhanced osteoblast differentiation and osteoclast activation. Tx mitigates macrophage-driven inflammation.
Clinical significance
Tx may enhance bone regeneration by modulating inflammatory responses and preserving cell integrity.This study is supported by Grant PID2020–114694RB-I00 funded by MCIN/AEI 10.13039/501,100,011,033 (M.T. and R.O.) and by the National Science Foundation under Grant 2,213,958 (E. Y.-A.)
Sampling, molecular tools, and experimentation for the study of bird feather mites and lice
No full textLos ectosimbiontes permanentes de las aves se han consolidado como sistemas de estudio excepcionales para abordar
cuestiones fundamentales en ecología y biología evolutiva. Entre los distintos grupos de ectosimbiontes de aves, los ácaros de las plumas
y los piojos son los mejor estudiados. Los avances en metodologías experimentales, en ecología molecular y en genómica han ampliado
notablemente el conocimiento sobre estos organismos, estableciéndose como sistemas modelo para la investigación de procesos
coevolutivos. No obstante, existe una notable falta de estandarización en los protocolos de muestreo y en las metodologías moleculares,
a lo que se suman conocimientos y experiencias que, en algunos casos, no se han publicado y solo se comparten de forma informal entre
investigadores. Esta situación limita la comparabilidad entre estudios y ralentiza el avance experimental. En este trabajo revisamos los
diferentes métodos de muestreo (colecta y conteo), las técnicas moleculares más apropiadas y las aproximaciones experimentales que se
han usado. Con esto, tratamos de poner en común el conocimiento acumulado, para facilitar y estimular futuras investigaciones sobre la
biología, ecología y evolución de estos ectosimbiontes.Permanent ectosymbionts of birds have become an exceptional study system for addressing key questions in ecology and
evolutionary biology. Among the different groups of avian ectosymbionts, feather mites and lice are the most extensively studied. Advances
in experimental methodologies, molecular ecology, and genomics have greatly expanded our understanding of these organisms,
establishing them as model systems for research on coevolutionary processes. However, there remains a notable lack of standardization
in sampling protocols and molecular methodologies, along with knowledge and experience that, in some cases, remain unpublished and
shared only informally among researchers. This situation limits comparability across studies and hinders experimental progress. In this
work, we review the different sampling methods (collection and counting), the most appropriate molecular techniques, and the experimental
approaches that have been used to date, aiming to consolidate existing knowledge and to facilitate and encourage future research into the
biology, ecology, and evolution of these ectosymbionts
Emotional Exhaustion in University Teachers: Contributing Aspects and Mediating Mechanisms
No full textNowadays, employees in the higher education sector are faced with an increasingly demanding environment, which can lead to high levels of stress and emotional exhaustion. In this context, the Demand-Resource Model can explain the different variables that influence the emotional exhaustion of professors. However, although the model has been tested on different samples of workers, there is a lack of literature on other variables that may mediate this relationship. In this sense, this research aims to investigate the mediating effect of psychological capital, a positive psychological construct, on the relationship between job demands and resources and its impact on emotional exhaustion. To this end, we conducted a survey of 205 professors
from different Ecuadorian universities. Structural equation modeling (SEM) analysis was applied to the data collected.
The results showed that high work resources had a direct impact on emotional exhaustion, as suggested by the model, and that this relationship was mediated by psychological capital. Similarly, high job demands (high work rhythms and emotional demands) were another source of emotional exhaustion, although in this case the relationship was not significantly mediated by psychological capital. The study shows that high job demands significantly increase emotional exhaustion, whereas an adequately resourced work environment, such as fair leadership and supervisor support, promotes psychological safety and reduces emotional exhaustion. Furthermore, psychological capital positively modulates the influence of resources on emotional
exhaustion but shows no significant mediation with job demands
Impact of a Serious Board Game on the Academic Performance of Future Physical Education Teachers
No full textUniversity-level training is constantly evolving to meet the needs of future professionals. However, a passive student role and a disconnect between academic content and professional practice often lead to disengagement and low involvement. To address these shortcomings, active learning methodologies have emerged, and their appropriate implementation fosters contextualised, meaningful learning. Among these methods, Game-Based Learning stands out, particularly the use of serious games, which aim to develop competencies and consolidate knowledge through play. This article evaluates the impact of Docentis, a board game created for undergraduates pursuing Primary Education teaching degrees. The game simulates the role of a Physical Education teacher, incorporating organisational and curricular elements of the subject, with the aim of enhancing both cognitive and non-cognitive skills while increasing participants’ engagement. Using a mixed-method approach, both quantitative and qualitative data were gathered, demonstrating that Docentis motivated students, enhanced their learning, and improved academic performance based on the experimental group’s results. Additionally, the game was highly valued for its transferability to professional practice. The findings confirm the suitability of this board game for training future Physical Education teachers, promoting meaningful learning experiences that bridge theory and practice through the simulation of professional contexts