1826 research outputs found
Sort by
Knowledge and collaborative clustering of multisource complex data
No full textLes nouveaux défis apportés par les données complexes imposent le développement de nouvelles méthodes de fouille de données. Dans cette thèse, nous nous intéressons plus particulièrement à l'étape du processus de fouille qu'est la classification non supervisée (clustering). Celle-ci consiste à créer, de manière automatique, des groupes au sein d'un ensemble d'objets. Il existe de nombreux algorithmes de clustering différents qui peuvent, à partir des mêmes données, fournir des résultats très différents. Une nouvelle méthode de clustering collaborative est présentée, celle-ci menant à une amélioration de la qualité de la collaboration entre les méthodes. De manière complémentaire, des connaissances du domaine ou contextuelles sont souvent disponibles sur le problème de clustering à considérer. Nous étudions dans cette thèse les différentes méthodes permettant d'intégrer des connaissances dans les algorithmes de clustering. Nous proposons enfin une approche d'intégration de connaissances dans le cadre du clustering collaboratif. Les géosciences et plus particulièrement l'observation de la Terre via les images de télédétection ont été le domaine privilégié d'application des propositions faites lors de cette thèse. Les approches proposées dans cette thèse ont permis de mettre en place un processus automatique d'interprétation d'image guidé par les connaissances de l'expert.The new challenges brought by complex data require the development of new methods of data mining. In this thesis, we are particularly interested in the step of unsupervised classification (or clustering). The goal is to automatically create groups within a set of objects. There are many different clustering algorithms that can provide very different results even from the same data. A new method of collaborative clustering is presented, the latter leading to an improvement in the quality of collaboration between the methods. Furthermore, domain or contextual knowledge are often available on the clustering problem. In this thesis we study different methods for integrating knowledge into clustering algorithms. Finally, we propose an approach to integrate knowledge in collaborative clustering. Geoscienced and more particularly Earth observation through satellite images has been the main domain of application of our propositions. The approaches proposed in this thesis allowed us to create an automatic process for interpreting images guided by the knowledge of the expert
Molecular interaction of zinc finger domain: Study of androgen receptor DNA binding domain and SCA7 domain of Ataxin7 by NMR
No full textLa voie de signalisation du récepteur des androgènes (AR) est impliquée dans la progression du cancer de la prostate, et il a été montré que des mutations dans ce domaine étaient responsables de l'activation constitutive des gènes placés sous le contrôle des hormones androgènes. Une de ces mutations transforme un résidu thréonine du DBD en alanine (T575A). Des expériences permettant de mesurer l'activité de transcription ont permis à l'équipe du Dr. Ceraline à l'IRCAD de montrer que la mutation T575A induit un changement de spécificité du récepteur. Alors que l'activité de promoteurs placés sous le contrôle d'éléments de réponse spécifique de AR diminue, celle des promoteurs placés sous le contrôle d'éléments non spécifique augmente. Ce changement de spécificité est corrélé à une modification de l'affinité du récepteur pour les éléments de réponse spécifiques et non spécifiques. Afin de comprendre le mécanisme de cette "reprogrammation" à l'échelle moléculaire, l'étude structurale des domaines DBD des récepteurs sauvage et muté a été entreprise par RMN. La comparaison des deux structures en solution a montré que la mutation n'altère pas le repliement du domaine et donc que la différence de reconnaissance des éléments de réponse n'est pas liée directement à la structure tridimensionnelle du domaine. Nous avons ensuite cherché à déterminer si l'altération de la fonction n'était pas due à une
différence de dynamique de la chaîne peptidique. Afin d'étudier les mouvements moléculaires le long de la chaîne, des mesures de relaxation hétéronucléaire ont été effectuées et ont montré également une grande similarité dans le comportement dynamique des deux domaines, à l'exception d'une région située dans le premier doigt de zinc à proximité d'une histidine (H570), qui est conservée dans l'ensemble de la famille des domaines DBD des récepteurs nucléaires. Cette différence nous a conduit à mesurer, par RMN, le pKa de cette histidine pour les deux protéines. Nous avons ainsi montré que la mutation T575A induit une diminution de 0,5 unité de pH par rapport à la même histidine dans le domaine sauvage. L'analyse de la structure a permis de montrer que cette différence de pKa est liée à la perte d'une interaction entre le groupe hydroxyle de la thréonine 575 et le cycle imidazole de l'histidine. L'effet de la mutation sur le mécanisme
