Open Access Publications (Univ. de Genève)
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The RB621 antibody recognizes the envelope E protein from SARS-CoV-2 by immunofluorescence
The recombinant antibody RB621 detects by immunofluorescence the envelope E protein from SARS-CoV-2
Linguagem em delírio: a literatura contracultural brasileira nos anos 60 e 70.
Au cours des années 1960 et 1970, alors que le Brésil vivait les années les plus difficiles de la dictature, une série de récits littéraires a présenté un regard critique sur le régime instauré. Plusieurs auteurs branchés sur la contre-culture ont cherché à approcher la réalité sociopolitique nationale à partir de fictions regorgeant d’images hallucinogènes/hallucinées. Partant de ce contexte, notre article tente d’analyser quelques productions littéraires motivées par l’approche de ce moment brésilien à travers ce que nous qualifions d’expérience du délire : elles présentent un langage à multiples facettes qui, à son tour, démantelle la logique et le contrôle discursif requis par les milieux officiels.Durante os anos 60 e 70 quando o Brasil vivia os anos mais acirrados da ditadura, uma série de narrativas literárias apresentava um olhar crítico para o período vigente. Certa parcela de autores afinados com a contracultura buscava uma abordagem da realidade sociopolítica nacional a partir de ficções repletas de imagens alucinógenas/alucinadas. Partindo deste contexto, o presente artigo busca assinalar algumas produções literárias interessadas na abordagem daquele momento brasileiro através do que cunhamos como experiência do delírio, apresentando uma linguagem multifacetada que, por sua vez, desmantela a logicidade e o controle discursivo almejados pelos meios oficiais
Données médicales et dossiers patients comme actifs informationnels : la gouvernance de l’information dans les hôpitaux universitaires suisses
Cet article, basé sur un travail de master en sciences de l’information, s’intéresse à la gouvernance de l’information (GI) dans les hôpitaux universitaires suisses (HUS), plus spécifiquement en ce qui concerne les données médicales. La GI est l’ensemble de rôles, règles et opérations qui permettent à une institution de maîtriser ses documents et données pour en tirer de la valeur, en fonction de sa stratégie et dans le respect du cadre réglementaire.
Les données médicales, liées à des dossiers patients, sont particulièrement sensibles et doivent être protégées. En même temps, il y a de nombreuses utilisations et réutilisations de ces données, dans le cadre clinique, pour la facturation, l’évaluation de la qualité, la surveillance sanitaire ou encore pour des projets de recherche. Il s’agit en fait d’actifs informationnels, c’est-à-dire d’informations ayant de la valeur pour les institutions.
Une revue de la littérature a été effectuée sur la GI et ses composantes, sur le monde hospitalier suisse en général et les HUS en particulier, sur l’évolution et les formes du dossier patient et sur les législations cantonales en lien avec notre sujet. De plus, cinq entretiens semi-dirigés ont été menés avec des représentants de chacun des HUS sur leurs pratiques informationnelles.
La synthèse des résultats permet d’affirmer que la valeur des données médicales et dossiers patients est reconnue par les institutions. Tous les HUS ont mis en place un grand nombre des composantes d’une GI, allant de la cybersécurité à l’archivage. Ils accordent beaucoup d’importance à la formation et la sensibilisation de leurs collaborateurs, en matière de protection des données notamment, et connaissent parfaitement le cadre réglementaire. En revanche, il n’y a pas de politique institutionnelle explicitement dédiée à la GI.
En conclusion, nous proposons un schéma général des flux des données médicales et de leurs diverses réutilisations, avec les dimensions transversales à traiter (enjeux éthiques, juridiques, économiques, etc.) et les fonctions et compétences nécessaires à la GI.
