Institut Charles Sadron

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    Homotopic deformations in n-ary digital images.

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    De nombreux domaines applicatifs utilisent des techniques de traitement d'images basées sur l'analyse de la topologie des images discrètes, en particulier pour des opérations devant préserver cette topologie. Si beaucoup de travaux théoriques et méthodologiques ont été menés dans le cadre des images binaires, les questions relatives à la modélisation et à la gestion simultanées des propriétés topologiques de plusieurs éléments sémantiques dans une même image discrète reste à l'heure actuelle un problème peu exploré. Dans cette thèse, nous avons porté notre attention sur la définition de déformations homotopiques compatibles avec la présence de plusieurs éléments non hiérarchisés dont les relations spatiales peuvent être significatives. Après avoir décrit le cadre théorique retenu pour les images binaires, et après avoir montré sa compatibilité avec les approches les plus fréquentes en imagerie, nous proposons des modélisations des images n-aires appuyées sur ce cadre théorique et dont les objets d'intérêts forment un sous-treillis de l'ensemble des parties de la partition initiale en régions de sémantiques distinctes. Ainsi, nous sommes en mesure de décrire quelques transformations élémentaires des images n-aires respectueuses non seulement des topologies individuelles des différents objets mais aussi des topologies "collectives" qui traduisent les inter-relations des objets.In a digital image, when performing processes such as registration, deformation or thinning, the preservation of the topological properties of the objects contained in the image (e.g., connected components, tunnels, cavities, etc.) is an important requirement. For 50 years, several tools enabling the analysis and the modification under topological constraints of binary images have been proposed and used. Nevertheless, in many fields an image is generally composed of several objects, and it is often important to understand or maintain their topological properties all together, that is the topology of each and the topology of the scene. In such images, the objects are characterised by specific labels on which there generally exists no meaningful order relation (unlike grey-level images for instance). In this thesis, we focus on homotopic deformations that preserve all the topological relations of such partitions of the space. After describing our theoretical framework for binary images, and its compatibility with usual approaches in digital imaging, we propose two models to be used with n-ary images. In these models, the regions of interest compose a sub-lattice of the power set of the labeled regions. Thereby, we can define some elementary modifications that preserve individual and "collective" topologies

    Possession through a third party.

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    Envisagée dès l’article 2255 du code civil, la possession par autrui est la situation dans laquelle un sujet de droit se voit reconnaître la qualité de possesseur d’une chose dont un autre a la détention. La possession par autrui n’est pas un cas d’école : l’examen de la jurisprudence révèle au contraire que ses hypothèses sont nombreuses et diverses. Le possesseur par autrui peut d’abord être le propriétaire prétendu d’un bien qui s’en est dessaisi en vertu d’une convention génératrice d’une obligation de restitution, comme le bail ou le dépôt. Mais le possesseur par autrui peut également prétendre à un simple droit réel sur la chose d’autrui, ce qui conduit à mettre en évidence le développement considérable de l’institution en droit des sûretés. Il reste que la diversité des situations de possession par autrui oblige à s’interroger sur leur effectivité. La possession par autrui est susceptible de produire effet non seulement dans les rapports du possesseur avec les tiers, mais aussi dans ses rapports avec le détenteur de la chose, en consacrant la perpétuité de l’obligation de restitution en nature pesant sur ce dernier. Toutefois, le possesseur par autrui n’aura pas toujours la possibilité de se prévaloir de ces différents effets. Concrètement, la possession par autrui présente le plus d’intérêt pour le possesseur en qualité de propriétaire d’un immeuble. En revanche, les effets de la possession par autrui sont plus limités en matière mobilière, et lorsque le possesseur prétend sur la chose à un autre droit que le droit de propriété. En dépit de l’importance que le code civil lui accorde, les effets de la possession par autrui demeurent donc souvent en demi-teinte.Already considered in the first article of the code civil regarding possession (article 2255), possession through a third party is the situation in which a person has the position of a possessor while the possessed thing is held by somebody else. That possessor may be the alleged owner of a thing which he delivered to a holder who is bound by contract to return it to him : such is the case of a leaseholder or a bailee. The possessor through a third party may as well be a creditor who has a security on a thing that remains in the hands of his debtor. How effective is such a possession? Possession through a third party can be useful for adverse possession. It could also play a role between the possessor and the holder : that role is to protect the right of the possessor to claim the thing back at the termination of the contract. Yet the possessor through a third party will not always have the opportunity to benefit fully from his possession. In practical terms, possession through a third party will be the most effective when the possessor claims to be the owner of an immovable property. By contrast, possession through a third party is less effective when the possessed thing is a movable property. It is also less effective when the possessor does not claim ownership of the thing, but only a right in rem

    Compared GDP of different countries of Western Europe since the treaty of Rome (1957-2007).

