Tesis Doctorals en Xarxa
Not a member yet
46997 research outputs found
Sort by
Los revestimientos marmóreos en el territorio de la Provincia Hispania Citerior Tarraconensis: materiales, modelos y talleres a partir de los sectilia y otras decoraciones pavimentales y parietales
No full textAquesta tesi, titulada "Els revestiments de marbre en el territori de la Provincia Hispania Citerior Tarraconensis: materials, models i tallers a través de l'estudi dels sectilia i altres decoracions parietals i pavimentals des del segle I al V d. C.", examina el fenomen del marbre en la decoració arquitectònica dins dels paràmetres cronològics i geogràfics daus.
Gairebé trenta anys després de la publicació de la monografia de Pérez Olmedo, els avanços tant en la recerca arqueològica com en la arqueometria han conduït a noves direccions i interpretacions. Aquests avanços han reformulat molts dels conceptes teòrics i metodològics prèviament assumits per a caracteritzar aquests tipus de revestiments. El provocat una revaluació de tals obres coordinant dos camps principals d'anàlisis: l'estudi de les fonts arqueològiques i l'anàlisi de les relacions comercials.
Aquests nous horitzons han obligat a crear una nova i completa sèrie d'eines per a desenvolupar un estudi ampli que inclogui no sols sectilia, sinó també altres revestiments de marbre que no poden atribuir-se a aquesta tècnica, els quals també representen una figura important en el comerç, treball i ús del marbre per a l'ornamentació arquitectònica.
Per tant, s'ha formulat un enfocament actualitzat dels revestiments marmoris ornamentals a la Provincia Tarraconensis, desenvolupant noves metodologies per a abordar contextos complexos. Així, ha estat possible obtenir dades noves i completes sobre la distribució temporal i espacial, tallers i materials involucrats en l'ornamentació arquitectònica d'aquest territori provincial.
En resum, la qual cosa aquí es presenta és un enfocament multidisciplinari d'un element de la història de l'art romà, basat en un estudi multifocal. Encara que limitat a una àrea específica, la intenció és clara: aprofundir en el coneixement de l'ús i difusió del marmor a Hispania, entenent-ho com un vehicle de transmissió d'idees, estatus social i vincles polítics.Esta tesis, titulada "Los revestimientos de mármol en el territorio de la Provincia Hispania Citerior Tarraconensis: materiales, modelos y talleres a través del estudio de sectilia y otras decoraciones parietales y pavimentales desde el siglo I al V d.C.", examina el fenómeno del mármol en la decoración arquitectónica dentro de los parámetros cronológicos y geográficos dados.
Casi treinta años después de la publicación de la monografía de Pérez Olmedo, los avances tanto en la investigación arqueológica como en la arqueometría han conducido a nuevas direcciones e interpretaciones. Estos avances han reformulado muchos de los conceptos teóricos y metodológicos previamente asumidos para caracterizar estos tipos de revestimientos. Lo provocado una revaluación de tales obras coordinando dos campos principales de análisis: el estudio de las fuentes arqueológicas y el análisis de las relaciones comerciales.
Estos nuevos horizontes han obligado a crear una nueva y completa serie de herramientas para desarrollar un estudio amplio que incluya no solo sectilia, sino también otros revestimientos de mármol que no pueden atribuirse a esta técnica, los cuales también representan una figura importante en el comercio, trabajo y uso del mármol para la ornamentación arquitectónica.
Por lo tanto, se ha formulado un enfoque actualizado de los revestimientos marmóreos ornamentales en la Provincia Tarraconensis, desarrollando nuevas metodologías para abordar contextos complejos. Así, ha sido posible obtener datos nuevos y completos sobre la distribución temporal y espacial, talleres y materiales involucrados en la ornamentación arquitectónica de este territorio provincial.
En resumen, lo que aquí se presenta es un enfoque multidisciplinario de un elemento de la historia del arte romano, basado en un estudio multifocal. Aunque limitado a un área específica, la intención es clara: profundizar en el conocimiento del uso y difusión del marmor en Hispania, entendiéndolo como un vehículo de transmisión de ideas, estatus social y vínculos políticos.This dissertation, entitled "The marble coverings in the territory of the Provincia Hispania Citerior Tarraconensis: materials, models and workshops through the study of sectilia and other wall and floor decorations from the 1st to the 5th centuries AD", examines the phenomenon of marble through architectural decoration within the chronological and geographical parameters given.
Almost thirty years after the publication of Pérez Olmedo's monograph, advances in both archaeological and archaeometric research have led to new directions and interpretations. These advances have reshaped many of the theoretical and methodological concepts previously assumed to characterize these types of decorative revetments. They have made it necessary to re-evaluate such works by coordinating two main fields of analysis: the study of archaeological sources and the analysis of commercial relations.
These new horizons have obliged us to create a new, comprehensive toolbox to develop a broad study that includes not only sectilia, but also other marble revetments that cannot be attributed to this technique, which also represent an important figure in the trade, work and use of marble for architectural ornamentation.
Therefore, it has been formulated an updated approach to the ornamental marmor revetments in the Provincia Tarraconensis. In addition, it has been developed new methodologies to deal with complex contexts. It has thus been possible to obtain new and complete data on the temporal and spatial distribution, workshops and materials involved in the architectural ornamentation of this provincial territory.
In short, what is presented here is a multidisciplinary approach to an element of Roman art history, based on a multifocal study. Although limited to a specific area, the intention is clear: to deepen knowledge of the use and diffusion of marble in the Iberian Peninsula, understanding it as a vehicle for the transmission of ideas, social status and political ties
Advanced Catalytic Materials and Systems for Electroconversion of Carbon Dioxide to Ethylene
No full textMentre que la gran dependència dels combustibles fòssils convencionals és directament proporcional als nivells de CO2 a l'atmosfera, la necessitat de desenvolupar sistemes fiables per a la conversió de CO2 és força important i és un requisit fonamental per satisfer les demandes energètiques globals. L'ECO2R, juntament amb electricitat renovable, ha demostrat ser una estratègia prometedora per convertir directament CO2 en productes de valor afegit. Desenvolupar electrocatalitzadors avançats robusts a base de Cu i Cu i la seva integració successiva en elèctrodes de difusió de gas (GDEs) i sistemes d'electròlisi per a una ECO2R eficient i altament selectiva a C2H4 és una necessitat que s'ha de complir. A partir dels resultats definits, es va demostrar que no només són els materials catalítics avançats, sinó també l'optimització dels sistemes d'electrodes i electròlisi, els que juguen un paper crucial en la millora general de l'electroconversió de CO2 a C2H4.Mientras que la gran dependencia de los combustibles fósiles convencionales es directamente proporcional a los niveles de CO2 en la atmósfera, la necesidad de desarrollar sistemas confiables para la conversión de CO2 es bastante importante y es un requisito fundamental para satisfacer las demandas energéticas globales. La ECO2R, junto con electricidad renovable, ha demostrado ser una estrategia prometedora para convertir directamente CO2 en productos de valor añadido. Desarrollar electrocatalizadores avanzados robustos a base de Cu y Cu y su integración sucesiva en electrodos de difusión de gas (GDEs) y sistemas de electrólisis para una ECO2R eficiente y altamente selectiva a C2H4 es una necesidad que debe cumplirse. A partir de los resultados definidos, se demostró que no solo son los materiales catalíticos avanzados, sino también la optimización de los sistemas de electrodos y electrólisis, los que desempeñan un papel crucial en la mejora general de la electroconversión de CO2 a C2H4.While the large dependency on conventional fossil fuels is directly proportional to the ever-increasing levels of CO2¬ in the atmosphere, the urge to develop reliable systems for CO2 conversion is quite important and is a strong requisite to meet the global energy demands. ECO2R coupled with renewable electricity is proven to be a promising strategy for directly converting CO2 to value-added products. Developing Cu and Cu-based functional advanced robust electrocatalysts and successive integration into gas diffusion electrodes (GDEs) and electrolyzer systems for an efficient and highly selective ECO2R to C2H4 is a necessity to accomplish. From the defined results, it was demonstrated that it is not only the advanced catalyst materials but also the optimization of the electrode and electrolyzer systems that play a substantial role in the overall enhancement of the electroconversion of CO2 to C2H4.Universitat Autònoma de Barcelona. Programa de Doctorat en Ciència de Material
