University of Zagreb

Repository of Faculty of Science, University of Zagreb
Not a member yet
    12064 research outputs found

    Vaadin, okruženje za razvoj web aplikacija u Javi

    No full text
    Vaadin je okruženje za razvoj web aplikacija čiji je jedan razvojni okvir Vaadin Flow. On olakšava razvoj web aplikacija u Javi tako da omogućuje razvoj cijele aplikacije koristeći samo programski jezik Java. U ovom radu detaljno opisujemo razvojni okvir Vaadin Flow i demonstriramo njegovu upotrebu razvojem web aplikacije za testiranje algoritama sortiranja. U prvom poglavlju ovog rada dajemo uvod u Vaadin Flow. Opisujemo način komunikacije serverskog i klijentskog dijela Vaadin Flow aplikacije koji je inače skriven od korisnika. Detaljno opisujemo funkcionalnosti koje Vaadin Flow nudi. Na kraju poglavlja razmatramo prednosti i mane ovog razvojnog okvira. U drugom poglavlju rada ukratko opisujemo tehnologije Spring Boot i Maven, koje su usko povezane s razvojem Vaadin Flow aplikacija. Zatim istražujemo različite moguće arhitekture Vaadin Flow aplikacija. U posljednjem poglavlju opisujemo razvoj web aplikacije za testiranje algoritama sortiranja koristeći Vaadin Flow. Dajemo kratki pregled algoritama sortiranja koji su implementirani u aplikaciji. Opisujemo arhitekturu aplikacije i sve njene funkcionalnosti. Detaljno opisujemo razvoj aplikacije i dajemo primjere upotrebe aplikacije.Vaadin is a web application development environment, one of whose frameworks is Vaadin Flow. Vaadin Flow simplifies development of web applications in Java by enabling the entire application to be developed using only the Java programming language. In this paper, we provide a detailed overview of the Vaadin Flow framework and demonstrate its use by developing a web application for testing sorting algorithms. In the first chapter of this paper, we introduce Vaadin Flow. We describe the communication between the server and client sides of a Vaadin Flow application, which is otherwise hidden from the user. We analyze the various features available in Vaadin Flow. At the end of the chapter, we consider the advantages and disadvantages of this framework. In the second chapter, we briefly describe Spring Boot and Maven, technologies which are closely related to the development of Vaadin Flow applications. We then explore various possible architectures for Vaadin Flow applications. In the final chapter, we describe the development of a web application for testing sorting algorithms using Vaadin Flow. We provide a brief overview of the sorting algorithms implemented in the application. We describe the application’s architecture and all of its features. We thoroughly describe the application development process and provide examples of its use

    Taxonomy, morphology, and distribution of the earwigs (Insecta: Dermaptera) in Croatia

