Institut Charles Sadron

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    Research on "The world as will and representation" of Schopenhauer : the philosophical problems posed by the suffering of human life.

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    Le but principal de ma recherche est de trouver les causes des souffrances de la vie humaine et d’en rechercher les sorties à partir d’une analyse de la philosophie de Schopenhauer, à travers son œuvre «Le monde comme volonté et comme représentation». Pour cela, j’ai d’abord regardé la philosophie de Schopenhauer sur un plan global. Puis j’ai étudié les souffrances humaines et le monde de la négation du vouloir-vivre chez Schopenhauer, et le caractère de l’homme selon une classification en trois groupes, «caractère de Nature, caractère d’Homme et caractère de Volonté». De plus, j’ai établi à partir des étapes précédentes les trois Lois, «la Loi absolue, la Loi de la nature et la Loi de l’homme» comme hypothèse principale de travail. De ce fait, j’ai pu analyser et enfin trouver les bonnes sorties des souffrances humaines : la meilleure sortie consiste en la meilleure adaptation de chaque personne à la Loi à laquelle elle appartient, selon son propre caractère, et donc selon sa propre capacité cognitive. Après ce résultat, je suis revenu à la philosophie de Schopenhauer dans une optique critique, en attendant que de nouvelles problématiques imprévues y soient claires et que la conclusion de mon travail soit plus solide et cohérente; il en est ainsi que j’ai pu trouver «la pure connaissance parfaite» de Wonhyo (le grand bouddhiste coréen, 7ème siècle après J.C), par rapport à «la pure connaissance» de Schopenhauer.The main purpose of my research is to find the causes of suffering for the human life and to seek the exits de this suffering from an analysis of the philosophy of Schopenhauer, in his work «The world as will and representation». For this, I first looked at the philosophy of Schopenhauer on a comprehensive plan. Then I studied the human suffering and the negation of the will to live in Schopenhauer, and the character of man as classified in three groups, «character of Nature, character of Man and character of Will». In addition, I established from the previous steps the three Laws, «Law absolute, Law of nature and Law of man», as the main working hypothesis. As a result, I could analysis and finally find the right outputs of human suffering : the best output consists of the best adaptation of each person with the Law to which it belongs, according to his own character, and therefore according to his own cognitive ability. After this, I returned to the philosophy of Schopenhauer with a critical view until new unforeseen problems are clear and the conclusion of my work is more consistent; so I found  «the perfect pure cognition» of  Wonhyo (the great Korean Buddhist, 7th century A.D.) compared to «the pure cognition» of Schopenhauer

    Molecular mechanisms underlying AID target specificity during antibody diversification

