Repositorio Digital Ikiam (Univ. Regional Amazónica)
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    850 research outputs found

    Metabolite fingerprinting of Urospatha sagittifolia (Araceae) tubers at different growth stages by multi-platform metabolomics and molecular networking

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    Urospatha sagittifolia is a medicinal plant with antivenom, antihemorrhagic and anti-inflammatory properties commonly used by vulnerable Amazon indigenous communities to tackle venomous snakebites and their life-threatening consequences. Despite its pharmacological potential as a rich source of drug candidates, its metabolomic profile remains unknown. In this context, this study integrated mass spectrometry-based metabolomics, multivariate analysis, and molecular networks to uncover the chemical composition of U. sagittifolia and its dynamic metabolic changes during three plant growth stages (seedling, juvenile and adult). In general, 50 metabolites were identified in U. sagittifolia tubers by LC-MS (43 metabolites) and GC-MS (seven metabolites). Multivariate analysis using LC-MS showed that the relative concentrations of most of the identified metabolites were higher in seedlings or juveniles than in adults. On the other hand, GC-MS analysis showed that methyl palmitate and methyl stearate were the most abundant in the early growth stages, whereas allantoic acid and palmitic acid prevailed as the plant matured. In summary, this is the first metabolomicscentered mining of U. sagittifolia compositional diversity focusing on chemical-level variability. These valuable findings offer a temporal view of metabolic changes during plant growth stages, which is useful for future bioprospecting, biological screening, and purification of metabolite-based therapeutics

    Application of neural networks in the prediction of the circular economy level in agri-food chains

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    The objective of the work is to predict the level of circular economy in the agri-food chain through an empirical neural network approach. The research methodology includes the training of a neural network to predict the level of 128 circular economy in two agri-food chains. The novelty of this work lies in the possibility of defining in advance circular strategies based on the prediction of the level of circular economy. Historical data on the level of circular economy are compared with those predicted by neural networks. As a result, it is shown that if the weights of the circular economy level variables are not homogeneous, the procedure has a lower correlation value which, however, remains significant

    Human activities shape global patterns of decomposition rates in rivers

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    Rivers and streams contribute to global carbon cycling by decomposing immense quantities of terrestrial plant matter. However, decomposition rates are highly variable and large-scale patterns and drivers of this process remain poorly understood. Using a cellulose-based assay to reflect the primary constituent of plant detritus, we generated a predictive model (81% variance explained) for cellulose decomposition rates across 514 globally distributed streams. A large number of variables were important for predicting decomposition, highlighting the complexity of this process at the global scale. Predicted cellulose decomposition rates, when combined with genus-level litter quality attributes, explain published leaf litter decomposition rates with high accuracy (70% variance explained). Our global map provides estimates of rates across vast understudied areas of Earth and reveals rapid decomposition across continental-scale areas dominated by human activities

    Mating preferences act independently on different elements of visual signals in Heliconius butterflies

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    Mating cues are often comprised of several elements, which can act independently, or in concert to attract a suitable partner. Individual elements may also function in other contexts, such as anti-predator defense or camouflage. In Heliconius butterflies, wing patterns comprise several individual color pattern elements, which advertise the butterflies’ toxicity to predators. These wing patterns are also mating cues and males predominantly court females that possess the same wing pattern as their own. However, it is not known whether male preference is based on the full wing pattern or only individual pattern elements. We compared preferences of male H. erato lativitta between female models with the full wing pattern and those with some pattern elements removed. We found no differences in preference between the full wing pattern model and a model with pattern elements removed, indicating that the complete composition of all elements is not essential to the mating signal. Wing pattern preferences also contribute to pre-mating isolation between two other Heliconius taxa, H. erato cyrbia, and H. himera; therefore, we next compared preferences for the same models in these species. H. erato cyrbia and H. himera strongly differed in preferences for the models, potentially providing a mechanism for how pre-mating isolation acts between these species. These findings suggest that contrasting levels of selective constraint act on elements across the wing pattern

    El "Super Adobe" y los costos de construcción de una vivienda de carácter social: caso Cayambe, Ecuador.

