Publications scientifiques de l'EnvA
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ProAKAP4 correlation with flow cytometry parameters in semen of Asturcon ponies
No full textInternational audienc
Borrelia, Leishmania, and Babesia: An Emerging Triad of Vector-Borne Co-Infections?
No full textEditorial MaterialInternational audienceCanine leishmaniosis (CanL), caused by the protozoan Leishmania infantum and transmitted primarily by phlebotomine sand flies, poses significant challenges for zoonotic disease management [...
Genome sequences of four Ixodes species expands understanding of tick evolution
No full textInternational audienceBackground: Ticks, hematophagous Acari, pose a significant threat by transmitting various pathogens to their vertebrate hosts during feeding. Despite advances in tick genomics, high-quality genomes were lacking until recently, particularly in the genus Ixodes, which includes the main vectors of Lyme disease.Results: Here, we present the genome sequences of four tick species, derived from a single female individual, with a particular focus on the European species Ixodes ricinus, achieving a chromosome-level assembly. Additionally, draft assemblies were generated for the three other Ixodes species, I. persulcatus, I. pacificus, and I. hexagonus. The quality of the four genomes and extensive annotation of several important gene families have allowed us to study the evolution of gene repertoires at the level of the genus Ixodes and of the tick group. We have determined gene families that have undergone major amplifications during the evolution of ticks, while an expression atlas obtained for I. ricinus reveals striking patterns of specialization both between and within gene families. Notably, several gene family amplifications are associated with a proliferation of single-exon genes—most strikingly for fatty acid elongases and sulfotransferases.Conclusions: The integration of our data with existing genomes establishes a solid framework for the study of gene evolution, improving our understanding of tick biology. In addition, our work lays the foundations for applied research and innovative control targeting these organisms
Analyse des génomes complets de Escherichia coli et Staphylococcus aureus pour la compréhension de la dissémination de ces espèces dans la population communautaire
No full textThis thesis investigates the community transmission of ESBL-producing E.coli and S. aureus, using two cohorts. The first cohort (BMR-IST) explores sexual transmission of E. coli and S. aureus among adults at risk for STI. The second cohort (Djibouti) analyzes an outbreak of PVL-producing S. aureus infections. This work employs high-resolution genomic characterization combined with metadata and public genome databases. Our findings enabled identification of risk factors associated with carriage , transmission routes, and replaces the strains in a global context. We demonstrate community diffusion of emerging E. coli STs associated with specific sexual practices, and high diversity of S. aureus STs withoutspecific risk factors. In Djibouti, multiple clusters of S. aureus ST152 reveal local transmission patterns within a continental dynamic. These findings highlight the value of genomic data coupled with epidemiology to document community carriage and understand transmission pathways.Cette thèse explore la diffusion communautaire des E. coli producteurs de BLSE et S. aureus, à partir de deux cohortes. La première (BMR-IST) porte sur la transmission sexuelle de E. coli et S. aureus chez des adultes à risque d’IST. La seconde (Djibouti) analyse une épidémie d’infections à S. aureus producteurs de la PVL. Cette thèse repose sur une caractérisation génomique à haute résolution, croisée avec des métadonnées et des génomes publics. Cette méthodologie a permis d’identifier des facteurs de risque associés au portage et la transmis sion, et de situer les souches dans un contexte global. Nous mettons en évidence la circulation communautaire de STs émergents de E. coli associée à certainespratiques sexuelles, et une grande diversité de clones de S. aureus sans facteur de risque spécifique. À Djibouti, plusieurs clusters de S. aureus ST152 révèlent des transmissions locales s’inscrivant dans une dynamique continentale. Ces travaux soulignent l’intérêt des données génomiques couplées à l’épidémiologie pour documenter le portage communautaires et comprendre les voies de transmissions
Stress thermique lié à la chaleur : mieux le comprendre pour limiter ses impacts sur le bien-être du mouton
