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Characterization of dynamic compliance of the respiratory system in healthy anesthetized dogs
No full text3International audienceIntroduction In clinical practice, evaluating dynamic compliance of the respiratory system (C dyn ) could provide valuable insights into respiratory mechanics. Reference values of C dyn based on body weight have been reported, but various factors may affect them and the evidence is scanty. This study aimed to establish a reference interval for C dyn and identify associated variables. Methods Data were collected from 515 client-owned dogs requiring anesthesia, excluding those with lower airway disease. The dogs were anesthetized, the tracheas intubated, and lungs ventilated at clinicians' discretion across 11 centers in six countries, with no restrictions on anesthesia protocols or ventilation settings, except avoiding inspiratory pauses. Three C dyn measurements from three consecutive breaths per dog were recorded using a standardized form, which also documented factors affecting C dyn identified through literature and an online survey. Various spirometry technologies were used. The substantial variance in C dyn measurements led to a comprehensive analysis using a multiple linear regression model. Multicollinearity (variables highly correlated with each other) was addressed by investigating, transforming, or excluding factors. Initial simple linear regression assessed each variable's individual effect on C dyn , followed by a multiple linear regression model constructed via stepwise forward selection and backward elimination. Results The best-fitting model identified a linear relationship between C dyn and body mass when the following conditions were met: high BCS (Body Condition Score), orotracheal tubes <7% smaller than predicted, the use of a D-lite flow sensor, and the absence of a high FIO2 (>80%) exposure for more than 10 minutes before C dyn measurement. In cases where these conditions were not met, additional factors needed to be incorporated into the model. Low (1/9, 2/9, 3/9) and medium (4/9, 5/9) BCS, an orotracheal tube of the predicted size or larger and longer inspiratory times were associated with increased C dyn . The use of alternative spirometry sensors, including Ped-lite, or prolonged exposure to high FIO 2 levels resulted in decreased C dyn . Conclusion and clinical relevance Establishing a reference interval for C dyn proved challenging. A single reference interval may be misleading or unhelpful in clinical practice. Nevertheless, this study offers valuable insights into the factors affecting C dyn in healthy anesthetized dogs, which should be considered in clinical assessments
Risk of Buetongue introduction by the wind: predictable? case study with EHDV in France
No full textInternational audienc
Estimation des paramètres diagnostiques de tests évaluant un état inflammatoire chez les bovins adultes au chevet du malade et au cabinet vétérinaire
No full textNational audienceUn taureau Aubrac de 3 ans a été présenté au service d’hospitalisation des animaux de rente de VetAgro Sup pour une augmentation de la taille des testicules (52cm de circonférence), sans atteinte de l’état général, remarqué par l’éleveur 15 jours avant. La présence d’une orchite bilatérale a été confirmée par échographie des testicules et quelques-unes des maladies infectieuses d’intérêt, potentiellement responsable d’orchite, ont été élimées par sérologies (brucellose, chlamydiose, besnoitiose et Fièvre Q). L’examen cytobactériologique des urines (prélevées par miction naturelle) réalisé est en faveur d’une absence d’infections urinaires (peu ou pas de cellule inflammatoire au culot urinaire et pousse peu abondantes d’entérocoques et de staphylocoques à coagulase négative en bactériologie probablement liées à une contamination lors de la miction). Un traitement antibiotique (florfénicol 20mg/kg, intramusculaires, toutes les 48h) mis en place pendant 3 semaines et a été associé à une diminution de la circonférence du scrotum (45cm 10jours après le début du traitement). Malgré l’amélioration clinique, l’absence de réussite à la saillie constatée sur une génisse du troupeau 4 mois après le début des symptômes laisse supposer une infertilité ou a minima une hypofertilité. Le contrôle de la qualité du sperme n’a pas pu être réalisé en raison du refus de la saillie du taureau lors de la tentative de récolte réalisée à la ferme
Integrated modelling of microbial-plant interactions in multi-species agroecosystems: the project MODIMIV