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    La construcción es un elemento dinamizador de la economía, es así que, en el año 2021 este sector representó el 7,3% del PIB ecuatoriano, la industria de la construcción desempeña un papel crucial en la economía del país, contribuyendo significativamente al Producto Interno Bruto (PIB) y generando empleo para una gran parte de la población. Sin embargo, el sector enfrenta diversos desafíos en términos de sostenibilidad ambiental y eficiencia económica. Partiendo de este dato podemos decir que hay un alto porcentaje de viviendas ineficientes a un costo que nos hace pensar en la especulación, ya que en muchas ocasiones no cumplen con los debidos márgenes de confort, generando un gasto adicional en sistemas artificiales y mejoras continuas. Sin embargo, la sierra ecuatoriana no es la excepción, tal y como vemos los datos en Cayambe, donde el 70.96% de viviendas son tipo villa y un 8.8% medias aguas, viviendas que no cumplen con los parámetros de confort, carecen en su mayoría de estrategias pasivas y esto a corto, mediano y largo plazo involucra mayores costos, debido a las deficiencias que van desde el origen de la villa. Es por esto que en esta investigación se plantea hacer el análisis comparativo de costos de la construcción de una vivienda de interés social propuesta por el MIDUVI en el año 2022 y una vivienda de interés social con características similares, pero adaptada a un sistema constructivo de súper adobe con estrategias pasivas de diseño, siendo el objetivo definir el costo beneficio de cada sistema desde el punto económico y también un breve análisis de confort interno de cada modelo de vivienda. Para la presente investigación se tomó como muestra poblacional al cantón Cayambe que cuenta con las propiedades idóneas para poder implementar el sistema de súper adobe, ya que su geografía y clima son propicios para poder analizar el modelo planteado, se registra que su población en un 70.94% es indígena, también se observa márgenes de pobreza considerables. En base al análisis realizado en esta investigación, el modelo de vivienda de interés social que se planteó con el sistema de súper adobe tiene un costo de construcción menor en un 3.62% en relación al modelo planteado con el sistema constructivo convencional. Siendo este resultado muy favorable para poder incluir este sistema constructivo al momento de plantear vivienda de interés social para la región sierra. Además, se realizó el análisis de la temperatura promedio y la humedad relativa en ambos modelos y se obtuvo que el modelo con súper adobe es más eficiente en comparación que el modelo convencional. Es más constante durante las 24 horas; sin embargo, a pesar de que el comportamiento del súper adobe es muy favorable para la temperatura interna, no se logró que esté dentro del rango de confort que nos indica la NEC-HS-CL, pero si se mantiene confortable en lo que concierne a humedad relativa promedio. Es decir, se puede corroborar que el sistema con súper adobe es mucho más benéfico por sus propiedades como material y sistema constructivo para ser aplicado en la ciudad de Cayambe, es una buena opción para retomar las técnicas constructivas sostenibles con tierra en la región sierra del Ecuador

    Diseño de un Mirado Turístico incorporando estrategias de construcción sostenible adecuadas a la ciudad de Tena, Ecuador.

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    Este trabajo busca establecer estrategias de construcción sostenibles adecuadas para la región amazónica, enfocándose en la ciudad de Tena. La investigación se desarrolla en cuatro etapas distintas: A través de una revisión bibliográfica exhaustiva sobre construcción sostenible en zonas tropicales, se aplicó el método Systematic Search Flow (SSF) para sistematizar la búsqueda de datos científicos. Con base en criterios específicos, se seleccionaron documentos relevantes. La información obtenida fue consolidada y sintetizada en una matriz detallada. Posteriormente, se eligieron cuatro miradores turísticos en Tena, evaluando aspectos espaciales, arquitectónicos y sociales, además de las estrategias de construcción sostenible existentes. Esta comparación y análisis determinaron las estrategias más adecuadas para el contexto de la Amazonia y la ciudad del Tena. La fase final incluyó el diseño de un mirador, aplicando las estrategias identificadas. La validación del diseño y estrategias se realizó mediante un grupo focal, integrando retroalimentación de diversas partes interesadas para ajustar la propuesta, asegurando su sostenibilidad, aceptación social y viabilidad en Tena. Este estudio proporciona una síntesis de prácticas sostenibles aplicables a la construcción en la Amazonía y, específicamente, en Tena

    NATURE BASED LIVING LAB (NB LAB): An undergraduate research experience at the Upper Amazonia.

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    The Tena River basin is a partially explored biodiversity hotspot; however, it has been affected by anthropogenic activities and global warming. Observing the declines and extinctions in the wide range of Amazonian biodiversity before they went extinct is the primary purpose of research work in Ecuador. For this, complete information on the diversity of species coexisting in these areas is relevant because it enables the generation of strategies for conserving the environment and the species they harbor. Thus, the objective of the NB Lab 1 platform, Exploring the biodiversity of the Amazon landscape, was to contribute to the knowledge of the batrachofauna (amphibian assemblage) of the Tena River basin using DNA barcoding, environmental-DNA (eDNA) metabarcoding-based techniques, Nanopore sequencing, and automation of bioinformatics processes. This was carried out through three processes: 1) fieldwork: observation of specimens in their habitat and collection of environmental samples; 2) laboratory work: molecular assays for processing amphibian tissues and eDNA samples, library preparation, and ONT sequencing; 3) data analysis: use of bioinformatics tools such as NGSpeciesID for DNA barcoding data, amplicon_sorter for eDNA metabarcoding reads and bash for computational process automation. Forty amphibian 16S rRNA gene sequences were generated. The eDNA approach was used for biomonitoring amphibian populations, and four species were detected: Scinax ruber, Pristimantis malkini, Rhinella marina, and Pristimantis sp. Furthermore, a bash script based on the Linux platform was designed to reduce the data processing time of DNA barcoding and eDNA metabarcoding. Each biodiversity assessment project is a step towards a better knowledge of local biodiversity, which is fundamental at the governmental level to implement better management plans that further benefit local communities regarding environmental conservation