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    Cette thèse intitulée PIB comparés des différents pays d’Europe occidentale depuis le traité de Rome (1957-2007) est une étude comparative des croissances économiques entre l’Europe des 15 (plus la Suisse) et les Etats-Unis, des débuts de la construction européenne jusqu’à la crise des subprimes. Les recherches se fondent sur les données constituées par l’Université de Groningue, la Banque mondiale et l’Université de Pennsylvanie. L’analyse fait apparaître deux grandes phases : une phase de forte croissance (1949-1973) et une phase de décélération (1986-2007) séparées par une période de crises (1973-1986). Ce sont les pays d’Europe méridionale qui ont connu les croissances les plus rapides durant la première phase, ce qui fait apparaître la prédominance de l’effet de rattrapage comme principal facteur du dynamisme européen avant l’ouverture des frontières. Les recherches montrent aussi durant cette période, le dynamisme économique des pays à fort transfert de population en provenance du secteur agricole (Europe des six, Autriche, Finlande). Le phénomène de la stagflation causé entre 1973 et 1986 par les chocs pétroliers marque la fin de l’embellie des «Trente Glorieuses». La période 1986 et 2007 laisse apparaître la persistance durable de la décélération dans les espaces économiques nationaux européens. L’écart de la croissance se creuse entre les Etats-Unis et les pays d’Europe occidentale et seuls l’Irlande, le Portugal, le Luxembourg et le Royaume-Uni échappent à ce déclin relatif. Après 1986, le levier fondamental de la croissance économique n’est plus le rattrapage ou le transfert de population active en provenance de l’agriculture, mais le commerce extérieur.This thesis on GDP of different countries of Western Europe compared since the treaty of Rome (1957-2007) is a comparative study of economic growth among the EU 15 (and Switzerland) and United States since the beginning of unification of Europe to the subprime crisis. The research is based on the databases of university of Groningen, world bank and university of Pennsylvania. The analysis of the groxth disparities revealed two major trends : a high-growth phase (1949-1973) and a deceleration phase (1986- 2007) interrupted by a period of crisis (1973-1986). The southern European countries have experienced the fastest growth in the first phase, confirming the predominance of catch-up effect as the main factor of European dynamism before the opening of the borders. Research also shows during this period, strong growth in countries with high transfer of agricultural population (Europe of six, Austria, Finland…). The phenomenon of stagflation caused by the oil crises between 1973 and 1986 marked the end of the upturn of the "Thirty Glorious Years". The period between 1986 and 2007 reveals the persistence of the slowdown in european national economic spaces. The growth gap is widening between the U.S. and Western European countries. Only Ireland, Portugal, Luxembourg and the United Kingdom escape this relative decline. After 1986, the main engine of growth is not longer the catch-up effect nor the agricultural population transfer, but the international trade

    Modelling of gravimetric and geodetic variations induced by the thinning of glaciers. Separation of past and present-day deglaciation effects

