Repositorio Institucional de Acceso Abierto (RIAA) (Universidad Autónoma del Estado de Morelos)
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Adaptaciones fisiológicas y moleculares de aspergillus sydowii en condiciones de halofilia
No full textRESUMEN
Los halófilos son un grupo de microorganismos que prosperan en ambientes
extremadamente salinos y han sido estudiados por su fisiología distintiva y sus
posibles aplicaciones biotecnológicas. Los mecanismos de adaptación celular y
molecular de hongos a la salinidad se han descrito comúnmente en cepas
halotolerantes. Estos estudios se han realizado en condiciones donde las células
están sujetas a estrés, ya sea hipo o hiperosmótico, que puede ser un factor de
confusión al describir los mecanismos fisiológicos relacionados con la salinidad. En
este trabajo hemos estudiado la expresión génica, los cambios fisiológicos y
moleculares en Aspergillus sydowii, una especie halófila, cuando crece en tres
condiciones de salinidad diferentes (Sin NaCl, o con 0.5 M y 2.0 M NaCl). En este
hongo las modificaciones fisiológicas importantes ocurren bajo alta salinidad (NaCl
2.0 M) y no cuando se cultiva en condiciones óptimas (NaCl 0.5 M a 1.0 M), lo que
sugiere que la mayoría de los mecanismos descritos para el crecimiento halófilo son
una consecuencia de la respuesta al estrés salino y no una adaptación a las
condiciones salinas. En esta cepa las modificaciones de la pared celular ocurrieron
exclusivamente en salinidad extrema, con un aumento del grosor de la pared celular
y la aparición de estructura lamelar, lo cual implicó un aumento del contenido de
quitina y un contenido menor de betaglucanos. El modelo de pared celular de A.
sydowii difiere ampliamente del de A. fumigatus, lo cual muestra una divergencia
fisiológica dentro del género que puede ser reflejo de adaptaciones ecológicas.
Además, tres genes de hidrofobina se expresaron diferencialmente bajo estrés hipo
o hiperosmótico, pero no cuando el hongo creció de manera óptima. La
caracterización biofísica de estas hidrofobinas no mostró un efecto de la salinidad
sobre la actividad superficial de estas proteínas. En cuanto a los solutos
compatibles, el glicerol es el principal compuesto acumulado en condiciones de
estrés salino, el arabitol y el eritritol se producen en condiciones óptimas, mientras
que la trehalosa y el manitol se acumulan en ausencia de sal. En este trabajo
llegamos a la conclusión de que la mayoría de los mecanismos de adaptación
descritos en los hongos son consecuencia del estrés salino y podrían no ocurrir bajo
las salinidades óptimas toleradas por los halófilos. Nuestros resultados destacan la
influencia del estrés en la remodelación de la respuesta de los extremófilos a los
desafíos ambientales. Dado que la investigación líder en adaptaciones moleculares
de estos microorganismos se ha llevado a cabo en entornos en los que las células
están sometidas a estrés, nuestros resultados destacan una preocupación particular
por la universalidad de tales mecanismos y subrayan una deficiencia metodológica
que está muy extendida en el campo.ABSTRACT
Halophiles are a group of microorganisms that thrive in extremely saline
environments and have been widely studied for their unique physiology and their
potential biotechnological applications. Mechanisms of cellular and molecular
adaptation of fungi to salinity have been commonly drawn from halotolerant strains
and few studies in basidiomycete fungi. These studies have been conducted in
settings where cells are subjected to stress, either hypo or hyperosmotic, which can
be a confounding factor in describing physiological mechanisms related to salinity.
We have studied gene expression, physiological and molecular changes in A.
sydowii, a halophilic species, when growing in three different salinity conditions (No
NaCl, 0.5 M, and 2.0 M NaCl). In this fungus major physiological modifications occur
under high salinity (2.0 M NaCl) and not when cultured under optimal conditions (0.5
M to 1.0M NaCl), suggesting that most of the mechanisms described for halophilic
growth are a consequence of saline stress response and not an adaptation to saline
conditions. Cell wall modifications occur exclusively at extreme salinity, with an
increase in cell wall thickness and lamellar structure, which involve an increase in
chitin content and a reduced content of beta-glucans. The model of cell wall of A.
sydowii differs widely from A. fumigatus, also showing a physiological divergence
within the genus which may reflect ecological adaptations. Additionally, three
hydrophobin genes were differentially expressed under hypo- or hyperosmotic
stress, but not when the fungus grows optimally. The biophysical characterization of
these hydrophobins shows no effect of salinity on the surface activity of these
proteins. Regarding compatible solutes, glycerol is the main compound accumulated
in salt stress conditions, arabitol and erythritol are produced under optimal
conditions, whereas trehalose and mannitol are accumulated in the absence of salt.
