NII Repository (National Institute of Informatics)
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SPARC Japan NewsLetter NO.39
Get PDF■SPARC Japan 活動報告
学術情報流通推進委員会[p.1]
SCOAP3 フェーズ 3（2020-2022）の対応について[p.1]
■SPARC Japan セミナー報告
企画概要[p.3]
参加者から[p.4]
企画後記[p.4]
ドキュメント[p.5]
（講演・パネルディスカッション）articl
SPARC Japan NewsLetter NO.40
Get PDF■ SPARC Japan 活動報告
学術情報流通推進委員会[p.1]
CLOCKSS の活動について[p.1]
■ SPARC Japan セミナー報告
企画概要[p.2]
参加者から[p.3]
企画後記[p.3]
ドキュメント[p.4]
（講演・パネルディスカッション）articl
NII Technical Report (NII-2020-001E)：A Stabilized GMRES Method for Solving Underdetermined Least Squares Problems
Get PDFConsider using the right-preconditioned generalized minimal residual (AB-GMRES) method, which is an efficient method for solving underdetermined least squares problems. Morikuni (Ph.D. thesis, 2013) showed that for some inconsistent and illconditioned problems, the iterates of the AB-GMRES method may diverge. This is mainly because the Hessenberg matrix in the GMRES method becomes very ill-conditioned so that the backward substitution of the resulting triangular system becomes numerically unstable. We propose a stabilized GMRES based on solving the normal equations corresponding to the above triangular system using the standard Cholesky decomposition. This has the effect of shifting upwards the tiny singular values of the Hessenberg matrix which lead to an inaccurate solution. Thus, the process becomes numerically stable and the system becomes consistent, rendering better convergence and a more accurate solution. Numerical experiments show that the proposed method is robust and efficient for solving inconsistent and ill-conditioned underdetermined least squares problems. The method can be considered as a way of making the GMRES stable for highly ill-conditioned inconsistent problems.departmental bulletin pape
NII Technical Report (NII-2020-002E)：Cluster Gauss-Newton method for finding multiple approximate minimisers of nonlinear least squares problems with applications to parameter estimation of pharmacokinetic models
Get PDFParameter estimation problems of mathematical models can often be formulated as nonlinear least squares problems. Typically these problems are solved numerically using iterative methods. The local minimiser obtained using these iterative methods usually depends on the choice of the initial iterate. Thus, the estimated parameter and subsequent analyses using it depend on the choice of the initial iterate. One way to reduce the analysis bias due to the choice of the initial iterate is to repeat the algorithm from multiple initial iterates (i.e. use a multi-start method). However, the procedure can be computationally intensive and is not always used in practice. To overcome this problem, we pro-pose the Cluster Gauss-Newton (CGN) method, an e cient algorithm for nding multiple approximate minimisers of nonlinear-least squares problems. CGN simultaneously solves the nonlinear least squares problem from multiple initial iterates. Then, CGN iteratively improves the solutions from these initial iterates similarly to the Gauss-Newton method. However, it uses a global linear approximation instead of the Jacobian. The global linear approximations are computed collectively among all the iterates to minimise the computational cost. We use physiologically based pharmacokinetic (PBPK) models used in pharmaceutical drug development to demonstrate its use and show that CGN is computationally more e cient and more robust against local minima compared to the standard Levenberg-Marquardt method, as well as state-of-the art multi-start and derivative-free methods.departmental bulletin pape
第3回 SPARC Japan セミナー2019 「実践 研究データ管理」 糖鎖科学における研究データ管理 発表資料
Get PDF第3回 SPARC Japan セミナー2019 「実践 研究データ管理」
開催場所：国立情報学研究所 12階 1208・1210会議室
日時：2020年2月7日（金）13:00-18:00conference objec
第1回 SPARC Japan セミナー2020 「研究データ公開：フルオープンと制限公開の境界線」 宇宙科学研究所におけるデータ公開・制限公開に関する議論の紹介 ドキュメント
Get PDF第1回 SPARC Japan セミナー2020 「研究データ公開：フルオープンと制限公開の境界線」
開催場所：オンライン開催
日時：2020年10月2日（金）13:00-17:00conference objec
第1回 SPARC Japan セミナー2020 「研究データ公開：フルオープンと制限公開の境界線」 データ流通市場におけるデータ公開の事例・論点 発表資料
Get PDF第1回 SPARC Japan セミナー2020 「研究データ公開：フルオープンと制限公開の境界線」
開催場所：オンライン開催
日時：2020年10月2日（金）13:00-17:00conference objec
SPARC Japan NewsLetter NO.37
Get PDF■ SPARC Japan 活動報告
学術情報流通推進委員会[p.1]
学術情報流通推進委員会について[p.1]
■ SPARC Japan セミナー報告
企画概要[p.3]
参加者から[p.3]
企画後記[p.4]
ドキュメント[p.5]
（講演・パネルディスカッションarticl
NACSIS-CAT/ILL Newsletter No.48
Get PDF1．これからの学術情報システム構築検討委員会の活動について[p.1]
2．CAT2020適用開始日について[p.2]
3．CAT2020対応マニュアル類の公開[p.3]
4．CAT2020説明会開催報告[p.4]
5．NACSIS-CAT/ILL Q&A DBの利用について[p.4]
6．申請に関するQ&Aについて[p.5]
7．2018年度NACSIS-CAT/ILL業務分析表の公開[p.5]
8．2020年度のILL 文献複写等料金相殺サービスの運営費について[p.6]
9．ILL文献複写等料金相殺サービスQ&Aについて[p.6]
10．ILL文献複写等料金相殺サービス処理報告（2018年度第4四半期～2019年度第3四半期）[p.7]
11．2019年度目録システム書誌作成研修 実施報告[p.9]
12．NACSIS-CAT/ILLセルフラーニング教材の公開[p.10]articl