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The Patrologia Graeca Corpus: OCR, Annotation, and Open Release of Noisy Nineteenth-Century Polytonic Greek Editions
No full textInternational audienceWe present the Patrologia Graeca Corpus, the first large-scale open OCR and linguistic resource for nineteenthcentury editions of Ancient Greek. The collection covers the remaining undigitized volumes of the Patrologia Graeca (PG), printed in complex bilingual (Greek-Latin) layouts and characterized by highly degraded polytonic Greek typography. Through a dedicated pipeline combining YOLO-based layout detection and CRNN-based text recognition, we achieve a character error rate (CER) of 1.05% and a word error rate (WER) of 4.69%, largely outperforming existing OCR systems for polytonic Greek. The resulting corpus contains around six million lemmatized and part-of-speech tagged tokens, aligned with full OCR and layout annotations. Beyond its philological value, this corpus establishes a new benchmark for OCR on noisy polytonic Greek and provides training material for future models, including LLMs
Incorporation of Ruthenium Polypyridyl Complexes Into DNA Oligonucleotides by Copper‐Free Click Chemistry
No full textInternational audienceAlternative methods for the preparation of naïve libraries for SELEX experiments are in dire need, particularly when hydrophobic, bulky, and complex modification patterns are considered. Here, we explore the first steps toward the preparation of libraries equipped with ruthenium polypyridyl complexes using strain‐promoted azide‐alkyne cycloaddition (SPAAC) reactions. We demonstrated that dsDNA products can be efficiently equipped with dibenzocyclooctyne (DIBAC) moieties using a suitable modified nucleoside triphosphate and primer extension (PEX) reactions or PCR. The resulting dsDNA products can then be further modified using SPAAC and ruthenium polypyridyl complexes equipped with azide moieties, permitting the installation of >10 complexes. Finally, dsDNA can be efficiently converted into the corresponding modified ssDNA using magnetoseparation. These results offer the possibility of producing longer oligonucleotides equipped with complex modification patterns and open the way to SPAAC‐click‐SELEX methodologies
Le ta’alluh comme finalité philosophique : transformation de soi et reconfiguration métaphysique chez Suhrawardī
No full textInternational audienceL’article montre que Suhrawardī fait du taʾalluh la finalité même de la philosophie, en l’entendant comme transformation spirituelle du sage et non comme simple savoir spéculatif. Il met en lumière la rupture avec Avicenne, chez qui l’âme, conçue comme substance immuable, ne peut pas être transformée en son essence. Chez Suhrawardī, au contraire, l’âme est pensée comme lumière susceptible d’intensification, ce qui rend possible une véritable transfiguration de soi. Cette transformation repose sur la connaissance par présence et sur le talaqqī, c’est-à-dire la réception directe des réalités lumineuses, au-delà de la seule représentation discursive. L’article montre enfin que cette reconfiguration a aussi une portée politique : le mutaʾallih devient, chez Suhrawardī, la figure légitime de la direction spirituelle et du gouvernement juste
Typologie, stratification et hypothèses généalogiques: Une architecture méthodologique collective
No full textInternational audienceCette communication présente l’architecture méthodologique du projet ERC BANG consacré à l’histoire linguistique de l’Afrique de l’Ouest intérieure, et en particulier de la région de Bandiagara. Elle met l’accent sur le rôle de la typologie dans la formation des hypothèses généalogiques et dans l’identification de strates de contact anciennes. Nous présentons une série d’axes complémentaires, chacun illustré par un cas d’étude ciblé, conçus comme des résultats méthodologiques en cours plutôt que comme des conclusions définitives.Éthique et co-construction de la rechercheLa question éthique est, depuis des décennies, interrogée en sciences du langage par des disciplines comme l’anthropologie, la sociologie et la sociolinguistique. Tout au long des travaux menés sur le terrain dans le cadre du projet BANG, elle s’est imposée à nous tant dans nos relations avec les membres des communautés partenaires que dans nos propres pratiques de recherche. Elle apparaît ainsi comme une dimension réflexive centrale de la méthodologie, influençant la manière dont les connaissances produites doivent être envisagées dans un cadre de collaboration impliquant également des collègues rattachés à des institutions universitaires des pays dits du Sud global. Cette réflexion est fondamentale pour promouvoir l’équité et de bonnes pratiques de recherche.Préparation et évaluation