In this work we concluded that most adaptation mechanisms described in fungi are
a consequence of saline stress and might not occur under the optimal salinities
tolerated by halophiles. Our results highlight the influence of stress in reshaping the
response of extremophiles to environmental challenges. Given that the leading
research in molecular adaptations of these microorganisms has been conducted in
settings where cells are subjected to stress, our results highlight a particular concern
about the universality of such mechanisms and underline a methodological
shortcoming that is widely spread within the field
Diagnóstico del modelo de gestión administrativa para mejorar la productividad en un organismo de la administración pública federal en México
No full textEl presente documento no cuenta con resume
Aislamiento e identificación de microorganismos marinos con capacidad quitinolítica y caracterización de quitinasas nativas
No full textLos mares y océanos cubren mas del 70% de la superficie terrestre y en ellos
podemos encontrar una gran biodiversidad. En los ecosistemas marinos actuales,
tras miles de millones de años de evolución, microorganismos como bacterias,
arqueas, virus, hongos y protistas (incluidas las microalgas) dominan la biomasa
viva. Los microorganismos marinos producen la materia orgánica y el oxígeno
necesarios para sustentar la vida y facilitar el almacenamiento, el transporte y la
transformación de elementos biológicos clave. Por lo tanto, los microorganismos
son la base de la vida y tienen una importancia crítica para la habitabilidad y la
sostenibilidad de nuestro planeta (Glöckner et al., 2012).
Uno de los compuestos más abundantes en el océano es la quitina, el cual es un
polímero constituido por residuos de N-acetil-D-glucosamina (Glc-NAc) unidos por
enlaces ß (1-4), siendo el segundo biopolímero más abundante de la tierra, solo
después de la celulosa (Mohamed et al., 2012). En el ambiente marino, este
polímero se encuentra formando parte del exoesqueleto de crustáceos y otros
invertebrados (Alvarado y cols., 2001). Existe una gran cantidad de organismos
que han desarrollado la capacidad de producir enzimas (quitinasas) con las cuales
se puede degradar la quitina (Nava, 2009). Su producción es realizada por
diferentes microorganismos, en particular, por bacterias marinas. A pesar de que
estas enzimas han sido ampliamente estudiadas, en los últimos años las
investigaciones se centran en las procedentes de los microorganismos marinos, ya
que pueden presentar propiedades ventajosas y únicas en el campo de la
biotecnología (Sieira, 2013). Estas enzimas pueden generar compuestos
generados por la hidrólisis de quitina como pueden ser el quitosán, los
quitooligosacáridos, y la N-acetilglucosamina, los cuales tienen una amplia gama
de usos y aplicaciones biotecnológicos debido a sus características como
biodegradabilidad, biocompatibilidad, baja o nula toxicidad, ambientalmente
amigables (Mohamed et al., 2012).
Debido a que se ha demostrado que los microorganismos marinos pueden ser
muy eficientes en la degradación de quitina, en este proyecto de investigación se
pretende aislar a partir de muestras marinas microorganismos quitinolíticos que
presenten una alta actividad en la degradación de quitina
Análisis de los casos de éxito en gestión integral de los residuos sólidos urbanos en México
No full textLa cantidad de residuos sólidos urbanos generados cada año se incrementa en países en vías de
desarrollo, debido a que se continúa utilizando sistemas básicos de manejo de residuos, enfocados
principalmente en la recolección y el vertido en sitios de disposición final, que no siempre incluyen
una protección ambiental adecuada, o también, se eliminan de manera descontrolada en basureros
abiertos, lo que ha provocado problemas de salud y ambientales. Sin embargo, en algunos municipios
de México se están realizando proyectos de gestión y manejo integral de residuos (DBGIR, 2020), lo
que permitió obtener información para planificar mejoras en este tipo de proyectos. Por lo tanto, en
este trabajo de revisión bibliográfica se identificaron los casos de éxito en la prevención y gestión
integral de los residuos en el país y se analizaron los resultados de los estudios para identificar factores
de éxito que puedan servir como punto de partida para proponer estrategias que repliquen ciertas
acciones de los casos de éxito.
La revisión bibliográfica se realizó en un intervalo de diez años abarcando del 2011 a la 2021, esto, en
función a la escasez de ejemplos en el tema. Para la revisión se usaron diferentes buscadores como
Google académico, Redalyc, Scielo y Dialnet, y palabras clave como, “gestión integral residuos
México”. Se utilizó el programa EndNote para administrar las referencias y los documentos de estas.
