Repositorio Digital Ikiam (Univ. Regional Amazónica)
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A systematic review on metal contamination due to mining activities in the Amazon basin and associated environmental hazards
Get PDFMetal contamination associated with mining activities has been considered one of the main environmental
pollution problems in the Amazon region. Understanding the levels of metal contamination from mining activities requires a good understanding of background metal concentrations, which may vary notably according to the geology/lithology characteristics of the region, soil type, and predominant biogeochemical processes. This review assessed 50 papers and reports published between 1989 and 2020 describing environmental concentrations of different metals and metalloids (As, Hg, Mn, Fe, Cd, Cu, Cr, Pb, Ni, and Zn) in water and sediments of mining and non-mining areas in five geographic regions of the Amazon basin. Metal enrichment caused by mining activities was calculated and exposure concentrations were compared with sediment and water quality standards set for the protection of aquatic life. Significant enrichments of Cd, Cu, Cr, Fe, Hg, Mn, Ni and Zn were observed in mining areas in both sediment and water. Regarding background levels in the different geographic regions, the highest prevalence of metal enrichment (i.e., concentrations 10 to 100-fold higher than mean background values) in sediment samples was found for Fe (100% of samples), Ni (90%), and Mn (69%). For water, high prevalence of metal enrichment occurred for Zn, Mn, and Fe (100% of samples), and for Hg (86%). Hg, Fe, Pb, Cu, Cd, Ni and Zn exceeded water and/or sediment quality standards in a significant number of samples in the proximity of mining areas. This study indicates that mining activities significantly contribute to water and sediment contamination across the Amazon basin, posing hazards for freshwater ecosystems and potentially having human health implications
Las reductasas NADPH-citocromo P450 de clase I y II exhiben diferentes funciones en la biosíntesis de triterpenoides en Lotus japonicus
No full textCytochrome P450 monooxygenases (CYPs) are enzymes that play critical roles in
the structural diversification of triterpenoids. To perform site-specific oxidations
of the triterpene scaffold, CYPs require electrons transferred by NADPH cytochrome P450 reductase (CPR), which is classified into two main classes,
class I and class II, based on their structural difference. Lotus japonicus is a
triterpenoids-producing model legume with one CPR class I gene (LjCPR1) and a
minimum of two CPR class II genes (LjCPR2-1 and LjCPR2-2). CPR classes I and II
from different plants have been reported to be involved in different metabolic
pathways. By performing gene expression analyses of L. japonicus hairy root
culture treated with methyl jasmonate (MeJA), this study revealed that LjCPR1,
CYP716A51, and LUS were down-regulated which resulted in no change in
betulinic acid and lupeol content. In contrast, LjCPR2s, bAS, CYP93E1, and
CYP72A61 were significantly upregulated by MeJA treatment, followed by a
significant increase of the precursors for soyasaponins, i.e. b-amyrin, 24-OH b amyrin, and sophoradiol content. Triterpenoids profile analysis of LORE1
insertion and hairy root mutants showed that the loss of the Ljcpr2-1 gene
significantly reduced soyasaponins precursors but not in Ljcpr1 mutants.
However, Ljcpr1 and Ljcpr2-1 mutants showed a significant reduction in lupeol
and oleanolic, ursolic, and betulinic acid contents. Furthermore, LjCPR1, but not
LjCPR2, was crucial for seed development, supporting the previous notion that
CPR class I might support plant basal metabolism. This study suggests that CPR
classes I and II play different roles in L. japonicus triterpenoid biosynthesi
Biochar de residuos de Guadua angustifolia Kunt: efecto de la temperatura y el tiempo de residencia en la pirólisis lenta
Get PDFEl bambú incluye 1500 especies de interés económico, social y ecológico, incluyendo a Guadua angustifolia Kunth. G. angustifolia es una especie nativa de Colombia, Venezuela y Ecuador con alta disponibilidad de biomasa y diversidad de usos y aplicaciones como la producción de biochar por medio de procesos termoquímicos. Esta investigación evaluó el efecto de la temperatura y tiempo de residencia en las propiedades fisicoquímicas del biochar de residuos de G. angustifolia obtenido mediante pirólisis lenta. Para ello, se hizo un estudio previo del secado natural de G. angustifolia durante 3 meses y un análisis proximal. Se produjo biochar variando la temperatura (450, 550, 600, 700 y 800 °C) y tiempo de residencia (30 minutos y 1 hora). Además, se determinó las propiedades fisicoquímicas de cada biochar por métodos analíticos como:
SEM-EDS, BET, FTIR, pH y conductividad. Los resultados mostraron que el secado y cambio de color de G. angustifolia ocurrió entre los días 11 y 28 hasta el día 80. Asimismo, se encontró un 13,03% de humedad, 77,76% de materia volátil, 3,63% de cenizas y 16,38% de carbono fijo en sus residuos. De las propiedades del biochar 2 analizado, se destacó BG 800 °C-1h con una mayor área superficial específica (597 ),
BG 600 °C-30m con más grupos funcionales oxigenados, BG 800 °C-30m, BG 600 °C- 1h y BG 550 °C-1h por presentar macroporos definidos, y BG 550 °C-30m por trazas de minerales encontradas en su superficie. La temperatura es la variable que más influyó en las propiedades del biochar de G. angustifolia.Tutor: Jaime Martí ; Cotutora: Yanet Villasan
