Repositorio Minciencias
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Ideas para el cambio bio : recuperando el agua y la vida.
No full textSu tradición ganadera y compromiso profundo con el territorio, motivó a los habitantes del municipio de Sucre, Cauca, a explorar alternativas para mejorar sus prácticas ambientales. Fue así como encontraron en la reforestación con plantas nativas y el silvopastoreo, una opción limpia y amigable para desarrollar su actividad ganadera, beneficiando a los animales, al medio ambiente y a la comunidad.Sistematización de experienci
Estudio de referenciación competitiva a las empresas productoras de palma de aceite híbrido (OXG) alto oléico.
No full textEl objetivo de este proyecto se fundamentó en la identificación de buenas prácticas de manejo para los materiales híbridos OxG y su posterior validación mediante ensayos en campo, que se llevarían a cabo en plantaciones de palma colombianas. En la vigencia del proyecto se realizaron diferentes etapas, las actividades y resultados frieron presentadas en los informes parciales; en este informe se presentan los resultados de los ensayos en campo de prácticas relacionadas con el manejo nutricional y la polinización del hibrido Coarí x La Mé que fueron las etapas seleccionadas al inicio del proyecto. (Apartes del texto)
Síntesis de puntos cuánticos de grafeno (GQDs) y su evaluación como sensores de contaminantes en aguas
No full textLos nanomateriales basado en carbono son conocidos por sus diferentes morfologías y propiedades únicas, por ello han inspirado una intensa labor de investigación en los últimos años. El fullereno (OD), los nanotubos de carbono (CNT) (1D) y el grafeno (2D) han sido descubiertos de manera sucesiva, y desde entonces se han aplicado en biología, química, materiales y ciencias ambientales. El grafeno es un nanomaterial bidimensional de un solo átomo de carbono de espesor, que exhibe características únicas como gran área superficial, alta movilidad de transporte, flexibilidad mecánica y una excelente estabilidad térmica y química. Los puntos cuánticos de grafeno (GQD, por su nombre en inglés) fueron descubiertos muy recientemente como una clase de nanomaterial grafítico cero dimensional con dimensiones laterales inferiores a 100 nm en una sola capa, capas dobles, y unas pocas capas (3 a 10). Los GQDs, por sus propiedades fluorescentes, son superiores a otros sistemas fluorescentes ( por ejemplo, los puntos cuánticos de semiconductores), en términos de facilidad de producción, resistencia a "fotoblanqueado", baja citotoxicidad y excelente bio-compatibilidad, lo que los hace prometedores como sensores químicos, bio-imagen, sistemas opto-electrónicos, etc. Por otra parte, similar al grafeno, los GQDs tienen unas características excelentes de gran área superficial, gran diámetro y posibilidad de adicionar diferentes grupos funcionales sobre su superficie que le confieren diversas propiedades físicas y químicas. Los grupos carboxilos e hidroxilos en el grafeno pueden mostrar una excelente solubilidad en agua y permite la funcionalización del grafeno con diversas especies orgánicas, inorgánicas, biológicas o poliméricas
Estudio de la organización genómica de regiones adyacentes a dominios ancestrales del sistema inmune de cordados inferiores
No full textDentro del grupo de especies que trabajamos en esta investigación nos concentramos en algunas especies de cordados basales especialmente en especies del sub-phylum Tunicata. Se trabajó con este sub-phylum porque sus especies son muy importantes en estudios evolutivos puesto que son considerados del grupo hermano de los vertebrados. Sin embargo, los estudios en genómica comparativa de cordados basales, en donde se ubican los tunicados, son escasos y por ende los comparativos. Por estas razones, en este proyecto se aisló, secuenció y ensambló el genoma de tres especies de tunicados Didemnum vexillum, Clavelina oblonga, y Perophora viridis para establecer un grupo taxonómico que permitiese realizar el estudio y contrastes requeridos para estudiar dominios ancestrales del sistema inmune. Los resultados del proceso de ensamblaje genómico se reportan en los anexos. La diversidad de dominios asociados al sistema inmune encontrada en este trabajo se propone que pueda soportar la razón de existencia de diferentes formas de vida y de ubicación en nichos ecológicos en diferentes ambientes marinos para los tunicados. Finalmente se presentaron modelos que explican la evolución de dominios según diferentes modelos del sistema inmune y la organización adyacente a los dominios del sistema inmune.Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] Colciencia
Desarrollo de una prueba de concepto y un estudio de factibilidad comercial de un dispositivo médico de tele-monitoreo continuo materno-fetal.
