Repositório Científico de Acesso Aberto da ULisboa
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    Goan oratorian missionary churches in Ceylon : origins, evolution, and synthesis

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    The crucial role of Goan Oratorian missionaries in maintaining and expanding Catholicism in Sri Lanka (previously Ceylon) is well known. The founder of the Goan Oratorian mission in Ceylon, Fr Joseph Vaz, was recently canonised for his fundamental role in revitalising the Catholic faith on the island. He arrived on the island in 1687, disguised as a beggar, with the aim of assisting the remaining believers in proclaiming their Catholic faith. The Catholics had been abandoned after Dutch rule (1658–1796) that led to the expulsion of missionaries from the Portuguese period (1505–1658) and the persecution of native Catholics. Fr Joseph Vaz was followed by other Goan missionaries affiliated with the Oratorian congregation founded by St Philip Neri, acting under the Portuguese Padroado Real. Their persistence allowed for the maintenance and subsequent growth of the Catholic faith on the island, which is still evident today. Until recently, the tangible remains of this Goan Oratorian mission were largely unknown, if not ignored or misunderstood. This oversight is not unrelated to the arrival of European missionaries linked to the Roman Curia of Propaganda Fide, whose missionary actions contributed to the diminishment of the Goan Oratorians' role to near obscurity. However, thorough research has uncovered that the Goan Oratorian missionaries indeed left a vast architectural (and, to some extent, also artistic) legacy. This research was aimed at conducting a detailed architectural survey of the Oratorian-founded churches that still exist in Sri Lanka and analysing their origins, typological characteristics, architectural evolution, and specific attributes. These churches reflect the history of Catholic missionary activity on the island from the post-Portuguese period to the early twentieth century under British rule (1795–1948). The revelation of a coherent architectural typology – the only one in the world related to the Goan Oratorians, which even influenced churches built later by succeeding missionaries from other European congregations – is a unique legacy of the utmost cultural and religious significance.O papel crucial dos padres oratorianos goeses na manutenção e expansão do catolicismo no Sri Lanka (antigo Ceilão) é por demais conhecido. O fundador da missão oratoriana no Ceilão, o padre José Vaz, aliás, foi recentemente canonizado pelo seu papel fundamental no renascimento da fé católica na ilha: em 1687 entrou disfarçado de mendigo na ilha, com intuito de prover na fé católica os crentes ainda remanescentes que haviam ficado desamparados após a conquista e domínio holandês (1658-1796) – os missionários que actuaram durante o domínio português (1505-1658) foram expulsos, e os católicos nativos foram perseguidos. Ao padre José Vaz seguiram-se outros padres goeses filiados sob a congregação fundada por São Filipe Néri e actuando sob o Padroado Real português; a sua persistência permitiu a manutenção e posterior crescimento das comunidades católicas na ilha, cujo testemunho ainda hoje é visível. Porém, até muito recentemente as reminiscências tangíveis destes padres oratorianos goeses eram quase desconhecidas, senão mesmo ignoradas ou equivocadas. A tal não é alheia a chegada de missionários europeus ligados à Cúria Romana da Propaganda Fide, cuja acção missiológica contribuiu para desvanecer o papel dos oratorianos goeses até quase ao esquecimento do ponto de vista tangível. Porém, após um profundo estudo, verificou-se que existe afinal um vasto legado arquitectónico (e, de algum modo, também artístico) que nos foi deixado pelos padres oratorianos goeses. Esta investigação procurou por isso realizar um aturado levantamento dos edifícios de fundação oratoriana ainda existentes no Sri Lanka, analisando as suas origens, características tipológicas, evolução arquitectónica e atributos específicos que acompanharam a própria história missionária católica na ilha no período pós-português e até aos inícios do século XX, já sob o domínio colonial britânico (1795-1948). A revelação de uma tipologia arquitectónica muito coerente – a única no mundo relacionada com os oratorianos – que inclusivamente influenciou igrejas construídas posteriormente por missionários de outras congregações europeias, é de facto um legado único e da maior importância a nível cultural e religioso

    Innovative medical device to prevent skin lesions caused by personal protective equipment due to Covid-19

