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    Efficacité de la reconnaissance automatique de phonèmes sur une tâche de production de pseudo-mots

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    International audienceContexte : Les modifications anatomiques consécutives à un cancer oral ou oropharyngé conduisent à s’intéresser à la production fonctionnelle de parole au niveau segmental (Mlynarek et al., 2008), pour analyser les liens entre anatomie oro-pharyngée et reconnaissance des phonèmes (Lazarus et al., 2013). L’utilisation de systèmes automatiques de décodage acoustico-phonétique permet cette analyse, mais nécessite d’étudier leur qualité de reconnaissance dans un contexte de parole pathologique (Halpern et al., 2022).Objectif : Étudier l’efficacité de la reconnaissance automatique phonémique sur une tâche de production de pseudomots après cancer oral ou oropharyngé. Méthode : Quatre-vingts sujets traités pour un cancer oral / oropharyngé ont été enregistrés en produisant une liste phonétiquement équilibrée de 52 pseudomots (moyenne : 4,6 phonèmes, Ghio et al., 2022). Chaque pseudomot a été transcrit par trois systèmes automatiques : un TDNN-HMM et deux transformers CTC (avec et sans fine-tuning). Un clinicien a également effectué en temps réel une transcription et a jugé perceptivement la sévérité du trouble de parole (0 : trouble majeur, 10 : absence de trouble). La qualité de la reconnaissance a ensuite été évaluée par le calcul : d’une part, d’un taux d’erreur de phonèmes (PER : rapport entre somme des erreurs de reconnaissance - délétions, insertions, substitutions - et nombre de phonèmes cibles) et d’autre part, d’un score global de déviation phonologique perçue (PPD, Ghio et al., 2022) correspondant au nombre de traits phonologiques d’écart moyen par phonème entre la reconnaissance et la cible.Résultats : 4 107 pseudomots ont été analysés (exclusions : problèmes d’enregistrement, données manquantes). La transcription humaine offre la meilleure efficacité de reconnaissance (PER et PPD les plus faibles). Parmi les systèmes automatiques, le Transformer CTC-fine-tuné présente le PER significativement le plus faible, mais le TDNN-HMM présente les moindres PPD. Chez l'humain comme chez les systèmes automatiques, les erreurs (PER et PPD) augmentent lorsque le trouble devient plus sévère. Les systèmes automatiques convergent davantage vers l’humain, avec un rapport plus favorable, lorsque l’on isole les sujets moins sévères (10). Cela interroge sur la nature des erreurs, notamment sur les insertions, fréquentes pour ce type de systèmes de reconnaissance automatique (Transformer CTC : 0,80 phonèmes / pseudomot). Elles pourraient ainsi dégrader rapidement les performances de reconnaissance dès que la parole s’éloigne d’une cible typique proche des données d’apprentissage. L’analyse des rapports humain / automatique questionne également sur des effets de restauration phonémique humaine dès que la parole est dégradée.Conclusion : Les systèmes de décodage acoustico-phonétique automatiques appliqués à la parole après cancer présentent encore une efficacité moindre qu’un expert humain. La qualité des erreurs dépend de l’architecture de ces systèmes, possiblement en lien avec les insertions fréquemment commises. De même, des événements sonores dans le signal (bruits de bouche…) peuvent perturber la qualité de la reconnaissance automatique contrairement à un humain. La réflexion doit être poursuivie pour étudier le lien entre la qualité de ces erreurs et les déficits analytiques présentés par les patients, afin d’éclairer les mécanismes de production et d’optimiser les stratégies de réadaptation de ces patients

    Co-culture of the fungus Fomitopsis betulina with E. coli on solid media for the detection of antibacterial candidates: deciphering the bacterial-fungus interaction

