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Terbinafine Resistance in Dermatophytes: A French Multicenter Prospective Study
No full textIn recent years, we have moved from the sporadic description of terbinafine-resistant (TerR) Trichophyton spp. isolates to the Indian outbreak due to T. indotineae. Population flows have spread TerR worldwide, altering local epidemiology. We conducted a prospective multicentric study to determine the relative frequency of TerR isolates in France (Paris area) and of the newly introduced T. indotineae species. TerR isolates were screened by the terbinafine-containing-agar-medium (TCAM) method and confirmed by EUCAST. Sequencing methods were used to identify isolates to the species/genotype level and to analyze substitutions in the squalene epoxidase gene (SQLE). In total, 3 isolates out of 580 (T. rubrumn = 1; T. interdigitalen = 1; T. indotineaen = 1) grew on TCAM, showed terbinafine resistance by EUCAST and harbored the Phe397Leu (n = 2) or Leu393Ser (n = 1) substitution in the SQLE. ITS-sequencing of isolates of the T. mentagrophytes/interdigitale complex (n = 125) revealed a relative frequency of 4.8% for T. indotineae and the presence of T. mentagrophytes genotype VII. Despite the detection of terbinafine resistance, isolates from this complex remained susceptible to itraconazole, voriconazole and amorolfine. Terbinafine resistance is present in France and the dermatophyte epidemiology is changing. Efficient systems must be implemented to survey the evolution of newly introduced species and to identify TerR isolates
Chiens de détection olfactive de la COVID-19 : élaboration et traitement d'une enquête pré-déploiement auprès du grand public
No full textCOVID-19 screening is more of a hot topic than ever when, every day, hundreds of thousands of new cases are detected around the world. Testing for SARS-CoV-2 is essential and yet still imperfect. This manuscript is divided into two parts. First, a bibliographic section, which takes stock of current knowledge around canine olfactory detection at the service of Humans and particularly around the canine olfactory detection of SARS-CoV-2. The results observed are very promising since the canine olfactory detection would have reliability close to that of the RT-PCR test. Secondly, an experimental part, based on a survey aimed at the general public across the Globe. No survey to assess the positioning of the general public around the world about the canine olfactory detection of COVID-19 had yet been undertaken. A questionnaire was developed by the French team Nosaïs, which was subsequently translated into six other languages and disseminated across continents with the notable help of WHO. Although the lack of representativeness of the samples did not allow the use of inference, some major trends could be extracted from the results of the questionnaires. The vast majority of respondents around the world show great enthusiasm and total acceptance of canine olfactory detection of COVID-19. However, Chinese respondents are the opposite of these observations by opposing the implementation of this screening method. Russian respondents are more mixed, since they do not show much interest in this method, but do not oppose its use. The comments left by respondents at the end of the questionnaires helped to target their concerns, which are mostly ethical and scientific. The results of this study could prompt governments in many countries to allow the implementation of canine olfactory detection for testing for COVID-19 or other diseases in the event of future pandemics. The results could also serve as a basis for future studies on the positioning of the general public vis-à-vis canine olfactory detection.Le dépistage de la COVID-19 est plus que jamais un sujet d'actualité quand, chaque jour, des centaines de milliers de nouveaux cas sont détectés à travers le monde. Les tests de dépistage du SARS-CoV-2 sont indispensables et pourtant encore imparfaits. Ce manuscrit s'articule en deux parties. Premièrement, une partie bibliographique, qui fait le point sur les connaissances actuelles autour de la détection olfactive canine au service de l'Homme et plus particulièrement autour de la détection olfactive canine du SARS-CoV-2. Les résultats observés sont très prometteurs puisque la détection olfactive canine aurait une fiabilité proche de celle du test par RT-PCR. Deuxièmement une partie expérimentale, basée sur une enquête à destination du grand public à travers le Globe. Aucune enquête visant à évaluer le positionnement du grand public à travers le monde vis-à-vis de la détection olfactive canine de la COVID-19 n'avait encore été entreprise. Un questionnaire a été élaboré par