No full textLas tasas de mortalidad neonatal y materna, así como aquellas tasas de discapacidad por stress fetal preocupan a países de altos, medianos y bajos ingresos. Para disminuir estas cifras, que entre el periodo de 2009 y 2011 en Colombia fueron superiores a las 3.566 muertes potencialmente evitadas, se utilizan técnicas de monitoreo cardiaco fetal tales como la cardiotocografía o el ultrasonido. Sin embargo, en el primer caso, existen periodos de no monitorización que pueden ser largos y en el segundo caso, la tecnología no permite monitorizar al feto en casos de maternas con alto IMC o durante el trabajo de parto o la cesárea.
Este proyecto busca responder la pregunta de estudio, dirigida a verificar la viabilidad técnica y comercial de un sistema de monitoreo continuo materno-fetal antes y durante el trabajo de parto y en intervenciones no obstétricas con indicación de monitoreo constante del feto. Se prevé que el dispositivo mencionado ofrezca características diferenciales, que permita una mejor adaptabilidad a las condiciones de las pacientes (de conformación física -obesidad- y posicionamiento) así como un sistema integrado de tele-monitoreo.
En la prueba de concepto se validará la captura de señales simuladas evaluando el sistema de telemetría y de almacenamientos local y remoto, integrándose con el sistema de análisis de señal y sistema de navegación de señal. El estudio de viabilidad comercial se basará en un estudio de mercado que permita validar el interés comercial de la tecnología desarrollada así como en un estudio de patentabilidad y solicitud de protección de derechos de propiedad intelectual y/o industrial en caso tal
A comprehensive genomic and transcriptomic analysis of dimorphic human pathogen fungi and its relation with virulence.
No full textThe ascomycete order Onygenales includes most dimorphic fungi that are pathogenic to humans. The most virulent of these fungal pathogens are found in the genera Paracoccidioides, Histoplasma, Blastomyces (family Ajellomycetaceae) and Coccidioides, which all have special medical relevance for South and/or North America. Paracoccidioides brasiliensis is endemic in Latin America where it is the third leading cause of death from chronic infection in particular countries and Histoplasma capsulatum is endemic in the United States where it is the most common cause of fungal respiratory infections in healthy individuals. These organisms share a close evolutionary relationship and common strategies of pathogenesis. However, despite the high incidence of infection with thermally dimorphic fungi, there is little understood about the molecular virulence mechanisms utilized by these organisms to manipulate disease progression in the host. A central line of research on Paracoccidioides, Histoplasma and other dimorphic human pathogenic fungi at the genome and gene level is the identification and characterization of virulence factors or molecular traits that make this fungus pathogenic and could be used as a lead for the design of vaccines, drugs and diagnostic methods. Sequencing of genomes and transcriptomes and subsequent comparative analysis is a particularly straightforward way to exhaustively scan and characterize species or individual strains of interest for this purpose. We propose to approach these endemic pathogens from an advanced and previously tested comparative genomics and transcriptomics framework. Two very recent advances make this an opportune moment to fill the remaining knowledge gap in a systematic way. The first is that next-generation sequencing has become inexpensive, and now it is more attractive to sequence the genomes of multiple isolates (population DNAseq) or the transcriptomes of multiple conditions (RNAseq) both allowing comparative analysis. The second is that for the Ajellomycetaceae family there are now several references genomes of the dimorphic pathogens Paracoccidioides, Histoplasma and Blastomyces and also genomes from non or less pathogenic species from the same family comprising Emmonsia parva, E. crescens, E. pasteuriana, Spiromastix grisea and Polytolypa hystricis. Part of those genomes were