Zusammenfassung
Dieser Artikel basiert auf einer Masterarbeit in Informationswissenschaften und behandelt die Information governance (IG) von Gesundheitsdaten in den Schweizer Universitätsspitälern (HUS). IG ist die Gesamtheit der Rollen, Regeln und Tätigkeiten, die dafür sorgen, dass Dokumente und Daten einer Institution auf kontrollierte Weise und strategiegemäss verwaltet werden können, um damit Wert zu generieren und Compliance-Vorgaben zu respektieren.
Gesundheitsdaten gehören zu Patientendossiers und sind besonders schützenswert. Gleichzeitig werden sie auf vielfältige Art und Weise genutzt: für die klinische Praxis, die Fakturierung, die Qualitätskontrolle, Monitoring-Programme oder zu Forschungszwecken. Es handelt sich um Information assets, also Informationen, die für die Institution wertvoll sind.
Eine Literaturrecherche wurde durchgeführt zur IG und ihren Bestandteilen, zur schweizerischen Spitallandschaft im Allgemeinen und den HUS im Besonderen, zur Geschichte und den verschiedenen Formen des Patientendossiers, und zu den kantonalen Gesetzen, die mit unserem Thema zusammenhängen. Ausserdem wurden in fünf Gesprächen Vertreterinnen und Vertreter der HUS zu ihren Informationspraktiken interviewt.
Die Ergebnisse bekräftigen, dass die Institutionen den Wert ihrer Gesundheitsdaten und Patientendossiers anerkennen. Alle HUS setzen diverse Komponenten der IG ein, von der Cybersecurity bis zur Archivierung. Sie messen der Ausbildung und Sensibilisierung ihrer Mitarbeitenden, insbesondere zum Thema Datenschutz, grosse Bedeutung bei und kennen die gesetzlichen und regulatorischen Rahmenbedingungen. Es gibt jedoch keine spezifische institutionelle Information governance Policy.
Abschliessend schlagen wir ein allgemeines Schema vor mit den Flüssen und den verschiedenen Verwendungszwecken der Gesundheitsdaten. Das Schema zeigt ebenfalls die interdisziplinären Herausforderungen (ethisch, juristisch, ökonomisch usw.) und die für die IG notwendigen Kompetenzen und Querschnittsfunktionen.
Abstract
This article is based on a master thesis in information science and takes a look at the information governance (IG) in Swiss university hospitals (HUS) applied to health data. IG means the roles, rules and operations that allow an institution to manage and master its data and documents, according to its strategy and compliance needs.
Medical data, linked to a patient’s health record, is very sensitive and must be protected. At the same time, it is used and re-used in many ways: clinical practice, invoicing, quality control, health watch programs, research projects, etc. Health data is in fact an information asset, i.e. information that is valuable for the institution.
A literature review has been made about IG and its components; about hospitals in Switzerland, especially the HUS; about the evolution and various forms of health records; and about the cantonal laws regarding our subject. In addition, five interviews with representatives of the HUS about the information practices at their hospital have taken place.
The results show that the institutions acknowledge the value of health data and patient records. All HUS have deployed numerous components of IG, from cyber security to archiving. They attach importance to training and awareness of employees, especially about data protection, and know compliance rules and laws. However, there is no explicit institutional IG policy.
In conclusion, we suggest a general schema of the workflows and the various reuses of medical data. It also shows the transverse dimensions (ethical, legal, economic, etc. challenges) of IG and the competencies and functions that are necessary to make it work
L’océrisation d’imprimés anciens : les sciences de l’information au service des Humanités
Cet article présente un projet de recherche, en collaboration avec le Bodmer Lab, qui a consisté à océriser des imprimés latins de la Renaissance, afin d’en obtenir une transcription et de la rendre explorable par la recherche plein texte.
Quatre logiciels d’océrisation gratuits et open source ont été testés, avec comme métriques la précision, le rappel, et la F-mesure (F1) au niveau des caractères et au niveau des mots. Tesseract et OCR4all étaient les plus performants, mais ce dernier présentait un problème technique qui rendait son utilisation complexe. Tesseract, qui présentait alors une F1 de 78.62% (caractères) et 31.78% (mots) a donc été retenu pour la suite du projet.