Después de la revisión bibliográfica se procedió a realizar un análisis comparativo de los estudios de
caso en México que nos permitió generar una serie de recomendaciones para la implementación de la
gestión integral de los residuos. Se encontraron estrategias adecuadas para ser replicadas en sitios con
características similares, ya sea de tamaño de población, actividades económicas y demás
Propuesta para implementar el servicio profesional de carrera en mandos medios y superiores en el h. ayuntamiento de Temixco, Morelos
No full textEl presente documento no cuenta con resumen
Conducta de polinizadores y su relación con la biología floral en Coryphantha elephantidens Cactaceae
No full textEl presente documento no cuenta con resumen
Homogeneización de la ictiofauna dulceacuícola en cuencas hidrográficas de méxico
Full text linkResumen general
Los patrones naturales de distribución de los peces dulceacuícolas en distintas regiones del
mundo se han modificado a través de procesos de homogeneización y diferenciación
biótica, que son en parte resultado de introducciones de especies no nativas y extirpaciones
de especies nativas. En este trabajo se exploraron los procesos de homogeneización y
diferenciación en cuencas del centro de México. En el primer capítulo se examinaron los
cambios en la composición de especies dulceacuícolas en la cuenca del río Pánuco y entre
las cuatro subcuencas que la integran. A través de la comparación de registros de peces
anteriores a 1980 y hasta 2018, se encontraron diferencias significativas en la composición
de las especies entre el primer (antes de 1980) y el último periodo de estudio (2011-2018),
pero no para períodos intermedios. Ocho grupos de especies independientes fueron claves
para explicar los cambios en la ictiofauna de la cuenca del Pánuco y trece especies (11 no
nativas y dos nativas) fueron responsables del recambio temporal. Estos resultados
sugieren altas tasas de diferenciación a lo largo del tiempo (a través de la pérdida de
especies nativas) después de introducciones generalizadas de especies no nativas.
En el segundo capítulo se presentó un análisis de los cambios en la composición de
peces dulceacuícolas a través del tiempo, y con el cual se cuantificó la homogeneización y
diferenciación ictiológica en tres cuencas de México (Balsas, Lerma-Santiago y Pánuco). Se
compararon las especies presentes entre cuencas, entre subcuencas y entre intervalos de
tiempo y se evaluó la diversidad beta a través de los componentes de recambio y riqueza
de especies. Se encontraron diferencias significativas entre los tres primeros intervalos de
tiempo (antes de 1980, 1981-1990 y 1991-2000) y el último (2010-2019); las cuencas fueron
más homogéneas entre el segundo y tercer intervalo y posteriormente se encontró
diferenciación. Las especies en cada cuenca fueron distintas y la diferenciación se dio por
recambio de especies. Las diferencias entre intervalos de tiempo se dieron por las
diferencias en riqueza y se explicó por la pérdida de especies. Este trabajo permitió conocer
los cambios en las cuencas del centro de México a través del tiempo, generados
principalmente por la pérdida acelerada de especies
Generación de pluripotencialidad a partir de fibroblastos humanos, mediante el uso de un medio de propagación celular
No full textEn la actualidad hay una necesidad creciente de contar con estrategias experimentales que permitan solucionar parcial o completamente afectaciones en la salud humana, que comprometen estirpes celulares completamente diferenciadas. Se conoce que una población celular puede manipularse con
diversas estrategias experimentales de manera tal que, puedan generarse linajes celulares específicos
induciendo a células somáticas hacia un estado de pluripotencialidad y la generación de Células troncales pluripotentes inducidas (CTPi o iPSCs) para que finalmente puedan ser diferenciadas a un
tipo celular en específico. En base a investigaciones previas en nuestro grupo de investigación y siendo de gran relevancia el impacto que tiene el medio epidermal UDMM-EPI como un medio de propagación de cultivo previamente estandarizado en el laboratorio e implicado en la desdiferenciación de queratinocitos y desdiferenciación de fibroblastos; en el presente proyecto se buscó la demostración de este medio como una alternativa para reprogramación celular y generación de pluripotencialidad, enfatizando la importancia de tener un método no invasivo, sin la inserción de genes exógenos y con la estrategia directa de aumentar la proliferación celular. Se comprobó mediante cultivos bidimensionales que el medio UDMM-EPI es un inductor de divisiones celulares en una ventana de tiempo menor que la requerida por el medio mesequimal UDMM-MM (control). Además, se determinó