RepOD Repository for Open Data
Not a member yet
3261 research outputs found
Sort by
Coagulase-negative staphylococci determined as a blood culture contamination have a high virulence characteristic including transfer of antibiotic resistance determinants to Staphylococcus aureus and Escherichia coli
This study aimed to evaluate the virulence of 36 clinical isolates estimated as blood culture contaminants (BCC). MALDI-TOF MS classified all isolates as coagulase-negative staphylococci (CoNS) with the highest percentage of S. epidermidis (77.78%). All tested strains formed biofilm with greater ability at room temperature than 37°C. CoNS were sensitive to vancomycin (0% of resistance) and relatively low resistant to linezolid and rifampicin (8.33 and 22.22 % of resistance). The highest resistance was observed for penicillin (94.44%). Moreover, we observed the transfer of antibiotic resistance genes from the tested CoNS to S. aureus and even to E. coli, although with lower efficiency. CoNS in planktonic form were completely combated by antiseptics after 10- and 60-second exposition, and activity against biofilms was time-dependent. Complete elimination of biofilms was observed after a 180-second exposure to Kodan and CITROclorex, and this exposure to Rivanol and Octenidyne showed still viable cells (>0.9 log CFU/mL). Our findings showed that careful selection of antiseptics and extension the exposure time before blood collection can reduce the occurrence of blood culture contamination. However, our most important finding is the indication that CoNS naturally occurring on human skin and mucous membranes exhibit antibiotic resistance, and what is more – determinants of antibiotic resistance are transferred to both closely related Gram-positive bacteria and phylogenetically distant Gram-negative bacteria. Thus, our findings shed new light on CoNS – they indicate the necessity of their control due to the effective transfer of mobile genetic elements harbored antibiotic resistance genes, which may contribute to the spread of resistance genes and deepening the antibiotic crisis.</p
Casein-Assisted Biomineralization of Calcium Carbonate Microspheres For Enhanced Surface and Adsorption Properties
The deposited data include results obtained in studies on the formation of CaCO₃-MS in presence and absence of protein casein. Their characterization by FTIR, DRIFT, SEM, TEM, XRD, BET analysis and H2O adsorption and desorption analysis.Abbreviations: Casein-calcium carbonate- Microsphere (Casein-CaCO₃-MS), Calcium carbonate- Microsphere (CaCO₃-MS), Scanning electron microscopy (SEM), Transmission Electron microscopy (TEM), Fourier Transform Infrared (FTIR) spectroscopy, X-ray diffraction (XRD), Brunauer-Emmett-Teller (BET) analysis, Diffuse reflectance infrared Fourier transform spectroscopy (DRIFT)</p
Hydrogen Controls the Heavy Atom Roaming in Transient Negative Ion
Theoretical and experimental raw data needed to reproduce the calculations and figures in the paper. All inputs for potential energy surfaces, donut plots, molecular dynamics are added.</p
Zbiór danych wykorzystanych do opracowania artykułu: The Gdańsk Builder Bartel Ranisch (1648–1710?): New Research on His Biography and Architectural Activity
ENThe deposited dataset provides supplementary material for the article and includes visual and documentary sources related to the biography and architectural activity of the Gdańsk builder Bartel Ranisch (1648–1710?). The dataset encompasses photographs of buildings attributed to Ranisch, details of architectural elements, and selected scans of archival documents referenced in the text.The article presents newly uncovered biographical data and a revised list of works attributed to Ranisch, active in the late 17th and early 18th century in Gdańsk. The visual material supports the analysis of his architectural style, the identification of his documented commissions, and contextual comparisons within the Northern European architectural milieu. The inclusion of historical documents serves to illustrate the evidentiary basis for new attributions and biographical insights. The dataset functions both as a visual supplement to the argumentation and as documentation of the material evidence underpinning the study.PLZdeponowany zbiór danych stanowi materiał uzupełniający do artykułu i obejmuje źródła wizualne oraz dokumentacyjne związane z biografią i działalnością architektoniczną gdańskiego budowniczego Bartla Ranischa (1648–1710?). Zbiór zawiera fotografie budowli przypisywanych Ranischowi, detale architektoniczne oraz wybrane skany dokumentów archiwalnych przywołanych w tekście.Artykuł przedstawia nowe ustalenia biograficzne oraz zrewidowany katalog realizacji Ranischa, działającego w Gdańsku pod koniec XVII i na początku XVIII wieku. Materiał wizualny wspiera analizę jego stylu architektonicznego, identyfikację udokumentowanych zleceń oraz umożliwia porównania kontekstowe w ramach północnoeuropejskiej architektury tego okresu. Zestawienie dokumentów historycznych ilustruje źródłowe podstawy nowych atrybucji oraz informacji biograficznych. Zbiór pełni funkcję zarówno ilustracyjną wobec argumentacji zawartej w artykule, jak i dokumentacyjną dla materialnych podstaw badań.</p