communautaire des donnéesCet axe porte sur l’évaluation des données linguistiques à partir des représentations et catégories mobilisées au sein des communautés concernées. Dans l’aire dogon, l’idéologie selon laquelle une ethnie correspondrait à une langue demeure particulièrement prégnante et s’exprime à travers des discours affirmant l’existence d’une langue dogon unique, les autres variétés étant reléguées au statut de dialectes. Cette logique d’homogénéisation a notamment conduit à la promotion du dɔgɔsɔ (terme néologique signifiant « langue dogon »), calqué sur le parler de Sangha, comme langue dogon de référence, ainsi qu’à la marginalisation d’autres variétés perçues comme incompatibles avec la cohésion ethnique.Les résultats de la recherche linguistique, qui mettent en évidence une diversité interne importante, sont souvent difficiles à faire accepter et peuvent susciter de fortes tensions identitaires, en particulier lorsqu’ils entrent en contradiction avec les récits d’origine issus de la tradition orale. Du côté académique, le souci de rigueur scientifique conduit fréquemment à minimiser les enjeux sociaux et les effets communautaires des classifications linguistiques. Cet axe propose de considérer la prise en compte des attentes, des discours et des savoirs locaux comme un résultat méthodologique en soi, structurant la collecte, la catégorisation et l’interprétation des données.Développement algorithmique et structuration des donnéesAfin de permettre l’analyse de larges ensembles lexicaux tout en respectant les propriétés propres à chaque langue, nous avons adopté une approche progressive de structuration des données, combinée à des méthodes computationnelles d’apprentissage itératif pour la détection de cognats probables. La préparation des données intègre des interventions successives fondées sur des connaissances linguistiques fines, tandis que les algorithmes, initialement non supervisés, sont ajustés à partir de retours humains. Cette articulation constitue un résultat méthodologique central du projet.Reconstruction historique et scénarios concurrentsL’évaluation des relations phylogénétiques dans la région de Bandiagara et, plus largement, en Afrique de l’Ouest demeure à un stade préliminaire. De nombreuses familles linguistiques nécessitent encore une analyse approfondie des régularités phonologiques, morphologiques et syntaxiques permettant de distinguer héritage et emprunt à l’aide de méthodes falsifiables. Dans ce contexte, la formulation d’hypothèses intermédiaires, fondées notamment sur des approches typologiques paramétrées, constitue une étape méthodologique nécessaire.Typologie comme outil de formation des hypothèses généalogiquesCet axe examine la manière dont le profil typologique du bangimé peut contribuer à l’évaluation de ses relations possibles avec des langues appartenant à d’autres familles africaines. Bien que la typologie ne constitue pas une preuve généalogique en soi, certains paramètres structuraux distinguent nettement le bangimé des langues voisines et invitent à formuler des hypothèses généalogiques exploratoires, nécessitant une contextualisation historique fine.Strates de contact et négationDans le prolongement direct des travaux d’Aurore Montébran, cet axe considère la négation comme un indice privilégié de stratification historique. L’analyse des systèmes négatifs permet d’explorer la superposition de couches de contact et de mieux distinguer héritage, diffusion et innovation grammaticale.Corpus audio bangimé et contraintes méthodologiquesPlusieurs axes du projet s’appuient sur l’analyse d’un corpus oral bangimé, mobilisé comme support méthodologique transversal. La constitution, la segmentation et l’annotation de ce corpus conditionnent l’accès aux phénomènes grammaticaux et typologiques, et jouent un rôle déterminant dans la visibilité de certaines structures linguistiques.Archéo-linguistique et perspectives généalogiquesCet axe développe une démarche archéo-linguistique fondée sur l’identification et l’analyse de lexèmes « datables », notamment les termes désignant des plantes et des animaux domestiqués. Il présente les étapes méthodologiques permettant de mettre en relation données linguistiques et chronologies culturelles issues de la littérature archéologique, biologique et historique. L’objectif est de formuler des hypothèses généalogiques exploratoires à partir de la convergence de plusieurs études de cas indépendantes, sans présupposer de filiation directe.ConclusionPris ensemble, ces axes montrent comment une approche que l’on peut qualifier de typologie pour la généalogie permet de formuler et de tester des hypothèses historiques dans des contextes où la méthode comparative seule demeure insuffisante. Cette démarche collective s’inscrit dans le prolongement direct de l’héritage scientifique d’Aurore Montébran, pour qui l’analyse typologique, et en particulier celle de la négation, constituait un point d’entrée privilégié vers l’histoire des langues