que el Factor de Crecimiento Epidermal (EGF) es el componente sustancial que promueve este aumento en la proliferación celular que resulta en el aumento de divisiones celulares. Para la generación de pluripotencialidad, se partió de un protocolo a partir de la generación de esferoides en un modelo tridimensional de cultivo, siguiendo con la expansión de las células provenientes del estado de agregación (CPA) para ser inducidas a eventos de diferenciación mediante el uso de medios condicionados para la obtención de linajes neurales y pancreáticos. Resultando en cambios morfológicos de similitud neuronal en el caso del empleo del Medio de Inducción neural (MIN) por un probable evento de transdiferenciación. Finalmente se demostró que el medio UDMM-EPI indujo eventos de plasticidad celular y una generación parcial de pluripotencialidad
Estructura jerárquica y cuidado parental del pez nativo Cichlasoma istlanum frente a cíclidos no nativos de la cuenca del Balsas
No full textEl comportamiento agresivo es utilizado por los animales para obtener recursos como territorio y/o pareja sexual. Los animales compiten por estos recursos y generalmente los más agresivos obtienen los recursos en disputa. Un animal es dominante cuando realiza mayor número de conductas agresivas y obtiene o defiende un recurso. Los peces cíclidos defienden los recursos agresivamente y realizan conductas de protección parental. El cuidado parental forma parte de la reproducción en estos peces y es la estrategia que utilizan para aumentar su éxito reproductivo. La presencia de nuevos competidores pueden modificar la jerarquía de dominancia, el cuidado parental y la reproducción de los cíclidos. Esta modificación puede afectar la supervivencia y el éxito reproductivo de las especies. La mojarra criolla es el único pez cíclido nativo de la cuenca del río Balsas en México. Cuatro cíclidos no nativos se introdujeron y se establecieron en cuenca: la tilapia, el pez cíclido convicto, el pez falso boca de fuego y el terror verde. Nosotros evaluamos la jerarquía de dominancia de los cinco cíclidos, cuantificamos el número de nidos y las conductas agresivas en el cuidado parental de la mojarra criolla y los cíclidos no nativos, y evaluamos el efecto de la presencia del cíclido convicto en el éxito reproductivo de la mojarra criolla
Solución del problema de la mochila 0-1 aplicando un método basado en búsqueda local iterada en la arquitectura obtenida por el cubo
No full textEn este trabajo se aborda el Problema de la Mochila 0-1 (KP 0-1). Es un problema de optimización combinatoria, clasificado como un problema NP-Duro. El problema se compone de un conjunto de objetos, cada uno con un peso y un beneficio, el propósito es elegir los objetos que sumen el mayor beneficio sin exceder la capacidad de carga de la mochila.
Para este trabajo se utilizan instancias de la literatura clásica y las 7 clases de instancias propuestas por Pisinger (Martello et al., 2000).
Se propone un nuevo enfoque para resolver el problema del peso en la mochila 0-1; normalmente para resolver el problema del peso en la mochila 0-1 existen procedimientos que se basan en una búsqueda en el espacio de soluciones factibles de todo el dominio sin conocer su estructura, con tiempos elevados de ejecución, consumiendo demasiados recursos y haciéndolo incomputable en instancias de dimensiones grandes. Con el enfoque propuesto es posible conocer del espacio de soluciones, el cual está dado por el cubo. Este enfoque consiste en utilizar la estructura de un cubo (lattice), que se genera a partir de la unión del conjunto potencia de los objetos de las instancias. La estructura es el cubo de Vladimir Khachaturov basado en un diagrama de Hasse (Khachaturov & Khachaturov, 2007).
Para determinar la solución de las instancias, se emplea un método basado en un algoritmo de Búsqueda Local Iterada (ILS) directamente en la estructura, lo que el método hace es buscar en los vértices de la estructura (subconjuntos generados a partir del conjunto potencia) analizando su vecindad evalúa que objeto tiene mayor beneficio, conforme realiza la búsqueda se construye la solucion. La búsqueda se realiza hacia arriba, ya que lo que se busca es maximizar la función objetivo.
Para evaluar el desempeño del algoritmo ILS, se realizaron pruebas comparando los resultados de algoritmo Branch and Bound en diferentes instancias; 23 instancias de la literatura, publicadas en Zavala-Díaz et al. 2019, además de 18 instancias de la clase No correlacionadas, 18 instancias de la clase Débilmente correlacionadas, 18 instancias de la clase Fuertemente correlacionadas, publicadas en Zavala-Díaz et al. 2021. Se determinaron soluciones factibles para todas las instancias de prueba, con gran dimensión de hasta 20,000 objetos