Ex vivo permeation of agomelatine from DLP 3D printed suspension gel-coated pyramid microneedle systems
Raw data from ex vivo permeation test (IVPT) of agomelatine (AGM) from microneedle systems.Microneedle system specifications:3D printing method: DLPmicroneedle shape: pyramidcoating-gel type: suspension gelDrug permeation studies:The permeation of agomelatine (AGM) was evaluated using Franz Diffusion Cells (Teledyne Hanson 376 Research, USA) with full-thickness human skin as the diffusion membrane. The skin was thawed in PBS at room temperature, mounted on the diffusion cells, and conditioned for 30 min. After this time the microneedle system was placed onto the chamber opening (1 cm²) with full-thickness human skin as the diffusion membrane. The study lasted for 7 days and sodium azide 0.02% w/v was added to the acceptor fluid as an antimicrobial agent. At specific time points, 0.3 mL samples were taken and analyzed using High-Performance Liquid Chromatography (HPLC). The amount of the acceptor medium taken for the analysis was immediately replaced with the fresh portion of the fluid. Six replications were performed for each formulation. After the study, the epidermis and dermis from each skin sample were separated manually using scissors and forceps and inserted in tubes with 3 mm zirconium beads (Benchmark Scientific Inc., Sayreville, NJ, USA). Next, 1 mL of water and ethanol solution (50:50 v/v) was added to each tube, and the samples were homogenized for 9 min using a BeadBug Microtube Homogenizer (Benchmark Scientific Inc., USA). Then, the samples were centrifuged for 5 min at 10,000 rpm, and the supernatant was analyzed using HPLC to examine the amount of the drug in the tissue.Quantification of AGM:The amount of AGM permeated was analyzed using High-Performance Liquid Chromatography (HPLC) (Shimadzu Nexera-I LC-2040C, Japan) with LabSolution Lite software.Chromatographic Conditions:Column: Reversed-phase C18 (HyperClone BDS C18, 5 µm, 4.6 × 250 mm, Phenomenex, Torrance, CA, USA)Column Temperature: 30.0 ± 0.2°CMobile Phase: Acetonitrile and 0.05 M potassium dihydrogen phosphate solution (pH = 2.9, adjusted with 85% orthophosphoric acid) in a 35:65 ratioMode: IsocraticFlow Rate: 1.0 mL/minDetection Wavelength: 230 nmThe set contains data in LCD/ LCB format, created using the LabSolutions software (HPLC, Nexera LC 2040C). Data file (.lcd) contains all analysis results and acquisition information from the following files. Data in .txt format can be read without the need for LabSolutions software.</p
Dokumenty przyjęte przez Europejską Radę Ochrony Danych oraz Europejskiego Inspektora Ochrony Danych, które odnoszą się do zjawiska utowarowienia danych osobowych
Zbiór danych obejmuje komplet dokumentów wydanych przez Europejską Radę Ochrony Danych (EROD) oraz Europejskiego Inspektora Ochrony Danych (EIOD) - zarówno wspólnie, jak i autonomicznie - które w swojej treści odnoszą się do zjawiska utowarowienia danych osobowych, rozumianego jako traktowanie danych osobowych w kategoriach towaru lub zasobu o wartości rynkowej.Dokumenty zostały pozyskane poprzez systematyczne wyszukiwanie w rejestrach dokumentów przyjętych przez EROD i EIOD, udostępnionych na oficjalnych stronach internetowych obu instytucji. Zbiór obejmuje zarówno treść każdego dokumentu, jak i szczegółowe metadane (nazwa dokumentu, instytucja/e wydająca/e, data wydania, zacytowane fragmenty odnoszące się do zjawiska utowarowienia danych osobowych, źródło internetowe oraz komentarz badawczy dotyczący znaczenia danego stanowiska dla ochrony praw podstawowych, w szczególności prawa do prywatności i ochrony danych osobowych)</p
Monk Fruit (Siraitia grosvenorii) as a Multifunctional Sweetener: Technological Applications, Health Benefits, and Future Perspectives in Sustainable Food Innovation
This systematic review comprehensively evaluates the technological applications, health benefits, and consumer acceptance of monk fruit extract (MFE) as a natural, high-intensity sweetener. MFE, primarily composed of mogrosides, exhibits a sweetness intensity 250–300 times greater than sucrose while providing additional functional properties, including antioxidant, anti-inflammatory, and metabolic health-promoting effects. This review was prepared due to the PRISMA guidelines. This article analyses literature published over the past five years on the impact of MFE on food formulations, physicochemical stability and sensory attributes. The results highlight the ability of MFEs to improve product quality while aligning with consumer preferences for clean-label and health-promoting food alternatives. However, challenges related to formulation stability, flavour modifications and regulatory inconsistencies in global markets remain significant barriers to widespread adoption. Future research is needed to optimise MFE stability during processing, mitigate sensory limitations and explore sustainable cultivation practices for commercial viability. These insights contribute to advancing MFE as a key ingredient in next-generation food innovations, addressing technological and nutritional imperatives within the food science sector.</p
