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AMOBIO : Analyse multicritère des effets exercés par les obstacles en cours d’eau sur les communautés biologiques (diatomées, macroinvertébrés, poissons). Rapport scientifique et technique final
Seroprevalence of dengue, Zika, and chikungunya in São Sebastião, Brazil (2020–2021): a population-based survey
International audienceBackground: Urban arboviruses pose a significant global burden, particularly in tropical regions like Brazil. São Sebastião, a lower-middle-class urban area just 26 km from the Brazilian capital, is an endemic area for dengue. However, asymptomatic cases may obscure the actual extent of the disease. In this study, we measured the seroprevalence of dengue, Zika virus, and chikungunya, and compared these findings with surveillance data.Methods: A cross-sectional study was conducted involving 1,535 households. ELISA serological tests were performed to detect IgM and IgG antibodies against dengue, Zika virus, and chikungunya. History of previous exposure to arboviruses, data on age, gender, and education level were collected through a questionnaire. Participants who tested positive for IgM and/or IgG were classified as soropositive. Statistical analyses included tests for normality, associations, mean comparisons, and correlations. Positive serological results were compared with cases captured by local epidemiological surveillance.Results: The study included 1,405 individuals, divided into two groups related to pre-pandemic and pandemic COVID-19 phases. Among participants, 0.7% to 28.8% self-reported history of dengue, Zika, or chikungunya. However, the estimated overall seroprevalence was 64.3% (95% CI: 61.8–66.7) for dengue virus, 51.4% (95% CI: 48.8–53.9) for Zika virus, and 5.4% (95% CI: 4.4–6.7) for chikungunya virus. Multiple arboviruses were noted at 4.0% (95% CI: 3.1–5.1). Advancing age and lower education were associated with higher exposure to arboviruses (p < 0.05). The estimated number of urban arboviral infections was 84 times higher than reported cases.Conclusions: The large gap between seroprevalence estimates and cases captured by epidemiological surveillance suggests a silent circulation of arboviruses, highlighting the need for comprehensive serological surveys in endemic regions. Addressing these discrepancies is crucial for effective resource allocation and implementation of public health interventions
Pêcheurs d’Haïti : une ingéniosité constante face aux contraintes sociales et climatiques
https://theconversation.com/pecheurs-dha-ti-une-ingeniosite-constante-face-aux-contraintes-sociales-et-climatiques-249078En Haïti, la pêche représente non seulement une source cruciale de protéines, mais aussi un pilier économique majeur pour les habitants. Elle rassemble également des savoirs transmis précieusement de générations en générations, et une connaissance très fine de l’environnement. Mais aujourd’hui, ces savoir-faire sont mis à mal par les aléas climatiques et les dommages environnementaux que subissent l’île
Evolution de la couverture corallienne de la plateforme récifale de Saint-Gilles / l’Hermitage à La Réunion entre 2013 à 2023
Ces données de recouvrement corallien ont été produites dans le cadre du projet BioEOS. La méthodologie utilisée est la suivante :1. Acquisition de scènes satellites Pléiades sur la plateforme récifale de Saint-Gilles / l’Hermitage entre 2013 et 2023, issues de la base de données Kalidéos Réunion. Ces données sont orthorectifiées et calibrées en réflectance à l’aide d’une chaine spécifiquement développée par le CNES assurant une haute cohérence de la série temporelle.2. Exploitation de données de in situ et historiques de couverture corallienne (CCV) sur la plateforme récifale.3. Masquage de la zone d’étude (suppression des pixels en dehors de la plateforme récifale, émergés, sur la pente externe, et présentant du déferlement)4. Calcul des indices de brillance BIBG (bandes bleue et verte) sur toutes les images5. Estimation des coefficients des droites de régressions entre CCV et BIBG et application pour produire les images d’estimation de la CCV par satellite Pleiades. Seuillage des valeurs en dehors de la plage [0, 100]6. Masquage des zones d’herbiers à l’aide des couches vectorielles d’herbiers produites dans le cadre de ce projet BioEOS, à partir des mêmes images Pléiades aux dates correspondantes.Dans le cadre du projet BioEOS, l’évolution temporelle de la couverture en corail vivant a été estimée sur la plateforme récifale de Saint-Gilles / l’Hermitage à partir de 10 images satellites Pléiades acquises entre le 20 août 2013 et le 05 octobre 2023. Le calcul des corrélations linéaires permet de mettre en évidence les tendances locales à l’échelle d’une surface de 100m² (polygones carrés de 10m x 10m). Un coefficient de corrélation de Pearson inférieur à 0,05 permet de valider l’hypothèse d’une corrélation linéaire entre les données (CCV vs temps), et d’identifier ainsi les tendances durant cette période (progression, régression, stabilité).La mise à jour régulière de ces données à partir de séries temporelles d’images satellites permet de suivre la dynamique spatio-temporelle des habitats côtiers sensibles