de reconnaissance s'explique donc par un effet indirect dans lequel un acide aminé situé à distance de la région
d'interaction modifie la surface électrostatique du domaine DBD. L'effet de la charge positive en position 570 sur la
spécificité de reconnaissance de l'élément de réponse a ensuite été étudiée en construisant plusieurs mutants portant ou non une charge à cette position (mutants H570R et H570A). Ces études ont permis de confirmer l'importance de cette charge et l'ensemble de nos travaux fournissent un éclairage inédit sur les mécanismes de reconnaissance de l'ADN par les récepteurs nucléaires... [etc]The androgen receptor (AR) is a ligand-activated transcriptional factor and a member of the nuclear receptor super family. AR shares a common structural and functional architecture with other members of nuclear receptors. The DNA binding domain of AR (ARDBD) binds to specific response elements as a homodimer. In the clinic, certain mutations in AR are associated with the progression of prostate cancer and have consequences for the treatment of patients with advanced prostate cancer. Previous studies showed that the mutation T575A, locating in the DNA binding domain, enhances the transcriptional activity regulated by full-length AR on promoters containing the non-specific response element compared to the wild type domain does not. These differences prompted us to study the molecular mechanism of ARDBD wild type and the T575A mutant. Structures of ARDBD wild type and T575A mutant revealed high similarity. However, dynamic behavior showed distinct differences between wild type and T575A mutant domains. The protonation state of H570 in ARDBD was found to be differed by the mutation. This loss of charge of H570 results in changes in transcriptional activity of AR... [etc
De l'exode balkanique à la genèse européenne : état des lieux et perspectives d'un Montenegro indépendant
No full textLorsque l’on se propose d’étudier les défis qui découlent de l’indépendance d’un pays, deux axes principaux s’offrent à nous : l’intégration de cet Etat dans la communauté internationale et sa stabilisation interne.
Indépendant de fait depuis 2000, le Monténégro a quitté l’union avec la Serbie en juin 2006 au lendemain d’un référendum encadré par les organisations internationales et notamment l’Union Européenne. Son « destin euro-atlantique », comme exprimé à de nombreuses reprises par ses dirigeants, l’a poussé sur la voie de l’Union Européenne et de l’OTAN, permettant la mise en place de profondes réformes et favorisant la stabilisation régionale et l’entrée du pays dans le « concert des Nations ».
La stabilisation interne du Monténégro est en revanche un chantier toujours en cours malgré de nombreux progrès. La construction de l’identité nationale et de l’Etat monténégrin restent à achever tandis que d’un point de vue économique, le pays doit multiplier les efforts pour lutter contre les trafics, la corruption, le tourisme anarchique et l’influence russe grandissante.
A ces conditions seulement, le Monténégro pourra être considéré comme un pays stable et intégré et aura réussi le pari de l’indépendance !Two directions come into mind when trying to examine the main challenges following the newly-acquired independence of a country. It seems to be essential first, to see to what extent this state is integrated in the international community, that is to say how successful the process of integration was and how stable and steady the state is afterwards.
Being de facto independent since 2000, Montenegro left Serbia in 2006 just after the referendum supervised by international organizations and European Union in particular. Its “Euro-Atlantic destiny” as it has repeatedly been referred to by its ruling class, opened up the way to its cooperation with European Union and NATO, thus enabling the implementation of profound reforms, encouraging stabilization in the area and promoting the entry of the country in the international community.
And yet, although the situation has improved a lot, Montenegro’s internal stabilization is still ‘on the go’, alterations going on. We must bear in mind that there is one major thing left : building a national identity and giving Montenegro its full potential. As regard economy, the country has no choice but to make repeated efforts to fight against trafficking, corruption, ill-organized tourism, and the growing influence of Russia.
