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    New advances in magnetic nanostructures

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    "Some of the new developments on magnetic nanostructures are reviewed. The advances on the synthesis, characterization, and understanding of magnetic nanoclusters, magnetic nanowires and single molecule magnets are discussed. Particular emphasis is made on the magnetic properties of: a) magnetic iron nanowires encapsulated in carbon nanotubes, and b) manganese nanostructures which show a very rich and complex behavior. Both systems are good candidates for technological applications.""Se discuten algunos de los avances recientes en materiales magnéticos nanoestructurados. Se analizan los avances recientes en la síntesis, caracterización, y entendimiento de las propiedades magnéticas de agregados atómicos, nanoalambres y magnetos de una sola molécula. En particular se hace énfasis en las propiedades magnéticas de: a) nanoalambres magnéticos de hierro encapsulados en nanotubos de carbón y b) en nanoestructuras de manganeso, las cuales muestran una gran riqueza de comportamiento magnético. Ambos sistemas tienen buenas posibilidades de aplicaciones tecnológicas.

    Regionalization and classification of bioclimatic zones in the central-northeastern region of México using principal component analysis (PCA)

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    "Utilizando un análisis de componentes principales, determinamos zonas climáticas en un gradiente topográfico en la zona centro-noreste de México. Se emplearon datos de precipitación y temperatura medias mensuales por un período de 30 años de 173 estaciones meteorológicas. La clasificación del clima fue llevada a cabo de acuerdo con el sistema de Köppen modificado para las condiciones de México. El análisis de componentes principales indicó una regionalización que concuerda con características de topografía y vegetación. Se describen zonas bioclimáticas, asociadas a vegetación típica para cada clima, usando sistemas de información geográfica (SIG).""Applying principal component analysis (PCA), we determined climate zones in a topographic gradient in the central-northeastern part of México. We employed nearly 30 years of monthly temperature and precipitation data at 173 meteorological stations. The climate classification was carried out applying the Köppen system modified for the conditions of México. PCA indicates a regionalization in agreement with topographic characteristics and vegetation. We describe the different bioclimatic zones, associated with typical vegetation, for each climate using geographical information systems (GIS).

    Delimitación de secuencias involucradas en el silenciamiento y trasactivación de los genes tardios del Virus Huasteco del Chile (PHV).