Cartographier les variables essentielles de biodiversité côtière par imagerie satellite multi et hyperspectrale : Projet SCO-BioEOS
International audienceSoutenu par le Centre national d'études spatiales (CNES) et labellisé par l'Observatoire spatial du climat (SCO), le projet BioEOS vise à développer des outils d'observation pour caractériser la dynamique spatiotemporelle de la biodiversité côtière. Cette initiative permettra de cartographier les changements et de produire des indicateurs opérationnels en soutien à la conservation et à la restauration dans les Aires marines protégées (AMP). Le projet s'appuie principalement sur des séries temporelles d’images provenant de systèmes satellitaires multispectraux (Pléiades, Sentinel-2, Vénus) et hyperspectraux (EnMAP, PRIS-MA). Un ensemble de métriques, proxy de la biodiversité, sont extraites grâce à l’intégration d'algorithmes à SRL (Scientific Readiness Level) élevés, largement utilisés par la communauté scientifique. Cette approche permet de générer des informations sur la bathymétrie, l'abondance des types d'habitats/fonds et les estimations des propriétés de la colonne d'eau. Les récifs coralliens et les herbiers marins de la région sud-ouest de l'océan Indien (La Réunion, Mayotte, Glorieuses et Bassas da India) sont les premiers écosystèmes ciblés pour cette expérimentation. Nous proposons de présenter les principales avancées d'un démonstrateur fournissant des variables essentielles contribuant à diverses utilisations finales à travers quatre cas d'utilisation distincts. De plus, nous discuterons des points forts et des limites des systèmes satellitaires employés, à la lumière des objectifs initiaux fixés
Developing EO-based framework for estimating biodiversity variables of coral reef and seagrass ecosystems at Large Scale
International audienceBiodiversity is a vital component of natural capital that significantly influences ecosystem functions and provides essential services and benefits, ranging from food security to cultural heritage. However, species are currently disappearing at a rate 100 to 1,000 times higher than the natural extinction rate. Coastal ecosystems are particularly concerning: they are among the most vulnerable due to their exposure to cumulative anthropogenic pressures while biodiversity knowledge is lacking. Supported by the French National Space Agency (CNES) and endorsed by the Space Climate Observatory (SCO), the BioEOS project aims to develop observation tools to characterize the spatiotemporal dynamics of coastal biodiversity. This initiative will map changes and produce operational indicators to assist in conservation and restoration efforts in the Marine Protected Area (MPA). The project primarily takes advantage of image time series from multispectral (Pleiades, Sentinel-2, Venus) and hyperspectral (EnMAP, PRISMA) satellite systems. A set of selected biodiversity proxy metrics are extracted using high SRL (Scientific Readiness Level) algorithms that have been widely used by the benthic scientific community. These algorithms encompass the inversion of radiative transfer models, machine learning-based scene segmentation, spectral unmixing, pansharpening, and the calculation of spectral indices. This approach enables to generate valuable information on bathymetry, bottom/habitat type abundances and distributions, as well as water column properties estimations. Coral reef and seagrasses of Southwestern Indian Ocean region (La Réunion, Mayotte, Glorieuses and Bassas da India) are the first targeted ecosystems for this experimentation. We present the main advancements of a demonstrator providing key essential variables contributing to various end uses through four distinct use cases. Additionally, we will discuss the strengths and limitations of the satellite systems employed, in light of the initial objectives set forth
Principes de formation robustes et Éducation Physique de Qualité. Illustration pour la formation initiale des professeurs d’EPS à l’INSPE de Normandie Caen