Análisis bibliométrico sobre la producción de biohidrógeno: generación a partir de la Digestión Anaerobia y tendencias
Get PDFEl constante incremento de la población está vinculado al incremento de recursos fósiles energéticos, Principalmente de origen fósil. Hoy en día, el interés se enfoca en desarrollar tecnologías eficientes para producir alternativas como el biohidrógeno de manera rentable, óptima y eficiente. Con ello, se podría contribuir en la mitigación del cambio climático y la crisis energética. En este sentido, el objetivo de este estudio de esta investigación es desarrollar un análisis bibliométrico sobre la producción de biohidrógeno utilizando la digestión anaerobia como técnica potencial. La metodología propuesta consideró el alcance de producción de documentos que existe sobre el tema, que fue desde el 2003 al 2023, se utilizó artículos indexados de la base de datos, Scopus. Se siguieron tres fases para el análisis bibliométrico: a) Selección de bases de datos y criterios de búsqueda; b) Análisis bibliométrico y, c) Revisión bibliométrica, Método PRISMA. Por otro lado, para el análisis bibliográfico, se basó en las cuatro fases de investigación según el método Framewrork: (1) búsqueda, (2) evaluación, (3) análisis, y, (4) síntesis. En los resultados se analizaron Diferentes aspectos que permitieron identificar las tendencias del tema, autores, revistas y países con mayor número de publicaciones. Se presentaron las condiciones para la producción de biohidrógeno como
los reactores, parámetros óptimos, factores que influyen en el proceso, rutas biológicas y microorganismos presentes. Conclusión, se ha demostrado que producir biohidrógeno utilizando la digestión anaerobia permite sustituir a los combustibles fósiles por ser una opción exitosa para lograr satisfacer las necesidades energéticas a futuro.Tutor: Cristhian David Chicaiza Orti
Compression Behaviour of Laminates of Dendrocalamus Asper bamboo and Guadua Angustifolia bamboo
Get PDFThis study presents the experimental results of the compression behaviour of bamboo laminates made of Dendrocalamus asper on the one hand and Guadua angustifolia on the other hand. The construction of these laminates involved using bamboo boards aligned in a singular orientation, as bamboo naturally comprises longitudinal threads. As a result, it was anticipated that the laminates would exhibit orthotropic behaviour. Hence, the current investigation considered three distinct orientations: parallel to the fibres, perpendicular to the fibres and parallel to the boards, and finally, perpendicular to the fibres and perpendicular to the boards. A total of ten tests were conducted for each type of specimen to ascertain the compression strength and elastic modulus in both directions for the two species. The laminates derived from Dendrocalamus asper exhibited comparatively reduced density, compression strength, and modulus of elasticity along the fibre orientation compared to the laminates of Guadua angustifolia. In contrast, the specimens of Dendrocalamus asper exhibited higher resistance and ductility when subjected to compression perpendicular to the fibre. It is essential to clarify that, beyond conducting a direct comparative analysis under identical conditions, this research aims to disseminate and analyze the numerical results of material tests conducted on laminates produced in factories in Colombia and Ecuador
Desarrollo y validación de una tecnología para la micropropagación de Vanilla odorata C. Presl
Get PDFLa presente investigación tuvo como objetivo establecer un protocolo de micropropagación
de Vanilla odorata C. Presl. Esto se realizó con el fin de brindar una alternativa al método
actual de propagación por esquejes, cuya eficiencia no es óptima. Se utilizaron yemas axilares
de plantas madre de una zona de producción en Tena. Para la primera fase de establecimiento
in vitro se evaluaron dos protocolos de desinfección (PD1 y PD2) reportados para la vainilla
comercial V. planifolia. Para la segunda fase de multiplicación de las vitro plantas establecidas,
se evaluaron cuatro medios de cultivo con diferentes concentraciones de 6-Bencilaminopurina
(BAP) (0, 1, 2.15 y 3 mg.L-1
). De la primera fase del estudio, se determinó que el protocolo de
desinfección PD2 fue el más eficiente, obteniendo una menor contaminación (40%) y una
sobrevivencia cercana al 60%. En cuanto a la fase de multiplicación, se determinó que los
medios de cultivo con 2.15 y 3 mg.L-1 de BAP favorecieron una mayor brotación, permitiendo
alcanzar índices de multiplicación de 4 y 3.5 respectivamente a los 60 días de evaluación. Los
resultados obtenidos al momento, permitieron establecer y multiplicar in vitro explantes de
V. odorata en medios de cultivo semisólidos
“Caracterización funcional del péptido dermaseptina CC1 de la secreción de la piel de la rana espléndida Cruziohyla calcarife
Get PDFLas dermaseptinas son una gran familia de péptidos antimicrobianos secretados por la
piel de las ranas pertenecientes a la familia Phyllomedusidae. Estos péptidos cumplen la
función de defensa frente a patógenos, por lo tanto, actúan sobre microorganismos
como virus, hongos, bacterias y parásitos. Este trabajo presenta la caracterización
funcional de la dermaseptina-CC1 de la especie Cruziohyla calcarifer. Este péptido fue