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    Tesis (Maestría en Ciencias en Biología Molecular)"El virus huasteco del chile (PHV) es un miembro de la familia Geminiviridae, la cual comprende virus de plantas con un genoma de ADN circular de cadena sencilla y una cápside con apariencia geminada. Varias líneas de evidencia indican que los geminivirus siguen programas de regulación temporal en la expresión de sus genes, al igual que la mayoría de los virus conocidos. Estudios previos han permitido identificar algunos elementos cis-reguladores que controlan la transcripción de los llamados “genes tardíos”. Uno de ellos es el llamado “elemento tardío conservado” (CLE) que funciona, aparentemente, como un blanco funcional de la proteína viral TrAP, involucrada en la transactivación de los genes CP (proteína de la cápside) y BV1, y otro elemento relevante es un silenciador que funciona de manera atípica, con actividad restringida al promotor CP. La presente investigación está orientada a analizar las secuencias reguladoras del promotor CP de PHV, especialmente el silenciador localizado en una región codificante del virus, así como a la caracterización funcional de algunos elementos conservados en los promotores CP de begomovirus. Para esto se construyeron casetes de expresión compuestos por el gen reportero GUS bajo el control de diversos promotores híbridos de origen viral, los cuales fueron integrados en dos clases de vectores: unos apropiados para ensayos de expresión transitoria en células vegetales, construídos previamente por Gómez-Castañón (2004), y otros para la transferencia del casete de expresión al genoma de las plantas mediante Agrobacterium tumefaciens, generados en este trabajo. A fin de delimitar el elemento silenciador del gen CP, fragmentos progresivamente menores de la región genómica de PHV donde dicha actividad ha sido mapeada se colocaron corriente arriba de un promotor CP truncado (-697 a +24), que es activo en tejido vascular. De este modo fueron creados seis vectores binarios que fueron transformados a Agrobacterium tumefaciens y serán utilizados para generar plantas transgénicas de tabaco. Se construyó además un vector binario en el que el silenciador del virus del mosaico dorado del tomate (TGMV), se fusionó al promotor CP de PHV, para determinar si ese silenciador viral tiene un efecto funcional sobre un promotor heterólogo.""Pepper Huasteco Virus (PHV) is a member of the Geminiviridae family, which groups plant viruses with circular ssDNA genomes and a geminate capsid morphology. Several lines of evidence indicate that geminiviruses follow temporal regulation programs of gene expression, like most of known viruses. Previous studies have allowed to identify some cis-regulatory elements involved in transcription control of “late genes”. One of them is the “Conserved Late Element” (CLE), which apparently works as a functional target of TrAP, a virus-encoded protein involved in transactivation of both CP (encoding the capsid protein) and BV1 genes. The other one is a transcriptional silencer which activity is restricted to the CP promoter in vascular tissues. The aim of this work is to analyze regulatory sequences of the PHV CP promoter, especially the silencer element located in a virus coding region, as well as functional characterization of some conserved elements in CP promoters of begomoviruses. For this purpose, we constructed a series of expression cassettes made up of the GUS reporter gene under the control of diverse hybrid promoters of viral origin, which were integrated into two kind of vectors: ones appropriate for transitory expression assays in vegetal cells, previously constructed by Gómez-Castañón (2004), and others for transfer of expression cassettes to the plant genome by an Agrobacterium tumefaciens-based system, which were generated in this work. In order to delimit the silencer element of the CP gene, progressively smaller fragments of a PHV genomic region where the silencer activity was previously mapped were placed upstream of a truncated CP promoter (-697 to +24), that is active in vascular tissues. In this way six binary vectors were created, whcih were transformed into Agrobacterium tumefaciens, and will be further employed to generate tobacco transgenic plants. In addition, a binary vector was constructed in which the silencer of Tomato golden mosaic virus (TGMV), was fused to the CP promoter of PHV, to determine if this silencer element has a functional effect on a heterologous viral promoter. Finally, expression vectors for both transitory assays and stable expression systems were generated; these vectors contained synthetic promoters with either CLE multimers or different combinations of evolutionarily conserved elements of begomovirus CP promoters, denominated “Conserved Modular Arrangements” (CMAs).

    Análisis proteómico de Bifidobacterium longum en presencia de fructanos de Agave tequilana como fuente de carbono.