Différentes méthodes ont été testées pour améliorer les résultats obtenus. Toutes les méthodes n’étaient pas nécessairement efficaces, mais grâce à certaines, une F1 de 80.06% au niveau des caractères et de 34.58% au niveau des mots a pu être obtenue.
Abstract
This article presents a research project, in collaboration with Bodmer Lab, which consisted of using an OCR software on Latin prints from the Renaissance, in order to obtain a transcription and make it explorable through full-text research.
Four free and open source OCR software were tested, with accuracy, recall, and F-measurement (F1) at character and word level as metrics. Tesseract and OCR4all were the best performers, but the latter presented a technical problem that made its use complex. Tesseract, which at the time had an F1 of 78.62% (characters) and 31.78% (words) was therefore chosen for the rest of the project.
Different methods were tested to improve the results obtained. Not all methods were necessarily effective, but thanks to some of them, an F1 of 80.06% at character level and 34.58% at word level could be obtained.
Zusammenfassung
Dieser Artikel stellt ein Forschungsprojekt in Zusammenarbeit mit dem Bodmer-Lab vor, das darin bestand, ein OCR-software mit lateinischen Drucken aus der Renaissance zu benutzen, um eine Transkription zu erhalten und sie durch Volltextforschung erforschbar zu machen.
Vier freie und open source OCR software wurden getestet, wobei Genauigkeit, Rückruf und F-Messung (F1) auf Zeichen- und Wortebene als Metriken verwendet wurden. Am besten schnitten Tesseract und OCR4all ab, wobei letzteres ein technisches Problem aufwies, das seine Anwendung komplex machte. Daher wurde Tesseract, das zu diesem Zeitpunkt einen F1 von 78,62% (Zeichen) und 31,78% (Wörter) hatte, für den Rest des Projekts gewählt.
Es wurden verschiedene Methoden getestet, um die erzielten Ergebnisse zu verbessern. Nicht alle Methoden waren notwendigerweise effizient, aber dank einiger von ihnen konnte eine F1 von 80,06% auf Zeichenebene und 34,58% auf Wortebene erreicht werden
AE804, AE806, AE999, AF017, AF041 and AF131 antibodies label mouse insulin-secreting beta cells by immunohistochemistry
The recombinant antibodies AE804, AE806, AE999, AF017, AF041 and AF131 detect by immunohistochemistry the insulin-secreting beta cells in mouse pancreatic islets. The most efficient staining was obtained with AE999
RB481, RB482, RB483, RB484, RB485, RB486, RB498 and RB499 antibodies recognize the coatomer COPI complex by ELISA
The recombinant antibodies RB481, RB482, RB483, RB484, RB485, RB486, RB498 and RB499 detect by ELISA a purified COPI complex from COS7 cells
RB448, RB449, RB450 and RB451 antibodies recognize a peptide from the D. discoideum AlyL protein by ELISA
The recombinant antibodies RB448, RB449, RB450 and RB451 detect by ELISA a fragment of the D. discoideum AlyL protein fused to a GST protein
RB045 and RB048 antibodies recognize a peptide of the D. discoideum SibA protein by western blot
Recombinant antibodies RB045 and RB048 detect by western blot a peptide of the Dictyostelium discoideum SibA protein fused to a GST protein
RB110 and RB157 antibodies recognize by ELISA specific phosphorylation patterns on CCR5 C-terminal peptides
Recombinant antibodies RB110 and RB157 can be used in ELISA assays to specifically detect human CCR5 phosphorylated at serines 336/337 and at serine 349, respectively
RB174, RB175, RB176, RB177 and RB178 antibodies recognize a fragment of the Dictyostelium discoideum CMF protein by ELISA
The recombinant antibodies RB174, RB175, RB176, RB177 and RB178 detect by ELISA a fragment of the Dictyostelium discoideum Conditioned Medium Factor (CMF) fused to a GST protein