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estudio de caso en agaváceas y cactáceas.
Get PDFTesis (Maestría en Ciencias Ambientales)"Las plantas suculentas, típicas de zonas áridas y semiáridas, han desarrollado diversas adaptaciones que les ayudan a sobrevivir en estos ambientes. Algunas de estas plantas presentan contracción (“arrugamiento” o “plegamiento”) de la raíz, arrastrando al tallo cerca o debajo de la superficie del suelo. El objetivo de este trabajo fue analizar a nivel fisiológico y anatómico la posible ventaja ecológica de este tipo de raíz para tolerar la sequía en cuatro especies suculentas: dos Agavaceae (Agave salmiana y Yucca decipiens) y dos Cactaceae (Leuchtenbergia principis y Turbinicarpus schmiedickeanus). Se seleccionaron diez plantas por cada especie, de las cuales cinco fueron sometidas a riego y cinco a sequía, durante cuatro meses, bajo condiciones de invernadero. Se midió el nivel de enterramiento de la planta a consecuencia de la contracción de la raíz, cada quince días durante cuatro meses. Se evaluó la eficiencia cuántica del fotosistema II al inicio y final del experimento, con mediciones intermedias de curvas de luz; también se midió la conductancia estomática (gs) en tres de las cuatro especies y al cuarto mes se cosecharon las raíces y se les hicieron cortes anatómicos. Otras variables de respuesta evaluadas son la tasa de transporte de electrones (ETR, por sus siglas en inglés), la disipación no fotoquímica (NPQ, por sus siglas en inglés), la acidez titulable, el diámetro de los vasos y la conductividad hidráulica axial teórica (Kh). Se encontró que la única especie que no presento contracción fue Y. decipiens y el fenómeno de “enterramiento” se presentó solo en L. principis y T. schmiedickeanus al tercer mes de sequía, alcanzando un máximo enterramiento de 0.92 cm en el cuarto mes. Respecto a la eficiencia cuántica del fotosistema II, la hora de mayor estrés fue a las 12 del día en riego y en sequía. En las especies con raíz contráctil hubo descenso de la ΦPSII a lo largo del día, pero se recuperaron por completo al atardecer. Turbinicarpus schmiedickeanus es la única especie que bajo riego y sequía mantuvo su eficiencia cuántica del fotosistema II en valores óptimos. Con excepción de Y. decipiens, para las demás especies con riego no hubo efecto en la hora de mayor estrés. En las plantas con menor eficiencia cuántica del fotosistema II la disipación de calor y la tasa de transporte de electrones fueron más altas, para tratar de tolerar el estrés.""Succulent plants are common in arid and semiarid areas, and they have developed several adaptations to survive in these environments, like contractile roots which induce an underground movement of the stem. The aim of this work was to evaluate the possible ecological advantages of contractile roots in four succulent plants: two Agavaceae (Agave salmiana and Yucca decipiens), and two Cactaceae (Leuchtenbergia principis and Turbinicarpus schmiedickeanus). Ten plants for each species were selected, 5 of them were watered and 5 were not irrigated, by a period of four months under greenhouse conditions. Underground movement was measured each 15 days. We evaluated the quantum efficiency of photosystem II at the beginning and at the end of the experiment, with intermediate measurements of light curves. In addition, we measured stomatal conductance (gs) in three of the four species, and made histological disections for all species. Other evaluated response variables were electron transport rate (ETR), non-photochemical quenching (NPQ), titratable acidity, vessel diameter and theoretical axial hydraulic conductivity (Kh). Contractile roots were found in three species, but not in Y. decipiens. The burial phenomenon was only detected for L. principis and T.schmiedickeanus, starting after three months of drought and reaching a maximum of 0.92 cm depth in the fourth month. We found higher stress (lower quantum efficiency of photosystem II; ΦPSII) at mid-day in both treatments. In species with contractile roots, ΦPSII declined at mid-day but recovered completely at sunset. Turbinicarpus schmiedickeanus was the only species that reached optimal values of ΦPSII under both treatments, and Y. decipiens was the only species that reached lower ΦPSII at mid-day when watered, but recovered at sunset. However; Y. decipiens in drought had lower ΦPSII and it did not recover at sunset, but had higher NPQ (heat dissipation) and ETR posibly as an attempt to tolerate stress. Stomatal conductance was lower for plants of the Agavaceae under drought, for L. principis it was very low in both treatments. Vessel diameter and Kh were higher in irrigated plants than in non-irrigated only for L. principis. In general for contractile root anatomy, the epidermis in the longitudinal plane showed waves and the medium to inner cortex cells were radial and tangentially collapsed.
