Tesis Doctorals en Xarxa
Not a member yet
46997 research outputs found
Sort by
Innovative Tools and Strategies for Metabolomics Data Analysis
Get PDFLa metabolòmica és un bon enfocament per comprendre els fenotips. Això és valuós en aplicacions biomèdiques, ja que els metabòlits proporcionen informació sobre els processos bioquímics en temps real. La volatilòmica es centra en els compostos orgànics volàtils (VOCs), molècules petites amb potencial per a diagnòstics no invasius. Tècniques com la cromatografia de gasos acoblada a l’espectrometria de masses (GC-MS) i la cromatografia de gasos bidimensional (GC×GC-MS) ofereixen alta sensibilitat i capacitats d’alt rendiment per al seu anàlisi. Tanmateix, desafiaments com el processament de dades de gran dimensionalitat, la variabilitat metodològica i la manca d’estandardització en els resultats limiten la adopció clínica més àmplia.
Aquesta tesi aborda aquests desafiaments mitjançant el desenvolupament d’eines i estratègies per automatitzar i estandarditzar els fluxos de treball en metabolòmica, impulsant el potencial clínic de la metabolòmica i la volatilòmica. El treball se centra en tres objectius principals: millorar l’anàlisi de dades de GC×GC-MS, perfeccionar les metodologies per a l’anàlisi de VOCs en orina i millorar la integració de dades entre estudis.
La tesi presenta GcDUO, un programari de codi obert en R per al processament en bloc de dades complexes de GC×GC-MS en metabolòmica. GcDUO és escalable i personalitzable, resolent barreres clau en la gestió de conjunts de dades de gran dimensionalitat.
En el segon objectiu es va compilar una base de dades amb 841 VOCs urinàries i es va validar el mètode de GC-MS basat en SPME Arrow, demostrant la seva reproductibilitat i utilitat per a aplicacions clíniques.
Per abordar la variabilitat en la nomenclatura dels metabolits, s’ha desenvolupat dues eines. L’Estratègia d’Unificació de Metabolits que estandarditza els identificadors de metabolits per millorar la integració de conjunts de dades, mentre que Amanida, una eina de metanàlisi, sintetitza resultats de diversos estudis. Amanida, disponible com a paquet de R i aplicació Shiny.
Aquestes innovacions automatitzen el processament de dades, estandarditzen metodologies i milloren la comparabilitat dels resultats, enfortint el paper de la metabolòmica en la recerca clínica.Los metabolitos, productos de procesos celulares, reflejan la actividad bioquímica de los organismos, lo que convierte a la metabolómica en un enfoque poderoso para comprender los fenotipos. Esto es particularmente valioso en aplicaciones biomédicas. La volatilómica se centra en los compuestos orgánicos volátiles (VOCs), moléculas pequeñas con potencial para diagnósticos no invasivos. Técnicas como la cromatografía de gases acoplada a espectrometría de masas (GC-MS) y la cromatografía de gases bidimensional (GC×GC-MS) ofrecen alta sensibilidad y capacidades de alto rendimiento para su análisis. Sin embargo, desafíos como el procesamiento de datos de alta dimensionalidad, la variabilidad metodológica y la falta de estandarización en los resultados limitan su adopción clínica.
Esta tesis aborda estos desafíos mediante el desarrollo de herramientas y estrategias para automatizar y estandarizar los flujos de trabajo en metabolómica. El trabajo tiene tres objetivos principales: mejorar el análisis de datos de GC×GC-MS, perfeccionar las metodologías para el análisis de VOCs en orina y mejorar la integración de datos entre estudios.
La tesis presenta GcDUO, un software de código abierto en R para el procesamiento por lotes de datos complejos GC×GC-MS en metabolómica. GcDUO es escalable y personalizable, resolviendo barreras clave en el manejo de conjuntos de datos de alta dimensionalidad.
Para el segundo objetivo se compiló una base de datos con 841 VOCs urinarios y se validó el método de GC-MS basado en SPME Arrow, demostrando su reproducibilidad y utilidad para aplicaciones clínicas.
Para la integración de datos, se desarrollaron dos herramientas. La Estrategia de Unificación de Metabolitos que estandariza los identificadores de metabolitos, mientras que Amanida, una herramienta de meta-análisis, sintetiza hallazgos de múltiples estudios utilizando estadísticas generales. Amanida, disponible tanto en R como app Shiny.