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    International audienceAntimicrobial resistance represents an increasing worldwide threat [1]. In this scenario, innovation in antibacterial compound sourcing, especially from fungi that represent bio-sourced and unexplored alternatives to synthetic compounds, is needed to increase the treatment success of infections. Most of the described antibacterial metabolites with fungal origins (penicilline derivatives, cephalosporines) are issued from the Ascomycota division (Penicillium sp., Acremonium sp.). Antibacterial potential of Basidiomycota, the sister group of Ascomycota, is well known, but secondary metabolism of these fungi is expressed only in specific, cryptic conditions. Secondary metabolite biosynthetic pathways are thus poorly known in Basidiomycota.In this context, co-culture experiments on solid media were performed to evidence the biosynthesis of antibacterial metabolites from the fungus Fomitopsis betulina (Basidiomycota) in the presence of the bacteria E. coli. An antibacterial activity, determined by an E. coli growth inhibition (inhibition zone) was observed. Using mass spectrometry metabolomic analyses combined with targeted purification of metabolites, the objectives of this study was to highlight and characterize antibacterial candidates.Only one candidate, constitutive of the fungus, was accumulated at the inhibition zone according to the metabolomic results. The compound of interest, purified from the fungus secretome and characterized by 1D and 2D NMR, appears to be a calcium complex of three units of Sumiki’s acid, but did not exert any direct antibacterial activity against E. coli. No other antibacterial metabolites was detected throught this MS-based metabolomic study. Interrogations remain regarding the mechanisms of growth inhibition and the correlative accumulation of this chelating agent in the inhibition zone

    Présentation du LSBB, Instrumentation et gestion du radon

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    Unlocking the Gates: A Novel Diagnostic Molecule for Quantifying Efflux Levels in Gram‐Positive Bacteria

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    International audienceAbstract Efflux‐mediated antibiotic resistance poses a significant global threat, affecting diverse bacterial species. Clinicians recognize the danger of efflux mechanisms during antibiotic treatment, yet precise diagnostic tools remain unavailable. The antibiogram currently infers abnormal efflux pump activity in clinical isolates, which is subsequently confirmed through transcriptomic or genomic analysis. This study harnesses the colorimetric, fluorescence, and solubility properties of phenazinium derivatives to develop a rapid protocol for detecting bacterial efflux. Among several synthesized phenazinium compounds, the compound demonstrating differential MIC in Staphylococcus efflux mutants and exhibiting appropriate physicochemical properties is selected. A diagnostic protocol is developed using the selected compound to assess efflux levels, categorized as no, weak, or strong, through colorimetry and spectroscopy techniques. Testing on Gram‐positive efflux mutants and clinical Staphylococcus isolates further validates the approach. In‐silico docking analysis confirms the interaction between the chosen compound and the NorA efflux pump in S. aureus . Flow cytometry is employed to re‐evaluate the detection assays. The developed molecule and protocol represent the first known method to evaluate efflux levels in any Gram‐positive species through a streamlined and user‐friendly process. This pioneering test significantly advances the epidemiological analysis of efflux mechanisms and enables more informed therapeutic decision‐making, leading to more effective treatment

    RGPD et transport ferroviaire : l'identité de genre du client n'est pas une donnée nécessaire à l'achat d'un titre de transport

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    Relire avec des « lunettes logistiques » la contribution de Jared Diamond sur le processus historique d'expansion des sociétés humaines.

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    International audienceJared Diamond est un chercheur mondialement renommé pour ses travaux en écologie et biologie évolutive. Membre de prestigieuses académies, il a publié plus de 600 articles et plusieurs ouvrages. Son ouvrage de référence analyse les facteurs de la domination de certaines sociétés humaines, intégrant des perspectives interdisciplinaires pour expliquer l’histoire. Jared Diamond souligne l’importance des réseaux commerciaux et des infrastructures dans le développement des civilisations. Sans la citer nommément, il démontre comment la logistique, essentielle pour la production et la distribution des ressources, a façonné les sociétés les plus prospères. L’agriculture, créant des excédents alimentaires, a permis la division du travail et le développement de systèmes complexes d’échange. Jared Diamond explore également les aspects sombres de la logistique, notamment son rôle dans les guerres et la propagation des maladies. L’analyse conduite souligne que la gestion des ressources et la logistique sont cruciales pour la stabilité des sociétés humaines, offrant des leçons pertinentes pour les défis contemporains à relever, liés à la mondialisation et au changement climatique

    Pêcheurs d’Haïti : une ingéniosité constante face aux contraintes sociales et climatiques

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    https://theconversation.com/pecheurs-dha-ti-une-ingeniosite-constante-face-aux-contraintes-sociales-et-climatiques-249078En Haïti, la pêche représente non seulement une source cruciale de protéines, mais aussi un pilier économique majeur pour les habitants. Elle rassemble également des savoirs transmis précieusement de générations en générations, et une connaissance très fine de l’environnement. Mais aujourd’hui, ces savoir-faire sont mis à mal par les aléas climatiques et les dommages environnementaux que subissent l’île

    Couvertures coralliennes de la plateforme récifale de Saint-Gilles / l’Hermitage à La Réunion : Cartographie par imagerie satellite Pléiades de 2013 à 2023