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    Tesis (Maestría en Ciencias en Biología Molecular)"Bifodobacterium longum es una de las especies bacterianas nativas de la flora intestinal, conocida como probióticas; es decir bacterias que proporcionan beneficios a la salud del huésped como los fructanos que se encuentran en plantas y son conocidos como preóbioticos. El reciente interés de la industria tequilera de darle nuevos usos a los fructanos de Agave despierta el interés de evaluar sus propiedades preóbiticas. En el presente trabajo hemos evaluado la capacidad de Bifidobacterium longum para utilizar fructanos de Agave tequilana como fuente de de carbono. El crecimiento de B. longum usando glucosa es similar al de fructanos como fuentes de carbono; por otra parte, en el estudio de microscopia de fuerza atómica se observó que las dimensiones de bifidobacterium son mayores cuando se crece con el prebiótico, reflejando una adaptación del microorganismo a la fuente de carbono. Los cambios de expresión de proteínas de bifidobacterium al crecer en medio con fructanos fueron analizados por 2D-PAGE. Las proteínas diferenciales fueron caracterizadas por MALDI-TOF y del análisis bioinformático de los datos de masas, se encontraron cambios en proteínas transportadoras de carbohidratos del tipo ABC y varias enzimas del catabolismo de carbohidratos como la vía de las pentosas, glucólisis y la vía de la F6PPK. La información generada nos da la pauta a realizar una búsqueda más exhaustiva de elementos involucrados en el catabolismo de fructanos en bacterias probióticas, y la relación con sus cualidades prebióticas. Hemos demostrado que Bifidobacterium longum es capaz de utilizar inulina de Agave tequilana como fuente de carbono y de ahí la capacidad de este carbohidrato para la formulación de novedosos probióticos por la industria alimentaría.""Bifodobacterium longum is one of the bacterial species found in gastrointestinal tract that it has probiotic properties, that is to say, provides benefits to the health of the host. In the intestine they preferentially consume nondigerible sugar by the host like the fructanos that are found in plants and are known like prebiotics. The recent interest of the tequila industry to give new uses to agave fructanos, wakes up the interest to evaluate its prebiotics properties. In this work we have evaluated the capacity of Bifidobacterium longum to use fructans from Agave tequilana like carbon source. The growth of Bifidobacterium longum using glucose is similar to the fructanos like carbon sources; on the other hand, in the study of microscopy atomic force it was observed that the dimensions of bifidobacterium are greater when it use the prebiotic, reflecting the adaptation of the microorganism to the carbon source. The changes of protein expression of bifidobacterium when growing in medium with fructanos were analyzed by 2D-PAGE. The proteins diferentials were characterized by MALDI-TOF and with the bioinformatic analysis of the data, we found changes proteins ABC type carbohydrate transporters and several enzymes of the carbohydrate catabolism like the pentose pathway, glycolysis and the F6PPK pathway. Based on information generated in this work, it becomes necessary a more exhaustive search of elements involved on fructans catabolism in probiotic bacteria, and the relationship with its prebiotic qualities. We have demonstrated that Bifidobacterium longum is able to use Agave tequilana´s fructans like carbon source and there the capacity of this carbohydrate for the formulation of novel probiotics foods by industry.

    FRW barotropic zero modes: dynamical systems observability

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    "The dynamical systems observability properties of barotropic bosonic and fermionic FRW cosmological oscillators are investigated. Nonlinear techniques for dynamical analysis have been recently developed in many engineering areas but their application has not been extended beyond their standard field. This paper is a small contribution to an extension of this type of dynamical systems analysis to FRW barotropic cosmolo-gies. We find that determining the Hubble parameter of barotropic FRW universes does not allow the observability, i.e., the determination of neither the barotropic FRW zero mode nor of its derivative as dy-namical cosmological states. Only knowing the latter ones correspond to a rigorous dynamical observability in barotropic cosmology.

    A new theory on tidal currents rotation

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    "Applying the linearized equations of motion, projection on the complex plane and a representation of the velocity vector and the forcing sea surface elevation gradient in function of the eigenvectors of the homogeneous system, we developed a theory that explains essential properties of tidal currents. We found the existence of a fundamental vector which we call sense of rotation s. The ellipticity, until now defined as a scalar quantity, results from the theory as a vector ɛ, normalized from s. ɛ is a measure of the eccentricity and sense of rotation of tidal ellipses and has some properties that are similar to those of the angular velocity. We derived an expression for the major and minor semi-axis in function of physical properties and characteristics of amphidromic systems. These and other results of the theory allow the analysis of important aspects of tidal currents.