Estas innovaciones automatizan el procesamiento de datos, estandarizan metodologías y mejoran la comparabilidad de resultados, fortaleciendo el papel de la metabolómica en la investigación clínica y traslacional.Metabolites, products of cellular processes, reflect the biochemical activity of organisms, making metabolomics—the study of metabolites—a powerful approach to understanding phenotypes. This is particularly valuable in biomedical applications, as metabolites provide insights into real-time biochemical processes. Among the subfields of metabolomics, volatilomics focuses on volatile organic compounds (VOCs), small molecules with significant potential for non-invasive diagnostics. Techniques like gas chromatography–mass spectrometry (GC-MS) and comprehensive GC×GC-MS offer sensitivity and high-throughput capabilities for VOC analysis. However, challenges such as high-dimensional data processing, methodological variability, and the lack of standardized reporting hinder broader clinical adoption.
This thesis addresses these challenges by developing tools and strategies to automate and standardize metabolomics workflows, advancing the clinical potential of metabolomics and volatilomics. The work focuses on three objectives: improving GC×GC-MS data analysis, refining VOC methodologies for urine, and enhancing data integration across studies through harmonization and meta-analysis.
To streamline GC×GC-MS data processing, the thesis introduces GcDUO, an open-source R-based software for batch processing complex metabolomics data. GcDUO is scalable and customizable, addressing key barriers in handling high-dimensional datasets.
Urine, a key biofluid in diagnostics, was central to the second objective. A database of 841 urinary VOCs was compiled, and SPME Arrow-based GC-MS was validated for reproducibility and high-throughput clinical applications.
To tackle variability in metabolite reporting, two tools were developed. The Metabolite Merging Strategy standardizes metabolite identifiers for better dataset integration, while Amanida, a meta-analysis tool, synthesizes findings from multiple studies using overall statistics. Amanida, available as an R package and Shiny app, enables evidence-based approaches in metabolomics.
These innovations automate data processing, standardize methodologies, and improve result comparability, strengthening metabolomics' role in clinical and translational research."Universitat Rovira i Virgili. Programa de doctorat en Tecnologies per a Nanosistemes, Bioenginyeria i Energia
La mentoria social com a eina d’inclusió dels adolescents d’origen migrant: evidències i reflexions per a la incorporació de la perspectiva interseccional
No full textENG - Social mentoring can be defined as a methodology of social intervention that fosters new relationships between two peers, or in a group context, and that, through this link, exerts an influence on the social inclusion of individuals in a situation of social exclusion or at risk of stumbling (Prieto-Flores & Feu Gelis, 2018). In the context of this doctoral thesis, the group of people in a situation of vulnerability under scrutiny are migrants, specifically adolescents of migrant origin who have recently arrived in Catalan society, particularly in Girona’s territory, and who participate in the Nightingale Project of the University of Girona. Social mentoring bonds offers a framework for addressing issues intimately linked to identities that, in the current socio-political climate, characterised by the structural characteristics of Eurocentric, colonial and patriarchal societies, among others, can give rise to situations of discomfort, discrimination and inequalities. This doctoral thesis proposes an analysis of social mentoring from a perspective that accentuates the structural inequalities that have hitherto been overlooked in its study.
Recent years have seen a proliferation of social mentoring programmes across multiple territories (Preston et al., 2019), giving rise to the need for scientific evaluation of their real impacts (Prieto-Flores and Feu, 2018). In order to contribute to the development of knowledge in this area, this thesis examines the results of the Applying Mentoring project, focusing on issues relevant to social mentoring, including the naturalness of the support it offers and the current context in which it is developedCAT - La mentoria social és una la metodologia d’intervenció social que fomenta noves relacions entre dos iguals, o de manera grupal, i que gràcies a aquest vincle s’incideix en la inclusió social de persones en situació d’exclusió social o en risc de trobar-s’hi (Prieto-Flores & Feu Gelis, 2018). En el cas d’aquesta tesi doctoral, el col·lectiu de persones en situació de vulnerabilitat que s’estudia és les persones migrants, concretament els adolescents d’origen migrant nouvinguts a la societat catalana, especialment a les comarques gironines, que participen al Projecte Rossinyol de la Universitat de Girona. Els vincles de mentoria social permeten tractar qüestions íntimes, vinculades a trets identitaris que, malauradament, en l’actualitat, per les característiques estructurals de la societat eurocèntrica, colonial i patriarcal entre d’altres, poden generar situacions d’incomoditat, discriminació o desigualtat. Així, aquesta tesi doctoral proposa una anàlisi de la mentoria social des d’una mirada que ressalti les desigualtats estructurals, que sovint s’han passat per alt en el seu estudi.
