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MycoMobilome: A community-focused non-redundant database of transposable element consensus sequences for the fungal kingdom
Full text linkTransposable elements (TEs) are found in nearly all eukaryotic genomes. Despite significant advances in the sequencing of genomes, TE resources remain sparse, leading to a lack of traceability, reproducibility, and duplication of effort when annotating TEs. Here, we focus on the fungal kingdom and present MycoMobilome, a non-redundant database of TE consensus sequences systematically curated using a set of 4,309 genomes covering all major clades. The initial database contains 276,641 consensus sequences after filtering to remove putative host genes and low-quality consensus sequences. We provide a consistent naming convention to surface information on the confidence in the classification including potential conflicting ORF functions, along with metadata to enable evaluation of TEs of interest and to determine whether further curation work is required on a case-by-case basis. Finally, we provide guidelines for community contributions, and encourage researchers to deposit new or curated sequences, which will be incorporated into future MycoMobilome releases
Les programmes d’occupation de travaux d’utilité publique au prisme de l’« intégration » et du « travail »
Full text linkLes programmes d’occupation de travaux d’utilité publique analysés dans ce mémoire sont unanimement considérés comme favorisant l’« intégration » des personnes issues de l’asile. Or, les pratiques, les politiques ou encore les discours sur la dite « intégration » ne sont pas anodins. Ils ont des implications importantes sur la façon dont nous concevons le monde, ils véhiculent des idées, des visions et des imaginaires particuliers ancrés dans la logique de l’État-nation (Dahinden 2016). Au contraire de l’idée d’« intégration » qui est systématiquement et volontiers associée à de tels programmes, il est plus difficile pour les acteur·trice·s de s’accorder sur le fait que ces programmes relèveraient ou non de « travail ». Ces programmes sèment le « trouble » sur la catégorie « travail », ils interrogent ses limites, mettent en lumière ses contradictions et ses enjeux (Dujarier 2021).
Dans ce mémoire, je me propose d’analyser les programmes d’occupation de travaux d’utilité publique au prisme de l’« intégration » et du « travail » en me penchant sur les manières dont les acteur·trice·s mobilisent ces catégories. En ce sens, je considère l’« intégration » et le « travail » comme des catégories de pratique qui nourrissent des compréhensions particulières de la réalité sociale et engendrent des pratiques concrètes. Dans cette perspective, la question de recherche qui guide ce mémoire est la suivante : Qu’est-ce-que les notions d’« intégration » et de « travail » mobilisées par les acteur·trice·s pour parler des programmes d’occupation pour personnes issues de l’asile (in)visibilisent et (re)produisent
Animal impérial : conquérir (par) le savoir zoologique dans les ménageries postrévolutionnaires
Full text linkUniNE, FLSH, Institut d'histoire de l'art et muséologie, soutenue le 30.06.2025Cette thèse porte sur la ménagerie de Joséphine de Beauharnais, qu’elle détenait au Château de la Malmaison entre 1800 et 1814, et les relations qu’elle entretenait avec les naturalistes du Muséum national d’histoire naturelle, une institution qui instaura la première ménagerie publique en 1794. Pour avoir accès aux animaux de cette enceinte impériale, cette recherche mobilise leurs portraits, peints sur vélin par les artistes du Muséum. En étudiant la circulation des peintures, ce sont les diverses trajectoires de ces animaux qui sont avant tout retracées, en mettant en lumière les réseaux dans lesquels ces êtres non-humains étaient inscrits. L’histoire de la ménagerie de Joséphine révèle comment les animaux des années postrévolutionnaires étaient imbriqués tant dans des considérations scientifiques que dans des entreprises impériales et coloniales, qui se répondaient mutuellement. De fait, cette recherche montre comment la production du savoir zoologique devint un instrument de conquête impérialiste à l’orée du XIXème siècle.This thesis focuses on the menagerie of Joséphine de Beauharnais, established at the Château de Malmaison between 1800 and 1814, and her connections with the naturalists of the National Museum of Natural History, an institution that created the first public menagerie in 1794. To have access to the animals belonging to this imperial space, the study examines their portraits, painted on vellum by artists of the Muséum. By tracing the circulation of these paintings, it is above all the trajectories of the animals themselves that come to light, revealing the networks in which these non-human beings were embedded. The history of Joséphine’s menagerie shows how animals in the post-revolutionary period were entangled simultaneously in scientific inquiries and in imperial and colonial enterprises, which mutually shaped one another. Ultimately, the research demonstrates that the production of zoological knowledge emerged as an instrument of imperial conquest in the early nineteenth century