Human footprints on bat’s health: exploring anthropogenic impacts
No full textEls ratpenats europeus han experimentat importants davallades poblacionals durant els últims 50 anys. Gairebé una quarta part d'aquestes espècies estan classificades com En Perill (EN) o Vulnerables (VU) per la Unió Internacional per a la Conservació de la Natura (UICN). La urgència per protegir aquestes espècies ha comportat un augment d'estudis enfocats a comprendre els desencadenants de les seves davallades poblacionals. Conseqüentment, milions de ratpenats europeus han estat marcats individualment amb anelles d'avantbraç. Encara que aquests estudis de captura-marcatge-recaptura han contribuït significativament al nostre coneixement sobre biologia i ecologia de ratpenats, l'ús d'anelles s'ha associat de manera repetida amb efectes negatius sobre la seva salut i fins i tot amb alguns esdeveniments de mortalitat massiva. A més, aquests estudis rarament incorporen aspectes sobre salut poblacional, àrea de coneixement que actualment es troba pràcticament inexplorada i que requeriria molta més atenció. Per exemple, l'anàlisi del microbioma fecal està considerat un mètode valuós des de fa anys per a avaluar la salut humana i animal, però en els ratpenats només s'ha començat a explorar recentment. Hipotetitzem que la salut de les poblacions de ratpenats podria veure's deteriorada per diverses activitats antropogèniques, com ara el marcatge individual i la intrusió de l’ésser humà en els seus hàbitats. A l'Estudi 1, vam avaluar l'impacte de les dues tècniques de marcatge més utilitzades en ratpenats, l'anella d'avantbraç i el microxip subcutani, recopilant la informació disponible de les principals institucions de recerca de ratpenats de Catalunya i avaluant totes dues tècniques en captivitat. El 55.1% (435/790) dels ratpenats salvatges recapturats amb anelles van presentar lesions associades amb aquesta tècnica. Cap ratpenat microxipat va mostrar lesions (n=446). Els 22 exemplars de Carollia perspicillata anellats en captivitat van mostrar lesions i comportaments de malestar degut a aquest mètode de marcatge, mentre que cap dels ratpenats microxipats (n=21) va mostrar tals problemes. Aquests resultats advoquen per l'establiment d'un comitè d'ètica referent al marcatge individual de ratpenats. Especialment, la innocuïtat de les anelles s’hauria d'avaluar per a cada espècie de ratpenat i en condicions de captivitat, on una taxa de recaptura completa és possible. Als Estudis 2 i 3, vam avaluar l'impacte de diverses activitats antropogèniques sobre l'estructura i composició del microbioma bacterià fecal, i sobre l'ocurrència i abundància de potencials bacteris patògens (PPB) de cinc espècies de ratpenats europeus (Miniopterus schreibersii, Nyctalus leisleri, Pipistrellus kuhlii, P. pipistrellus i P. pygmaeus). Per aquest motiu, vam realitzar la seqüenciació completa del gen 16S rRNA mitjançant l'ús del seqüenciador MinION™. L'assignació taxonòmica per l’anàlisi del microbioma es va realitzar a nivell de gènere bacterià, mentre que l'avaluació de les PPB es va realitzar a nivell d'espècie bacteriana. Tots dos estudis van mostrar que els ratpenats de paisatges urbans exhibien una menor diversitat alfa en comparació amb els de paisatges ben preservats (àrees naturals o d'agricultura extensiva). Vam identificar 222 PPB, incloent alguns patògens animals i humans reconeguts (Brucella abortus, Francisella tularensis) i altres (Yersinia enterocolitica) prèviament aïllats de mostres patològiques de cadàvers de ratpenats. No es va trobar correlació entre el tipus d'ús del sòl i l'ocurrència i abundància de PPB. Aquests resultats suggereixen que els paisatges ben preservats promouen microbiomes bacterians fecals més resilients en les espècies de ratpenats estudiades. Degut a la seva naturalesa no invasiva i facilitat de mostreig, l'anàlisi del microbioma fecal té el potencial de ser emprat com a indicador de salut per espècies de ratpenats insectívors. Amb l'objectiu de donar suport a les mesures de conservació dels ratpenats, els estudis en aquestes espècies han de mostrar un major compromís amb els codis de conducta ètica i prioritzar l'ús de tècniques de mostreig no invasives.Los murciélagos europeos han experimentado importantes declives poblacionales durante los últimos 50 años. Casi una cuarta parte de estas especies están clasificadas como En Peligro (EN) o Vulnerables (VU) por la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza (UICN). La urgencia por proteger estas especies ha comportado un aumento de estudios enfocados a comprender las causas de sus declives poblacionales. Consecuentemente, millones de murciélagos europeos han sido marcados individualmente con anillas de antebrazo. Aunque estos estudios de captura-marcaje-recaptura han contribuido significativamente a nuestro conocimiento sobre biología y ecología de murciélagos, el uso de anillas se ha asociado repetidamente a efectos negativos sobre su salud e incluso a eventos de mortalidad masiva. Además, estos estudios rara vez incorporan aspectos sobre salud, área de conocimiento prácticamente inexplorada en murciélagos y que requeriría mucha más atención. Por ejemplo, el análisis del microbioma fecal se considera un método valioso des de hace años para evaluar la salud humana y animal, pero en los murciélagos sólo se ha comenzado a explorar recientemente. Hipotetizamos que la salud de las poblaciones de murciélagos podría verse deteriorada por diversas actividades antropogénicas, tales como el marcaje individual y la intrusión humana en sus hábitats. En el Estudio 1, evaluamos el impacto de las dos técnicas de marcaje más utilizadas en murciélagos, la anilla de antebrazo y el microchip subcutáneo, recopilando la información disponible de las principales instituciones de investigación de murciélagos de Cataluña y evaluando ambas técnicas en cautividad. El 55.1% (435/790) de los murciélagos silvestres recapturados con anillas presentaron lesiones cutáneas asociadas con esta técnica. Ningún murciélago microchipado mostró lesiones (n=446). Los 22 ejemplares de Carollia perspicillata anillados en cautividad mostraron lesiones y comportamientos de malestar debido a este método de marcaje, mientras que ninguno de los murciélagos microchipados (n=21) mostró tales problemas. Estos resultados abogan por el establecimiento de un comité de ética al respecto del marcaje individual de murciélagos. Especialmente, la inocuidad de las anillas debería explorarse para cada especie de murciélago y en condiciones de cautividad, donde se posibilita una tasa de recaptura completa. En los Estudios 2 y 3, evaluamos el impacto de varias actividades antropogénicas en la estructura y composición del microbioma bacteriano fecal, y en la ocurrencia y abundancia de potenciales bacterias patógenas (PPB) de cinco especies de murciélagos europeos (Miniopterus schreibersii, Nyctalus leisleri, Pipistrellus kuhlii, P. pipistrellus y P. pygmaeus). Para ello, secuenciamos el gen 16S rRNA completo mediante el uso del secuenciador MinION™. La asignación taxonómica para los análisis del microbioma se realizó a nivel de género bacteriano, mientras que la evaluación de las PPB se realizó a nivel de especie bacteriana. Ambos estudios mostraron que las muestras de paisajes urbanos exhibían una menor diversidad alfa en comparación con las de paisajes bien preservados (áreas naturales o de agricultura extensiva). Análisis a nivel de especie bacteriana mostraron 222 PPB, incluidos algunos patógenos animales y humanos reconocidos (Brucella abortus, Francisella tularensis) y otros (Yersinia enterocolitica) previamente aislados de muestras patológicas de cadáveres de murciélagos. No se encontró correlación entre el tipo de uso del suelo y la ocurrencia y abundancia de PPB. Estos