L'expansió dels programes de mentoria social al llarg de múltiples territoris en els últims anys (Preston et al., 2019) ha fet que sorgeixi la necessitat de conèixer i avaluar els impactes reals que aporta des d’una vessant científica, que encara té molt de recorregut per endavant (Prieto-Flores i Feu, 2018). Amb la voluntat d’aportar coneixement en aquesta direcció, la tesi doctoral aprofundeix en els resultats presentats pel projecte Applying Mentoring, centrant-se en dues qüestions rellevants per la mentoria social, tant per la naturalesa del suport que ofereix com pel context actual on es desenvolupaPrograma de Doctorat en Educaci
Estudio metabólico de c-KIT en líneas celulares mieloides y LMA en casos con sobreexpresión de WT1
No full textLa leucèmia mieloide aguda és un tipus de càncer originat en els progenitors hematopoètics que determina un stop maduratiu i una proliferació anormal de cèl·lules immadures atípiques. És una malaltia amb un perfil heterogeni, ja que estan involucrades una gran quantitat d'anomalies genètiques. La recerca actual està enfocada a oferir un tractament personalitzat en funció de les característiques moleculars de cada pacient.
El receptor c-KIT és una proteïna transmembrana que es pot trobar mutada en les cèl·lules impulsores de les neoplàsies mieloides. La mutació més comuna és la D816V que condueix a una activació constitutiva del receptor i de les vies de senyalització. En el present estudi analitzem el perfil metabòlic mitocondrial de la mutació en dues línies cel·lulars mieloides. Hem trobat que la mutació KIT D816V provoca un augment en l'activitat mitocondrial associada a una elevada producció de superòxid que pot promoure inestabilitat genètica. Els canvis mitocondrials trobats s'han associat a la infraexpressió de BNIP3 que redueix l'autofàgia. Així mateix, hem trobat la via de mTOR constitutivament activa en cèl·lules mutades, una via que regula l'autofàgia. Finalment, els resultats suggereixen que l'expressió de BNIP3 es veu reduïda en pacients portadors de la mutació KIT.
En la LMA, es troba habitualment una sobreexpressió del mRNA del factor de transcripció WT1. Fins ara, es coneix poc sobre els efectes que produeix. A partir de l’anàlisi d'expressió gènica en pacients, hem trobat gens l'expressió dels quals es veu alterada en funció de l'expressió de WT1, sent un d'ells SGK1 amb el que presenta una correlació inversa. A partir de models cel·lulars, hem mostrat una correlació inversa entre els nivells d'expressió de tots dos. També hem comprovat que la seva expressió afecta a la viabilitat cel·lular en condicions de privació de nutrients, mostrant un avantatge de supervivència de les cèl·lules que sobreexpresan WT1 o infraexpressen SGK1. Finalment, els nostres resultats suggereixen que hi ha una regulació coordinada i inversa entre els nivells de WT1 i SGK1 durant la diferenciació cel·lular.La leucemia mieloide aguda es un tipo de cáncer originado en los progenitores hematopoyéticos que determina un stop madurativo y una proliferación anormal de células inmaduras atípicas. Es una enfermedad con un perfil heterogéneo, ya que están involucradas una gran cantidad de anomalías genéticas. La investigación actual está enfocada a ofrecer un tratamiento personalizado en función de las características moleculares de cada paciente.
En el presente estudio, pretendemos analizar las alteraciones metabólicas utilizando dos modelos de líneas celulares con c-KIT mutado y muestras de LMA con sobreexpresión de WT1.
El receptor c-KIT es una proteína transmembrana que se puede encontrar mutada en las células impulsoras de neoplasias mieloides. La mutación más común es la D816V que conduce a una activación constitutiva del receptor y de las vías de señalización. En el presente trabajo analizamos el perfil metabólico mitocondrial de la mutación en dos líneas celulares mieloides. Hemos encontrado que la mutación KIT D816V provoca un aumento en la actividad mitocondrial asociada a una elevada producción de superóxido que puede promover la inestabilidad genética. Los cambios mitocondriales encontrados se han asociado a la infraexpresión de BNIP3 que reduce la autofagia. Así mismo, hemos encontrado la via de mTOR constitutivamente activa en células mutadas, una vía que regula la autofagia. Finalmente, nuestros hallazgos sugieren que la expresión de BNIP3 se ve reducida en pacientes portadores de la mutación KIT.
En LMA, se encuentra muy a menudo una sobreexpresión del mRNA del factor de transcripción WT1. Hasta ahora, se conoce poco sobre los efectos que produce. A partir de análisis de expresión génica en pacientes, hemos encontrado genes cuya expresión se ve alterada en función de la expresión de WT1, siendo uno de ellos SGK1 con el que tiene una correlación inversa. Usando modelos celulares, hemos demostrado una correlación inversa entre los niveles de expresión de ambos. También hemos demostrado que su expresión afecta a la viabilidad celular en condiciones de privación de nutrientes, mostrando una ventaja de supervivencia en las células que sobreexpresan WT1 o infraexpresan SGK1. Finalmente, nuestros hallazgos que hay una regulación coordinada e inversa entre los niveles de WT1 y SGK1 durante la diferenciación celular.Acute myeloid leukemia is a type of cancer originating in hematopoietic progenitors that determines a maturational arrest and abnormal proliferation of atypical immature cells. It is a disease with a very heterogeneous profile since many genetic abnormalities are involved. Current research is focused on offering personalized treatment based on the molecular characteristics of each patient.