International audienceThe term quality Physical Education updates and synthesizes the educational, health and societal issues considered essential for physical education and sport in the contemporary world. This expression, which has been mobilized within UNESCO, thus challenges PE teacher training, and specifically in France, PE teachers. This text contributes to an epistemological approach to the initial training of PE teachers. It aims to highlight some principles for the training of students in quality physical and sports education. These principles are described as robust because they aim to form long-term guidelines that transcend the contemporary "curricular fluctuations" of the French teacher training system. Two of them are more specifically formalized and examined here: creating a model that accommodates the complexity and controversies relating to the teacher’s activity; making students’ experience and bodily practice a training modality. These principles having explicitly praxeological aims, they are exemplified here within the framework of a training course in Master MEEF at the INSPE of Normandy Caen.Le terme d’Éducation Physique de qualité réactualise et synthétise les enjeux éducatifs, sanitaires et sociétaux considérés comme essentiels pour l’Éducation Physique et le sport dans le monde contemporain. Cette expression, mobilisée au sein de l’UNESCO, interpelle ainsi les formations d’enseignants d’EP et spécifiquement en France, les enseignants d’EPS. Le présent texte est contributif à une approche épistémologique de la formation initiale des enseignants d’EPS. Il ambitionne de mettre en évidence quelques principes pour la formation des étudiantes et des étudiants à une Éducation Physique et sportive de qualité. Ces principes sont qualifiés de robustes puisqu’ils visent à former des lignes directrices à long terme qui transcendent les « fluctuations curriculaires » contemporaines du système de formation des enseignants français. Deux d’entre eux sont plus spécifiquement formalisés et examinés ici : faire exister un modèle qui accueille la complexité et les controverses relatives à l’activité du professeur ; faire de l’expérience et de la pratique corporelle des étudiants une modalité de formation. Ces principes ayant des visées explicitement praxéologiques, ils sont exemplifiés ici dans le cadre d’un parcours de formation en Master MEEF à l’INSPE de Normandie Caen
Associations between dietary diversity and self-rated health in a transverse study of four local food systems (French Guiana, Guadeloupe, Portugal and Senegal)
International audienceBackground: The nutrition transition is linked to the double-burden of malnutrition worldwide, and its impact on the quality of life is considerable. The dietary diversity score and self-rated health are two proxies that have been used to assess, for the former, nutrient adequacy and overall diet quality, and for the latter, health from a sociological, epidemiological and economical lens. The general aim of this study was to evaluate the relation between food and subjective health, and to test the hypothesis that greater dietary diversity is positively associated with a better perception of health.Methods: A transverse comparison of foods consumed in four highly contrasted local socio-ecosystems (i.e., two French oversea territories: French Guiana, Guadeloupe, Portugal and Senegal) was conducted using 24-hour dietary recalls. Dietary diversity was calculated using 18 food groups based on classifications provided by WHO and FAO. Binary logistic regressions were used to assess the relationship between dietary diversity scores and answers to the question assessing self-rated health. Results Overall, 465 individuals, 18 years and older, from Senegal, Guiana, Guadeloupe and Portugal were interviewed using a 24-hour dietary recall. Participants were selected via a combination of non-probability sampling methods. The mean dietary diversity score for all regions combined was 9.22. Over one-third of participants reported their health as ‘good’ (39.8%), whereas ‘bad’ and ‘excellent’ health were the least reported, at 6.45% and 9.03%, respectively. Multiple binary logistic regression notably found that dietary diversity score (OR = 0.88, 95% CI [0.79, 0.99], p = 0.010) and at-home meal preparation, specifically with the reference category ‘all the time’ compared to ‘never’ (OR = 3.31, 95% CI [1.55, 7.07], p = 0.002) were statistically significant predictors of self-rated health (i.e., declaring overall bad health).Conclusions: This study demonstrates a positive association between dietary diversity and self-rated health across distinct cultural contexts. The findings reinforce the importance of diverse diets for subjective well-being, regardless of differences in food systems. Public health messaging should continue to promote dietary diversity and home-cooked meals as effective strategies for improving health. Self-rated health could serve as a useful tool for quickly assessing the outcomes of nutrition therapy