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    Nous modélisons les déformations élastiques terrestres dues au changement actuel de l'épaisseur des glaciers et étudions comment, dans les observations, elles peuvent être séparées des déformations visco-élastiques suivant la déglaciation du Pléistocène. A partir des variations de l'épaisseur des glaciers du massif du Mont Blanc nous montrons que les variations d'inclinaison du sol peuvent être suivies par des inclinomètres hydrostatiques longue base. Utilisant 6 modèles de fonte actuelle au Svalbard, Norvège, et la déformation visco-élastique qui résulte de la dernière grande déglaciation, nous obtenons qu'une diminution de 25 km3/a du volume des glaciers permet d'expliquer les observations au sol. Toutefois, l'analyse des solutions de la mission de gravimétrie spatiale Gravity Recovery And Climate Experiment conduit à une variation de volume comprise entre -18 et -5 km3/a. La forte topographie de cette région ne peut être négligée pour expliquer les deux types d'observations. L'absence de topographie, l'utilisation des observations sol et la prise en compte de deux rapports théoriques, caractérisant les déformations visqueuses et élastiques, permettrait de séparer dans les observations les effets induits par les changements actuels et passés des masses de glace. La topographie peut faire varier un des rapports. Le contexte de glaciation/ déglaciation passée et actuelle permet alors d'estimer un domaine de valeurs possibles pour ce rapport. Enfin, la perte et le gain de glace sont évalués en Antarctique où les variations de gravité vues par GRACE et de hauteur altimétrique observées sont associées aux changements de l'épaisseur de la calotte.We model the elastic deformations of the Earth due to current change of the thickness of the glaciers and study how, in the observations, they can be separated from the visco-elastic deformations subsequent to the Pleistocene deglaciation. We show from the variations of the thickness of the glaciers of the Mont Blanc area that the variations of the ground tilt can be monitored with ong base hydrostatic tiltmeters. Using 6 models of ice thinning in Svalbard, Norway, and the visco-elastic deformation due to the Pleistocene deglaciation we obtain a decrease of 25 km3/yr for the volume change of the glaciers, which does not explain the ground observations. However, analysing the solutions of the space gravimetry mission Gravity Recovery And Climate Experiment leads to a volume change ranging between -18 and -5 km3/yr. The topography of that region cannot be neglected to explain both ground and space observations. The absence of topography and use of ground observations and two theoretical ratios, for the viscous and elastic deformations, could lead to the separation in the observations of the effects induced by past and current ice-mass changes. The topography can change one of these ratios. The current and past glaciation/deglaciation context provides a range of possible values for this ratio. Finally, the loss and gain of ice are confirmed in Antarctica where space gravity and altimetry observations are assumed to be induced by the change of the thickness of the ice cap

    Static and dynamic methods of polyhedral compilation for an efficient execution in multicore environments

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    Depuis plusieurs années, le nombre de cœurs de calcul dans les processeurs ne cesse d'augmenter à chaque nouvelle génération. Les processeurs multi-cœurs sont maintenant très fréquents mais le développement de logiciels séquentiels reste une pratique très courante. Pour pallier à ce problème, des outils de parallélisation automatique ont été proposés mais ils ne sont pas encore prêts pour une utilisation à grande échelle. Nous proposons d'étendre les outils existants dans trois directions différentes. Premièrement, on peut remarquer que le code source de certains programmes n'est pas disponible. Nous proposons donc un système de parallélisation statique de code binaire qui permet de paralléliser un application séquentielle déjà compilée. Ensuite, on peut s'apercevoir que la performance d'un programme dépend du contexte d'exécution dans lequel il s'exécute. Nous présentons donc un système qui permet de sélectionner une version d'un programme parmi plusieurs afin d'exploiter au mieux les particularités du contexte d'exécution courant. Enfin, étant donné que certains programmes sont difficiles à analyser statiquement, nous proposons un système de parallélisation spéculative permettant d'appliquer dynamiquement des transformations de code complexes sur ces programmes. Ces trois systèmes utilisent le modèles polyédrique comme une boîte à outil permettant d'analyser, de transformer ou de paralléliser les programmes. En travaillant à différentes phases de la vie des programmes, ils forment une approche globale qui étend les techniques de parallélisation existantes.The recent spreading of multicore processors has put an extreme pressure towards parallelism extraction from software. Although important progresses have been made, automatic parallelization technologies are not yet fully operational for large-scale deployment and still fail to handle programs for many different reasons. We propose to extend the existing tools and techniques in three different directions. First, the existing programs have to be parallelizable, even if the source code is unreachable. For that purpose, we present a system able to parallelize sequential binary programs. Second, the parallelism extraction has to take into account the current external environment to reach the maximal performance. Thus, we present a version selection system which can exploit the specificities of different execution contexts to accelerate programs. Third, the parallelization can be complex or impossible to perform using only static tools. Thus, we propose a speculative parallelization system to transform and parallelize programs which are hard to analyze statically. All those three systems use the polyhedral model as a toolbox to analyze, transform, or parallelize programs. Working at different stages, from compile time to execution time, they form a global approach to extend the existing parallelization techniques