Comparison of M10 and M20 Meteomodem radiosondes relative humidity measurements with ECMWF ERA5 above France: focus on the upper troposphere
No full textInternational audienceAccurate knowledge of the relative humidity (RH) in the troposphere is important for predicting cloud formation, particularly in the upper troposphere where contrails can form and contribute to global warming. However, it is difficult to predict their formation due to the lack of precise RH measurements at these altitudes. This paper compares RH data from Meteomodem radiosondes (M10 and M20) acquired over a 5-years period (2020-2024) at the Trappes and Nîmes meteorological stations in France with ECMWF ERA5 analyses, with a focus on the upper troposphere. For Trappes, two datasets exist: one processed operationally by Météo France (MF) and a second processed using the GRUAN standard. Whatever the processing is, Meteomodem radiosondes RH values are on average higher than ERA5 ones, by about 2 % at 800 hPa up to 10 % at 200 hPa. The operational MF processing generally gives higher RH than the GRUAN processing. The median difference between both processing methods is lower than 2.2 % for pressures higher than 300 hPa and is maximum for lower pressures and nighttime measurements, the GRUAN processing showing more consistency between daytime and nighttime measurements. The evolution of MF processing over time
Les magiciens et magiciennes du monde gréco-romain: Pratiques, savoirs, représentations
No full textNational audienceContribution to the catalogue of the exhibition "Sorcières" (February 6-June 28 2026, Musée d'Histoire de Nantes).Contribution au catalogue de l'exposition "Sorcières" (6 février-28 juin 2026, Musée d'Histoire de Nantes)
Synthesis, Characterization, and Evaluation of Chelators for Radium-223
No full textInternational audienceThe stable coordination of radium-223 ( 223 Ra) for targeted alpha therapy remains elusive. Herein, seventeen chelators were investigated for the complexation of 223 Ra, of which thirteen have previously not been reported. MacroPa was used as a reference and control for the studies, and by a process of systematic modifications to this chelator and a range of other chelator scaffolds, a library of structurally related compounds was obtained, each differing from another by a single functional group or change in the backbone. The radiolabelling of each chelator was assessed by radio-thin layer chromatography to determine radiochemical conversion. Fourteen of the synthesized chelators provided quantitative coordination of 223 Ra at room temperature and neutral pH (or close to). The stability of these complexes in human serum at 37 °C was analyzed using radio-size exclusion chromatography where results corresponding to [ 223 Ra][Ra(MacroMePhos)] were encouraging. However, radio-thin layer chromatography analysis of the 'small molecule' fractions revealed the presence of free 223 Ra, indicating instability within 1 h. In fact, even [ 223 Ra][Ra(MacroPa)] dissociated within 1 h, albeit at higher dilutions. Overall, this work shows that the search for a suitable 223 Rachelator for applications in radiopharmaceuticals still requires significant attention and effort.</div
Intravenous immunoglobulin remodels innate immune cell communication and induces differential autophagy pathways in Kawasaki disease
No full textInternational audienceIntroduction Intravenous immunoglobulin (IVIG), a therapeutic preparation of pooled normal IgG is extensively used as a first-line immunotherapy for many autoimmune and inflammatory diseases, including Kawasaki disease (KD). IVIG provides therapeutic benefits through several non-exclusive mechanisms. Our recent data demonstrate that IVIG induces autophagy in inflammatory innate immune cells, a finding further supported by observations in IVIG-treated myopathy patients. However, whether IVIG selectively activates specific autophagy pathways across distinct innate immune cell subsets remains unclear. Methods Single-cell RNA sequencing data from peripheral blood mononuclear cells (PBMC) of healthy controls, acute untreated KD patients, and IVIG-treated KD patients were analysed. Differential gene expression, cell–cell communication, functional pathway enrichment of autophagy-related pathways, and pseudotime trajectory analyses were performed. Mechanistic studies were conducted in vitro using PBMC and monocytes from healthy donors treated with different IVIG preparations, Fc fragments, or inhibitors, followed by immunoblotting for LC3-II. Results KD