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    The COVID-19 pandemic significantly increased the reliance on personal protective equipment (PPE) and rigorous hand sanitation practices. However, the prolonged use of PPE, particularly masks, caused skin issues such as acne, dermatitis, dryness, and rashes among healthcare professionals and frequent PPE users, due to sustained friction, pressure, and tension. These conditions are likely to impact both the physical comfort and the overall quality of life of PPE users. This study sought to address these challenges by developing gelatin-based hydrogel patches as a novel, sustainable, cost-effective solution to protect the skin of PPE users, with the potential to integrate active substances, thus offering additional therapeutic benefits. A gelatin-based hydrogel patch was designed using a Quality by Design (QbD) approach and design space tools, and optimized by incorporating excipients that improved gelation temperature, elasticity, and adhesiveness, characteristics that were confirmed through rheological analysis, Attenuated Total Reflectance Fourier-Transform Infrared spectroscopy (ATR-FTIR), and molecular docking. Tannic acid was added to further reinforce structural integrity and enable steam sterilization, enhancing the patch’s reusability and sustainability. In vitro and in vivo tests were conducted to validate the physical properties and protective efficacy of the hydrogel patches. In vitro assays assessed cytotoxicity, biocompatibility and antioxidant activity, while in vivo biometric measurements evaluated skin temperature, sebum level, hydration, transdermal water loss (TEWL), and redness in human volunteers using FFP2 masks. As an innovative approach, active ingredients - metronidazole (1% w/w) and salicylic acid (2% w/w) - were added separately into the gelatin/tannic acid hydrogel formulation to create dual-function patches for skin barrier protection and targeted treatment of conditions like rosacea and maskne. The hydrogel patches were evaluated for gelation temperature, burst strength, extensibility, adhesivity, and tribological behavior, to study the impact of the active ingredients on the patches’ mechanical properties. Additionally, in vitro release and permeation studies were conducted to assess the active ingredients’ release profiles and skin permeation efficiencies. Finally, extrusion-based 3D printing technology was employed to customize hydrogel patches with different infill patterns, tailored for specific structural and release requirements. The gelatin-based hydrogel patch exhibited enhanced physical properties, including higher gelation temperature, steam sterilization capacity, enhanced burst strength, and increased elasticity, attributed to the addition of tannic acid. Rheological and texture analyses, supported by molecular docking studies, confirmed strong interactions between gelatin and the excipients, particularly tannic acid, which contributed to the patch's enhanced mechanical properties and adhesiveness. Tribology studies revealed consistent friction levels across different temperatures and skin types, indicating reliable usability. In vitro studies using the HaCaT cell line confirmed the hydrogel patch’s suitability for topical application, showing biocompatibility, no cytotoxic effects, and antioxidant properties, highlighting its potential for safe use. In vivo biometric analysis indicated that when the patch was used under FFP2 masks, it significantly increased skin hydration and reduced facial redness, without affecting baseline facial temperature or TEWL, thus reinforcing the skin barrier without compromising comfort. Positive consumer feedback on patch application further supported its acceptability in real-world conditions. In vitro drug release studies showed an initial burst followed by sustained release of both metronidazole and salicylic acid, confirming a controlled release mechanism for all tested formulations. In vitro permeation studies revealed that metronidazole exhibited limited skin penetration, suggesting minimal systemic absorption, whereas salicylic acid successfully penetrated the epidermal barrier, despite low retention. These findings suggest that the patches hold significant potential for effectively treating skin lesions. The use of extrusion-based 3D printing allowed the customization of gelatin/tannic acid hydrogel patches containing active ingredients. Different infill patterns affected both tensile strength, drug release rates and permeation profile, with grid patterns yielding the strongest structures and most controlled release, further underscoring the adaptability of this approach for personalized skin care solutions. This study introduces an innovative, sustainable, and effective solution for skin protection: a gelatin-based hydrogel patch reinforced with tannic acid, designed to address PPE-induced skin lesions. The addition of tannic acid enhanced structural integrity and enabled sterilization, which improved the patch's reusability and sustainability. The patch’s protective efficacy, confirmed by in vitro and in vivo assessments, highlights its potential for widespread use, particularly among healthcare professionals. Additionally, the personalized 3D printed hydrogel patches containing active ingredients offer a targeted approach for managing specific skin conditions like rosacea and maskne. By preventing common PPE-related skin issues, these patches offer a practical, adaptable, and sustainable approach to maintaining skin health and comfort during prolonged PPE use. The patch’s optimized design, performance, and adaptability underscore its significance as a sustainable and effective skincare solution in clinical and pandemic contexts