No full textInternational audienceClimate change is a major issue in agriculture, imposing several potentially detrimental constraints to animal welfare, particularly regarding nutrition and health. In addition, the resulting global warming is increasing the frequency, intensity and amplitude of heat waves, and consequently the risk of heat stress in animals. This condition involves significant behavioral and physiological alterations that can lead to a loss of productive and reproductive performance, as well as effects on offspring and, in extreme cases, death. To avoid these harmful outcomes, it is essential to implement appropriate preventive measures into herd management. Veterinarians should be able to understand mechanisms and consequences of heat stress, as well as action levers, to better advise farmers on preventive management plans. This article discusses the mechanisms, diagnosis and preventive measures of heat stress, using sheep as an example.Le dérèglement climatique est une problématique d’actualité en agriculture et impose plusieurs contraintes sur le bien-être animal, notamment liées à l’alimentation et à la santé. Une des conséquences de ce dérèglement est l’augmentation de la fréquence, de l’intensité et de l’amplitude des vagues de chaleur et, par conséquent, du risque de stress thermique chez les animaux. Ce dernier implique des altérations comportementales et physiologiques importantes pouvant engendrer une perte de performance productive et reproductive ainsi que des effets sur la descendance et, dans les cas extrêmes, la mort des animaux. Pour éviter ces conséquences néfastes, il est nécessaire d’intégrer des mesures préventives adaptées dans la conduite de l’élevage. Il est important pour le vétérinaire de comprendre les mécanismes et les conséquences du stress thermique ainsi que les leviers d’action, afin de mieux conseiller l’éleveur autour de sa prévention. Cet article discutera les mécanismes, le diagnostic et les mesures préventives, en prenant comme exemple l’espèce ovine
Étude des facteurs de rémission du diabète sucré chez le chat : étude prospective de 30 cas vus au CHUVA entre 2021 et 2024
No full textDiabetes mellitus is a common endocrinopathy in cats, for which clinical remission, defined as the maintenance of euglycemia without insulin therapy for at least four weeks, represents a major therapeutic goal. However, published studies show highly variable definitions, protocols, and sample sizes, making it difficult to reliably identify factors associated with remission at the time of diagnosis. This study aimed to describe the clinical, biological, and therapeutic characteristics of cats newly diagnosed with diabetes mellitus, prospectively followed between 2021 and 2024 at the National Veterinary School of Alfort (EnvA - CHUVA), and to identify potential factors associated with the occurrence of remission. Included cats met strict criteria: recent diagnosis of diabetes mellitus, initial treatment with either ProZinc® or Lantus® insulin, and a minimum follow-up period of six months. Data collected at admission included signalment, history, complete clinical examination, biochemical results, and imaging and urinalysis findings. Follow-up consisted of standardized visits up to six months post inclusion, with treatment adjustments and remission assessment. Statistical analysis was performed using the Kaplan-Meier method, and group comparisons were conducted using the Log-rank test. A total of 30 cats were enrolled. Most were male (80%), neutered, of domestic shorthair breed (87%), with a median age of 10.5 years. The most frequent clinical signs were weight loss (83%), polydipsia (77%), and polyuria (73%). Biochemical abnormalities commonly observed included hypercholesterolemia (67%), marked elevated fructosamine levels (67 %), and moderate to marked ketonemia (53%). The main comorbidities were pancreatitis, ketosis, and chronic kidney disease (each affecting around 30% of cats). Five out of thirty cats achieved remission during the follow-up period, within 41 to 172 days after diagnosis. At 6 months post-diagnosis, the remission rate estimated by the Kaplan-Meier curve was 35%. Exposures significantly associated with a faster remission included the presence of an abdominal abnormality on palpation (p = 0.002), urine specific gravity < 1.035 (p = 0.008), mild glucosuria (p = 0.012), and ketosis (p = 0.014). These findings represent a first step toward a larger-scale study and emphasize the need for standardized protocols to refine the prognostic assessment of this condition.Le diabète sucré est une endocrinopathie fréquente chez le chat, dont la rémission clinique, définie par le maintien d'une euglycémie sans insulinothérapie pendant au moins quatre semaines, représente un objectif thérapeutique majeur. Cependant, les facteurs associés à la rémission identifiés au moment du diagnostic sont