    No full text
    Uholaže su red kukaca koji je u svijetu zastupljen s 11 porodica i dvije tisuće vrsta, a široko su rasprostranjene i u Europi i u Hrvatskoj. Usprkos njihovom upečatljivom izgledu i njihovoj općeprisutnosti, uholaže su vrlo neistražena skupina, naročito u Hrvatskoj. Osobito je zapostavljena panonska Hrvatska koja je gotovo bez podataka. Ciljevi ovog rada bili su: sastaviti prvi popis uholaža cijele Hrvatske, opisati morfološke i biološke značajke vrsta, izraditi ključ za identifikaciju vrsta, izraditi karte rasprostranjenosti u Hrvatskoj, prikupiti uzorke i izraditi suhe i mokre zbirke za daljnja istraživanja. Pretražena je literatura s nalazima uholaža na području Hrvatske, pregledane su muzejske zbirke i mrežne baze podataka iNaturalist i GBIF te su provedeni terenski izlasci u nedovoljno istražena područja kako bi se prikupio što veći broj nalaza. Hrvatsku nastanjuju četiri porodice uholaža: Anisolabididae, Forficulidae, Labiduridae i Spongiphoridae, s ukupno 13 vrsta u deset rodova. Vrstama je najbrojnija porodica Forficulidae s osam vrsta, a najbrojniji vrstama je nominotipski rod Forficula Linnaeus, 1758 s tri vrste. Terenskim istraživanjima potvrđeno je prisustvo 11 vrsta, čiji su uzorci sakupljeni, no nedostaju Labia minor (Linnaeus, 1758) i Apterygida albipennis (Megerle von Mühlfeld in von Charpentier, 1825). S više od dvjesto prikupljenih jedinki i 11 vrsta, ovo je trenutno vrstama najbogatija zbirka uholaža u Hrvatskoj. Za tri vrste: Anechura bipunctata (Fabricius, 1781), Euborellia annulipes (Lucas, 1847) i Guanchia obtusangula (Krauss, 1904) predstavljeni su prvi nalazi nakon više od 120 godina, a vrsta Nala lividipes (Dufour, 1820) zabilježena je prvi put u Hrvatskoj. Jadranska regija Hrvatske najbogatija je vrstama uholaža s devet potvrđenih vrsta, slijedi panonska regija sa šest vrsta te dinarska regija sa samo četiri potvrđene vrste.Earwigs are an insect order represented worldwide by 11 families and around two thousand species, widespread across Europe and Croatia. Despite their striking appearance and common occurrence, earwigs remain an understudied group, particularly in Croatia. Continental Croatia is especially neglected, with almost no published data. The aims of this study were to: compile the first comprehensive list of earwig species in Croatia, describe their morphological and biological traits, develop a key for species identification, create distribution maps for the country, collect samples, and to establish dry and wet collections for future research. Relevant literature, museum collections and online databases iNaturalist and GBIF were reviewed, and field research was carried out in poorly studied areas in order to gather as many new records as possible. Croatia is home to four families of earwigs: Anisolabididae, Forficulidae, Labiduridae, and Spongiphoridae, comprising a total of 13 species in ten genera. The most species-rich family is Forficulidae, with eight reported species, and the most species-rich genus is the nominotypical Forficula Linnaeus, 1758, which contains three species. Field surveys confirmed the presence of 11 species, and specimens were collected for all but two species, Labia minor (Linnaeus, 1758) and Apterygida albipennis (Megerle von Mühlfeld in von Charpentier, 1825). With 11 species and over two hundred collected specimens, this is currently the largest earwig collection in Croatia. For three species: Anechura bipunctata (Fabricius, 1781), Euborellia annulipes (Lucas, 1847), and Guanchia obtusangula (Krauss, 1904) the first records from Croatia in over 120 years are presented, and species Nala lividipes (Dufour, 1820) is recorded in the country for the first time. The Adriatic region of Croatia is the richest in the number of species, with nine confirmed species, followed by the Pannonian region with six species, and the Dinaric region with only four confirmed species

    Kod za rad Dinamika ljudskog tijela

    No full text

    Biochemical characterization of the RRAS2 protein from the sponge Eunapius subterraneus ; Inquiry-Based Chemistry Education