    Análisis del metabolismo de poliaminas de maíz bajo condiciones de estrés biótico y abiótico

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    Tesis (Doctorado en Ciencias en Biología Molecular)"La salinidad, junto con la sequía y las bajas temperaturas, constituyen los factores ambientales más adversos que afectan dramáticamente el desarrollo de las plantas. Además, el ataque por patógenos e insectos constituye un factor más en la pérdida de los cultivos. Las poliaminas, putrescina, espermidina y espermina (Put, Spd y Spm), son policationes alifáticos de bajo peso molecular involucrados en múltiples procesos fisiológicos y de desarrollo en plantas, y también en respuesta a factores de estrés biótico y abiótico. En el presente trabajo, se analizaron cambios en el metabolismo de las poliaminas de maíz bajo dos condiciones de estrés, uno abiótico que comprende el efecto del NaCl y el otro biótico, que incluye la interacción del maíz con el hongo biotrófico Ustilago maydis. Pocos genes involucrados en la biosíntesis de poliaminas de maíz han sido aislados y caracterizados. En este sentido, se aisló la secuencia completa del ADNc y la secuencia genómica equivalente al marco de lectura abierto de la espermidina sintasa 2 (Zmspds2) de maíz. Este gen participa en la biosíntesis de Spd a partir de Put. De manera interesante, la organización genómica del gen de la Zmspds2 es altamente homologa a otros genes que codifican para aminopropil transferasas de plantas (espermidina o espermina sintasas), manteniendo conservados el tamaño y la secuencia de la mayoría de los exones. Respecto a los intrones, se observó que también mantienen una similitud elevada, y conservan los bordes típicos entre las secuencias exon/intron de plantas. A nivel transcripcional, se analizó la expresión del gen Zmspds2 junto con la de otros genes involucrados en la biosíntesis de poliaminas (adc, odc y samdc) en diferentes órganos de la planta de maíz, encontrándose una expresión mayoritaria de estos transcritos en hojas. En el caso del estrés salino, se observó una regulación positiva de los genes Zmspds2, Zmspds1 y samdc. Sugerimos, que principalmente, el gen que codifica para la ZmSPDS2 podría jugar un papel muy importante en la respuesta del maíz a este tipo de estrés, ya que su expresión. aumenta con la subsecuente acumulación y/o mantenimiento de los niveles intracelulares de espermina. Además, se aisló una variante de procesamiento alternativo (“splicing”) del transcrito del Zmspds2 (Zmspds2B), la cual se expresa únicamente en presencia de cloruro de sodio. Se encontró que el gen de la Zmspds2 se induce en respuesta a ácido abscísico (ABA), choque osmótico y altas temperaturas lo que sugiere la presencia de elementos de respuesta como ABRE, DRE/CRT, HSE en el promotor de este gen. Estas evidencias sugieren una conexión importante entre el estrés salino, el ácido abscísico y las poliaminas. En el caso del estrés biótico, se analizó el metabolismo de las poliaminas de maíz durante la interacción con Ustilago maydis, incluyendo etapas de la infección como clorosis y la formación de tumores. Esta interacción dió lugar a un aumento en la expresión de los genes adc, samdc1, samdc2 y samdc3 en los tejidos infectados. Además, un aumento notorio en la actividad ADC en los tejidos infectados, se asoció a la acumulación de Put libre y conjugada en estos sitios. La formación de conjugados podría estar asociada directamente con la infección. Estos conjugados participarían en la generación de agentes anti-fúngicos y también en la reducción de la concentración poliaminas libres que podrían estar involucradas en el desarrollo del tumor. Por otro lado, el catabolismo de poliaminas (espermidina y espermina) mediado por la enzima PAO, fue estimulado durante la interacción, sugiriendo un papel importante de este proceso en la lignificación y la formación de la pared durante el desarrollo del tumor. Este trabajo, constituye el primer reporte de regulación transcripcional de la espermidina sintasa en respuesta a estrés salino en plantas y la presencia de una variante de splicing asociada a este proceso. Por otro lado, la evidente acumulación de putrescina libre y conjugada durante el desarrollo de tumores inducidos por Ustilago maydis en maíz, sugiere un papel sumamente importante para la putrescina en estrés biótico.""Soil salinity, in conjunction with drought, high and low temperatures, constitute the major abiotic stresses affecting plant growth and development. In addition, pathogen and insect attack contribute to another percentage of losses in crop productivity. Polyamines, putrescine, spermidine and spermine (Put, Spd and Spm), are low molecular weight aliphatic polycations involved in multiple physiological and developmental processes in plants, and also in response to biotic and abiotic stress conditions. In the present work, we analysed changes in maize polyamine metabolism under two different stress conditions. On one side, we analyzed the effect of salinity (abiotic stress) and on the other side, the interaction of the maize plant with the biotrophic fungus Ustilago maydis. Up to now few sequences coding maize polyamine biosynthetic genes have been isolated and characterized. In these sense, we isolated the full length cDNA sequence and also the genomic sequence equivalent to the open reading frame of the maize spermidine synthase 2 (Zmspds2) gene. This gene participates in Spd biosynthesis from Put. Interestingly, the genomic organization of this gene is highly homologous to other genes encoding plant aminopropyl transferases (spermidine and spermine synthases), conserving size and sequence similarity of most of the exons. In addition, introns also present a considerable sequence homology, including conservation of plant exon/intron boundaries. At the transcriptional level, we analysed the expression of the Zmspds2 gene and that of other genes involved in polyamine biosynthesis (adc, odc and samdc), in different maize organs, finding a predominant expression in leaves. In the case of salt stress, we observed an up-regulation of the Zmspds2, Zmspds1 and samdc genes. Our results suggest an important role of the Zmspds2 gene in the response of maize plants to salt stress, in which transcript accumulation might be related to spermine accumulation and/or maintenance of the intracellular levels of this polyamine under stress. In addition, a splicing variant of the Zmspds2 gene (Zmspds2B) was identified to be induced only in response to NaCl. We observed that the Zmspds2 gene is responsive to abscisic acid (ABA), osmotic stress and heat shock suggesting the presence of cis acting elements such as ABRE, DRE/CTR and HSE in the promoter region of this gene.