assembled, annotated and analyzed by our group in collaboration with the Broad Institute in previous and current projects allowing us to obtain the know-how for genome-based studies. Both recent advances showed that is a perfect moment for our group to continue this avenue of comparative genomics and functional genomics on the dimorphic pathogenic fungi Paracoccidioides and Histoplasma, including strategies such as RNAseq and transcriptional profiling. Here we propose to sequence the genomes (DNAseq) of isolates with particular phenotypic and geographic location as well as transcriptomes (RNAseq) of reference strains of P. brasiliensis and H. capsulatum in a comparative population and functional genomics approach. By performing genome and transcriptome based studies we expected to achieve success in this multi-target project allowing us: 1) to update and to improve the reference genome assemblies and annotations of Paracoccidioides and Histoplasma; 2) to identify differential molecular traits and mechanisms related to the pathogenesis and virulence of H. capsulatum and P. brasiliensis via comparative genomics (gene gain/losses, family expansion/contractions, etc) with other closely related pathogens and non-pathogens of the Ajellomycetaceae family, and via population genomics analysis within isolates of the same species with particular interesting phenotypes, source or location (SNPs analysis, recombination analysis, selection analysis) and 3) to identify differentially transcribed genes between host simulated and non-host condition that could be related with fungal virulence and pathogenicity
Implementacion de un vector basado en Virus Dengue para la liberación de RNAi terapéuticos en enfermedades Neurodegenerativas.
No full textEl uso de vectores virales se ha constituido en la mejor herramienta para la liberación de genes terapéuticos y los mismos están ahora siendo utilizados in vivo en la liberación de RNAi para el tratamiento de muchas enfermedades. Los vectores virales disponibles para terapia génica poseen limitaciones para ser usados con seguridad en el tratamiento de enfermedades en humanos, debido entre otros factores a su inmunogenicidad, integración al genoma y potencial oncogénico, además de la baja especificidad a nivel celular y tiempo de expresión del transgen de interés; haciendo necesario el diseño de nuevos vectores que permitan superar dichos problemas. El Virus Dengue es un Flavivirus ampliamente distribuido, del cual se han obtenido cDNAs infecciosos a través de la clonación en plásmidos convencionales, de bajo número de copias, cromosomas artificiales de levadura y de bacteria. Este virus posee características útiles para su uso en terapia génica, como son, la demostrada actividad replicativa en el núcleo sin integrarse al genoma del hospedero, la potente inhibición de la respuesta IFN, su potencial neurotropismo, estructuras 5'- y 3'-UTR que recrean un ambiente de microRNA, así como un genoma de tamaño pequeño que permite su fácil manipulación. El presente proyecto busca la construcción de un cDNA infeccioso en cromosoma artificial bacteriano, bajo el control del promotor CMV, así como la obtención de un vector viral bioseguro basado en Virus Dengue, cuya evaluación in vitro e in vivo permitirá determinar su habilidad para invadir el sistema nervioso central, así como para transducir poblaciones neuronales diferencialmente. Finalmente la clonación de secuencias de RNAi contra Cdk5 y su evaluación en cultivos primarios de ratón, permitirá postularlo como una alternativa terapéutica para el tratamiento de enfermedades neurodegenerativas, específicamente la enfermedad de Alzheimer
Decreto Nº 1467 de 6 de agosto de 2018
No full textEste decreto adiciona y modifica el Decreto 1082 de 2015 con el fin de reglamentar la Ley 1923 de 2018 (que regula lo relativo a los programas y proyectos de inversión que se financiarán con recursos del fondo de ciencia, tecnología e innovación del sistema general de regalías).n
Análisis estructural y funcional de la Nicotinamida/Nicotinato Adenililtransferasa (NMNAT) de Plasmodium falciparum : enzima central del metabolismo del NAD.