Pre-European contact leprosy in the Americas and its current persistence
International audienceLeprosy, primarily caused by Mycobacterium leprae , is considered a disease introduced into the Americas during European colonization. However, the recent discovery of a second pathogen causing leprosy, M. lepromatosis , mainly found in the Americas, challenges this view. Here, we show that M. lepromatosis infected humans in the Americas before European contact. By screening 389 ancient and 408 contemporary samples, we have expanded the genetic data available for the species. Phylogenetic analyses revealed distinct human-infecting clades of M. lepromatosis , with one dominating North America since colonial times. The presence of millennia-old strains in North and South America indicates M. lepromatosis may have been widespread during the Late Holocene, demonstrating M. lepromatosis leprosy has a long-standing history in the Americas before European arrival
Projet SCO-BioEOS, Suivi des Variables Essentielles de la Biodiversité côtière : Mise en Oeuvre sur le Site Pilote de La Réunion
Labelled by the SCO (Space for Climate Observatory) and supported by CNES, the BioEOS project (BIOdiversity Earth Observation and monitoring at regional Scale) aims to use satellite imagery to extract metrics that allow for the quantification and monitoring of coastal biodiversity through proxies. The main objective is to address a real need for spatio-temporal knowledge about biodiversity, particularly highlighted in overseas territories.With additional financial support from a convergence and transformation contract for La Réunion (Prefecture of La Réunion in connection with SGAR and DEAL), the initial focus was on the site of La Réunion for the establishment of processing chains, before applying them to other study sites of the project (Glorieuses, Mayotte, and Bassas Da India). The developments carried out so far have generated spatialized knowledge on bathymetry, seagrasses, and coral reefs using images from various sensors (Pléiades, Pléiades NEO, Sentinel, EnMAP, and PRISMA).The work conducted under the BioEOS project highlights the importance of synergy between in situ data and satellite imagery to produce the richest and most accurate information for the management needs of coastal ecosystems. Other opportunities for further work are anticipated to enrich and improve the quality of information extracted regarding these vulnerable ecosystems, namely seagrasses and coral reefs.Labelisé par le SCO (Space for Climate Observatory) et soutenu par le CNES, le projet BioEOS (BIOdiversity Earth Observation and monitoring at régional Scale) propose d’utiliser l’imagerie satellite pour extraire des métriques permettant de quantifier et suivre, via des proxys, la biodiversité côtière. L’objectif principal, qui est de répondre à un réel besoin de connaissances spatio-temporelles sur la biodiversité, mis en exergue notamment dans les territoires d’outre-mer.Bénéficiant d’un soutien financier complémentaire d’un contrat de convergence et de transformation de La Réunion (Préfecture de La Réunion en lien avec le SGAR et la DEAL), le choix s’est porté dans un premier temps sur le site de La Réunion pour la mise en place des chaînes de traitements, avant de les appliquer sur les autres sites d’étude du projet (Glorieuses, Mayotte et Bassas Da India). Les développements réalisés jusqu’à présent ont permis de générer des connaissances spatialisées sur la bathymétrie, les herbiers et les récifs coralliens en utilisant des images issues de différents capteurs (Pléiades, Pléiades NEO, Sentinel, EnMAP et PRISMA).Les travaux menés dans le cadre de ce projet BioEOS soulignent l’importance de la synergie entre données in situ et imagerie satellite afin de produire les informations les plus riches et les plus précises pour les besoins de gestion des écosystèmes côtiers. D’autres possibilités de travaux sont en perspective pour enrichir et améliorer la qualité des informations extraites concernant ces écosystèmes vulnérables que sont les herbiers et les récifs coralliens.Pour la suite du projet BioEOS, les chaines de traitements mises en place sur le site de La Réunion vont pouvoir ainsi être améliorées, étendues et/ou adaptées à l'ensemble des trois autres sites d’étude dans le cadre de la convention avec le CNES