sintetizado químicamente y luego se determinó su potencia, rango de acción y toxicidad
en eritrocitos. Adicionalmente, se realizaron análisis bioinformáticos para obtener las
características fisicoquímicas y similitud de secuencias con dermaseptinas conocidas en
bases de datos (NCBI, UniProt). Los resultados muestran que la dermaseptina CC1 es un
péptido catiónico que tiene una α-hélice anfipática con carga neta +3, con una secuencia
que difiere de las dermaseptinas presentes en las bases de datos, alcanzando un 85 %
de identidad y compartiendo características como un triptófano conservado en el
tercera posición y motivos de consenso de la región media. La dermaseptina CC1 mostró
actividad para todos los microorganismos utilizados en este estudio (cepas ATTC de
Escherichia coli, Staphylococcus aureus y Candida albicans, y aislados clínicos de
Klebsiella pneumoniae y Pseudomonas aeruginosa), siendo más potente contra
bacterias Gram negativas con una concentración inhibitoria mínima (MIC) de 2,25 μM
contra E. coli y 9,02 μM contra aislados clínicos resistentes a ampicilina (K. pneumoniae
y P. aeruginosa), sin actividad hemolítica. Este estudio presenta la dermaseptina CC1
como un péptido potencial para desarrollar tratamientos terapéuticos enfocados a
combatir la resistencia bacteriana
Contrasting biogeographical patterns of threatened vertebrates on islands emerge from disparities between expert-derived maps and Global Biodiversity Information Facility data
Get PDFThe most popular sources of information on species distributions are the expert-derived maps and georeferenced occurrences, mainly those compiled by the Global Biodiversity Information Facility (GBIF). These sources have been constantly used with biogeographical and conservation goals. However, their degree of accuracy in representing geographical biodiversity patterns remains poorly understood. Here, we compared both sources of information on species distributions to estimate global patterns of richness and species composition of threatened vertebrates on marine islands
NEOTROPICAL FRESHWATER FISHES: A dataset of occurrence and abundance of freshwater fishes in the Neotropics
Get PDFThe Neotropical region hosts 4225 freshwater fish species, ranking first among the world's most diverse regions for freshwater fishes. Our NEOTROPICAL FRESHWATER FISHES data set is the first to produce a large-scale Neotropical freshwater fish inventory, covering the entire Neotropical region from Mexico and the Caribbean in the north to the southern limits in Argentina, Paraguay, Chile, and Uruguay. We compiled 185,787 distribution records, with unique georeferenced coordinates, for the 4225 species, represented by occurrence and abundance data. The number of species for the most numerous orders are as follows: Characiformes (1289), Siluriformes (1384), Cichliformes (354), Cyprinodontiformes (245), and Gymnotiformes (135). The most recorded species was the characid Astyanax fasciatus (4696 records). We registered 116,802 distribution records for native species, compared to 1802 distribution records for nonnative species. The main aim of the NEOTROPICAL FRESHWATER FISHES data set was to make these occurrence and abundance data accessible for international researchers to develop ecological and macroecological studies, from local to regional scales, with focal fish species, families, or orders. We anticipate that the NEOTROPICAL FRESHWATER FISHES data set will be valuable for studies on a wide range of ecological processes, such as trophic cascades, fishery pressure, the effects of habitat loss and fragmentation, and the impacts of species invasion and climate change. There are no copyright restrictions on the data, and please cite this data paper when using the data in publications
Unlocking the potential of snake venom-based molecules against the malaria, Chagas disease, and leishmaniasis triad
No full textMalaria, leishmaniasis and Chagas disease are vector-borne protozoal infections with a disproportionately high impact on the most fragile societies in the world, and despite malaria-focused research gained momentum in the past two decades, both trypanosomiases and leishmaniases remain neglected tropical diseases. Affordable effective drugs remain the mainstay of tackling this burden, but toxicicty, inneficiency against later stage disease, and drug resistance issues are serious shortcomings. One strategy to overcome these hurdles is to get new therapeutics or inspiration in nature. Indeed, snake venoms have been recognized as valuable sources of biomacromolecules, like peptides and proteins, with antiprotozoal activity. This review highlights major snake venom components active against at least one of the three aforementioned diseases, which include phospholipases A2, metalloproteases, L-amino acid oxidases, lectins, and oligopeptides. The relevance of this repertoire of biomacromolecules and the bottlenecks in their clinical translation are discussed considering approaches that should increase the success rate in this arduous task. Overall, this review underlines how venom-derived biomacromolecules could lead to pioneering antiprotozoal treatments and how the drug landscape for neglected diseases may be revolutionized by a closer look at venoms. Further investigations on poorly studied venoms is needed and could add new therapeutics to the pipeline