    Repurposing of CFTR modulator drugs in the context of colorectal cancer

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    Tese de Mestrado, Biologia Humana e Ambiente, 2025, Universidade de Lisboa, Faculdade de CiênciasDesde meados do século XX, o cancro colorretal (CRC) tornou-se num dos tipos de cancro mais comuns nos países ocidentais e é atualmente o segundo tipo de cancro mais letal a nível mundial, com uma taxa de mortalidade significativa, em particular nos países desenvolvidos. Apesar de existirem vários fatores que contribuem para o desenvolvimento do CRC, cerca de 20-30% dos casos têm uma base familiar, sendo que 5-10% desses estão associados a síndromes hereditários bem definidos, como o Síndrome de Lynch e a Polipose Adenomatosa Familiar (FAP). Estes envolvem mutações em genes específicos que aceleram a progressão de tumores benignos para malignos, impulsionada por uma combinação de alterações genéticas e epigenéticas, sendo que as mutações mais comuns ocorrem em genes como APC, KRAS e TP53, que alteram o ciclo celular e promovem a invasão tumoral. Além disso, a instabilidade de microssatélites e a desregulação da via PI3K/AKT promovem a sobrevivência e a metástase celular. O diagnóstico precoce do CRC é fundamental para melhorar as taxas de sobrevida e reduzir a mortalidade. Devido à sua alta incidência e potencial de cura nas fases iniciais, o CRC é um candidato ideal para programas de rastreamento populacional, geralmente oferecidos a pessoas entre os 50 e os 75 anos. O diagnóstico geralmente é feito através de exames físicos, seguidos de colonoscopia e biópsias, que permitem a caracterização precisa das lesões cancerígenas ou pré-cancerígenas. Este tipo de cancro é classificado em cinco estágios (0 a IV), com base na profundidade de invasão tumoral e na presença de metástases. Tumores nos estágios iniciais (0 e I) são frequentemente tratados apenas com cirurgia, enquanto tumores nos estágios II e III requerem tratamento adicional, como quimioterapia ou radioterapia. No estágio IV, o tratamento é mais individualizado e especializado, uma vez que as metástases se encontram em órgãos distantes. Recentemente, o canal de cloreto e bicarbonato CFTR (cystic fibrosis transmembrane conductance regulator) foi implicado na etiologia do CRC, uma vez que uma expressão diminuída de CFTR está associada a maior agressividade e menor sobrevivência no CRC esporádico. Mutações no gene CFTR estão também associadas à doença autossómica recessiva fibrose quística (CF), uma vez que uma deficiência no canal iónico CFTR está associada à desidratação e obstrução das vias respiratórias, consequente da produção de um muco demasiado espesso que promove o desenvolvimento de infeções bacterianas recorrentes, provocando a destruição progressiva das vias aéreas. Para além da doença respiratória, a disfunção pancreática é também relevante para indivíduos que sofrem desta doença, existindo evidências de alterações na absorção intestinal de nutrientes e na composição da microbiota. Devido ao aumento da esperança média de vida para estes pacientes, o risco destes desenvolverem neoplasias aumentou também, em particular no trato gastrointestinal, sendo que se destaca o CRC. A proteína CFTR é crucial para a regulação de fluidos e secreção de muco em vários órgãos do corpo humano, como os intestinos, os pulmões e as glândulas exócrinas. É composta por cinco domínios principais, incluindo dois domínios de ligação ao nucleótido (NBD1 e NBD2), dois domínios transmembranares (MSD1 e MSD2) e um domínio regulador (R). Esta é sintetizada inicialmente no retículo endoplasmático (ER) e passa por um processo de folding complexo e glicosilação, essencial para a sua função na membrana celular. Na CF, a disfunção de CFTR provoca uma redução da secreção de fluidos e de bicarbonato no epitélio intestinal, provocando disbiose microbiana, interrupção da função intestinal normal e inflamação. Acredita-se que a disbiose disfuncional associada à CFTR e a inflamação intestinal promovem a desdiferenciação epitelial, contribuindo para o risco aumentado de desenvolvimento de CRC nestes indivíduos. É importante realçar que a expressão de CFTR também foi detetada como estando significativamente reduzida em coortes de tumores esporádicos de CRC de indivíduos não-CF, mas, em contraste com o CRC associado à CF, em CRC esporádicos a redução da expressão do canal não está associada a mutações no gene CFTR. Assim, pensa-se que outros fatores estão na base da diminuição da abundância e função de CFTR nos CRC não-CF, entre os quais o stress do ER associado ao elevado índice metabólico das células tumorais. Durante a tumorigénese, o aumento da taxa de proliferação celular sobrecarrega o ER, levando ao acúmulo de proteínas com erros de folding. Como a proteína CFTR é grande e tem uma cinética de folding lenta, esta é particularmente vulnerável ao stress do ER, sendo que o seu misfolding é rapidamente detetado pelos mecanismos de controlo de qualidade (ERQC), levando à degradação prematura de quaisquer canais acumulados no ER. Curiosamente, a mutação F508del, que está presente em cerca de 80% dos pacientes com CF, causa um defeito no folding do canal CFTR que reduz drasticamente a abundância desta proteína nas células epiteliais devido à sua retenção no ER e posterior degradação mediada pelo ERQC. Pesquisas recentes têm-se focado em resgatar a função da proteína neste tipo de mutação, usando uma nova classe de medicamentos moduladores. Esses fármacos, desenvolvidos originalmente para tratar a CF, incluem os “corretores” Tezacaftor (VX-661) e Elexacaftor (VX-445), que facilitam o folding e a estabilidade da proteína, e o “potenciador” Ivacaftor (VX-770) que prolonga o tempo de abertura do canal iónico. Existem ainda amplificadores experimentais, como o Nesolicaftor (PTI-428), que aumentam a produção de CFTR funcional. Tendo tudo isto em consideração, o atual projeto de mestrado visou determinar se estes fármacos também podem ser usados para melhorar a abundância e função de CFTR em células CRC não-CF, com expressão diminuída da proteína, e se estes poderiam ser usados para reduzir as propriedades oncogénicas das células de CRC. Para tal, quatro linhas celulares de CRC (Caco-2, DLD-1, HCT116 e HT29), com diferentes níveis de expressão de CFTR, foram cultivadas e tratadas com moduladores específicos da proteína em questão, individualmente e em combinação, administrados em diferentes concentrações para observar os seus efeitos sobre a abundância de CFTR nestas células. Os níveis do canal foram monitorizados por Western blot e os resultados obtidos foram quantificados através do software ImageJ (NIH). As condições de tratamento que aumentaram a expressão de CFTR, numa primeira fase experimental, foram posteriormente utilizadas para testar se também afetavam as propriedades oncogénicas das células CRC responsivas. Nesta primeira fase, as linhas celulares Caco-2 e DLD-1 demonstraram ambas um aumento significativo na expressão da proteína CFTR, especialmente quando tratadas com uma combinação dos corretores VX-661 e VX-445. Nas células HCT116 e HT29 nenhuma das drogas revelou impactar os níveis de CFTR de modo significativo, indicando a limitação do efeito dos moduladores a células de CRC com perfis genéticos e epigenéticos específicos. Este aspeto foi ainda explorado nas células HCT116 através do tratamento com o amplificador PTI-428, observando-se um aumento dos níveis de transcritos CFTR, mas que não conduziram a um aumento significativo de proteína, sugerindo a geração de transcritos aberrantes. Esta resposta limitada pode estar associada à hipermetilação do promotor do gene CFTR e a mutações silenciosas que afetam o splicing. De seguida, realizaram-se ensaios de viabilidade celular (MTT), onde é medida a atividade metabólica das células, nas linhas DLD-1 e Caco-2, que mostraram que os tratamentos com os corretores VX-661 e VX-445 não causaram uma mudança significativa na viabilidade das células quando expostas durante 48 horas e 72 horas, indicando que as combinações não são citotóxicas em condições in vitro. Por último, fizeram-se ensaios de migração celular com filtros PET, utilizando também o potenciador VX-770, onde o tratamento com a combinação dos dois corretores reduziu significativamente a migração das células das linhas Caco-2 e DLD-1, sendo que a adição do potenciador intensificou ainda mais o efeito. No entanto, nas células HT29, que já possuem uma expressão elevada de CFTR, o tratamento com o VX 770 não teve qualquer impacto significativo. Embora estas células já possuam um baixo potencial migratório, estes resultados reforçam as nossas observações anteriores que a resposta funcional da CFTR aos fármacos moduladores depende do contexto celular e da localização subcelular da proteína. Assim, é possível concluir que, em determinados contextos de CRC, o canal CFTR desempenha um papel crítico na modulação das propriedades migratórias das células tumorais e que a recuperação da sua abundância e funcionalidade, através da administração de fármacos moduladores, poderá trazer benefícios terapêuticos relevantes. No futuro, são necessários mais estudos para validar o impacto destes fármacos no desenvolvimento de tumores de CRC, nomeadamente usando xenógrafos das linhas celulares responsivas em modelos de ratinhos. Também será importante explorar o uso de outros fármacos, nomeadamente de agentes desmetilantes, para aumentar a expressão da CFTR em células de CRC, como as HCT116, por exemplo, onde os fármacos moduladores não tiveram efeitos significativos. Não obstante, o facto de se poder vir a conseguir utilizar estes fármacos no tratamento de alguns subtipos de CRC esporádico seria benéfico não só para estes doentes, mas também para os indivíduos que sofrem de CF, uma vez que uma maior aplicabilidade clínica destes fármacos resultaria numa redução do custo dos mesmos.Colorectal cancer (CRC) remains one of the leading causes of cancer death worldwide and is considered to arise from genetic and epigenetic changes due to interactions between the tumor and the microenvironment that surrounds it. Recently, the chloride and bicarbonate channel CFTR (cystic fibrosis transmembrane conductance regulator) was implicated in CRC etiology, since a decreased CFTR expression is associated to higher aggressiveness and lower survival in sporadic CRC. Moreover, CFTR mutations are the cause for the autosomal recessive disease cystic fibrosis (CF), and individuals with CF have a higher risk of developing CRC. Several CFTR modulator drugs have been recently clinically approved to improve CFTR functional expression in CF individuals. The current Masters’ project aimed to determine if these drugs can also be used to improve CFTR abundance in non-CF CRC cells, and whether these could be used to reduce their oncogenic properties. For this purpose, four CRC cell lines, with different CFTR expression levels, were cultured and treated with three CFTR modulator drugs, individually and in combination. It was observed that the combination treatment with the three drugs significantly increased CFTR protein levels in the Caco-2 and DLD-1 cells, but had no significant impact in either HCT116 or HT29 cells, likely due to their particular genetic and epigenetic backgrounds. Importantly, treatment with CFTR modulators significantly inhibited migration of Caco 2 and DLD-1 cells, without markedly impacting their viability. These findings suggest that CFTR modulators have potential as therapeutic agents to counteract the oncogenic properties of CRC cells with specific genetic and epigenetic profiles. However, the impact of CFTR modulator treatment in CRC development will need to be validated in vivo using mouse models. Repurposing these modulators for CRC treatment could enhance outcomes for CRC patients while also reducing costs for CF patients by expanding the clinical applications of these drugs