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    Afin d'établir une immunité durable et adaptée, le répertoire des lymphocytes B est diversifié par les mécanismes d’hypermutation somatique (HMS) et commutation isotypique (CI). Ces processus sont initiés par des cassures à l’ADN induites par Activation Induced Cytidine Deaminase (AID). Lors de la CI, ces lésions sont reconnues par des facteurs de réparation de l’ADN et réparées par jonction d’extrémités non homologues. Cependant, malgré les multiples voies de réparation de l’ADN, les lésions générées par AID peuvent être réparées de manière aberrante et mènent à des recombinaisons illégitimes. C’est pourquoi de robustes mécanismes de régulation et ciblage d’AID sont requis afin de limiter les dommages à l’ADN au locus Igh dans les cellules B et prévenir les dommages collatéraux pouvant mener à une tumorogenèse étendue. Parmi ces mécanismes, des modifications épigénétiques du locus Igh corrélant avec la CI pourraient être importantes pour le ciblage spécifique d’AID au locus Igh. Aussi afin d’appréhender les mécanismes moléculaires qui sous-tendent le ciblage d’AID dans les loci Ig, avons-nous entrepris d’identifier les facteurs interagissant avec AID et étudier leur rôle fonctionnel au cours de l’HMS et CI.Nous avons montré que AID forme un complexe avec les facteurs KAP1 et HP1 qui est retenu au locus Igh, au niveau de la région de switch Sμ porteuse de la modification de l’histone H3 H3K9me3 in vivo. La disruption in vivo du complexe cause un défaut de formation des cassures dans la région Sμ et en un défaut concomitant de la CI, l’HMS n’étant pas altérée. Ainsi KAP1 et HP1 retiennent AID aux résidus H3K9me3 marquant la région Sμ afin de permettre une CI efficace.B lymphocytes diversify their antibody repertoire through somatic hypermutation (SHM) and class switch recombination (CSR), which require a single enzyme, Activation induced cytidine deaminase (AID). AID deaminates cytosines to uracils, to produce dU:dG mismatches that are recognized and processed by to result in SHM or CSR. AID-induced DNA lesions are processed to form DNA double-stranded breaks (DSBs) during CSR, recognized by components of the DNA damage response pathway and repaired through non-homologous end joining. Aberrant processing of such DNA breaks leads to increased levels of illegitimate recombination events, therefore tight regulatory and targeting mechanisms are required to restrict AID to the appropriate cell type and loci. Although, CSR correlates with epigenetic modifications at the Igh locus, and these modifications have been proposed to target the CSR machinery, the relationship between these and AID remains unknown. My results provide a mechanism linking AID to epigenetic modifications during CSR. We show that during CSR, AID forms a complex with KAP1 and HP1 that is tethered to the Igh locus (specifically to the donor switch region-S), bearing trimethylation at lysine 9 (H3K9me3) in vivo. Furthermore, in vivo disruption of this complex results in inefficient DSB-formation at S and a concomitant defect in CSR but not in somatic hypermutation. We thus propose a model in which KAP1 and HP1 tether AID to H3K9me3 residues that mark S in order to permit efficient CSR

    New data concerning endogenous morphine : description of its localization in the central nervous system and development of biotechnological and therapeutic tools

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    C’est depuis les années 80 que de nombreuses études ont démontré la présence de morphine endogène (ME), de structure identique à la morphine du pavot, dans le système nerveux central (SNC) de mammifères. Cependant, déterminer ses rôles au sein du SNC est difficile puisqu’il existe que très peu de données la concernant (localisation cellulaire, protocoles de quantification). Dans ce contexte, mon objectifs était fournir de nouveaux outils permettant l’étude et la compréhension des rôles de la ME au sein du SNC. La première partie de mes résultats décrit la localisation de la ME au sein du SNC de souris adulte. Après avoir caractérisé l’anticorps anti-morphine que j’ai utilisé, j’ai montré que la ME et ses dérivés sont principalement retrouvés dans les interneurones GABAergiques et les astrocytes du SNC. La seconde partie de mes résultats présente les études réalisées sur deux protéines liant les alcaloïdes endogènes/exogènes : (i) la PhosphatidylEthanolamine Binding Protein, capable de lier la M6G et la M3G avec une affinité identique à son ligand de référence, la PhosphatidylEthanolamine. (ii) La créatine kinase, qui lie à haute affinité la ME et ses dérivés. Du plus, j’ai décrit une dissociation de ce complexe par le lithium. Enfin ma dernière partie décrit que l’utilisation du lithium lors de prélèvements sanguins permet d’augmenter jusqu’à quatre fois le rendement de détection de la ME. En conclusion, ce travail de thèse présente de nouveaux outils et de nouvelles pistes de recherche permettant l’étude et la compréhension des rôles de la ME au sein du SNC (cartographie, protéine de liaison, amélioration de la quantification).Since 80s, endogenous morphine (eM), structurally identical to the morphine from poppy, has been found in mammalian central nervous system (CNS). Only few informations are available about eM (cellular localization, models and quantification protocols) and thus, studies of its roles and implications in the brain physiology is difficult. During my thesis, my goal was to developed new tools in order to study and understand the roles of eM in the CNS. First, I have described the localization of eM in the CNS of adult mouse. Using a well characterized antibody, I have demonstrated that eM and its derived compounds are mainly found in astrocytes and GABAergic interneurons throughout the mouse CNS. Secondly, I described two endogenous / exogenous alkaloids binding proteins. (i) The PhosphatidylEthanolamine Binding Protein that is able to bind M6G and M3G in a similar manner as its reference ligand PhosphatidylEthanolamine. (ii) The creatine kinase (CK) that is able to bind eM and its derived compounds with high affinity. Such CK-eM complex is dissociated by a lithium treatment. Finally, in the last part of my results, I have described that the presence of lithium in the collection tube allows a better measuring of eM and exogenous morphine. To conclude, during my thesis I set up new tools and new research lines (eM CNS mapping, binding proteins and better quantification yield) that will allow to study and understand the roles of eM in the CNS of mammals

