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Workflow for BBC room netCDF creation and replication - Seperated by years
No full textJupyter notebook of the BBC room data.
This workflow contains all steps to recreate a global netCDF file. The global netCDF file contains all 39 measurements, regardless of year and dates.
IF wanting to use this workflow, PLEASE ENSURE you have dowloaded the "Processed files" from RDG.
All 39 measurements included are organized by themes. You can find:
Office environement: Ambiant values (Temperature, humidity and CO2), Indicators (Presence, ventilation, VOC and heating), Doors and windows (Opened of closed, only starting in 2020)
Specialized office values Relative temperature, humidity and CO2 concentration
Specialized sensors:Thermocouples sensors(TC1-4, temperature), Triosys 1-2 measuring temperature and triosys 1 measuring humidity.
Solar measurements: Adjustable sunshade (south, southeast, east, southwest and west), starting in 2020. Pyranometer energy and irradiance.
Illuminance: North and south.
Energy:
General, heating, kitchen, main and outlets meter.
The obtained netCDF file can be used to analyze the environmental impact on office workers.
The workflow in itself can be used to replicate the corresponding file, but also a good idea on how to create netCDF file if wanting to replicate
Empirical Evidence of a Bet-Hedging Strategy in the Carrot Cyst Nematode Heterodera carotae
No full textPhenotypic data and R-script used in the ms 'Empirical Evidence of a Bet-Hedging Strategy in the Carrot Cyst Nematode Heterodera carotae' by Fournet et al. (2025)
Contributions of scenario and model uncertainty sources to Explore2 hydroclimate projections. The effect of a Regional Warming Level analysis
No full textDans un contexte de changement climatique, la modélisation permet de simuler les évolutions futures du climat et des ressources en eau. La combinaison de plusieurs scénarios d’émissions, modèles climatiques globaux et régionaux et modèles hydrologiques conduit à la création d’ensembles multi-modèles de projections hydroclimatiques. Alors que les projections sont traditionnellement analysées en horizons temporels, de récentes politiques publiques ont adopté une approche basée sur des niveaux de réchauffement global. En France, la TRACC (Trajectoire de Référence pour l’Adaptation au Changement Climatique) définit des cibles de réchauffement global auxquelles la société devra s’adapter au cours du XXIe siècle. Le concept de niveau de réchauffement régional y est introduit, correspondant au réchauffement moyenné à l’échelle de la France. Cette étude évalue l’effet d’une analyse en niveau de réchauffement régional sur les projections hydroclimatiques et sur les incertitudes associées. Le questionnement central de ce travail est: «L’utilisation du niveau de réchauffement régional comme variable explicative des projections hydroclimatiques permet-elle de réduire la plage d’incertitude associée aux projections et, par suite, de communiquer un message plus facile à appréhender par les acteurs ?» L’ensemble de projections hydroclimatiques utilisé dans cette étude provient de la base de données Explore2, qui fournit des projections issues de 36 chaînes climatiques et de 4 modèles hydrologiques pour 1735 stations hydrologiques sur la France métropolitaine. La méthode statistique QUALYPSO est utilisée pour distinguer les tendances à long terme de la variabilité interne du climat, et pour décomposer l’incertitude totale de l’ensemble en incertitudes liées au scénario d’émission et aux modèles. Les analyses sont menées pour un niveau de réchauffement régional de 2°C et pour l’année 2037, sur cinq variables climatiques et trois variables hydrologiques. L’étude met en évidence une réduction générale des incertitudes liées aux modèles dans le cadre de l’analyse par niveau de réchauffement régional. Cet effet est particulièrement marqué en été et pour les températures saisonnières. L’incertitude liée aux scénarios est fortement influencée par l’approche en niveau de réchauffement, avec des différences spatiales contrastées de réduction ou d’augmentation. Les comparaisons réalisées dans cette étude soutiennent l’utilisation du niveau de réchauffement régional comme variable explicative plus pertinente que le temps pour l’analyse des projections hydroclimatiques. Cela est particulièrement vrai pour les variables et saisons fortement liées au réchauffement régional, telles que les températures saisonnières et les précipitations estivales
Microprobe analysis SWIR basaltic glasses
No full textThe file EDUL_EMPA-EH.csv includes a geochemical dataset of basaltic glasses from the Southwest Indian Ridge (cruise EDUL MD-107).