Prosecuting Strategic Corruption: Impact on the Integrity of Criminal Justice and Potential Risks of Non-Trial Resolutions in Sub-Saharan African States
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Uneven Pathways to Local Power: The Political Incorporation of Immigrants’ Descendants
No full textResearch focusing on the political incorporation of immigrants’ descendants is rather scarce, in contrast to the high level of scholarly attention paid to the case of foreign-born immigrants. This exploratory study addresses this gap by adopting a sociological and neo-institutionalist approach to investigate the trajectories leading to political involvement of children of immigrants elected to local parliaments across a selection of Swiss cantons. The analysis of the factors shaping their mobilization in relation to the features of local policies for immigrants’ integration and cantonal conceptions of citizenship sheds light on the variability of their political incorporation. The article thus makes a twofold contribution to the existing literature. First, it highlights the distinctive role played by local schools in the political socialization of immigrants’ descendants, compared to that of their Swiss-origin counterparts. Second, it shows the decisive impact of cantonal institutional and discursive contexts in shaping the categories that are relevant for political action, influencing collective identities, claim-making, and political mobilization.tru
The Quarry Outside My Window: Geographies of Protest in Sochi 2014
Full text linkEvery four years, the Winter Olympics become a focal point for activism and resistance. But in the modern era, mere bids to host the Games have sparked fierce opposition from groups motivated by local or global concerns. Russell Field edits a collection that charts the evolution of protest around the Winter Games and illuminates the issues at the heart of anti-Olympic activism. The essays collectively explore the shifting dynamics and power relations between the civic coalitions that pursue the Winter Olympics and the social movements that oppose their efforts. The contributors look at specific Games impacted by dissent and probe the issues that swirled around failed and withdrawn bids. In addition, contributions on the contemporary Olympics describe current or future bids while delving into the campaigns demanding host nations pay attention to economic, social, humanitarian, and environmental concerns. A first-of-its-kind collection, Winters of Discontent profiles the wide range of activists and social movements that have organized against the Winter Olympics
L'esclavage : les limites d'une définition juridique sous le prisme d'une approche littéraire, historique et sociologique
Full text linkCette recherche vise à étudier la notion de l’esclavage depuis l’Antiquité à nos jours en confrontant les approches à la fois sociologique et littéraire à l’approche juridique. Le présent travail se veut l’interprète entre d’un côté la souffrance de l’esclavage sublimée par la littérature et de l’autre côté la rigueur d’un droit, prétentieux parfois, nécessaire pourtant. Cette étude se divise en deux temps. Dans une première grande partie, il s’agit de conceptualiser la thématique de l’esclavage en littérature en trois points : tout d’abord, une définition de l’esclavage, puis une brève explication du mouvement Droit & Littérature dans lequel s’inscrivent nos développements et finalement la présentation de notre méthodologie de recherche. Puis, dans un deuxième temps, nous nous confrontons à l’analyse de quatre textes à savoir, Le "Pseulodus" de PLAUTE, puis "L’esclavage des noirs ou l’heureux naufrage" d’Olympe DE GOUGES, ensuite le "Cahier d’un retour au pays natal" d’Aimé CESAIRE avant de terminer avec quelques poésies issues du recueil "La machine est ton seigneur et ton maître" de Xu LIZHI. Ce polyptyque littéraire nous permet d’illustrer la perception de l’esclavage et les limites de ses définitions de hier à aujourd’hui en mettant en exergue les aspects juridiques de son évolution historique
Quality & risk management of ethical AI use in human health research
No full textPolicy BriefThe development of Artificial Intelligence/Machine Learning (AI/ML) has acceler-ated significantly, attracting public attention and investment. While AI promises to revolution-ize healthcare and health research with more accurate diagnostics, personalized treatments, and streamlined processes, it also poses risks to fundamental rights and raises concerns about trustworthiness. Regulatory bodies like the EU are responding with frameworks such as the "AI Act," which establishes different risk levels for AI systems, categorizing medical devices using AI as high-risk but exempting scientific research. Despite increasing use of AI in health re-search, as evidenced by rising approvals for AI-related projects, there is a lack of specific guid-ance on how health research stakeholders should practically assess and monitor AI systems within their ethical obligations. This absence of clear guidance can lead to quality issues in health-AI research.
In this policy brief we explore the complexity of quality and risk assessment of AI system to validate their ethical use. We also propose recommendations for action in order to manage this complexity throughout the research project lifecycle and beyond