First records of the White Ibis (Eudocimus albus) from the highland plateau of San Luis Potosi, Mexico
Get PDF"Reportamos dos observaciones visuales del ibis blanco (Eudocimus albus) de la Laguna de Los Coyotes, un afluente natural del manantial la Media Luna que se localiza en el municipio de Rioverde, San Luis Potosí, México. Los avistamientos ocurrieron en septiembre de 2011 y febrero de 2012. Este es el primer reporte de la presencia de esta ave en dicha localidad, y es importante porque la especie ha sido escasamente encontrada en ambientes no ribereños del Altiplano Mexicano.""We report two visual records of the White Ibis (Eudocimus albus) at "Los Coyotes" lagoon, a natural affluent of the water spring "Media Luna" located at the "Rioverde" municipality of San Luis Potosi, Mexico. These visual encounters took place on September 2011 and February 2012. This is the first published report of the species at this locality, and our finding is important because this species has been barely found in non-coastal wetlands of the Mexican highland plateau.
Proteomic analysis of amaranth under abiotic stress
Get PDFTesis (Doctorado en Ciencias en Biología Molecular)"Las especies comerciales de amaranto de grano Amaranthus
hypochondriacus, A. cruentus y A. caudatus son nativas de América y están distribuidas en los cinco continentes. El amaranto es un pseudocereal altamente nutritivo y no alergénico con notables propiedades nutracéuticas, capaz de adaptarse a diversas condiciones de cultivo tales como suelos pobres en
nutrientes y moderadamente salinos, condiciones de poca agua y altas temperaturas. Estas características lo convierten en un buen modelo para estudiar la tolerancia a condiciones de estrés abiótico como la sequía y el estrés salino. El estrés abiótico es uno de los principales factores que limitan la productividad agrícola mundial y genera la reducción de hasta el 50% en el
rendimiento potencial de los cultivos. La exposición de las plantas a condiciones de estrés abiótico, desencadena cambios fisiológicos que se rigen por la expresión de diferentes grupos de genes y proteínas cuya actividad permite a las plantas tolerar condiciones ambientales adversas. El empleo cada vez más frecuente de las tecnologías “omicas” permite la identificación de genes y proteínas asociados con la tolerancia al estrés abiótico.