was characterized by expansion of inflammatory monocytes and low-density neutrophils with reduced NK and γδ T cells. IVIG therapy reshaped innate immune composition and partially restored coordinated immune networks. IVIG upregulated core macroautophagy genes across innate immune subsets, particularly ATG7 and UVRAG in monocytes. It also induced non-canonical LC3-associated phagocytosis and multiple selective autophagy pathways in a cell-type-specific manner. Pseudotime analysis revealed normalization of monocyte trajectories following treatment. IVIG-induced autophagy occurred independently of Fc fragments and C-type lectin receptors. Discussion IVIG remodels innate immune communication and activates differential autophagy programs, which may contribute to its therapeutic effects in KD and other autoimmune and inflammatory pathologies
Structure of Riemann solvers on networks (preliminary version 3)
No full textInternational audienceIn this paper we consider scalar Riemann solvers on networks, associated to scalar conservation laws. A junction is a particular network which is a finite set of half lines glued together at the origin. Riemann solvers solve uniquely the Riemann problem on the junction. We also assume that Riemann solutions are stable by passage to the limit.In part I, we only address fundamental questions concerning Riemann problems on junctions. We show a characterization of Riemann solvers either by their set of stationary solutions (the germ), or equivalently by their junction Godunov flux. Moreover, we show that the gluing of two junctions with Riemann solvers is well defined and leads to a new junction with a new Riemann solver. We also show that given a quasi Godunov flux (which does not satisfies all the properties of Godunov fluxes), there exists a nonlinear projection which allows to associate a uniqueGodunov flux. This projection is called relaxation. Our theory encompasses in particular Kru˘zkov germs, (quasi) Hamilton-Jacobi germs, monotone germs, conservative and non-conservative germs.In part II, we focus on the special case of importance in applications, where the fluxes of the network are bell-shaped. In this case, we show that the junction Godunov flux has a polar decomposition into a preflux composed with an explicit capacity. Hence all the information is encoded in the preflux. We then find explicit formulas inorder to glue prefluxes, or to relax quasi-prefluxes. We also give some explicit characterizations of some conservative prefluxes where flux limiters appear naturally.In part III, we give an existence and uniqueness theory for conservation laws on networks in the special case where Riemann solvers are associated to Kru˘zkov germs
Evaluation of parasitic and tissue-specific accumulation of emerging contaminants in wild European chubs (Squalius cephalus) across the Seine River system
No full textInternational audienceAquatic ecosystems are increasingly affected by chemical contamination from anthropogenic activities, yet the fate of pesticides and pharmaceutical residues within organisms remains poorly understood. Parasites can also significantly influence pollutant dynamics, through a high capacity for bioaccumulation. In this study, we quantified 60 emerging contaminants, including pesticides, antibiotics, and other pharmaceuticals, in surface waters, fish tissues (gills, liver, muscle), and intestinal acanthocephalan parasites of wild European chubs (Squalius cephalus) across multiple rivers of the Seine river system, France. Forty compounds were detected in water samples, whereas 28, 18, 17, and 8 were detected in parasites, gills, liver, and muscle tissues, respectively. Six compounds, mainly pharmaceuticals and one pesticide (diflufenican), were detected in more than 50 % of samples in at least one biological compartment. Pollutant detection in water was associated with increased occurrence and levels in fish tissue, although tissue levels did not directly correlate with waterborne levels. Gills exhibited the highest pollutant diversity and levels among tissues. Habitat type influenced the number of pollutants detected in water, with higher values in agricultural areas, but did not directly affect tissue concentrations. Acanthocephalans accumulated several pharmaceuticals, especially paracetamol and fluoxetine, at high levels, supporting their bioaccumulation potential. Moreover, parasite biomass influenced host contamination in a tissue-specific manner, decreasing pollutant levels in gills but increasing them in muscle. Fish size positively, and body condition negatively, correlated with pollutant load. These findings highlight the importance of considering both host physiology and parasitism when assessing contaminant fate in freshwater ecosystems