No full textInternational audienceThe MODIMIV (“Modeling relationships between microbial and plant diversity in multi-species agroecosystems”) exploratory project (2024-2025) within the INRAE Biosefair meta-programme (https://biosefair.hub.inrae.fr) sets out to redefine our understanding of the intricate dynamics within multi-species vegetation covers (https://biosefair.hub.inrae.fr/rubriques-verticales/nos-actions/projets-exploratoires/modimiv-projet-exploratoire-2024-2026). Recognising the pivotal role played by soil microbial diversity and plant diversity in governing carbon and nutrient cycles, MODIMIV is committed to unravelling these complex interactions, with grasslands serving as revealing case studies for broader multi-species ecosystems.Conventional modelling approaches often compartmentalise plant and microbial components, overlooking their dynamic interplays. In contrast, MODIMIV challenges this view by integrating the dynamics of microbial and plant diversity into simulation tools, thereby offering key insights for sustainable agricultural management practices. Microbial diversity significantly shapes processes such as nitrification, denitrification and carbon sequestration, while plant diversity holds promise of optimising microbial carbon and nitrogen use by harmonising nutrient supply and demand.At the core of MODIMIV lies the ambition to develop integrated simulators capable of capturing the material flows within and between microorganisms and plants. By aligning the availability of nutrients with the needs of plants and microbes, this approach seeks to shed light on the nuanced interplay within ecosystems.The main objectives of MODIMIV include:- Investigating how biodiversity shapes carbon and nutrient cycling across diverse, multi-species vegetation cover to deepen our understanding of ecosystem dynamics.- Developing advanced simulation tools that seamlessly integrate plant and microbial diversity to enrich the modelling of ecological processes associated with herbaceous covers.- Assessing the effects of plant and microbial diversity on nutrient cycling and carbon sequestration, highlighting their central role in supporting ecosystem sustainability.- Providing long-term prediction models: Equipping stakeholders with robust predictive models to strengthen sustainable agricultural practices by offering foresight for sustainable management strategies.Taking a comprehensive approach, MODIMIV leverages data from multi-year mesocosm studies and replicated field experiments on grassland and agro-grassland treatments in Clermont-Ferrand (France) to refine prototypes. Moreover, the project actively welcomes collaboration with other initiatives, including the EJP Soil AGROECOSeqC project. With grasslands as its primary focus, MODIMIV aims to show the effectiveness of its simulators, particularly in low-input agroecosystems. These ecosystems serve as compelling examples of how plant communities adeptly modulate nutrient availability to soil microbiota, thereby promoting plant growth. Through these collaborative efforts, MODIMIV seeks to transcend conventional modelling paradigms and advocate for the adoption of sustainable agricultural practices across a diverse array of multi-species vegetation covers
Neuro-Oncologic Veterinary Trial for the Clinical Transfer of Microbeam Radiation Therapy: Acute to Subacute Radiotolerance after Brain Tumor Irradiation in Pet Dogs
No full text3International audienceSynchrotron Microbeam Radiation Therapy (MRT) has repeatedly proven its superiority compared with conventional radiotherapy for glioma control in preclinical research. The clinical transfer phase of MRT has recently gained momentum; seven dogs with suspected glioma were treated under clinical conditions to determine the feasibility and safety of MRT. We administered a single fraction of 3D-conformal, image-guided MRT. Ultra-high-dose rate synchrotron X-ray microbeams (50 µm-wide, 400 µm-spaced) were delivered through five conformal irradiation ports. The PTV received ~25 Gy peak dose (within microbeams) per port, corresponding to a minimal cumulated valley dose (diffusing between microbeams) of 2.8 Gy. The dogs underwent clinical and MRI follow-up, and owner evaluations. One dog was lost to follow-up. Clinical exams of the remaining six dogs during the first 3 months did not indicate radiotoxicity induced by MRT. Quality of life improved from 7.3/10 [±0.7] to 8.9/10 [±0.3]. Tumor-induced seizure activity decreased significantly. A significant tumor volume reduction of 69% [±6%] was reached 3 months after MRT. Our study is the first neuro-oncologic veterinary trial of 3D-conformal Synchrotron MRT and reveals that MRT does not induce acute to subacute radiotoxicity in normal brain tissues. MRT improves quality of life and leads to remarkable tumor volume reduction despite low valley dose delivery. This trial is an essential step towards the forthcoming clinical application of MRT against deep-seated human brain tumors
