Portail HAL ONIRIS VetAgroBio Nantes
Not a member yet
11563 research outputs found
Sort by
Les principales affections oculaires chez les Otariidés en parcs zoologiques en France : prévalence et prise en charge (prévention, entraînement médical, traitements)
No full textLes affections oculaires représentent une dominante pathologique chez les Otariidés. Leur prévalence, leurs facteurs de risque et les modalités de leur prise en charge ont fait l’objet d’études à l’international que cette thèse complète par une enquête sur les Otariidés hébergées en parcs zoologiques en France. Les données ont été récoltées auprès des vétérinaires et soigneurs concernés par le biais de questionnaires. Les affections oculaires, notamment les ulcères cornéens, les œdèmes cornéens et les cataractes, sont fréquentes chez les otaries hébergées en captivité, avec une prévalence de 67,8 % dans les parcs étudiés. Plus précisément, la prévalence des atteintes cornéennes est de 50 % et celle des atteintes du cristallin de 7 %. Les facteurs de risque majeurs mis en évidence sont l’âge, l’exposition aux UV ainsi que les traitements chimiques de l’eau des bassins. Les traitements incluent principalement des collyres antibiotiques et anti-inflammatoires, des analgésiques, et des mesures zootechniques comme la réalisation de bains salés. Leur observance reste un défi, en particulier en cas de douleur ou d'anorexie. Le médical training, particulièrement chronophage pour les équipes, est néanmoins essentiel pour une prévention et une prise en charge optimales de ces affections et doit donc être renforcé. D’autres pistes d’amélioration relatives à l’aménagement des infrastructures, notamment des bassins et systèmes de filtration, sont mises en lumière. Bien que menée sur un échantillon restreint, cette étude constitue un premier état des lieux sur les Otariidés hébergés en France et souligne la nécessité de poursuivre les recherches et les échanges sur cette problématique
Étude autour de l'implication d'histophilus somni dans les troubles de la reproduction chez les vaches laitières dans un élevage commercial
No full textLes troubles de la reproduction regroupent plusieurs entités et constituent une préoccupation majeure au sein des élevages bovins laitiers. Quelques cas d’implication de la bactérie, H. somni, ont été décrits au cours de ces 30 dernières années, mais son incidence et sa pathogénicité restent peu connues. L’objectif de cette thèse était d’évaluer l’efficacité d’un vaccin commercial respiratoire, Hiprabovis somni/lkt®, sur la survenue des affections utérines dans des élevages laitiers. Ce travail a inclus une étude rétrospective dans 2 élevages laitiers et un essai clinique prospectif dans un élevage laitier. L’essai clinique mené sur des vaches laitières et des génisses a été complété par des analyses de la production laitière et les performances de reproduction. Aucune efficacité du vaccin n’a été mise en évidence sur la dynamique des affections utérines, ni dans l’étude rétrospective, ni dans l’essai clinique limité à ce jour au premier mois post-partum sur cet élevage. Concernant la production laitière, des différences significatives sont notables, les vaches multipares produisent plus que les primipares et les vaches vaccinées produisent plus que les vaches non vaccinées. Pour les performances de reproduction, la présence d’affections utérines n’a pas d’influence sur les dates d’insémination. En complément des examens vaginaux lors du suivi, des analyses PCR sur les écoulements vaginaux ont été réalisés. Les résultats d’analyses montrent une absence de détection d’H. somni chez les vaches vaccinées alors que les vaches non vaccinées ont un résultat positif, quelle que soit la présence ou non de l’affection utérine. L’implication d’H. somni reste dans notre étude probablement marginale. Ces résultats constituent une étude préliminaire à l’implication de cette bactérie dans les troubles de la reproduction. Ils montrent que d’autres études et des analyses complémentaires sont nécessaires pour explorer davantage H. somni afin de comprendre sa pathogénicité en plus de sa commensalité au sein de l’appareil génital. L’exploration du microbiote génital à différents périodes et l’analyse précise des profils pourront permettre d’éclaircir ces pistes. L’étude devrait être élargie et poursuivie afin d’affiner les résultats lors d’un essai expérimental
In Toto Adipocytes Analysis Using Hydrophilic Tissue Clearing, Light Sheet Microscopy, and Deep Learning‐Based Image Processing