On this condition only will Montenegro be considered as a stable and successfully integrated country, and succeed in being an independent state
L' Etat pris en comptes : les finances du duché de Lorraine sous le règne du duc Antoine (1508-1544)
No full textMeasurement of (n,xng) reaction cross sections of interest for the Generation IV reactors
No full textLe développement de réacteurs de quatrième génération demande la connaissance de sections efficaces de différentes réactions nucléaires. Les recherches du groupe GRACE concernent principalement la détermination des sections efficaces des réactions (n,xn) sur des isotopes intervenant dans les processus de transmutation et de régénération dans ces réacteurs. Le but de ces investigations est d’obtenir des sections efficaces inconnues et de réduire les incertitudes sur des données existantes.
Le présent travail consiste dans l'optimisation du dispositif expérimental développé pour les mesures sur des noyaux radioactifs. Les expériences sont réalisées auprès de l’installation GELINA (IRMM, Geel, Belgique) qui produit un faisceau de neutrons blanc pulsé. Ce faisceau pulsé permet de déterminer les énergies des neutrons par la méthode du temps de vol et la spectroscopie gamme prompte est utilisée pour identifier les différents noyaux formés par les réactions (n,xnγ).
L'objectif de ce travail est d'aboutir à un dispositif expérimental permettant la mesure des sections efficaces de la réaction 233U(n,xnγ), d’une très grande importance pour le processus de régénération du cycle 232Th.The presented work consists of studying 232Th(n,xnγ) and 235U(n,xnγ) reactions in the fast neutron energy domain (up to 20 MeV) with the best precision possible. The experiments are performed at GELINA which delivers a pulsed, white neutron beam at IRMM, Belgium. The time characteristics of the beam enable us to measure neutron energies with the time-of-flight (TOF) technique. The neutron induced reactions (in this case inelastic scattering, (n,2n) and (n,3n) reactions) are identified by online prompt γ spectroscopy with an experimental setup including four HPGe detectors. A double layered fission chamber is used to monitor the incident neutron flux. The obtained results are presented and a comparison between the measured cross sections and the TALYS code predictions will be discussed.
In order to achieve a very high precision on the reaction cross sections, an extensive work has been realised on the detection efficiencies of the counters used in the experiment. These quantities were in fact the largest sources of uncertainty in foregoing campaigns. After important efforts including high precision measurements together with Geant4 simulations, the efficiency of the fission chambers as well as of the HPGe detectors could be determined with accuracies below 3 %, accomplishing the final goal of a cross section determination with a precision of 5 %.
This work is a further step in the preparation of the measurement of 233U(n,xnγ) reactions, which are completely unknown at this stage although of very high importance in the 232Th regeneration process. For this reason, a new, segmented HPGe detector was conceived, which will complete the current experimental setup
Confinement and adsorption of end-grafted lambda-phage DNAs under bio-adhesive membranes
No full textMa thèse est une contribution à la compréhension du rôle joué par les macromolécules dans la formation d'un contact adhésif entre des membranes bio-fonctionnelles de phospholipides. Nous étudions l'étalement d'un bicouche de DOPC sur un tapis d'ADNs du phage lambda, greffés par leurs deux extrémités. Le processus d'étalement a pour résultat de râcler et d'agraffer les chaînes entre la membrane et le substrat. La forme finale d'un ADN agraffé dépend des deux paramètres que sont la tension interne de la chaîne et les forces appliquées par la bicouche. Nous montrons qu'en utilisant la relation force-extension bien connue pour une molécule d'ADN, nous pouvons révéler les forces mises en jeu durant la formation de la zone d'adhésion. Nous calculons également la distribution spatiale des monomères des segments d'ADN qui ne sont pas confinés sous la membrane, mais émergent de la zone d'adhésion, et fluctuent dans la limite des contraintes géométrique du sytème. Finallement nous contrôlons les conformations et la dynamique des ADN greffés en jouant sur la concentration d'AzoTAB, un agent compactant photosensible de l'ADN.My PhD is a contribution towards the understanding of the role played by bio-macromolecules in the formation of the adhesive contact between bio-functional phospholipid membranes. We study the spreading of a biotinylated DOPC bilayer on a carpet of double end-grafted λ-phage DNAs. The spreading process scrapes and staples the chains between the membrane and the substrate. The final stapled DNA shape is a function of both the internal chain tension and the forces applied by the bilayer. We show that by using the well known force extension relationship for a DNA molecule we can reveal the forces at play during the formation of the adhesion patch. We also compute the monomer distribution of the segments of the DNA chains that are not confined under the membrane but emerge from the membrane side and fluctuate within the geometric boundaries of the system. Finally we control the conformations and the dynamics of the tethered DNAs by using AzoTAB concentration, a photosensitive compacting agent of the DNA chains
Vulnerability of socio-environmental system in the Sahel : the case of the Senegal river estuary from perception to natural hazards management.