    No full text
    Rak je jedna od najrasprostranjenijih bolesti današnjice i često se javlja uslijed mutacija ili promjena u ekspresiji gena koji kodiraju za proteine uključene u kontrolu rasta i razvoja stanica. RRAS2 je primjer takvog proteina te pripada skupini malih GTPaza. Često je prekomjerno eksprimiran u različitim tipovima raka kod ljudi. Homolog proteina RRAS2 pronađen je i kod evolucijski puno starijih i jednostavnijih životinja – spužvi. Spužve predstavljaju dobar modelni organizam jer imaju jednostavnu morfologiju, a kompleksan genom, te većina gena iz spužvi pokazuje značajnu očuvanost s homolozima kod kralješnjaka. Kako bismo dobili bolji uvid u biokemijske karakteristike homologa RRAS2 iz spužve Eunapius subterraneus, klonirana je spužvina cDNA za RRAS2 te unesena u odgovarajući ekspresijski vektor. Napravljena je prekomjerna ekspresija rekombinantnog proteina u bakteriji Escherichia coli. Analizirana je i potvrđena intrinzična GTPazna aktivnost spužvinog proteina RRAS2, što ukazuje na očuvanost biokemijskih svojstava ovog onkogena. U metodičkom dijelu ovog rada dan je prijedlog nastavnog sata temeljen na istraživačkoj nastavi, za odabranu temu (Enzimi). Pregledana je stručna i udžbenička literatura, oblikovani su prikladni didaktičko-metodički materijali te su navedeni mogući problemi koji se mogu javiti tijekom izvedbe nastavnog sata istraživačkog učenja.Cancer is one of the most widespread diseases nowadays and often occurs due to mutations or changes in the expression levels of genes that control cell growth and development. RRAS2 is one of such proteins and a small GTPase. The homologue of the human RRAS2 was found in evolutionarily much older and simpler animals – sponges. Despite their simple morphology, sponges have a complex genome with many genes very similar to their vertebrate homologues. To get a better insight into the biochemical characteristics of the RRAS2 homologue from the sponge Eunapius subterraneus, the cDNA for RRAS2 was cloned and inserted into an appropriate expression vector. E. coli cells were chemically transformed for the expression of the RRAS2 recombinant protein. The GTPase activity of the sponge RRAS2 was analyzed and confirmed, which indicates that the biochemical properties of this oncogene are evolutionary conserved. In the methodological part, a proposal of inquiry-based lesson, for the selected topic (Enzymes) is given. Professional and textbook literature was reviewed, appropriate didactic-methodical materials were designed, and possible problems that may arise during the implementation of the inquiry-based learning were highlighted

    Effects of water excess and shortage on the phytochemical composition of broccoli (Brassica oleracea convar. botrytis var. cymosa) seedlings and antioxidant potential of their extracts

    No full text
    Uvjeti u okolišu su determinante za proizvodnju bioaktivnih spojeva u biljkama. Zbog očiglednih ekstremnih klimatskih promjena, biljke su tijekom svog rasta i razvoja sve češće izložene abiotskih stresovima poput poplava i suša, što u konačnici dovodi do njihove metaboličke adaptacije. Cilj ovog diplomskog rada bio je usporediti nutritivni potencijal klijanaca brokule uzgojenih u uvjetima viška i manjka vode u tlu na razini različitih skupina fitokemikalija, te antioksidacijskog kapaciteta njihovih ekstrakata i sposobnosti inhibicije glikacija proteina. U tu svrhu korištene su različite spektrofotometrijske metode, te metoda tekućinske kromatografije visoke moći razlučivanja. Klijanci brokule u smislu prinosa, tj. biomase bolje toleriraju poplavu u odnosu na sušu. Suša je uzrokovala povećanje udjela ukupnih fenola, antocijana, kondenziranih tanina, topivih i reducirajućih šećera, klorofila b, porfirina, feofitina b, sinapinske kiseline, vitamina C, antioksidacijskog kapaciteta određenog metodom ABTS, te postotka inhibicije glikacije. S druge strane, poplava je povisila udio ukupnih flavonoida, flavonola, intaktnih glukozinolata, ferulične kiseline, kvercetina, kempferola, te utječe i na povišenje antioksidacijskog kapaciteta određenog metodama DPPH te FRAP. Navedeni spojevi očigledno imaju značajnu ulogu u prilagodbi klijanaca brokule na vodni stres. Osim navedenih, udjeli mnogih spojeva nisu se značajno promijenili bez obzira radi li se o uvjetima suše ili poplave, primjerice ukupne hidroksicimetne kiseline, tanini, klorofil a, feofitin a, karotenoidi te likopen.Environmental conditions are determinants for the production of bioactive compounds in plants. Due to the obvious extreme climate changes, abiotic stresses such as floods and droughts are increasingly becoming important factors in growth and development of plants, which ultimately leads to their metabolic adaptation. The aim of this thesis was to compare the nutritional potential of broccoli seedlings grown in conditions of excess or lack of water in the soil at the level of different groups of phytochemicals, the antioxidant capacity of their extracts and the ability to inhibit protein glycation. For that reason, differenty spectrophotometric methods and high performance liquid chromatography methods were used. In terms of yield, i.e. biomass, broccoli seedlings tolerate flooding better than drought. Drought caused an increase in the proportion of total phenols, anthocyanins, condensed tannins, soluble and reducing sugars, chlorophyll b, porphyrin, pheophytin b, sinapic acid, vitamin C, antioxidant capacity determined by the ABTS method, and the percentage of glycation inhibition. On the other hand, the flood increased the proportion of total flavonoids, flavonols, intact glucosinolates, ferulic acid, quercetin, kaempferol, and also the antioxidant capacity determined by the DPPH and FRAP methods. The aforementioned compounds obviously play a significant role in the adaptation of broccoli seedlings to water stress. Many of the compounds, except the aforementioned ones, did not show any significant change regardless of drought or flood conditions, for example total hydroxycinnamic acids, tannins, chlorophyll a, pheophytin a, carotenoids and lycopen