    Desenvolvimento de novas metodologias de controlo de qualidade da anodização do alumínio para a arquitetura

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    Tese de Mestrado, Química Tecnológica, 2025, Universidade de Lisboa, Faculdade de CiênciasO controlo de qualidade é fundamental na indústria, especialmente para o alumínio anodizado, cuja inspeção rigorosa assegura a sua utilização segura em diversas aplicações arquitetónicas. Este trabalho, que foi realizado no LNEC, segue as especificações da QUALANOD, organização que define e monitoriza os requisitos de qualidade para o alumínio anodizado em vários países europeus. Estes requisitos baseiam-se na norma ISO 7599, que regula os processos de anodização com ácido sulfúrico. Além disso, o cumprimento rigoroso das normas ISO (International Organization for Standardization) é indispensável e foi garantido ao longo deste trabalho, sendo citadas conforme necessário. A norma ISO 2931 estabelece a medição da admitância (Y) como parâmetro de controlo de qualidade para o alumínio anodizado. Contudo, o aparelho específico recomendado para esta medição está em fase de descontinuação, criando a necessidade de um método alternativo que seja eficiente, portátil, autónomo e capaz de medir admitância. Este estudo explorou a relação entre admitância e capacidade, medida com dois dispositivos diferentes (um multímetro simples e um do tipo LCR (aparelho Fluke). Foram realizados testes comparativos dos valores de admitância para várias amostras de alumínio anodizado, variando em métodos de produção e cores, tendo-se verificado uma boa correlação linear entre admitância e capacidade na maioria dos casos. O aparelho Fluke, revelou-se o mais fiável para obter uma correlação linear com menor margem de erro, tendo-se concluído ser este o tipo de multímetro a usar para cumprir o objetivo proposto. Os resultados obtidos na gama de trabalho (0 a 200 µS) foram promissores, com 69% das medições com erro até ±2 µS e apenas 9% com erro superior a ±5 µS. Embora o método proposto seja promissor, recomenda-se a realização de mais ensaios, especialmente com o multímetro LCR indicado, o que poderá contribuir para uma validação mais robusta da técnica e para estudos futuros.Quality control is essential in the industry, particularly for anodized aluminum, where rigorous quality assurance supports its diverse applications in architecture. This study is based on QUALANOD’s specifications, an organization that defines and oversees anodized aluminum quality standards across approximately 44 European countries, grounded in ISO 7599, which regulates sulfuric acid anodizing processes. Additionally, adherence to ISO standards (International Organization for Standardization) is critical, with all relevant standards meticulously followed and referenced as needed in this study. ISO 2931 specifies the measurement of admittance (Y) as a key quality control parameter for anodized aluminum. However, the recommended measurement device is now being discontinued, highlighting the need for a new efficient, portable, battery-operated device capable of measuring admittance reliably. The study explored the relationship between admittance and capacitance, measured using two instruments: a simple multimeter and LCR equipment (Fluke device). Comparative testing of admittance values across various anodized aluminum samples—with different methods and colors—showed a strong linear correlation between admittance and capacitance in most cases. The Fluke LCR meter demonstrated the most reliable linear correlation, with lower errors suggesting that an LCR-type multimeter is the most appropriate for this application. Results were promising within the testing range (0 to 200 µS): 69% of measurements fell within ±2 µS error range and 9% up to ±5 µS. These findings support the feasibility of the proposed method as a replacement for the discontinued device. Further testing is recommended to enhance validation, especially with the suggested LCR-type multimeter, which could refine the approach and confirm its reliability. Future research could expand on these findings to establish a robust, portable quality control method for anodized aluminum

    Desenvolvimento de um produto funcional inovador com incorporação de biomassa de macroalga