In the present work, we aim to analyze metabolic alterations using two cell line models with mutated c-KIT and AML samples with WT1 overexpression.
The c-KIT receptor is a transmembrane protein that can be found mutated in the cells that drive myeloid neoplasms. The most prevalent mutation is D816V, which causes a constitutive activation of the receptor and downstream signaling pathways. In the present work, we analyze the mitochondrial metabolic profile of the mutation in two myeloid cell lines. We have found that the KIT D816V mutation causes an increase in mitochondrial activity associated with a high production of superoxide that can promote genomic instability. The mitochondrial changes found have been associated with the downregulation of BNIP3 that reduces autophagy. Likewise, we have found the mTOR pathway constitutively active in mutated cells, a pathway that regulates autophagy. Finally, we have found that BNIP3 expression is reduced in patients carrying the KIT mutation.
In AML, overexpression of the WT1 transcription factor mRNA is very often found.
Until now, little is known about the effects that it produces. We have discovered genes whose expression is influenced by WT1 expression through gene expression analysis in patients. One of them is SGK1, with which it has an inverse correlation. We have shown an inverse correlation between their expression levels using cell models. Additionally, we have demonstrated how its expression impacts the ability of cells to survive in starving conditions, in cells that overexpress WT1 or downrexpress SGK1, demonstrating an advantage in survival. Lastly, we have demonstrated that during cell differentiation, WT1 and SGK1 levels are coordinately and inversely regulated.Universitat Autònoma de Barcelona. Programa de Doctorat en Bioquímica, Biologia Molecular i Biomedicin
El contractualismo en la génesis de la teoría de género: El poder como constructor de la realidad
No full textLas consecuencias de la teoría de género ocupan la actualidad cultural y política de muchos países occidentales. Recientemente, además, el desarrollo biotecnológico está permitiendo nuevas maneras de construcción de la identidad que van más allá de la transexualidad. Para poder comprender estas dinámicas, es imprescindible atender a las fuentes de la teoría de género, que se suelen trazar en el freudomarxismo y el existencialismo. Sin embargo, esta tesis propone que se puede comprender el desarrollo de la teoría de género como parte de un proceso de desnaturalización que comienza con la Modernidad política, en el contractualismo. En este sentido, la teoría de género podría ser un instrumento que sirve no a la liberación de la persona, sino a la absolutización del sistema de poder. Se pretende demostrar que este mecanismo, que se ha denominado paradoja de la libertad y el control ya operaba en el Estado moderno clásico respecto de las libertades religiosa, de conciencia y opinión y que es el mismo que se da respecto del sistema de poder posmoderno y las libertades sexuales
Novel pharmacological and electroceutical approaches for memory improvement in animal models of intellectual disability
Get PDFIntellectual disability is a term used to describe a group of neurodevelopmental disorders defined by deficits in cognitive and adaptive functioning with onset during the developmental period. Preclinical research suggest that pharmaceutical approached might benefit people with intellectual disabilities since mouse models bearing similar genetic modifications to those in human syndromes improve cognitive performance upon treatment. This thesis focused on the therapeutic potential of two different approaches, pharmacological and electroceutical, in two mouse models of intellectual disability. First, we studied therapeutic potential of long-term treatments targeting the endocannabinoid system for memory improvement in a well-characterized mouse model of Down syndrome. Secondly, we explored a new electroceutical approach for memory enhancement in a mouse model of fragile X syndrome based on vagus nerve stimulation. Together, using behavioral, pharmacological, electrostimulation, histological and biochemical approaches, we have described two new therapeutical interventions for memory enhancement in mouse models of intellectual disability.La discapacitat intel·lectual és un terme que s'utilitza per a descriure un grup de trastorns del neurodesenvolupament definits per dèficits en el funcionament cognitiu que comencen al llarg del període de desenvolupament. Aquesta tesi es va centrar en el potencial terapèutic de dues aproximacions diferents, farmacològica i electrocèutica, en dos models de ratolí de discapacitat intel·lectual. En primer lloc, hem estudiat el potencial terapèutic dels tractaments a llarg termini dirigits al sistema endocannabinoide per a millorar la memòria en un model de ratolí de síndrome de Down. En segon lloc, hem explorat un nou enfocament electrocèutic per a la millora de la memòria en un model de ratolí de la síndrome X fràgil basat en l'estimulació del nervi vague. Conjuntament, utilitzant tècniques conductuals, farmacològics, d'electroestimulació, histològics i bioquímics, hem descrit dues noves aplicacions terapèutiques per a la millora de la memòria en models de ratolí de discapacitat intel·lectual.Programa de doctorat en Biomedicin