Como parte del proyecto Amaranth-Future-Food, en este trabajo se evaluó mediante un enfoque proteómico la respuesta del amaranto a condiciones de estrés abiótico como la sequía y el estrés salino. Para lo cual se obtuvieron los patrones de proteínas mediante Electroforesis Bidimensional (2-DE) y se identificaron las proteínas diferencialmente acumuladas mediante Espectrometría de Masas en Tándem. Algunas de estas proteínas pueden considerarse como asociadas con la tolerancia al estrés abiótico. Sin embargo, es necesaria una caracterización funcional de estas proteínas a fin de demostrar su importancia en la respuesta de las plantas ante el estrés. Algunas alternativas para demostrar el papel que juegan estas proteínas diferencialmente acumuladas en la respuesta ante el estrés abiótico son: la
complementación funcional de levaduras sensibles a componentes del estrés abiótico como el estrés osmótico, el silenciamiento génico, la expresión de dichas proteínas en líneas insercionales así como la evaluación de la acumulación diferencial de estas proteínas candidatas en híbridos que mantengan los rasgos deseados. Estos acercamientos nos darían una idea más clara del papel que desempeñan tales proteínas en los mecanismos de respuesta al estrés abiótico.""Commercial amaranth species such as Amaranthus hypochondriacus, A. cruentus and A. caudatus are native to America and are worldwide distributed. Amaranth is a highly nutritious and non-allergenic pseudo-cereal crop with remarkable nutraceutical properties. Amaranth is also a promising species often grown under semiarid conditions prone to both drought and salinity. For the above described amaranth is a good model to study tolerance to abiotic stress conditions such as drought and salt stress. Abiotic stress is one of the major factors limiting crop productivity worldwide and responsible for the reduction of up to 50% in the potential yield of crops. Plant exposure to abiotic stress triggers physiological changes ruled by the expression of different sets of genes and proteins whose activities enable plants to tolerate stressful environmental conditions. The application of 'omics' technologies has allowed the identification of genes and proteins related to abiotic stress tolerance. As part of the Amaranth-Future-Food project, in the present thesis, 2-DE gel coupled with LC-MS/MS approach was applied in order to analyze the changes in amaranth protein accumulation in response to abiotic stress conditions such as drought and salt stress. Some of the differentially accumulated proteins in response to stress may be considered associated to abiotic stress tolerance. However, functional characterization of these proteins in order to demonstrate its importance in plant response to abiotic stress is needed. Functional complementation by heterologous expression in yeast, gene silencing, heterologous expression in insertional lines and evaluation of differential accumulation of these proteins in hybrids from cultivars with contrasting tolerance to abiotic stress that preserve the desired trait are among the alternatives to demonstrate the role played by such proteins in plant responsive mechanisms to cope with abiotic stresses.
Caracterización trascripcional de los genes HR4 Y WRKYs de Arabidopsis thaliana en la interacción con Trichoderma atroviride.
Get PDFTesis (Doctorado en Ciencias en Biología Molecular)"En el presente trabajo se analizó la respuesta de la planta modelo Arabidopsis thaliana a la interacción con el hongo benéfico Trichoderma atroviride. Para ello se realizaron microarreglos de la interacción in vitro de plántulas de A. thaliana con T. atroviride. De los resultados de los microarreglos de Arabidopsis seleccionamos al gene HR4 y a ocho factores de transcripción del tipo WRKY para estudiar sus patrones transcripcionales durante dicha interacción. El gen HR4 es homólogo de los genes RPW8.1 y RPW8.2 presentes en A. thaliana ecotipo Ms-0, los cuales son genes R que confieren resistencia al “powdery mildew” por medio de la activación de la ruta del ácido salicílico (SA). Como resultado de la caracterización transcripcional de este gen, observamos que el transcrito se incrementa en respuesta a la colonización del hongo, tanto en interacción directa como en interacción a distancia. Además se caracterizaron los genes RPW8.1 y RPW8.2 (Ms-0), observando una fuerte inducción del gen RPW8.1, siendo éste el primer reporte de los genes RPW8 bajo una interacción benéfica. Continuando con la caracterización del gen HR4 se midieron los niveles de transcripción en plántulas de Arabidopsis en interacción con otros microorganismos tanto benéficos (Pseudomonas fluorescens) como patogénicos (Pseudomonas syringae) así como en tratamiento con diversas hormonas. A pesar que el ecotipo Col-0 de Arabidopsis thaliana es el más estudiado, el gen HR4 no había sido previamente caracterizado, así los datos obtenidos aquí sobre este gen proveen importante información de su regulación en interacciones benéficas. En relación a los factores de transcripción se analizaron: WRKY8, WRKY33, WRKY38, WRKY42, WRKY54, WRKY57, WRKY60 y WRKY70. La mayoría de estos genes respondieron incrementando su transcripción a medida que se establecía la interacción Arabidopsis-Trichoderma. En contraste el gen WRKY8 disminuyó fuertemente su transcrito en la interacción. Algunos de estos factores de transcripción han sido caracterizados en interacciones con microorganismos