A Large‐Scale Serological Survey in Pets From October 2020 Through June 2021 in France Shows Significantly Higher Exposure to SARS ‐ CoV ‐2 in Cats Compared to Dogs
No full textInternational audienceIntroduction : Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS‐CoV‐2) has the potential to infect various animals, including domestic pets like dogs and cats. Many studies have documented infection in companion animals by molecular and serological methods. However, only a few have compared seroprevalence in cats and dogs from the general population, and these studies were limited by small sample sizes and collections over short periods. Our aim was to obtain a more accurate evaluation of seroprevalence in companion animals in France and to determine whether cats and dogs differ in their exposure to SARS‐CoV‐2. Methods : We conducted an extensive serological survey of SARS‐CoV‐2, collecting blood samples from 2036 cats and 3577 dogs during routine veterinary medical examinations across different regions of metropolitan France from October 2020 to June 2021. This period encompassed the peaks and onset of two waves, as well as the emergence of the first variants. A microsphere immunoassay targeting the receptor‐binding domain and trimeric spike protein was used to detect anti‐SARS‐CoV‐2 antibodies. A subset of 308 seropositive samples was tested for the presence of neutralising antibodies. Results : We determined an overall seroprevalence of anti‐SARS‐CoV‐2 antibodies of 7.1% (95% confidence interval [CI]: 6.4%–7.8%) among the sampled pets. Cats exhibited a significantly higher seroprevalence (9.3%; 95% CI: 8.1%–10.1%) compared to dogs (5.9%; 95% CI: 5.2%–6.8%). Among the subset of seropositive samples, 81 (26.3%; 95% CI: 21.5%–31.6%) displayed neutralizing antibodies. Furthermore, seroprevalence in both species was lower in older animals and was not associated with sex. Finally, unlike cats, seroprevalence in dogs was found to be correlated with the date of sampling. Conclusions : The large sample size enhances the reliability and statistical robustness of our estimates regarding pet exposure to SARS‐CoV‐2. This study on SARS‐CoV‐2 reaffirms the crucial importance of adopting a One Health approach incorporating domestic animals when managing an epidemic caused by a zoonotic virus
Obstacles to the reuse of treated wastewater: an analysis of the Puy-de-Dôme region using the Q method
No full textInternational audienceThe aim of this study is to investigate perceptions of stakeholders about obstacles to the reuse treated wastewater. We conducted a Q-study and interviews with 14 1 stakeholders in the Puyde-Dôme region where projects of water reuse are on stage. We found out four main perspectives. While for some individual operational financial and non-monetary barriers are important, for some others, health and pollution, psycho-socio obstacles or management and political obstacle can compromise the implementation of these projects. This study also sheds lights on consensus and disagreements between actors and generally contributes to understanding how stakeholders perceive water reuse projects and their potential obstacles.</div
Demande d’avis relatif à l’évaluation des risques pour la santé publique et la santé animale liés à la transmission inter-espèces (être humain-animal et animal-être humain) des virus influenza en élevage porcin et les mesures de surveillance et de prévention à mettre en œuvre
No full textCitation suggérée : Anses. (2024). Demande d’avis relatif à l’évaluation des risques pour la santé publique et la santé animale liés à la transmission inter-espèces (être humain-animal et animal/être humain) des virus influenza en élevage porcin et les mesures de surveillance et de prévention à mettre en œuvre. (Saisine 2021-SA-0195). Maisons-Alfort : Anses, 306 p.