La manera més salvatge. Una aproximació a la didàctica de la poesia des del cos
No full textThis research explores the possibilities of the use of body movement in the field of the teaching of literature and, more specifically, for teaching poetry. It is based on a questioning of the control of the body that takes place in educational institutions and proposes using body movement as a tool to unlock and encourage poetic writing. Based on the fact that poetry generally has little presence in the classroom of literature, the lack of tools, training and teaching materials along with the study of the prejudices that many teachers and students show towards the genre, we propose a renewal of poetry education that advocates an unacomplexed vision that promotes enjoyment and that claims it as a popular genre, accessible to all students regardless of their social and cultural backgroundAquest estudi aborda l’ensenyament i l’aprenentatge de la poesia i se centra en la possibilitat d’utilitzar el moviment corporal a l’aula de literatura per al foment de la comprensió i l’escriptura poètica. Es parteix d’un qüestionament del control dels cossos que té lloc a les institucions educatives i es proposa utilitzar el moviment corporal com a eina per a desbloquejar i encoratjar l’escriptura poètica. A partir de la constatació que la poesia té, en general, poca presència a l’aula de literatura, de la manca de formació i de materials específics per al professorat i de l’estudi dels prejudicis que molts professors i estudiants mostren envers el gènere; es proposa una renovació de la didàctica de la poesia que advoqui per una visió desacomplexada que promogui el gaudi i que el reivindiqui com a gènere popular i accessible a tots els alumnes independentment del seu bagatge social i culturalPrograma de Doctorat Interuniversitari en Arts i Educaci
Identification of markers from whole-genome sequencing associated with pork quality and lipid metabolism
No full textEn aquesta tesi hem investigat l'adequació de les dades de WGS per identificar variants genètiques o indicadors biològics associats amb els trets productius, i ampliar el nostre coneixement sobre el determinisme genètic dels trets de qualitat de la carn.Els resultats mostren que una major densitat de variants en les dades de WGS permet detectar nous QTL en comparació amb els xips de SNPs. Hem identificat múltiples variants genètiques amb potencial per a programes de selecció assistida per marcadors en desequilibri de lligament per a la deposició de greix i el contingut d'àcids grassos en el porc. També, les dades de WGS han permès dur a terme fine-mapping dels efectes de múltiples QTL dins de regions específiques, tant en gens candidats funcionals com en gens prioritzats segons altres criteris. Finalment, hem observat que el nombre de còpies d'ADN mitocondrial, un fenotip cel·lular que es pot estimar a partir de les dades de WGS, es correlaciona amb l'eficiència alimentària, la magresa i el pH final. Aquesta troballa obre una via interessant per comprendre la interacció entre el metabolisme cel·lular i els trets productius.En esta tesis, hemos investigado la idoneidad de los datos de WGS para identificar variantes genéticas o indicadores biológicos asociados con los rasgos productivos y ampliar nuestro conocimiento sobre el determinismo genético de los rasgos de calidad de la carne.
Los resultados muestran que una mayor densidad de variantes en los datos de WGS permite detectar nuevos QTL en comparación con los chips de SNPs. Hemos identificado múltiples variantes genéticas con potencial para programas de selección asistida por marcadores en desequilibrio de ligamiento para la deposición de grasa y el contenido de ácidos grasos en el cerdo. Además, los datos de WGS han permitido llevar a cabo un mapeo de precisión de los efectos de múltiples QTL dentro de regiones específicas, tanto en genes candidatos funcionales como en genes priorizados según otros criterios. Finalmente, hemos observado que el número de copias de ADN mitocondrial, un fenotipo celular que se puede estimar a partir de los datos de WGS, se correlaciona con la eficiencia alimentaria, la magrez y el pH final. Este hallazgo abre una vía interesante para comprender la interacción entre el metabolismo celular y los rasgos productivos.In this thesis, we have investigated the suitability of WGS data to identify genetic variants or biological indicators associated with livestock productive traits, and increased our knowledge on the genetic determinism of meat quality traits.