    The morpho-functional maturation of the locomotor system in the King penguin chick

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    La période qui sépare la naissance d’un individu de l’acquisition de son indépendance est caractérisée par une croissance rapide marquée par une alimentation parentale soutenue. Lorsque la durée d’élevage est longue, l’apport alimentaire parental peut présenter des variations saisonnières liées à des modifications environnementales et devenir un facteur limitant de la croissance. Dans cette situation peu d’études permettent de comprendre comment est géré le développement des tissus lorsque les apports énergétiques sont limités. Afin de répondre à cette question, nous avons étudié la croissance du poussin de manchot royal. Cet oiseau marin, semi-altricial, se caractérise par un élevage long (environ un an) interrompu par une période de restriction alimentaire sévère durant l’hiver austral. L’objectif de ce travail était d’étudier le développement des ceintures pectorale et pelvienne. La masse protéique, les types de fibre et la composition en chaînes lourdes de myosine ont été déterminés dans les muscles. La compacité des os longs a aussi été mesurée. Nous avons montré que le développement rapide des muscles pelviens permet aux poussins d’acquérir une locomotion terrestre indispensable à leur survie. Tandis que la croissance des muscles pectoraux, utilisés pour la nage, est retardée. Les muscles pelviens sont moins affectés par l’hiver que les muscles pectoraux qui seront sollicités plus tard, lors du départ en mer. Le développement des os semble égal au niveau des deux ceintures et aucun effet de l’hiver n’est observé. Finalement, le manchot royal possède une croissance différente des autres espèces altriciales à mettre en relation avec les contraintes environnementales.The period between birth and the acquisition of independence is generally characterized by a rapid and continuous growth, and by a steady parental food supply. When the rearing period is long, parental food provisioning may fluctuate seasonally in relation to environmental changes and food shortage becomes a growth-limiting factor. In such situations little is known on how the development of tissues is ensured when energy is limited. We investigated this question in chicks of the king penguin. This semi-altricial seabird is characterized by a long rearing cycle (about one year) which is interrupted by a period of severe food restriction during the sub-Antarctic winter months. The main of this work was to study the development of the pectoral and pelvic girdles. Protein mass, fibre type and myosin heavy chain content were determined in muscles. The bone area was also measured in long bones. We showed that the development of the pelvic muscles allow nestlings to rapidly acquire an effective pedestrian locomotion that is essential for their survival. The growth of the pectoral muscles, which is required for aquatic locomotion, is delayed. In addition, it appears that pelvic muscles were less affected by winter than pectoral muscles, used later for swimming, at departure to sea. The development of the long bones of the pectoral and pelvic girdles seems equivalent and no effect of the winter is observed. Finally, the king penguin has a different growth from the other altricial species, in relation to the environmental constraints

    The water cycle in sahelian africa : multidiscipinary approach and contribution of spatial and terrestrial gravimetry

