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eDNA surveys substantially expand known geographic and ecological niche boundaries of marine fishes
No full textInternational audienceAssessing species geographic distributions is critical to approximate their ecological niches, understand how global change may reshape their occurrence patterns, and predict their extinction risks. Yet, species records are over-aggregated across taxonomic, geographic, environmental, and anthropogenic dimensions. The undersampling of remote locations biases the quantification of species geographic distributions and ecological niche for most species. Here, we used nearly one thousand environmental DNA (eDNA) samples across the world's oceans, including polar regions and tropical remote islands, to determine the extent to which the geographic and ecological niche ranges of marine fishes are underestimated through the lens of global occurrence records based on conventional surveys. Our eDNA surveys revealed that the known geographic ranges for 93% of species and the ecological niche ranges for 7% of species were underestimated, and contributed to filling them. We show that the probability to detect a range filling for a given species is primarily shaped by the GBIF/OBIS sampling effort in a cell, but also by the number of occurrences available for the species. Most gap fillings were achieved by addressing a methodological sampling bias, notably when eDNA facilitated the detection of small fishes in previously sampled locations using conventional methods. Using a machine learning model, we found that a local effort of 10 eDNA samples would detect 24 additional fish species on average and a maximum of 98 species in previously unsampled tropical areas. Yet, a null model revealed that only half of ecological niche range fillings would be due to eDNA surveys, beyond a random allocation of classical sampling effort. Altogether, our results suggest that sampling in remote areas and performing eDNA surveys in over-sampled areas may both increase fish ecological niche ranges toward unexpected values with consequences in biodiversity modeling, management, and conservation
Restaurer la forêt marécageuse pour contrer le Typha, une espèce exotique envahissante
No full texthttps://guadeloupe-parcnational.fr/frFor the past ten years, the Parc national de la Guadeloupe has supported scientific studies on the archipelago's wetlands. In this context, the work carried out at the University of the West Indies (UA) plays an essential role in optimizing the management of these natural environments, which are largely under the Park's responsibility. The following is a summary of a recent UA study highlighting the rapid invasion of Typha domingensis in Guadeloupe and an effective control technique based on swamp forest restoration.Le Parc national de la Guadeloupe soutient depuis une dizaine d’années les études scientifiques portant sur les zones humides de l’archipel. Dans ce contexte, les travaux menés à l’Université des Antilles (UA) jouent un rôle essentiel pour optimiser la gestion de ces milieux naturels, en grande partie placés sous la responsabilité du Parc. Voici le résumé d’une étude récente de l’UA mettant en évidence l’invasion fulgurante de Typha domingensis en Guadeloupe et une technique de contrôle efficace basée sur la restauration de la forêt marécageuse
Mapping the city's trajectory for climate change adaptation: mapping territorial evolution, politics will and planning regulations
No full textInternational audienc
Rapport de campagne DIADEM
No full textEn Janvier-Février 2023, la campagne DIADEM (Deep Investigations At DEMerara, ou DIve At DEMerara) s’est déroulée à bord du Navire Océanographique Pourquoi Pas ?, au Nord-Est du plateau sous-marin de Demerara, au large de la Guyane française et du Suriname. Cette campagne océanographique a utilisé une panoplie d’outils de mesures, de prélèvement et d’observation en fond de mer : le Nautile, sous-marin d’observation et de prélèvements, l’AUV (Autonomous Underwater Vehicle) IdeFx opérant des mesures géophysiques près du fond (cartographie bathymétrique, sondeur de sédiment, courants et paramètres physiques des eaux de fond), un mouillage pour mesurer les variations temporelles des courants et des paramètres physiques des eaux de fond, des carottiers pour prélever des sédiments meubles (Calypso pour une carotte d’une trentaine de mètres de long, Fantacore pour des carottes métriques préservant l’interface entre l’eau de fond et le sédiment), et une drague pour prélever des roches indurées.Cette campagne était multidisciplinaire et multisites. Les deux principaux objectifs étaient de:-Comprendre l’interaction entre les courants de fond, la morphologie du fond de la mer, et la sédimentation