À la date de rédaction de ce rapport, quatre genres d’influenzavirus sont distingués au sein de la famille des Orthomyxoviridae : le genre Alphainfluenzavirus (virus influenza de type A ou IAV), le genre Betainfluenzavirus (virus influenza de type B ou IBV), le genre Gammainfluenzavirus (virus influenza de type C ou ICV) et le genre Deltainfluenzavirus (IDV).Les IAV sont les virus influenza qui ont la plus grande diversité d’espèces hôtes (oiseaux et mammifères) et sont les seuls à avoir été responsables de pandémies de grippe. Le porc héberge des IAV, lesquels sont responsables de l’influenza porcin. Le porc peut être infecté par des ICV, mais, comme chez l’être humain, ceux-ci ne provoquent pas d’infections symptomatiques. Il peut également être infecté par des IDV (transmis par les bovins), qui pourraient jouer un rôle dans le complexe respiratoire porcin mais dont la circulation au sein de l’espèce porcine n’est pas démontrée. Ainsi, les risques (pour la santé publique et la santé animale) liés à la transmission inter-espèces des virus influenza en élevage porcin concernenttrès majoritairement les IAV. La présente évaluation a donc uniquement porté sur les IAV.D’après le texte de la saisine, « les IAV ont une propension importante à évoluer, notamment par mutations ou par réassortiments génomiques. Ces virus sont isolés chez de nombreuses espèces animales, sauvages comme domestiques, ainsi que chez l’être humain. Certaines souches sont hautement pathogènes pour leurs hôtes et/ou sont capables de passer la barrière d’espèces. Ces virus peuvent ainsi avoir un impact sanitaire et économique majeur tant en santé publique humaine que vétérinaire. Ils peuvent en effet être zoonotiques et présenter un potentiel pandémique et panzootique comme en témoignent les épidémies etépizooties des dernières décennies.L’influenza porcin ou la grippe du porc, causée par un IAV, est une maladie respiratoire virale fréquente dans les élevages de porcs français, et tous les virus influenza porcins sont à potentiel zoonotique. Le porc peut être infecté par des IAV porcins mais également par des IAV humains ou aviaires. Il peut donc devenir un hôte intermédiaire pour la transmission de virus influenza aviaires à l’être humain, mais aussi servir de « mixing vessel », où, à la faveur des co-infections, de nouveaux virus réassortants peuvent émerger. Les souches circulant chez le porc en France font l’objet d’une surveillance événementielle par le Réseau national de surveillance des virus influenza porcins (Résavip). Le Laboratoire National de Référencepour l’influenza porcin (LNR-IP) (Anses, Laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort) mène également des activités de recherche sur ces virus.Les lieux de détention (élevages, abattoirs, etc.) de suidés et de volailles sont des lieux de circulation de virus animaux dans des conditions de grande proximité avec l’être humain. Des cas de transmission de virus influenza d’origine porcine à l’être humain ont été mis en évidence à plusieurs reprises à l’étranger et récemment en France. Un risque de réassortiment, chez l’animal ou l’être humain co-infecté par des virus d’origine animale et/ou humaine existe et est possiblement accentué lors de la saison de circulation des virus grippaux humains ».Au regard du risque pour la santé publique que représentent les virus influenza porcins, la DGAL a sollicité l’expertise de l’Anses le 8 septembre 2021 (demande d’appui scientifique et technique - AST du 8 septembre 2021) pour qu’une investigation épidémiologique soit conduite dans un élevage porcin présumé être à l’origine d’un cas humain d’infection par un virus influenza porcin survenu en août 2021, en lien avec les travaux d’investigation épidémiologique chez l’être humain qui ont été coordonnés par Santé Publique France (SPF) et conduits par l’Agence Régionale de Santé (ARS) Bretagne.La Haute Autorité de Santé (HAS) et le Haut Conseil de Santé Publique (HCSP) avaient été saisis concomitamment en septembre 2021 concernant les questions de la vaccination contre la grippe saisonnière des personnes exposées aux virus influenza porcins et des mesures de protection des intervenants dans les lieux de détention des porcins
19. Colistin resistance in pigs – assessing the effectiveness of mitigation measures
No full textInternational audienceThe discovery of the plasmid gene for resistance to colistin mcr-1 in 2015 profoundly changed how this widely used molecule in veterinary medicine in France was considered. Subsequently, national management measures were set up to reduce its use in animals, in line with European Union recommendations aiming at preserving usefulness of colistin for human multiresistant infections treatment
La coexistence des initiatives de reterritorialisation des filières légumières : proposition d'un cadre d'analyse