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    En regard de la variabilité climatique et des activités humaines, un intérêt croissant a été porté au cours des dernières décennies à l’observation des ressources en eau, leur évolution et leur quantification. Les méthodes géodésiques examinent la forme de la Terre et son champ de gravité. Elles sont sensibles à la redistribution des masses d’eau à la surface terrestre, à des échelles spatiales variant de la parcelle au continent et s’avèrent de ce fait être des outils de choix pour suivre la variabilité des ressources en eau. Dans le cadre des projets AMMA et GHYRAF, une série d’actions en gravimétrie, géodésie, géophysique, et hydrologie a été orchestrée sur un site pilote situé au sud–ouest du Niger, à 70 km de sa capitale Niamey. L’influence de la mousson ouest africaine sur le champ de pesanteur est étudiée à l’échelle locale par des mesures in - situ et à l’échelle continentale par des mesures satellitaires. Le signal gravimétrique observé est interprété en terme de variabilité hydrologique, afin d’accéder aux paramètres hydrogéologiques locaux comme la porosité de drainage de l’aquifère. Les incertitudes liées à la présence d’eau dans les premiers mètres de sol sont évaluées à l’aide de mesures d’humidité in-situ. Les valeurs de porosité estimées par gravimétrie sont comparées aux valeurs estimées par résonance magnétique protonique, illustrant la cohérence de ces deux méthodes géophysiques de sensibilités différentes (résolution spatiale et temporelle, objet imagé). L’hétérogénéité spatiale des stocks d’eau est appréhendée, à l’échelle du bassin versant (~2.5 km2), par une saison de mesures intensives de microgravimétrie. De variations dynamiques de la gravité de faible à moyenne amplitude (≤ 220 nm s-2) sont détectées et analysées avec minutie afin de mieux évaluer la variabilité intrasaisonnière des différents réservoirs hydriques en présence. L’hétérogénéité de stockage dans la zone de vadose apparaît comme la source principale de variabilité spatiale du signal gravimétrique à l’échelle locale (< 1 km).In regard with climate variability and human activities, recent advances in water resources observation, quantification and prediction have led to a growing interest in the geophysical community. Geodetic techniques allow measuring the shape and the gravity field of the Earth. These measurements are sensitive to the water mass distribution at the Earth’s surface over a wide range of time and space scales. Such techniques may thus provide valuable information about continental water storage changes. In the framework of the AMMA and GHYRAF projects, a bunch of actions have been set up in gravimetry, geodesy, geophysics and hydrology on a pilot site located in south-west Niger, at 70 km of the city of Niamey. The seasonal water cycle, in link with the West African monsoon, is studied at local scale by in situ measurements and at continental scale by satellite data. The observed gravity signal is analysed to retrieve local hydrogeological parameters, such as the drainage porosity. The uncertainties due to the presence of water in the first meters of soil are evaluated with in situ measurements. Porosity values estimated by gravimetry are compared to values of the aquifer water content derived from magnetic resonance soundings. The good agreement between these two independent geophysical methods, displaying different sensitivity as well as spatial and temporal resolutions, shows their potential to constrain local hydrogeological parameters. The spatial heterogeneity of the water storage is investigated at the small catchment scale (~ 2.5 km2) by an intensive microgravity field campaign. Dynamic variations of the gravity are measured with small to medium amplitudes (≤ 220 nm s-2) and carefully analysed to evaluate the intraseasonal variability of the water storage. The heterogeneity of the water storage in the vadose zone appears as the main reason for the spatial variability of the gravimetric signal at local scale (<1 km)

    Dynamical aspects of currents around quantum to classical crossover

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    Cette thèse s'inscrit dans la problématique de la transition quantique-classique et, plus particulièrement, dans le cadre de la construction de l'électromagnétisme classique à partir de l'électrodynamique quantique sous-jacente en faisant appel à la théorie de la décohérence. Pour cela, il est nécessaire d'utiliser un cadre théorique permettant de définir des observables sur des états mixtes afin de rendre compte de l'intervention d'un environnement. Les observables et les phénomènes sont décrits ici au moyen de fonctions de Green. La valeur moyenne du champ électromagnétique et celle de courants de charges ont été introduites pour des résolutions d'espace-temps appartenant au domaine quantique. Ces moyennes sont définies à partir de conditions initiales: les équations du mouvement retardées leur correspondant ont été obtenues par application du principe variationnel à l'ordre d'une boucle. En outre, ces relations font intervenir la polarisabilité d'un environnement constitué de charges dont l'étude a été menée dans le vide ainsi qu'à température et densité finies. Enfin, la décohérence du champ électromagnétique a pu être établie par le calcul perturbatif de la matrice densité réduite de cette observable. Pour une résolution microscopique, les chemins consistants correspondent à ceux dont les modes définissent des excitations collectives de faible temps de vie: c'est le signal d'un régime fortement dissipatif nécessaire à l'établissement d'une limite classique au sens de la décohérence.This thesis is about the quantum to classical crossover. More specifically, this work is motivated by the derivation of classical electromagnetism from the underlying quantum electrodynamics using the theory of decoherence. To achieve this goal, the use of a framework allowing mixed states for observables is needed in order to take into account the effects of an environment. Observables and phenomena are described here by means of Green's functions. Expectation values of the electromagnetic field and of the electric currents are introduced at space-time resolution which belongs to the quantum domain. These quantities are defined by initial values: they obey retarded equations of motion which can be derived from an action principle and which are obtained at one-loop order. These relations bring in the polarizability of an environment of charges which is studied in vaccuo as well as at finite temperature and density. Finally, decoherence of the electromagnetic field is established by a perturbative calculation of the reduced density matrix for this field. At the microscopic scale, consistency depends on histories which define short life-time collective excitations: this is the mark of a strongly dissipative situation which is necessary if one wants to establish a classical regime within the framework of decoherence