l'équipe française Nosaïs, par la suite traduit en six autres langues et diffusé à travers les continents avec l'aide notable de l'OMS. Même si le manque de représentativité des échantillons n'a pas permis d'avoir recours à l'inférence, quelques grandes tendances ont pu être extraites des résultats des questionnaires. La grande majorité des répondants à travers le monde présente un grand engouement et une totale acceptation de la détection olfactive canine de la COVID-19. Les répondants chinois se placent cependant à l'opposé de ces observations en s'opposant à la mise en place de cette méthode de dépistage. Les répondants russes sont plus mitigés, puisqu'ils ne montrent pas un grand intérêt pour cette méthode, mais ne s'opposent pas pour autant à son utilisation. Les commentaires laissés par les répondants à la fin des questionnaires ont permis de cibler leurs inquiétudes, qui sont majoritairement d'ordre éthique et scientifique. Les résultats de cette étude pourraient inciter les gouvernements de nombre de pays à autoriser la mise en oeuvre de la détection olfactive canine pour le dépistage de la COVID-19 ou d'autres maladies dans le cas de futures pandémies. Les résultats pourraient en outre servir de base pour de futures études sur le positionnement du grand public vis-à-vis de la détection olfactive canine
Seasonal dynamics of competition between honey bees and wild bees in a protected Mediterranean scrubland
No full textInternational audienceDue to the widespread use of pesticides and the lack of floral resources in many agricultural landscapes, beekeepers have moved numerous honey bee colonies in protected areas which could shelter an important diversity of wild bees. Here, we investigated the seasonal dynamics of the competition between honey bees and wild bees through a two-year study of plant-bee networks in a Mediterranean protected area. We recorded the visitation rates of four bee groups: honey bees, small wild bees, large wild bees and bumblebees. Our study reveals that the competition for floral resources induced by honey bees is especially strong during the early spring and then decreases along the season for all groups of wild bees. We observed a competitive exclusion of all groups of wild bees illustrated by an avoidance of well-flowered plant species in presence of honey bees. As a consequence, we detected a rewiring of large and small bee floral preferences linked to the presence of honey bees. In presence of honey bees, Rosmarinus officinalis and Cistus albidus were significantly less visited by large bees. This study underlines the need to mitigate the establishment of numerous honey bee colonies in protected areas as honey bees could strongly affect the foraging activity of wild bees
Quantum Dot-Based Screening Identifies F3 Peptide and Reveals Cell Surface Nucleolin as a Therapeutic Target for Rhabdomyosarcoma
No full textInternational audienceActive drug delivery by tumor-targeting peptides is a promising approach to improve existing therapies for rhabdomyosarcoma (RMS), by increasing the therapeutic effect and decreasing the systemic toxicity, e.g., by drug-loaded peptide-targeted nanoparticles. Here, we tested 20 different tumor-targeting peptides for their ability to bind to two RMS cell lines, Rh30 and RD, using quantum dots Streptavidin and biotin-peptides conjugates as a model for nanoparticles. Four peptides revealed a very strong binding to RMS cells: NCAM-1-targeting NTP peptide, nucleolin-targeting F3 peptide, and two Furin-targeting peptides, TmR and shTmR. F3 peptide showed the strongest binding to all RMS cell lines tested, low binding to normal control myoblasts and fibroblasts, and efficient internalization into RMS cells demonstrated by the cytoplasmic delivery of the Saporin toxin. The expression of the nucleophosphoprotein nucleolin, the target of F3, on the surface of RMS cell lines was validated by competition with the natural ligand lactoferrin, by colocalization with the nucleolin-binding aptamer AS1411, and by the marked sensitivity of RMS cell lines to the growth inhibitory nucleolin-binding N6L pseudopeptide. Taken together, our results indicate that nucleolin-targeting by F3 peptide represents a potential therapeutic approach for RMS
Numerical simulations of granular column collapse: comparison between DEM, Navier-Stokes and thin-layer models