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    Tese de Mestrado, Biologia Humana e Ambiente, 2025, Universidade de Lisboa, Faculdade de CiênciasO consumo de alimentos à base de algas tem sido impulsionado devido aos benefícios para a saúde que lhes são atribuídos. As algas, um recurso sustentável, são assim uma matéria-prima valiosa para a indústria alimentar pois apresentam uma composição interessante do ponto de vista nutricional. O objetivo deste trabalho centrou-se no estudo de macroalgas alvo como potencial ingrediente para o desenvolvimento de um produto funcional comercialmente viável. As algas selecionadas foram a Gracilaria gracilis (colhida em 2022 e 2023) e duas do género Codium (colhidas em 2023). Foi determinada a composição química aproximada, perfil de ácidos gordos, teor de polifenóis totais e atividades antioxidante e anti-inflamatória. Foi também estudada a bioacessibilidade dos compostos/bioatividades alvo, usando um modelo in vitro que simula a digestão humana. Dos resultados, destacam-se os obtidos nos extratos aquosos da G. gracilis 2023, como o teor de polifenóis totais (213,2 ± 6,7 mg GAE/100g ps), as atividades antioxidante, medida pelo DPPH (cerca de 53 mg eq AA/100g ps) e ABTS (2558,4 ± 422,3 µmol [Trolox]/100g ps), e anti-inflamatória (36,9 ± 12,5% de inibição da COX-2). Esta alga foi assim selecionada como ingrediente funcional do produto a desenvolver, uns raviolis, incorporando 1,4% (p/p) da sua biomassa liofilizada na massa destes. O produto desenvolvido, principalmente após tratamento culinário, nem sempre refletiu o potencial da alga como ingrediente funcional. Precisamente, os raviolis com alga crus apresentaram uma atividade anti-inflamatória maior comparativamente com os cozinhados (ao redor de 62 e 43 % de inibição da COX-2, respetivamente). Relativamente à bioacessibilidade, salienta-se que nos extratos etanólicos da G. gracilis, o teor de polifenóis totais aumentou após a digestão, já nas restantes amostras houve uma redução das atividades. Considerando a aplicação destas algas como ingrediente funcional, conclui-se que serão necessários mais estudos focados na maximização da biodisponibilidade dos compostos/bioatividades alvo.The consumption of seaweed-based foods has been boosted due to the health benefits attributed to them. Seaweed, a sustainable resource, is therefore a valuable raw material to the food industry as it presents an interesting composition from a nutritional point of view. The purpose of this work was to study macroalgae as a potential ingredient for the development of a commercially viable functional product. The seaweed selected were Gracilaria gracilis (harvested in 2022 and 2023) and two of the Codium genus (harvested in 2023). The approximate chemical composition, fatty acid profile, total polyphenol content and antioxidant and anti-inflammatory activities were determined. The bioaccessibility of the target compounds/bioactivities was also studied using an in vitro model that simulates human digestion. Among the results, those obtained in aqueous extracts of G. gracilis 2023 stood out, such as the total polyphenol content (213,2 ± 6,7 mg GAE/100g dw), antioxidant activities measured by DPPH (around 53 mg eq AA/100g dw) and ABTS (2558,4 ± 422,3 µmol [Trolox]/100g dw), and anti-inflammatory activity (36,9 ± 12,5 % COX-2 inhibition). This seaweed was therefore selected as the functional ingredient in the product to be developed, ravioli, incorporating 1,4% (w/w) of its freeze-dried biomass into the dough. The developed product, especially after culinary treatment, did not always reflect the seaweed´s potential as a functional ingredient. In fact, raw seaweed ravioli showed greater anti-inflammatory activity than the cooked ravioli (around 62 and 43% COX-2 inhibition, respectively). Regarding bioaccessibility, it should be noted that in the G. gracilis ethanolic extracts, the content of total polyphenols increased after digestion, while in the remaining samples there was a reduction in activity. Considering the application of these algae as a functional ingredient, it can be concluded that further studies will be needed to maximize the bioavailability of the target compounds/bioactivities

    Treatment and cure of HIV infection : available drugs, resistance pathways, and promising new compounds

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    Human immunodeficiency virus types 1 and 2 (HIV-1 and HIV-2) are the cause of acquired immunodeficiency syndrome (AIDS). What was once a death sentence has become a chronically manageable condition with the introduction of antiretroviral therapy (ART). Although HIV-2 infection has a much lower prevalence than HIV-1 infection, its intrinsic resistance to specific classes of antiretroviral drugs (ARVs) presents substantial challenges in the treatment of affected individuals. Recognizing the importance of addressing these challenges, our research focuses on the identification of drug resistance mutations and the exploration of novel compounds to devise more potent treatment strategies tailored specifically to HIV-2 infection. In the initial segment of this thesis, we present two key projects: The first project involves identifying resistance mutations in people living with HIV-2 experiencing treatment failure in Cape Verde. The second project aims to analyze the efficacy of integrase inhibitors and a new spiro-β-lactam compound against both naïve and raltegravir (RAL)-resistant isolates from Portuguese HIV-2-infected individuals. The initial project outcomes revealed a high prevalence (76.5%) of resistance mutations in people from Cape Verde living with HIV-2 experiencing virological failure. These mutations, located in the reverse transcriptase (RT) and protease (PR), confer resistance against the majority of RT and PR inhibitors. This underscores the imperative for incorporating integrase inhibitors into treatment regimens to effectively address this resistance. In the second project, the results confirmed the robust efficacy of integrase inhibitors, specifically RAL and DTG, against HIV-2 isolates. This aligns with the established clinical efficacy of RAL and DTG in managing HIV-2 infection. The compelling activity observed with the new integrase inhibitor BIC and the novel spiro-β-lactam BSS-730A, even in the face of multi-drug resistant isolates, holds promising prospects for the clinical application of these drugs. While ART has undeniably transformed the landscape of HIV management, the pursuit of an HIV cure remains a crucial endeavor to alleviate the enduring burden of lifelong therapy. Achieving a cure necessitates the elimination of latent virus reservoirs, making a functional cure a more pragmatic goal. Consequently, the second segment of this thesis encompasses two projects dedicated to advancing our understanding and contributing to the cure of HIV infection. The first project entails the development and antiviral evaluation of a compound, Apsi510, which combines an anti-integrase aptamer (T30695) with a small interfering RNA (siRNA) targeting the TAR/poly A region of HIV-1. Notably, the Apsi510 compound exhibited potent antiviral activity against HIV-1, with a remarkable inhibition of over 95% of viral replication observed at a concentration of 50 nM. The siRNA, designed to target the TAR/poly A region, demonstrated efficacy in inhibiting viral transcription, suggesting its potential application in a functional cure approach. In the second project, the investigation into the role of FUBP3 in the regulation of HIV transcription revealed promising findings. Depletion of FUBP3 resulted in a substantial reduction in viral messenger RNA and p24 protein, indicating a significant inhibition of HIV replication. This inhibition persisted even in the presence of an HIV transcription activator compound. Furthermore, the results underscored that the inhibition of FUBP3 protein expression led to a diminished recruitment of RNA polymerase II to the HIV-1 promoter, emphasizing the pivotal role of FUBP3 in the regulation of HIV transcription. As such, these findings position FUBP3 as a compelling candidate for consideration as a potential target in functional cure strategies, particularly through the block-and-lock approach. In summary, our data significantly contributes to the ongoing development of advanced algorithms aimed at predicting treatment susceptibility for HIV-2 infection. Additionally, our research introduces novel compounds that hold promise for the treatment of HIV-2 infection. Furthermore, we present a novel and potent HIV-1 antiviral compound that has potential implications for advancing strategies towards the cure of HIV-1 infection. Concurrently, our work underscores the viability of FUBP3 as a target for functional cure strategies in HIV infection. It is imperative to acknowledge that the ultimate goal in the battle against HIV infection lies in a comprehensive approach, combining multiple strategies and the judicious use of ART. Furthermore, recognizing the unique characteristics of HIV-2, including its lower infectivity and propensity for latency, underscores the importance of tailoring strategies specifically to HIV-2. Insights derived from such tailored approaches may prove instrumental in the development of effective functional cure strategies.(AKDN)–Portugal Collaborative Research Network in Portuguese- speaking countries in Africa (332821690)Bristol-Myers Squibb Partnering for cure grant AI424-54