resultados sugieren que los paisajes bien preservados promueven microbiomas bacterianos fecales más resilientes en las especies de murciélagos estudiadas. Debido a su naturaleza no invasiva y facilidad de muestreo, el análisis del microbioma fecal tiene el potencial de ser utilizado como indicador de salud para las especies de murciélagos. Con el objetivo de apoyar las medidas de conservación de los murciélagos, los estudios en estas especies deben mostrar un mayor compromiso con los códigos de conducta ética y priorizar el uso de técnicas de muestreo no invasivas.European bat populations have experienced significant declines for the past 50 years. Consequently, nearly a quarter of these species are classified as Endangered (EN) or Vulnerable (VU) by the International Union for Conservation of Nature (IUCN). This urgent need for protection has led to increased research focused on understanding the drivers of such negative trends in their populations. In this context, millions of bats across Europe have been individually marked, mostly with forearm rings. Although these capture-mark-recapture studies have contributed significantly to our understanding of bats’ biology and ecology, the use of forearm rings in insectivorous bats has been repeatedly associated with negative health effects and even some mass mortality events. Additionally, these long-term studies have rarely incorporated bats’ health aspects, which currently represents an unexplored area requiring much more attention. For instance, fecal microbiome analysis is a valuable method to assess human and animal health, yet it remains underdeveloped for bat species. We hypothesized that the health of free-ranging European bat populations may be negatively affected by a range of anthropogenic activities, such as individual marking activities and human encroachment into bats’ habitats. In Study 1, we assessed the health impact of the two most used marking techniques in bat species, the forearm ring and the Passive Integrated Transponder (PIT) tag, collecting available information from the main bat research institutions from Catalonia (NE-Spain) and testing both techniques in captivity. We reported 55.1% (435/790) of recaptured free-ranging bats with forearm rings presenting skin lesions associated with this technique. No PIT-tagged bat showed lesions (n=446). In captivity, all 22 banded Carollia perspicillata showed skin lesions and discomfort behaviours due to forearm rings, while none of the PIT-tagged bats (n=21) exhibited such issues throughout the study. These results call for establishing an ethics committee within the framework of bat research involving individual marking activities. Particularly, the safety of forearm rings should be explored for each bat species and under captive conditions, where full recapture rates are possible. In Studies 2 and 3, we assessed the impact of human activities and types of land use on the structure and composition of the fecal bacterial microbiome, and on the occurrence and abundance of potential pathogenic bacteria (PPB) of five free-ranging European bat species (Miniopterus schreibersii, Nyctalus leisleri, Pipistrellus kuhlii, P. pipistrellus and P. pygmaeus). We used the full-length 16S rRNA gene metabarcoding with the nanopore long-read sequencer MinION™ to perform these analyses. Taxonomic assignment for the analyses of the microbiome structure, composition and diversity were performed at bacterial genus level, while the assessment of PPB was performed at bacterial species level. Both studies showed that samples from urban landscapes exhibited the lowest alpha diversity value compared to well-preserved landscapes (natural or extensive agriculture areas). Analyses at the bacterial species level showed 222 PPB, including some recognized animal and human pathogens (e.g. Brucella abortus and Francisella tularensis) and others (e.g. Yersinia enterocolitica) previously isolated from pathological samples of deceased European bats. No correlation was found between the land use type and the occurrence and abundance of PPB. These results suggest that well-preserved landscapes promote more resilient fecal bacterial microbiomes in the five studied bat species. We further highlighted the potential of microbiome studies reaching bacterial species-level resolution to be used in bat health studies. Owing to its non-invasive nature and simplicity of sampling, the fecal microbiome analysis has the potential to be used as a health indicator for bat species. This thesis also concludes that to gain knowledge about bats’ health while supporting bat conservation efforts, future studies must enhance their commitment to adhering to ethical standards and prioritize non-invasive techniques when working with bats.Universitat Autònoma de Barcelona. Programa de Doctorat en Medicina i Sanitat Animal
An analysis of the predicament of judicial practice and the protection of personality rights of women suffering domestic violence in China from the perspective of women’s rights
No full textENG- The role of women in marriage and the family is significant, also as China's feudal society developed, traditional marriage and family customs changed. After reaching its highest point in the matrilineal clan culture of antiquity, the standing of women in the family gradually decreased until it eventually reached its lowest point in the Confucian-influenced feudal society.
This thesis begins by examining the reasons for women's traditional marriages, and the dissolution of traditional marriages in the Tang, Song, and Ming dynasties as a starting point. It then delves into feminist perspectives and traditional Chinese family culture in the judicial practice of domestic violence and divorce cases, where women's experiences, as the most prevalent domestic violence victims, were facing the status quo of questioning from feminist perspectives.
It is almost impossible to explain the essence of domestic violence and provide corresponding theoretical support for the protection of victims from violence and the realization of women's human rights in traditional sociological and legal studies, which are based on the gender-blindnessof theory. Feminist analyses can offer a distinct theoretical and methodological viewpoint based on theoretical and practical demands, identifying the legal challenges victims confront, delving into the root causes of these issues, and offering solutions and improvements.
China's current legislative framework, including MLC, CCC, and ADVLC, addresses the issue of domestic violence. These legal documents aim to protect victims within marital relationships by offering judicial remedies, preventing, and suppressing domestic violence, and emphasizing the importance of ensuring the freedom to divorce. However, in judicial practice, female victims often face the problem that judicial decisions and women's understanding of their own experience are like two parallel lines that do not intersect, and for victims who are not at fault in a marriage, they are often unable to obtain physical security and economic relief through divorce proceedings for a variety of reasons in practice.
Chinese society has therefore advanced stronger demands for the realization of judicial justice in such instances considering the multiple legal challenges faced by victims in domestic violence divorce proceedings as well as the intricate structural factors behind them.
The current safeguards for victims need to be backed up not only by strong laws through protection and prevention, but also by putting these laws into practiceCAT- El paper de la dona en el matrimoni i la família és significatiu, també a mesura que es va desenvolupar la societat feudal xinesa, el matrimoni tradicional i els costums familiars van canviar. Després d'assolir el seu punt més alt en la cultura de clans matrilineal de l'antiguitat, la posició de les dones a la família va disminuir gradualment fins que finalment va arribar al seu punt més baix en la societat feudal d'influència confuciana.
Aquesta tesi comença examinant les raons dels matrimonis tradicionals de les dones, i la dissolució dels matrimonis tradicionals en les dinasties Tang, Song i Ming com a punt de partida. A continuació, s'aprofundeix en les perspectives feministes i la cultura familiar tradicional xinesa en la pràctica judicial dels casos de violència domèstica i divorci, on les experiències de les dones, com a víctimes de violència domèstica més prevalents, s'enfrontaven a l'statu quo de qüestionar-les des de perspectives feministes.