No full textGranular flows occur in various contexts including laboratory experiments, industrial processes and natural geophysical flows. In order to investigate their dynamics, different kinds of physically-based models have been developed. These models can be characterized by the length scale at which dynamic processes are described. Discrete models use a microscopic scale to model individually each grain, Navier-Stokes models use a mesoscopic scale to consider elementary volumes of grains, and thin-layer models use a macroscopic scale to model the dynamics of elementary columns of fluids. In each case, the derivation of the associated equations is well known. However, few studies focus on the extent to which these modeling solutions yield mutually coherent results. In this work, we compare the simulations of a granular column collapse on a horizontal or inclined plane, for the discrete model COCD, the Navier-Stokes model Basilisk, and the thin-layer model SHALTOP. We show that, although all three models allow reproducing the temporal evolution of the free surface in the horizontal case (except for SHALTOP at the initiation), the modeled flow dynamics are significantly different, and in particular during the stopping phase. The pressures measured at the flow's bottom are in relatively good agreement, but significant variations are obtained with the COCD model due to complex and fast-varying granular lattices. Similar conclusions are drawn using the same rheological parameters to model a column collapse on an inclined plane. This comparison exercise is essential for assessing the limits and uncertainties of granular flow modeling
Les nutraceutiques dans la gestion du chien arthrosique : analyse critique de la littérature
No full textOsteoarthritis is a frequent painful and incapacitating degenerative disease. Several therapeutic options are available, none of them being enough on their own, which is why the usual recommandation is to combine them into a multimodal approach. One of the possible option relies on the use of nutraceuticals. Nutraceutical is a ill-defined term but it generally refers to the active ingredients that can be found in food. Nutraceuticals are perceived as long-term safe and effective products and are numerous on the market. However, from a scientifical point of view, their field is still poorly documented. The purpose of this work was to collect the actual knowledge on the pharmokinetics, the pharmacodynamics and the toxicity of nutraceuticals that claim to be appropriate in the treatement of dog osteoarthritis. As a second step, a review based on an Evidence-Based Veterinary Medecine method of the available clinical trials using the aforementioned nutraceuticals was carried out in order to ensure their level of evidence. The pharmokinetics datas are rarely complete. Because nutraceuticals don’t have to satisfy the same requirements as drugs, few studies are avaible and they often are controversial. The pharmacodynamics are usually well-known. Most of the in vitro studies corroborate their presumed anti-inflammatory and chondroprotective roles. The supposed absence of toxicity of nutraceuticals also seems to be accurate. Nevertheless, when considering the datas coming from the reviewed clinical trials, only omega-3 fatty acids brought by fish oil demonstrated a real reliable beneficial clinical effect on the pain and the mobility of arthritic dogs. When reading these conclusions, it should be kept in mind that the clinical signs evaluation methods, the osteoarthritis models, the injured joints and the dosages employed in the reviewed clinical trials were highly heterogeneous. Therefore precise comparison and unequivocal recommendations can not be drawn. Still it is possible to question the frequent usage of glucosamine and chondroitin sulfate whereas the evidence is poor. On the contrary, undenatured type II collagen and Perna Canaliculus powder seem to be promising substances but more investigation is required.L'arthrose est maladie articulaire dégénérative fréquente, douloureuse et handicapante dans les activités quotidiennes des animaux atteints. Plusieurs options thérapeutiques existent, aucune n'étant satisfaisante à elle seule, c'est pourquoi il est recommandé dans les combiner dans une approche multimodale. Une des options envisageables s'appuie sur l'utilisation de nutraceutiques, terme à la définition vague mais généralement considérée comme qualifiant les principes actifs pouvant être retrouvés dans l'alimentation. Les nutraceutiques sont perçus par le grand public comme une solution sûre et efficace, utilisable sur le long court, et abordable grâce à l'abondance de produits disponibles sur le marché. Pourtant, d'un point de vue scientifique, ce domaine reste encore peu documenté. Ce travail a eu pour but de réunir l'ensemble des connaissances actuelles concernant la pharmacocinétique, la pharmacodynamie et la toxicité des nutraceutiques supposément indiqués dans le traitement de l'arthrose du chien. Dans un second temps, une étude des essais cliniques disponibles employant ces mêmes