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Caracterización de los genes MTL de Candida glabrata en Saccharomyces cerevisiae
Get PDFTesis (Maestría en Ciencias en Biología Molecular)"La reproducción sexual se ha descrito como una ventaja evolutiva debido a la recombinación genética que podría favorecer una mejor adaptación. Por ello es importante el estudio de la regulación de la expresión de los genes que controlan el apareamiento, y la función de las proteínas codificadas por estos genes (Cgalfa1, Cgalfa2, Cgalfa3 y Cga1). Nuestro modelo de estudio, Candida glabrata, es una levadura patógena y asexual, que posee tres loci ortólogos (MTL1, MTL2 y MTL3) a los loci que regulan el apareamiento en la levadura sexual Saccharomyces cerevisiae. En este trabajo nos propusimos determinar si los genes codificados en los loci MTL de C. glabrata pueden complementar para la función de apareamiento, a mutantes de los genes ortólogos en S. cerevisiae. Mediante ensayos de complementación heteróloga observamos que las proteínas Cgalfa1, Cgalfa2, Cgalfa3 y Cga1 de C. glabrata no conservan la función para apareamiento de S. cerevisiae. Además, determinamos la actividad de los promotores de estos genes tanto en S. cerevisiae como en C. glabrata. Para ello construimos vectores que contienen fusiones transcripcionales de los promotores de los genes de C. glabrata con la proteína fluorescente YFP y encontramos que estos promotores se reconocen en S. cerevisiae. También determinamos que son activos en C. glabrata. Sin embargo, la actividad de estos promotores es menor en C. glabrata que en S. cerevisiae. Nuestros datos sugieren que la regulación y la función de las proteínas Cgalfa1, Cgalfa2, Cgalfa3 y a1 de C. glabarata podría ser diferente a la de S. cerevisiae.""Sexual reproduction is thought to provide evolutionary advantage due to genetic recombination, which could provide better adaptation to environmental conditions. Therefore, it is important to study the regulation of expression of the genes that control mating, as well as the function of the proteins encoded in these genes (Cgalpha1, Cgalpha2, Cgalpha3 and Cga1). Our model organism, Candida glabrata, is an asexual fungal pathogen that contains three orthologous loci to the loci that control mating in the sexual yeast Saccharomyces cerevisiae (MTL1, MTL2 and MTL3). In this work we wanted to determine whether the genes encoded in the C. glabrata MTL loci complement the mating function in S. cerevisiae. We performed heterologous complementation assays and we found that the Cgalpha1, Cgalpha2 Cgalpha3 and Cga1 genes, are unable to complement, the mating function in mating-deficient S. cerevisiae strains. We also determine the promoter activity of these genes both in S. cerevisiae and in C. glabrata. To this end we made replicative vectors containing transcriptional fusions of each promoter with the yellow fluorescent protein YFP and found that the C. glabrata promoters are recognized in S. cerevisiae and they are also functional in C. glabrata, although the activity is higher in S. cerevisiae. Our data suggests that the regulation and the function of Cgalpha1, Cgalpha2, Cgalpha3 and Cga1 proteins are different from the role they have in mating in S. cerevisiae.
Perceptual security of encrypted images based on wavelet scaling analysis
Get PDF"The scaling behavior of the pixel fluctuations of encrypted images is evaluated by using the detrended fluctuation analysis based on wavelets, a modern technique that has been successfully used recently for a wide range of natural phenomena and technological processes. As encryption algorithms, we use the Advanced Encryption System (AES) in RBT mode and two versions of a cryptosystem based on cellular automata, with the encryption process applied both fully and partially by selecting different bitplanes. In all cases, the results show that the encrypted images in which no understandable information can be visually appreciated and whose pixels look totally random present a persistent scaling behavior with the scaling exponent close to 0.5, implying no correlation between pixels when the DFA with wavelets is applied. This suggests that the scaling exponents of the encrypted images can be used as a perceptual security criterion in the sense that when their values are close to 0.5 (the white noise value) the encrypted images are more secure also from the perceptual point of view.
Estabilidad de familias de sistemas lineales de ecuaciones diferenciales
Get PDF"Para estudiar la estabilidad asintótica de familias de sistemas lineales de ecuaciones diferenciales lineales, x = Ax, con A 2 F, podemos analizar la localizacióon de las raíces del polinomio característico, p(t), asociado a la matriz A. En este capítulo se presentan diversos resultados para distintos tipos de familias.