    the role of noncovalent interactions

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    Noncovalent interactions are essential for several biological processes, such as solvation and drug absorption. In this context, halogen bonds (XBs) are often overlooked despite their relevance in biological systems. Indeed, halogenation is a common strategy to improve drug pharmacokinetics, with many halogenated compounds in clinical use; however, the anisotropic nature of halogen is often not considered in in silico approaches. In this work, the impact of noncovalent interactions in solvation, with a special focus on XBs, was studied using two approaches: an implicit (faster) and an explicit solvent (more detailed) model. We provided optimized parameters, namely halogen PB radii (ropt), and validated the use of extra-points (EP), a simple strategy to account for the halogen anisotropy using empirical force fields, for MD simulations. This work showed that describing the halogen anisotropy is important even for the weakest XB donors, leading to an improvement of the calculated hydration free energies. Since desolvation plays an important role in protein-ligand systems, the use of optimized parameters was also assessed in the determination of binding free energies, with the description of halogen anisotropy in combination with ropt, achieving higher correlations with the experimental values. In the context of membrane permeability and noncovalent interactions, the literature is biased towards hydrogen bonds (HBs). To tackle this issue, the study of other noncovalent interactions was assessed for six currently used halogenated drugs, providing valuable insights about the use of EPs and the determination of the membrane permeability coefficients, showing that the use of this charge model does not impair the sampling of HBs. In addition, the synthesis of a library of structurally identical compounds was undertaken aiming to study the substituent effect on membrane permeability. The validation of a proper procedure to measure their permeability in Caco-2 cells is ongoing