No full textLa zone sahélienne est sujette à une forte variabilité hydroclimatique qui se traduit ces dernières années par un retour à des hivernages pluvieux. L’estuaire du fleuve Sénégal qui se trouve dans sa partie septentrionale subit les conséquences de ces fluctuations climatiques. En 2003, la crue du fleuve Sénégal qui s’annonçait précocement avait poussé les autorités sénégalaises à délocaliser l’embouchure du fleuve Sénégal à 25 km en amont. Cette décision prise dans l’urgence a entraîné de profondes modifications du comportement hydrologique et hydrodynamique de l’estuaire. L’objectif de ce travail est de mettre en évidence la relation conflictuelle de l’homme à l’environnement, notamment illustrer une approche de géographie globale qui se situe résolument à l’interface homme/nature. Il s’agit de montrer, d’une part, que la société engendre des vulnérabilités par ses différentes modes d’occupation du sol dans un espace qui est déjà fragilisé par ses conditions physiques. D’autre part, les différentes politiques visant à atténuer les risques naturels ont induit une vulnérabilité plus insidieuse du fait d’une absence de culture du risque perceptible dans les pays en voie de développement.The Sahel is subject to high variability resulting hydroclimatic years by a return to rainy winters recently. The estuary of the Senegal river located in the northern part suffers the consequences of these climatic fluctuations. In 2003, the flooding of the Senegal river had precociously pushed the senegalese authorities to relocate the mouth of the Senegal River 25 km upstream. This decision resulted the urgency of profound changes of the hydrological behavior and hydrodynamics of the estuary. The objective of this work is to highlight the conflictual relationship of man and environment, particularly illustrating a firm comprehensive approach to geography at the interface between man and nature. These show, first, that society creates vulnerabilities through its various modes of land in an area which is already weakened by its physical condition. Secondly, that the various policies to mitigate natural hazards have led a more potential vulnerability due to lack of awareness of risk perceived by the people in developing countries
Study of hypernuclei in the reaction 6Li+ I2C at 2 A Oe V
No full textCette thèse présente une nouvelle approche expérimentale proposée par la collaboration HypHI pour l’étude des hypernoyaux dans des réactions induites par des faisceaux d’ions lourds stables ou radioactifs. La méthode proposée permet de mesurer les hypernoyaux formés par coalescence entre un hypéron Λ produit dans la région des participants et un fragment spectateur issu du projectile. Ce mode de production offre la possibilité d’étudier les hypernoyaux dans des conditions extrêmes d’isospin et de mesurer directement leur moment magnétique hypernucléaire. Une première expérience ayant pour objectif principal de démontrer la faisabilité de la nouvelle méthode proposée, a été réalisée en effectuant une spectroscopie précise des hypernoyaux 4 ΛH, 3 ΛH et 5 ΛHe produits dans les collisions 6Li+12C à une énergie incidente de 2 GeV par nucléon. La conception, le développement et la réalisation du nouveau dispositif de détection sont présentés. Les performances des détecteurs, ainsi que celles du système de déclenchement ont été étudiées.