No full textInternational audienceABSTRACT Background Information Obesity is a multifactorial metabolic disease characterized by excessive fat storage in adipocytes, particularly in visceral adipose tissue (VAT) like mesenteric adipocytes. Metabolic dysfunctions due to obesity are often associated with modification of adipocyte volume. Various techniques for measuring adipocyte size are described in the literature, including classical histological methods on paraffin‐embedded tissue sections or dissociation of adipose tissue (AT) using collagenase with artifacts due to AT post treatment. Results This study aims to develop and implement an innovative method for 3D investigation of AT to assess adipocyte volume, overcoming the limitations and biases inherent in traditional techniques. The principle of the method relies on fluorescent labeling of lipids and extracellular matrix (ECM) in toto within AT, followed by a tissue clearing step without delipidation and imaging using 3D light sheet microscopy coupled with automated analysis of adipocyte size through a deep learning approach. By this work we showed that the volume of adipocytes increased in mesenteric AT from obese rats with an increase in the distance between adipocytes. Conclusion and Significance The current work highlights the interest in combining AT clearing without a delipidation step and light sheet microscopy for in toto 3D adipocyte characterization in obese versus healthy rats. While this method is particularly valuable for understanding adipocyte hypertrophy in the context of obesity, its applicability extends beyond this area. This innovative approach offers valuable opportunities for investigating adipocyte dynamics in various pathological conditions, evaluating the impact of nutritional interventions, and assessing the effectiveness of pharmacological treatments
Overcoming convergence problems in PLS Path modelling
No full textInternational audiencePartial Least Squares Path Modeling (PLS-PM) is one of the methods most widely used in the Structural Equation Modeling (SEM). PLS-PM aims to study the relationships among several blocks of observed variables, usually called Manifest Variables (MVs), where each block is assumed to measure a construct defined as a latent variable. Hanafi (2007) points out that there are two procedures for calculating the latent variable scores : the original procedure as proposed by Wold, and extended by Hanafi (2007) called the Hanafi-Wold procedure (2020), and an alternative procedure introduced by Lohmoller called the Lohmoller procedure. The systematic use of the Lohmoller procedure fo computing the latent variable scores can be ineffective. The contribution of this article is to remedy the issue of non-convergence of the Lohmoller procedure. Consequently, a new procedure for computing the latent variable scores, called Signless Laplacian Matrix (SLM) will be introduced, the main difference between the two procedures (SLM and Lohmoller) lies in the use of two different matrices to perform their iterations, both monotony and error convergence for this new procedure will be establishe
A network approach to Joint Dimension Reduction of a set of data tables
No full textInternational audienceTo deal with the dimension reduction task simultaneously of different classes of multi-block data, we propose to model theses classes in the form of graphs, introducing the notion of networks between data tables. Several examples are presented to illustrate this new notion and its generic nature. A generalization of the known Eckart-Young problem from a single table to a network of tables is formulated leading to an exploratory method for analyzing a network of tables. Main steps of an ALS type algorithm for solving this problem are described. An illustration based on real data is presented
A network approach to Joint Dimension Reduction of a set of data tables
No full textInternational audienc
Identification, synthesis and investigation of non-intentionally added substances (NIAS) in vegetable-containing metallic cans
No full textInternational audienc
Impact du stress thermique sur la survenue des boiteries des bovins laitiers hébergés en bâtiment en climat océanique tempéré
No full textClimate change affects the health, production, and welfare of dairy cows, even in temperate climates. This exploratory study aimed to characterize the relationships between heat stress, standing time, and lameness incidence in 63 cows from two herds. The dataset included environmental measurements, production indicators, locomotion and hoof-trimming records, and standing time (via AIHerd®). Generalized additive models (GAM) and linear models were used to analyze these relationships and to test a potential mediating role of standing time. Results showed that heat stress thresholds in temperate climates are lower than those reported in hot climates and vary across herds. Standing time increased nonlinearly with maximum temperature. In one herd, a THI ≥ 73.1 during the 49 days preceding evaluation was associated with a 2.5-fold higher risk of lameness. The mediating role of standing time could not be fully confirmed, highlighting the complexity of interactions between heat stress and locomotor health. These findings emphasize