    Digital leadership scale : conceptualization, development and validation

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    Doutoramento em GestãoDigital transformation has changed how people think, work, and interact. Moreover, the COVID-19 pandemic has quickly changed the digital setting, and leaders must adapt to a new digital scenario to thrive. Thus, digital leadership (DL) has become a key element in the challenges of digital transformation. As leadership is context-related, it is paramount to identify the leadership capabilities needed to perform in the digital setting and prepare the leaders to perform their roles in this scenario better. The main objective of this thesis is to answer the research question – What are the structure and attributes to measure DL? To answer this question, we have divided the research into three parts, i) theoretical, ii) qualitative, and iii) quantitative. The first part presents the theoretical articles that aimed to establish the state of the art of research on DL construct (Chapter 2) and propose the theoretical model to be studied (Chapter 3). In Chapter 2, we used Bibexcel for the bibliometric study and VOSviewer software for building, displaying, and exploring a bibliometric map supported by network data. In Chapter 3, we explored and proposed an integrated model of the DL's main capabilities for theoretical directions before moving to the empirical chapters. This chapter used a multi-method approach using a four-round Delphi panel with 24 experts working in six countries and content analysis for the qualitative data. This theoretical part's main results show that DL evolved from the e-leadership construct, and it is an emerging field of study. Moreover, this part reveals the main DL capabilities gathered from the academic and practitioner perspective. In the empirical studies (second part), we address specific gaps in leaders' behaviors for the digital transformation scenario and the development and validation of the DL scale (third part). In the second part (Chapters 4, 5, and 6), we conduct qualitative studies focusing on three leaders’ capabilities (outcomes) identified in the theoretical part: trustworthiness (Chapter 4), creativity (Chapter 5), and innovation (Chapter 6). These qualitative studies aimed to deepen the analysis and understanding of some main DL topics we selected from the theoretical analysis. We used fuzzy-set qualitative comparative analysis (fsQCA) to identify the causal configurations that lead to the presence and absence of the studied outcome. Our main results show the challenges and opportunities to develop DL behaviors to thrive in the digital setting. Leaders and organizations need to be aware of the desired DL behaviors to train, develop and incorporate them into practice. Moreover, to identify the behaviors that should be avoided. We develop and validate the DL scale in the third part (Chapter 7). We used a quantitative approach, performing two studies with different samples of 229 responses each from Portuguese workers. First, we conducted an Exploratory Factorial Analysis (EFA) using IBM SPSS software to instrument purification. Afterward, we performed a Confirmatory Factorial Analysis (CFA) using SmartPLS software to examine the scale validity, reliability, and latent structure. The final validated DL scale is a practical short-measure tool for organizations. This thesis is pioneering in using a mixed and multi-method approach to integrate an academic and practitioner perspective by empirically testing DL. This process allowed us to link the constructs to DL, to understand how leaders and employees perceive them and how to behave in organizations in the digital era. This thesis contributes to integrating DL theories and practices through leadership capabilities. Our outcomes provide a comprehensive analysis through the characteristics and relationships of the DL field of publications, offering a holistic perspective on the domain of DL. This thesis differentiates the concept of DL and e-leadership while providing a broad perspective of DL capabilities. Therefore, helping practitioners to focus on the main leadership capabilities to thrive in digital times. Regarding the qualitative studies on specific leadership capabilities (i.e., trustworthiness, creativity, and innovation), the results identify different outcomes to encourage practitioners to engage in the behaviors needed to result in a leader´s trustworthiness, creative, and innovative behaviors. Furthermore, recruitment and selection-specific rules and HR management practices can promote training for leaders to simulate the desired behaviors in the organization. Nonetheless, qualitative studies also provide different outcomes that the leader should avoid. Managers should avoid the behaviors associated with untrustworthy leadership that will most likely result in distrust, the profiles to uncreative problem-solving behavior, and the paths that lead to an absence of innovative leadership. Finally, the validated DL scale contributes to integrating the dimensions related to the digital environment. The scale's generic characteristics allow it to be used in diverse contexts worldwide. The proposed scale may serve as an internal diagnostic tool to map the DL capabilities most widely adopted in the organization and the ones that need to be developed. Therefore, the organization can more easily assess these capabilities by identifying employees with the capability for DL and helping identify others who may benefit from specific attention and coaching. Finally, our scale can be used for managers to devise leadership strategies in the capabilities identified in this study to achieve and sustain organizational longevity.A transformação digital mudou a forma como as pessoas pensam, trabalham e interagem. Além disso, a pandemia do COVID-19 mudou rapidamente o cenário digital e os líderes tiveram que se adaptar a um novo cenário digital para prosperar. A transformação digital representa desafios para os líderes e para as organizações em como lidar com riscos e incertezas constantes. Nesse cenário, o líder digital tornou-se um elemento-chave no esforço de modernização das organizações à medida que vivenciam novos desafios devido à disrupção digital. Além disso, as organizações devem estar cientes das principais competências necessárias dos líderes para prosperarem no ambiente digital. Como a liderança está relacionada ao contexto, é fundamental identificar as competências de liderança necessárias para atuar no ambiente digital e preparar os líderes para desempenhar melhor as suas funções nesse cenário. Assim, a liderança digital tornou-se um elemento-chave nos desafios da transformação digital. O objetivo principal desta tese é responder à questão de pesquisa – Qual é a estrutura e os atributos para medir a liderança digital? Para responder a esta questão, dividimos a pesquisa em três partes, i) teórica, ii) qualitativa e iii) quantitativa. A primeira parte apresenta os artigos teóricos que visaram estabelecer o estado da arte da pesquisa sobre o construto liderança digital (Capítulo 2) e propor o modelo teórico a ser estudado (Capítulo 3). No Capítulo 2, usamos o Bibexcel para o estudo bibliométrico para estudar o material bibliográfico e mapear o campo de pesquisa sem viés subjetivo. Utilizamos também o software VOSviewer para construir, exibir e explorar o mapa bibliométrico suportado por dados de rede. O VOSviewer permite visualizações das informações nos quais os nós da rede representam unidades de análise (por exemplo, documentos, autores, periódicos, palavras) e os laços da rede representam conexões de similaridade, estando os mais fortes mais próximos um do outro. Os resultados informam que a liderança digital é um campo emergente, pois ainda não entrou em seu estágio de maturidade, mostrando a relevância e atualidade do tema. As conclusões através de uma análise de palavras-chave detetaram, quer na análise bibliométrica quer na análise de rede, que o termo “digital” se tornou mais relevante para o tipo de desafio que as organizações enfrentam atualmente, passando de “e-liderança” e “virtual” para “digital ”. No Capítulo 3, exploramos e propusemos um modelo integrado das principais competências da liderança digital para direções teóricas antes de passar para os capítulos empíricos. Este capítulo usou uma abordagem multimétodo usando um painel Delphi de quatro rodadas com 24 especialistas trabalhando em seis países e análise de conteúdo para os dados qualitativos. Os principais resultados desta parte teórica mostram que a liderança digital evoluiu a partir do construto de e-leadership, sendo um campo de estudo emergente. Como a liderança está relacionada ao contexto, as descobertas informam que embora muitas competências de liderança permaneçam as mesmas (por exemplo, ter visão e direção), as características da transformação digital também exigem novas competências dos líderes (por exemplo, ser digital e tecnológico). Nesse cenário, a liderança digital será um elemento regular e padrão em uma sociedade digital, e os estudiosos da liderança devem analisar as implicações da transformação digital para a organização. Além disso, esta parte do estudo da tese revela as principais competências da liderança digital reunidas sob a perspectiva acadêmica e profissional. Nos estudos empíricos (segunda parte), abordamos lacunas específicas nos comportamentos dos líderes para o cenário de transformação digital e o desenvolvimento e validação da escala de liderança digital (terceira parte). Na segunda parte (Capítulos 4, 5 e 6), realizamos estudos qualitativos com foco em três competências (resultados) dos líderes identificadas na parte teórica: confiabilidade (Capítulo 4), criatividade (Capítulo 5) e inovação (Capítulo 6). Esses estudos qualitativos visaram aprofundar a análise e compreensão de alguns dos principais tópicos da liderança digital que selecionamos a partir da análise teórica. Utilizamos a análise qualitativa comparativa (fsQCA) para identificar as configurações causais que levam à presença e ausência do resultado estudado. Nossos principais resultados mostram os desafios e oportunidades para desenvolver comportamentos de liderança digital para prosperar no ambiente digital. Líderes e organizações precisam estar atentos aos comportamentos da liderança digital desejados para treiná-los, desenvolvê-los e incorporá-los à prática. Além disso, identificar os comportamentos que devem ser evitados. Desenvolvemos e validamos a escala de liderança digital na terceira parte (Capítulo 7). Recorremos a uma abordagem quantitativa, realizando dois estudos com diferentes amostras de 229 respostas cada uma de trabalhadores portugueses. Primeiro, realizamos uma Análise Fatorial Exploratória usando o software IBM SPSS para a purificação do instrumento. Posteriormente, realizamos uma Análise Fatorial Confirmatória usando o software SmartPLS para examinar a validade, fiabilidade e estrutura latente da escala. Os resultados mostraram que os dois fatores confirmados denominados “liderar em um ambiente dinâmico” e “habilitar equipes dinâmicas” reforçaram que algumas capacidades de liderança são mais evidentes devido à transformação digital (por exemplo, mudança constante e adaptabilidade). Outra característica da escala é que a aprendizagem ao longo da vida e o compartilhamento de informações podem ser fundamentais para capacitar intelectualmente os trabalhadores na era do conhecimento. As evidências da escala de liderança digital validada mostraram que está em consonância com outras escalas de liderança, focando nos aspectos específicos do tema desenvolvido (liderança digital). Além disso, trata-se de uma ferramenta curta e prática para as organizações. Esta tese é pioneira no uso de uma abordagem mista e multimétodos para integrar uma perspectiva acadêmica e profissional, testando empiricamente a liderança digital. Esse processo permitiu vincular diferentes constructos à liderança digital, entender como os líderes e colaboradores os percebem e como se comportar nas organizações na era digital. Esta tese contribui para integrar teorias e práticas de liderança digital por meio de competências de liderança. Nossos resultados fornecem uma análise abrangente por meio das características e relacionamentos do campo de publicações da liderança digital, oferecendo uma perspectiva holística sobre este domínio. Esta tese diferencia o conceito de liderança digital e e-leadership, ao mesmo tempo em que fornece uma perspectiva ampla das competências da liderança digital. Portanto, ajudando os profissionais a se concentrarem nas principais competências de liderança para prosperar em tempos digitais. Em relação aos estudos qualitativos sobre competências específicas da liderança (ou seja, confiabilidade, criatividade e inovação), os resultados identificam diferentes resultados para incentivar os profissionais a se envolverem nos comportamentos necessários para resultar em comportamentos confiáveis, criativos e inovadores de um líder. Além disso, regras específicas de recrutamento e seleção e práticas de gestão de RH podem promover o treinamento de líderes para simular os comportamentos desejados na organização. No entanto, estudos qualitativos também fornecem resultados diferentes que o líder deve evitar. Os gerentes devem evitar os comportamentos associados à liderança não confiável que provavelmente resultarão em desconfiança, os perfis de comportamento não criativo na solução de problemas e os caminhos que levam à ausência de liderança inovadora. Por fim, a escala de liderança digital validada contribui para a integração das dimensões relacionadas ao ambiente digital. As características genéricas da escala permitem que ela seja utilizada em diversos contextos em todo o mundo. A escala proposta pode servir como uma ferramenta de diagnóstico interno para mapear as capacidades da liderança digital mais amplamente adotadas na organização e aquelas que precisam ser desenvolvidas. Portanto, a organização pode avaliar mais facilmente esses recursos identificando funcionários com capacidade para a liderança digital e ajudando a identificar outros que podem se beneficiar de atenção e treinamento específicos. Finalmente, nossa escala pode ser usada para que os gerentes criem estratégias de liderança nas competências identificadas neste estudo para alcançar e sustentar a longevidade organizacional.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

