Repositorio Digital Ikiam (Univ. Regional Amazónica)
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Diversidad de peces utilizando ADN ambiental y métodos convencionales en ecosistemas acuáticos del rio Tena, Ecuador
Full text linkLos peces de agua dulce representan una cuarta parte del total de vertebrados en el
planeta. En los últimos años, la diversidad de peces ha sido afectada fuertemente por
presiones antrópicas. Comprender la diversidad de peces y su distribución en los
ecosistemas acuáticos es de vital para la gestión sostenible y la conservación. El uso de
la técnica de ADN ambiental (eDNA) en contraste con los métodos convencionales
(pesca eléctrica y trampas) muestra ser una alternativa no invasiva y eficiente para la
identificación de peces. En el sitio de muestreo se realizaron dos estudios. El primero,
centrado en la caracterización de la diversidad de peces con la técnica de eDNA en
charcas y ríos, donde se identificaron 34 especies de peces y se encontró mayor
diversidad alfa en los ríos. La diversidad beta mostró que existe gran disimilitud en la
composición de peces entre charcas y ríos, a pesar de tener especies compartidas. El
segundo, basado en la comparación entre la técnica eDNA y los métodos convencionales
en arroyos, donde se detectaron 31 especies con eDNA de las que únicamente 12 fueron
detectadas por los métodos convencionales. La técnica de eDNA tuvo mayor capacidad
de detección. En ambos estudios se encontraron especies invasoras (Oreochromis
niloticus y Poecilia sp.) y especies de baja densidad poblacional (Synbranchus
marmoratus). En conclusión, la técnica de eDNA ha mostrado ser efectiva para la
detección de peces en ecosistemas acuáticos amazónicos.Tutor: Hugo Mauricio Ortega Andrade ; Cotutor : Francisco José Villamarín Jurad
Rehabilitación arquitectónica del Vicariato Apostólico de Napo para mejoramiento del confort interior con soluciones pasivas
Full text linkEl Vicariato Apostólico de Napo es una importante institución religiosa ubicada en Ecuador, en la provincia de Napo, ciudad de Tena. Esta edificación en la actualidad se encuentra subutilizada, también padece el problema de disconfort térmico en su interior debido a su ubicación en el predio y a las condiciones climáticas de la región. Este presente trabajo de investigación tiene como finalidad generar un anteproyecto de rehabilitación arquitectónica usando soluciones pasivas para mejorar el confort térmico interior del edificio. Para lograr
este objetivo se diagnostica el estado actual del edifico en su forma y función, también se estudia el comportamiento térmico interior mediante mediciones realizadas con un termohigrómetro digital, encuestas y simulaciones en softwares especializados. Adicionalmente, se analizan estrategias pasivas en
referentes teóricos de rehabilitación arquitectónica que tenga como propósito mejorar el comportamiento térmico para el confort del usuario. Finalmente se proponen estrategias pasivas en el Vicariato Apostólico de Napo para mejorar el confort interior además se modifican los espacios interiores del objeto de estudio
para adaptarlo a las necesidades actuales de la ciudad de Tena conservando su valor histórico y cultural.Tutora: Karina Alexandra Chérrez Roda
Bioprospección de plantas amazónicas con alto contenido de flavonoides como indicador del ptencial para la síntesis verde de nZVI
Full text linkLa bioprospección se centra en la búsqueda y comercialización de bio-recursos para descubrir nuevos biomateriales, integrando conocimientos tradicionales con información genética y promoviendo el uso sostenible y el desarrollo socioeconómico. La Amazonia, con hasta 50,000 especies de plantas, ofrece un vasto repositorio de recursos genéticos esenciales para la investigación científica y biotecnológica. Este estudio exploró plantas amazónicas con alto contenido de flavonoides, compuestos con funciones biológicas cruciales y aplicaciones en nanotecnología, especialmente en la síntesis de nanopartículas de hierro cerovalente (nZVI). Se identificaron proteínas asociadas a la biosíntesis de flavonoides en Arabidopsis thaliana utilizando la base de datos Gene Ontology. Las proteínas ortólogas fueron buscadas en la base de datos de NCBI y procesadas mediante la herramienta BLAST para identificar especies vegetales amazónicas. Se identificaron los principales tipos de flavonoides sintetizados por las plantas amazónicas encontradas. La herramienta KEGG se utilizó para mapear rutas metabólicas de flavonoides