HAL - La Rochelle Université, Archives Ouvertes
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Two de novo transcriptome assemblies and functional annotations from juvenile cuttlefish (Sepia officinalis) under various metal and pCO2 exposure conditions
No full textThe cuttlefish Sepia officinalis is a precious model in behavioural and neurobiology studies. It is currently facing combined environmental changes related to the anthropogenic global change. However, genomic resources available to support investigations tackling this issue are still scarce. Therefore, we present two annotated de novo transcriptome assemblies from recently hatched (whole body) and one-month-old (head) Sepia officinalis juveniles. Both assemblies rely on an important read depth validated by a pseudo-rarefaction analysis, and gathered several individuals from various metal and pCO 2 exposure conditions. After redundancy reduction, assemblies from newly hatched and one-month-old individuals comprised 244,772 and 397,569 transcripts with 39,804 and 49,402 putative ORFs, respectively, and an average annotation rate of 60%. Assemblies were compared to each other, revealing age-specific transcriptomic landscapes. These two assemblies constitute highly valuable genomic resources facilitating the investigation of transcriptomic endpoints in environmental studies considering coleoid cephalopods
Suivi de la mégafaune marine au sein du Parc Naturel Marin des estuaires picards et de la mer d’Opale - Programme MAMO - Rapport de campagne 2023-2025 pour le PNM EPMO (OFB-22-0565).
No full textLe projet MAMO vise à enrichir les connaissances sur les oiseaux et les mammifères marins dans le Parc naturel marin des estuaires picards et de la mer d’Opale (PNM EPMO) et de ses eaux avoisinantes, à une résolution saisonnière. Cette campagne d’acquisition de données via l’observation aérienne vise également les autres espèces mobiles visibles en surface (poissons, raies, méduses), les macrodéchets flottants ainsi que les navires. Elle a pour objectif d'identifier et préciser distributions et abondances des taxons de la mégafaune marine les plus abondants dans la zone d’étude, tout en caractérisant les variations saisonnières.Initialement prévue pour l’automne 2022, la campagne a débuté au printemps 2023 après obtention des accords nécessaires pour les eaux anglaises. Sept sessions de prospection aérienne ont été menées entre le printemps 2023 et l’hiver 2025, couvrant plus de 12 300 kilomètres d’effort d’observation. Les survols ont été réalisés selon la méthode du Distance Sampling à une altitude de 600 pieds, avec un protocole identique à celui des campagnes nationales SAMM. L’échantillonnage a été complété par le système d’acquisition photographique STORMM, embarqué à partir du printemps 2024, permettant de coupler observation visuelle et acquisition digitale.Malgré des contraintes météorologiques, techniques et réglementaires, la couverture des plans d’échantillonnage a été satisfaisante. Plus de 18 300 observations visuelles ont été collectées : 613 observations (941 individus) de mammifères marins ; 12 814 observations d’oiseaux (38 709 individus) ; 412 observations d’autres espèces marines ; ainsi que 3 629 observations de déchets (dont 82 de déchets de pêche), 430 de bouées de pêche et 257 de navires pour les activités humaines.Le marsouin commun et les phoques constituent les mammifères marins les plus observés, avec des densités maximales en hiver. Chez les oiseaux, les alcidés, les laridés et le fou de Bassan montrent les taux de rencontre les plus élevés, avec une forte saisonnalité observée pour les alcidés en hiver.L’apport du dispositif STORMM a permis d’affiner les identifications, de corriger des erreurs taxonomiques et de préciser les effectifs, en particulier pour les phoques, mouettes, sternes et goélands. L’analyse digitale a amélioré la précision taxonomique de l’échantillon d’observations traité.Ces résultats renforcent les connaissances disponibles pour l’évaluation de l’état de conservation des espèces et l’identification de zones d’importance écologique dans la Manche orientale. Les données collectées sont essentielles pour affiner les stratégies de suivi et d’évaluation de l’état de conservation des espèces marines de la région. La première session a notamment permis d’étendre vers le Sud une proposition de zone importante pour les mammifères marins (IMMA). Par ailleurs, la troisième session, réalisée conjointement avec la couverture hivernale du projet SCANS IV (Small Cetaceans in the European Atlantic and North Sea), a permis d’élargir la zone de prospection de cette campagne à grande échelle. Ces efforts soutiennent les objectifs de conservation et de gestion écologique du Parc, assurant une meilleure connaissance de la biodiversité marine locale
Antoine de Conflans : nouvelles considérations sur la carrière et l'oeuvre d'un marin français du début du XVIe siècle
No full textInternational audienc
Sensing danger: Energetic and hydric costs of chemoreception in a lizard