The major element compositions were measured by E. Humler between 1998 and 1999 at the University of Paris 7 using the CAMECA SX50 electron microprobe of the CAMPARIS[1] analytical platform.
Analytical conditions included a 15 kV accelerating voltage, 20 nA beam current, and a 10 μm beam diameter. Counting times were 30 s for Na₂O, TiO₂, and FeOt (where “t” indicates total iron), 60 s for Al₂O₃, SiO₂, CaO, and MgO, 70 s for K₂O, and 100 s for P₂O₅ and MnO.
The analytical sequence utilized simultaneously the four spectrometers equipped with TAP, LIF, and PET crystals, in the order listed bellow:
Analytical Sequence:
TAP: Na₂O, CaO, MnO
TAP: TiO₂, MgO, P₂O₅
LIF: FeO, K₂O
PET: SiO₂, Al₂O₃
For each sample, a minimum of six analytical spots was performed and averaged to obtain representative compositions go the melts. Every 30 to 50 measurements, five points were analyzed on the Lamont in-house natural glass standard JDF-D2 (East Pacific Rise) provided by C.H. Langmuir. Regular analysis of the JDF-D2 throughout each analytical session allowed for monitoring and correcting instrumental drift of the electron microprobe, following the method described by Reynolds and Langmuir (1997).
All analyzed compositions were normalized to the recommended composition of the JDF-D2 standard (Reynolds and Langmuir, 1997):
JDF-D2 Recommended Value ±1σ Precision [2] (wt.%)
SiO₂: 50.80±0.17
TiO₂: 1.92±0.02
MnO: 0.22±0.02
Al₂O₃: 13.71±0.05
FeOt: 12.12±0.13
MgO: 6.59±0.09
CaO: 10.64±0.09
Na₂O: 2.75±0.05
K₂O: 0.20±0.005
P₂O₅: 0.22±0.01
Total: 99.77
[1] http://ecceterra.sorbonne-universite.fr/fr/les_services_aoc/les_plateformes_analytiques2/plateforme_men.html
[2] typical values on 5-6 replicate analyses
Bibliography :
Reynolds J. R., Langmuir C. H. (1997) Petrological systematics of Mid-Atlantic Ridge south of Kane: implications for ocean crust formation. J. Geophys. Res. 102, 14915–14946
Leaves of 7 accessions of pepper infected by GFP-tagged Potato virus Y, from 5dpi to 22 dpi
No full textPhotographs of leaves inoculated with a Green Fluorescent Protein (GFP) tagged Potato virus Y.
Leaves are from 7 accessions of pepper (Capsicum annuum
L.), inoculated by aphid transmission (I), mock inoculated (M) or healthy controls (TS).
Fluorescence progression was tracked through regular photography at 5, 7, 8, 11, 13, 15, 18, 20, and 22 dpi. Images were captured using a Nikon D5300 digital camera set to aperture F8, ISO 2000, and a shutter speed of 1/2 second, with a picture size of 4496 × 3000 pixels. Fluorescence photographs were captured using a photo bench from the manufacturer BLS (Budapest, Hungary), equipped with lamps designed for GFP excitation, with an emission spectrum ranging from 460 to 495 nm. A green filter with a bandwidth between 500 and 515 nm was mounted on the camera lens to minimize background light and selectively capture GFP emission. A low-intensity white light source was added to allow differentiation of healthy tissues from the background. Focusing was performed under intense white light prior to each photograph; this light was then turned off before the image was captured. The fabric background was selected for its high light-absorption properties to reduce reflections and enhance image
clarity
Projections hydrologiques Explore2 du débit pour le modèle SIM2 sous RCP 4.5
No full textDébit journalier simulé par le modèle hydrologique SIM2 pour l'ensemble des projections climatiques Explore2 sous RCP 4.5. Ces fichiers résultent de la concaténation des simulations hydrologiques sous runs historiques (avant 2005) et des projections hydrologiques (post 2005), fichiers NetCDF disponibles au téléchargement sur le portail https://www.drias-eau.fr/commande.