difficiles à interpréter en raison d'une grande hétérogénéité des études publiées. Ce travail s'inscrit dans ce contexte et avait pour objectif de décrire les caractéristiques cliniques, biologiques et thérapeutiques des chats nouvellement diagnostiqués de diabète sucré, suivis prospectivement entre 2021 et 2024 au Centre Hospitalier Universitaire Vétérinaire d'Alfort (CHUVA), et d'identifier les éventuels facteurs associés à la survenue d'une rémission. Les chats inclus répondaient à des critères précis : diagnostic récent de diabète sucré, traitement initial par insuline ProZinc® ou Lantus®, et suivi d'au moins six mois. Les données recueillies à l'admission comprenaient le signalement, les commémoratifs, l'examen clinique complet, les résultats biologiques, ainsi que les examens d'imagerie et urinaires. Le suivi comportait plusieurs visites standardisées jusqu'à six mois après l'inclusion, avec ajustement du traitement et évaluation de la rémission. L'analyse statistique a été réalisée selon la méthode de Kaplan-Meier, et les comparaisons entre groupes effectuées à l'aide du test du Logrank. Trente chats ont été inclus. Ils étaient majoritairement mâles (80 %), stérilisés, de race Européenne (87 %), et âgés en médiane de 10,5 ans. Les signes cliniques les plus fréquents étaient l'amaigrissement (83 %), la polydipsie (77 %) et la polyurie (73 %). Sur le plan biologique, une hypercholestérolémie (67 %), une hyperfructosaminémie marquée (67 %) et une cétonémie modérée à marquée (53 %) étaient fréquemment observées. Les comorbidités principales incluaient pancréatite, cétose et maladie rénale (environ 30 % chacune). Cinq chats sur trente ont atteint la rémission au cours du suivi, dans un délai de 41 à 172 jours post diagnostic. À 6 mois post-diagnostic, le taux de rémission estimé par la courbe de Kaplan-Meier était de 35 %. Les expositions significativement associées à une rémission plus rapide étaient la présence d'une anomalie à la palpation abdominale (p = 0,002), une densité urinaire < 1,035 (p = 0,008), une glucosurie discrète (p = 0,012) et la présence d'une cétose (p = 0,014). Ces résultats sont une première étape vers une étude sur un effectif plus important nécessitant une standardisation des protocoles pour affiner l'évaluation pronostique de cette affection
Infection grippale maternelle par le virus influenza H3N2 : caractérisation des effets fœto-placentaires via deux lignées transgéniques murines
No full textNational audienc
Projet grippe “ Ivernale”: de la conception à la réalisation d’un projet collaboratif entre membres SAPS
No full textInternational audienc
Les affections du pied postérieur chez le cheval: étude rétrospective de 50 cas examinés au CIRALE
No full textFoot conditions are a major condition of equine locomotor injuries. The diagnosis of these lesions is a challenge for the veterinarian, and the improvement of imaging techniques has led to significant advancements in this area. Numerous studies have been conducted, improving the understanding of these conditions as well as their treatment and prognosis. Nevertheless, these studies are generally focused on the forefoot, which is more frequently affected. The objective of our study was to conduct a retrospective analysis of hindfoot conditions, their imaging and to discuss the treatments and prognosis associated with these lesions based on 50 cases examined at CIRALE. The results showed that the imaging procedures performed on the hindfoot are very similar to that performed on the forefoot for diagnosing the same condition. Some conditions exhibit lesion characteristics similar to those described on the forefoot, particularly fractures, which are most frequently located on the medial part of the plantar process of the distal phalanx in our study (50% of cases). However, some of our results differ from existing literature on the forefoot, such as for the street nail where the lesion characteristics differ, but also the prognosis which is better for a posterior foot condition. Our study provides an overview of the hindfoot conditions and establishes some comparisons with forefoot diseases.Les affections du pied sont une dominante des affections locomotrices équines. Le diagnostic de ces entités pathologiques est un enjeu pour le vétérinaire et l'amélioration des techniques d'imagerie a permis une grande avancée en la matière. De nombreuses études ont été réalisées et ont permis d'améliorer les connaissances de ces lésions mais aussi de leur traitement et de leur pronostic. Néanmoins ces travaux sont généralement focalisés sur le pied antérieur, plus fréquemment atteint. L'objectif de notre travail était de mener une étude rétrospective sur les affections du pied postérieur, son imagerie mais