És gairebé impossible explicar l'essència de la violència domèstica i proporcionar el corresponent suport teòric per a la protecció de les víctimes de la violència i la realització dels drets humans de les dones en els estudis sociològics i jurídics tradicionals, que es basen en la ceguesa de gènere de la teoria. Les anàlisis feministes poden oferir una visió teòrica i metodològica diferent basada en demandes teòriques i pràctiques, identificant els reptes legals als quals s'enfronten les víctimes, aprofundint en les causes profundes d'aquests problemes i oferint solucions i millores.
El marc legislatiu actual de la Xina, inclosos MLC, CCC i ADVLC, aborda el problema de la violència domèstica. Aquests documents legals tenen com a objectiu protegir les víctimes dins de les relacions matrimonials oferint recursos judicials, prevenint i suprimint la violència domèstica i emfatitzant la importància de garantir la llibertat de divorci. No obstant això, en la pràctica judicial, les dones víctimes sovint s'enfronten al problema que les decisions judicials i la comprensió de les dones de la seva pròpia experiència són com dues línies paral·que no s'entrecreuen, i per a les víctimes que no tenen la culpa en un matrimoni, sovint no poden obtenir seguretat física i alleujament econòmic a través de procediments de divorci per diverses raons a la pràctica.
Per tant, la societat xinesa ha avançat demandes més fortes per a la realització de justícia judicial en aquests casos, tenint en compte els múltiples desafiaments legals als quals s'enfronten les víctimes en els procediments de divorci de violència domèstica, així com els intricats factors estructurals que hi ha darrere.
Les garanties actuals per a les víctimes han d'estar recolzades no només per lleis sòlides a través de la protecció i la prevenció, sinó també per la posada en pràctica d'aquestes lleisPrograma de Doctorat Interuniversitari en Dret, Economia i Empres
Elucidating the role of natural killer cells in hiv control and evaluation of a bispecific antibody to enhance their function
No full textEl virus de la immunodeficiència humana (VIH) causa una infecció crònica que afecta al sistema immunitari i, en absència de tractament, por conduir a la síndrome de la immunodeficiència adquirida (SIDA). El tractament antiretroviral (TAR) actual disponible pot suprimir la virèmia fins a nivells indetectables, restaurar la funció de les cèl·lules immunitàries, i reduir la mortalitat i morbiditat associades a la infecció, disminuint així el risc de transmissió. Tot i així, el TAR és incapaç d’eliminar completament el virus de les cèl·lules principalment degut a la formació de reservoris virals que permeten que el VIH quedi en un estat latent, invisible a l’acció del TAR i del sistema immune. A més, això implica que, en interrompre el tractament, la càrrega viral augmenta de nou a nivells detectables en poques setmanes. D’aquesta manera, els individus amb VIH requereixen la continua administració de TAR el llarg de tota la vida. Per aquesta raó, és necessari desenvolupar noves estratègies terapèutiques dirigides a curar la infecció per VIH. El desenvolupament de noves teràpies exigeix una comprensió profunda dels mecanismes que controlen el VIH i enfocaments que potenciïn les respostes immunològiques per eliminar el virus. Actualment, s’han descrit sis casos de curació del VIH, tots ells a través de transplantaments de cèl·lules hematopoètiques en pacients oncològics amb una mutació en el gen CCR5, que confereix resistència a la infecció per VIH amb virus amb tropisme R5. A més d’aquests casos, també existeixen els anomenats controladors d’èlit, individus amb VIH que són capaços de controlar la infecció d’una manera excepcional en absència de TAR. Per altra banda, les cèl·lules Natural Killer (NK) són candidates prometedores per la desenvolupament d’immunoteràpies contra el VIH, donada la seva potent activitat immunològica. En la present tesi es descriu, en primer lloc, el fenotip diferencial expressat per les cèl·lules NK en controladors d’èlit en comparació amb altres cohorts de persones amb VIH. S’observa que aquests individus tenen més cèl·lules NK de memòria, amb un fenotip particular que inclou l’expressió del marcador inhibidor NKG2A, i que són capaces de promoure respostes de tipus ADCC molt potents contra cèl·lules infectades. A més, aquestes cèl·lules presenten un perfil transcripcional caracteritzat per la sobreregulació de gens implicats en el metabolisme, migració, resposta efectora i resposta antiviral d’aquestes cèl·lules. En segon lloc, s’ha avaluat l’ús d’un anticòs biespecífic dirigit a les cèl·lules VIH+ i cèl·lules NK, tant in vitro com in vivo, en un model de ratolí humanitzat d’infecció per VIH. Els resultats mostren que l’anticòs biespecífic potencia l’acció de les cèl·lules NK en l’eliminació de les cèl·lules VIH+ en diversos contextos d’infecció viral. No obstant això, els resultats preclínics mostren una reducció de la població total de cèl·lules NK després d’una administració prolongada de l’anticòs, associada amb un pitjor control virològic després de la interrupció del TAR. En conclusió, aquesta tesi descriu una població de cèl·lules NK amb una potent resposta citotòxica contra cèl·lules infectades per VIH en controladors d’èlit, amb implicacions per al disseny de noves estratègies de cura funcional dirigides a l’eliminació dels reservoris virals, i destaca el potencial d’un anticòs biespecífic per a aplicacions en immunoteràpies dirigides a potenciar l’acció de les cèl·lules NK en la resposta anti-VIH.
El virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) causa una infección crónica que afecta al sistema inmunitario y, en ausencia de tratamiento, puede dar lugar al síndrome de la inmunodeficiencia adquirida (SIDA). El tratamiento antirretroviral (TAR) actual disponible es capaz de suprimir la viremia hasta niveles indetectables, restaurar la función de las células inmunitarias, y reducir la mortalidad y morbilidad asociadas a la infección, disminuyendo así el riesgo de transmisión. Sin embargo, el TAR es incapaz de eliminar completamente el virus de las células, principalmente debido a la formación de reservorios virales que permiten que el VIH quede en un estado latente, invisible a la acción del TAR y del sistema inmunológico. Esto implica que, al interrumpir el tratamiento, la carga viral aumenta de nuevo a niveles detectables en pocas semanas. De esta manera, las personas con VIH requieren la continua administración de TAR a lo largo de toda la vida. Por esta razón, es necesario desarrollar nuevas estrategias terapéuticas dirigidas a curar la infección por VIH. El desarrollo de nuevas terapias exige una comprensión profunda de los mecanismos que controlan el VIH y enfoques que potencien las respuestas inmunológicas para eliminar el virus. Actualmente, se han descrito seis casos de curación del VIH, todos ellos a través del trasplante de células hematopoyéticas con una mutación en el gen CCR5, que confiere resistencia a la infección por VIH con virus de tropismo R5, en pacientes oncológicos. Además de estos casos, también existen los llamados controladores de élite, individuos con VIH que son capaces de controlar la infección de una manera excepcional en ausencia de TAR. Por otro lado, las células Natural Killer (NK) son candidatas prometedoras para el desarrollo de inmunoterapias contra el VIH, dada su potente actividad inmunológica. En la presente tesis se describe, en primer lugar, el fenotipo diferencial expresado por las células NK en controladores de élite en comparación con otras cohortes de personas con VIH. Se observa que estos individuos tienen más células NK de memoria, con un fenotipo particular que incluye la expresión del marcador inhibidor NKG2A, y que son capaces de promover respuestas de tipo ADCC muy potentes contra células infectadas. Además, estas células presentan un perfil transcripcional caracterizado por la sobreexpresión de genes implicados en el metabolismo, migración, respuesta efectora y respuesta antiviral de estas células. En segundo lugar, se ha evaluado el uso de un anticuerpo biespecífico dirigido a las células VIH+ y células NK, tanto in vitro como in vivo, en un modelo de ratón humanizado de infección por VIH. Los resultados muestran que el anticuerpo biespecífico potencia la acción de las células NK en la eliminación de las células VIH+ en distintos contextos de infección viral. No obstante, los resultados preclínicos muestran una reducción de la población total de células NK después de la administración prolongada del anticuerpo, asociada a un peor control virológico tras la interrupción del TAR. En conclusión, la presente tesis describe una población de células NK con una potente respuesta citotóxica contra células infectadas por VIH en controladores de élite, con implicaciones para el diseño de nuevas estrategias de cura funcional dirigidas a la eliminación de los reservorios virales, y destaca el potencial de un anticuerpo biespecífico para aplicaciones en inmunoterapias dirigidas a potenciar la acción de las células NK en la respuesta anti-VIH.