nutraceutiques a été menée à l'aide d'une méthode d'Evidence-Based Veterinary Medecine, afin d'établir le niveau de confiance pouvant leur être véritablement accordé. Les données pharmacocinétiques disponibles sont rarement complètes. Les nutraceutiques n'étant pas soumis au même régime que les médicaments, peu d'études se sont penchées sur la question et lorsqu'elles l'ont fait, les résultats sont généralement controversés. La pharmacodynamie est globalement bien documentée via divers modèles in vitro et soutient dans la majeure partie des cas l'hypothèse des rôles anti-inflammatoires ou chondroprotecteurs qui leur sont attribués. Concernant la toxicité, la réputation des nutraceutiques comme étant des produits sûrs semble se vérifier. Néanmoins, d'après l'analyse critique réalisée ici, seuls les acides gras oméga-3 apportés en complémentation de la ration alimentaire de base via l'emploi d'huile de poisson ont été considérés avoir démontré un réel effet clinique bénéfique fiable sur la douleur et la mobilité des chiens arthrosiques. Les propos rapportés ici sont à analyser en gardant à l'esprit que les méthodes d'évaluation des signes cliniques, les modèles d'arthrose, les articulations atteintes et les posologies étant fortement hétérogène en fonction des essais, il reste difficile de les comparer efficacement et d'en tirer des recommandations inéquivoques. Il est néanmoins possible de questionner l'utilisation de glucosamine et la chondroïne sulfate, qui semble bien trop courante comparée au faible nombre de données probantes récoltées dans la littérature. A l'inverse, le collagène de type II non dénaturé et la poudre de chair de moule Perna canaliculus semblent être des agents prometteurs qui méritent néanmoins de plus amples investigations
État des lieux de l'utilisation d'hormones dans la gestion de la fertilité de la truie en France et recherche d'alternatives à l'utilisation de gonadotropines
No full textIn swine industry, hormones are used on sows for a wide variety of indications. Among these hormones we focused on gonadotropins (which stimulate follicular growth and heat behavior) and their use to control or improve sows’ fertility as well as the means that can be implemented to reduce their use. Firstly, we conducted an online survey. This survey was addressed to pig farmers which breed sow. The survey’s goal was to make an inventory of the different breeding practices having an influence on fertility in French pig farms, reproductive problems encountered by farmers and the different uses of hormones in reproductive management. The data collected through this online survey were analyzed to find out if gonadotropin users were similar or different to other farmers. For this we did a univariate analysis with Fisher tests. Then we did a multivariate analysis and carried out two PCAs. One PCA was on the reproduction problems encountered and the other one was toward breeding technique. In our sample of those who responded to the online survey, we were able to observe that gonadotropin users are more birthing sites with a large number of sows and many workers. Farmers who use gonadotropins tend to intervene more and they use more conventional treatments (as opposed to so-called alternative treatments). The use of gonadotropins for some of these users was associated with lower prolificity and a fertility similar to other herds. Analysis suggests that management of heat detection can be improved for some gonadotropins users. This can be a working track in order to reduce or stop gonadotropin use. Secondly, we developed a method for auditing fertility and the use of hormones that aimed to identify risk factors for fertility troubles. This audit aims to find avenues of work to improve fertility in the farms surveyed. If the farmer uses gonadotropins, the questionnaire would aim to propose alternatives to gonadotropins. The audit questionnaire resulted in a RADAR diagram showing the scores obtained in major parts We added to the questionnaire a recording of the housing temperature over three to four weeks and analyzed it. Also, when data were available, an analysis of back fat thickness was added. This audit has been implemented in ten French farms. Individual answers were used to test the questionnaire's ability to describe variability of practices from farm to farm and its ability to identify infertility risk factors. The questionnaire indeed detected variable practices between farms, but no numerical alert threshold could be implemented. This promising tool could be improved by better integration of temperature and backfat monitoring, and testing on larger data set.Les hormones sont utilisées en production porcine chez la truie pour des indications