    Kvarc, silikati i alumosilikati: od keramike do prirodnih apsorbensa

    No full text
    Silikati pripadaju najrasprostranjenijoj skupini minerala u Zemljinoj kori. Dijele se u 6 temeljnih skupina, a građeni su od SiO4 4− tetraedara: nezosilikate, ortodisilikate, ciklosilikate, inosilikate, filosilikate i tektosilikate. Razlikuju se u načinu povezivanja SiO4 4− tetraedara i brojem kisikovih atoma koji sudjeluju u procesu vezanja SiO4 4− tetraedara. Jedna od izrazitih primjena silikata u današnjem društvu je u izradi keramičkih materijala i zeolita. U njihovoj izradi najčešće se primjenjuju silikati iz skupine filosilikata i tektosilikata kao i organski ili anorganski spojevi (SDA) koji kontroliraju i usmjeravaju izgradnju takvih struktura. Sinteza keramike i zeolita nalazi sve veću primjenu u raznim granama industrije i biomedicini pa se prilikom njihove sinteze nastoje poboljšati svojstva silikatnih okosnica tih materijala raznim postupcima poput dodatka ZrSiO4 ili aluminijskih nanočestica keramici ili uporabom SDA spojeva i anorganskih reagensa koji sadrže fluor. Primjena zeolita je raznovrsna, rabe se u biomedicinske svrhe za izradu implantata, antikorozivne svrhe, kao katalizatori, molekulska sita, u svrhu pročišćavanja zraka ili regeneraciji kože itd. U raznolikosti primjene nimalo ne zaostaje keramika. Keramički materijali nalaze primjenu u izradi alata za rezanje, porculana, posuđa, sanitarija, abraziva itd

    O-benzyloximes as butyrylcholinesterase inhibitors

    No full text
    U okviru ovog rada klasičnim postupcima organske sinteze pripremljen je O-benzilni eter kinuklidin-3- on-oksima reakcijom hidroklorida kinuklidin-3-ona i O-benzilhidroksilamina bez dodatka organskih ili anorganskih baza. Kvaternizacijom kinuklidinskog atoma dušika u molekuli sintetiziranog Obenziloksima s metil-jodidom te odabranim, različito supstituiranim benzil-bromidima (metilna ili nitroskupina te atomi halogena u meta ili para položaju) pripremljena je serija od dvanaest novih kvaternih derivata. Odabrani spojevi imaju različite modifikacije u strukturi kako bi se mogli definirati strukturni parametri važni za postizanje poboljšane biološke aktivnosti spojeva u interakciji s kolinesterazama. Pripremljenim spojevima određeno je talište te je struktura potvrđena infracrvenom spektroskopijom, spektrometrijom masa te 1D i 2D spektroskopijom nuklearne magnetske rezonancije. Nadalje, svim pripremljenim spojevima određen je inhibitorni potencijal prema enzimu butirilkolinesterazi iz konjskog seruma (EC 3.1.1.8) korištenjem Ellmanove metode za kolorimetrijsko određivanje aktivnosti kolinesteraze.In this work, O-benzyl ether of quinuclidin-3-one oxime was prepared by the reaction of hydrochloride salts of quinuclidin-3-one and O-benzylhydroxylamine without the addition of organic or inorganic bases. A series of twelve new quaternary derivatives were prepared by quaternization of the quinuclidine nitrogen atom with methyl iodide and selected, differently substituted benzyl bromides (methyl or nitro group and halogen atoms in the meta or para position). The selected compounds have different modifications in the structure to define the structural parameters important for achieving improved biological activity in the interaction with cholinesterases. The melting points of the prepared compounds were determined, and the structure was confirmed by infrared spectroscopy, mass spectrometry and 1D and 2D nuclear magnetic resonance spectroscopy. Furthermore, the inhibitory potential of all prepared compounds toward the enzyme butyrylcholinesterase from horse serum (EC 3.1.1.8) was determined using the Ellman method for colorimetric determination of cholinesterase activity