The human immunodeficiency virus (HIV) causes a chronic infection that disrupts the immune system and, in the absence of treatment, can lead to acquired immunodeficiency syndrome (AIDS). The currently available antiretroviral treatment (ART) can suppress viremia to undetectable levels, restore immune cell function, and reduce the mortality and morbidity associated with the infection, thereby decreasing the risk of transmission. However, ART is unable to completely eliminate the virus from the cells, primarily due to the formation of viral reservoirs that allow HIV to remain in a latent state, rendering invisible to the action of ART and the immune system. Consequently, upon treatment interruption, the viral load increases again to detectable levels within a few weeks. Therefore, individuals with HIV require lifelong administration of ART. For this reason, it is essential to develop new therapeutic strategies aimed at achieving HIV cure. The development of new therapies requires a deep understanding of the mechanisms that control HIV as well as the development of approaches that enhance immune responses to eliminate the virus. To date, six cases of HIV cure have been described, all through hematopoietic stem cell transplants harboring mutations in the CCR5 gene, which confers resistance to HIV infection from R5-tropic virus, in cancer patients. In addition to these cases, there are also the so-called elite controllers, individuals that exhibit the exceptional ability to control HIV infection for prolonged periods in the absence of ART. Furthermore, Natural Killer (NK) cells are promising candidates for the development of immunotherapies against HIV due to their potent immunological activity. The present doctoral thesis describes the differential phenotype expressed by NK cells in elite controllers compared to other groups of people living with HIV. Here, we show that these individuals present higher frequencies of memory NK cells with a particular phenotype, including the expression of the inhibitory marker NKG2A, and that they can mediate robust ADCC responses against infected cells. Additionally, these cells exhibit a unique transcriptional profile characterized by the upregulation of genes involved in the metabolism, migration, effector and antiviral responses of these cells. Secondly, the use of a bispecific antibody to simultaneously target HIV-infected cells and NK cells has been evaluated both in vitro and in vivo in a humanized mouse model of HIV infection. The results show that the bispecific antibody enhances the action of NK cells in eliminating HIV+ cells in various contexts of viral infection. However, preclinical evaluation showed a reduction in the total NK cell population following sustained antibody administration, which was associated with poor virological HIV control after ART interruption. In conclusion, the present doctoral thesis describes a population of NK cells with potent cytotoxic responses against HIV-infected cells in elite controllers, with implications for the design of new functional cure strategies aimed at eliminating viral reservoirs, and highlights the potential of a bispecific antibody for the development of novel immunotherapies targeting NK cells for HIV control.Universitat Autònoma de Barcelona. Programa de Doctorat en Bioquímica, Biologia Molecular i Biomedicin
Mortalidad materna a principios del siglo XXI en los Altos de Chiapas, México: Violencia estructural y búsqueda de atención
No full textLa mortalitat materna continua sent un problema de salut significatiu al segle XXI, especialment a països de baixos
ingressos. Tot i els avenços globals, el 99% d'aquestes morts ocorren en països en desenvolupament, on la RMM és
20 vegades superior. Aquest problema destaca les disparitats en el desenvolupament econòmic i social, així com a
l'estatus de les dones, reflectint inequitats entre les dones i d'accés a serveis de salut.
El 2001, Chiapas, Mèxic, va registrar 87 morts maternes, 11 de les quals van ocórrer a la Regió Alts, notable per la
seva alta densitat de població indígena i nivells significatius de monolingüisme i analfabetisme. Les autòpsies verbals
van revelar 19 morts addicionals mal classificades per l'escassetat de personal mèdic i recursos de salut.
L'Organització Mundial de la Salut identifica la pobresa, la distància, la manca d'informació, l'absència de serveis
adequats i certes pràctiques culturals com a barreres significatives. Aquests elements contribueixen a la “violència
estructural”, fenomen arrelat en la pobresa, exclusió social i marginació que limiten les dones per respondre
efectivament a emergències obstètriques.La mortalidad materna continúa siendo un problema de salud significativo en el siglo XXI, especialmente en países de
bajos ingresos. A pesar de los avances globales, 99% de estas muertes ocurren en países en desarrollo, donde la
RMM es 20 veces superior. Este problema destaca las disparidades en el desarrollo económico y social, así como en
el estatus de las mujeres, reflejando inequidades entre las mujeres y de acceso a servicios de salud.
En 2001, Chiapas, México, registró 87 muertes maternas, 11 de las cuales ocurrieron en la Región Altos, notable por
su alta densidad de población indígena y niveles significativos de monolingüismo y analfabetismo. Las autopsias
verbales revelaron 19 muertes adicionales mal clasificadas por la escasez de personal médico y recursos de salud.
La Organización Mundial de la Salud identifica la pobreza, la distancia, la falta de información, la ausencia de servicios
adecuados y ciertas prácticas culturales como barreras significativas. Estos elementos contribuyen a la "violencia
estructural", fenómeno arraigado en la pobreza, exclusión social y marginación que limitan a las mujeres para
responder efectivamente a emergencias obstétricasMaternal mortality continues to be a significant health problem in the 21st century, especially in low-income countries.
Despite global advances, 99% of these deaths occur in developing countries, where the MMR is 20 times higher. This
problem highlights disparities in economic and social development, as well as in the status of women, reflecting
inequities among women and in access to health services.
In 2001, Chiapas, Mexico, recorded 87 maternal deaths, 11 of which occurred in the Altos Region, notable for its high
density of indigenous population and significant levels of monolingualism and illiteracy. Verbal autopsies revealed an
additional 19 deaths that were misclassified due to a shortage of medical personnel and health resources.