patógenos, pero poco se sabe de su comportamiento en interacciones benéficas.""In this study, we investigated the response of the model plant Arabidopsis thaliana in interaction with beneficial fungus Trichoderma atroviride. For this purpose microarrays were performed of Arabidopsis-Trichoderma interaction. From the microarrays data the HR4 gene and eight WRKY genes were selected for their transcriptional characterization. The HR4 gene is homologous to RPW8.1 and RPW8.2 genes in Arabidopsis thaliana ecotype Ms-0, which confer resistance to Powdery mildew fungi. HR4 gene was selected for transcriptional characterization in Arabidopsis seedlings interacting with the beneficial fungus Trichoderma atroviride. We observed the induction of the HR4 gene mainly at 96 hpi when the fungus interaction was established. Furthermore, we found that the HR4 gene was differentially regulated in interactions with the beneficial bacterium Pseudomonas fluorescens and the pathogenic bacterium P. syringae. When hormone treatments were applied to A. thaliana (Col-0), each hormone treatment induced changes in HR4 gene expression. On the other hand, the expression of the RPW8.1 and RPW8.2 genes of Arabidopsis ecotype Ms-0 in interaction with T. atroviride was assessed. Interestingly, these genes are interaction-responsive; in particular, the RPW8.1 gene shows a very high level of expression in the later stages of interaction. These results indicate that HR4 and RPW8 genes could play a role in the establishment of Arabidopsis interactions with beneficial microbes. In relation to transcription factors were analyzed: WRKY8, WRKY33, WRKY38, WRKY42, WRKY54, WRKY57, WRKY60 and WRKY70. Most of these genes respond by increased its transcription, as the Arabidopsis-Trichoderma interaction was development. In contrast WRKY8 strongly decreased its transcription in the interaction. Some of these transcription factors have been characterized in interactions with pathogens, but little is known about their behavior in beneficial interactions.
Efecto de la adición de pulso de ozono sobre la composición de la biopelícula durante la biofiltración de formaldehído.
Get PDFTesis (Maestría en Ciencias Ambientales)"La presente propuesta de investigación tuvo como objetivo evaluar el efecto que tiene la adición de pulsos de ozono sobre la composición de la biopelícula en la biofiltración de formaldehído (FD), además de estudiar el efecto de la alimentación de altas cargas de FD al sistema. El experimento de la biofiltración de formaldehído, constó de dos fases, la primera fue la biofiltración de FD a diferentes cargas de alimentación, la cual tardó 206 días. La segunda fase tardó 95 días y consistió en ver el efecto de la adición de pulsos de ozono (O3) al sistema. Para llevar a cabo los experimentos, se montó un biofiltro convencional empacado con soportes inertes, con un volumen del lecho filtrante de 2 L, un flujo de alimentación de 2 L/min y un tiempo de retención del lecho vacio de 60 s. Se realizó adición de medio mineral 2 veces por semana para mantener la humedad del lecho y también como fuente de nutrientes para los microorganismos. En la primera fase del experimento se aplicaron cargas de formaldehído de 19.7 1.1 a 73.7 ± 1.8 g/m3*h y de 22.7± 7.2 a 65.3 ± 2.6 g/m3*h, para las cuales de alcanzaron capacidades de eliminación (CE) promedio de de 11 ± 3.3 a 44.8 ± 28 g/m3*h y 15.6 ± 6.4 a 55.1 ± 11.5 g/m3*h, respectivamente. Los resultados obtenidos mostraron que a cargas mayores de 57 g/m3* h, los microorganismos se ven inhibidos por la presencia de subproductos ácidos de la degradación de FD, como el ácido fórmico, afectando principalmente el pH y la capacidad de eliminación (CE) en el sistema.""The objectives of this research were to study the effects of high formaldehyde loading on a biofiltration system and to evaluate the effect of ozone pulses on formaldehyde biofiltration. In the first phase of the experiment, different loads of formaldehyde were run through a biofilter over a period of 206 days. In the second phase, maintained for 95 days, ozone pulses were added to the system. In both phases, a conventional biofilter with a bed volume of 2 L, flow of 2 L/min and a bed retention time of 60 s was packed with inert materials. Mineral medium was added twice a week as a source of nutrients for the microorganisms and to keep the biofilter bed humid. In the first experimental phase, formaldehyde loads of 19.7 ± 1.1 to 73.7 ± 1.8 g/m3*h and 22.7 ± 7.2 to 65.3 ± 2.6 g/m3*h were applied to the biofilter. The results show that at greater formaldehyde loads the microorganisms’ activity was inhibited by the presence of acidic by-products, including formic acid, produced during the biodegradation of formaldehyde. These acidic by-products affected the pH and the elimination capacity (EC) of the system. During the experimental phase without ozone pulses, it was impossible for the biofilter to operate under loads of 73.7 ± 1.8 g/m3*h and 65.3 ± 2.6 g/m3*h, because the pH in the biofilter reached values lower than 4 and the microorganisms were inhibited in this conditions. In the second phase of the experiment, we evaluated the effect of ozone addition on the EC of formaldehyde and on the principal compounds of the biofilm (e.g. carbohydrates, proteins and exopolysaccharides (EPS)). The results show that ozone had a strong effect on the EPS and proteins but not on the overall activity of the microorganisms.