    Molecular and isotopic characterization of organic residues in an exceptional collection of potteries from Deir el-Medina (Egypt): a population and its products

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    Ces travaux concernent la caractérisation moléculaire et isotopique de vingt trois échantillons organiques archéologiques, qui n’ont jamais été analysés. Ils proviennent d’une nécropole égyptienne située à proximité du village de Deir el-Médineh, datée de la XVIIIème dynastie et plus précisément du règne de Thoutmosis III (soit 1500 av. J.C). Les nombreuses spécificités de cette nécropole et tout particulièrement le nombre exceptionnel de poteries dont la plupart étaient toujours pleines, ont maintenu le mystère autour de la nature et de la fonction des gens qui l’occupaient. L’étude moléculaire et isotopique de ces échantillons, menée au moyen de techniques chromatographiques et de spectrométrie de masse, nous a permis d’établir la présence de corps gras très dégradés. Des huiles végétales siccatives ou semi-siccatives et des graisses animales, seules ou en mélange avec une substance végétale dont seules les cires cuticulaires ont survécu aux phénomènes d’altération, ont pu être identifiées. En plus de cette famille à base de corps gras, trois échantillons caractérisés par la présence de sucres ont été détectés. L’hypothèse d’offrande alimentaire semble être la plus probable pour ces cas particuliers. Dans le cas des échantillons caractérisés par la présence de corps gras, la piste des onguents, probablement parfumés, utilisés comme remède ou cosmétique a été proposée. Ils auraient pu être fabriqués selon des pratiques anciennes d’enfleurage et de macération Le principe de ces techniques est d’extraire par l’intermédiaire du corps gras, les substances parfumées issues de fleurs, de feuilles, de résines, etc.In the present study, the molecular and isotopic composition of twenty three never analyzed archaeological organic samples, were investigated by chromatographic and mass spectrometric techniques. Samples came from an Egyptian necropolis, near the village of Deir el-Medina, dating from the XVIIIth dynasty and more precisely from the reign of Thoutmosis III (approximately 1500 B.C.). The many features of the necropolis, in particular the amazing number of closed and still full containers keep the mystery about the origin and function of the population. The molecular and isotopic study of these samples, allowed us to establish the presence of highly degraded fatty substances. We identified drying or semi-drying plant oils and animal fats, pure or in association with a completely degraded vegetal substance, characterized by the only presence of residual cuticular waxes. In addition to this family composed of fatty substances, three other samples with presence of carbohydrates were detected. These particular potteries were probably used as symbolic food offerings. The potteries probably contain unguents, maybe perfumed, used as remedies or cosmetics. For their preparation, ancient practices of maceration and enfleurage, in which fatty material such as animal fat or plant oil were used to extract aromatic and fragrant substances from flowers, leaves, resins, etc

    Brain atrophy estimation using magnetic resonance imaging : application to multiple sclerosis.

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    Cette thèse est consacrée à l'estimation de l'atrophie cérébrale longitudinale pour les patients atteints de sclérose en plaques. Tout d'abord, sur la base de leur robustesse à diverses sources d'erreur (inhomogénéité en intensité, bruit, distorsions géométriques, artefacts d'interpolation et présence de lésions), une évaluation des principales approches d'estimation de l'atrophie cérébrale est réalisée à l'aide de simulations d'une vérité terrain. Ensuite, une analyse statistique est effectuée afin d'estimer les incertitudes associées à l'atrophie mesurée. Un cadre générique est proposé pour construire des intervalles de confiance de l'atrophie estimée dans une région d'intérêt du cerveau. Une base d'apprentissage est utilisée pour obtenir ces intervalles de confiance pour un algorithme quelconque d'estimation de l'atrophie. Enfin, un cadre bayésien est proposé pour l'estimation conjointe d'une transformation non-rigide (à partir de laquelle l'atrophie est calculée) et du champ d'inhomogénéité en intensité présent dans les images. Cette approche bayésienne couplée aux techniques MCMC fournit un cadre rigoureux pour la construction d'intervalles de confiance de l'atrophie cérébrale.This dissertation is dedicated to estimation of longitudinal brain atrophy in patients with multiple sclerosis. First, an evaluation of widely used brain atrophy estimation approaches is carried out using simulated gold standards in order to test their robustness to various sources of error (bias-field inhomogeneity, noise, geometrical distortions, interpolation artefacts and presence of lesions). Next, statistical analysis of maps of volumetric change in an individual brain is performed in order to estimate the uncertainties associated with the measured atrophy. A generic framework for constructing confidence intervals for atrophy estimated in any region of interest in the brain is developed. With the help of a learning database, confidence intervals can be obtained for any atrophy estimation algorithm. Finally, a Bayesian framework is developed that allows for the estimation of a non-rigid transformation (from which atrophy is obtained through its Jacobian) and bias field inhomogeneity. MCMC sampling methods coupled with this framework make the construction of confidence intervals possible for the estimated atrophy