Le code d’analyse développé pour la reconstruction des hypernoyaux est présenté ainsi que ses performances sur les données simulées. L’analyse des données expérimentales et
les premiers résultats de la reconstruction de l’hypéron Λ et de l’hypernoyau 5 ΛHe, ainsi que la mesure de leur temps de vie, sont présentés. Ces premiers résultats démontrent
la faisabilité de cette nouvelle approche expérimentale pour l’étude des hypernoyaux et ouvrent de nouvelles perspectives dans la recherche d’hypernoyaux lourds et proches des limites de stabilité.This thesis presents a new experimental approach proposed by the HypHI collaboration to study hypernulei by means of reactions induced by stable and radioactive heavy-ion
beams. The proposed method allows to measure hypernuclei formed by coalescence of a Λ-hyperon produced in the participant region and a projectile spectator fragment. Such
a production mode offers the opportunity to investigate hypernuclei at extreme isospin and to measure directly hypernuclear magnetic moments. A first experiment aiming
at demonstrating the feasibility of this new method has been carried out with a 6Li beam at 2 A GeV impinged on a 12C target by identifying 3 ΛH, 4 ΛH and 5 ΛHe hypernuclei
from their mesonic weak decay modes. The design, development and realization of this experiment are presented. Performances of the detectors and of the trigger system have been investigated. The software analysis developed for the reconstruction of hypernuclei is
presented and its performances are evaluated using simulated data. The data analysis and preliminary results of the reconstruction of Λ hyperons and of 5 ΛHe and the measurement of their lifetime are reported. The results demonstrate the feasibility of the new experimental
approach for the study of hypernuclei and open new perspectives to investigate heavier hypernuclei toward the proton and neutron drip lines
Molecular and cellular aspects of programmed cell death in response to genotoxics in plants
No full textLes plantes sont constamment exposées à différents stress endogènes et exogènes, et donc en raison de leur sessilité, par rapport aux animaux, elles ont dû développer des mécanismes de défense spécifiques. Un de ces stress est le dommage à l'ADN, qui doit être précisément réparé pour éviter la génération de mutation d'ADN qui pourraient déclencher la mort cellulaire programmée (MCP). Toute dérégulation de la réparation d'ADN ou de la MCP pourrait induire un développement du cancer et/ou à la mort cellulaire. Chez les Eukaryotes, la réponse aux dommages d'ADN est conservée, donc certains régulateurs, tels qu´ATM, ATR ou E2F, ont été identifiés chez les animaux ainsi que chez les plantes. La kinase ATM est essentielle pour la réponse aux cassures d'ADN double-brin (CDBs) et, chez les mammifères, elle module l'activité des facteurs de transcription p53 et E2F, impliqués dans le contrôle de checkpoints du cycle cellulaire, la réparation d'ADN et la MCP. Contrairement à p53, les facteurs E2Fs ont été identifiés chez les plantes, mais leurs rôle dans la régulation de la MCP reste mal défini.
En utilisant Arabidopsis et la lignée de tabac BY-2, nous avons démontré qu´un traitement à la bléomycine (BLM - un inducteur de CDBs) induit de la MCP autophagique à travers différentes voies de signalisation en fonction des concentrations de la BLM. En présence de fortes doses de BLM, la MCP est contrôlée par ATM ce qui n´était pas le cas pour de faibles doses de BLM. Dans les racines d'Arabidopsis, la MCP est induite principalement dans le méristème. Les autres cellules racinaires vont vers un programme de différenciation et d’endoréduplication suite à des modifications des flux d’auxine. Dans les cellules BY-2 non-différenciées, des fortes doses de BLM induisent de la MCP qui est non régulée au cours du cycle cellulaire, mais est inhibée par la surexpression d’E2F. À faibles doses de BLM, la mort cellulaire induite est contrôlée par le checkpoint G2/M qui est inhihibé par la surexpression de E2F. L´ensemble de nos résultats nous a permis de démontrer certaines spécificités de la régulation de la MCP végétale en réponse aux dommages d'ADN.Plants are continuously exposed to different endogenous and exogenous stresses and thus, compared to animals, they had to evolve specific defense mechanisms due to their sessile life. One of these stresses is DNA damage,which must be precisely repaired to avoid the generation of harmful DNA mutation which could, in extreme cases, lead to programmed cell death (PCD). DNA damage response is conserved among Eukaryotes, thus some regulators, such as ATM, ATR or E2F, have been identified in both,animals and plants. The kinase ATM is essential for the response to DNA double strand breaks (DBSs) and, in mammals, modulates the activity of p53 and E2F transcriptional factors involved in PCD induction. Compared to p53,E2F members were identified also in plants,but their role in PCD regulation remains unknown.