No full textInternational audiencePour répondre à la montée des préoccupations environnementales et aux externalités négatives du modèle agroindustriel, les initiatives de reterritorialisation de l’alimentation se multiplient (Lamine, 2019). Cela se traduit par la coexistence d’initiatives diverses, tant du fait des parties prenantes impliquées (les producteurs, les intermédiaires de la transformation et de la distribution, les citoyens, les acteurs publics), que de la pluralité des enjeux qui y sont associés. En particulier, on observe depuis quelques années des initiatives orientées vers des objectifs de structuration de filières « territorialisées ». La diversité et la multiplicité des initiatives questionne la gouvernance de leur coexistence.L’objectif de la communication est de proposer un cadre d’analyse des situations de coexistence de ces initiatives, en s’appuyant sur le cas des filières légumières dans les territoires des Métropoles de Clermont-Ferrand et Lyon. La construction de ce cadre d’analyse se fonde sur des aller-retour entre la littérature et des données issues d’une enquête exploratoire conduite sur les deux territoires étudiés. La littérature sur la coexistence (Gasselin et al. 2021; Chiffoleau et al. 2020; Thomé et al. 2021; Gasselin et Hostiou 2020) a particulièrement été mobilisée. La notion de coexistence permet d’aborder les différentes formes d’interactions sur les territoires. Elle peut se définir comme « des configurations de concurrences, de confrontations, de rapports de force, mais aussi de coprésences, de coévolutions, de complémentarités, de synergies et parfois même [d’] hybridations » (Gasselin et al. 2021, p379). Le cadre d’analyse proposé a été construit à partir des dimensions identifiées par Gasselin et al. (2021) permettant de caractériser des situations de coexistence de modèles agricoles et alimentaires. Il s’agit des « acteurs ou systèmes [qui] interagissent» ; les « « scènes » ou cadres d’interaction» dans lesquels ils interagissent ; les modalités d’interaction, à savoir « comment ils interagissent» ; les « objets» sur lesquels portent les interactions (Gasselin et al. 2021, p.20-21). En parallèle, 17 entretiens exploratoires semi-directifs ont été réalisés, entre février et juin 2023, auprès d’interlocuteurs professionnels en charge de la reterritorialisation de filières alimentaires à différentes échelles territoriales (Région Auvergne-Rhône-Alpes, départements, EPCI, PAT). Les données de terrain et la littérature ont permis de confirmer l’existence d’une diversité d’initiatives de structuration de filière portées par des acteurs privés comme publics, en matière de production, de mise en marché, d’approvisionnement en légumes ou d’accompagnement. Ils ont également permis d’identifier des composantes permettant d’analyser et de caractériser leurs interactions.Les résultats, permettent de dégager cinq dimensions constitutives du cadre d’analyse : la caractérisation des acteurs partie-prenantes des initiatives, les ressources mobilisées et les controverses territoriales qui conditionnent les stratégies des acteurs, les modalités d’interaction autour de ces ressources et controverses et les arènes dans lesquelles ces interactions prennent place. Les stratégies de structuration de filières amènent à considérer, pour caractériser les initiatives et leur coexistence, l’ensemble des acteurs de l’alimentation, qu’ils participent directement ou indirectement à la fourniture d’aliments (Lamine 2012). La littérature et les données de terrain suggèrent qu’ils peuvent être caractérisés par leurs fonctions (rôle, statut), les représentations qu’ils portent (visions et perceptions des enjeux), ainsi qu’à travers leurs logiques et stratégies d’action (là où est situé leur intérêt individuel ou collectif). Ces acteurs se regroupent pour mobiliser ou développer des ressources territoriales et extraterritoriales (Houdart et al. 2023) nécessaires au processus de production, de transformation et de distribution. Les enquêtes permettent de faire émerger quatre principaux types de ressources : des ressources naturelles, des ressources financières et politiques, des ressources sociales et cognitives et des ressources marchandes. Elles mettent également en évidence que la gestion, la mobilisation et la construction de ces ressources peuvent participer au développement de coopérations et de stratégies collectives mais entraine également des concurrences. L’émergence de controverses en lien avec les processus de reterritorialisation et l’usage des ressources poussent les acteurs à se positionner les uns par rapport aux autres. Une focalisation sur les controverses peut permettre de saisir l’articulation et les tensions entre initiatives (Venturini 2010), d’identifier les arènes dans lesquelles les interactions prennent place et le développement de modalités de gouvernance de cette coexistence.Cette communication est issue d’un travail de thèse en géographie en cours, qui s’inscrit dans le projet de recherche ReSysTerr (Résilience des systèmes alimentaires territoriaux) financé par la région Auvergne-Rhône-Alpes (Pack ambition recherche 2021) et qui contribue au projet TETRAE TRAACT (TRansitions des systèmes Agricoles et alimentaires)