The World Health Organization identifies poverty, distance, lack of information, lack of adequate services and certain
cultural practices as significant barriers. These elements contribute to "structural violence," a phenomenon rooted in
poverty, social exclusion and marginalization that limit women's ability to respond effectively to obstetric emergencies
Novelty and Adaptability in Science and Innovation
No full textL'objectiu principal de la meva recerca és comprendre l'estructura i la dinàmica de la innovació basada en la ciència. Per entendre millor l'estructura, examino la recerca aplicada en diferents entorns organitzatius i, per millorar la comprensió de la dinàmica, estudio l'elasticitat de la ciència. Així, la meva primera corrent de recerca examina el paper dels diferents entorns organitzatius en la traducció de diferents tipus de recerca i la segona intenta comprendre l'adaptabilitat de la ciència i els científics als reptes de la innovació del nostre temps. Adopto principalment una perspectiva de demanda induïda, investigant fins a quin punt la demanda i les necessitats socials poden alterar la trajectòria de la ciència, una qüestió cada vegada més crítica donats els reptes del nostre temps.El objetivo principal de mi investigación es comprender la estructura y la dinámica de la innovación basada en la ciencia. Para entender mejor la estructura, examino la investigación aplicada en diferentes entornos organizativos y para mejorar la comprensión de la dinámica, estudio la elasticidad de la ciencia. Así, mi primera línea de investigación examina el papel de los diferentes entornos organizativos en la traducción de diferentes tipos de investigación y la segunda intenta comprender la adaptabilidad de la ciencia y los científicos a los desafíos de la innovación de nuestro tiempo. Adopto principalmente una perspectiva de demanda inducida, investigando hasta qué punto la demanda y las necesidades sociales pueden alterar la trayectoria de la ciencia, un asunto cada vez más crítico dados los desafíos de nuestro tiempo.The overarching goal of my research is to understand the structure and dynamics of science based innovation. To better understand structure, I examine applied research at different organizational settings and to improve understanding of dynamics I study the elasticity of science. Thus, my first research stream examines the role of different organizational settings in translating different types of research and the second attempts to comprehend the adaptability of science and scientists to the innovation challenges of our time. I adopt a primarily demand pull perspective, probing the extent to which demand and societal needs can alter the trajectory of science - an increasingly critical issue given the challenges of our time
Revalorització d’un residu de l’olivera per l’aplicació en el sector de l’adoberia
No full textAquesta Tesi Doctoral contribueix a l’estudi d’un residu de l’olivera, la remolta de l’oliva, per la seva reutilització en el sector de l’adoberia.
La indústria de la pell així com els residus dels molins d’oliva tenen un gran impacte al medi ambient. Tot i que s'han desenvolupat diferents projectes i estudis sobre la valorització dels residus de la indústria d’olivera, la Tesi tracta un enfocament completament nou de l’aplicació de la remolta per a l'adobament.
S'han caracteritzat diferents tipus de remoltes i subproductes de la remolta. Concentrant la polpa d’oliva, s’ha obtingut un nou polifenol de base biotecnològica sòlid en pols amb un 20% de tanins i sense sòlids insolubles.
S’ha aconseguit adobar pell wet-white amb l’extracte de la polpa d’oliva amb les recomanacions de qualitat per cuirs vegetals.
S’ha realitzat l’estudi d’anàlisis de cicle de vida de l’obtenció a nivell planta pilot del nou polifenol. I s’ha completat la Tesi amb l’estudi de transferència tecnològica de la recerca amb l’elaboració d’un pla comercial, estratègic i financer.Esta Tesis Doctoral contribuye al estudio de un residuo del olivo, el alperujo de la aceituna, para su reutilización en el sector de la curtiduría.
La industria de la piel así como los residuos de los molinos de aceituna tienen un gran impacto en el medio ambiente. Aunque se han desarrollado diferentes proyectos y estudios sobre la valorización de los residuos de la industria del olivo, la Tesis trata un enfoque completamente nuevo de la aplicación del alperujo para el curtido.
Se han caracterizado distintos tipos de alperujos y subproductos del alperujo. Concentrando la pulpa de aceituna, se ha obtenido un nuevo polifenol de base biotecnológica sólido en polvo con un 20% de taninos y sin sólidos insolubles.
Se ha conseguido curtir la piel wet-white con el extracto de la pulpa de aceituna con las recomendaciones de calidad para cueros vegetales. Se ha realizado el estudio de análisis de ciclo de vida de la obtención a nivel planta piloto del nuevo polifenol. Y se ha completado la Tesis con el estudio de transferencia tecnológica de la investigación con la elaboración de un plan comercial, estratégico y financiero.This Doctoral Thesis contributes to the study of a residue of the olive tree, the wet olive pomace, for its reuse in the tannery sector.
The leather industries as well as the waste from the olive mills have a great impact on the environment. Although different projects and studies have been developed on the valorization of waste from the olive industry, this is a completely new approach to the application of wet olive pomace for tanning.
Different types of wet olive pomace and wet olive pomace byproducts have been characterized. By concentrating the olive pulp, a new solid biotechnological based polyphenol has been obtained in powder with 20% tannins and no insoluble solids. It has been possible to tan wet-white leather with olive pulp extract in accordance with the quality recommendations for vegetable leather. The life cycle analysis study of obtaining the new polyphenol at the pilot plant level has been carried out. And the Thesis has been completed with the research technology transfer study with the preparation of a commercial, strategic and financial plan
The talent show phenomenon on general-interest television in France, Germany, Italy, Spain, and the United Kingdom
No full textAquesta investigació analitza la presència i representació dels continguts dels formats de concursos de talents emesos entre 2010 i 2020 a les cadenes generalistes de França, Alemanya, Itàlia, Espanya i el Regne Unit. Els talent shows es troben cada any entre els programes de televisió més vistos i són formats altament internacionalitzats, sent especialment fiables en temps de fragmentació de l'audiència. L'objectiu principal és reconèixer pràctiques similars i diferents en l'ús dels concursos de talents i identificar les principals característiques dels formats.
Aquest estudi comparatiu se centra en els principals mercats audiovisuals europeus. S'ha combinat una anàlisi de contingut quantitativa d'una setmana de programació regular durant les temporades entre 2010-11 i 2019-20 de França, Alemanya, Itàlia, Espanya i el Regne Unit, amb una anàlisi de contingut quantitativa i qualitativa d'una selecció de programes de talents. L'anàlisi de contingut es centra en la presència de concursos de talents i observa les pràctiques de programació d'aquests programes. A més, l'anàlisi identifica els elements centrals dels concursos de talents, com ara temes, participants, espais, narratives, transmedia, participació de l'audiència i distribució, entre altres característiques.
Els resultats mostren una major presència dels concursos de talents en canals privats, tot i que destaca l'actuació excepcional de la BBC. Els programes s'emeten principalment durant l'horari de màxima audiència i en franges nocturnes, amb freqüents reposicions els caps de setmana. Els espectacles ofereixen diversitat en termes de temàtica i estil de competició. Diferents participants, amb predominança masculina, estan presents per crear l'ambient de l'espectacle. Es combina l'ús d'espais i decoracions adequades per maximitzar el seu missatge. Les actuacions són crucials en els espectacles; una àmplia selecció i una manera impressionant de retratar la realitat són essencials per al seu èxit. L'audiència interactua amb aquests programes de manera textual i contextual. Els programes de talents són fonamentals en la televisió d'esdeveniments, captivant els espectadors amb actuacions dinàmiques i històries convincents. Molts d'aquests formats es transmeten arreu del món per la seva fórmula fàcilment replicable. Destaca la posició del Regne Unit en la venda de formats televisius, seguit dels Estats Units i Espanya.Esta investigación analiza la presencia y representación de los contenidos de los formatos de concursos de talentos emitidos entre 2010 y 2020 en las cadenas generalistas de Francia, Alemania, Italia, España y Reino Unido. Los talent shows se sitúan cada año entre los programas más vistos de televisión y son formatos altamente internacionalizados, siendo especialmente fiables en tiempos de fragmentación de audiencias. El objetivo principal es reconocer prácticas similares y diferentes en el uso de los concursos de talentos e identificar las principales características de los formatos.