    Efecto de la aplicación de citoquinas y auxinas en el cultivo in vitro de Passiflora punctata

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    El género Passiflora, el más diverso de la familia Passifloraceae, abarca 530 especies y 400 híbridos distribuidos en América y Europa. Entre estas, Passiflora punctata, una especie silvestre no domesticada, juega un papel crucial en la crianza de las mariposas Heliconius erato, ampliamente comercializadas en artesanías, exposiciones e investigaciones científicas. No obstante, P. punctata es vulnerable a diversas patologías tropicales, lo que subraya la necesidad de desarrollar métodos eficientes de cultivo in vitro. Este estudio se centra en el uso de medios de cultivo enriquecidos con reguladores de crecimiento, como auxinas y citoquinas, para promover y controlar el crecimiento y desarrollo celular de P. punctata. Se realizaron tres ensayos con diferentes concentraciones de citoquinas (BAP, kinetina) y auxinas (IBA, IAA). En el tercer ensayo, se combinaron las concentraciones óptimas determinadas previamente. Los resultados mostraron que 2 mg/L. de 6-bencilaminopurina (BAP) generaron la mayor longitud de brotes, con una significancia estadística alta (Pr(>F) de 5.25e-16 ***). En el ensayo de auxinas, aunque no hubo diferencias significativas entre el ácido indol-3-butírico (AIB) y el ácido indol-3-acético (IAA), 2 mg/L. de IAA promovieron el crecimiento en hojas y raíces. Las combinaciones de 6-BAP a 2.5 mg/L. e IAA a 2.5 mg/L. mostraron la mayor longitud de brotes, sugiriendo una sinergia en la promoción de brotes y hojas, sin cambios significativos en las raíces. Estos resultados son significativos para la propagación in vitro de P. punctata y mejoran los protocolos de cultivo aplicables a otras especies vegetales importantes. Se recomienda ajustar las concentraciones de reguladores de crecimiento y aumentar los intervalos de tiempo para una morfogénesis más evidente, abriendo nuevas líneas de investigación

    Estado del ecosistema acuático de la Cuenca del Río Quimi

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    Este estudio evaluó la calidad del ecosistema acuático en la cuenca del Río Quimi, afectado porel proyecto minero Mirador de EcuaCorrientes en la parroquia Tundayme, cantón Gualaquiza, provincia de Morona Santiago. Se emplearon diversas metodologías, incluyendo la medición deparámetros físico-químicos, análisis de metales pesados (HPI), evaluación de macroinvertebrados (AAMBI) y ensayos de fitotoxicidad con semillas de lechuga (Lactuca sativa). La mayoría de los puntos en el Índice de Calidad del Agua (ICA) superaron 70, indicandobuena calidad, excepto el punto 13 con valores inferiores a 70, señalando calidad regular. En macroinvertebrados, P1, P3, P6 y P7 mostraron valores superiores a 120, mientras que P11 y P13 carecieron de estos organismos. En metales, la mayoría de los puntos estuvo libre de contaminación, excepto P13 con niveles superiores a 50. Las tasas de germinación en ensayos fitotoxicológicos variaron entre 72% y 98%, siendo P3 la más alta y P10 la más baja. La integración de evidencia reveló que P3 presentó el menor grado de degradación (4.37%), mientras que P13 mostró el más alto (47.26%), evidenciando el deterioro del ecosistema acuático, especialmente cerca del proyecto minero. Estos resultados resaltan la urgencia de abordar los impactos negativos de la minería para preservar la salud del ecosistema y la biodiversidad en la región afectad

    Landslides Susceptibility Analysis Employing Analytical Hierarchy Process On An Amazonian Roadway In Ecuador [Análisis De Susceptibilidad A Deslizamientos Empleando El Proceso De Jerarquía Analítica En Una Carretera Amazónica Del Ecuador]

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    The Puyo-Tena roadway is prone to landslides due to the geodynamics, geomorphology, and geological materials of the area (unstable outcrops and strata). In recent years, this problem has persistently caused the road to be partially or completely disabled on numerous occasions. The objective of the research was to generate a cartographic model of landslides susceptibility based on variables such as slope, geological formations, land cover and land use, as well as distances to faults, road, and rivers. The degree of landslides incidence was estimated as the linear combination of the weighted variables using the analytic hierarchy process. The importance of this semi-quantitative method lies in its ability to break down a complex decision problem into a simpler and more coherent decision model. The resulting cartographic model was classified into five susceptibility categories: very low, low, moderate, high, and very high. The results showed that 17 km out of the 80 km of the Puyo-Tena roadway have a high probability of landslides, which is equivalent to 21.25% of the road. Furthermore, within this percentage, it was determined that there are fifteen regions with a high probability of landslides due to their location in areas with steep slopes, porous and permeable lithology, a large number of rivers, and agricultural soils. The area under the curve (AUC) of the receiver operating characteristic (ROC) was used for model verification. The verification results showed that the cartographic model for the study area has an accuracy value of 83.7%. The cartographic model of landslide susceptibility will enable relevant decisions to be made to mitigate potential hazards that may endanger transporters, material goods, and residents of the area

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