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    Ces données de recouvrement corallien ont été produites dans le cadre du projet BioEOS. La méthodologie utilisée est la suivante :1. Acquisition de scènes satellites Pléiades sur la plateforme récifale de Saint-Gilles / l’Hermitage entre 2013 et 2023, issues de la base de données Kalidéos Réunion. Ces données sont orthorectifiées et calibrées en réflectance à l’aide d’une chaine spécifiquement développée par le CNES assurant une haute cohérence de la série temporelle.2. Exploitation de données de in situ et historiques de couverture corallienne (CCV) sur la plateforme récifale.3. Masquage de la zone d’étude (suppression des pixels en dehors de la plateforme récifale, émergés, sur la pente externe, et présentant du déferlement)4. Calcul des indices de brillance BIBG (bandes bleue et verte) sur toutes les images5. Estimation des coefficients des droites de régressions entre CCV et BIBG et application pour produire les images d’estimation de la CCV par satellite Pleiades. Seuillage des valeurs en dehors de la plage [0, 100]6. Masquage des zones d’herbiers à l’aide des couches vectorielles d’herbiers produites dans le cadre de ce projet BioEOS, à partir des mêmes images Pléiades aux dates correspondantes.Dans le cadre du projet SCO BioEOS, une cartographie des coraux vivants de la plateforme récifale de Saint-Gilles / l’Hermitage a été réalisée à partir de 10 images satellites Pléiades acquises entre le 20 août 2013 et le 05 octobre 2023. La méthode d’estimation de la couverture corallienne est basée sur l’indice spectral de brillance bleu vert calculé sur les images et de données de validation historiques et in-situ.La production régulière de ces données à partir d’images satellites de télédétection permet de suivre l’état et la dynamique spatio-temporelle des habitats côtiers sensibles

    Les politiques du sport aux Seychelles et le reflet de la globalisation sportive (1976-2018)

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    International audienceLibérés de la tutelle coloniale britannique et indépendants depuis 1976, les Seychelles ont progressivement vu naître, se déployer puis se développer des politiques sportives ambitieuses au regard de la conjoncture et des ressources du pays – ceci par l’intermédiaire d’un régime socialiste, non aligné et autocratique mené par France-Albert René (1977-2004), puis sous la présidence de James Michel (2006-2016). En l’espace de quarante ans, la gouvernance sportive seychelloise s’est ainsi penchée sur le maillage territorial des équipements dédiés, l’institutionnalisation du mouvement sportif, la couverture législative de l’ensemble des déclinaisons du sport (haut-niveau, sport pour tous, santé, éducation, loisirs, etc.) ; et a rendu possible l’organisation de deux éditions des Jeux des îles de l’océan Indien en 1993 et 2011 (Violette & Naria, 2025). Ce processus de structuration et d’affirmation des politiques sportives est à la fois corrélé à des enjeux sociaux (identité nationale, aménagement territorial, réformes sanitaires et éducatives, etc.) et des enjeux diplomatiques (intégration régionale, reconnaissance internationale, etc.), dont le sport semble un catalyseur dans les pays des Suds (Jarcie, 2011). Afin d’appréhender la complexité de ces relations multiscalaires, nous proposons d’évaluer ces politiques publiques à la lumière du concept de globalisation sportive et de ses avatars – homogénéisation, hybridation, polarisation (Sage, 2010). La notion postule d’une dynamique de standardisation des modèles sportifs nationaux à l’échelle internationale au cours du Second XXe siècle, sans passer sous silence les résistances et les appropriations différenciées inhérentes au phénomène. Dans cette perspective, à travers le prisme des politiques sportives locales doivent être étudiés le rôle et le poids des transferts culturels, des impératifs normatifs et des influences supranationales dont le sport mondialisé est agent et produit. Pour ce faire, l’analyse repose sur un panel de sources primaires diverses, composé d’archives institutionnelles, législatives et médiatiques (textes officiels, plans stratégiques de développement, fonds du quotidien Seychelles Nation, documentation du CIO, UNESCO, etc.).Ainsi, nous montrerons que l’essor de la gouvernance sportive aux Seychelles s’accompagne d’une standardisation vis-à-vis de modèles dominants issus de l’Occident – modèles parmi lesquels sont centraux les enjeux de rayonnement sportif, d’institutionnalisation, de solidarité et de coopération internationale, ainsi que de développement par le sport. En somme, malgré quelques divergences, c’est une forme d’isomorphisme qui semble s’exprimer à travers les politiques sportives promues dans l’archipel

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