    Structural, petrological and geochronological contribution to intracontinental tectonics of the variscan belt of Europe (Sudetes, Vosges)

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    La tectonique intracontinentale de la chaîne hercynienne d’Europe est explorée en combinant géologie structurale, pétrologie métamorphique et géochronologie. Cette approche est appliquée à l’étude de différents niveaux de la croûte orogénique dans deux témoins hercyniens : le dôme d’Orlica-Śnieżnik (Sudètes) et les Vosges (NE France). Au Dévonien, l’activité de subductions peut aboutir à l’ouverture de bassins d’arrière-arc, mais génère aussi un épaississement crustal. Dans les deux massifs, la croûte orogénique se forme alors par amalgamation de portions autochtones et allochtones. Au début du Carbonifère inférieur, des transferts verticaux de matière s’opèrent grâce à un plissement d’échelle crustale, et juxtaposent la croûte moyenne et inférieure. Ce phénomène est remplacé par un aplatissement localisé formant une discontinuité intra-orogénique dans la croûte moyenne. Cette discontinuité permet un découplage de la déformation entre croûte supérieure et inférieure, et sa réactivation en régime extensif favorise l’exhumation du système. A la fin du Carbonifère inférieur, l’exhumation est simultanément accommodée par un amincissement ductile au cœur de l’orogène et par des détachements développés vers les bordures de la chaîne. L’évolution des Sudètes paraît contrôlée par la fermeture du bassin saxothuringien. A l’inverse, le socle vosgien enregistre l’influence des subductions quasi-orthogonales du bassin saxothuringien et de l’océan Paléotéthys, avant de subir les effets de la fermeture du système rhénohercynien. Les processus reconnus dans ce travail suggèrent finalement que le caractère de la tectonique intracontinentale n’a que peu varié au cours du Phanérozoïque.Intracontinental tectonic processes acting during Variscan orogeny are explored using a combination of structural geology, metamorphic petrology and geochronology. This approach is applied to study different levels of the orogenic crust in two Variscan massifs: the Orlica-Śnieżnik Dome (Sudetes) and the Vosges Mountains (NE France). During the Devonian, the activity of subductions locally triggered back-arc opening, but also generated crustal thickening. In both massifs, the orogenic crust was formed by the welding of autochtonous and allochtonous portions. In the early Lower Carboniferous, vertical material transfers were achieved through crustal-scale folding and led to the juxtaposition of the middle and lower crust. It was followed by localized flattening which produced an intra-orogenic boundary zone at mid-crustal level. The presence of such a zone allowed deformation decoupling between the upper and lower crust, and also favoured exhumation of the system during extensional reactivation. In the late Lower Carboniferous, exhumation was simultaneously accommodated by ductile thinning in the core of the orogen, and by the activity of detachment systems towards the margins of the orogenic belt. The evolution of the Sudetes appears to be controlled by the closure of the Saxothuringian basin. Conversely, the Vosges basement recorded the influence of the quasi-orthogonal subduction zones of the Saxothuringian basin and the Palaeotethys Ocean, and later documented closure of the Rhenohercynian basin. The processes recognized in this work finally suggest that the character of intracontinental tectonics has not significantly changed throughout the entire Phanerozoic