récente. La partie du plateau de Demerara étudiée pour cette thématique est balayée par la North Atlantic Deep Water (NADW), qui s’y écoule vers le Sud-Est. Cet écoulement est marqué dans la morphologie par des dépressions allongées (nommées queues de comètes), initiées sur des reliefs (nommés têtes de comètes). Le champ de comètes « Tangara » a été étudié en détail grâce à 6 plongées AUV, 4 plongées Nautile, (incluant des carottages d’interface au moyen de push-cores) et un mouillage. Sept autres sites ont été carottés autour de Tangara, afin d’obtenir une archive sédimentaire la plus complète possible dans les zones contouritiques présentant les taux de sédimentation maxima.Les observations faites pendant la campagne montrent que les têtes de comètes sont constituées de carbonates lités, souvent fortement basculés, et ont confirmé le rôle des courants de fond dans la sédimentation et morphologie sous-marine du secteur.-Cartographier et échantillonner les roches pre- et syn-rift affleurant sur la bordure du plateau. Cela concernait deux horsts ou blocs basculés (Plateau Bastille et Ride Buteur) sur la bordure Est du plateau (marge divergente), et différents sites (Ride des 60°, Canyon Poubelle) sur la bordure Nord du plateau (marge transformante), avec un socle formé de coulées basaltiques héritées du rifting Jurassique, recouvert par des séries sédimentaires associées au rift Crétacé. Au total, 6 plongées Nautile et 6 dragues ont permis d’observer et/ou d’échantillonner autant de coupes, et ont confirmé la nature presque exclusivement basaltique du socle du plateau.-Enfin, deux plongées Nautile ont été dédiées à des objets pouvant être associés à la sortie en fond de mer de fluides profonds. Une plongée a eu lieu sur une structure en forme de dôme, initialement supposée être un volcan de boue, mais qui s’est révélée être composée d’un empilement de carbonates lités. Une autre plongée a eu lieu dans la cicatrice sommitale des glissements gravitaires affectant le Nord Est du plateau de Demerara.-L’ensemble des plongées a observé une densité d’organismes importante en fond de mer. Des champs de nodules polymétalliques ont également été observés, associés aux affleurements de basaltes
Synthèse des connaissances sur les membracides et les aetalions de Guyane française (Hemiptera :Auchenorrhyncha : Membracidae, Aetalionidae). Partie II : biologie, plantes-hôtes et interactions écologiques.
No full textInternational audienceThis article reports on the knowledge of host plants and mutualistic interactions of membracids in French Guiana, based on six years of field surveys conducted between 2016 and 2023. Brief notes are presented regarding microhabitats, phenology, polyphagy, predation, and parasitism. Several hypotheses are proposed to explain evolutionary convergences and defense mechanisms. Additionally, a classification approach for membracids is introduced, based on ecological traits (degree of association with ants) and morphological characteristics (mimicry, shape of pronotal helmets).Cet article fait état des connaissances des plantes hôtes et des interactions mutualistes des membracides de Guyane suite à six années de prospection sur ce territoire entre 2016 et 2023. De brèves notes sont présentées concernant les micro-habitats, la phénologie, le polyphagisme, la prédation et le parasitisme. Quelques hypothèses sont proposées pour expliquer des convergences évolutives ou des mécanismes de défense. Une approche de classification des membracides selon des traits écologiques (degré d’affinités avec les fourmis) ou morphologiques (mimétisme, forme des casques) est également présentée
Safety Monitoring of Machine Learning Perception Functions: a Survey
No full text25 pages, 2 figuresInternational audienceMachine Learning (ML) models, such as deep neural networks, are widely applied in autonomous systems to perform complex perception tasks. New dependability challenges arise when ML predictions are used in safety-critical applications, like autonomous cars and surgical robots. Thus, the use of fault tolerance mechanisms, such as safety monitors, is essential to ensure the safe behavior of the system despite the occurrence of faults. This paper presents an extensive literature review on safety monitoring of perception functions using ML in a safety-critical context. In this review, we structure the existing literature to highlight key factors to consider when designing such monitors: threat identification, requirements elicitation, detection of failure, reaction, and evaluation. We also highlight the ongoing challenges associated with safety monitoring and suggest directions for future research
Récifs coralliens, joyaux de biodiversité