    Análisis de estabilidad de la implementación de leyes de control que asignan un espectro finito a sistemas con retardos.

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    Tesis (Maestría en Control y Sistemas Dinámicos)"El problema de control de sistemas con retardos es una tarea no trivial debido a la naturaleza infinito-dimensional de los sistemas. Uno de los resultados más importantes para este problema, es la estrategia de control conocida como Asignación de Espectro Finito; que asigna al sistema en lazo cerrado un espectro finito el cual puede ser arbitrariamente ubicado bajo ciertas condiciones de controlabilidad. Dicha estrategia de control involucra términos integrales sobre valores pasados del control y necesita ser aproximada numéricamente en una implementación práctica. Resultados recientes muestran que la implementación numérica de la ley de control demanda la estabilidad de la dinámica interna del controlador, la cual está descrita por una clase especial de ecuaciones integrales con retardo. En este trabajo de tesis se estudia la estabilidad de dichas ecuaciones integrales. Se obtienen condiciones suficientes de estabilidad dependientes del retardo para las ecuaciones integrales. Dicho resultado determina una clase de sistemas con retardo en el control para los cuales se tiene una implementación segura de la ley de control que asigna un espectro finito en lazo cerrado mediante métodos numéricos de aproximación por cuadratura.""The control problem of time-delay systems is a not trivial task due to the infinitedimensional nature of the addressed systems. One of the most important results on this problem is the control strategy known as Finite Spectrum Assigment (FSA) that assigns a finite spectrum to the closed-loop system, which under some controlabillity conditions can be arbitrarily located. This control strategy involves integral terms over the past values of the control which need to be numerically approximated in a practical implementation. Recent results show that the numerical implementation of the control law dependends the stability of the internal dynamics. In this work the stability of such integral equations is addressed. We provide delay-dependent stability conditions for the integral delay equation. The results determines a class of systems with delays in the control input for which a safe implementation of the control law that assigns a finite spectrum to the closed-loop system is guaranteed by using only standard numerical methods.

    Respuestas funcionales a dos niveles de humedad de gramíneas nativas y exóticas en pastizales semiáridos del Desierto Chuhuahuense.