Ce dépôt regroupe un fichier NetCDF par couple GCM/RCM et correction de biais. Retrouvez davantage d'information sur la chaîne de modélisation du climat dans les métadonnées des fichiers NetCDF et le rapport https://doi.org/10.57745/PUR7ML .
La description des modèles hydrologiques utilisés est disponible dans les annexes du rapport https://doi.org/10.57745/S6PQXD. Retrouvez le diagnostic des modèles hydrologiques résumé à l'échelle des régions hydrologiques dans les fiches téléchargeables ici : https://doi.org/10.57745/DMFUXW.
Métadonnées supplémentaires :
Description de l'ensemble des chaînes de modélisations : https://doi.org/10.57745/R6HG5X
Description de l'ensemble des points de simulation : https://doi.org/10.57745/UTKWR5
Liste des simulations des chaînes de projections jugées aberrantes / horsains : https://doi.org/10.57745/YZNENQ
Décomposition des chaînes de caractère formant le nom des fichiers NetCDF, séparées par des "_" :
{1}: Variable : Nom de la variable (avec Adjust si les données sont corrigées)
{2}: Domain : Couverture spatiale des données
{3}: GCM-Inst-Model : Identifiant du GCM forçeur = Institut-Modèle
{4}: Experiment : Identifiant de l’expérience historique ou future via le scénario
{5}: Member : Numéro du membre de l'ensemble
{6}: RCM-Inst-Model : Identifiant du RCM = Institut-Modèle
{7}: Version : Identifiant de l’expérience historique ou future via le scénario
{8}: Bc-Inst-Method-Obs-Period : Identifiant de la méthode de correction de biais statistique =
Institut-Méthode-Réanalyse-Période
{9}: HYDRO-Inst-Model : Identifiant du HYDRO = Institut-Modèle
{10}: TimeFrequency : Pas de temps du jeu de données
{11}: Startyear-Endyear : Couverture temporelle des données sous forme YYYYMMDD-YYYYMMD
Unveiling the role of mir-187 in adult ovarian follicle growth in medaka (Oryzias latipes)
No full textTo investigate the phenotypic alterations in the ovaries of miR-187 knockout (KO) fish, a 3D imaging analysis of wild-type and mutant ovaries was performed at two key developmental stages: before (104 days post-fertilization, dpf) and during (211 dpf) the reproductive period. Ovarian follicle diameters were extracted from the 3D image datasets, enabling the characterization and comparison of follicle size distribution profiles across genotypes and developmental time points
Concentrations of α-dicarbonyl intermediates of the G and G+L model cakes
No full textThe concentrations of glucosone, 1-deoxyozone, 3-deoxyozone, 3,4-dideoxyozone, methylgloxal, and diacetyl at different times during baking of the G and G+L model cakes at 140°C/25 Hz, 140°C/50 Hz, 170°C/25 Hz, 170°C/50 Hz, 200°C/25 Hz and 200°C/50 Hz were determined after sampling, extraction and analysis by UHPLC-MS
Concentrations of furanic compounds of the G and G+L model cakes
No full textThe concentrations of furfural and 5-hydroxymethylfurfural at different times during baking of the G and G+L model cakes at 140°C/25 Hz, 140°C/50 Hz, 170°C/25 Hz, 170°C/50 Hz, 200°C/25 Hz and 200°C/50 Hz were determined after sampling, extraction and analysis by UHPLC-DAD
Data from article entitled "Electroisomerization Blinking of an Azobenzene Derivative Molecule"
No full textData corresponding to the article entitled "Electroisomerization Blinking of an Azobenzene Derivative Molecule" published in Nanotechnology Journal (IOP)
Raw Data for Images of the Figures 2a, 2b, 3a, 3b, 3c et 3d - Format Nanonis /
Images for Figures 2a, 2b, 3a, 3b, 3c et 3d - Format WsXm 5.0 /
Figures 3m-n-o-p, SI-2, SI-7b, SI-8b, SI-8c, SI-8d, SI-8e, SI-8f - Format Origin 2023 /
Raw data for NMR "NMR.topspin.zip" File can be opened with TopSpin 4.0.8 software from Bruker BioSpin Gmb