    Synthesis of fluorescent photo-activatables dyes for labeling and studying the dynamic of cellular proteins

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    Le développement d'outils d'investigation performants est une des clés de la compréhension de nombreux phénomènes biologiques. De part son caractère non invasif, le marquage de protéines par des sondes fluorescentes représente un outil de choix dans les explorations concernant l'expression ou la dynamique de protéines sur des cellules ou des organismes vivants. Les sondes fluorescentes photo-activables sensibles aux irradiations bi-photons permettent d'associer une résolution spatiale élevée à une faible toxicité vis à vis des systèmes biologiques vivants. Ces sondes sont toutefois limitées par une faible sensibilité aux irradiations bi-photon et une émission de fluorescence à des longueurs d'onde auxquelles certains composants des cellules émettent également de la fluorescence, diminuant ainsi la spécificité du signal fluorescent émis par la sonde. Le présent travail de thèse présente le développement d'une sonde fluorescente photo-activable émettant dans le rouge, hors de la zone d'émission des composants cellulaires et dont l'activation présente une sensibilité très élevée à une irradiation bi-photon.The development of new powerful investigation tools is one of the key points in the comprehension of many biological events. Fluorescent labeling of proteins is one of the most interesting tool for studying the expression and the dynamic of proteins, because of its non invasive aspect. Two-photon sensitive photo-activatable fluorescent probes associate high spatial resolution to low toxicity toward living systems. But they are mainly limited by a low two-photon photo-activation efficiency and an emission of fluorescence within a wavelengths range where some cellular components also emit fluorescence, decreasing thereby the intrinsic fluorescent signal emitted by the dye. This work describes the development of a new red-emitting two-photon photo-activatable fluorescent probe, which emits beyond the field of autofluorescence of the cells and shows a very high sensitivity to two-photon irradiation

    Citizens under guardianship. The « radical » women’s movement in Wilhelmine Germany. Presuppositions, stakes, strategies

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    La présente thèse de doctorat vise à saisir les enjeux du mouvement féministe « radical » de l’Allemagne wilhelmienne. Pour ce faire, elle identifie les présupposés théoriques de ses revendications et ses stratégies d’action. L’objectif de ces travaux de recherche est de rendre visibles les formes d’intervention politique de ces femmes engagées dans leur siècle, qui aspiraient, dans un contexte peu propice à l’expression d’une volonté politique féminine, à participer au progrès et à apporter leur contribution aux réflexions suscitées par l’avènement de la modernité. Comment s’articulaient les luttes proprement féministes du mouvement féministe « radical » avec son projet politique, qui touchait la société allemande dans son entier? Cette interrogation définit le cadre de notre enquête. L’organe de presse central du mouvement féministe « radical », intitulé Frauenbewegung. Revue für die Interessen der Frauen, paru pendant un quart de siècle, constitue l’élément majeur de notre corpus de sources. L’examen de la phase de constitution du mouvement féministe « radical » allemand situe ce mouvement dans son contexte discursif et dégage de premiers éléments de stratégie, définis par des enjeux sociaux, éthiques et anthropologiques. Se dessinent en filigrane des représentations de l’État, de la citoyenneté et de l’autonomie de l’individu qui se précisent à l’apogée du mouvement féministe « radical », où il s’agit, pour ses chefs de file, de s’imposer comme des actrices de la vie politique. La dernière partie de notre enquête s’interroge sur les circonstances du déclin que connut le mouvement féministe « radical » avant et pendant la Première Guerre mondiale, ainsi que sur l’héritage idéel de ce mouvement après sa disparition en 1919.This doctoral thesis aims to grasp the stakes in the « radical » women’s movement in Wilhelmine Germany. To this end, it works out the theoretical presuppositions and the strategies of action of this social movement. The goal of this research is to make visible the multiple forms of political intervention of women who were involved in their century. In spite of a context little favourable to the expression of a woman’s political opinion, the « radical » feminists longed to take part in progress and to contribute to answering the questions raised by the rise of modern times. How were the genuine feminist struggles of the « radical » women’s movement in Germany linked with its political project regarding the whole German society? This question sets the framework of our investigation. The central press organ of the title Frauenbewegung. Revue für die Interessen der Frauen, published by Minna Cauer during a quarter of a century, constitutes the main item in the corpus of sources. The analysis of the forming « radical » women’s movement places this social movement in its discursive context and draws first items of a strategy derived from social, ethical and anthropological stakes. Representations of state, citizenship and autonomy of the individual are hinted at in its first struggles and take shape at the climax of the « radical » women’s movement, where its main activists were striving to assert their right to be involved in deciding in Germany’s policies. The last part of this investigation analyses and explains the decline of the « radical » women’s movement before and during the First World War and points out the ideal legacy of this movement after its disbanding in 1919