No full textColorés et d'une grande beauté, les récifs coralliens du parc naturel de la mer de Corail forment de véritables forêts sous-marines. Ces univers complexes, encore large-ment méconnus, abritent une biodiversité exceptionnelle, où chaque élément structurant et chaque communauté biologique joue un rôle fondamental dans l'équilibredes écosystèmes. Bien qu'éloignés de la plupart des activités humaines et bénéficiant d'une haute protection, ces récifs sont aujourd'hui menacés par le réchauffementclimatique et des épisodes successifs de blanchissement. Face à ces dangers, les scientifiques de divers horizons collaborent pour mieux comprendre ces écosystèmeset anticiper les transformations à venir. Quelles espèces peuplent ces récifs ? Existe-t-il des connexions entre les récifs éloignés ? Comment ces récifs réagissent-ils aux canicules marines ? Quels sont les impacts passés et actuels de l'humain sur ces récifs éloignés ? Quelles relations entretient-il avec ces récifs ? C'est à cesquestions que ce chapitre tente d'apporter des éléments de réponse en s'appuyant sur de nombreuses expéditions naturalistes et études scientifiques faisant appelà diverses disciplines
Atlas des agricultures du monde et des systèmes alimentaires face au changement climatique
No full textInternational audienc
Beyond Reducing Deforestation: Impacts of a REDD+ Project on Household Livelihoods
No full textInternational audienceUnderstanding why forest conservation initiatives succeed is essential to designing cost-effective programs. In this study, we investigate the impacts of a REDD+ project on both environmental and livelihood outcomes in the Brazilian Transamazon region, an area with historically high deforestation rates. Using counterfactual impact evaluation methods applied to survey and remote-sensing data, we assess the impact of the project over 2013–2019, from its first year until two years after its end. Based on a theory of change, we focus on land use and socioeconomic outcomes affected by the initiative. Our findings reveal specific impact mechanisms: forest conservation occurred primarily through reducing pasture expansion, while cattle production was maintained through intensification (increased stocking rates). Additionally, the project led to significantly higher agrobiodiversity among participating farms and promoted alternative livelihoods that generated greater revenue while using less land. These results suggest that conservation programs that combine conditional payments with technical assistance and support for adopting low-impact activities can effectively reduce deforestation in the short term and induce lasting changes in production systems, with positive effects persisting even after program completion
Physicochemical Exploration and Computational Analysis of Bone After Subchronic Exposure to Kalach 360 SL in Female Wistar Rats
No full textInternational audienceGlyphosate (N-phosphonomethylglycine) is a widely used organophosphorus herbicide that inhibits the shikimate pathway, a crucial metabolic route responsible for the synthesis of aromatic amino acids in plants and certain microorganisms. Due to its broad-spectrum activity, glyphosate serves as the main active ingredient in various commercial herbicide formulations, including Roundup and Kalach 360 SL (KL). It poses a health hazard to animals and humans due to its persistence in soil, water erosion, and crops. The aim of our study was to continue the previous research to explore the impact of KL on bone using physico-chemical parameters and in silico studies after exposing female wistar rats for 60 days. The in silico study concerned the assessment of binding affinity and molecular interactions using computational modeling approach. The rats were allocated into three experimental groups: group 1 (n = 6) served as controls, while groups 2 and 3 received low and high doses (Dose 1: 126 mg/Kg and Dose 2: 315 mg/Kg) of KL dissolved in water, respectively. All rats were sacrificed after 60 days of exposure. XRD and FTIR spectrum analysis of bone tissues in female rats showed significant histoarchitectural changes associated with bone mineralization disruption. Our results have demonstrated that sub-chronic exposure of adult female rats to KL causes bone rarefaction, as confirmed by a previous histological study. This physico-chemical study has further confirmed the harmful impact of KL on the crystalline fraction of bone tissue, composed of hydroxyapatite crystals. In addition, the computational analyses showed that glyphosate binds to 3 Glu form of osteocalcin (3 Glu-OCN) (4MZZ) and decarboxylated osteocalcin (8I75) with good affinities and strong molecular interactions, which justified and supported the in vivo findings. In conclusion, KL may interfere with hydroxyapatite and osteocalcin and, therefore, impair bone remodeling and metabolism