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    Tesis (Maestría en Ciencias Ambientales)"La invasión de especies es un fenómeno en el cual una especie se introduce deliberada o accidentalmente a un nuevo hábitat, en donde logra establecerse y producir individuos fértiles, desplazando a las especies nativas y alterando el hábitat para asegurar su persistencia. Es un fenómeno de dimensiones globales con graves repercusiones en los ecosistemas. Recientemente, los pastizales semiáridos del centro de México en donde B, gracilis es la especie dominante se han visto afectados por la invasión de gramíneas africanas. El éxito de las especies invasoras depende, de sus características funcionales de las especies tales como; el crecimiento, la asignación de biomasa, fisiología y en como estas influencian su medio. Por lo anterior, el objetivo de este trabajo fue: Bajo dos condiciones de humedad, examinar rasgos funcionales (crecimiento, asignación de biomasa, morfología, fisiología y captura de nutrientes) de plántulas de un especie nativa (B. gracilis) con las de una especie exótica exitosa (E. lehmanniana) y un exótica poco exitosa (M. repens). El experimento fue realizado bajo condiciones de invernadero. Los resultados mostraron que E. lehmanniana presenta características de mayor capacidad de crecimiento que incluyeron, una alta producción de biomasa, longitud radical y área foliar en comparación con las otras dos especies, las cuales por su parte fueron bastante similares entre sí. En cuanto a la distribución de biomasa, E. lehmanniana la asigna principalmente a sus hojas, además de presentar un potencial hídrico en las hojas menos negativo en comparación con las otras dos especies. Las características exhibidas por E. lehmanniana sugieren que posee ventajas en el estado de plántula en cuanto al tamaño y la adquisición de recursos (luz, nutrientes) aún bajo condiciones de sequía. Mientras que M. repens, es una especie que presenta características muy similares a la especie nativa lo cual sugiere que existe traslapo en la adquisición de recursos. Este trabajo sirve como una base para identificar características funcionales clave en el éxito actual de la invasión de especies en zonas áridas y permite además, identificar características potenciales de invasión por especies no exitosas en futuros escenarios del cambio ambiental global.""The invasion of species refers to a phenomenon where one species is introduced deliberately or accidentally in a new habitat where it establishes and produces fertile individuals, replaces native species and alters the habitat to guarantee its persistence. This phenomenon is of global dimension with important repercussions on global ecosystems. Recently, the semiarid grasslands in Central Mexico, where Bouteloua gracilis is the dominant species have been affected by the invasion of African grasses. The success of an invasive species depends on its functional characteristics such as growth, biomass allocation, physiology and its influence on soil resource availability. The objective of this study was:, to compare functional characteristics of seedlings (growth, biomass allocation, morphology, physiology and uptake of nutrients) among a native (B. gracilis) and a successful exotic species (Eragrostis lehmanniana) and a less successful exotic species (Melinis repens) under two conditions of humidity. The experiment was conducted under greenhouse conditions. The main results showed that E. lehmanniana displays characteristics suggesting a greater capacity of growth including greater biomass, root length and leaf area in comparison to the other two species, which were relatively similar in their responses. Eragrostis lehmanniana allocated most of the biomass to the leaves and presented the lowest leaf water potential in comparison with the other two species. The characteristics exhibited by E. lehmanniana suggest clear advantages at the seedling stage with respect to both size and acquisition of resources (light and nutrients) under drought conditions. Melinis repens displays very similar characteristics as the native species suggesting overlap in resource use. This work provides first insight into key functional characteristics that explain the success of the invasion of species in arid zones and allows also identifying potential characteristics of invasion by non successful species in future scenarios of global environmental change.

    Dos proteínas que participan en la represión catabólica nitrogenada están relacionadas con la resistencia a zinc en Saccharomyces cerevisiae.