Our results showed that the increased variant density of WGS data enables the detection of novel quantitative trait loci compared to SNP arrays. Additionally, we uncovered multiple genetic variants that show potential for linkage disequilibrium marker-assisted selection programs for pig fat deposition and fatty acid content. Also, WGS data allowed fine-mapping of the effects of multiple QTLs within specific genomic regions, both in candidate genes from families involved in metabolic pathways or prioritized according to other criteria. Finally, we observed that mitochondrial DNA copy number, a cellular phenotype that can be estimated from WGS data, correlates with feed efficiency, leanness, and ultimate pH. This finding offers an intriguing avenue for understanding the interplay between cellular metabolism and productive traits
El dilema accional. La decisión y la renuncia en el videojuego
No full textDoctorat internacionalEsta tesis ahonda en los dilemas morales en el videojuego para detectar cómo el sistema fuerza a un jugador comprometido con la ludoficción a tomar decisiones, pero también a experimentar las consecuencias y la renuncia. Partimos de la hipótesis de que el dilema en el videojuego tiene un valor adicional frente a otros medios por su capacidad interactiva, inmersiva y participativa, que permite empujar al jugador hacia un estado de reflexión y obligarlo a experimentar los resultados de sus acciones e inacciones dentro de un mundo ludoficcional. Establecemos dos objetivos principales que consisten en proponer una definición del dilema accional y proporcionar un modelo de análisis del dilema en el videojuego. En los resultados observamos que el dilema accional surge no solo de la acción de decidir, sino también cuando el jugador es forzado a participar alrededor de cuestiones éticas difíciles o irresolubles.This doctoral thesis explores moral dilemmas in video games to detect how the system forces players committed to the game to make decisions, but also to experience the consequences and relinquishment. We start from the hypothesis that the dilemma in video games has an additional value compared to other media due to its interactive, immersive and participative capacity, which allows pushing players towards a state of reflection and forcing them to experience the results of their actions and inactions within a ludofictional world. We have established two main objectives, which consist of proposing a definition of the action dilemma and providing a model of analysis of the action dilemma in video games. In the results we observe that the actional dilemma arises not only from the action of deciding, but also when players are forced to participate around difficult or irresolvable ethical issues.Programa de Doctorat en Ciències de la Comunicaci
Impact of phosphorus nutrition on senescence and resistance to pathogen infection in rice
No full textLes plantes s'enfronten constantment a una sèrie d'estressos ambientals, biòtics i abiòtics, que provoquen importants reduccions de la productivitat dels cultius. L'estrès abiòtic, com les temperatures extremes, la salinitat, la sequera, les inundacions, la toxicitat per metalls pesants i la disponibilitat de nutrients, afecta negativament el creixement i la productivitat de les plantes a tot el món. A la natura, les plantes també estan exposades a la infecció per una àmplia gamma de patògens, com fongs, oomicets, bacteris, virus, insectes, nematodes i plantes paràsites. La majoria dels estudis per determinar els efectes de l'estrès ambiental s'han fet en plantes exposades a un estrès individual. No obstant, les respostes de les plantes a l'estrès combinat no es poden predir directament a partir de l’estudi d'un únic estrès alhora, una situació que poques vegades es dóna a la natura. Les vies de senyalització activades per un estrès concret poden interactuar amb la resposta de la planta a un altre tipus d'estrès, de manera sinèrgica o antagònica. En aquesta tesi doctoral s'han investigat les regulacions interconnectades entre la nutrició de fosfat i la immunitat en plantes d'arròs. També hem explorat l'impacte de la fertilització del fosfat sobre la senescència foliar en arròs. El fòsfor és un macronutrient essencial a les plantes que s'absorbeix a través de les arrels en forma de fosfat inorgànic (Pi). Encara que el contingut global de P a terra és generalment alt, la baixa biodisponibilitat de Pi representa un factor limitant per al creixement de les plantes. En conseqüència, els fertilitzants amb Pi es fan servir habitualment per optimitzar el rendiment dels cultius. Tot i això, l'ús excessiu de fertilitzants amb Pi condueix a un escenari d'excés de Pi als sòls agrícoles.