    Role of clathrin mediated endocytosis in adenovirus type 26 induced inflammasome activation in vitro

    No full text
    Vektorske vakcine na bazi adenovirusa čovjeka tipa 26 (HAdV-D26) intenzivno se istražuju unazad nekoliko godina. Unatoč tome mehanizmi aktivacije urođenog imunosnog sustava ovim virusom još nisu u potpunosti istraženi. Inflamasom je signalni kompleks koji preko kaspaze-1 aktivira proupalne interleukine važne za upalni odgovor i zaštitu od patogena. Cilj ovog rada bio je istražiti kako inhibicija endocitoze posredovane klatrinom utječe na aktivaciju inflamasoma u epitelnim stanicama čovjeka inficiranima virusom HAdV-D26. Metodom reverzne trenskripcije i lančanom reakcijom polimerazom u stvarnom vremenu utvrđeno je smanjenje ekspresije gena za proupalne interleukine IL-1β i IL-18 i kaspazu-1 nakon infekcije, a inhibicijom endocitoze posredovane klatrinom ona se povećala. Aktivacija inflamasoma je bila analizirana i na razini proteina westernskom metodom otiska i metodom imunofluorescencije. Pritom nisu uočene značajne promjene u ekspresiji proteina NLRP3, AIM2 i ASC koji sudjeluju u nastanku inflamasoma, kao ni u njihovoj unutarstaničnoj lokalizaciji, neovisno o inhibiciji endocitoze posredovane klatrinom. Također nisu bili detektirani ni aktivni oblici kaspaze-1 i proupalnih interleukina IL-1β i IL-18. Na temelju toga se može zaključiti da infekcija virusom HAdV-D26 ne aktivira inflamasom u epitelnim stanicama čovjeka. No s druge su strane infekcija virusom HAdV-D26 i inhibicija endocitoze posredovane klatrinom potaknule oslobađanje katepsina B iz lizosoma što može biti signal za sklapanje i aktivaciju inflamasoma.Vector vaccines based on human adenovirus type 26 (HAdV-D26) have been intensively researched for several years. Regardless, the mechanisms of activation of the innate immune system by this virus have not yet been fully investigated. The inflammasome is a signaling complex that via caspase-1 activates pro-inflammatory interleukins important for the inflammatory response and protection against pathogens. The aim of this study was to investigate how inhibition of clathrin-mediated endocytosis affects inflammasome activation in human epithelial cells infected with HAdV-D26. The quantitative polymerase chain reaction revealed a decrease in gene expression for pro-inflammatory interleukins IL-1β i IL-18 and caspase-1 after infection, while inhibition of clathrin-mediated endocytosis increased it. Inflammasome activation was also analyzed at the protein level by western blot and immunofluorescence. No significant changes were observed in the expression of proteins NLRP3, AIM2 and ASC which are involved in the formation of inflammasome, nor in their intracellular localization, regardless of the inhibition of clathrin-mediated endocytosis. Active forms of caspase-1 and pro-inflammatory interleukins IL-1β i IL-18 were also not detected. Based on this, it can be concluded that infection with HAdV-D26 does not activate inflammasome in human epithelial cells. However, infection with HAdV-D26 and inhibition of clathrin-mediated endocytosis stimulated the release of cathepsin B from lysosomes, which could be the signal for inflammasome assembly and activation

    Nanocomposites of iron and carbon nanoparticles in removal of Gd3+ ions from water solutions