No full textInternational audienceAbstract Understanding the benefits and costs of chemoreception and predator avoidance is crucial for unravelling the ecological adaptations of potential prey organisms. In squamate reptiles, tongue flicking is a specialized behaviour used to collect chemical cues from the environment for foraging and predator detection. We hypothesized that the behavioural response to predator scents, and notably chemosensory investigation, incurs both energetic and hydric costs. We conducted two complementary experiments in a small, ground‐active lizard ( Zootoca vivipara ) to assess the energetic and water‐based constraints associated with predator detection and response. First, under controlled exposure to predator scents in a flow‐through system, lizards increased tongue‐flicking rates and thereby metabolic rate and total evaporative water loss. Second, in a laboratory manipulation, chronically dehydrated lizards showed reduced tongue‐flick rates and impaired predator scent discrimination. These findings highlight a trade‐off between water balance regulation and chemoreception, with potential implications for prey–predator interactions in terrestrial ecosystems under drought risk. Thus, energy and water constraints may mediate indirect effects of climate change on species interactions and population dynamics through alterations in sensory capacities. Read the free Plain Language Summary for this article on the Journal blog
« Voy le portrait au vif de Henri quatrième »
No full textInternational audiencePalabras claves: siglo xvi, guerras civiles religiosas, Enrique IV, pacificación, imágenes políticas, retratos reales, cultura visual, propagandaGéographique : FrancePart of the renewed work on the nature and modalities of the end of the civil wars of religion implemented by King Henry IV and his supporters, the study invites us to consider the role of royal imagery in the vast enterprise waged against the zealous Catholics of the Holy Union. In contrast to the image of his predecessor’s weakened and vulnerable royalty and the ligueur visual imagery of a contested and represented monarchy, the image of royalty full and embodied was constructed around Henry IV. The article proposes to measure, in this persuasive economy, the role played by a group of singular images that we propose to call ‘talking portraits’ and whose effectiveness would come from the king directly appealing to the viewer. It is then suggested, by inviting the enrichment of this first corpus of portraits, a renewed understanding of the royal authority of Henry V, which would then be constructed less from the reflective and contractual dimensions of conditioned, even monarchomachic obedience, than from an obvious power of subjugation.Inscrita en la renovación de los trabajos sobre la naturaleza y las modalidades del fin de las guerras civiles de religión llevadas a cabo por el rey Enrique IV y sus partidarios, el estudio invita a considerar, en la amplia empresa llevada a cabo contra los católicos celosos de la Santa Unión, el papel desempeñado por las imágenes reales. En contra de la imagen de la realeza debilitada y vulnerable de su predecesor, así como de la imaginación visual de la Liga de una monarquía disputada y representada, se construye en torno a Enrique IV la imagen de una realeza plena y encarnada. El artículo propone medir en esta economía persuasiva el papel desempeñado por un grupo de imágenes singulares que se propone llamar «retratos parlantes» y cuya eficacia procedería de una interpelación directa del rey al espectador. Se sugiere entonces, invitando a enriquecer este primer corpus de retratos, una comprensión renovada de la autoridad real de Enrique IV, que se construiría menos a partir de las dimensiones reflexivas y contractuales de un obediencia condicionada, incluso monárquica, que a partir de una evidente potencia de sujeción.Inscrite dans le renouvellement des travaux sur la nature et les modalités de la fin des guerres civiles de religion mise en œuvre par le roi Henri IV et ses partisans, l’étude invite à considérer, dans la vaste entreprise menée contre les catholiques zélés de la Sainte‑Union, la part prise par l’imagerie royale. À rebours, en effet, de l’image de la royauté affaiblie et vulnérable de son prédécesseur comme de l’imaginaire visuel ligueur d’une monarchie disputée et représentée, il se construit autour d’Henri IV l’image d’une royauté pleine et incarnée. L’article propose de mesurer dans cette économie persuasive le rôle joué par un groupe d’images singulières que l’on propose d’appeler des « portraits parlants » et dont l’efficacité procéderait d’une interpellation directe du regardeur par le roi. Il est alors suggéré, en invitant à l’enrichissement de ce premier corpus de portraits, une compréhension renouvelée de l’autorité royale d’Henri IV qui se construirait dès lors moins depuis les dimensions réfléchies et contractuelles d’une obéissance conditionnée, voire monarchomaque, qu’à partir d’une puissance évidente d’assujettissement