Evaluación de la capacidad de adsorción de fluoruro en compositos a base de quitosano-zeolita-alga marina
Get PDF"The objective of this study was to evaluate the adsorption capacity of fluoride in batch system at different pH on synthesized composites based in chitosan and low cost materials such as zeolite and seaweed. Both composites were compared: chitosan-zeolite and seaweed). The data of adsorption isotherms were a better fit to the Freundlich model. The adsorption capacity of these materials and composite is affected by the pH of the solution. At pH 5 the ch-z composite had 1.2 time higher fluoride adsorption than composite ch-a, which showed a higher capacity for fluoride removal to a pH 7. The characterization of these materials was performed with the infrared spectroscopy techniques with Transported Fourier (FTIR), thermal gravimetric analysis (TGA) and point of zero charge (PZC) to elucidate the possible fluoride adsorption mechanism. Finally according to our results both composites can be considered as efficient adsorbents for fluoride removal from water.""El objetivo de este trabajo fue evaluar la capacidad de adsorción de fluoruros en lotes a diferente pH sobre compositos sintetizados a base quitasol y materiales de bajo costo como la zeolita y las algas marina, Se compraron ambos compositor: quitasanos zeolitas (q-z), quitosano-alga marina (q-a). También se realizaron experimentos de absorción tuvieron un mejor ajuste al modelo de Freundlich. La capacidad de adsorción de todos los materiales y compositos se ve afectada por el pH de la solución. Se observó que el pH óptimo para el proceso de adsorción de fluoruro en el caso del composito q-z es a un pH de 5, ya que remueve 1.2 veces más fluoruro que el composito q-a, el cual mostro una mayor capacidad de remoción a un pH 7. La caracterización de estos materiales se realizó con las técnicas de espectroscopia Infrarroja con Transportada de Fourier (FTIR), análisis termogravimétrico (TGA) y punto de carga cero (PCC) con el fin de elucidar el posible mecanismo de adsorción de fluoruro. Finalmente de acuerdo con nuestros resultados ambos compositos pueden ser considerados como eficientes adsorbentes para la eliminación de fluoruro del agua.
Alelopatía diferencial entre los géneros de un árbol invasor dioico sobre plantas de desierto
Get PDF"The Peruvian peppertree (Schinus molle) is a dioecious species from South America that was introduced into central Mexico five centuries ago. This tree has invaded abandoned agricultural fields from semiarid regions, where it can be found with several native succulent plants that have recolonized these areas. Although peppertrees have negative allelopathic effects on crops, their effects on these native plants remain unknown. Indeed, the allelopathy of peppertrees has only been tested for female individuals, while the allelopathic potential of male peppertrees has not been assessed yet. This study focused on these issues and assessed whether peppertrees affect germination of succulent plants from the Chihuahuan Desert and whether these effects differ between male and female trees. For this we conducted a series of germination bioassays where seeds of native species were watered with aqueous extracts of staminate flowers and leaves produced by male peppertrees, and with aqueous extracts of fruits and leaves produced by female peppertrees. Additionally, we conducted experiments where seeds of native species were sowed on soils collected beneath the canopy of both tree genders. The results of all these experiments indicated that both peppertree genders can reduce germination of native species, but also suggested that male peppertrees would have stronger allelopathic effects than female peppertrees. To our best knowledge, this is the first study reporting allelopathic effects of peppertrees on native plants from Mexico, but this is also the first study indicating differential gender effects for invasive dioecious species with allelopathic potential.""El pirul (Schinus molle) es una especie dioica de Sudamérica que fue introducida en México hace cinco siglos atrás. Este árbol ha invadido campos agrícolas abandonados de regiones semiáridas, donde puede ser encontrado con varias especies de plantas suculentas nativas que han recolonizado estas áreas. Aunque los pirules tienen efectos alelopáticos negativos sobre los cultivos, sus efectos sobre estas plantas nativas siguen siendo desconocidos. De hecho, la alelopatía de los pirules sólo se ha probado para individuos femeninos, mientras que el potencial alelopático de los pirules masculinos aún no se ha evaluado. Este estudio se enfocó en estos temas y evaluó si los pirules inhiben la germinación de plantas suculentas del desierto Chihuahuense y si estos efectos diferen entre árboles masculinos y femeninos. Para ello se realizó una serie de bioensayos de germinación donde semillas de las especies nativas fueron regadas con extractos acuosos obtenidos de fores estaminadas y hojas producidas por pirules masculinos, y con extractos acuosos de frutos y hojas producidas por pirules femeninos. Adicionalmente, realizamos experimentos donde semillas de las especies nativas fueron sembraron en suelos recogidos bajo el dosel de ambos géneros de pirul. Los resultados de todos estos experimentos indicaron que ambos géneros del pirul pueden reducir la germinación de especies nativas, pero también sugirieron que los pirules masculinos tendrpian efectos alelopáticos más fuertes sobre las especies nativas que los pirules femeninos. Hasta donde estamos enterados, este es el primer estudio que reporta efectos alelopáticos de los pirules sobre plantas nativas de México, pero esto también es el primer estudio que indica los efectos de diferenciales del género para especies invasoras dioicas con potencial alelopático.