e identificar las enzimas clave para los metabolitos de interés. Se predijeron estructuras tridimensionales de proteínas clave usando I-TASSER y se analizaron sus funciones biológicas con COFACTOR y COACH. Los resultados mostraron 16 especies previamente no exploradas para la síntesis verde de nZVI, siendo cacao (Theobroma cacao), caucho (Hevea brasiliensis), yuca (Manihot esculenta) y Abrus precatorius las especies más representativas. Los principales flavonoides sintetizados por las plantas amazónicas encontradas fueron los flavonoles y flavanoles. Se investigaron el flavonol sintasa/flavanona 3-hidroxilasa de Manihot esculenta, la dihidroflavonol 4-reductasa bifuncional/flavanona 4-reductora de Theobroma cacao, la antocianidina reductasa de Abrus precatorius y la proteína de la familia de la chalcona-flavanona isomerasa de Hevea brasiliensis. Los resultados indicaron que estas proteínas participan en la síntesis de flavonoides en las plantas seleccionadas y que su conservación se observa entre distintas especies. Además, se identificó que los metabolitos flavonoles y flavanoles son esenciales en la síntesis de nanopartículas de hierro cerovalente (nZVI). En conclusión, la identificación de proteínas asociadas a la biosíntesis de flavonoides en plantas amazónicas puede guiar la bioprospección de especies con alto contenido de flavonoides, ofreciendo un enfoque sostenible y eficiente para la producción de nanopartículas y otros materiales de interés biotecnológico y ambientales.Tutora: Yanet Villasana ; Cotutora: Cristina Quirog
Análisis de viabilidad en la producción de biohidrógeno a bajo costo a partir de efluentes de aguas residuales domésticas
Full text linkPara optimizar el desempeño de los biodigestores anaerobios, se planteaunaalternativa innovadora: potenciar la generación de metano a través de la reacciónentre el hidrógeno y el CO2 presentes en estos sistemas. La obtencióndeestehidrógeno se puede llevar a cabo mediante un proceso electroquímico conocidocomoelectrólisis. El objetivo central de esta investigación es sintetizar hidrogeno, conmirasa implementar esta mejora, haciendo uso de tecnologías de bajo costo en los efluentesde biodigestores. Para alcanzar este propósito, se ejecutó un diseño experimental
factorial completo con tres niveles y tres factores, abordando diversos parámetrosoperativos que inciden en el proceso de electrolisis. Entre estos parámetrosseincluyen el voltaje (9 V, 6 V, 12 V) y el amperaje (0,4 A, 1 A, 2 A), juntoconlaintroducción de nuevos criterios, como el uso de biochar como electrolito (0 g/l, 50g/l, 150 g/L). Los resultados clave revelaron que la producción de hidrógeno(ml/h)
aumenta de manera lineal en función exclusiva al incremento de los voltajesyconcentración de biochar aplicados, siendo la máxima producción de 2,76ml/ha12V, 150 g/L de biochar y 1 A. Por otro lado, se observó que el incremento en el amperajeno ejerce ninguna influencia en el aumento de la producción de hidrógeno, yaqueestase mantiene constante. Al final, se diseñó un electrolizador de bajocosto, aprovechando un panel fotovoltaico para la síntesis eficiente de hidrógeno, basándonos en los hallazgos obtenidos en el laboratorioTutor: Jaime Marti ; Cotutor: Galo Cerd
Secuenciamiento de ADN de alto p eso molecular mediante nanopore: genética descriptiva mitocondrial de una especie de Bufonidae (Atelopus Bomolochos)
Full text linkLa histórica Evaluación Global de Anfibios (GAA2) del 2022 revela que el 40,7% de anfibios registrados están globalmente Frente a esta situación, la obtención del genoma mitocondrial (mitogenoma) se considera esencial para la conservación y estudios filogenéticos efectivos. Es crucial secuenciar y anotar éstos mitogenomas, debido a que aún existen vacíos en la información genética. La secuenciación de próxima generación (NGS) ofrece una alternativa para obtener y analizar grandes cantidades de datos genéticos en un corto periodo de tiempo, con mayor precisión y actualmente a un costo relativamente bajo. Este enfoque, combinado con innovadoras herramientas bioinformáticas, nos permitió caracterizar el mitogenoma completo de Atelopus bomolochos, sapo de la familia Bufonidae, considerado en Peligro Crítico de extinción. Se logró codificar un total de 18399 pb, siendo el primer mitogenoma secuenciado y anotado para esta especie. Además, se presenta la filogenia con datos de 133 mitogenomas de anfibios disponibles en la base de datos del National Center for Biotechnology Information (NCBI).