    No full text
    Gadolinij pripada elementima rijetkih zemalja te je tehnološki važan element. Široka upotreba gadolinija prouzročila je problem nakupljanja gadolinija u okolišu i njegov utjecaj na živi svijet. Nanočestice željeza posjeduju sposobnost akumuliranja zagađivača iz okoliša, koja je poboljšana primjenom ugljikovih nanocjevčica kao nosača za nanočestice željeza. Priređeni su nanokompoziti ugljika i željeza te su karakterizirani pomoću pretražne elektronske mikroskopije i mjerenjem magnetsne susceptibilnosti. Spektrometrijom mase uz induktivno spregnutu plazmu ispitana je adsorpcija kelatno vezanog i ionskog gadolinija na nanočestice kompozita te je provedena varijacija mase nanokompozita kod adsorpcije gadolinija. Utvrđeno je da čestice nanokompozita vrlo dobro adsorbiraju gadolinij pri uskom području niskih koncentracija, a povećanjem koncentracije gadolinija sposobnost adsorpcije čestica značajno opada.Gadolinium belongs to the rare earth elements (REEs) and is a technologically important element. The widespread use of gadolinium has caused the problem of gadolinium accumulation in the environment and its impact on the living world. Iron nanoparticles can accumulate pollutants from the environment, which is improved by using carbon nanotubes as a carrier for iron nanoparticles. Carbon and iron nanocomposites were prepared and characterized using scanning electron microscopy and magnetic susceptibility measurements. The adsorption of chelated and ionic gadolinium on composite nanoparticles was tested by mass spectrometry with inductively coupled plasma, and the mass variation of the nanocomposite during gadolinium adsorption was performed. It was found that nanocomposite particles adsorb gadolinium very well in a narrow range of low concentrations, and with an increase in gadolinium concentration, the adsorption capacity of the particles decreases significantly

    Development and validation of method for determination of loratadine in the presence of its degradation products

    No full text
    Stabilnost farmakološki aktivnih spojeva utječe na kvalitetu, djelotvornost i sigurnost lijeka. Izlaganje djelatne tvari različitim uvjetima razgradnje pruža direktan uvid u njezinu intrizičnu stabilnost. Razvojem stabilitetno-indikativne metode, odnoso validiranog analitičkog postupka moguće je kvantificirati smanjenje količine aktivnog farmaceutskog sastojka uslijed prisilne razgradnje. Validacijom metode se dokazuje prikladnost mjernog postupka za prethodno određenu svrhu, odnosno da metoda udovoljava zahtjevima uporabe. U sklopu ovog diplomskog rada razvijena je i validirana metoda određivanja loratadina u prisutnosti njegovih razgradnih produkata pomoću spregnutog sustava tekućinske kromatografije ultravisoke djelotvornosti i spektrometrije masa visokog razlučivanja. Uz selektivnost, određene su i ostale značajke metode poput linearnosti, preciznosti, granice detekcije i kvantifikacije analita te robusnosti. Validacija je provedena u skladu s ICH smjernicama.Stability of active pharmaceutical ingredient affects quality, efficacy, and safety of a drug. Exposure of an active substance to various stress conditions provides direct insight in its intrinsic stability. A stability-indicating method is a validated analytical procedure used to quantitate the decrease in the amount of active pharmaceutical ingredient due to forced degradation. Validation of the method provides the suitability of the measurement procedure for a previously determined purpose, in other words, that the method meets the requirements of use.The aim of this thesis is to develop and validate a new method for determination of loratadine in the presence of its degradation products using ultrahigh performance liquid chromatography coupled with high resolution mass spectrometry. Besides selectivity, other validation parameters such as selectivity, precision, linearity, limits of detection and quantification of the analyte and robustness are determined

    4,455

    full texts

    12,064

    metadata records
    Updated in last 30 days.
    Repository of Faculty of Science, University of Zagreb
    Access Repository Dashboard
    Do you manage Open Research Online? Become a CORE Member to access insider analytics, issue reports and manage access to outputs from your repository in the CORE Repository Dashboard! 👇