Two-phase flow patterns in two channel geometries of heat and mass exchanger (CFD simulation results)
The results were generated using a CFD model of a channel fragment with complex geometry designed for application in heat and mass exchangers in thermally integrated distillation (HIDiC) applications. They were developed within the NCN OPUS research project entitled "Experimental studies and numerical simulations of thermal-flow phenomena in countercurrent flow in parallel channels with simultaneous diaphragmatic heat exchange and thermal separation of substances". They present two sets of data in the flow space of the channel, differing in used channel geometry.Wyniki zostały wygenerowane z użyciem modelu CFD fragmentu kanału o złożonej geometrii projektowanego pod kątem aplikacji w wymiennikach ciepła i masy w zastosowaniach destylacji zintegrowanej cieplnie (HIDiC). Opracowane zostały w ramach projektu badawczego NCN OPUS pt. „Badania eksperymentalne i symulacje numeryczne zjawisk cieplno-przepływowych w przeciwprądowym przepływie w kanałach równoległych z równoczesną przeponową wymianą ciepła i rozdziałem termicznym substancji”. Przedstawiają dwa zestawy danych w przestrzeni przepływowej kanału różniące się geometrią kanału.</p
Singlet Fission in a New Series of Systematically Designed Through-space Coupled Tetracene Oligomers
Supplementary Information file consists of data that support the findings of this study, including synthetic protocols, analytical data, spectroscopic data, and computational data. </p
Electrochemical signals of dsDNA after its oxidative damage in the presence of allicin
[ENG:]The dataset contains voltammograms recorded using square-wave voltammetry technique (SWV) for synthetic double-stranded DNA with sequence 5’GTCAACTTCCGTACCGAGC, subjected to oxidation in the presence of different concentrations of allicin, and then electrostatically deposited on the surface of the working electrode. Detailed information on molecular ratios can be found in the "ReadMe" file.The data were recorded using a three-electrode system consisting of a working electrode – a carbon paste electrode, an AgCl reference electrode and a measuring electrode Pt. DNA was deposited on the outer layer of the working electrode using the +0.5V potential.The files contain recorded signals in the form of current [μA] as a function of the gradually changing potential [V], corrected against the base signal – the background of the phosphate buffer used for research.The study of aliicin protective effect on DNA against oxidative stress was conducted using slightly modified own mthod descrivbed in publication: Szczepaniak, O., Ligaj, M., Stuper-Szablewska, K., Joanna Kobus-Cisowska , J. Genoprotective effect of cornelian cherry (Cornus mas L.) phytochemicals, electrochemical and ab initio interaction study. Biomedicine & Pharmacotherapy. Volume 152, August 2022, 113216. 10.1016/j.biopha.2022.113216[PL:]Zbiór danych zawiera woltamperogramy zarejestrowane techniką woltamperometrii fali prostokątnej (SWV) dla syntetycznego, dwuniciowego oligonukleotydu o sekwencji 5’GTCAACTTCCGTACCGAGC poddanego uszkodzeniu oksydacyjnemu w obecności allicyny o różnych stężeniach, a następnie osadzonego elektrostatycznie na powierzchni elektrody pracującej za pasty węglowej. Szczegółowe informacje na temat sposobów, kolejności oddziaływań oraz stężeń związków można znaleźć w pliku „ReadMe”.Dane zarejestrowano przy pomocy układu trójelektrodowego składającego się z elektrody pracującej – elektrody z pasty węglowej, elektrody referencyjnej AgCl oraz elektrody pomiarowej Pt. Dwuniciowe DNA osadzano na powierzchni elektrody pracującej przy pomocy potencjału +0,5V.Pliki zawierają zarejestrowane sygnały w postaci natężenia prądu [μA] jako funkcję stopniowo zmieniającego się potencjału [V], skorygowane o sygnał bazowy - tło buforu fosforanowego używanego do badań.Badanie oceny wpływu ochronnego allicyny na DNA przed stresem oksydacyjnym zostało wykonane według nieznacznie zmodyfikowanej metodyki własnej opisanej w publikacji: Szczepaniak, O., Ligaj, M., Stuper-Szablewska, K., Joanna Kobus-Cisowska , J. Genoprotective effect of cornelian cherry (Cornus mas L.) phytochemicals, electrochemical and ab initio interaction study. Biomedicine & Pharmacotherapy. Volume 152, August 2022, 113216. 10.1016/j.biopha.2022.113216</p