Using BY-2 cells and Arabidopsis, we demonstrated that bleomycin (BLM–a DBS inducer) treatment led to PCD mediated by vacuolar collapse but via different signaling pathways according to BLM concentrations. At high BLM doses, PCD induction was controlled by ATM, but at low BLM doses cell death induction was ATM-independent.In Arabidopsis root, PCD occurred mainly in the meristem leading to differentiation and endoreduplication of the root tip cells mediated by the modification of auxin fluxes.In non-differentiated BY-2 cells,high doses of BLM induced PCD which was not cell cycle-regulated and which was inhibited by E2F overexpression. At low doses,BLM specifically induced cell death at the G2/M cell cycle checkpoint which was together with PCD bypassed by E2F overexpresion. Taken our results together, we demonstrate some plant specificities of PCD regulation in response to DBSs
Evolution of flow, architecture and rheology of an orogenic accretionary wedge (Orlica-Śnieżnik, Sudetes)
No full textL’évolution tectono-métamorphique d’un prisme d’accrétion orogénique est abordée à l’aide d’une étude géologique multiméthode. Le dôme d’Orlica-Śnieżnik (Sudètes) est situé au front d’un butoir rigide. Sa formation est expliquée par l’influx de croûte continentale subductée jusqu’à 50-60km de profondeur dans un prisme d’accrétion. La racine ainsi formée comprend une croûte inférieure felsique avec quelques lentilles basiques partiellement fondues en profondeur et séparées de la croûte moyenne (metasédiments) par une couche rigide d’orthogneiss. Cette infrastructure rhéologiquement hétérogène est remaniée au front du butoir par des plissements plurikilométriques de longueurs d’onde variables. Ils permettent des échanges verticaux aboutissant à l’exhumation des différents niveaux crustaux. La croissance du dôme par plissement s’achève par le décoiffement de la superstructure associé à un amincissement ductile et à un remplissage des bassins syn-orogéniques adjacents. Cette étude montre la formation et l’évolution conjuguée des différents niveaux crustaux notamment lors de l’enfouissement le long de la zone de subduction. Ici, la déformation dans les orthogneiss est localisée et permet le transport passif de larges portions de roches peu déformées et rigides. Ceci est expliqué par un changement dans le mécanisme de recristallisation d’un fluage- dislocation vers un glissement aux joints de grains. initié par la croissance de phases interstitielles dans les agrégats monominéraux. Cette évolution est aussi observée dans les migmatites formant le cœur des anticlinaux proches du butoir. Ils permettent l’adoucissement rhéologique nécessaire au fluage dans le prisme d’accrétion.Evolution of flow, framework and rheology of an orogenic accretionnary wedge is assessed with a multimethod geological investigation. The Orlica-Śnieżnik Dome (Sudetes) is situated in front of a rigid indenter. Its structure is explained by an influx of continental crust until 50-60 km depth in an accretionnary wedge. The incipient root is composed of lower crustal felsic material partially melted with smaller pieces of basic rocks. Structurally above it lies an intermediate level of weakly deformed metagranite and metasediments of the middle crust. This rheologicaly heterogeneous layered infrastructure is subsequently reworked in front of the rigid buttress developing multi-scale wave-length crustal upright folds. It permits vertical material transfers between different crustal levels that is responsible for the growing dome. It is achieved by the detachment of the superstructure, ductile thinning and by infill of syn-orogenic basins. This study highlights the shared evolution of the different crustal levels, in particular during influx and burial along the subducting plate. Here, the deformation in eclogites metagranites is localized and allows to passively transport large pieces of weakly deformed rocks into the apex of the corner. This localization is explained by a switch in the mode of recrystallisation from dislocation creep to grain boundary sliding diffusion creep which is chemically enhanced by nucleation of interstitial phases in monomineralic aggregates. This switch in mode of deformation is also observed in migmatites in front of the butress during exhumation. It permits the weakening of the rocks that is necessary to explain flow in the whole felsic corner