Immobilization of humic substances on metal-oxides(nano) particles and their impact in redox processes.
Get PDFTesis (Doctorado en Ciencias Ambientales)"Durante las dos últimas décadas se ha demostrado que el uso de sustancias húmicas (SH) y sus análogos (quinonas) pueden servir como mediadores redox (MR), acelerando la velocidad de reducción de diferentes contaminantes electrofílicos (CE) como colorantes azo, compuestos nitroaromáticos, compuestos polihalogenados y metaloides. Sin embargo, es necesario desarrollar estrategias apropiadas para lograr la inmovilización de MR a fin de erradicar el requisito de adicionarlos de manera continua en sistemas anaerobios de tratamientos de aguas residuales. En esta tesis se identifican y caracterizan SH extraídas de suelos y compostas de distintos sitios de México, a fin de seleccionar aquellas con apropiada capacidad de transferencia de electrones (CTE). Se utilizan partículas de óxidos metálicos (OM), a escala nanométrica y micrométrica, para inmovilizar las distintas SH seleccionadas a partir del proceso de caracterización. También se evalúa el impacto catalítico de las SH inmovilizadas durante la biotransformación de distintos CE, actuando como MR. Por último, se muestran los efectos toxicológicos de nanopartículas (NP) de óxidos metálicos cubiertas con SH sobre un consorcio anaerobio, considerando procesos relevantes como la metanogénesis y la reducción del humus; esto permitirá establecer las bases para la co-inmovilización de MR y microorganismos reductores del humus por medio del proceso de granulación. Los resultados mostrados en el capítulo 3 indican que existen fuentes apropiadas de SH para ser utilizadas como MR en sistemas de tratamiento de aguas residuales, de acuerdo a los valores de CTE observados en las muestras, lo cual depende de su origen. De igual forma se demostró que existen grupos funcionales presentes en las SH, distintos a los grupos quinona, que son capaces de participar en la transferencia microbiológica de electrones utilizando Geobacter sulfurreducens, lo que sólo había sido demostrado anteriormente por métodos químicos. A partir de este estudio de caracterización se seleccionaron dos muestras de SH que se utilizaron para ser inmovilizadas sobre partículas de OM a escala micrométrica (capítulo 4) y nanométrica (capítulo 6). En el capítulo 4 se estudia el impacto de SH, previamente inmovilizadas en micropartículas de alúmina, durante la deshalogenación reductiva de tetracloruro de carbono por un consorcio anaerobio.""During the last two decades, evidence has been accumulated indicating that humic substances (HS) and quinoid analogues can act as redox mediators (RM), accelerating the reduction rates of different electron accepting contaminants (EAC) such as azo dyes, nitroaromatics compounds, halogenated solvents, and metalloids. Nevertheless, it is necessary to develop suitable strategies to immobilize RM in order to eliminate the prerequisite of their continuous addition in anaerobic wastewater treatments systems. In this dissertation HS extracted from soils and composts from different parts of Mexico were identified and characterized, in order to select those effective sources, considering their electron transferring capacity (ETC). Metal-oxides (MO) particles at nano- and micrometric scale were used to immobilize those HS selected from the study of characterization. Once immobilized, the catalytic effect of HS was tested during the anaerobic biotransformation of EAC, acting as solid-phase RM. Finally, relevant processes such as methanogenesis and humus reduction were considered in order to evaluate the toxicological effects of MO nanoparticles (NP), covered with HS, on an anaerobic consortium. This study provides with essential information required for the co-immobilization of RM and humus reducing microorganisms through the granulation process. The results presented in chapter 3 indicate that suitable sources of RM can be found in natural environments to be