Este estudio comparativo se centra en los principales mercados audiovisuales europeos. Un análisis de contenido cuantitativo de una semana de programación regular durante las temporadas entre 2010-11 y 2019-20 de Francia, Alemania, Italia, España y Reino Unido, se ha combinado con un análisis de contenido cuantitativo y cualitativo de una selección de programas de talentos. El análisis de contenido se centra en la presencia de concursos de talentos y observa las prácticas de programación de estos programas. Además, el análisis identifica los elementos centrales de los concursos de talentos, como temas, participantes, espacios, narrativas, transmedia, participación de la audiencia y distribución, entre otras características.
Los resultados muestran la mayor presencia de los concursos de talentos en canales privados, aunque destaca el desempeño excepcional de la BBC. Los programas se transmiten principalmente durante el horario de máxima audiencia y en franjas nocturnas, con frecuentes reposiciones los fines de semana. Los espectáculos ofrecen diversidad en términos de temática y estilo de competencia. Diferentes participantes, con predominio masculino, están presentes para crear el ambiente del espectáculo. Se incluye la combinación de espacios y decoraciones apropiadas para maximizar su mensaje. Las actuaciones son cruciales en los espectáculos; una amplia selección y una manera impresionante de retratar lo real es esencial para su éxito. La audiencia interactúa con estos programas de manera textual y contextual. Los programas de talentos son fundamentales en la televisión de eventos, ya que cautivan a los espectadores con actuaciones dinámicas e historias convincentes. Muchos de estos formatos se transmiten en todo el mundo por su fórmula fácilmente replicable. Destaca la posición del Reino Unido en la venta de formatos televisivos, seguido de Estados Unidos y España.This research analyses the presence and content representation of talent show formats aired between 2010 and 2020 on the general-interest channels of France, Germany, Italy, Spain, and the United Kingdom. Talent shows are among the most watched television programmes, and their formats are highly internationalised every year, making them exceptionally reliable in times of audience fragmentation. The main goal is to recognise similar and different practices in using talent shows and identify the main characteristics of the formats.
This comparative study focuses on the main European audiovisual markets. A quantitative content analysis of one regular scheduling week during seasons between 2010-11 and 2019-20 of France, Germany, Italy, Spain, and the United Kingdom, has been combined with a quantitative and qualitative content analysis of a selection of talent show programmes. The content analysis focuses on the presence of talent shows and observes the scheduling practices of these formats. Moreover, it identifies the core elements of talent shows, such as themes, participants, spaces, narratives, transmedia, audience involvement, and distribution, among other features.
The results show a higher presence of talent shows on commercial channels, although the BBC performed exceptionally well. The programmes are mostly aired during prime time and night slots, with frequent weekend reruns. The shows offer diversity in terms of theme and competition style. Different participants, with a male predominance, are present in creating the show's mood. The combination of appropriate spaces and decorations is included to maximise its message. The performances are crucial in the shows; a broad selection and impressive way of portraying the real is essential for its success. The audience engages with these shows in textual and contextual ways. Talent shows are pivotal in event television, captivating viewers with dynamic performances and compelling stories. Many of these formats are broadcast worldwide for their easily replicable formula. It highlights the position of the United Kingdom in selling television formats, followed by the United States and Spain.Universitat Autònoma de Barcelona. Programa de Doctorat en Comunicació Audiovisual i Publicita
Bulk and Single-Cell Omics for Characterizing Sperm Cryo-tolerance, the Functional Genome of Spermatogenic Cells, and Spermatid Survival in Swine
No full textLa producció porcina s'enfronta a desafiaments importants de tipus reproductiu, que son crucials per a l'eficiència dels programes d'inseminació artificial. La qualitat del semen varia àmpliament entre verros, la qual cosa fa essencial millorar la comprensió sobre la base molecular de la funció espermàtica. Cal doncs, identificar marcadors moleculars per a diferents caracters espermàtics. Els estudis presentats en aquesta tesi pretenen exploren els mecanismes moleculars subjacents a la criotolerància espermàtica, un paràmetre important per al sector porcí, l'arquitectura funcional del genoma espermàtic i la supervivència de les espermàtides, en porcí.
En l'article I, vam avaluar l'efecte sobre el transcriptoma espermàtic del porc de la purificació d'ejaculats amb BoviPure™. Anàlisi de tipus RNA-Seq i d'expressió diferencial entre ejaculats purificats i no purificats, va mostrar una alta similitud entre grups. No obstant, 372 gens van mostrar una abundància diferencial de RNA. La llista de gens diferencialment abundants estava sobre-representada per gens específics de l'epidídim, la qual cosa suggereix que la purificació va eliminar cèl·lules epitelials epididimàries, vesícules extracel·lulars epididimàries o cèl·lules espermàtiques que havien incorporat RNA epididimaris.
En l'article II, es va realitzar un GWAS i una anàlisi d'RNA-Seq (RNA total i RNA petit) en 99 i 20 ejaculats de semen, respectivament, cadascun procedent d'un verro Pietrain diferent. L’objectiu era identificar factors genètics i transcriptòmics que influencien la criotolerància espermàtica en porcs. Vam identificar una associació GWAS al cromosoma 12. L’estudi dels RNAs va permetre identificar 13 gens llurs nivells de RNA variaven segons la criotolerància espermàtica. Aquests gens estaven principalment relacionats amb l'estrès oxidatiu i la funció mitocondrial.
En l'article III, vàrem caracteritzar l'estructura de la cromatina dels espermatozoides porcins mitjançant el mapatge de les fraccions de cromatina mono- i sub-nucleosòmica de dues mostres. Per a tal fi, es va emprar la nucleasa micrococcal i el seqüenciament d'alt rendiment (Mnase-Seq). L'anàlisi va permetre identificar 25.293 pics mono-nucleosòmics i 4.239 sub-nucleosòmics, i s’observà una conservació posicional entre porcs i humans en regions genòmiques relacionades amb el desenvolupament. Les anàlisis d’ontologia gènica i dels motius de factors de transcripció van revelar associacions amb la funció espermàtica i l'embriogènesi, destacant el motiu ZNF263, un factor de transcripció relacionat amb la regulació de l'expressió preferencial paterna en embrions.
En l'article IV, un objectiu va ser obtenir els mapes genòmics funcionals (expressió gènica i accessibilitat de la cromatina), indicatius d'elements reguladors actius (promotors, enhancers), per als diferents tipus cèl·lulars del testicle porcí. L’altre objectiu fou identificar variants genètiques amb efecte potencial sobre la supervivència de les espermàtides. Vam utilitzar la tecnologia single cell multiome ATAC + Gene Expression per a seqüenciar el transcriptoma i la cromatina accessible de 18.550 cèl·lules de quatre verros adults de raça Large White. L'anàlisi identificà tots els principals tipus de cèl·lules testiculars i revelà una reducció en l'expressió gènica i l'accessibilitat de la cromatina en espermàtides tardanes, d'acord amb la condensació de la cromatina i la silenciació de l'expressió característics de l'espermatogènesi tardana. Els pics ATAC estaven enriquits vora Transcription Start Sites i gens altament expressats. Dels 3.114 polimorfismes d'un sol nucleòtid (SNP) heterozigots investigats, 773 mostraren desequilibri en la representació al·lèlica a nivell del recompte de seqüencies en espermàtides, que són cèl·lules haploides. Aquest desequilibri al·lèlic pot indicar diferències en la proporció de cèl·lules haploides que porten cada al·lel o variacions en l'expressió gènica o en l'accessibilitat de la cromatina. Es van genotipar in silico vuitanta SNPs en espermàtides i es va comptar el nombre de cèl·lules que portaven cada al·lel. Cinquanta-quatre SNPs van mostrar desequilibri en la representació al·lèlica a nivell del recompte cèl·lular, suggerint un possible efecte al·lèlic en la supervivència de les espermàtides.La producción porcina se enfrenta a desafíos importantes en el ámbito reproductivo, cruciales para la eficiencia de los programas de inseminación artificial. La calidad del semen varía considerablemente entre verracos, lo que hace esencial comprender mejor la base molecular de la función espermática. Es pues necesario identificar marcadores moleculares que influyan en las características espermáticas. Los estudios presentados en esta tesis exploran los mecanismos moleculares subyacentes a la criotolerancia espermática, un parámetro clave para el sector porcino, la arquitectura funcional del genoma espermático y la supervivencia de las espermátides.