    Ultrafast spectroscopy of optical activity in chiral molecules

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    Ce travail est consacré à la mesure du dichroïsme circulaire résolu en temps pour l’étude de changement de structure ultra-rapide de molécules chirales. Nous avons mis en place un système unique qui permet de mesurer le pouvoir rotatoire et le dichroïsme circulaire, en couplant une expérience pompe sonde et un ellipsomètre. La pompe induit des variations d’activité optique tandis que la sonde mesure ces changements grâce à l’utilisation d’une lame quart d’onde achromatique et deux polariseurs de Glan croisés. Notre montage rend possible les mesures sur les états fondamentaux et excités des niveaux électroniques de molécules chirales. Nous avons testé ce montage sur deux énantiomères d’une molécule chirale modèle le Ruthenium tris(bipyridyl) et analysé l’activité optique statique et résolue en temps.This work is concerned with the measurement of time resolved circular dichroism to follow ultrafast structure changes on chiral molecules. We have developed a unique system which allows measuring optical rotary dispersion and circular dichroism, by coupling a pump-probe and an ellipsometric experiment. The pump induces variations in optical activity whereas the probe measures these changes using an achromatic quarter wave plate and two crossed glan polarizers. Our set-up allow to measure steady and transient electronic states of chiral molecules. We have tested this set-up by analysing steady and time resolved optical activity of the two enantiomers of a model chiral molecule, the Ruthenium tris(bipyridyl)

    Magnetic method for multi-scale exploration of the Franceville Basin

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    Le but de ce travail de thèse est d’établir de nouveaux outils en méthode magnétique pour la caractérisation de cibles géologiques. Dans un premier temps, nous présentons des développements théoriques et numériques relatifs aux méthodes potentielles et en particulier magnétique, dans les domaines spatial et spectral. Nous généralisons l’opération de réduction au pôle afin de symétriser à l’aplomb d’une source magnétique quelconque les fonctions magnétiques caractéristiques. Ainsi, les superpotentiels sont introduits de manière originale en méthode magnétique. Nous définissons le tenseur de l’anomalie magnétique à partir des dérivées secondes du superpotentiel scalaire. Ces deux nouvelles fonctions présentent des propriétés intéressantes de symétrie permettant de faciliter l’interprétation d’une carte magnétique. Dans un second temps, nous appliquons ces résultats à l’étude du Bassin de Franceville au Gabon dans un contexte d’exploration minière. L’objectif est d’établir une nouvelle cartographie de cibles potentiellement uranifères à partir de données aéromagnétiques fournies par AREVA NC. L’étude du modèle métallogénique de l’uranium francevillien nous permet de relier la présence de pièges uranifères à l’existence d’anomalies magnétiques. Une étude multi-échelle est menée pour étudier aussi bien les couloirs de failles superficielles que le socle aimanté profond. Le tenseur de l’anomalie magnétique agissant comme un filtre directionnel se révèle particulièrement performant pour caractériser les structures 2D. Pour conclure, nos résultats sont rassemblés sur une carte structurale fournissant aux structuralistes de nouveaux indices d’intérêt économique.The purpose of this thesis is to develop new tools in magnetic method to characterize geological units. First, we present theoretical and numerical developments of the potential field theory for magnetic method in space and frequency domains. We generalize the reduction-to-the-pole transformation so that symmetrical sources cause symmetrical magnetic functions. Thus, the superpotential functions are newly defined for magnetic methods. The magnetic anomaly tensor is defined as the superpotential second derivatives. These two new functions have interesting symmetry properties that help magnetic maps interpretation. Second, we apply our results to analyze aeromagnetic data from the Franceville Basin collected in Gabon by AREVA NC for mining exploration. The aim of this study is to analyze these data in order to establish a new structural map and identify potential uranium targets. The metallogenic model of the Francevillian uranium helps us to link the presence of potential uranium deposits with the existence of magnetic anomalies. A multi-scale study is carried out in Fourier domain to explore sub-surface faults and the deep basement. The magnetic tensor acts as directional filtering and enables us to locate 2D structures. To conclude, we gather the results in a structural map providing the structuralist new information regarding uranium deposits of economic interest

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