used in wastewater treatment systems. ETC values depended of the origin of the HS sample, which ranging between 112−392 μmol g-1 by chemical method. In addition, it was demonstrated that non-quinone functional groups accounted for an important fraction of ETC of different HS samples and that the humus-reducing microorganism Geobacter sulfurreducens, is able to reduce both quinone and non-quinone redox functional groups in HS. From this characterization study, two HS samples were selected to be immobilized on MO particles at micrometric (chapter 4) and nanometric scale (chapter 6). In chapter 4, the impact of immobilized HS on alumina microparticles during the reductive dehalogenation of carbon tetrachloride by anaerobic sludge was studied. Immobilized HS preserved their catalytic properties, which was evidenced by an increase up to 10.4-fold in the rate of reduction of carbon tetrachloride compared to the control lacking HS, achieving a dehalogenation efficiency >90%.
A multivibrator circuit based on chaos generation
Get PDF"We present a parameterized method to design multivibrator circuits via piecewise-linear (PWL) chaotic systems, which can exhibit double-scroll oscillations. The circuit is conformed exploiting a parametric modulation that manipulates the equilibrium stability of each linear subsystem. Chua's oscillator is used as benchmark to illustrate the effectiveness of the proposed method to design multivibrator circuits. Thus, our proposal allows the design of the three configurations of a multivibrator: monostable, astable, and bistable. Potential applications are illustrated designing a pulse generator and a full S-R flip flop device based on our all-in-one multivibrator circuit.
Diseño y modelado matemático de una microcelda de combustible líquido
No full text"Las microceldas de combustible líquido aprovechan la naturaleza del flujo laminar para mantener separados a los reactantes, análogamente a como lo hace la membrana de intercambio protónico en una celda de combustible de hidrógeno convencional. El no uso de dicha membrana hace que las microceldas de combustible líquido sean dispositivos muy atractivos para la generación de energía limpia debido principalmente a su bajo costo y su rápida cinética electroquímica. Sin embargo, debido a su relativa recién invención, las microceldas de combustible líquido aún se encuentran en la etapa experimental. En el presente trabajo de tesis se estudia el comportamiento y operación de una microcelda de combustible líquido utilizando análisis de elemento finito. Se evalúa el rendimiento de la microcelda al modificar distintas variables del sistema como lo son: i) el ángulo entre los brazos de inyección de los fluidos, ii) la distancia entre los electrodos, iii) el área de las superficies catalíticas, iv) el área de contacto entre los reactantes, v) el desplazamiento de la interfaz líquido-líquido. Con base en el análisis de la forma en cómo afectan dichas variables en el rendimiento de la microcelda se hace una propuesta de dos nuevos y mejores diseños. Se realiza una comparativa de las capacidades de entrega de energía y aprovechamiento de combustible del diseño típico de microcelda con respecto a los nuevos diseños propuestos. Finalmente, se propone un modelo dinámico de estructura ((ARX sin retardos)) que describe la dinámica de la microcelda de combustible líquido con fines de control. Particularmente se realizó un modelado entrada-salida del sistema, considerando como salida la ((densidad de corriente promedio en el cátodo)) y el ((aprovechamiento de combustible)). Como entradas del sistema fueron consideradas la ((velocidad de entrada del combustible)) y la ((velocidad de entrada del oxígeno)).""The microfluidic fuel cells (MFC) take advantage of the nature of the laminar flow to keep two reactant flows separated, analogously as the proton exchange membrane does in the conventional hydrogen fuel cells. Since MFC do not use membrane these cells results very attractive to generate