Robust stability of integral delay systems with exponential kernels
Get PDF"In this chapter the stability analysis via Lyapunov-Krasovskii method is extended to perturbed integral delay systems with exponential kernels. Several sufficient robust stability conditions given in the form of linear matrix inequalities are derived.
Síntesis y caracterización de nanopartículas de oro funcionalizadas con seroalbúmina bovina para aplicaciones biomédicas
Get PDF"Como la hipertermia empleada para eliminar tumores es ineficaz y afecta a las
células cancerosas y normales, la técnica basada en el efecto plasmónico de las
nanopartículas de oro anisotrópicas (MBAuNPs, Multi-branched Gold
Nanoparticles) está siendo explorada para mejorar la ablación térmica de tumores.
Aquí nos propusimos sintetizar MBAuNPs potencialmente útiles para la ablación
térmica de tumores (anisotrópicas, con diámetro ? 100 nm y absorción máxima de
luz cercana al infrarrojo medio), funcionalizarlas con seroalbúmina bovina (BSA)
para dirigirlas a las células endoteliales y determinar la hipertermia inducida por
irradiación de las MBAuNPs con un láser a 808 nm en suspensiones acuosas y
geles que simulan la piel. Sintetizamos MBAuNPs a partir de semillas áuricas en
mezclas con variaciones en el contenido de semillas, HEPES e hidroxilamina. Sus
propiedades ópticas se determinaron mediante el espectro ultravioleta-visible (UVVIS)
durante y después de la síntesis, la forma y tamaño por microscopía
electrónica de barrido y la concentración por espectroscopía UV-VIS y
espectroscopía de masas con plasma acoplado inductivamente (ICP-MS). Las
semillas áuricas fueron esféricas con un diámetro medio de 18 nm y absorción
máxima a 520 nm. Las 27 mezclas de síntesis generaron MBAuNPs con una
concentración media de 6.9 × 109/mL, diámetros entre 95 y 160 nm y absorbancia
máxima entre 640 y 873 nm. Para la funcionalización seleccionamos MBAuNPs
con un diámetro medio de 97.5 nm y absorción máxima a 820 nm. El espectro UVVIS
de las MBAuNPs-BSA tuvo un pico a 280 nm (idéntico al de BSA pura) y otro
desplazado de 820 a 865-890 nm en función de la concentración de BSA.
Concluimos que las MBAuNPs seleccionadas parecen adecuadas para la ablación
térmica de tumores pues la irradiación con el láser a 808 nm produce hipertermia
de 3.7-5.2 °C en los geles phantom, proporcional a la concentración de MBAuNPs
y la potencia de irradiación.""Since hyperthermia to remove tumors is ineffective and affects cancer and normal
cells, the plasmonic effect of anisotropic gold nanoparticles (MBAuNPs, Multibranched
Gold Nanoparticles) is being explored for thermal ablation of tumors. Our
aim was to synthesize MBAuNPs for thermal ablation of tumors of diameter ? 100
nm, maximum light absorption near the mid-infrared region, functionalized with
bovine serum albumin (BSA) to target them to endothelial cells, and to determine
the hyperthermia induced with a 808 nm laser in aqueous suspensions and gels
simulating the skin. MBAuNPs were synthesized in mixtures with variable auric
seed content, HEPES, and hydroxylamine. Their ultraviolet-visible (UV-VIS)
spectrum was determined during and after synthesis, their shape and size by
scanning electron microscopy, and their concentration by UV-VIS spectroscopy
and inductively-coupled plasma mass-spectroscopy. Auric seeds were spherical,
18 nm in diameter, with maximum absorption at 520 nm; all synthesis mixtures
generated MBAuNPs with average concentration of 6.9 × 109 / mL, diameters
between 95 and 160 nm, and maximum absorbance between 640 and 873 nm. For
functionalization, MBAuNPs of 97.5 nm diameter and maximum absorption at 820
nm were selected. The UV-VIS spectrum of MBAuNPs-BSA had a peak at 280 nm
(as pure BSA) and the 820 nm one displaced to 865-890 nm as a function of BSA
concentration. The selected MBAuNPs appear to be appropriate for thermal
ablation of tumors, since irradiation with the 808 nm laser produces hyperthermia
of 3.7-5.2 °C in gels, proportional to MBAuNPs concentration and irradiation power.