très variées. Parmi ces hormones nous nous sommes intéressées aux gonadotropines (qui stimulent la croissance folliculaire et la venue en chaleur) et à leur usage afin de maîtriser ou améliorer la fertilité des truies, ainsi qu'aux moyens pouvant être mis en oeuvre pour réduire leur utilisation. Dans un premier temps nous avons réalisé une enquête en ligne. Cette enquête s'adressait aux éleveurs porcins faisant de la reproduction (naisseur et naisseur-engraisseur) et son but était de faire un état des lieux sur les différentes pratiques d'élevages ayant une influence sur la fertilité, les problèmes de reproductions rencontrés et l'usage des hormones dans la gestion de la reproduction. Les données récoltées grâce à cette enquête en ligne ont été analysées afin de chercher si les utilisateurs de gonadotropines étaient comparables aux autres éleveurs. Pour cela nous avons fait une analyse univariée. Puis nous avons réalisé une analyse multivariée avec deux ACP, une sur les problèmes de reproductions rencontrés et une autre sur la conduite d'élevage. Dans notre échantillon ayant répondu à l'enquête en ligne nous avons pu observer que les utilisateurs de gonadotropines sont davantage des sites de naissage avec un grand nombre de truies et beaucoup de personnel. Les éleveurs utilisateurs de gonadotropines sont plus interventionnistes et utilisent plus de traitements conventionnels (par oppositions aux traitements dits alternatifs). L'utilisation de gonadotropines pour une partie de ces utilisateurs était associée à de plus faibles prolificités et à une fertilité semblable aux autres éleveurs. La conduite de la détection des chaleurs est améliorable pour certains éleveurs et peut constituer une piste de travail en vue de diminuer ou d'arrêter l'usage des gonadotropines. Dans un deuxième temps, nous avons élaboré une méthode d'audit de la fertilité et de l'usage d'hormones. Cet audit a pour but de trouver des pistes de travail pour améliorer la fertilité dans les élevages enquêtés et chez les utilisateurs de gonadotropines, le questionnaire a pour but de proposer des alternatives personnalisées. Le questionnaire d'audit aboutit à un diagramme RADAR représentant les notes obtenues par thématique. A cela s'ajoute une analyse des températures sur trois à quatre semaines et lorsque les données sont disponibles une analyse des épaisseurs de lard dorsal. Cet audit a été testé dans dix élevages. Le questionnaire permet de mettre en évidence des différences entre les élevages et pourrait être une aide afin d'identifier des facteurs de risques vis-à-vis de la fertilité. Toutefois aucun seuil d'alerte chiffré n'a pu être défini dans notre étude. La pertinence de cet outil reste à confirmer en intégrant des élevages aux performances plus diversifiées et des monitorings d'ambiance et d'état corporel. Systématiques
Duchenne muscular dystrophy trajectory in R-DMDdel52 preclinical rat model identifies COMP as biomarker of fibrosis
No full textInternational audienceAbstractDuchenne muscular dystrophy (DMD) is a fatal muscle-wasting disorder caused by mutations in the Dystrophin gene and for which there is currently no cure. To bridge the gap between preclinical and therapeutic evaluation studies, we have generated a rat model for DMD that carries an exon 52 deletion (R-DMDdel52) causing a complete lack of dystrophin protein. Here we show that R-DMDdel52 animals recapitulated human DMD pathophysiological trajectory more faithfully than the mdx mouse model. We report that R-DMDdel52 rats displayed progressive and severe skeletal muscle loss associated with fibrotic deposition, fat infiltration and fibre type switch. Early fibrosis was also apparent in the cardiac muscle. These histological modifications led to severe muscle, respiratory and cardiac functional impairments leading to premature death around 1 year. Moreover, DMD muscle exhibited systemic inflammation with a mixed M1/M2 phenotype. A comparative single cell RNAseq analysis of the diaphragm muscle was performed, revealing cellular populations alteration and molecular modifications in all muscle cell types. We show that DMD fibroadipogenic progenitors produced elevated levels of cartilage oligomeric matrix protein, a glycoprotein responsible for modulating homeostasis of extracellular matrix, and whose increased concentration correlated with muscle fibrosis both in R-DMDdel52 rats and human patients. Fibrosis is a component of tissue remodelling impacting the whole musculature of DMD patients, at the tissue level but most importantly at the functional level. We therefore propose that this specific biomarker can optimize the prognostic monitoring of functional improvement of patients included in clinical trials.</jats:p