El capítol I descriu que l'acumulació de Pi afecta negativament la senescència de la fulla d’arròs. El capítol II detalla l'efecte del Pi al patosistema arròs/Magnaporthe oryzae. L'acumulació de Pi als teixits de l'arròs té un efecte sobre tots dos individus: la planta i el patogen. D'una banda, l'acumulació de Pi afecta negativament la capacitat de la planta per activar respostes de defensa durant la infecció del patogen. Pel costat del patogen, l'acumulació de Pi afavoreix l'expressió dels efectors de M. oryzae, i modula de manera oposada l'expressió dels supressors de la mort cel·lular de la planta i dels efectors inductors de la mort cel·lular de la planta. El Capítol III reporta l'impacte del contingut de Pi a la malaltia bakanae causada per Fusarium fujikuroi. El Pi promou la colonització de les arrels per part de F. fujikuroi alhora que compromet l'expressió de la resposta immune. Finalment, el capítol IV explora els beneficis rebuts per la simbiosi micorrícica arbuscular en varietats d'arròs d'elit (cultivars d'arròs temperate japonica). Les plantes d'arròs micoríciques cultivades en condicions controlades en sòl natural, així com en condicions de camp, presenten resistència a piriculariosi. En conjunt, aquests resultats recolzen que l'excés de fosfat afecta negativament la resistència a les malalties en l'arròs, almenys els fongs patògens M. oryzae i F. fujikuroi. Els nivells de Pi a les fulles d'arròs són també un factor important en la determinació de la senescència foliar en arròs. Els resultats obtinguts en aquest estudi poden establir les bases per optimitzar racionalment l'ús de fertilitzants i pesticides al cultiu d'arròs.Las plantas se enfrentan constantemente a una serie de estreses ambientales, bióticos y abióticos, que provocan importantes reducciones de la productividad de los cultivos. El estrés abiótico, como las temperaturas extremas, la salinidad, la sequía, las inundaciones, la toxicidad por metales pesados y la disponibilidad de nutrientes, afecta negativamente al crecimiento y la productividad de las plantas en todo el mundo. En la naturaleza, las plantas también están expuestas a la infección por una amplia gama de patógenos, como hongos, oomicetos, bacterias, virus, insectos, nematodos y malas hierbas. La mayoría de los estudios para determinar los efectos del estrés ambiental se han realizado en plantas expuestas a un estrés individual. Sin embargo, las respuestas de las plantas al estrés combinado no pueden predecirse directamente a partir del simple estudio de un estrés a la vez, una situación que rara vez se da en la naturaleza. Las vías de señalización activadas por un estrés concreto pueden interactuar con la respuesta de la planta a otro tipo de estrés, de forma sinérgica o antagónica. En esta Tesis Doctoral, se han investigado las regulaciones interconectadas entre la nutrición de fosfato y la inmunidad en plantas de arroz. También hemos explorado el impacto de la fertilización con Pi sobre la senescencia foliar en arroz. El fósforo es un macronutriente esencial en las plantas que se absorbe a través de las raíces en forma de fosfato inorgánico (Pi). Aunque el contenido global de P en el suelo es generalmente alto, su baja biodisponibilidad de Pi representa un factor limitante para el crecimiento de las plantas. En consecuencia, los fertilizantes de Pi se utilizan habitualmente para optimizar el rendimiento de los cultivos. Sin embargo, el uso excesivo de fertilizantes con Pi conduce a un escenario de exceso de Pi en los suelos agrícolas.
El capítulo I describe que la acumulación de Pi afecta negativamente a la senescencia de las hojas. El capítulo II detalla el efecto del Pi en el patosistema arroz/Magnaporthe oryzae. La acumulación de Pi en los tejidos del arroz tiene un efecto sobre ambos individuos: la planta y el patógeno. Por un lado, la acumulación de Pi afecta negativamente a su capacidad de la planta para activar respuestas de defensa durante la infección del patógeno. Por el lado del patógeno, la acumulación de Pi favorece la expresión de los efectores de M. oryzae, y modula de forma opuesta la expresión de los supresores de la muerte celular de la planta y de los efectores inductores de la muerte celular de la planta. El Capítulo III reporta el impacto del contenido de Pi en la enfermedad bakanae causada por Fusarium fujikuroi. El Pi promueve la colonización de las raíces por parte de F. fujikuroi a la vez que compromete la expresión de la respuesta inmune. Por último, el capítulo IV explora los beneficios recibidos por la simbiosis micorrícica arbuscular en variedades de arroz de élite (cultivares de arroz temperate japonica). Las plantas de arroz micorrícicas cultivadas en condiciones controladas en suelo natural, así como en condiciones de campo, presentan resistencia a piriculariosis. En conjunto, estos hallazgos apoyan que el exceso de fosfato afecta negativamente a la resistencia a las enfermedades en el arroz, al menos a los hongos patógenos M. oryzae y F. fujikuroi. Los niveles de Pi en las hojas de arroz son también un factor importante en la determinación de la senescencia foliar en arroz. Los resultados obtenidos en este estudio pueden sentar las bases para optimizar racionalmente el uso de fertilizantes y pesticidas en el cultivo de arroz.Plants are persistently confronted with a variety of environmental stresses, biotic and abiotic stresses, that cause significant reductions in crop productivity. Abiotic stresses, such as extreme temperatures, salinity, drought, flooding, heavy metal toxicity and nutrient availability negatively affect plant growth and productivity worldwide. In nature, plant are also exposed to infection by a wide range of pathogens, such as fungi, oomycetes, bacteria, viruses, insects, nematodes and weeds. Most studies to determine the effects of environmental stress have been performed on plants exposed to an individual stress. However, the responses of plants to combined stress cannot be directly predicted from simply studying one stress at a time, a situation that is rarely found in nature. Signalling pathways that are activated by a particular stress, might interact with the plant response to other type of stress, in a synergistic or antagonistic manner. In this Ph.D Thesis, interconnected regulations between phosphate nutrition and immunity have been investigated in rice plants. We also explored the impact of Pi fertilization on leaf senescence in rice. Phosphorus is an essential macronutrient in plants that is absorbed through the roots in the form of inorganic phosphate (Pi). Although the overall content of P in the soil is generally high, its low bioavailability of Pi represents a limiting factor for plant growth. Consequently, Pi fertilizers are routinely used to optimize crop yield. The overuse of Pi fertilizers, however, lead to a scenario of Pi excess in agricultural soils.