clean energy at low cost and with fast electrochemical kinetics. However, due to its relative new invention, the microfluidic fuel cells are yet in its experimental stage. In this work, behavior and operation of a microfluidic fuel cell are studied using finite element analysis. The performance of the microfluidic fuel cell is evaluated when several critical system variables are modified. Those variables are: i) the angle between the injection arms of the fluids, ii) the distance between the electrodes, iii) the catalytic surfaces areas, iv) the contact area between the reactants, v) the liquid-liquid interface displacement. After understanding how those variables affect the microfluidic fuel cell performance, two new and better designs are proposed. A comparison between the different design is performed using variables as energy delivery and fuel use. Finally, a dynamic model is proposed using an ((ARX without delays)) strategy. Particularly two input-output models are proposed, using as output the ((cathode average current density)) and the ((fuel use)) and as inputs the ((fuel inlet velocity)) and the ((oxygen inlet velocity)). This thesis is a very first attempt to describe the dynamic behavior of a MFC that can be used for control purposes.
Nonsingular parametric oscillators Darboux-related to the classical harmonic oscillator
Get PDF"Interesting nonsingular parametric oscillators which are Darboux related to the classical harmonic oscillator and have periodic dissipative/gain features are identi?ed through a modi?ed factorization method. The same method is applied to the upside-down (hyperbolic) "oscillator" for which the obtained Darboux partners show transient underdamped features.
Loci de microsatélites y análisis de paternidad en cabras Nubia y Boer
Get PDF"Los loci SRCRSP (Small Ruminant Collaborative Research Support Program) son secuencias de microsatélites polimórficos de 100-300 pares de bases de dinucleótidos repetidos que pueden ser amplificados por la reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Los alelos de un determinado locus son los productos de PCR de longitud única amplificados con iniciadores específicos. Los loci SRCRSP se han utilizado para identificar individuos, pero no para determinar la paternidad en el ganado caprino. En el presente trabajo se reporta el desarrollo de un método para evaluar la paternidad en caprinos mediante el análisis del polimorfismo de loci SRCRSP en un rebaño de 20 animales, que incluía nueve de raza Nubia y 11 Boer. Se amplificaron 36 alelos: 6 del SRCRSP-1, 5 del SRCRSP-2, 4 del SRCRSP-3, 5 del SRCRSP-4, 5 del SRCRSP-5, 6 del SRCRSP-6 y 5 del SRCRSP-9. Cuatro alelos aparecieron exclusivamente en el grupo Nubia, mientras que sólo ocho en el grupo Boer. El análisis del polimorfismo llegó a 0.995 de certeza en la exclusión correcta del segundo padre. Los loci descritos en este trabajo podrían ser utilizados para controlar la paternidad así como para identificar a los individuos en ganado caprino.""SRCRSP (Small Ruminant Collaborative Research Support Program) loci are polymorphic 100-300 base pair-long microsatellite sequences of repeated dinucleotides that can be amplified by the polymerase chain reaction (PCR). Alleles of a given locus are the PCR products of unique length amplified with a set of specific primers. SRCRSP loci have been used to identify individuals but not to assess paternity in goats. We have developed a method to assess caprine paternity by polymorphism analysis of SRCRSP loci in a herd of 20 goats from two breeds, nine Nubia and 11 Boer, respectively. Thirty six alleles were amplified: 6 SRCRSP-1; 5 SRCRSP-2; 4 SRCRSP-3; 5 SRCRSP-4; 5 SRCRSP-5; 6 SRCRSP-6 and 5 SRCRSP-9. four alleles appeared only in the Nubia group and eight only in the Boer group. Polymorphism analysis led to a 0.995 certainty for correct exclusion of the second parent. The loci described in this work could be used to control goat paternity as well as to identify individuals.