No full textLos dinucleótidos de piridina y adenina (NAD+ y NADP+) son moléculas esenciales en todos los organismos, ya que participan en diversos procesos biológicos, tales como rutas de producción energética, transducción de señales, síntesis de movilizadores de calcio y mantenimiento de sistemas REDOX. Su relevancia no solo es atribuida a su función como cofactores de numerosas oxidorreductasas, también estos dinucleótidos son co-sustratos en diversas modificaciones covalentes de proteínas determinantes en la regulación de procesos celulares como replicación, conservación telomérica, apoptosis, transcripción, ciclo celular, restricción calórica y supervivencia celular. El descubrimiento de los anteriores mecanismos de regulación dependientes de este dinucleótido ha señalado la importancia de la biosíntesis del NAD+ como punto central en el control de estos procesos. Las dos vías de biosíntesis del NAD+, la vía de novo y la vía de salvamento, convergen en una reacción catalizada por la enzima Nicotinamida/Nicotinato Mononucleótido Adenililtransferasa (NMNAT) (EC2.7.7.1) perteneciente a la familia de fosfodiesterasas nucleotidiltransferasas, paso clave en la biosíntesis del NAD+.
El estudio de la NMNAT en diferentes organismos, ha demostrado la importancia de la biosíntesis del NAD+ en el desarrollo de diversas patologías y ha permitido identificar diferencias significativas entre las enzimas de organismos procariotas y eucariotas, postulándola como posible blanco de agentes terapéuticos. Una de las enfermedades parasitarias de mayor incidencia a nivel mundial es la malaria, producida por un protozoario del género Plasmodium, el cual se estima es causante en promedio de dos millones de muertes anualmente. Se han implementado diferentes estrategias de control enfocadas en la erradicación del vector y en la eliminación del parasito mediante el desarrollo de insecticidas y el diseño de vacunas contra antígenos de superficie, respectivamente. Sin embargo, se ha observado incremento de la enfermedad debido a la resistencia desarrollada por los vectores y algunas especies del parásito. El metabolismo del NAD+ cumple una función importante en la supervivencia de todos los organismos estudiados a la fecha. Con el fin de desarrollar nuevas estrategias de control e identificar nuevos blancos terapéuticos, es necesario establecer investigaciones enfocadas en construir un conocimiento integral de la biología del parásito, el metabolismo del NAD+, así como las enzimas involucradas en su biosíntesis, ofrecen un excelente punto de partida, dada su esencialidad en procesos básicos celulares.
Estudios realizados en nuestro laboratorio, permitieron identificar, clonar y expresar la NMNAT de P. falciparum (PfNMNAT) en el sistema heterólogo E. coli. La purificación y caracterización enzimática de dicha proteína, permitió establecer aproximaciones experimentales claves para comprender el metabolismo del NAD+ en este parásito. Estudios bioinformáticos, realizados en este estudio, definieron la existencia de secuencias exclusivas de la proteína PfNMNAT, evidenciando componentes estructurales únicos en la enzima del parásito, en comparación con las NMNATs humanas. Igualmente se produjeron anticuerpos contra la PfNMNAT, constituyendo herramientas importantes para la caracterización de la enzima.
El proyecto planteado pretende dar continuidad al estudio del metabolismo del NAD+ en Plasmodium, al caracterizar la PfNMNAT punto clave de la ruta biosintética, desarrollando aproximaciones in-vivo e in-vitro. El primer acercamiento está encaminado a determinar localización y niveles de expresión a través del ciclo eritrocítico del parasito, definiendo en espacio y tiempo su relevancia y asociación con determinados procesos del ciclo. El segundo acercamiento in-vitro, abordará el estudio estructural de la proteína, empleando la proteína recombinante correspondiente, con el fin de determinar su estructura mediante estudios de difracción de rayos X
Científico por un día : pesticida hecho a base de aceite de ricino – SENA.
Get PDFMultimedia en formato .mp4Los pesticidas pueden afectar la salud de los seres humanos y la de los demás seres vivos. Sin embargo, en uno de nuestros Tecnoparques SENA, hemos acompañado el proceso de elaboración de uno que es completamente natural, a base del mismo ingrediente esencial del aceite de ricino denominada la planta higuerilla. ¡Qué aventura! Dale play