Estos avances constituyen un gran aporte a la genómica de la conservación, herramientas y técnicas genéticas para preservación y gestión de especies en peligro de extinción, garantizando su supervivencia a largo plazo de las poblaciones silvestres y la biodiversidad en general.Tutor: Hugo Mauricio Ortega Andrad
Analysis of the protein-protein interaction network of the parasite-vector-human system in changas disease
Full text linkTrypanosoma cruzi es la causa etiológica de la Enfermedad de Chagas, una de las enfermedades más críticas en América Latina y considerada una de las 13 enfermedades tropicales más desatendidas a nivel mundial. En los últimos años, los datos ómicos han aumentado sustancialmente en calidad y cantidad. En particular, los de proteómica y transcriptómica se pueden utilizar durante el desarrollo de redes biológicas, donde se producen interacciones proteína-proteína (PPI). En el sistema parásito-vector-humano de la Enfermedad de Chagas, se producen interacciones específicas entre proteínas del parásito (T. cruzi), del vector (Rhodnius prolixus) y del humano (Homo sapiens). Este estudio tuvo como objetivo comprender el sistema parásito-vector-humano de la enfermedad de Chagas a través del análisis automatizado de redes de interacción proteína-proteína. Para ello, se construyó una red PPI basada en suposiciones, luego se identificaron los nodos de interés (componentes conectados, centralidad, medidas comunitarias y peso de unión entre proteínas) y se realizó un análisis de enriquecimiento. En este trabajo se analizaron 101 602 genes, y tras ser filtrados y purificados se obtuvieron 985 genes: 501 nodos y 5 796 interacciones. La identificación de genes fundamentales, incluidos TNF, IL6 y GADPH, subraya la importancia de nodos específicos en la red. Estos genes se destacan como posibles objetivos terapéuticos con sus funciones pronunciadas e interacciones sólidas. Su participación sugiere contribuciones críticas al panorama molecular de la enfermedad de Chagas, ofreciendo información valiosa sobre sus mecanismos de comprensión.Tutor: Marco Andrés Viteri Yánez ; Cotutor: Moisés Rubén Gualapuro Gualapur
Validación de genes de referencia para análisis de expresión génica en Heliconius Erato Lativitta (Lepidóptera: Nymphalidae)
Full text linkLa mariposa neotropical Heliconius erato lativitta sirve como organismo modelo para el estudio de adaptaciones evolutivas, especiación y bases genéticas. Esta especie es reconocida principalmente por el mimetismo del patrón de color de las alas. Sin embargo, los mecanismos moleculares implicados en la adaptación a los cambios de temperatura siguen sin identificarse. En este sentido, la PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR) ha resultado una de las herramientas más útiles para dilucidar el mecanismo molecular mediante la cuantificación del ARNm de genes implicados en la adaptación de estas especies. Sin embargo, la precisión y confiabilidad de los datos de qPCR dependen de la selección adecuada de genes de referencia, cuyos perfiles de expresión deben permanecer estables en diferentes condiciones experimentales. Por tanto, en este trabajo se seleccionaron seis genes (ACT1, ACT2, ANX, AK, eEf1α y eEf1α2) de H. e. lativitta que se utilizaron como genes candidatos de referencia y se evaluó su nivel de expresión a diferentes temperaturas en tres tipos de tejidos tanto para machos como para hembras. La estabilidad de los genes de referencia se evaluó utilizando tres algoritmos geNorm, NormFinder y RefFinder. Los resultados obtenidos con estos algoritmos indican que AK y ACT2 son estables bajo estrés térmico. Sin embargo, a nivel de tejido, sólo ACT1 y AK fueron los genes más estables, mientras que, a nivel de sexo, sólo ACT1 y ACT2 exhibieron una alta estabilidad. Por lo tanto, este estudio proporciona un conjunto estandarizado de genes de referencia para futuros análisis de expresión génica utilizando qPCR en H. e. lativitaTutora: Bacquet Pérez, Caroline Nicole Orian