    Incorporating the genomic signature of environmental Mycobacterium bovis into transmission models of animal tuberculosis under a phylodynamics conceptual framework

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    Animal tuberculosis (TB) remains an impacting animal and public health problem worldwide. This disease, affecting a wide range of mammal species, is primarily caused by Mycobacterium bovis. National authorities tackle animal TB mainly through culling programmes focused on cattle, overlooking transmission in wildlife and infection via the environment. This dissertation thus aimed at improving our understanding of the transmission processes of M. bovis/M. caprae at interfaces, via the development, application, and integration of novel tools to support data-driven intervention. We developed eco-phylodynamic frameworks informed by pathogen whole genome sequencing (WGS) data, representing a multi-host transmission system in Portugal, at the livestock-wildlife interface. We found evidence for the co-circulation of M. bovis Eu1, Eu2, and Eu3 clonal complexes, enlightening Eu2 emergence and spread processes, showing most host transitions are intraspecific, while interspecific transmission between wildlife species, and between wild boar and cattle, are highly supported. We report the first phylodynamic analysis of Eu3 in Iberia and, via ecological modelling, we show most host transitions occurred toward higher temperature and precipitation and lower agriculture, road, and host density. Phylogeographic reconstruction evidenced frequent transmission between two ecological clusters, representing an ecological corridor of unrecognised importance. Due to the historic inability to isolate environmental M. bovis, in this dissertation, an innovative single-cell workflow was developed, enabling quantification and sorting of viable and dormant M. bovis cells from natural substrates, showing widespread environmental contamination in animal aggregation spots. Whole genome enrichment and WGS enabled assessment, for the first time, of phylogenomic relatedness of environmental and animal M. bovis strains, showing these genomes are highly intertwined, with data supporting environmental contamination by shedding animals and pointing the environment as source of new infections. This dissertation offers ground-breaking insights, with implications for animal TB policy formulation, advocating the inclusion of genomic and environmental surveillance in control programmes

    Whole-organism vaccines against Plasmodium vivax malaria

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    Tese de mestrado, Microbiologia Aplicada, 2025, Universidade de Lisboa, Faculdade de CiênciasMalaria is a mosquito-borne infectious disease caused by protozoan parasites of the genus Plasmodium and remains one of the most prevalent and devastating human infectious diseases worldwide, affecting primarily children under 5 years old. Among the five Plasmodium species that cause malaria in humans, P. vivax (Pv) is the most geographically spread, but is often disregarded due to the misconception that infection by this parasite is benign or mild. Additionally, its ability to form hypnozoites, dormant parasite forms that can lead to disease relapses, poses an additional obstacle to eradicating malaria. Despite the progress and efforts put into malaria control measures, there is still a long way to go in developing a safe and effective malaria vaccine. Whole-organism vaccination is a promising immunization strategy that has been successfully employed to immunize against P. falciparum (Pf) malaria using attenuated sporozoites of this human-infective Plasmodium species. However, whole-organism vaccines against Pv have been, so far, impossible to produce in large amounts. Recently, a platform that relies on the transgenesis of the rodent P. berghei (Pb) parasite to deliver antigens of their human-infective counterparts has been developed as a safe “naturally attenuated” whole-organism vaccination approach. Here, we present a pre-clinical characterization of novel whole-organism vaccine candidates using the Pb platform to deliver Pv antigens related to one or more of the stages of this parasite’s life cycle, including the Pv thrombospondin-related anonymous protein (PvTRAP) and the Pv Duffy-binding protein (PvDBP). The parasite fitness of the genetically engineered parasite lines PbviVacchi-PvTRAP and PbviVacchi-PvDBP was not impaired and the inserted Pv antigens were confirmed to be expressed at the mRNA level. However, only the immunization of rodents with PbviVacchi-PvTRAP, but not PbviVacchi-PvDBP, elicited a humoral response against the newly added Pv antigen

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