Chapter I describes that Pi accumulation negatively affects leaf senescence. Chapter II details the effect of Pi on the rice/Magnaporthe oryzae pathosystem. Pi accumulation in rice tissues has an effect on the two partners: plant and pathogen. On the plant side, Pi accumulation negatively affects the capability of the plant to activate defense responses during pathogen infection. On the pathogen side, Pi accumulation fosters the expression of M. oryzae effectors, and oppositely modulates the expression of suppressors of plant cell death and plant cell-death-inducing effectors. Chapter III reports the impact of Pi content in bakanae disease caused by Fusarium fujikuroi. Here, Pi promotes root colonization by F. fujikuroi colonization while compromising the expression of immune response. Last, Chapter IV explores the benefits received by the arbuscular mycorrhizal symbiosis in elite rice varieties (temperate japonica rice cultivars). Blast resistance occurs in mycorrhizal rice plants grown under controlled conditions on natural soil as well as under field conditions. Together, these findings support that phosphate excess negatively affects disease resistance in rice, at least to the fungal pathogens M. oryzae and F. fujikuroi. Pi levels in rice leaves is also an important factor in determining in leaf senescence in rice. Results obtained in this study might lay a foundation for rationally optimizing fertilizer and pesticide use in rice cultivation.Universitat Autònoma de Barcelona. Programa de Doctorat en Biologia i Biotecnologia Vegeta
Ética animalista y feminismo. Pensamiento filosófico y social en la España contemporánea
No full textENG- The oppression and domination suffered by women and animals obeys the same pattern. There are many parallelisms in the treatment and moral categorization that affect both of them under the framework of the patriarchal system that still rules our society. The objective of this thesis is to analyze what the different modes of domination and oppression have in common to show that the similarities are not fortuitous or random, but they all share the same common denominator and come from the same source.
Starting from the conviction that academic debate has power in the social transformation of the present due to its ability to create new ideas or realities, we will analyze the works of the main philosophers of our country, experts in animal ethics and committed to feminism. We will also take an approach to the activism that is carried out on the street through different entities and spaces dedicated to the defense of animal rights, in order to understand the role that women have and see to what extent their own modus operandi of the patriarchal system is also reproduced.
To achieve our goals we start from the background of the relationship between women, nature and animality. In this look at the past that reveals us the origin of the relationship between feminism and animalism we will review the classic theories of animal ethics and those of feminism to finally focus on some particular current cases, important for the feminist debate and/or in contemporary Spain. This is the case of the consumption of meat as food, its relationship with sex or reproduction, zoophilia or bestiality, petism and traditionally masculine activities such as hunting and bullfightingCAT- L'opressió i la dominació que pateixen dones i animals obeeix al mateix patró. Hi ha molts paral·lelismes en el tracte i categorització moral que afecten tots dos col·lectius sota el marc del sistema patriarcal que encara governa la nostra societat. L'objectiu d'aquesta tesi és analitzar allò que tenen en comú els diferents mètodes de domini i opressió per mostrar que les similituds no són fortuïtes ni aleatòries, sinó que totes comparteixen el mateix denominador comú i procedeixen de la mateixa font.
Partint del convenciment que el debat acadèmic té poder en la transformació social del present per la seva capacitat de configurar noves idees o realitats, analitzarem les obres de les principals filòsofes del nostre país expertes en ètica animal i compromeses amb el feminisme. També ens aproparem a l'activisme que es fa al carrer a través de diferents entitats i espais bolcats en la defensa dels drets dels animals, amb la finalitat de conèixer el paper que hi juga la dona i veure fins a quin punt el modus operandi propi del sistema patriarcal també s'hi reprodueix.
Per complir els nostres objectius partim dels antecedents de la relació entre dona, natura i animalitat. En aquesta mirada al passat que ens revela l‟origen de la relació entre feminisme i animalisme, revisarem les teories clàssiques d‟ètica animal i les del feminisme per finalment centrar-nos en alguns casos particulars d‟actualitat, importants per al debat feminista i/o de l‟Espanya contemporània. És el cas del consum de carn com a aliment, la seva relació amb el sexe o la reproducció, la zoofília o bestialisme, el mascotisme i activitats tradicionalment masculines com la caça i la tauromàquiaPrograma de Doctorat en Ciències Humanes, del Patrimoni i de la Cultur