    Development of a method to analyze reaction mixtures by APPI mass spectrometry

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    L'objectif du projet est de mettre au point et d’évaluer le champ d’application d’une méthode apportant une information rapide et précise sur la composition du milieu réactionnel (identification et quantification des composés issus d'un substrat d'intérêt), la plus universelle possible et facile à mettre en œuvre. Le principe de cette méthode, [TMOA-APPI-MS], repose sur le marquage d'un composé d'intérêt par une molécule organique chimiquement inerte et possédant des caractéristiques d'ionisation sélective par spectrométrie de masse APPI. Dans cette approche, le marqueur (triméthoxybenzène) est sélectivement ionisé et seules les molécules marquées sont détectées. Dans un premier temps, la méthode a été comparée avec des méthodes classiques (RMN, GC, HPLC) dans un couplage carbonylant de Sonogashira. Puis, l’étude de milieux plus complexes comportant des amines a été entreprise. Celle-ci a permis l’optimisation de conditions réactionnelles pour la synthèse d’hétérocycles à partir d’une ynone marquée. Suite à cette étude, une réaction de déséthylation de la triéthylamine catalysée par du platine a été découverte de manière fortuite grâce à la méthode. Une étude de validation de découverte de «nouvelles réactions» a ensuite été effectuée. Des conditions réactionnelles décrites et non décrites dans la littérature ont été appliquées à des substrats modèles marqués portant des fonctions alcynes ou diynes; les réactions ont été analysées par [TMOA-APPI-MS] afin de vérifier que la méthode est en mesure de détecter toutes nouvelles transformations. Ce criblage systématique de conditions réactionnelles a révélé que l’argent catalyse sélectivement l’hydratation des alcynes terminaux.The aim of the project is to set up a universal method, easy to implement, that gives a rapid and precise information on the composition of the reaction mixture (identification and quantification of compounds of interest) and to evaluate the scope of the method. The principle of this method, [TMOA-APPI-MS], relies on the labeling of a compound of interest by an organic molecule that is chemically inert and owns selective ionization by APPI. In this method, the label (trimethoxybenzene) is selectively ionized and only the labeled molecules are detected. The label decreases the influence of the other functions on the molecule or in the reaction mixture and allows a standardization of the analysis conditions. The method was first compared with classical techniques (NMR, GC, HPLC) in a carbonylative Sonogashira coupling. The study of more complex reaction mixture with amines was then undertaken. This study enabled the optimization of reaction conditions for the synthesis of heterocycles starting from a labeled ynone. A reaction of deethylation of triethylamine catalyzed by platinum was discovered by the method [TMOA-APPI-MS]. A study to validate the discovery of "new reactions" was then undertaken. Known and new reaction conditions were applied to labeled model substrates with alkyne or diyne functions. The reactions were analyzed by the method [TMOA-APPI-MS], in order to ensure its ability to detect new transformations. This systematic screening showed that silver selectively catalyzes the hydration of terminal alkynes

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