Diseño arquitectónico de un Centro Etnocultural con enfoque en el diseño eco-positivo para el Barrio Santa Inés
No full textLa región amazónica se destaca por su riqueza cultural. Diez de las trece nacionalidades indígenas identificadas en el país se encuentran asentadas en esta zona, aportando conocimientos y tradiciones a la Amazonía. Sin embargo, en la actualidad las nuevas generaciones han perdido la importancia de estas
culturas (Haboud, 2017). Con el objetivo de promover la difusión de la cultura e identidad heredada por la población indígena kichwa local, el Gobierno Autónomo Descentralizado (GAD) de Tena contempla la Proyección de un centro etnocultural dentro del Plan de Ordenamiento Urbanístico Integral y Sustentable.
Según el programa de inversiones urbanas, el centro etnocultural debe ubicarse en uno de los tres barrios que cuentan con zonas destinadas a la difusión de los conocimientos etnoculturales en la ciudad. Estos sitios eran antiguas comunidades que se han transformado en barrios y se han incorporado al límite urbano. La propuesta se enfoca en la gestión social y los procesos ecológicos como conceptos base del diseño eco-positivo que implementa estrategias que fomentan la participación del barrio en la planificación del equipamiento, al mismo tiempo que promueve el aprovechamiento de los recursos naturales. La creación de este primer centro etnocultural en el límite urbano de la ciudad permitirá que los niños y jóvenes de diferentes unidades Educativas que visiten el proyecto comprendan el estilo de vida de la cultura kichwa local.Tutor: Juan Carlos Zambrano Pilatuña ; Co-tutor: Diana Patricia Astudillo Brav
Evaluación del uso de pirochar de guadua angustifolia en el proceso de digestión anaerobica de aguas residuales domésticas
Full text linkLa implementación de biochar puede mejorar significativamente la degradación de compuestos contaminantes y la calidad del agua tratada. Este estudio evaluó el impacto del biochar derivado de Guadua angustifolia en la digestión anaerobia de aguas residuales en la Universidad Regional Amazónica Ikiam, ubicada en Napo, Ecuador. Se analizaron parámetros clave del potencial bioquímico de metano (PBM) mediante ensayos por lotes, utilizando biochar sintetizado a diferentes temperaturas (300, 500 y 700°C) y en diversas dosis (5, 15 y 25 g/L). La caracterización del biochar mostró que el producido a 500°C presentaba una mayor área superficial y volumen de poros, mientras que el sintetizado a 700°C exhibía una menor funcionalidad de grupos superficiales. Los ensayos de PBM revelaron que el biochar sintetizado a 300°C y a una dosis de 25 g/L mejoró la producción de metano, alcanzando 402,7 NmL/gSV, lo que representa un incremento del 58% en comparación con el control, que produjo 266 NmL/gSV. Estos resultados sugieren que el biochar derivado de residuos de G. angustifolia posee un potencial significativo como material de soporte en la digestión anaerobia de aguas residuales, promoviendo una mayor eficiencia en la producción de biogás y contribuyendo al desarrollo de tecnologías sostenibles para el tratamiento de aguas residuales agroindustriales. Esta investigación proporciona una base sólida para futuras aplicaciones del biochar en procesos de biorremediación y producción de energía renovable, destacando su relevancia en el contexto de la gestión ambiental y la economía circular.Tutor: Rocío Cecibel Jiménez Paute ; Cotutores: Jaime Emilio Martí Herrero y Joaquín Luis Brito Gonzalve