Generalización paramétrica de la espiral de cornu en difracción óptica
Get PDF"El objetivo general de este estudio fué realizar una revisión matemática detallada de
las formulaciones básicas del fenómeno de difracción óptica.
Es por ello que en el Capítulo 1 se presenta una descripción de diferentes sucesos en
el estudio del fenómeno de difración óptica. Además de dar una breve descripción de
como se relaciona el fenómeno de difracción en diferentes áreas de aplicación como en
las rejillas de difracción y medicina.
En el Capítulo 2 se proporcionan las bases de la teoría de la difracción escalar en
la que se presenta la fórmula integral de Fresnel-Kirchhoff que es la se utiliza para la
realización del análisis matemático de las diferentes rendijas y aberturas resentadas,
tanto para el régimen de difracción de campo lejano como el régimen de difracción de
campo cercano.
En el Capítulo 3 se analiza las bases de la difracción para el régimen de campo le-
jano o difracción de Fraunhofer para una sola rendija, la abertura rectangular, la doble
rendija y para múltiples rendijas.
Posteriormente en el Capítulo 4, se analiza el régimen de difracción de campo cer-
cano para el caso de una rendija rectangular en el que se introduce una forma general
del número de Fresnel en los límites de integración de las integrales de Fresnel que
son soluciones de estas aberturas. Realizando un análisis sistemático mediante gráficos
de irradiancia para diferentes números de Fresnel y variando el tamaño de las aberturas.
En el Capítulo 5, se obtiene una solución general de la ecuación diferencial lineal
ordinaria de tercer orden que satisfacen las integrales de Fresnel como soluciones par-
tículares, más una función error suplementaria que está afectada por un parámetro de
deformación. Donde además se estudia el comportamiento de las espirales de Cornu
debido al parámetro de deformación introducido por la solución general obtenida an-
teriormente.
Finalmente en el Capítulo 6 se presentan las conclusiones y aportaciones obtenidas
en esta investigación.
Candida glabrata encodes a longer variant of the mating type (MAT) alpha2 gene in the mating type-like MTL3 locus, which can form homodimers
Get PDF"The fungal pathogen Candida glabrata is a haploid asexual yeast. Candida glabrata contains orthologs of the genes that control mating and cell-type identity in other fungi, which encode putative transcription factors localized in the MAT locus in Saccharomyces cerevisiae or MTL in other fungi. Candida glabrata contains three copies of the CgMTL locus but only CgMTL1 correctly expresses the information encoded in it. CgMTL1 can encode the Cga1 gene (a information), or the Cgalpha1 and Cgalpha2 genes (alpha information). CgMTL2 contains an identical copy of the Cga1 gene. CgMTL3 contains an identical copy of the Cgalpha1 gene but a longer variant of the Cgalpha2 gene that we termed Cgalpha3. In S. cerevisiae diploid cells, that express Sca and Scalpha information, Sca1 and Scalpha2 proteins form a heterodimer, which represses genes expressed only in haploid cells and some genes involved in stress response. We constructed C. glabrata strains that simultaneously express Cga1 and Cgalpha2 or Cga1 and Cgalpha3 genes. We did not find any phenotype in these strains when grown under a large variety of stress and nutritional conditions. However, we detected an interaction between Cga1 and Cgalpha2 but not between Cga1 and Cgalpha3 by Bimolecular Fluorescence Complementation and co-immunoprecipitation assays.
Structures and electronic properties of TinV (n = 1–16) clusters: first-principles calculations
Get PDF"Structures and electronic properties of TinV (n = 1–16) clusters have been investigated using density functional theory with the generalized gradient approximatio. The calculations have shown that the TinV clusters favor compact spherical structures having similar conformations to the pure Tin clusters. The results show that the vanadium atom remains on the surface when n ? 8 and n = 16, while for n = 9–15, it occupies the endohedral position. The Ti6V, Ti12V, and Ti14V clusters are found to be more stable than their neighbors, consistent with pure Tin clusters that have the same size. Additionally Ti4V has been found to be also magic, consistent with recent reports of B- and Al-doped Ti clusters. Small TinV (n ? 4) clusters exhibit a transition from metallic-like to semimetallic electronic structure, while for n = 5 onward, no significant changes are observed compared with pure Tin clusters.