En el artículo I, evaluamos el efecto de la purificación de eyaculados de cerdo con BoviPure™ sobre el transcriptoma espermático. El análisis de RNA-Seq y la expresión diferencial entre eyaculados purificados y no purificados mostraron una alta similitud entre grupos. Sin embargo, 372 genes presentaron una abundancia diferencial de RNA. La lista de genes diferencialmente abundantes incluía genes epidídimo-específicos, lo que sugiere la purificación eliminó células epiteliales epididimarias, vesículas extracelulares epididimarias o espermatozoides que habían incorporado RNAs epididimarios.
En el artículo II, se realizaron un GWAS y un RNA-Seq (RNA total y pequeño) en 99 y 20 eyaculados de semen, respectivamente, cada uno proveniente de un verraco Pietrain diferente. El objetivo era identificar factores genéticos y transcriptómicos que influyeran en la criotolerancia espermática en porcinos. Identificamos una asociación GWAS en el cromosoma 12. El análisis de RNA identificó 13 genes cuyos niveles de RNA variaban según la criotolerancia espermática. Estos genes estaban principalmente relacionados con el estrés oxidativo y la función mitocondrial.
En el artículo III, caracterizamos la estructura de la cromatina de los espermatozoides porcinos mediante el mapeo de las fracciones de cromatina mono- y sub-nucleosómica en dos muestras, empleando la nucleasa micrococcal y secuenciación de alto rendimiento (MNase-Seq). El análisis identificó 25,293 picos mono-nucleosómicos y 4,239 sub-nucleosómicos, observándose una conservación posicional entre cerdos y humanos en regiones genómicas relacionadas con el desarrollo. Los análisis de ontología génica y de los motivos de factores de transcripción revelaron asociaciones con la función espermática y la embriogénesis, destacando el motivo para el factor de transcripción ZNF263, relacionado con la regulación de la expresión paternal en embriones.
En el artículo IV, el primer objetivo fue obtener los mapas genómicos funcionales (expresión génica y accesibilidad de la cromatina), indicativos de elementos reguladores activos (promotores, enhancers), para los diferentes tipos celulares presentes en el testículo porcino. El segundo objetivo fue identificar variantes genéticas que pudieran influir en la supervivencia de las espermátides. Utilizamos la tecnología de single-cell multiome ATAC + Gene Expression para secuenciar el transcriptoma y la cromatina accesible de 18,550 células de cuatro verracos Large White adultos. El análisis identificó los principales tipos celulares testiculares y reveló una reducción en la expresión génica y la accesibilidad de la cromatina en las espermátides tardías, en línea con la condensación de la cromatina y el apagado de la expresión característicos de la espermatogénesis tardía. Los picos de ATAC se enriquecieron cerca de los sitios de inicio de la transcripción y en genes altamente expresados. De los 3,114 polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) heterocigotos investigados, 773 mostraron un desequilibrio en la representación alélica a nivel del recuento de secuencias en las espermátides, que son células haploides. Este desequilibrio alélico podría indicar diferencias en la proporción de células haploides que portan cada alelo o variaciones en la expresión génica o accesibilidad de la cromatina. Ochenta SNPs fueron genotipados in silico, y se contó el número de células que portaban cada alelo. Cincuenta y cuatro SNPs mostraron desequilibrio alélico a nivel del recuento celular, lo que sugiere un posible efecto alélico en la supervivencia de las espermátides.Pig breeding faces significant challenges in reproductive performance, which is crucial for the efficiency of artificial insemination (AI) programs. Semen quality can vary widely between boars, making it essential to understand the genetic and molecular basis of sperm function. Research is vital to identify markers influencing sperm traits. The studies presented in this thesis aim to address these challenges by exploring the molecular mechanisms underlying sperm cryo-tolerance, an important sperm parameter for the pig production sector, the functional architecture of the porcine sperm genome, and spermatid survival.
In paper I, we sought to evaluate effect on the pig sperm transcriptome of purifying ejaculates with BoviPure™. RNA-Seq followed by differential expression analysis of purified and non-purified ejaculates showed high similarity between groups, yet, 372 genes displayed differential RNA abundance. The list of differentially abundant genes was enriched with epididymis-specific genes, suggesting that the purification process removed either epididymal epithelial cells, epididymal extracellular vesicles, or sperm cells that had incorporated epididymal RNAs.
In paper II, a Genome-wide Association Scan (GWAS) and RNA-Seq (total RNA and small RNA) analysis were performed on 99 and 20 sperm ejaculates, respectively, each from a different Pietrain boar, to identify genetic and transcriptomic factors influencing sperm cryo-tolerance in swine. We identified a GWAS hit on chromosome 12 and 13 genes which RNA levels varied according to sperm cryo-tolerance. These genes were mainly related to oxidative stress and mitochondrial function.
In paper III, we characterize the chromatin structure of pig spermatozoa by mapping the location of mono- and sub-nucleosomal chromatin fractions from two samples using micrococcal nuclease digestion coupled with high-throughput sequencing. The analysis allowed identifying 25,293 mono-nucleosomal and 4,239 sub-nucleosomal peaks, with positional conservation observed between pigs and humans in development-related genomic regions. Gene ontology and transcription factor motif enrichment analyses revealed associations with sperm function and embryogenesis, notably highlighting the ZNF263 motif, a transcription factor that has been linked to the regulation of paternally preferential gene expression in early embryos.
In paper IV, the first aim was to obtain the functional genomic maps of gene expression and chromatin accessibility – indicative of active regulatory elements such as promoters or enhancers – for the different cell types present in the pig testicle. The second aim was to identify genetic variants potentially influencing spermatid survival. We employed single-cell multiome ATAC + Gene Expression technology to sequence the transcriptome and accessible chromatin of 18,550 cells from four adult Large White boars. The analysis led to the identification of all known major testicular cell types and revealed that gene expression and chromatin accessibility were significantly reduced in late spermatids, consistent with the chromatin condensation and expression shutdown characteristic of late spermatogenesis. ATAC peaks were enriched near transcription start sites and highly expressed genes. Out of 3,114 heterozygous single nucleotide polymorphisms (SNPs) that were interrogated, 773 showed allelic representation imbalance at the sequencing read count level in spermatids, which are haploid cells. This allelic imbalance may indicate differences in the proportion of haploid cells carrying each allele or variations in gene expression (RNA levels) or chromatin accessibility (ATAC peaks). Eighty SNPs were in silico genotyped in the haploid cells and the number of cells carrying each allele was counted. Fifty-four SNPs showed allelic representation imbalance at the cell count level, suggesting a potential allelic effect on spermatid survival.Universitat Autònoma de Barcelona. Programa de Doctorat en Producció Anima