the value of approaches integrating mediation analysis to better understand the mechanisms linking heat stress, postural behavior, and lameness, and they open perspectives for developing monitoring and prevention tools tailored to temperate conditions.Le réchauffement climatique affecte la santé, la production et le bien-être des vaches laitières, même en climat tempéré. Cette étude exploratoire visait à caractériser les relations entre stress thermique, temps passé debout et incidence des boiteries chez 63 vaches de deux élevages. Les données comprenaient mesures d’ambiance, indicateurs de production, locomotion, parage et temps debout (via AIHerd®). Des modèles additifs généralisés (GAM) et linéaires ont été utilisés pour analyser ces relations et tester un rôle médiateur du temps debout. Les résultats montrent que les seuils de stress thermique en climat tempéré sont plus bas que ceux rapportés en climat chaud et varient entre troupeaux. Le temps passé debout augmente de manière non linéaire avec la température maximale. Dans un élevage, un THI ≥ 73,1 dans les 49 jours précédant l’évaluation était associé à un risque 2,5 fois plus élevé de boiterie. Le rôle médiateur du temps debout n’a pu être pleinement confirmé, soulignant la complexité des interactions entre stress thermique et santé locomotrice. Ces résultats mettent en évidence l’intérêt d’approches intégrant l’analyse de médiation pour mieux comprendre les mécanismes liant température, comportement postural et boiteries, et ouvrent des perspectives pour le développement d’outils de suivi et de prévention adaptés aux conditions tempérées
Large-scale profiling of antibody reactivity to glycolipids in patients with Guillain-Barré syndrome
No full textInternational audienceAbstract Guillain-Barré syndrome is an acute polyradiculoneuropathy in which preceding infections often elicit the production of antibodies that target peripheral nerve antigens, principally gangliosides. Anti-ganglioside antibodies are thought to play a key role in the clinical diversity of the disease and can be helpful in clinical practice. Extensive research into clinical associations of individual anti-ganglioside antibody specificities has been performed. Recent research has highlighted glycolipid complexes, glycolipid combinations that may alter antibody binding, as targets. In this study, we investigated antibody reactivity patterns to glycolipids and glycolipid complexes using combinatorial array, in relation to clinical features in Guillain-Barré syndrome. In total, 1413 patients from the observational International Guillain-Barré syndrome Outcome Study (0–91 years, 60.3% male) and 1061 controls (healthy, family, infectious, vaccination, other neurological disease) were included. Acute-phase sera from patients were screened for IgM, IgG, and IgA reactivity against 15 glycolipids and one phospholipid and their heteromeric complexes, similarly to archived control sera. Antibody specificities and reactivity patterns were analysed in relation to clinical features. Of all patients, 1309 (92.6%) were positive for at least one anti-glycolipid (complex) antibody. Anti-GM1 and anti-GQ1b (complex) antibodies best distinguished motor Guillain-Barré syndrome and Miller Fisher syndrome from controls, with antibodies to glycolipid complexes outperforming antibodies to single glycolipids. Three models consisting of anti-glycolipid (complex) antibodies distinguished patients with Guillain-Barré syndrome, the motor variant, and Miller Fisher syndrome from controls with high sensitivity and specificity, performing better than antibodies to single glycolipids used in clinical practice. Seven patient clusters with particular antibody reactivity patterns were identified. These clusters were distinguished by geographical region, clinical variants, preceding Campylobacter jejuni infection, electrophysiological subtypes, the Medical Research Council sum score at study entry, and the ability to walk 10 m unaided at 26 weeks. Two patient clusters with distinct anti-GM1 (complex) reactivity (broad versus restricted) differed in frequency of the axonal subtype. In cumulative incidence analyses, 15 anti-glycolipid (complex) antibodies were associated with the time required to regain the ability to walk 10 m unaided. After adjustment for known prognostic factors, IgG anti-GQ1b:GM4, GQ1b:PS and GQ1b:Sulfatide remained associated with faster recovery. Addition of anti-glycolipid antibodies to clinical prognostic models slightly improved their discriminative capacity, though insufficiently to improve the models. Measurement of anti-glycolipid antibodies by combinatorial array increases the diagnostic yield compared to assaying single glycolipids, identifies clinically relevant antibody reactivity patterns to glycolipids and glycolipid complexes, and may be useful in outcome prediction in Guillain-Barré syndrome