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    Tesis (Maestría en Ciencias en Biología Molecular)"Saccharomyces cerevisiae tiene la capacidad de crecer en diferentes fuentes de nitrógeno, pero no lo hace a la misma velocidad, y esto se debe a que existe una regulación transcripcional diferencial en ciertos grupos de genes. En una buena fuente de nitrógeno (como glutamina), los genes regulados por un mecanismo conocido como represión catabólica nitrogenada (NCR) se transcriben de manera basal; en cambio, si las células crecen en una mala fuente de nitrógeno (como prolina), estos genes, que en general codifican para permeasas y enzimas catabólicas, elevan considerablemente su expresión. La transcripción de los genes regulados por NCR depende principalmente de dos factores transcripcionales de tipo GATA: Gln3p y Gat1p. Cuando la célula crece en una buena fuente de nitrógeno, la mayor parte de las moléculas de Gln3p, y probablemente de Gat1p, se encuentra retenida en citoplasma por una proteína llamada Ure2p. Si la levadura crece en una mala fuente de nitrógeno, Gln3p y Gat1p entran al núcleo e incrementan la transcripción de sus genes blanco. En experimentos de microarreglos que evaluaron la respuesta de los genes a distintas fuentes de nitrógeno en mutantes gln3Δ, gln3Δ gat1Δ y ure2Δ se obtuvieron, de manera inesperada, un grupo de genes que codifican para transportadores de zinc, que en algunos casos fueron inducidos, y en otros reprimidos. Además, se ha descrito que una mutante ure2Δ es más resistente a zinc que la cepa parental al crecer en glutamina, glutamato, amonio y prolina. Sin embargo, no se conoce el mecanismo de regulación transcripcional de estos transportadores en diferentes fuentes de nitrógeno, ni el posible mecanismo de resistencia a zinc dado por Gat1p, Gln3p y/o Ure2p ya sea de manera directa o indirecta. Los resultados de este trabajo confirman que Ure2p es un regulador negativo en la resistencia a zinc cuando S. cerevisiae crece en glutamina, amonio o prolina como fuente de nitrógeno. Gln3p parece no influir en la resistencia a zinc en glutamina; sin embargo, conforme la calidad de la fuente de nitrógeno va disminuyendo, este factor transcripcional adquiere una función importante como regulador negativo en la resistencia a zinc.""Saccharomyces cerevisiae grows in a wide variety of nitrogen sources, but its growth rate differs due to the regulatory systems that keep some genes in their basal states when cells grow in a good nitrogen source. In glutamine, for example, some genes are regulated by a mechanism known as NCR (Nitrogen Catabolite Repression), and their expression is low under this condition. Instead, when cells are grown in proline, a poor nitrogen source, those genes that encode for permeases and catabolite enzymes for poor nitrogen sources are generally transcribed at high levels. NCR gene transcription depends on two GATA factors, Gln3p and Gat1p that bind to promoters in their target genes. When cells are growing In a good nitrogen source Gln3p, and probably Gat1p, is retained in cytoplasm by a protein called Ure2p. In proline, Gln3p and Gat1p enter into the nucleus and increase the transcription of their target genes. Microarray experiments performed to analyze gene expression patterns in different nitrogen sources of ure2Δ, gln3Δ and gln3Δ gat1Δ mutants versus a wild type strain, showed unexpectedly that some genes encoding for zinc transporters were induced or in some cases, repressed. Furthermore, ure2Δ mutant grown in glutamine, glutamate, ammonia or proline is more resistant than the wild type strain to 15 mM of zinc sulphate. Nevertheless, to date the transcriptional regulation mechanism of zinc transport in response to different nitrogen sources is not known, nor the possible interaction between Gln3p, Gat1p and/or Ure2p regarding to cell zinc resistance. The results of this work show that Ure2p is a negative regulator of zinc resistance in cells grown in all nitrogen sources analyzed. Although Gln3p seems to have no relation with zinc resistance in glutamine, this factor appears to be a negative regulator when cells grow in ammonia or proline.

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