aussi évoquer les traitements et le pronostic associé à ces affections à partir de 50 cas examinés au CIRALE. Les résultats ont montré que l'imagerie réalisée sur le pied postérieur est très proche de celle effectuée sur le pied antérieur pour le diagnostic d'une même affection. Certaines affections présentent des caractéristiques lésionnelles similaires à celles décrites sur le pied antérieur, c'est le cas notamment des fractures qui sont le plus fréquemment localisées sur la partie médiale du processus plantaire de la phalange distale dans notre étude (50%). Cependant certains de nos résultats présentent des différences avec les résultats existants dans la littérature sur le pied antérieur notamment pour le clou de rue où les caractéristiques lésionnelles diffèrent ainsi que le pronostic qui est meilleur pour une atteinte du pied postérieur. En conclusion, cette étude permet de faire un état des lieux des affections rencontrées sur le pied postérieur et de les comparer à celles du pied antérieur
Améliorer la communication interpersonnelle des vétérinaires envers les propriétaires de chevaux de sport lors de la visite d'achat
No full textCommunication failures related to purchase visits are one of the main sources of professional liability claims against French equine veterinarians. Addressing the pitfalls of this communication is a key area of focus in efforts to reduce the number of claims against veterinarians. Our study enabled us to examine veterinary practices and the expectations of sport horse owners with regard to interpersonal communication during purchase visits in France. Comparing these two perspectives should help to identify the causes of the deterioration in veterinary communication during purchase visits. Using individual analysis of interviews with five veterinarians, four sellers and five buyers of sport horses in France, in a qualitative approach, we have highlighted that during sport horse purchase visits, interpersonal communication is perceived as essential but remains unevenly mastered by veterinarians. Veterinarians must prove their legitimacy to gain the trust of buyers and sellers, but they are insufficiently trained in interpersonal communication, which they sometimes consider secondary. Owners expect clear exchanges tailored to their plans, while veterinarians emphasise the limits of their role. A climate of mistrust, reinforced by the fear of unpaid bills and disputes, further complicates communication. The pressure exerted on veterinarians is detrimental to the quality of communication. The results obtained in this study provide initial avenues for reflection, enabling improvements to be made to current veterinary practices during visits to purchase sport horses in France, thanks to the difficulties observed and in light of the expectations expressed by the owners surveyed.Les défauts de communication liés à la visite d'achat constituent une des principales sources de mise en cause de la responsabilité civile professionnelle des vétérinaires équins français. Approcher les écueils de cette communication représente un axe majeur de réflexion pour tenter de diminuer le nombre d'accusations à l'encontre des vétérinaires. Notre étude nous a permis d'approcher les pratiques vétérinaires et les attentes des propriétaires de chevaux de sport, concernant la communication interpersonnelle lors des visites d'achat en France. Confronter ses deux perspectives devrait permettre d'identifier les origines de la dégradation de la communication vétérinaire en visite d'achat. A l'aide de l'analyse individuelle des entretiens de cinq vétérinaires, de quatre vendeurs et de cinq acheteurs de chevaux de sport, dans une approche qualitative, nous avons mis en évidence que lors des visites d'achat de chevaux de sport, la communication interpersonnelle est perçue comme essentielle mais reste inégalement maîtrisée par les vétérinaires. Ces derniers doivent prouver leur légitimité pour gagner la confiance des acheteurs et des vendeurs et sont insuffisamment formés à la communication interpersonnelle, qu'ils jugent parfois secondaire. Les propriétaires attendent des échanges clairs, adaptés à leur projet, tandis que les vétérinaires insistent sur les limites de leur rôle. Un climat de méfiance, renforcé par la peur des impayés et des litiges, complexifie encore la communication. Les pressions exercées sur les vétérinaires nuisent à la qualité des échanges. Les résultats obtenus dans cette étude constituent des premières pistes de réflexion, permettant d'améliorer les pratiques actuelles des vétérinaires lors des visites d'achat de chevaux de sport en France, grâce aux difficultés observées et à la lumière des attentes formulées par les propriétaires interrogés